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ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

  Error connecting to IGV?   CHST6_chr16_75467052_75500441  CHST6_chr16_75467052_75500441 (clean+top1000)

Multiple Alignments (by translate haplotype frequency)Multiple Alignments (by aa haplotype frequency) Multiple Alignments (by translate haplotype similarity)Multiple Alignments (by aa haplotype similarity)

Item Value
geneid 4166
ensemblid ENSG00000183196.10
hgncid 6938
symbol CHST6
name carbohydrate sulfotransferase 6
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ver v1.2
region chr16:75472052-75495441
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p.His304Arg
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1504/8370 911/1188 304/395 chr16 75478918
chr16:75478959 G
G
 T
T
 1 a0006
a0006
 1 NA19068.hp2
NA19068.hp2
 missense_variant MODERATE c.870C>A
c.870C>A
 p.Phe290Leu
p.Phe290Leu
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chr16:75479101 C
C
 T
T
 1 a0004
a0004
 1 HG01516.hp1
HG01516.hp1
 missense_variant MODERATE c.728G>A
c.728G>A
 p.Arg243His
p.Arg243His
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1321/8370 728/1188 243/395 chr16 75479101
chr16:75479198 G
G
 A
A
 1 a0007
a0007
 1 NA19067.hp2
NA19067.hp2
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c.631C>T
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p.Arg211Trp
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chr16:75479345 G
G
 C
C
 1 a0002
a0002
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HG00735.hp1
HG01074.hp1
others(5): Show 
HG00099.hp2
HG00735.hp1
HG01074.hp1
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p.Arg162Gly
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1077/8370 484/1188 162/395 chr16 75479345

chr:pos ref alt #
# of chapid
 chapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr16:75479061 G
G
 A
A
 1 a0001c0010
a0001c0010
 1 NA20129.hp1
NA20129.hp1
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c.768C>T
 p.Ala256Ala
p.Ala256Ala
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1361/8370 768/1188 256/395 chr16 75479061
chr16:75479163 G
G
 A
A
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a0001c0011
 1 HG02486.hp1
HG02486.hp1
 synonymous_variant LOW c.666C>T
c.666C>T
 p.Asn222Asn
p.Asn222Asn
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1259/8370 666/1188 222/395 chr16 75479163
chr16:75479364 C
C
 T
T
 1 a0001c0003
a0001c0003
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HG01169.hp2
HG03688.hp1
others(1): Show 
HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03688.hp1
HG03710.hp2
 synonymous_variant LOW c.465G>A
c.465G>A
 p.Arg155Arg
p.Arg155Arg
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1058/8370 465/1188 155/395 chr16 75479364
chr16:75479535 G
G
 C
C
 1 a0001c0003
a0001c0003
 4 HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03688.hp1
others(1): Show 
HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03688.hp1
HG03710.hp2
 synonymous_variant LOW c.294C>G
c.294C>G
 p.Ser98Ser
p.Ser98Ser
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 887/8370 294/1188 98/395 chr16 75479535
chr16:75479571 T
T
 G
G
 1 a0001c0004
a0001c0004
 4 HG02280.hp1
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others(1): Show 
HG02280.hp1
HG02896.hp2
HG03041.hp1
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c.258A>C
 p.Ala86Ala
p.Ala86Ala
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 851/8370 258/1188 86/395 chr16 75479571
chr16:75479586 C
C
 A
A
 1 a0001c0013
a0001c0013
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HG03486.hp1
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c.243G>T
 p.Ser81Ser
p.Ser81Ser
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G
 A
A
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a0001c0014
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
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c.237C>T
 p.Thr79Thr
p.Thr79Thr
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chr16:75479699 G
G
 A
A
 1 a0001c0014
a0001c0014
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
 synonymous_variant LOW c.130C>T
c.130C>T
 p.Leu44Leu
p.Leu44Leu
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 723/8370 130/1188 44/395 chr16 75479699
chr16:75479709 G
G
 A
A
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a0001c0005
 3 HG02257.hp2
HG02965.hp2
HG02970.hp2
HG02257.hp2
HG02965.hp2
HG02970.hp2
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c.120C>T
 p.Arg40Arg
p.Arg40Arg
 CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 713/8370 120/1188 40/395 chr16 75479709

chr:pos ref alt #
# of thapid:transcript level
 thapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr16:75472087 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0044
a0001c0001t0044
 1 NA18998.hp2
NA18998.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*6554T>C
c.*6554T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 6554 chr16 75472087
chr16:75472167 C
C
 G
G
 42 a0001c0001t0001
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a0001c0001t0008
others(39): Show 
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a0001c0001t0003
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HG00140.hp2
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 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*6474G>C
c.*6474G>C
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chr16:75472175 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0098
a0001c0001t0099
a0001c0001t0098
a0001c0001t0099
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HG02965.hp1
HG02055.hp1
HG02965.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*6466T>C
c.*6466T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 6466 chr16 75472175
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0067
a0001c0001t0067
 1 HG02602.hp1
HG02602.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*6144C>T
c.*6144C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 6144 chr16 75472497
chr16:75472631 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0086
a0001c0001t0086
 1 HG00597.hp1
HG00597.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*6010G>A
c.*6010G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 6010 chr16 75472631
chr16:75472674 G
G
 C
C
 26 a0001c0001t0002
a0001c0001t0006
a0001c0001t0016
others(23): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0006
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a0001c0001t0029
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others(79): Show 
HG00558.hp1
HG00609.hp1
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 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*5967C>G
c.*5967C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 5967 chr16 75472674
chr16:75472695 G
G
 A
A
 52 a0001c0001t0001
a0001c0001t0003
a0001c0001t0005
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c.*5759G>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0112
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NA18948.hp2
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c.*5710C>T
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AG
 A
A
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C
 G
G
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c.*5592G>C
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A
 T
T
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a0001c0001t0106
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HG04115.hp1
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c.*5549T>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0058
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HG00621.hp1
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c.*5543G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 5543 chr16 75473098
chr16:75473100 T
T
 A
A
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a0001c0001t0101
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NA18989.hp1
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c.*5541A>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0103
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NA19086.hp2
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c.*5520T>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0068
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HG02683.hp1
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c.*5465C>T
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C
 T
T
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c.*5445G>A
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G
 A
A
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a0001c0004t0022
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c.*5441C>T
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chr16:75473355 T
T
 A
A
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c.*5286A>T
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chr16:75473444 G
G
 A
A
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a0001c0001t0099
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HG02965.hp1
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c.*5197C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 5197 chr16 75473444
chr16:75473454 A
A
 C
C
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a0001c0001t0074
a0001c0001t0073
a0001c0001t0074
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NA21309.hp2
HG02717.hp1
NA21309.hp2
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c.*5187T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 5187 chr16 75473454
chr16:75473492 G
G
 T
T
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a0001c0001t0085
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NA18957.hp1
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c.*5149C>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 5149 chr16 75473492
chr16:75473852 T
T
 C
C
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a0001c0001t0069
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HG02818.hp1
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c.*4789A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 4789 chr16 75473852
chr16:75473948 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0112
a0001c0001t0112
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NA18948.hp2
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c.*4693C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 4693 chr16 75473948
chr16:75474031 C
C
 T
T
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a0001c0001t0062
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
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c.*4610G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 4610 chr16 75474031
chr16:75474036 G
G
 A
A
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a0001c0005t0050
a0001c0005t0030
a0001c0005t0050
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HG02257.hp2
HG02965.hp2
HG02970.hp2
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c.*4605C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 4605 chr16 75474036
chr16:75474068 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0034
a0001c0001t0034
 2 NA18987.hp2
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NA18987.hp2
NA19085.hp2
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CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 4573 chr16 75474068
chr16:75474137 T
T
 A
A
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a0001c0001t0092
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A
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a0001c0001t0064
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A
 G
G
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C
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a0001c0001t0078
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HG02738.hp1
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c.*4306G>A
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G
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G
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A
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HG02258.hp2
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T
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c.*4086G>A
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A
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A
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a0001c0001t0070
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G
 A
A
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HG04228.hp2
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A
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C
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a0001c0001t0065
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HG01361.hp1
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T
 A
A
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C
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G
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T
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a0001c0001t0064
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HG00280.hp1
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c.*3783G>A
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a0001c0001t0085
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NA18957.hp1
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c.*3755G>A
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 A
A
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c.*3742C>T
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 T
T
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a0001c0001t0097
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T
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C
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G
 A
A
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NA19086.hp1
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A
 G
G
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a0001c0001t0009
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c.*3465T>C
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chr16:75475277 G
G
 T
T
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a0001c0001t0084
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HG01255.hp2
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c.*3364C>A
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CAG
 C
C
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c.*3225_*3226delCT
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chr16:75475573 A
A
 C
C
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a0001c0001t0052
 1 HG00642.hp1
HG00642.hp1
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c.*3068T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 3068 chr16 75475573
chr16:75475577 G
G
 T
T
 1 a0001c0003t0045
a0001c0003t0045
 1 HG01167.hp1
HG01167.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3064C>A
c.*3064C>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 3064 chr16 75475577
chr16:75475616 A
A
 C
C
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a0001c0001t0089
 1 HG00673.hp1
HG00673.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3025T>G
c.*3025T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 3025 chr16 75475616
chr16:75475685 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0014
a0001c0001t0083
a0001c0001t0014
a0001c0001t0083
 7 HG01433.hp2
HG02280.hp2
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others(4): Show 
HG01433.hp2
HG02280.hp2
HG02486.hp2
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NA19056.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2956G>A
c.*2956G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2956 chr16 75475685
chr16:75475686 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0071
a0001c0001t0071
 1 HG01099.hp2
HG01099.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2955C>T
c.*2955C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2955 chr16 75475686
chr16:75475694 C
C
 A
A
 1 a0001c0014t0081
a0001c0014t0081
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
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c.*2947G>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2947 chr16 75475694
chr16:75475808 A
A
 C
C
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a0001c0003t0046
a0001c0003t0048
a0001c0003t0045
a0001c0003t0046
a0001c0003t0048
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HG01169.hp2
HG03688.hp1
HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03688.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2833T>G
c.*2833T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2833 chr16 75475808
chr16:75476180 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0057
a0001c0001t0057
 1 HG03710.hp1
HG03710.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2461C>T
c.*2461C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2461 chr16 75476180
chr16:75476215 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0031
a0001c0001t0060
a0001c0001t0031
a0001c0001t0060
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HG06807.hp1
NA19043.hp1
HG03471.hp1
HG06807.hp1
NA19043.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2426T>C
c.*2426T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2426 chr16 75476215
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G
 A
A
 30 a0001c0001t0002
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others(27): Show 
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others(87): Show 
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NA19067.hp1
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NA19086.hp1
NA19087.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2327C>T
c.*2327C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2327 chr16 75476314
chr16:75476353 A
A
 C
C
 4 a0001c0001t0073
a0001c0001t0074
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others(1): Show 
a0001c0001t0073
a0001c0001t0074
a0001c0001t0097
a0001c0004t0022
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HG02280.hp1
HG02717.hp1
others(4): Show 
HG00738.hp2
HG02280.hp1
HG02717.hp1
HG02896.hp2
HG03041.hp1
HG03579.hp2
NA21309.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2288T>G
c.*2288T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2288 chr16 75476353
chr16:75476431 G
G
 C
C
 1 a0001c0014t0081
a0001c0014t0081
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2210C>G
c.*2210C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2210 chr16 75476431
chr16:75476540 G
G
 A
A
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a0001c0001t0082
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
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c.*2101C>T
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chr16:75476560 C
C
 CA
CA
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a0001c0001t0017
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c.*2080dupT
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chr16:75476560 C
C
 CAA
CAA
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c.*2079_*2080dupTT
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CA
 C
C
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c.*2080delT
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CAA
 C
C
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a0001c0001t0027
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c.*2079_*2080delTT
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chr16:75476560 CAAA
CAAA
 C
C
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a0001c0001t0042
a0001c0001t0014
a0001c0001t0042
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HG01433.hp2
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c.*2078_*2080delTTT
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others(6): Show 
CAAAAAAAAAAAAA
 C
C
 1 a0001c0001t0101
a0001c0001t0101
 1 NA18989.hp1
NA18989.hp1
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others(9): Show 
c.*2068_*2080delTTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 2068 chr16 75476560
chr16:75476560 CAAAAAAA
others(7): Show 
CAAAAAAAAAAAAAA
 C
C
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a0001c0001t0038
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a0001c0001t0029
a0001c0001t0038
a0001c0001t0076
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HG02132.hp1
NA18953.hp1
NA18968.hp2
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others(10): Show 
c.*2067_*2080delTTTTTTTTTTTTTT
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chr16:75476617 G
G
 C
C
 53 a0001c0001t0001
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a0001c0001t0003
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NA18942.hp1
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NA19079.hp1
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 A
A
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HG02293.hp2
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HG02738.hp1
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NA18957.hp2
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NA18967.hp2
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NA18969.hp2
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NA18977.hp2
NA18979.hp1
NA18983.hp2
NA18984.hp1
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NA18987.hp1
NA18987.hp2
NA18989.hp2
NA18990.hp1
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NA19011.hp2
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NA19064.hp2
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NA19076.hp2
NA19079.hp1
NA19079.hp2
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NA19085.hp1
NA19085.hp2
NA19086.hp2
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NA20805.hp1
NA20805.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1566T>G
c.*1566T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1566 chr16 75477075
chr16:75477176 A
A
 G
G
 1 a0001c0005t0050
a0001c0005t0050
 1 HG02965.hp2
HG02965.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1465T>C
c.*1465T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1465 chr16 75477176
chr16:75477215 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0014
a0001c0001t0014
 6 HG01433.hp2
HG02280.hp2
HG02486.hp2
others(3): Show 
HG01433.hp2
HG02280.hp2
HG02486.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02723.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1426C>A
c.*1426C>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1426 chr16 75477215
chr16:75477264 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0079
a0001c0001t0080
a0001c0001t0079
a0001c0001t0080
 2 NA19000.hp2
NA19005.hp2
NA19000.hp2
NA19005.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1377G>A
c.*1377G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1377 chr16 75477264
chr16:75477266 C
C
 T
T
 1 a0001c0004t0022
a0001c0004t0022
 4 HG02280.hp1
HG02896.hp2
HG03041.hp1
others(1): Show 
HG02280.hp1
HG02896.hp2
HG03041.hp1
HG03579.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1375G>A
c.*1375G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1375 chr16 75477266
chr16:75477267 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0076
a0001c0001t0076
 1 NA18953.hp1
NA18953.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1374C>T
c.*1374C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1374 chr16 75477267
chr16:75477361 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0049
a0001c0001t0049
 1 HG03942.hp2
HG03942.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1280G>A
c.*1280G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1280 chr16 75477361
chr16:75477583 C
C
 T
T
 4 a0001c0003t0045
a0001c0003t0046
a0001c0003t0047
others(1): Show 
a0001c0003t0045
a0001c0003t0046
a0001c0003t0047
a0001c0003t0048
 4 HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03688.hp1
others(1): Show 
HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03688.hp1
HG03710.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1058G>A
c.*1058G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1058 chr16 75477583
chr16:75477594 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0014
a0001c0001t0014
 6 HG01433.hp2
HG02280.hp2
HG02486.hp2
others(3): Show 
HG01433.hp2
HG02280.hp2
HG02486.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02723.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1047G>T
c.*1047G>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 1047 chr16 75477594
chr16:75477686 G
G
 A
A
 7 a0001c0001t0014
a0001c0001t0015
a0001c0001t0019
others(4): Show 
a0001c0001t0014
a0001c0001t0015
a0001c0001t0019
a0001c0001t0027
a0001c0001t0042
a0001c0001t0098
a0001c0001t0099
 20 HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
others(17): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG02055.hp1
HG02145.hp1
HG02280.hp2
HG02451.hp2
HG02486.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02615.hp1
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02896.hp1
HG02965.hp1
HG03453.hp1
HG03579.hp1
NA18522.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*955C>T
c.*955C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 955 chr16 75477686
chr16:75478035 C
C
 T
T
 4 a0001c0003t0045
a0001c0003t0046
a0001c0003t0047
others(1): Show 
a0001c0003t0045
a0001c0003t0046
a0001c0003t0047
a0001c0003t0048
 4 HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03688.hp1
others(1): Show 
HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03688.hp1
HG03710.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*606G>A
c.*606G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 606 chr16 75478035
chr16:75478092 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0078
a0001c0001t0078
 1 HG02738.hp1
HG02738.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*549G>C
c.*549G>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 549 chr16 75478092
chr16:75478151 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0044
a0001c0001t0044
 1 NA18998.hp2
NA18998.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*490G>A
c.*490G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 490 chr16 75478151
chr16:75478264 C
C
 T
T
 8 a0001c0001t0008
a0001c0001t0021
a0001c0001t0032
others(5): Show 
a0001c0001t0008
a0001c0001t0021
a0001c0001t0032
a0001c0001t0077
a0001c0001t0102
a0001c0001t0110
a0001c0001t0111
a0001c0001t0112
 18 HG00597.hp2
HG00639.hp2
HG01070.hp1
others(15): Show 
HG00597.hp2
HG00639.hp2
HG01070.hp1
HG01261.hp2
HG01928.hp1
HG01978.hp2
HG01981.hp1
HG02083.hp1
HG02129.hp1
HG02165.hp1
HG02293.hp2
HG02300.hp1
HG03927.hp2
NA18612.hp1
NA18948.hp2
NA18950.hp1
NA18992.hp1
NA19079.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*377G>A
c.*377G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 377 chr16 75478264
chr16:75478394 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0100
a0001c0001t0100
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*247C>T
c.*247C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 247 chr16 75478394
chr16:75478398 G
G
 GC
GC
 58 a0001c0001t0001
a0001c0001t0003
a0001c0001t0005
others(55): Show 
a0001c0001t0001
a0001c0001t0003
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a0001c0001t0008
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a0001c0001t0090
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a0001c0001t0100
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a0001c0001t0110
a0001c0001t0111
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a0001c0001t0113
a0001c0001t0114
a0001c0001t0115
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a0001c0010t0001
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a0002c0002t0093
a0002c0002t0096
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a0007c0012t0003
 199 HG00099.hp1
HG00099.hp2
HG00140.hp1
others(196): Show 
HG00099.hp1
HG00099.hp2
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00280.hp2
HG00323.hp1
HG00323.hp2
HG00423.hp1
HG00558.hp2
HG00597.hp1
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HG00639.hp2
HG00642.hp2
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HG00673.hp2
HG00735.hp1
HG00735.hp2
HG00738.hp1
HG00738.hp2
HG01069.hp2
HG01070.hp1
HG01074.hp1
HG01074.hp2
HG01081.hp1
HG01081.hp2
HG01106.hp1
HG01106.hp2
HG01123.hp2
HG01192.hp1
HG01192.hp2
HG01243.hp2
HG01255.hp2
HG01256.hp1
HG01256.hp2
HG01257.hp2
HG01261.hp1
HG01261.hp2
HG01433.hp2
HG01496.hp1
HG01496.hp2
HG01515.hp1
HG01515.hp2
HG01517.hp2
HG01884.hp2
HG01928.hp1
HG01928.hp2
HG01934.hp1
HG01978.hp1
HG01978.hp2
HG01981.hp1
HG01993.hp1
HG01993.hp2
HG02015.hp1
HG02015.hp2
HG02040.hp1
HG02040.hp2
HG02055.hp1
HG02056.hp1
HG02056.hp2
HG02074.hp1
HG02074.hp2
HG02080.hp1
HG02083.hp1
HG02129.hp1
HG02129.hp2
HG02132.hp2
HG02135.hp2
HG02145.hp2
HG02165.hp1
HG02258.hp1
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HG02280.hp2
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HG02300.hp2
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HG02559.hp2
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HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02698.hp2
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HG02895.hp1
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HG03041.hp1
HG03098.hp1
HG03098.hp2
HG03195.hp1
HG03225.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
HG03490.hp1
HG03491.hp1
HG03491.hp2
HG03540.hp1
HG03579.hp2
HG03669.hp2
HG03688.hp2
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HG03942.hp1
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NA18612.hp1
NA18612.hp2
NA18747.hp1
NA18906.hp2
NA18941.hp2
NA18942.hp1
NA18947.hp1
NA18948.hp2
NA18949.hp1
NA18950.hp1
NA18951.hp1
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NA18954.hp2
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NA18967.hp2
NA18969.hp1
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NA18977.hp2
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NA18987.hp2
NA18989.hp2
NA18990.hp1
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NA18994.hp2
NA18995.hp1
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NA19011.hp2
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NA19084.hp2
NA19085.hp1
NA19085.hp2
NA19087.hp1
NA19240.hp2
NA20129.hp1
NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20805.hp1
NA20805.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*242_*243insG
c.*242_*243insG
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 242 chr16 75478398
chr16:75478502 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0038
a0001c0001t0101
a0001c0001t0038
a0001c0001t0101
 3 HG02132.hp1
NA18968.hp2
NA18989.hp1
HG02132.hp1
NA18968.hp2
NA18989.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*139A>G
c.*139A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 3/3 139 chr16 75478502
chr16:75481863 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0043
a0001c0001t0043
 1 HG03831.hp1
HG03831.hp1
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-63T>C
c.-63T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/3 2035 chr16 75481863
chr16:75481878 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0015
a0001c0001t0019
a0001c0001t0027
others(1): Show 
a0001c0001t0015
a0001c0001t0019
a0001c0001t0027
a0001c0001t0042
 12 HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
others(9): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
HG02145.hp1
HG02451.hp2
HG02615.hp1
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02896.hp1
HG03453.hp1
HG03579.hp1
NA18522.hp1
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-78T>C
c.-78T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/3 2050 chr16 75481878
chr16:75495076 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0102
a0001c0001t0102
 1 HG02083.hp1
HG02083.hp1
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-228C>G
c.-228C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/3 15248 chr16 75495076
chr16:75495273 T
T
 TG
TG
 18 a0001c0001t0018
a0001c0001t0023
a0001c0001t0039
others(15): Show 
a0001c0001t0018
a0001c0001t0023
a0001c0001t0039
a0001c0001t0103
a0001c0001t0104
a0001c0001t0105
a0001c0001t0106
a0001c0001t0107
a0001c0001t0108
a0001c0001t0109
a0001c0001t0110
a0001c0001t0111
a0001c0001t0112
a0001c0001t0113
a0001c0001t0114
a0001c0001t0115
a0001c0001t0116
a0005c0009t0018
 25 HG00597.hp2
HG00609.hp2
HG01256.hp2
others(22): Show 
HG00597.hp2
HG00609.hp2
HG01256.hp2
HG02132.hp2
HG02451.hp1
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HG02886.hp1
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NA18979.hp1
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NA19079.hp1
NA19080.hp1
NA19080.hp2
NA19086.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-426dupC
c.-426dupC
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/3 15446 chr16 75495273
chr16:75495361 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0116
a0001c0001t0116
 1 HG00609.hp2
HG00609.hp2
 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant LOW c.-513C>T
c.-513C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/3 chr16 75495361
chr16:75495362 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0116
a0001c0001t0116
 1 HG00609.hp2
HG00609.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-514C>T
c.-514C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/3 15534 chr16 75495362
chr16:75495436 C
C
 G
G
 3 a0001c0001t0027
a0001c0001t0040
a0001c0001t0041
a0001c0001t0027
a0001c0001t0040
a0001c0001t0041
 4 HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG03098.hp2
others(1): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG03098.hp2
HG03540.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-588G>C
c.-588G>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/3 15608 chr16 75495436

chr:pos ref alt #
# of ghapid:genebody level
 ghapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid genebody_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr16:75479891 AT
AT
 A
A
 6 a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0020g0300
a0001c0001t0020g0304
others(3): Show 
a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0020g0300
a0001c0001t0020g0304
a0001c0001t0031g0317
a0001c0001t0031g0327
a0001c0001t0060g0306
 6 HG02970.hp1
HG03471.hp1
HG06807.hp1
others(3): Show 
HG02970.hp1
HG03471.hp1
HG06807.hp1
NA19043.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-16-48delA
c.-16-48delA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75479891
chr16:75479962 G
G
 C
C
 1 a0001c0005t0050g0205
a0001c0005t0050g0205
 1 HG02965.hp2
HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-16-118C>G
c.-16-118C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75479962
chr16:75479986 C
C
 T
T
 12 a0001c0001t0015g0058
a0001c0001t0015g0059
a0001c0001t0015g0290
others(9): Show 
a0001c0001t0015g0058
a0001c0001t0015g0059
a0001c0001t0015g0290
a0001c0001t0015g0309
a0001c0001t0015g0328
a0001c0001t0019g0062
a0001c0001t0019g0295
a0001c0001t0019g0303
a0001c0001t0019g0307
a0001c0001t0027g0014
a0001c0001t0027g0015
a0001c0001t0042g0244
 12 HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
others(9): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
HG02145.hp1
HG02451.hp2
HG02615.hp1
HG02622.hp2
HG02717.hp2
HG02896.hp1
HG03453.hp1
HG03579.hp1
NA18522.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-16-142G>A
c.-16-142G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75479986
chr16:75480073 CATGTGAG
others(13): Show 
CATGTGAGTCCTACCTTCTTA
 C
C
 38 a0001c0001t0008g0156
a0001c0001t0015g0058
a0001c0001t0015g0059
others(35): Show 
a0001c0001t0008g0156
a0001c0001t0015g0058
a0001c0001t0015g0059
a0001c0001t0015g0290
a0001c0001t0015g0309
a0001c0001t0015g0328
a0001c0001t0017g0305
a0001c0001t0017g0308
a0001c0001t0017g0316
a0001c0001t0017g0319
a0001c0001t0019g0062
a0001c0001t0019g0295
a0001c0001t0019g0303
a0001c0001t0019g0307
a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0020g0300
a0001c0001t0020g0304
a0001c0001t0025g0019
a0001c0001t0025g0296
a0001c0001t0025g0299
a0001c0001t0027g0014
a0001c0001t0027g0015
a0001c0001t0028g0043
a0001c0001t0028g0291
a0001c0001t0031g0317
a0001c0001t0031g0327
a0001c0001t0037g0314
a0001c0001t0037g0315
a0001c0001t0040g0013
a0001c0001t0042g0244
a0001c0001t0053g0105
a0001c0001t0060g0306
a0001c0001t0061g0030
a0001c0001t0073g0066
a0001c0001t0074g0293
a0001c0005t0030g0020
a0001c0005t0030g0321
a0001c0005t0050g0205
 38 HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
others(35): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
HG02055.hp2
HG02145.hp1
HG02257.hp2
HG02300.hp1
HG02451.hp2
HG02572.hp1
HG02615.hp1
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02717.hp1
HG02717.hp2
HG02809.hp1
HG02896.hp1
HG02922.hp1
HG02965.hp2
HG02970.hp1
HG02970.hp2
HG03130.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03516.hp1
HG03516.hp2
HG03540.hp1
HG03540.hp2
HG03579.hp1
HG06807.hp1
NA18522.hp1
NA18522.hp2
NA18906.hp1
NA19043.hp1
NA19056.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp2
NA20300.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-16-249_-16-230del
others(20): Show 
c.-16-249_-16-230delTAAGAAGGTAGGACTCACAT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480073
chr16:75480162 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0097g0302
a0001c0001t0100g0038
a0001c0001t0097g0302
a0001c0001t0100g0038
 2 HG00738.hp2
HG02145.hp2
HG00738.hp2
HG02145.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-16-318T>C
c.-16-318T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480162
chr16:75480338 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0097g0302
a0001c0001t0100g0038
a0001c0001t0097g0302
a0001c0001t0100g0038
 2 HG00738.hp2
HG02145.hp2
HG00738.hp2
HG02145.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-16-494G>A
c.-16-494G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480338
chr16:75480394 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0069g0025
a0001c0001t0069g0025
 1 HG02818.hp1
HG02818.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-16-550C>T
c.-16-550C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480394
chr16:75480459 T
T
 C
C
 11 a0001c0001t0015g0058
a0001c0001t0015g0059
a0001c0001t0015g0290
others(8): Show 
a0001c0001t0015g0058
a0001c0001t0015g0059
a0001c0001t0015g0290
a0001c0001t0015g0309
a0001c0001t0015g0328
a0001c0001t0019g0062
a0001c0001t0019g0295
a0001c0001t0019g0303
a0001c0001t0027g0014
a0001c0001t0027g0015
a0001c0001t0042g0244
 11 HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
others(8): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
HG02145.hp1
HG02451.hp2
HG02615.hp1
HG02717.hp2
HG02896.hp1
HG03453.hp1
HG03579.hp1
NA18522.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-16-615A>G
c.-16-615A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480459
chr16:75480562 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0118
 1 HG02165.hp2
HG02165.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-16-718T>G
c.-16-718T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480562
chr16:75480570 A
A
 AT
AT
 185 a0001c0001t0001g0002
a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0009
others(182): Show 
a0001c0001t0001g0002
a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0009
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0039
a0001c0001t0001g0072
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0076
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0084
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NA20300.hp1
NA21309.hp2
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c.-16-727delA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480570
chr16:75480655 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0005g0049
a0001c0001t0005g0240
a0001c0001t0005g0049
a0001c0001t0005g0240
 2 HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG01081.hp2
HG01934.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-16-811C>T
c.-16-811C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480655
chr16:75480658 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0072
a0001c0001t0001g0072
 1 NA18954.hp1
NA18954.hp1
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c.-16-814C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480658
chr16:75480666 C
C
 T
T
 11 a0001c0001t0010g0004
a0001c0001t0010g0029
a0001c0001t0010g0047
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a0001c0001t0010g0029
a0001c0001t0010g0047
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HG01517.hp1
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HG01516.hp2
HG01517.hp1
HG01891.hp2
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c.-16-822G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480666
chr16:75480676 C
C
 G
G
 1 a0005c0009t0018g0342
a0005c0009t0018g0342
 1 HG02698.hp2
HG02698.hp2
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c.-16-832G>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480676
chr16:75480813 C
C
 A
A
 4 a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0002g0277
a0001c0001t0002g0279
others(1): Show 
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a0001c0001t0002g0277
a0001c0001t0002g0279
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 4 HG00741.hp2
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HG01981.hp2
others(1): Show 
HG00741.hp2
HG01516.hp1
HG01981.hp2
HG02257.hp1
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c.-16-969G>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480813
chr16:75480855 G
G
 A
A
 1 a0001c0014t0081g0017
a0001c0014t0081g0017
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
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c.-17+962C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480855
chr16:75480896 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0011g0046
a0001c0001t0011g0046
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HG03486.hp2
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c.-17+921G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480896
chr16:75480915 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0007g0322
a0001c0001t0007g0322
 1 HG02886.hp2
HG02886.hp2
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c.-17+902T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480915
chr16:75480920 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0037g0314
a0001c0001t0037g0315
a0001c0001t0037g0314
a0001c0001t0037g0315
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HG03540.hp1
HG02647.hp1
HG03540.hp1
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c.-17+897A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480920
chr16:75480927 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0118
 1 HG02165.hp2
HG02165.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-17+890G>T
c.-17+890G>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480927
chr16:75480927 C
C
 CA
CA
 38 a0001c0001t0002g0288
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a0001c0001t0010g0029
others(35): Show 
a0001c0001t0002g0288
a0001c0001t0010g0004
a0001c0001t0010g0029
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 39 HG01099.hp2
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others(36): Show 
HG01099.hp2
HG01433.hp2
HG01516.hp2
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NA19240.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-17+889dupT
c.-17+889dupT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480927
chr16:75480927 C
C
 CAA
CAA
 13 a0001c0001t0014g0021
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others(10): Show 
a0001c0001t0014g0021
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 13 HG02280.hp1
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others(10): Show 
HG02280.hp1
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HG02622.hp1
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NA18522.hp2
NA18906.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-17+888_-17+889dup
others(2): Show 
c.-17+888_-17+889dupTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480927
chr16:75480933 AAAAAAAA
others(7): Show 
AAAAAAAAAAAAAAG
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0122
a0001c0001t0001g0122
 1 NA18957.hp2
NA18957.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-17+870_-17+883del
others(14): Show 
c.-17+870_-17+883delCTTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480933
chr16:75480935 AAAAAAAA
others(10): Show 
AAAAAAAAAAAAGAAAAG
 A
A
 1 a0001c0001t0064g0220
a0001c0001t0064g0220
 1 HG00280.hp1
HG00280.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-17+865_-17+881del
others(17): Show 
c.-17+865_-17+881delCTTTTCTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480935
chr16:75480942 A
A
 AAG
AAG
 8 a0001c0001t0008g0114
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others(5): Show 
a0001c0001t0008g0114
a0001c0001t0021g0116
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 8 HG00280.hp2
HG02083.hp1
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others(5): Show 
HG00280.hp2
HG02083.hp1
HG02165.hp1
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NA18950.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-17+874_-17+875ins
others(2): Show 
c.-17+874_-17+875insCT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 2/2 chr16 75480942
chr16:75480942 A
A
 AG
AG
 174 a0001c0001t0001g0002
a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0009
others(171): Show 
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A
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a0001c0001t0097g0302
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T
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0222
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G
 A
A
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C
 A
A
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HG02647.hp1
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C
 T
T
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C
 T
T
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G
 A
A
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G
 A
A
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 CTAT
CTAT
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T
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T
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C
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C
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A
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c.-91-950C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75482841
chr16:75482847 G
G
 A
A
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a0001c0005t0050g0205
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HG02965.hp2
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c.-91-956C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75482847
chr16:75482867 A
A
 G
G
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others(3): Show 
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a0001c0001t0099g0332
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others(3): Show 
HG02055.hp1
HG02280.hp1
HG02896.hp2
HG02965.hp1
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c.-91-976T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75482867
chr16:75482873 C
C
 T
T
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a0001c0001t0062g0135
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HG04199.hp2
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c.-91-982G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75482873
chr16:75482894 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0134
a0001c0001t0002g0134
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NA18964.hp2
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c.-91-1003G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75482894
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G
 A
A
 2 a0001c0001t0037g0314
a0001c0001t0037g0315
a0001c0001t0037g0314
a0001c0001t0037g0315
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HG03540.hp1
HG02647.hp1
HG03540.hp1
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c.-91-1088C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75482979
chr16:75483005 G
G
 A
A
 6 a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
a0001c0004t0022g0022
others(3): Show 
a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
a0001c0004t0022g0022
a0001c0004t0022g0053
a0001c0004t0022g0201
a0001c0004t0022g0204
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HG02280.hp1
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others(3): Show 
HG02055.hp1
HG02280.hp1
HG02896.hp2
HG02965.hp1
HG03041.hp1
HG03579.hp2
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c.-91-1114C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75483005
chr16:75483072 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0183
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NA18952.hp1
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c.-91-1181G>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75483072
chr16:75483073 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0140
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HG02135.hp2
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c.-91-1182C>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75483073
chr16:75483217 G
G
 C
C
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others(3): Show 
a0001c0001t0002g0211
a0001c0001t0002g0214
a0001c0001t0002g0276
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others(3): Show 
HG00741.hp2
HG01070.hp2
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c.-91-1326C>G
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chr16:75483311 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0069g0025
a0001c0001t0069g0025
 1 HG02818.hp1
HG02818.hp1
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c.-91-1420C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75483311
chr16:75483317 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
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HG02965.hp1
HG02055.hp1
HG02965.hp1
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c.-91-1426C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75483317
chr16:75483574 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0063g0294
a0001c0001t0063g0294
 1 HG02615.hp2
HG02615.hp2
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c.-91-1683T>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75483574
chr16:75483654 A
A
 C
C
 12 a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0020g0300
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others(9): Show 
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a0001c0001t0020g0300
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others(9): Show 
HG02055.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
HG02922.hp1
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c.-91-1763T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75483654
chr16:75483960 G
G
 T
T
 2 a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
 2 HG02055.hp1
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HG02055.hp1
HG02965.hp1
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c.-91-2069C>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75483960
chr16:75484005 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
 2 HG02055.hp1
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HG02055.hp1
HG02965.hp1
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c.-91-2114G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484005
chr16:75484030 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0106
 1 NA18969.hp2
NA18969.hp2
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c.-91-2139T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484030
chr16:75484091 A
A
 T
T
 12 a0001c0001t0015g0058
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others(9): Show 
a0001c0001t0015g0058
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a0001c0001t0015g0309
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others(9): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
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NA18522.hp1
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c.-91-2200T>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484091
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C
 T
T
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a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
a0001c0001t0089g0099
a0001c0001t0098g0202
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HG02965.hp1
HG00673.hp1
HG02055.hp1
HG02965.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-91-2204G>A
c.-91-2204G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484095
chr16:75484165 C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0020g0300
a0001c0001t0020g0304
a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0020g0300
a0001c0001t0020g0304
 3 HG02970.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp2
HG02970.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-91-2274G>A
c.-91-2274G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484165
chr16:75484167 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0181
a0001c0001t0002g0181
 1 NA19006.hp2
NA19006.hp2
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c.-91-2276C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484167
chr16:75484209 C
C
 A
A
 11 a0001c0001t0015g0058
a0001c0001t0015g0059
a0001c0001t0015g0290
others(8): Show 
a0001c0001t0015g0058
a0001c0001t0015g0059
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 11 HG01069.hp1
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others(8): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01109.hp1
HG02145.hp1
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HG02717.hp2
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HG03579.hp1
NA18522.hp1
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c.-91-2318G>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484209
chr16:75484228 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0086
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HG02129.hp2
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G
 A
A
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 C
C
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G
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A
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HG03540.hp1
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G
 A
A
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HG02055.hp1
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C
 T
T
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NA19043.hp1
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c.-91-2762G>A
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A
 G
G
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HG06807.hp1
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c.-91-2905T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484796
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G
 A
A
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a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
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HG02055.hp1
HG02965.hp1
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CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484823
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C
 T
T
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a0001c0001t0010g0029
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HG02647.hp2
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c.-91-2963G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
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HG02055.hp1
HG02965.hp1
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c.-91-2979G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75484870
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G
 A
A
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HG02647.hp2
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c.-91-3052C>T
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 T
T
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HG02630.hp2
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c.-91-3227G>A
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T
 C
C
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HG02647.hp1
HG03540.hp1
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A
 G
G
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c.-91-3408T>C
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 C
C
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A
 C
C
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T
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c.-91-3829A>C
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A
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A
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T
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HG04184.hp2
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AG
 A
A
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c.-91-3963delC
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C
 T
T
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c.-91-3967G>A
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T
 C
C
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HG02976.hp2
NA19043.hp1
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C
 A
A
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G
 A
A
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a0001c0001t0031g0327
a0001c0001t0072g0292
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HG02976.hp2
NA19043.hp1
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C
 T
T
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a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
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HG02055.hp1
HG02965.hp1
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c.-91-4291G>A
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C
 T
T
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C
 T
T
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NA20752.hp1
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A
 G
G
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C
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a0001c0001t0098g0202
a0001c0001t0099g0332
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c.-91-4510A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0072g0292
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HG02976.hp2
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 C
C
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G
 A
A
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HG03130.hp1
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c.-91-4876C>T
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GT
 G
G
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c.-91-4958delA
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G
 A
A
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C
 T
T
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HG03041.hp2
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c.-91-5221G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0011g0046
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HG03486.hp2
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c.-91-5228C>T
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 A
A
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C
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T
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T
 C
C
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A
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A
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A
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 A
A
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C
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C
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T
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T
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0121
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TA
 T
T
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A
 G
G
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A
 G
G
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a0001c0001t0017g0305
a0001c0001t0017g0316
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NA18906.hp1
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 A
A
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a0001c0001t0011g0186
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NA19030.hp2
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 C
C
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HG02055.hp2
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A
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a0001c0001t0003g0223
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G
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G
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a0001c0001t0001g0039
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HG00323.hp1
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c.-91-6293G>C
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C
 G
G
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NA18948.hp2
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c.-91-6308G>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488199
chr16:75488309 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0190
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NA18906.hp2
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c.-91-6418G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0235
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NA19011.hp2
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c.-91-6454A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488345
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G
 C
C
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a0001c0011t0006g0208
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HG02486.hp1
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0297
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HG02976.hp1
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c.-92+6518T>C
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 A
A
 131 a0001c0001t0001g0002
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c.-92+6516C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488424
chr16:75488469 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0110g0348
a0001c0001t0110g0348
 1 HG00597.hp2
HG00597.hp2
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c.-92+6471G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488469
chr16:75488475 GA
GA
 G
G
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a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0158
a0001c0001t0002g0279
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HG01981.hp2
NA18951.hp1
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c.-92+6464delT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488475
chr16:75488563 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0261
a0001c0001t0004g0261
 1 HG01123.hp1
HG01123.hp1
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c.-92+6377C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488563
chr16:75488586 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0285
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others(5): Show 
a0001c0001t0003g0061
a0001c0001t0004g0285
a0001c0001t0010g0029
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 8 HG01891.hp2
HG02145.hp2
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others(5): Show 
HG01891.hp2
HG02145.hp2
HG02622.hp2
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NA21309.hp1
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c.-92+6354G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488586
chr16:75488766 ATGAGGTC
others(1488): Show 
ATGAGGTCTGTAATGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGA
GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCTAGATCACGCCATTGCACTCCAGCCTGGGC
AACAAGAGTGAAACTTCGTCTCAAAGAAAAACAAAACCAAAAACAAAACA
TAAAACATAAAGATGGAAGGTGAGTGTTCATGGGGGGCAGGAACAAGGAA
CCCCTGCAAACATCATCTATGAGGGTTTCCTACATGCCCAGTCTTTCCCA
TCCATTTTCTGATTTGATCCTCACAGCAACCCTATGACATGGACCTGATG
ATCATCCCTATTTTATAGATGAGGAAAGTGAGGTGTAGAAAAATTAAGGG
AGGCAGGGCATGGTGACTGATGCCTGTAATCACAGCACTTTGGGAGGCCG
AGGCGGGCGGATTACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGACAACA
TGACGAAACCCCAACTGTACTAAAAATACAAAAATTAGCTAGGCGTGGTG
GTGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCGTGAAGATGAGGCAGAAGAATCGC
TTGAGCCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCAC
TCCAGCCTGGGCAACAAAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAGAAAAAAGAAAAGGGACTTGCGGGAAGAATTCACACAGTGGCTGCT
GAGTCAGAGTTGGAAGTCTAGCAGTGTAACCTTGGAGCTCTTCGCTACAT
AGTGTCAAGTGGAAAACAGAAGTAACAAAGCTGACATACATATATACATT
TCTCCCATCTGTGTGTGTTCTTAGATGTGCATGTATTTTTCACACAGTTG
GCTGGGTGTTAAAAATACACGAATATCAAAGAACACTCACAGATGGGAGA
AAACAGTTGCAAATCATGTCTACAGAATGGGACTTGTACCCAGAATATAA
GAAGAGCTCTTACAACTCAACACAAAATAGGCAAATATCCTATTTAGTTT
TTTAAGAATAAGCATATTTAAGAAATATAAGAATAAATAAATTTAAGAAT
GAATAAAGAAAAAAATTAAAATGAGTAAAGGATTTGGGAGAAGTTTCTCT
GAAGAAGATACACAAATGGAAAGATGCTCAACCAGGCGCAGTGGCCCATG
CCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGTGTGGATCACCTGAGGT
CAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTA
AAAATACCAAAAACTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGCACCTGTAATCCCAGC
TACTCGGCGGGGAGGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAG
TGAGCCAAGGTTGTGCCATTGCATTCTAGCCTGGGGAACAAGAGCGAGAC
TTTGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGGGCACAGTGGCTCA
CGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCTGGTGGATCACC
 A
A
 1 a0001c0001t0019g0295
a0001c0001t0019g0295
 1 HG02615.hp1
HG02615.hp1
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others(2): Show 
c.-92+4679_-92+6173del
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488766
chr16:75488822 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0190
 1 NA18906.hp2
NA18906.hp2
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c.-92+6118C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488822
chr16:75488833 G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0003g0031
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0003g0031
a0001c0001t0005g0032
a0001c0001t0006g0033
 6 HG00140.hp1
HG01978.hp1
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others(3): Show 
HG00140.hp1
HG01978.hp1
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02293.hp1
NA20752.hp1
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c.-92+6107C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488833
chr16:75488844 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0274
a0001c0001t0004g0274
 1 HG01433.hp1
HG01433.hp1
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c.-92+6096C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488844
chr16:75488883 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0087g0213
a0001c0001t0087g0213
 1 HG02015.hp2
HG02015.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+6057C>T
c.-92+6057C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75488883
chr16:75489081 T
T
 C
C
 8 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0039
a0001c0001t0003g0324
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0039
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 9 HG00280.hp2
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others(6): Show 
HG00280.hp2
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c.-92+5859A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489081
chr16:75489313 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0031g0317
a0001c0001t0031g0317
 1 HG06807.hp1
HG06807.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+5627G>A
c.-92+5627G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489313
chr16:75489314 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0006g0203
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a0001c0001t0006g0203
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HG02630.hp1
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HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+5626C>T
c.-92+5626C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489314
chr16:75489370 G
G
 C
C
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 8 HG01106.hp2
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HG01109.hp1
HG02622.hp2
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c.-92+5570C>G
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chr16:75489398 C
C
 CA
CA
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a0001c0001t0003g0061
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HG01243.hp1
HG01261.hp2
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c.-92+5541dupT
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chr16:75489398 CA
CA
 C
C
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a0001c0001t0002g0090
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HG01070.hp2
HG01169.hp2
HG01192.hp1
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c.-92+5541delT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489398
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CAA
 C
C
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HG01978.hp1
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NA20752.hp1
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others(4): Show 
c.-92+5540_-92+5541delTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489398
chr16:75489414 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0112g0341
a0001c0001t0112g0341
 1 NA18948.hp2
NA18948.hp2
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c.-92+5526T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489414
chr16:75489427 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0023g0336
a0001c0001t0023g0336
 1 NA18984.hp1
NA18984.hp1
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c.-92+5513C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489427
chr16:75489454 A
A
 G
G
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others(3): Show 
a0001c0001t0005g0036
a0001c0001t0005g0067
a0001c0001t0010g0029
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 6 HG01884.hp2
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others(3): Show 
HG01884.hp2
HG02647.hp2
HG02809.hp2
HG03225.hp2
HG03471.hp2
NA20300.hp1
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c.-92+5486T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489454
chr16:75489505 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0023g0356
a0001c0001t0023g0356
 1 NA18994.hp1
NA18994.hp1
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c.-92+5435G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489505
chr16:75489508 C
C
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0034
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0003g0031
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HG01978.hp1
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others(3): Show 
HG00140.hp1
HG01978.hp1
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02293.hp1
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+5432G>T
c.-92+5432G>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489508
chr16:75489512 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0010g0029
a0001c0001t0061g0030
a0001c0001t0010g0029
a0001c0001t0061g0030
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NA20300.hp1
HG02647.hp2
NA20300.hp1
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c.-92+5428T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489512
chr16:75489610 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0082g0331
a0001c0001t0082g0331
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+5330G>A
c.-92+5330G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489610
chr16:75489762 G
G
 GT
GT
 35 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0003g0324
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others(32): Show 
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0003g0324
a0001c0001t0003g0325
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 36 HG00280.hp2
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others(33): Show 
HG00280.hp2
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01433.hp2
HG01884.hp1
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HG02280.hp1
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HG02818.hp1
HG02886.hp2
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HG02965.hp1
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HG02970.hp2
HG03098.hp2
HG03130.hp1
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NA18906.hp1
NA18941.hp2
NA19004.hp1
NA19012.hp2
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+5177dupA
c.-92+5177dupA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489762
chr16:75489969 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0011g0065
a0001c0001t0011g0065
 1 HG03688.hp2
HG03688.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+4971C>G
c.-92+4971C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75489969
chr16:75490005 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0167
a0001c0001t0001g0167
 1 NA18977.hp2
NA18977.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+4935G>A
c.-92+4935G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490005
chr16:75490006 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0312
a0001c0001t0002g0312
 1 HG03130.hp2
HG03130.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+4934C>T
c.-92+4934C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490006
chr16:75490092 G
G
 A
A
 10 a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0003g0031
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0003g0031
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 11 HG00140.hp1
HG01978.hp1
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others(8): Show 
HG00140.hp1
HG01978.hp1
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02293.hp1
HG02630.hp2
HG02809.hp2
HG03195.hp2
HG03471.hp2
NA19030.hp2
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+4848C>T
c.-92+4848C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490092
chr16:75490149 G
G
 A
A
 10 a0001c0001t0006g0203
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others(7): Show 
a0001c0001t0006g0203
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 10 HG01069.hp1
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others(7): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG02055.hp1
HG02280.hp1
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HG02965.hp2
HG03098.hp2
HG03540.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+4791C>T
c.-92+4791C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490149
chr16:75490173 C
C
 CA
CA
 48 a0001c0001t0001g0297
a0001c0001t0002g0115
a0001c0001t0002g0287
others(45): Show 
a0001c0001t0001g0297
a0001c0001t0002g0115
a0001c0001t0002g0287
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A
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c.-92+4739C>T
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A
 T
T
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A
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a0001c0001t0002g0146
 1 NA18985.hp2
NA18985.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+4688C>T
c.-92+4688C>T
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chr16:75490298 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0109g0347
a0001c0001t0109g0347
 1 HG02451.hp1
HG02451.hp1
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c.-92+4642C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490298
chr16:75490331 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0010g0313
a0001c0001t0010g0313
 1 HG04184.hp2
HG04184.hp2
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c.-92+4609T>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490331
chr16:75490419 G
G
 C
C
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a0001c0001t0009g0147
 1 NA19076.hp1
NA19076.hp1
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c.-92+4521C>G
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chr16:75490452 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0287
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HG01106.hp2
HG01109.hp1
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c.-92+4488A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0190
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HG00735.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-92+4467G>A
c.-92+4467G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490473
chr16:75490537 C
C
 T
T
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a0001c0003t0047g0096
 1 HG03710.hp2
HG03710.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+4403G>A
c.-92+4403G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490537
chr16:75490607 T
T
 C
C
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a0001c0001t0003g0083
 1 HG02074.hp2
HG02074.hp2
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c.-92+4333A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490607
chr16:75490779 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0222
a0001c0001t0002g0222
 1 NA18747.hp2
NA18747.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+4161G>A
c.-92+4161G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490779
chr16:75490797 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0148
a0001c0001t0003g0148
 1 NA19084.hp2
NA19084.hp2
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c.-92+4143A>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490797
chr16:75490941 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0007g0322
a0001c0001t0007g0322
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HG02886.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3999A>C
c.-92+3999A>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490941
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T
 C
C
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a0001c0001t0005g0036
a0001c0001t0010g0029
a0001c0001t0061g0030
 3 HG01884.hp2
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HG01884.hp2
HG02647.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+3965A>G
c.-92+3965A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75490975
chr16:75491152 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0090g0255
a0001c0001t0090g0255
 1 NA20805.hp2
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3788A>G
c.-92+3788A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491152
chr16:75491161 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0008g0193
a0001c0001t0008g0193
 1 NA18612.hp1
NA18612.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+3779C>G
c.-92+3779C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491161
chr16:75491165 T
T
 TA
TA
 10 a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0238
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others(7): Show 
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0238
a0001c0001t0002g0257
a0001c0001t0003g0272
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 10 HG00323.hp2
HG01192.hp1
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others(7): Show 
HG00323.hp2
HG01192.hp1
HG01255.hp1
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NA18984.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-92+3774dupT
c.-92+3774dupT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
chr16:75491165 T
T
 TAA
TAA
 13 a0001c0001t0001g0260
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others(10): Show 
a0001c0001t0001g0260
a0001c0001t0004g0239
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 13 HG00423.hp2
HG00597.hp2
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others(10): Show 
HG00423.hp2
HG00597.hp2
HG00609.hp2
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NA19080.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3773_-92+3774d
others(4): Show 
c.-92+3773_-92+3774dupTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
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TA
 T
T
 12 a0001c0001t0001g0080
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others(9): Show 
a0001c0001t0001g0080
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 13 HG00558.hp2
HG02074.hp2
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others(10): Show 
HG00558.hp2
HG02074.hp2
HG02132.hp1
HG02135.hp1
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NA18954.hp2
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NA18977.hp2
NA18989.hp1
NA19085.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3774delT
c.-92+3774delT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
chr16:75491165 TAA
TAA
 T
T
 8 a0001c0001t0003g0209
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others(5): Show 
a0001c0001t0003g0209
a0001c0001t0004g0154
a0001c0001t0005g0286
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 8 HG00280.hp1
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others(5): Show 
HG00280.hp1
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HG03834.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3773_-92+3774d
others(4): Show 
c.-92+3773_-92+3774delTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
chr16:75491165 TAAAA
TAAAA
 T
T
 8 a0001c0001t0002g0287
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others(5): Show 
a0001c0001t0002g0287
a0001c0001t0002g0288
a0001c0001t0004g0219
a0001c0001t0005g0289
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 8 HG01243.hp1
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others(5): Show 
HG01243.hp1
HG01891.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.-92+3771_-92+3774d
others(6): Show 
c.-92+3771_-92+3774delTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
chr16:75491165 TAAAAAAA
others(3): Show 
TAAAAAAAAAA
 T
T
 3 a0001c0001t0004g0318
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a0001c0001t0004g0318
a0001c0001t0007g0326
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 3 HG01884.hp1
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NA19043.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+3765_-92+3774d
others(12): Show 
c.-92+3765_-92+3774delTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
chr16:75491165 TAAAAAAA
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TAAAAAAAAAAA
 T
T
 3 a0001c0001t0031g0317
a0001c0001t0037g0314
a0001c0001t0037g0315
a0001c0001t0031g0317
a0001c0001t0037g0314
a0001c0001t0037g0315
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HG03540.hp1
HG06807.hp1
HG02647.hp1
HG03540.hp1
HG06807.hp1
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c.-92+3764_-92+3774delTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
chr16:75491165 TAAAAAAA
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TAAAAAAAAAAAA
 T
T
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a0001c0001t0003g0324
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HG02074.hp1
HG02965.hp1
NA18906.hp1
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c.-92+3763_-92+3774delTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
chr16:75491165 TAAAAAAA
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TAAAAAAAAAAAAA
 T
T
 1 a0001c0001t0014g0323
a0001c0001t0014g0323
 1 HG02486.hp2
HG02486.hp2
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c.-92+3762_-92+3774delTTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491165
chr16:75491173 AAAAAAAA
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AAAAAAAAAAAAAAAAAAATAT
 A
A
 7 a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0003g0206
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a0001c0001t0001g0003
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0003g0206
a0001c0001t0003g0207
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 8 HG00140.hp1
HG00280.hp2
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HG00140.hp1
HG00280.hp2
HG01978.hp1
HG02273.hp1
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c.-92+3746_-92+3766delATATTTTTTTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491173
chr16:75491175 AAAAAAAA
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AAAAAAAAAAAAAAAAATATAT
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0031
a0001c0001t0003g0031
 1 NA20752.hp1
NA20752.hp1
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others(23): Show 
c.-92+3744_-92+3764delATATATTTTTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491175
chr16:75491176 A
A
 AATATATA
others(7): Show 
AATATATATATATAT
 1 a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0020g0200
 1 NA20129.hp2
NA20129.hp2
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others(16): Show 
c.-92+3763_-92+3764insATATATATATATAT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491176
chr16:75491176 A
A
 T
T
 1 a0001c0014t0081g0017
a0001c0014t0081g0017
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3764T>A
c.-92+3764T>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491176
chr16:75491176 AAAAAAAA
others(9): Show 
AAAAAAAAAAAAAAAAT
 A
A
 2 a0001c0001t0006g0203
a0001c0004t0022g0204
a0001c0001t0006g0203
a0001c0004t0022g0204
 2 HG02630.hp1
HG02896.hp2
HG02630.hp1
HG02896.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3748_-92+3763d
others(18): Show 
c.-92+3748_-92+3763delATTTTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491176
chr16:75491176 AAAAAAAA
others(13): Show 
AAAAAAAAAAAAAAAATATAT
 A
A
 1 a0001c0001t0069g0025
a0001c0001t0069g0025
 1 HG02818.hp1
HG02818.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+3744_-92+3763d
others(22): Show 
c.-92+3744_-92+3763delATATATTTTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491176
chr16:75491178 A
A
 T
T
 2 a0001c0001t0020g0200
a0001c0014t0081g0017
a0001c0001t0020g0200
a0001c0014t0081g0017
 2 HG02809.hp2
NA20129.hp2
HG02809.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3762T>A
c.-92+3762T>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491178
chr16:75491178 AAAAAAAA
others(9): Show 
AAAAAAAAAAAAAATAT
 A
A
 1 a0001c0005t0050g0205
a0001c0005t0050g0205
 1 HG02965.hp2
HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3746_-92+3761d
others(18): Show 
c.-92+3746_-92+3761delATATTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491178
chr16:75491178 AAAAAAAA
others(11): Show 
AAAAAAAAAAAAAATATAT
 A
A
 2 a0001c0001t0004g0026
a0001c0001t0033g0027
a0001c0001t0004g0026
a0001c0001t0033g0027
 2 HG03209.hp1
HG03453.hp2
HG03209.hp1
HG03453.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3744_-92+3761d
others(20): Show 
c.-92+3744_-92+3761delATATATTTTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491178
chr16:75491180 A
A
 T
T
 4 a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0026g0018
a0001c0004t0022g0201
others(1): Show 
a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0026g0018
a0001c0004t0022g0201
a0001c0014t0081g0017
 4 HG02280.hp1
HG02809.hp2
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others(1): Show 
HG02280.hp1
HG02809.hp2
HG03471.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3760T>A
c.-92+3760T>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491180
chr16:75491180 AAAAAAAA
others(5): Show 
AAAAAAAAAAAAT
 A
A
 3 a0001c0001t0003g0329
a0001c0001t0003g0330
a0001c0001t0015g0328
a0001c0001t0003g0329
a0001c0001t0003g0330
a0001c0001t0015g0328
 3 HG02451.hp2
HG02523.hp1
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HG02451.hp2
HG02523.hp1
HG02602.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3748_-92+3759d
others(14): Show 
c.-92+3748_-92+3759delATTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491180
chr16:75491180 AAAAAAAA
others(7): Show 
AAAAAAAAAAAATAT
 A
A
 1 a0001c0001t0082g0331
a0001c0001t0082g0331
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+3746_-92+3759d
others(16): Show 
c.-92+3746_-92+3759delATATTTTTTTTTTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491180
chr16:75491182 A
A
 T
T
 4 a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0026g0018
a0001c0004t0022g0201
others(1): Show 
a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0026g0018
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 4 HG02280.hp1
HG02809.hp2
HG03471.hp2
others(1): Show 
HG02280.hp1
HG02809.hp2
HG03471.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3758T>A
c.-92+3758T>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491182
chr16:75491184 A
A
 AT
AT
 3 a0001c0001t0001g0094
a0001c0001t0008g0095
a0001c0001t0012g0068
a0001c0001t0001g0094
a0001c0001t0008g0095
a0001c0001t0012g0068
 3 HG01261.hp2
HG02040.hp1
NA18990.hp1
HG01261.hp2
HG02040.hp1
NA18990.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+3755_-92+3756i
others(3): Show 
c.-92+3755_-92+3756insA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491184
chr16:75491184 A
A
 ATAT
ATAT
 3 a0001c0001t0001g0175
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a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0083g0070
a0002c0002t0096g0089
 3 HG00735.hp1
NA18612.hp2
NA19056.hp2
HG00735.hp1
NA18612.hp2
NA19056.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3755_-92+3756i
others(5): Show 
c.-92+3755_-92+3756insATA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491184
chr16:75491184 A
A
 T
T
 7 a0001c0001t0020g0200
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others(4): Show 
a0001c0001t0020g0200
a0001c0001t0026g0018
a0001c0001t0029g0177
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others(4): Show 
HG02055.hp1
HG02280.hp1
HG02809.hp2
HG03471.hp2
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NA19066.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3756T>A
c.-92+3756T>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491184
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A
 AT
AT
 39 a0001c0001t0001g0002
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0035
others(36): Show 
a0001c0001t0001g0002
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0035
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a0001c0001t0002g0001
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 45 HG00423.hp1
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others(42): Show 
HG00423.hp1
HG00558.hp1
HG00621.hp1
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HG01070.hp1
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HG02083.hp1
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HG02135.hp2
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NA18941.hp1
NA18947.hp1
NA18947.hp2
NA18949.hp1
NA18949.hp2
NA18950.hp2
NA18951.hp2
NA18952.hp1
NA18961.hp1
NA18961.hp2
NA18964.hp2
NA18970.hp1
NA18974.hp1
NA18985.hp2
NA18987.hp1
NA18987.hp2
NA18992.hp1
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NA19004.hp2
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NA19076.hp1
NA19084.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+3753_-92+3754i
others(3): Show 
c.-92+3753_-92+3754insA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491186
chr16:75491186 A
A
 ATAT
ATAT
 11 a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0178
a0001c0001t0002g0103
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0178
a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0109
a0001c0001t0006g0110
a0001c0001t0021g0111
a0001c0001t0035g0108
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a0001c0003t0045g0107
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 11 HG01167.hp1
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others(8): Show 
HG01167.hp1
HG01169.hp2
HG03927.hp2
NA18968.hp1
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others(5): Show 
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A
 ATATATAT
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ATATATATATATATAT
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a0001c0001t0051g0088
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NA19012.hp1
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c.-92+3753_-92+3754insATATATATATATATA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491186
chr16:75491186 A
A
 T
T
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a0001c0001t0001g0076
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a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0076
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HG00609.hp1
HG00673.hp1
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chr16:75491188 A
A
 AATATATA
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A
 AATATATA
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NA19006.hp1
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 AATATATA
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 AATATATA
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AATATATATATATATATAT
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HG01192.hp2
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chr16:75491188 A
A
 AT
AT
 8 a0001c0001t0001g0086
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a0001c0001t0001g0086
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HG00621.hp2
HG00642.hp1
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c.-92+3751_-92+3752insA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491188
chr16:75491188 A
A
 ATAT
ATAT
 6 a0001c0001t0007g0151
a0001c0001t0010g0029
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a0001c0001t0007g0151
a0001c0001t0010g0029
a0001c0001t0010g0191
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HG01109.hp1
HG02647.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-92+3751_-92+3752i
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c.-92+3751_-92+3752insATA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491188
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A
 T
T
 124 a0001c0001t0001g0002
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a0001c0001t0001g0016
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a0001c0001t0001g0009
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others(130): Show 
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NA19063.hp1
NA19063.hp2
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NA19068.hp2
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NA19087.hp2
NA20129.hp2
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c.-92+3752T>A
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AAAATAT
 A
A
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a0001c0001t0005g0298
a0001c0001t0011g0301
a0001c0001t0020g0300
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HG02976.hp1
HG03195.hp1
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A
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A
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A
 AAAAAAAA
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AAAAAAAAATATATAT
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A
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NA21309.hp2
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A
 AAAAAAAT
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HG03453.hp1
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A
 AAAAAAAT
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A
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A
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NA18967.hp1
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A
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A
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a0001c0001t0007g0052
a0001c0001t0026g0051
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A
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HG01891.hp2
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A
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A
 AAAAT
AAAAT
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a0001c0001t0018g0339
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A
 AAAATATA
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AAAATATATAT
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a0001c0001t0007g0055
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HG02818.hp2
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CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491190
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A
 AAAATATA
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AAAATATATATATAT
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a0001c0001t0003g0045
a0001c0001t0005g0067
a0001c0001t0011g0046
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HG01243.hp2
HG03225.hp2
HG03486.hp2
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others(16): Show 
c.-92+3749_-92+3750insATATATATATATTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491190
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A
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AAATATATATATAT
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c.-92+3749_-92+3750insATATATATATATT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491190
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A
 AT
AT
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a0001c0001t0010g0313
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a0001c0001t0005g0216
a0001c0001t0010g0313
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NA18968.hp2
HG00738.hp1
HG04184.hp2
NA18968.hp2
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others(3): Show 
c.-92+3749_-92+3750insA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491190
chr16:75491190 A
A
 ATAT
ATAT
 6 a0001c0001t0002g0211
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a0001c0001t0002g0211
a0001c0001t0005g0212
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HG01070.hp2
HG01074.hp2
HG01978.hp2
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others(5): Show 
c.-92+3749_-92+3750insATA
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491190
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A
 ATATATAT
others(4): Show 
ATATATATATAT
 1 a0001c0001t0023g0336
a0001c0001t0023g0336
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NA18984.hp1
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others(13): Show 
c.-92+3749_-92+3750insATATATATATA
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A
 T
T
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a0001c0001t0001g0016
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a0001c0001t0001g0002
a0001c0001t0001g0009
a0001c0001t0001g0016
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A
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A
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A
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T
 A
A
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T
 A
A
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c.-92+3722A>T
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T
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TAA
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T
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TATAA
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A
 T
T
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a0001c0001t0039g0335
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HG02132.hp2
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c.-92+3720T>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491220
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A
 T
T
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HG01884.hp2
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c.-92+3719T>A
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C
 A
A
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HG03490.hp2
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c.-92+3708G>T
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G
 T
T
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NA19030.hp2
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c.-92+3674C>A
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C
 G
G
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HG01069.hp2
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c.-92+3486G>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0079g0174
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NA19005.hp2
NA19010.hp2
NA19063.hp1
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c.-92+3379G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491561
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T
 A
A
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a0001c0001t0006g0028
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HG03041.hp2
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c.-92+3241A>T
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T
 C
C
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T
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c.-92+3048G>A
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G
 A
A
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A
 C
C
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c.-92+3037T>G
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A
 C
C
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NA18949.hp2
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A
 C
C
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NA18990.hp1
NA18949.hp2
NA18990.hp1
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c.-92+3035T>G
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G
 T
T
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NA18990.hp1
NA18949.hp2
NA18990.hp1
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c.-92+3033C>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491907
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G
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NA18990.hp1
NA18949.hp2
NA18990.hp1
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others(12): Show 
c.-92+3031_-92+3032insTGGGAGTGTG
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491908
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G
 C
C
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a0001c0001t0006g0069
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NA18990.hp1
NA18949.hp2
NA18990.hp1
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c.-92+3026C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491914
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G
 T
T
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a0001c0001t0006g0069
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 2 NA18949.hp2
NA18990.hp1
NA18949.hp2
NA18990.hp1
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c.-92+3024C>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75491916
chr16:75491937 A
A
 C
C
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C
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A
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G
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C
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C
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G
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C
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G
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A
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c.-92+1423dupT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493516
chr16:75493516 C
C
 CAA
CAA
 15 a0001c0001t0001g0009
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0178
others(12): Show 
a0001c0001t0001g0009
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0178
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HG00621.hp1
HG00738.hp2
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others(4): Show 
c.-92+1422_-92+1423dupTT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493516
chr16:75493516 CA
CA
 C
C
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a0001c0001t0006g0028
a0001c0001t0011g0186
others(3): Show 
a0001c0001t0005g0187
a0001c0001t0006g0028
a0001c0001t0011g0186
a0001c0001t0016g0188
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 6 HG02630.hp2
HG03041.hp2
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others(3): Show 
HG02630.hp2
HG03041.hp2
HG03195.hp2
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NA19030.hp2
NA19065.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+1423delT
c.-92+1423delT
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493516
chr16:75493539 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0017g0305
a0001c0001t0019g0307
a0001c0001t0060g0306
a0001c0001t0017g0305
a0001c0001t0019g0307
a0001c0001t0060g0306
 3 HG02622.hp2
HG03471.hp1
HG03516.hp1
HG02622.hp2
HG03471.hp1
HG03516.hp1
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c.-92+1401T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493539
chr16:75493570 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0005g0187
a0001c0001t0011g0186
a0001c0001t0016g0188
a0001c0001t0005g0187
a0001c0001t0011g0186
a0001c0001t0016g0188
 3 HG02630.hp2
HG03195.hp2
NA19030.hp2
HG02630.hp2
HG03195.hp2
NA19030.hp2
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c.-92+1370C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493570
chr16:75493576 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
 1 HG04204.hp1
HG04204.hp1
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c.-92+1364C>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493576
chr16:75493578 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0019g0303
a0001c0001t0019g0303
 1 HG01109.hp1
HG01109.hp1
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c.-92+1362A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493578
chr16:75493626 G
G
 A
A
 33 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0003g0324
a0001c0001t0003g0325
others(30): Show 
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a0001c0001t0003g0324
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a0001c0001t0007g0322
a0001c0001t0007g0326
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a0001c0005t0030g0321
a0001c0005t0050g0205
 34 HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01433.hp2
others(31): Show 
HG01069.hp1
HG01071.hp1
HG01433.hp2
HG01884.hp1
HG02055.hp1
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HG02083.hp2
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NA18906.hp1
NA18941.hp2
NA19004.hp1
NA19012.hp2
NA19030.hp1
NA19043.hp1
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c.-92+1314C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493626
chr16:75493632 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0190
 1 NA18906.hp2
NA18906.hp2
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c.-92+1308A>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493632
chr16:75493632 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0014g0311
a0001c0001t0095g0310
a0001c0001t0014g0311
a0001c0001t0095g0310
 2 HG01106.hp2
HG02723.hp1
HG01106.hp2
HG02723.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+1308A>G
c.-92+1308A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493632
chr16:75493657 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0020g0304
a0001c0001t0020g0304
 1 HG02970.hp1
HG02970.hp1
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c.-92+1283T>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493657
chr16:75493663 C
C
 T
T
 23 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0003g0324
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others(20): Show 
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0003g0324
a0001c0001t0003g0325
a0001c0001t0003g0329
a0001c0001t0003g0330
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a0001c0001t0004g0318
a0001c0001t0007g0322
a0001c0001t0007g0326
a0001c0001t0014g0320
a0001c0001t0014g0323
a0001c0001t0015g0328
a0001c0001t0017g0316
a0001c0001t0017g0319
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a0001c0001t0031g0327
a0001c0001t0033g0027
a0001c0001t0037g0314
a0001c0001t0037g0315
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a0001c0001t0082g0331
a0001c0001t0099g0332
a0001c0005t0030g0321
 24 HG01433.hp2
HG01884.hp1
HG02074.hp1
others(21): Show 
HG01433.hp2
HG01884.hp1
HG02074.hp1
HG02083.hp2
HG02451.hp2
HG02486.hp2
HG02523.hp1
HG02602.hp2
HG02647.hp1
HG02809.hp1
HG02818.hp1
HG02886.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
HG03209.hp1
HG03453.hp2
HG03540.hp1
HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA18941.hp2
NA19004.hp1
NA19012.hp2
NA19030.hp1
NA19043.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+1277G>A
c.-92+1277G>A
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493663
chr16:75493896 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0010g0191
a0001c0001t0010g0191
 1 HG04228.hp1
HG04228.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+1044C>T
c.-92+1044C>T
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493896
chr16:75493905 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0014g0024
a0001c0001t0014g0024
 1 HG02559.hp2
HG02559.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+1035G>C
c.-92+1035G>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493905
chr16:75493937 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0192
a0001c0001t0004g0192
 1 HG03209.hp2
HG03209.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+1003A>G
c.-92+1003A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493937
chr16:75493991 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0023
a0001c0001t0002g0023
 1 NA19004.hp2
NA19004.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-92+949G>C
c.-92+949G>C
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75493991
chr16:75494021 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0004g0285
a0001c0001t0014g0283
a0001c0013t0003g0284
a0001c0001t0004g0285
a0001c0001t0014g0283
a0001c0013t0003g0284
 3 HG02572.hp2
HG03486.hp1
NA21309.hp1
HG02572.hp2
HG03486.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-92+919A>G
c.-92+919A>G
CHST6 ENSG00000183196.10 transcript ENST00000332272.9 protein_coding 1/2 chr16 75494021
chr16:75494031 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0008g0193
a0001c0001t0008g0193
 1 NA18612.hp1
NA18612.hp1
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c.-92+909C>G
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T
 C
C
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G
 A
A
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C
 T
T
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c.-92+804G>A
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T
 G
G
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A
 T
T
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 T
T
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c.-92+332C>A
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C
 T
T
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