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chr5:123614022	G G	A A	1	a0001c0001t0002g0099 a0001c0001t0002g0099	1	NA18995.hp1 NA18995.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1317-320G>A c.1317-320G>A	CSNK1G3	ENSG00000151292.19	transcript	ENST00000696905.1	protein_coding	13/13		chr5	123614022
chr5:123614052	A A	C C	56	a0001c0001t0002g0003 a0001c0001t0002g0008 a0001c0001t0002g0009 others(53): Show a0001c0001t0002g0003 a0001c0001t0002g0008 a0001c0001t0002g0009 a0001c0001t0002g0046 a0001c0001t0002g0047 a0001c0001t0002g0084 a0001c0001t0002g0096 a0001c0001t0002g0097 a0001c0001t0002g0098 a0001c0001t0002g0099 a0001c0001t0002g0100 a0001c0001t0002g0101 a0001c0001t0002g0102 a0001c0001t0002g0103 a0001c0001t0002g0105 a0001c0001t0002g0106 a0001c0001t0002g0108 a0001c0001t0002g0109 a0001c0001t0002g0111 a0001c0001t0002g0112 a0001c0001t0002g0113 a0001c0001t0002g0115 a0001c0001t0002g0116 a0001c0001t0002g0117 a0001c0001t0002g0121 a0001c0001t0002g0134 a0001c0001t0002g0140 a0001c0001t0002g0147 a0001c0001t0002g0154 a0001c0001t0002g0218 a0001c0001t0002g0260 a0001c0001t0002g0267 a0001c0001t0004g0045 a0001c0001t0004g0049 a0001c0001t0004g0094 a0001c0001t0004g0119 a0001c0001t0004g0120 a0001c0001t0004g0122 a0001c0001t0004g0123 a0001c0001t0004g0124 a0001c0001t0004g0125 a0001c0001t0004g0126 a0001c0001t0004g0127 a0001c0001t0004g0128 a0001c0001t0004g0144 a0001c0001t0004g0146 a0001c0001t0005g0072 a0001c0001t0005g0090 a0001c0001t0005g0091 a0001c0001t0005g0092 a0001c0001t0005g0093 a0001c0001t0010g0088 a0001c0001t0010g0104 a0001c0001t0010g0107 a0001c0001t0021g0118 a0001c0001t0024g0136	59	HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00408.hp1 others(56): Show HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00408.hp1 HG00438.hp2 HG00597.hp2 HG00639.hp2 HG00733.hp2 HG00735.hp2 HG00738.hp1 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01106.hp2 HG01109.hp1 HG01255.hp1 HG01256.hp2 HG01258.hp1 HG01361.hp1 HG01891.hp2 HG01943.hp1 HG01981.hp1 HG02056.hp2 HG02080.hp2 HG02257.hp2 HG02559.hp1 HG02647.hp1 HG02818.hp1 HG02895.hp2 HG02922.hp2 HG02976.hp2 HG03017.hp1 HG03209.hp2 HG03453.hp1 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp2 HG03710.hp1 HG03831.hp1 NA18522.hp1 NA18945.hp1 NA18950.hp1 NA18955.hp2 NA18959.hp1 NA18967.hp2 NA18973.hp1 NA18981.hp1 NA18984.hp1 NA18984.hp2 NA18995.hp1 NA19002.hp1 NA19005.hp1 NA19007.hp1 NA19011.hp1 NA19030.hp1 NA19057.hp1 NA19080.hp1 NA19081.hp1 NA19084.hp1 NA19088.hp1 NA19091.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1317-290A>C c.1317-290A>C	CSNK1G3	ENSG00000151292.19	transcript	ENST00000696905.1	protein_coding	13/13		chr5	123614052
chr5:123614142	A A	G G	1	a0001c0001t0002g0048 a0001c0001t0002g0048	1	HG03516.hp1 HG03516.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1317-200A>G c.1317-200A>G	CSNK1G3	ENSG00000151292.19	transcript	ENST00000696905.1	protein_coding	13/13		chr5	123614142
chr5:123614213	A A	G G	1	a0001c0001t0002g0043 a0001c0001t0002g0043	1	HG03471.hp2 HG03471.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1317-129A>G c.1317-129A>G	CSNK1G3	ENSG00000151292.19	transcript	ENST00000696905.1	protein_coding	13/13		chr5	123614213

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JoGo Online Haplotype Explorer CSNK1G3_chr5_123507177_123622049

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 27)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 275)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 2)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 28)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 275)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 294)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 0)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 25)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 903)

External Link

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)