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chr1:158976369	T T	G G	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-332T>G c.6-332T>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976369
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chr1:158976371	T T	A A	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-330T>A c.6-330T>A	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976371
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chr1:158976380	A A	G G	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-321A>G c.6-321A>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976380
chr1:158976383	A A	C C	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-318A>C c.6-318A>C	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976383
chr1:158976384	G G	T T	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-317G>T c.6-317G>T	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976384
chr1:158976388	C C	G G	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-313C>G c.6-313C>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976388
chr1:158976389	C C	A A	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-312C>A c.6-312C>A	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976389
chr1:158976392	T T	A A	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-309T>A c.6-309T>A	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976392
chr1:158976393	T T	A A	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-308T>A c.6-308T>A	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976393
chr1:158976394	A A	G G	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-307A>G c.6-307A>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976394
chr1:158976396	C C	G G	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-305C>G c.6-305C>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976396
chr1:158976399	T T	C C	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-302T>C c.6-302T>C	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976399
chr1:158976402	T T	A A	3	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0008g0047 a0001c0001t0008g0160 a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0008g0047 a0001c0001t0008g0160	3	HG02683.hp2 NA18986.hp2 NA20805.hp1 HG02683.hp2 NA18986.hp2 NA20805.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.6-299T>A c.6-299T>A	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976402
chr1:158976403	C C	A A	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-298C>A c.6-298C>A	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976403
chr1:158976404	G G	C C	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-297G>C c.6-297G>C	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976404
chr1:158976405	T T	C C	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-296T>C c.6-296T>C	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976405
chr1:158976408	G G	T T	1	a0001c0003t0001g0090 a0001c0003t0001g0090	1	HG03239.hp1 HG03239.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.6-293G>T c.6-293G>T	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976408
chr1:158976412	C C	G G	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-289C>G c.6-289C>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976412
chr1:158976426	T T	G G	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-275T>G c.6-275T>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976426
chr1:158976429	A A	T T	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-272A>T c.6-272A>T	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976429
chr1:158976435	T T	G G	1	a0001c0001t0003g0050 a0001c0001t0003g0050	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.6-266T>G c.6-266T>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976435
chr1:158976489	A A	G G	1	a0001c0001t0001g0314 a0001c0001t0001g0314	1	HG04115.hp1 HG04115.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.6-212A>G c.6-212A>G	PYHIN1	ENSG00000163564.15	transcript	ENST00000368140.6	protein_coding	8/8		chr1	158976489

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer PYHIN1_chr1_158926552_158982059

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) PYHIN1_chr1_158926552_158982059

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 4)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 8)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 29)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 373)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 8)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 36)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 375)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 398)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 4)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 38)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 629)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)