JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

Sort By

Choose a field to sort by.

Order by

Ascending / Descending.

Show

Results per page.

regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0060	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0061	1	0	0	0	0	1	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0062	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0063	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0064	1	0	0	0	0	1	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0065	1	0	0	0	0	1	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0066	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0067	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0068	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0069	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0070	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/1	g0071	1	0	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0072	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0073	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0074	1	0	1	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0075	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0076	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0077	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0078	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0079	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0080	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0081	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0082	1	0	0	0	0	1	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0083	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0084	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0085	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0086	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0087	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0088	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0089	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0090	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0091	1	0	0	1	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0092	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0093	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0094	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0095	1	1	0	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3G_chr22_39072275_39092743	0/0	g0096	1	0	1	0	0	0	APOBEC3G	chr22	39072275	39092743
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0001	61	2	20	27	4	8	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0002	52	1	10	33	0	8	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0003	39	1	7	21	4	6	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0004	23	3	4	10	0	6	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0005	17	0	4	12	1	0	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0006	16	6	1	8	1	0	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0007	15	8	2	3	2	0	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0008	13	0	1	9	0	3	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0009	9	0	4	4	0	1	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0010	6	5	0	0	0	1	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0011	5	0	0	4	0	1	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0012	5	0	0	5	0	0	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067
APOBEC3H_chr22_39092244_39109067	0/0	g0013	5	1	1	2	0	1	APOBEC3H	chr22	39092244	39109067