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chr2:200634833	C C	T T	1	a0005 a0005	4	HG00408.hp1 NA18979.hp1 NA19056.hp1 others(1): Show HG00408.hp1 NA18979.hp1 NA19056.hp1 NA19082.hp1	missense_variant	MODERATE	c.2264C>T c.2264C>T	p.Thr755Ile p.Thr755Ile	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	21/35	2359/4928	2264/4017	755/1338	chr2	200634833
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chr2:200659241	C C	G G	1	a0014 a0014	1	HG03540.hp2 HG03540.hp2	missense_variant	MODERATE	c.3248C>G c.3248C>G	p.Ala1083Gly p.Ala1083Gly	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	28/35	3343/4928	3248/4017	1083/1338	chr2	200659241
chr2:200659279	G G	A A	1	a0013 a0013	1	HG03041.hp2 HG03041.hp2	missense_variant	MODERATE	c.3286G>A c.3286G>A	p.Gly1096Ser p.Gly1096Ser	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	28/35	3381/4928	3286/4017	1096/1338	chr2	200659279
chr2:200661607	A A	G G	3	a0003 a0006 a0014 a0003 a0006 a0014	29	HG01515.hp1 HG01517.hp1 HG02055.hp2 others(26): Show HG01515.hp1 HG01517.hp1 HG02055.hp2 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02258.hp1 HG02647.hp1 HG02723.hp1 HG02723.hp2 HG02886.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02976.hp2 HG03041.hp1 HG03130.hp2 HG03209.hp1 HG03225.hp2 HG03453.hp2 HG03471.hp1 HG03540.hp2 HG03704.hp2 HG03831.hp1 HG04204.hp2 HG06807.hp2 NA18522.hp2 NA19030.hp1 NA20300.hp1 NA20300.hp2 NA21309.hp2	missense_variant	MODERATE	c.3404A>G c.3404A>G	p.Asn1135Ser p.Asn1135Ser	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	30/35	3499/4928	3404/4017	1135/1338	chr2	200661607
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chr2:200668648	T T	C C	1	a0011 a0011	1	HG02809.hp2 HG02809.hp2	missense_variant	MODERATE	c.3643T>C c.3643T>C	p.Tyr1215His p.Tyr1215His	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	33/35	3738/4928	3643/4017	1215/1338	chr2	200668648
chr2:200669666	A A	G G	3	a0002 a0006 a0010 a0002 a0006 a0010	41	HG00621.hp1 HG00673.hp2 HG01106.hp1 others(38): Show HG00621.hp1 HG00673.hp2 HG01106.hp1 HG01123.hp2 HG01192.hp2 HG01255.hp2 HG01346.hp1 HG01358.hp2 HG01361.hp1 HG01515.hp2 HG01517.hp2 HG01934.hp2 HG01943.hp2 HG02040.hp1 HG02071.hp1 HG02148.hp2 HG02273.hp2 HG02300.hp1 HG02523.hp2 HG02698.hp1 HG03239.hp1 HG03453.hp2 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03491.hp1 HG03492.hp2 HG03669.hp2 NA18944.hp1 NA18948.hp1 NA18956.hp1 NA18963.hp1 NA18968.hp1 NA18974.hp1 NA18978.hp2 NA18980.hp1 NA18987.hp1 NA19007.hp2 NA19055.hp2 NA19060.hp1 NA19082.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	missense_variant	MODERATE	c.3890A>G c.3890A>G	p.His1297Arg p.His1297Arg	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	34/35	3985/4928	3890/4017	1297/1338	chr2	200669666

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chr2:200613804	G G	A A	1	a0001c0014 a0001c0014	1	NA18906.hp1 NA18906.hp1	splice_region_variant&synonymous_variant	LOW	c.1449G>A c.1449G>A	p.Arg483Arg p.Arg483Arg	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	15/35	1544/4928	1449/4017	483/1338	chr2	200613804
chr2:200616016	T T	C C	1	a0003c0009 a0003c0009	2	HG02055.hp2 HG02109.hp1 HG02055.hp2 HG02109.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1657T>C c.1657T>C	p.Leu553Leu p.Leu553Leu	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	16/35	1752/4928	1657/4017	553/1338	chr2	200616016
chr2:200621192	C C	T T	1	a0001c0031 a0001c0031	1	HG02602.hp1 HG02602.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1947C>T c.1947C>T	p.Asp649Asp p.Asp649Asp	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	18/35	2042/4928	1947/4017	649/1338	chr2	200621192
chr2:200627439	A A	G G	4	a0001c0005 a0001c0029 a0003c0030 others(1): Show a0001c0005 a0001c0029 a0003c0030 a0015c0017	8	HG01884.hp2 HG02258.hp2 HG02976.hp1 others(5): Show HG01884.hp2 HG02258.hp2 HG02976.hp1 HG03209.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp2 NA18522.hp2 NA18906.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2211A>G c.2211A>G	p.Gln737Gln p.Gln737Gln	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	20/35	2306/4928	2211/4017	737/1338	chr2	200627439
chr2:200636928	C C	G G	1	a0001c0027 a0001c0027	1	HG00738.hp1 HG00738.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2364C>G c.2364C>G	p.Thr788Thr p.Thr788Thr	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	22/35	2459/4928	2364/4017	788/1338	chr2	200636928
chr2:200636982	G G	A A	1	a0003c0018 a0003c0018	1	HG03704.hp2 HG03704.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2418G>A c.2418G>A	p.Ala806Ala p.Ala806Ala	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	22/35	2513/4928	2418/4017	806/1338	chr2	200636982
chr2:200641112	C C	T T	5	a0001c0005 a0001c0008 a0003c0009 others(2): Show a0001c0005 a0001c0008 a0003c0009 a0003c0026 a0015c0017	12	HG01884.hp2 HG02055.hp2 HG02109.hp1 others(9): Show HG01884.hp2 HG02055.hp2 HG02109.hp1 HG02258.hp2 HG02486.hp2 HG02965.hp1 HG02970.hp1 HG02976.hp1 HG03225.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp2 NA18906.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2583C>T c.2583C>T	p.Asn861Asn p.Asn861Asn	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	24/35	2678/4928	2583/4017	861/1338	chr2	200641112
chr2:200641115	T T	C C	1	a0001c0019 a0001c0019	1	HG00140.hp2 HG00140.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2586T>C c.2586T>C	p.Asp862Asp p.Asp862Asp	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	24/35	2681/4928	2586/4017	862/1338	chr2	200641115
chr2:200651090	G G	A A	1	a0001c0020 a0001c0020	1	NA19004.hp1 NA19004.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2964G>A c.2964G>A	p.Leu988Leu p.Leu988Leu	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	26/35	3059/4928	2964/4017	988/1338	chr2	200651090
chr2:200668740	C C	T T	1	a0003c0006 a0003c0006	4	HG02258.hp1 HG02895.hp1 HG02976.hp2 others(1): Show HG02258.hp1 HG02895.hp1 HG02976.hp2 HG06807.hp2	synonymous_variant	LOW	c.3735C>T c.3735C>T	p.Pro1245Pro p.Pro1245Pro	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	33/35	3830/4928	3735/4017	1245/1338	chr2	200668740
chr2:200668797	A A	G G	1	a0003c0006 a0003c0006	4	HG02258.hp1 HG02895.hp1 HG02976.hp2 others(1): Show HG02258.hp1 HG02895.hp1 HG02976.hp2 HG06807.hp2	synonymous_variant	LOW	c.3792A>G c.3792A>G	p.Ser1264Ser p.Ser1264Ser	AOX1	ENSG00000138356.14	transcript	ENST00000374700.7	protein_coding	33/35	3887/4928	3792/4017	1264/1338	chr2	200668797

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer AOX1_chr2_200581014_200676495

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ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 19)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 32)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 10)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 367)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 32)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 46)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 367)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 370)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 17)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 11)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 9)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1094)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)