Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr1:168729167	A A	G G	1	a0011 a0011	1	NA19043.hp2 NA19043.hp2	missense_variant	MODERATE	c.8T>C c.8T>C	p.Leu3Pro p.Leu3Pro	DPT	ENSG00000143196.5	transcript	ENST00000367817.4	protein_coding	1/4	40/1719	8/606	3/201	chr1	168729167

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JoGo Online Haplotype Explorer DPT_chr1_168690468_168734206

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 11)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 17)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 22)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 321)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 17)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 41)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 321)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 438)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 10)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 17)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 468)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)