Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr15:55587803	G G	A A	2	a0001c0001t0021g0383 a0001c0001t0021g0384 a0001c0001t0021g0383 a0001c0001t0021g0384	2	HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.49+32C>T c.49+32C>T	PYGO1	ENSG00000171016.13	transcript	ENST00000563719.4	protein_coding	1/2	chr15	55587803

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer PYGO1_chr15_55533884_55593345

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) PYGO1_chr15_55533884_55593345

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 10)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 83)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 399)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 10)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 89)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 399)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 412)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 4)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 94)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 692)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)