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chr19:34299712	G G	A A	5	a0001c0003t0004 a0001c0003t0006 a0001c0003t0008 others(2): Show a0001c0003t0004 a0001c0003t0006 a0001c0003t0008 a0001c0003t0014 a0001c0003t0015	17	HG02109.hp1 HG02258.hp1 HG02451.hp2 others(14): Show HG02109.hp1 HG02258.hp1 HG02451.hp2 HG02572.hp1 HG02717.hp1 HG02717.hp2 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02818.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02965.hp2 HG02976.hp1 HG03195.hp2 NA19030.hp2 NA20129.hp2	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-762G>A c.-762G>A	GARRE1	ENSG00000166398.14	transcript	ENST00000299505.8	protein_coding	2/14	762		chr19	34299712
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chr19:34299944	G G	T T	1	a0001c0002t0013 a0001c0002t0013	2	HG01256.hp2 HG01258.hp1 HG01256.hp2 HG01258.hp1	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-530G>T c.-530G>T	GARRE1	ENSG00000166398.14	transcript	ENST00000299505.8	protein_coding	2/14			chr19	34299944
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chr19:34352612	C C	T T	11	a0001c0003t0004g0068 a0001c0003t0004g0069 a0001c0003t0004g0070 others(8): Show a0001c0003t0004g0068 a0001c0003t0004g0069 a0001c0003t0004g0070 a0001c0003t0004g0072 a0001c0003t0004g0073 a0001c0003t0004g0074 a0001c0003t0004g0075 a0001c0003t0004g0076 a0001c0003t0004g0077 a0001c0003t0004g0078 a0001c0003t0014g0071	11	HG02109.hp1 HG02258.hp1 HG02572.hp1 others(8): Show HG02109.hp1 HG02258.hp1 HG02572.hp1 HG02717.hp1 HG02818.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02976.hp1 HG03195.hp2 NA20129.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.2905-35C>T c.2905-35C>T	GARRE1	ENSG00000166398.14	transcript	ENST00000299505.8	protein_coding	13/13		chr19	34352612

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer GARRE1_chr19_34249554_34360566

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) GARRE1_chr19_34249554_34360566

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 11)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 16)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 25)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 325)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 16)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 38)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 325)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 326)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 10)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 26)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1073)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)