Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr18:31631066	A A	G G	1	a0001c0003 a0001c0003	1	HG01884.hp2 HG01884.hp2	synonymous_variant	LOW	c.669T>C c.669T>C	p.Cys223Cys p.Cys223Cys	B4GALT6	ENSG00000118276.12	transcript	ENST00000306851.10	protein_coding	6/9	824/4672	669/1149	223/382			chr18	31631066

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chr18:31622988	G G	C C	1	a0001c0001t0006 a0001c0001t0006	14	HG01074.hp1 HG01081.hp1 HG01934.hp1 others(11): Show HG01074.hp1 HG01081.hp1 HG01934.hp1 HG01975.hp1 HG01975.hp2 HG01993.hp1 HG02004.hp1 HG02148.hp2 NA18950.hp1 NA18955.hp1 NA18956.hp2 NA18973.hp1 NA18987.hp2 NA19081.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2626C>G c.2626C>G	B4GALT6	ENSG00000118276.12	transcript	ENST00000306851.10	protein_coding	9/9	2626	chr18	31622988
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chr18:31623008	T T	C C	1	a0001c0003t0021 a0001c0003t0021	1	HG01884.hp2 HG01884.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2606A>G c.2606A>G	B4GALT6	ENSG00000118276.12	transcript	ENST00000306851.10	protein_coding	9/9	2606	chr18	31623008
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chr18:31623422	T T	G G	6	a0001c0001t0003 a0001c0001t0014 a0001c0001t0037 others(3): Show a0001c0001t0003 a0001c0001t0014 a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0002c0002t0003 a0002c0002t0032	31	HG00280.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 others(28): Show HG00280.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01361.hp2 HG01516.hp2 HG01884.hp1 HG01934.hp2 HG01952.hp1 HG02015.hp1 HG02135.hp1 HG02257.hp2 HG02622.hp1 HG02723.hp2 HG02738.hp2 HG02809.hp2 HG02922.hp1 HG02976.hp1 HG03041.hp1 HG03471.hp1 HG03492.hp2 HG03579.hp2 HG03688.hp2 HG03710.hp2 HG04228.hp1 HG04228.hp2 NA18953.hp2 NA18991.hp1 NA19009.hp2 NA19085.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2192A>C c.2192A>C	B4GALT6	ENSG00000118276.12	transcript	ENST00000306851.10	protein_coding	9/9	2192	chr18	31623422
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JoGo Online Haplotype Explorer B4GALT6_chr18_31617246_31689581

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 7)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 38)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 287)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 7)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 43)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 287)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 306)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 5)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 33)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 567)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)