Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr14:21268351	G G	A A	1	a0001c0001t0001g0370 a0001c0001t0001g0370	1	HG02630.hp1 HG02630.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-63+947C>T c.-63+947C>T	HNRNPC	ENSG00000092199.19	transcript	ENST00000553300.6	protein_coding	1/8	chr14	21268351
chr14:21268352	T T	A A	1	a0001c0001t0001g0370 a0001c0001t0001g0370	1	HG02630.hp1 HG02630.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-63+946A>T c.-63+946A>T	HNRNPC	ENSG00000092199.19	transcript	ENST00000553300.6	protein_coding	1/8	chr14	21268352
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chr14:21268944	A A	G G	1	a0001c0002t0002g0012 a0001c0002t0002g0012	1	HG03540.hp2 HG03540.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.-63+354T>C c.-63+354T>C	HNRNPC	ENSG00000092199.19	transcript	ENST00000553300.6	protein_coding	1/8	chr14	21268944
chr14:21269135	G G	A A	1	a0001c0001t0001g0377 a0001c0001t0001g0377	1	HG01891.hp1 HG01891.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-63+163C>T c.-63+163C>T	HNRNPC	ENSG00000092199.19	transcript	ENST00000553300.6	protein_coding	1/8	chr14	21269135
chr14:21269206	T T	C C	1	a0001c0001t0002g0378 a0001c0001t0002g0378	1	HG02622.hp1 HG02622.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-63+92A>G c.-63+92A>G	HNRNPC	ENSG00000092199.19	transcript	ENST00000553300.6	protein_coding	1/8	chr14	21269206
chr14:21269244	C C	A A	1	a0001c0001t0002g0379 a0001c0001t0002g0379	1	HG02300.hp2 HG02300.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.-63+54G>T c.-63+54G>T	HNRNPC	ENSG00000092199.19	transcript	ENST00000553300.6	protein_coding	1/8	chr14	21269244
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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer HNRNPC_chr14_21204147_21274442

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) HNRNPC_chr14_21204147_21274442

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 22)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 381)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 3)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 24)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 381)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 388)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 25)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 769)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)