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chr1:229342558	C C	T T	1	a0001c0002t0010g0040 a0001c0002t0010g0040	1	NA21309.hp2 NA21309.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.-48-45G>A c.-48-45G>A	CCSAP	ENSG00000154429.11	transcript	ENST00000284617.7	protein_coding	1/3	chr1	229342558

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JoGo Online Haplotype Explorer CCSAP_chr1_229316015_229348047

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 37)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 386)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 6)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 42)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 386)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 436)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 4)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 43)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 337)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)