JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

Sort By

Choose a field to sort by.

Order by

Ascending / Descending.

Show

Results per page.

regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0181	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0182	1	0	1	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0183	1	0	1	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0184	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0185	1	0	1	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0186	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0187	1	0	0	0	0	1	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0188	1	0	0	0	1	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0189	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0190	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0191	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0192	1	0	1	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0193	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0194	1	0	1	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0195	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0196	1	0	1	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0197	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0198	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0199	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0200	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0201	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0202	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0203	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0204	1	0	0	0	0	1	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0205	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0206	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0207	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0208	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0209	1	0	0	0	0	1	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0210	1	0	0	0	1	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0211	1	0	1	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0212	1	1	0	0	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0213	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF81_chrX_47831902_47930627	0/0	g0214	1	0	0	1	0	0	ZNF81	chrX	47831902	47930627
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0001	33	2	8	21	1	1	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0002	15	0	1	10	0	4	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/1	g0003	13	0	3	4	0	5	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	1/0	g0004	11	3	4	1	1	1	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0005	10	0	1	9	0	0	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0006	9	0	5	2	0	2	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0007	9	0	3	2	0	4	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0008	8	0	0	8	0	0	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0009	7	7	0	0	0	0	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0010	7	7	0	0	0	0	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0011	6	0	1	3	1	1	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0012	5	5	0	0	0	0	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0013	5	5	0	0	0	0	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0014	5	5	0	0	0	0	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0015	5	0	1	4	0	0	ZNF821	chr16	71854685	71889182
ZNF821_chr16_71854685_71889182	0/0	g0016	5	1	2	0	0	2	ZNF821	chr16	71854685	71889182