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chr16:68298692	G G	C C	1	a0001c0001t0015 a0001c0001t0015	1	NA18977.hp1 NA18977.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1364G>C c.1364G>C	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	1364		chr16	68298692
chr16:68298798	T T	A A	1	a0002c0002t0016 a0002c0002t0016	1	HG06807.hp1 HG06807.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1470T>A c.1470T>A	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	1470		chr16	68298798
chr16:68298844	G G	A A	14	a0001c0001t0001 a0001c0001t0006 a0001c0001t0010 others(11): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0006 a0001c0001t0010 a0001c0001t0011 a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 a0001c0001t0017 a0001c0001t0018 a0001c0001t0019 a0001c0001t0020 a0001c0006t0001 a0004c0007t0001 a0005c0005t0001 a0006c0004t0001	133	HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00408.hp2 others(130): Show HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00408.hp2 HG00438.hp1 HG00558.hp1 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG00639.hp2 HG00733.hp1 HG00735.hp2 HG00738.hp2 HG01069.hp2 HG01070.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01109.hp2 HG01192.hp1 HG01255.hp2 HG01256.hp1 HG01257.hp1 HG01258.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp2 HG01346.hp2 HG01433.hp1 HG01496.hp1 HG01515.hp1 HG01517.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01943.hp1 HG01943.hp2 HG01952.hp2 HG01975.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG01993.hp1 HG02004.hp1 HG02004.hp2 HG02027.hp1 HG02056.hp1 HG02056.hp2 HG02071.hp1 HG02074.hp2 HG02080.hp2 HG02132.hp2 HG02257.hp1 HG02258.hp1 HG02280.hp2 HG02293.hp2 HG02451.hp1 HG02486.hp1 HG02523.hp1 HG02523.hp2 HG02559.hp2 HG02572.hp1 HG02602.hp2 HG02615.hp1 HG02630.hp1 HG02647.hp2 HG02698.hp2 HG02735.hp1 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG02976.hp2 HG03017.hp1 HG03041.hp2 HG03130.hp1 HG03130.hp2 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03195.hp2 HG03453.hp1 HG03471.hp1 HG03654.hp1 HG03704.hp2 HG03710.hp2 HG03831.hp1 HG03831.hp2 HG03834.hp1 HG03927.hp1 HG03942.hp2 HG04115.hp1 HG04199.hp1 HG04204.hp2 HG04228.hp1 HG04228.hp2 NA18906.hp1 NA18940.hp2 NA18942.hp1 NA18948.hp1 NA18948.hp2 NA18949.hp2 NA18950.hp2 NA18952.hp1 NA18953.hp2 NA18956.hp2 NA18959.hp2 NA18961.hp1 NA18961.hp2 NA18963.hp1 NA18963.hp2 NA18969.hp1 NA18969.hp2 NA18970.hp1 NA18970.hp2 NA18973.hp1 NA18977.hp1 NA18977.hp2 NA18991.hp2 NA18994.hp2 NA18995.hp1 NA19000.hp2 NA19004.hp2 NA19010.hp1 NA19043.hp1 NA19055.hp1 NA19057.hp2 NA19060.hp2 NA19064.hp2 NA19065.hp2 NA19066.hp2 NA19079.hp1 NA19079.hp2 NA19089.hp1 NA19090.hp1 NA19091.hp2 NA20129.hp2 NA20752.hp1 NA20905.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1516G>A c.1516G>A	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	1516		chr16	68298844
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chr16:68299019	G G	T T	1	a0001c0001t0020 a0001c0001t0020	1	NA19090.hp1 NA19090.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1691G>T c.1691G>T	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	1691		chr16	68299019
chr16:68299634	A A	G G	1	a0001c0001t0019 a0001c0001t0019	1	HG03139.hp2 HG03139.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2306A>G c.2306A>G	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	2306		chr16	68299634
chr16:68299710	G G	A A	1	a0001c0001t0008 a0001c0001t0008	3	HG02055.hp1 HG03486.hp1 HG03579.hp1 HG02055.hp1 HG03486.hp1 HG03579.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2382G>A c.2382G>A	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	2382		chr16	68299710
chr16:68299751	G G	A A	1	a0001c0001t0018 a0001c0001t0018	1	HG00621.hp1 HG00621.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2423G>A c.2423G>A	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	2423		chr16	68299751
chr16:68300044	C C	G G	1	a0001c0001t0025 a0001c0001t0025	1	HG03209.hp2 HG03209.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2716C>G c.2716C>G	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	2716		chr16	68300044
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chr16:68300096	G G	T T	2	a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009	6	HG01433.hp2 HG02055.hp1 HG03471.hp2 others(3): Show HG01433.hp2 HG02055.hp1 HG03471.hp2 HG03486.hp1 HG03579.hp1 NA19030.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2768G>T c.2768G>T	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	2768		chr16	68300096
chr16:68300130	T T	C C	1	a0001c0001t0010 a0001c0001t0010	2	HG02056.hp2 HG02523.hp1 HG02056.hp2 HG02523.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2802T>C c.2802T>C	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	2802		chr16	68300130
chr16:68300162	A A	C C	1	a0001c0001t0011 a0001c0001t0011	2	HG01257.hp1 HG01258.hp1 HG01257.hp1 HG01258.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2834A>C c.2834A>C	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	2834		chr16	68300162
chr16:68300522	C C	T T	1	a0001c0001t0024 a0001c0001t0024	1	HG02280.hp1 HG02280.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3194C>T c.3194C>T	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	3194		chr16	68300522
chr16:68300527	T T	C C	1	a0001c0001t0021 a0001c0001t0021	1	HG03540.hp2 HG03540.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3199T>C c.3199T>C	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	3199		chr16	68300527
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chr16:68300661	T T	C C	2	a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009	6	HG01433.hp2 HG02055.hp1 HG03471.hp2 others(3): Show HG01433.hp2 HG02055.hp1 HG03471.hp2 HG03486.hp1 HG03579.hp1 NA19030.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3333T>C c.3333T>C	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	11/11	3333		chr16	68300661
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chr16:68296064	T T	C C	13	a0001c0001t0004g0007 a0001c0001t0004g0028 a0001c0001t0004g0029 others(10): Show a0001c0001t0004g0007 a0001c0001t0004g0028 a0001c0001t0004g0029 a0001c0001t0004g0030 a0001c0001t0004g0031 a0001c0001t0008g0071 a0001c0001t0008g0072 a0001c0001t0008g0073 a0001c0001t0009g0067 a0001c0001t0009g0068 a0001c0001t0009g0070 a0003c0003t0004g0232 a0003c0003t0004g0233	14	HG00741.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp2 others(11): Show HG00741.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp2 HG01346.hp1 HG01433.hp2 HG02055.hp1 HG02895.hp1 HG03041.hp1 HG03225.hp2 HG03471.hp2 HG03486.hp1 HG03579.hp1 NA19030.hp1 NA20752.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1120-300T>C c.1120-300T>C	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	8/10		chr16	68296064
chr16:68296094	G G	A A	136	a0001c0001t0001g0002 a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0008 others(133): Show a0001c0001t0001g0002 a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0008 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0011 a0001c0001t0001g0013 a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0016 a0001c0001t0001g0017 a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0042 a0001c0001t0001g0043 a0001c0001t0001g0044 a0001c0001t0001g0045 a0001c0001t0001g0047 a0001c0001t0001g0066 a0001c0001t0001g0069 a0001c0001t0001g0081 a0001c0001t0001g0082 a0001c0001t0001g0083 a0001c0001t0001g0087 a0001c0001t0001g0090 a0001c0001t0001g0091 a0001c0001t0001g0092 a0001c0001t0001g0093 a0001c0001t0001g0095 a0001c0001t0001g0096 a0001c0001t0001g0097 a0001c0001t0001g0098 a0001c0001t0001g0099 a0001c0001t0001g0100 a0001c0001t0001g0102 a0001c0001t0001g0103 a0001c0001t0001g0104 a0001c0001t0001g0107 a0001c0001t0001g0108 a0001c0001t0001g0109 a0001c0001t0001g0110 a0001c0001t0001g0111 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chr16:68297103	G G	C C	1	a0001c0001t0001g0152 a0001c0001t0001g0152	1	NA19043.hp1 NA19043.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1454-131G>C c.1454-131G>C	SLC7A6	ENSG00000103064.15	transcript	ENST00000219343.11	protein_coding	10/10		chr16	68297103

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer SLC7A6_chr16_68259526_68306819

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) SLC7A6_chr16_68259526_68306819

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 6)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 7)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 26)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 249)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 7)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 32)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 253)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 282)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 5)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 26)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 311)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)