JoGo: Joint Open Genome and Omics Platform

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chr2:200826395	AGATAGAT others(2): Show AGATAGATAG	A A	7	a0001c0001t0005 a0001c0001t0037 a0001c0001t0064 others(4): Show a0001c0001t0005 a0001c0001t0037 a0001c0001t0064 a0001c0001t0083 a0001c0001t0117 a0001c0001t0119 a0001c0001t0127	16	HG01123.hp1 HG01168.hp2 HG01256.hp1 others(13): Show HG01123.hp1 HG01168.hp2 HG01256.hp1 HG01358.hp2 HG02027.hp1 HG02071.hp2 HG02080.hp2 HG02615.hp2 HG03130.hp1 HG03688.hp1 HG03704.hp1 NA18983.hp2 NA19065.hp2 NA19067.hp2 NA19082.hp2 NA19091.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4218_4226delGATA others(5): Show c.4218_4226delGATAGATAG	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4218		chr2	200826395
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chr2:200826395	AGATAGAT others(8): Show AGATAGATAGATATTT	A A	1	a0001c0001t0080 a0001c0001t0080	1	HG00733.hp1 HG00733.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4218_4232delGATA others(11): Show c.4218_4232delGATAGATAGATATTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4218		chr2	200826395
chr2:200826395	AGATAGAT others(9): Show AGATAGATAGATATTTT	A A	2	a0001c0001t0024 a0001c0001t0079 a0001c0001t0024 a0001c0001t0079	4	HG01071.hp2 HG01167.hp1 HG01169.hp1 others(1): Show HG01071.hp2 HG01167.hp1 HG01169.hp1 HG01169.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4218_4233delGATA others(12): Show c.4218_4233delGATAGATAGATATTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4218		chr2	200826395
chr2:200826395	AGATAGAT others(10): Show AGATAGATAGATATTTTT	A A	1	a0001c0001t0078 a0001c0001t0078	1	NA20805.hp1 NA20805.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4218_4234delGATA others(13): Show c.4218_4234delGATAGATAGATATTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4218		chr2	200826395
chr2:200826395	AGATAGAT others(16): Show AGATAGATAGATATTTTTTTTTTT	A A	1	a0001c0001t0077 a0001c0001t0077	1	HG01891.hp2 HG01891.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4218_4240delGATA others(19): Show c.4218_4240delGATAGATAGATATTTTTTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4218		chr2	200826395
chr2:200826395	AGATAGAT others(17): Show AGATAGATAGATATTTTTTTTTTTT	A A	1	a0001c0001t0023 a0001c0001t0023	3	HG02723.hp1 HG03139.hp1 HG03225.hp1 HG02723.hp1 HG03139.hp1 HG03225.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4218_4241delGATA others(20): Show c.4218_4241delGATAGATAGATATTTTTTTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4218		chr2	200826395
chr2:200826395	AGATAGAT others(21): Show AGATAGATAGATATTTTTTTTTTTTTTTT	A A	1	a0001c0001t0076 a0001c0001t0076	1	HG02622.hp1 HG02622.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4218_4245delGATA others(24): Show c.4218_4245delGATAGATAGATATTTTTTTTTTTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4218		chr2	200826395
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chr2:200826397	A A	T T	2	a0001c0001t0026 a0001c0001t0084 a0001c0001t0026 a0001c0001t0084	4	HG00741.hp2 HG01167.hp2 HG03209.hp1 others(1): Show HG00741.hp2 HG01167.hp2 HG03209.hp1 HG03516.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4219A>T c.4219A>T	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4219		chr2	200826397
chr2:200826397	ATAGATAG others(8): Show ATAGATAGATATTTTT	A A	1	a0001c0001t0135 a0001c0001t0135	1	HG02647.hp2 HG02647.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4221_4235delAGAT others(11): Show c.4221_4235delAGATAGATATTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4221	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	200826397
chr2:200826397	ATAGATAG others(9): Show ATAGATAGATATTTTTT	A A	3	a0001c0001t0036 a0001c0001t0060 a0001c0001t0138 a0001c0001t0036 a0001c0001t0060 a0001c0001t0138	6	HG02615.hp1 HG02970.hp1 HG03041.hp2 others(3): Show HG02615.hp1 HG02970.hp1 HG03041.hp2 HG03139.hp2 NA19043.hp2 NA20300.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4221_4236delAGAT others(12): Show c.4221_4236delAGATAGATATTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4221	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	200826397
chr2:200826397	ATAGATAG others(10): Show ATAGATAGATATTTTTTT	A A	2	a0001c0001t0134 a0001c0001t0155 a0001c0001t0134 a0001c0001t0155	2	HG01884.hp2 HG02717.hp2 HG01884.hp2 HG02717.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4221_4237delAGAT others(13): Show c.4221_4237delAGATAGATATTTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4221	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	200826397
chr2:200826397	ATAGATAG others(22): Show ATAGATAGATATTTTTTTTTTTTTTTTTTT	A A	1	a0001c0001t0116 a0001c0001t0116	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4221_4249delAGAT others(25): Show c.4221_4249delAGATAGATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4221	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	200826397
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chr2:200826399	AGATAGAT others(6): Show AGATAGATATTTTT	A A	1	a0001c0001t0133 a0001c0001t0133	1	HG03225.hp2 HG03225.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4222_4234delGATA others(9): Show c.4222_4234delGATAGATATTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4222		chr2	200826399
chr2:200826399	AGATAGAT others(14): Show AGATAGATATTTTTTTTTTTTT	A A	1	a0001c0001t0115 a0001c0001t0115	1	HG01975.hp1 HG01975.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4222_4242delGATA others(17): Show c.4222_4242delGATAGATATTTTTTTTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4222		chr2	200826399
chr2:200826401	A A	T T	2	a0001c0001t0075 a0001c0001t0118 a0001c0001t0075 a0001c0001t0118	2	HG02145.hp1 HG03098.hp2 HG02145.hp1 HG03098.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4223A>T c.4223A>T	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4223		chr2	200826401
chr2:200826401	ATAGATAT others(3): Show ATAGATATTTT	A A	1	a0001c0001t0132 a0001c0001t0132	1	HG02895.hp2 HG02895.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4225_4234delAGAT others(6): Show c.4225_4234delAGATATTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4225	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	200826401
chr2:200826401	ATAGATAT others(4): Show ATAGATATTTTT	A A	2	a0001c0001t0059 a0001c0001t0136 a0001c0001t0059 a0001c0001t0136	3	HG02622.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp1 HG02622.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4225_4235delAGAT others(7): Show c.4225_4235delAGATATTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4225	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	200826401
chr2:200826401	ATAGATAT others(5): Show ATAGATATTTTTT	A A	2	a0001c0001t0035 a0001c0001t0137 a0001c0001t0035 a0001c0001t0137	4	HG02280.hp2 HG02559.hp1 HG02630.hp2 others(1): Show HG02280.hp2 HG02559.hp1 HG02630.hp2 HG03486.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4225_4236delAGAT others(8): Show c.4225_4236delAGATATTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4225	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	200826401
chr2:200826401	ATAGATAT others(6): Show ATAGATATTTTTTT	A A	1	a0001c0001t0058 a0001c0001t0058	2	HG02976.hp2 NA19043.hp1 HG02976.hp2 NA19043.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4225_4237delAGAT others(9): Show c.4225_4237delAGATATTTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4225	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	200826401
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chr2:200826403	AGATATTT others(10): Show AGATATTTTTTTTTTTTT	A A	1	a0001c0001t0114 a0001c0001t0114	1	HG01123.hp2 HG01123.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4226_4242delGATA others(13): Show c.4226_4242delGATATTTTTTTTTTTTT	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4226		chr2	200826403
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chr2:200826405	A A	T T	13	a0001c0001t0005 a0001c0001t0010 a0001c0001t0018 others(10): Show a0001c0001t0005 a0001c0001t0010 a0001c0001t0018 a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0001c0001t0064 a0001c0001t0075 a0001c0001t0083 a0001c0001t0086 a0001c0001t0117 a0001c0001t0118 a0001c0001t0119 a0001c0001t0127	31	HG00280.hp1 HG00423.hp2 HG00597.hp1 others(28): Show HG00280.hp1 HG00423.hp2 HG00597.hp1 HG01123.hp1 HG01168.hp2 HG01256.hp1 HG01358.hp2 HG01433.hp2 HG01515.hp2 HG02027.hp1 HG02071.hp2 HG02080.hp2 HG02145.hp1 HG02615.hp2 HG02895.hp1 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02970.hp2 HG03098.hp2 HG03130.hp1 HG03486.hp1 HG03688.hp1 HG03704.hp1 HG03942.hp2 HG04199.hp2 NA18983.hp2 NA19065.hp2 NA19067.hp2 NA19070.hp2 NA19082.hp2 NA19091.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4227A>T c.4227A>T	BZW1	ENSG00000082153.18	transcript	ENST00000409600.6	protein_coding	12/12	4227		chr2	200826405
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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer BZW1_chr2_200806910_200832338

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Translation Multiple Alignment View

ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 155)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 77)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 4)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 158)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 221)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 388)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 151)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 98)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)