JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

Sort By

Choose a field to sort by.

Order by

Ascending / Descending.

Show

Results per page.

regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0191	1	0	0	1	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0192	1	0	1	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0193	1	0	0	1	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0194	1	0	0	0	0	1	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0195	1	0	0	1	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0196	1	0	0	0	0	1	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0197	1	0	0	1	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0198	1	0	0	0	0	1	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0199	1	0	1	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0200	1	0	0	1	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0201	1	0	0	1	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0202	1	0	0	0	0	1	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0203	1	0	0	1	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0204	1	0	0	0	0	1	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0205	1	0	0	1	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0206	1	0	1	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0207	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0208	1	0	0	0	0	1	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0209	1	0	1	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0210	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0211	1	0	0	0	0	1	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0212	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0213	1	0	1	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0214	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0215	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0216	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0217	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0218	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0219	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0220	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL2_chr22_36221209_36244527	0/0	g0221	1	1	0	0	0	0	APOL2	chr22	36221209	36244527
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0001	19	17	2	0	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0002	15	2	2	7	0	4	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0003	15	0	0	14	1	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0004	13	0	0	13	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0005	13	2	5	2	2	2	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	1/0	g0006	12	1	7	0	0	3	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0007	11	0	7	1	0	3	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0008	8	7	1	0	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0009	7	0	0	7	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0010	5	1	1	0	3	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0011	5	0	0	5	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0012	4	0	1	2	0	1	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0013	4	1	1	0	2	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0014	4	4	0	0	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0015	4	4	0	0	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0016	3	0	0	3	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0017	3	0	0	3	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0018	3	0	3	0	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755
APOL3_chr22_36135329_36165755	0/0	g0019	3	0	0	3	0	0	APOL3	chr22	36135329	36165755