Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr15:43194634	A A	C C	1	a0001c0001t0004g0085 a0001c0001t0004g0085	1	NA18966.hp2 NA18966.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.969-93A>C c.969-93A>C	CCNDBP1	ENSG00000166946.14	transcript	ENST00000300213.9	protein_coding	10/10		chr15	43194634

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JoGo Online Haplotype Explorer CCNDBP1_chr15_43180403_43202177

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 7)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 19)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 189)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 7)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 25)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 226)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 358)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 16)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 101)

External Link

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)