Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr20:62289269	C C	T T	1	a0001c0006 a0001c0006	1	NA19043.hp1 NA19043.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1188C>T c.1188C>T	p.Thr396Thr p.Thr396Thr	OSBPL2	ENSG00000130703.17	transcript	ENST00000313733.9	protein_coding	12/14	1393/3944	1188/1443	396/480	chr20	62289269

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chr20:62294283	G G	A A	4	a0001c0001t0003 a0001c0006t0003 a0001c0007t0003 others(1): Show a0001c0001t0003 a0001c0006t0003 a0001c0007t0003 a0002c0003t0003	41	HG00741.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp2 others(38): Show HG00741.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01074.hp1 HG01081.hp2 HG01106.hp2 HG01175.hp1 HG01358.hp2 HG01496.hp2 HG01891.hp1 HG01975.hp2 HG01993.hp2 HG02056.hp2 HG02109.hp1 HG02145.hp2 HG02622.hp1 HG02717.hp1 HG02717.hp2 HG02723.hp1 HG02809.hp1 HG02818.hp2 HG02886.hp2 HG02897.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp1 HG03017.hp2 HG03195.hp1 HG03209.hp2 HG03453.hp1 HG03486.hp2 HG03516.hp1 HG03579.hp1 HG03579.hp2 HG03669.hp1 NA18966.hp2 NA19007.hp2 NA19030.hp1 NA19043.hp1 NA20300.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.396G>A c.396G>A	OSBPL2	ENSG00000130703.17	transcript	ENST00000313733.9	protein_coding	14/14	396		chr20	62294283
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JoGo Online Haplotype Explorer OSBPL2_chr20_62233521_62301183

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 4)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 7)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 28)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 324)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 7)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 32)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 327)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 348)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 23)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 766)

External Link

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)