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Search Genic Haplotype Catalog

Haplotypefield

Choose the ACTG layer used to define haplotypes.

Genename

e.g. ALDH2, HBB.

Chr

Chromosome number (1-22, X, Y).

GRCh38

1 = haplotype type matches GRCh38; 0 = does not match.

Chm13v2

1 = haplotype type matches CHM13v2; 0 = does not match.

Gpopname

Filter by superpopulation group.

Popname

Filter by population group.

Total

Minimum number of hits (≥).

Start

Start coordinate (GRCh38).

End

End coordinate (GRCh38).

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regionname	grch38/ chm13v2 1/0: The haplotype type is the same as GRCh38 0/1: The haplotype type is the same as CHM13v2 0/0: The haplotype type matches neither GRCh38 nor CHM13v2 1/1: The haplotype type is the same on both GRCh38 and CHM13v2	ghapid	total	AFR	AMR	EAS	EUR	SAS	genename	chr	start	end
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0394	1	0	1	0	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0395	1	0	0	1	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0396	1	0	0	1	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0397	1	0	0	1	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	1/0	g0398	1	0	0	0	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0399	1	0	0	0	1	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0400	1	0	0	1	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0401	1	0	1	0	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0402	1	1	0	0	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0403	1	1	0	0	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
BZW2_chr7_16641181_16711517	0/0	g0404	1	0	0	1	0	0	BZW2	chr7	16641181	16711517
C10orf105_chr10_71706701_71724778	1/0	g0001	131	21	36	49	6	18	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/1	g0002	62	5	9	37	3	7	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0003	40	5	13	7	5	10	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0004	37	0	4	33	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0005	31	1	2	24	0	4	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0006	18	0	1	17	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0007	13	12	1	0	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0008	9	9	0	0	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
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C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0010	6	4	2	0	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
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C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0013	4	4	0	0	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0014	4	3	1	0	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0015	3	0	0	3	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0016	3	0	0	3	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0017	3	2	1	0	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0018	2	0	2	0	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
C10orf105_chr10_71706701_71724778	0/0	g0019	2	0	0	2	0	0	C10orf105	chr10	71706701	71724778
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