Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr1:32669321	T T	C C	1	a0001c0004 a0001c0004	3	HG02559.hp1 HG03139.hp2 HG03486.hp2 HG02559.hp1 HG03139.hp2 HG03486.hp2	synonymous_variant	LOW	c.852T>C c.852T>C	p.Tyr284Tyr p.Tyr284Tyr	RBBP4	ENSG00000162521.19	transcript	ENST00000373493.10	protein_coding	7/12	951/7883	852/1278	284/425	chr1	32669321
chr1:32669324	T T	C C	1	a0001c0005 a0001c0005	1	HG00733.hp2 HG00733.hp2	synonymous_variant	LOW	c.855T>C c.855T>C	p.Ser285Ser p.Ser285Ser	RBBP4	ENSG00000162521.19	transcript	ENST00000373493.10	protein_coding	7/12	954/7883	855/1278	285/425	chr1	32669324

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chr1:32679847	C C	T T	4	a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0001t0053 others(1): Show a0001c0001t0004 a0001c0001t0007 a0001c0001t0053 a0001c0001t0054	37	HG00423.hp1 HG00544.hp1 HG00621.hp2 others(34): Show HG00423.hp1 HG00544.hp1 HG00621.hp2 HG00642.hp1 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG01123.hp1 HG01168.hp2 HG01261.hp1 HG01496.hp2 HG01928.hp2 HG01943.hp2 HG01975.hp2 HG01981.hp2 HG02015.hp1 HG02132.hp1 HG02293.hp2 HG03669.hp2 NA18946.hp2 NA18947.hp1 NA18950.hp2 NA18961.hp1 NA18964.hp2 NA18969.hp2 NA18973.hp2 NA18977.hp1 NA18979.hp2 NA18982.hp2 NA18987.hp1 NA18989.hp1 NA18993.hp1 NA18994.hp2 NA19065.hp1 NA19074.hp2 NA19079.hp2 NA19084.hp2 NA19085.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.142C>T c.142C>T	RBBP4	ENSG00000162521.19	transcript	ENST00000373493.10	protein_coding	12/12	142		chr1	32679847
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chr1:32679385	G G	C C	1	a0001c0001t0001g0131 a0001c0001t0001g0131	1	HG02165.hp2 HG02165.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1213-255G>C c.1213-255G>C	RBBP4	ENSG00000162521.19	transcript	ENST00000373493.10	protein_coding	11/11		chr1	32679385
chr1:32679401	C C	T T	3	a0001c0001t0032g0047 a0001c0001t0033g0049 a0001c0001t0034g0048 a0001c0001t0032g0047 a0001c0001t0033g0049 a0001c0001t0034g0048	3	HG01109.hp2 HG02809.hp2 HG03453.hp1 HG01109.hp2 HG02809.hp2 HG03453.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1213-239C>T c.1213-239C>T	RBBP4	ENSG00000162521.19	transcript	ENST00000373493.10	protein_coding	11/11		chr1	32679401
chr1:32679435	A A	G G	3	a0001c0004t0005g0032 a0001c0004t0005g0034 a0001c0004t0005g0037 a0001c0004t0005g0032 a0001c0004t0005g0034 a0001c0004t0005g0037	3	HG02559.hp1 HG03139.hp2 HG03486.hp2 HG02559.hp1 HG03139.hp2 HG03486.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1213-205A>G c.1213-205A>G	RBBP4	ENSG00000162521.19	transcript	ENST00000373493.10	protein_coding	11/11		chr1	32679435
chr1:32679480	C C	T T	2	a0001c0001t0049g0090 a0001c0001t0050g0141 a0001c0001t0049g0090 a0001c0001t0050g0141	2	NA18964.hp1 NA19010.hp1 NA18964.hp1 NA19010.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1213-160C>T c.1213-160C>T	RBBP4	ENSG00000162521.19	transcript	ENST00000373493.10	protein_coding	11/11		chr1	32679480

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JoGo Online Haplotype Explorer RBBP4_chr1_32646208_32691211

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 54)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 267)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 5)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 55)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 274)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 312)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 0)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 62)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 403)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)