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ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

  Error connecting to IGV?   BCL9_chr1_147536501_147631216  BCL9_chr1_147536501_147631216 (clean+top1000)

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Item Value
geneid 607
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HG00140 hp1 a0001 c0001 t0007 g0097 EUR GBR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00140 hp2 a0002 c0002 t0001 g0109 EUR GBR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00280 hp1 a0002 c0002 t0001 g0110 EUR FIN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00280 hp2 a0002 c0002 t0001 g0112 EUR FIN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00323 hp1 a0001 c0001 t0011 g0058 EUR FIN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00323 hp2 a0001 c0001 t0004 g0146 EUR FIN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00423 hp1 a0001 c0001 t0001 g0007 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00423 hp2 a0001 c0001 t0003 g0009 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00438 hp1 a0001 c0001 t0001 g0077 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00438 hp2 a0001 c0001 t0003 g0178 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00544 hp1 a0006 c0009 t0005 g0031 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00544 hp2 a0001 c0001 t0004 g0080 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00558 hp1 a0001 c0001 t0004 g0122 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00558 hp2 a0001 c0001 t0003 g0164 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00597 hp1 a0001 c0001 t0004 g0144 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00597 hp2 a0005 c0008 t0001 g0038 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00609 hp1 a0001 c0001 t0002 g0268 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00609 hp2 a0001 c0001 t0004 g0056 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00621 hp1 a0001 c0001 t0005 g0119 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00621 hp2 a0001 c0001 t0004 g0189 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00639 hp1 a0001 c0001 t0009 g0246 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00639 hp2 a0002 c0002 t0001 g0004 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00673 hp1 a0001 c0001 t0003 g0009 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00673 hp2 a0001 c0001 t0001 g0063 EAS CHS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00738 hp1 a0002 c0002 t0001 g0052 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG00738 hp2 a0001 c0001 t0002 g0249 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01071 hp1 a0003 c0004 t0001 g0135 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01071 hp2 a0001 c0001 t0005 g0154 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01074 hp1 a0001 c0001 t0002 g0257 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01074 hp2 a0004 c0005 t0018 g0277 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01081 hp1 a0001 c0001 t0005 g0036 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01081 hp2 a0001 c0001 t0019 g0274 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01099 hp1 a0002 c0002 t0002 g0022 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01099 hp2 a0001 c0001 t0007 g0010 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01109 hp1 a0001 c0001 t0007 g0139 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01109 hp2 a0002 c0002 t0002 g0022 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01168 hp1 a0001 c0001 t0001 g0049 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01168 hp2 a0001 c0006 t0010 g0172 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01169 hp1 a0001 c0001 t0005 g0092 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01169 hp2 a0001 c0001 t0001 g0048 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01175 hp1 a0004 c0005 t0001 g0059 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01175 hp2 a0001 c0001 t0006 g0018 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01192 hp1 a0001 c0001 t0004 g0133 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01192 hp2 a0003 c0004 t0002 g0019 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01243 hp1 a0001 c0001 t0004 g0075 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01243 hp2 a0001 c0001 t0001 g0055 AMR PUR BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01256 hp1 a0001 c0001 t0001 g0015 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01256 hp2 a0001 c0001 t0003 g0242 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01257 hp1 a0001 c0001 t0002 g0250 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01257 hp2 a0002 c0002 t0001 g0108 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01258 hp1 a0001 c0001 t0001 g0015 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01258 hp2 a0001 c0001 t0002 g0019 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01261 hp1 a0001 c0001 t0005 g0089 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01261 hp2 a0002 c0002 t0001 g0123 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01346 hp1 a0001 c0001 t0007 g0010 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01346 hp2 a0001 c0001 t0005 g0153 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01358 hp1 a0001 c0001 t0003 g0185 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01358 hp2 a0002 c0003 t0001 g0011 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01433 hp1 a0001 c0001 t0009 g0219 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01433 hp2 a0002 c0003 t0001 g0011 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01516 hp1 a0002 c0002 t0001 g0014 EUR IBS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01516 hp2 a0001 c0001 t0002 g0255 EUR IBS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01517 hp1 a0002 c0002 t0001 g0014 EUR IBS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01517 hp2 a0002 c0002 t0001 g0107 EUR IBS BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01884 hp1 a0002 c0002 t0001 g0124 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01884 hp2 a0001 c0001 t0021 g0220 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01891 hp1 a0001 c0001 t0003 g0158 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01891 hp2 a0001 c0001 t0006 g0275 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01934 hp1 a0001 c0001 t0012 g0241 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01934 hp2 a0001 c0001 t0005 g0098 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01952 hp1 a0001 c0010 t0003 g0262 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01952 hp2 a0001 c0001 t0010 g0283 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01978 hp1 a0001 c0001 t0001 g0045 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01978 hp2 a0001 c0001 t0004 g0150 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01981 hp1 a0001 c0001 t0004 g0127 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01981 hp2 a0001 c0001 t0005 g0155 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02027 hp1 a0001 c0001 t0001 g0040 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02027 hp2 a0001 c0001 t0003 g0032 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02055 hp1 a0001 c0001 t0015 g0198 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02055 hp2 a0001 c0001 t0008 g0213 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02056 hp1 a0001 c0001 t0002 g0176 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02056 hp2 a0001 c0001 t0004 g0128 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02071 hp1 a0001 c0001 t0004 g0081 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02071 hp2 a0001 c0001 t0004 g0106 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02074 hp1 a0001 c0001 t0003 g0035 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02074 hp2 a0001 c0001 t0005 g0041 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02080 hp1 a0001 c0001 t0002 g0252 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02080 hp2 a0001 c0001 t0005 g0082 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02083 hp1 a0002 c0002 t0001 g0066 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02083 hp2 a0001 c0001 t0004 g0012 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02129 hp1 a0001 c0001 t0002 g0030 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02129 hp2 a0001 c0001 t0004 g0136 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02132 hp1 a0001 c0001 t0004 g0078 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02132 hp2 a0001 c0001 t0005 g0046 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02135 hp1 a0002 c0002 t0001 g0126 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02135 hp2 a0001 c0001 t0002 g0269 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02145 hp1 a0001 c0001 t0015 g0217 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02145 hp2 a0001 c0001 t0003 g0159 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02273 hp1 a0001 c0001 t0007 g0088 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02273 hp2 a0001 c0001 t0003 g0163 AMR PEL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02280 hp1 a0001 c0001 t0014 g0195 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02280 hp2 a0001 c0001 t0014 g0229 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02523 hp1 a0001 c0001 t0003 g0177 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02523 hp2 a0002 c0002 t0001 g0054 EAS KHV BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02572 hp1 a0001 c0001 t0008 g0157 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02572 hp2 a0001 c0001 t0008 g0207 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02602 hp1 a0002 c0002 t0007 g0100 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02602 hp2 a0002 c0002 t0002 g0279 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02615 hp1 a0001 c0001 t0006 g0271 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02615 hp2 a0001 c0001 t0011 g0142 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02630 hp1 a0001 c0001 t0006 g0237 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02630 hp2 a0001 c0001 t0023 g0208 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02647 hp1 a0001 c0001 t0006 g0284 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02647 hp2 a0001 c0001 t0009 g0266 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02683 hp1 a0002 c0002 t0001 g0004 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02683 hp2 a0001 c0001 t0005 g0070 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02698 hp1 a0001 c0001 t0002 g0256 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02698 hp2 a0001 c0001 t0007 g0132 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02717 hp1 a0001 c0001 t0006 g0201 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02717 hp2 a0001 c0001 t0008 g0193 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02723 hp1 a0001 c0001 t0010 g0209 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02723 hp2 a0001 c0001 t0006 g0236 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02735 hp1 a0001 c0001 t0017 g0244 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02735 hp2 a0002 c0002 t0001 g0156 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02738 hp1 a0002 c0002 t0007 g0117 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02738 hp2 a0001 c0001 t0020 g0245 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02818 hp1 a0001 c0001 t0002 g0232 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02818 hp2 a0001 c0001 t0009 g0218 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02886 hp1 a0001 c0001 t0002 g0206 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02886 hp2 a0001 c0001 t0002 g0276 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02895 hp1 a0001 c0001 t0011 g0051 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02895 hp2 a0001 c0001 t0009 g0017 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02896 hp1 a0001 c0001 t0007 g0074 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02896 hp2 a0001 c0001 t0008 g0196 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02897 hp1 a0001 c0001 t0007 g0073 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02897 hp2 a0001 c0001 t0009 g0017 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02922 hp1 a0001 c0001 t0009 g0202 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02922 hp2 a0001 c0001 t0008 g0214 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02965 hp1 a0001 c0001 t0006 g0278 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02965 hp2 a0001 c0001 t0002 g0221 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02970 hp1 a0001 c0001 t0006 g0161 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02970 hp2 a0001 c0001 t0008 g0211 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02976 hp1 a0001 c0001 t0007 g0191 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02976 hp2 a0001 c0001 t0003 g0162 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03017 hp1 a0001 c0001 t0004 g0134 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03017 hp2 a0001 c0001 t0001 g0102 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03041 hp1 a0001 c0001 t0008 g0227 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03041 hp2 a0001 c0001 t0009 g0197 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03098 hp1 a0001 c0001 t0003 g0160 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03098 hp2 a0001 c0001 t0006 g0230 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03139 hp1 a0001 c0001 t0008 g0008 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03139 hp2 a0001 c0001 t0006 g0225 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03195 hp1 a0001 c0001 t0009 g0231 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03195 hp2 a0001 c0001 t0006 g0018 AFR ESN BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03209 hp1 a0001 c0001 t0026 g0072 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03209 hp2 a0001 c0007 t0009 g0273 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03225 hp1 a0001 c0001 t0009 g0270 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03225 hp2 a0001 c0001 t0024 g0194 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03453 hp1 a0001 c0001 t0016 g0224 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03453 hp2 a0001 c0001 t0009 g0200 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03486 hp1 a0001 c0001 t0006 g0216 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03486 hp2 a0001 c0001 t0006 g0282 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03540 hp1 a0001 c0001 t0006 g0272 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03540 hp2 a0001 c0001 t0002 g0248 AFR GWD BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03579 hp1 a0001 c0001 t0008 g0008 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03579 hp2 a0001 c0001 t0006 g0192 AFR MSL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03710 hp1 a0001 c0001 t0028 g0105 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03710 hp2 a0001 c0001 t0007 g0149 SAS PJL BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03831 hp1 a0001 c0001 t0001 g0118 SAS BEB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03831 hp2 a0001 c0001 t0011 g0148 SAS BEB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03834 hp1 a0001 c0001 t0012 g0204 SAS BEB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03834 hp2 a0001 c0001 t0011 g0138 SAS BEB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03927 hp1 a0002 c0002 t0001 g0125 SAS BEB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03927 hp2 a0001 c0001 t0011 g0086 SAS BEB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03942 hp1 a0002 c0003 t0001 g0111 SAS BEB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG03942 hp2 a0001 c0001 t0029 g0147 SAS BEB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG04115 hp1 a0001 c0001 t0012 g0174 SAS STU BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG04115 hp2 a0003 c0004 t0002 g0235 SAS STU BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18522 hp1 a0001 c0001 t0008 g0008 AFR YRI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18522 hp2 a0001 c0001 t0006 g0223 AFR YRI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18906 hp1 a0001 c0001 t0007 g0103 AFR YRI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18906 hp2 a0001 c0001 t0006 g0264 AFR YRI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18942 hp1 a0001 c0001 t0003 g0170 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18942 hp2 a0001 c0001 t0004 g0001 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18944 hp1 a0001 c0001 t0003 g0024 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18944 hp2 a0001 c0001 t0004 g0006 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18945 hp1 a0001 c0001 t0003 g0165 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18945 hp2 a0001 c0001 t0027 g0012 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18951 hp1 a0001 c0001 t0004 g0069 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18951 hp2 a0001 c0001 t0003 g0003 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18953 hp1 a0001 c0001 t0003 g0184 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18953 hp2 a0001 c0001 t0001 g0130 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
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NA19077 hp1 a0001 c0001 t0003 g0023 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA19077 hp2 a0001 c0001 t0005 g0084 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA19079 hp1 a0001 c0001 t0002 g0002 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA19079 hp2 a0002 c0002 t0001 g0099 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA19081 hp1 a0001 c0001 t0004 g0006 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
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NA19090 hp2 a0001 c0001 t0003 g0029 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA19091 hp1 a0001 c0001 t0002 g0002 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA19091 hp2 a0001 c0001 t0003 g0175 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA19240 hp1 a0001 c0001 t0014 g0234 AFR YRI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA19240 hp2 a0001 c0001 t0002 g0281 AFR YRI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20129 hp1 a0001 c0001 t0009 g0280 AFR ASW BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20129 hp2 a0001 c0001 t0007 g0085 AFR ASW BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20752 hp1 a0001 c0001 t0017 g0101 EUR TSI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20752 hp2 a0002 c0003 t0001 g0044 EUR TSI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20805 hp1 a0001 c0001 t0007 g0053 EUR TSI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20805 hp2 a0002 c0002 t0002 g0247 EUR TSI BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20905 hp1 a0001 c0001 t0004 g0057 SAS GIH BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20905 hp2 a0001 c0001 t0002 g0251 SAS GIH BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01123 hp1 a0002 c0002 t0001 g0004 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG01123 hp2 a0001 c0001 t0005 g0186 AMR CLM BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02109 hp1 a0001 c0001 t0001 g0071 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02109 hp2 a0001 c0001 t0008 g0210 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02486 hp1 a0001 c0001 t0006 g0203 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02486 hp2 a0001 c0001 t0012 g0205 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02559 hp1 a0001 c0001 t0008 g0215 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG02559 hp2 a0002 c0002 t0005 g0096 AFR ACB BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG06807 hp1 a0001 c0001 t0006 g0222 AFR USA BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
HG06807 hp2 a0001 c0001 t0006 g0240 AFR USA BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18955 hp1 a0001 c0001 t0001 g0116 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA18955 hp2 a0001 c0001 t0005 g0140 EAS JPT BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20300 hp1 a0001 c0001 t0005 g0152 AFR USA BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA20300 hp2 a0001 c0001 t0009 g0228 AFR USA BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA21309 hp1 a0002 c0002 t0002 g0238 AFR LWK BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
NA21309 hp2 a0001 c0001 t0025 g0239 AFR LWK BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
homoSapiens_chm13v2 hp1 a0001 c0001 t0012 g0243 REF REF BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216
homoSapiens_grch38 hp1 a0001 c0001 t0001 g0039 REF REF BCL9_chr1_147536501_147631216 BCL9 chr1 147536501 147631216

chr:pos ref alt #
# of ahapid:amino-acid(protein) level
 ahapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
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A
 G
G
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a0002
a0001
a0002
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HG00323.hp1
HG00639.hp1
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HG03098.hp2
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NA20129.hp2
NA20300.hp2
NA20805.hp1
NA21309.hp2
 splice_region_variant LOW c.-345A>G
c.-345A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 2/10 chr1 147604909
chr1:147619060 G
G
 A
A
 1 a0003
a0003
 3 HG01071.hp1
HG01192.hp2
HG04115.hp2
HG01071.hp1
HG01192.hp2
HG04115.hp2
 missense_variant MODERATE c.905G>A
c.905G>A
 p.Gly302Asp
p.Gly302Asp
 BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 8/10 1556/6189 905/4281 302/1426 chr1 147619060
chr1:147620166 C
C
 T
T
 1 a0002
a0002
 38 HG00099.hp2
HG00140.hp2
HG00280.hp1
others(35): Show 
HG00099.hp2
HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00280.hp2
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HG01517.hp2
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HG02738.hp1
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NA20805.hp2
NA21309.hp1
 missense_variant MODERATE c.2011C>T
c.2011C>T
 p.Pro671Ser
p.Pro671Ser
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C
 G
G
 1 a0006
a0006
 1 HG00544.hp1
HG00544.hp1
 missense_variant MODERATE c.3547C>G
c.3547C>G
 p.Leu1183Val
p.Leu1183Val
 BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 4198/6189 3547/4281 1183/1426 chr1 147624225
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G
 A
A
 1 a0004
a0004
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HG01175.hp1
HG01074.hp2
HG01175.hp1
 missense_variant MODERATE c.3633G>A
c.3633G>A
 p.Met1211Ile
p.Met1211Ile
 BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 4284/6189 3633/4281 1211/1426 chr1 147624311
chr1:147624699 A
A
 G
G
 1 a0005
a0005
 1 HG00597.hp2
HG00597.hp2
 missense_variant MODERATE c.4021A>G
c.4021A>G
 p.Met1341Val
p.Met1341Val
 BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 4672/6189 4021/4281 1341/1426 chr1 147624699

chr:pos ref alt #
# of chapid
 chapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr1:147619883 G
G
 A
A
 1 a0002c0003
a0002c0003
 4 HG01358.hp2
HG01433.hp2
HG03942.hp1
others(1): Show 
HG01358.hp2
HG01433.hp2
HG03942.hp1
NA20752.hp2
 synonymous_variant LOW c.1728G>A
c.1728G>A
 p.Pro576Pro
p.Pro576Pro
 BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 8/10 2379/6189 1728/4281 576/1426 chr1 147619883
chr1:147620189 T
T
 A
A
 1 a0001c0007
a0001c0007
 1 HG03209.hp2
HG03209.hp2
 synonymous_variant LOW c.2034T>A
c.2034T>A
 p.Pro678Pro
p.Pro678Pro
 BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 8/10 2685/6189 2034/4281 678/1426 chr1 147620189
chr1:147620906 A
A
 C
C
 1 a0001c0010
a0001c0010
 1 HG01952.hp1
HG01952.hp1
 synonymous_variant LOW c.2751A>C
c.2751A>C
 p.Ser917Ser
p.Ser917Ser
 BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 8/10 3402/6189 2751/4281 917/1426 chr1 147620906
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C
 T
T
 1 a0001c0006
a0001c0006
 2 HG00099.hp1
HG01168.hp2
HG00099.hp1
HG01168.hp2
 synonymous_variant LOW c.4026C>T
c.4026C>T
 p.Pro1342Pro
p.Pro1342Pro
 BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 4677/6189 4026/4281 1342/1426 chr1 147624704

chr:pos ref alt #
# of thapid:transcript level
 thapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr1:147541592 G
G
 A
A
 24 a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
a0001c0001t0006
others(21): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
a0001c0001t0006
a0001c0001t0008
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a0001c0001t0020
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a0001c0001t0022
a0001c0001t0023
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a0001c0006t0010
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a0004c0005t0018
 161 HG00099.hp1
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others(158): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp2
HG00438.hp2
HG00558.hp2
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HG01358.hp1
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HG06807.hp1
HG06807.hp2
NA18522.hp1
NA18522.hp2
NA18906.hp2
NA18942.hp1
NA18944.hp1
NA18945.hp1
NA18951.hp2
NA18953.hp1
NA18954.hp2
NA18957.hp2
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18969.hp1
NA18972.hp1
NA18977.hp2
NA18981.hp1
NA18981.hp2
NA18983.hp1
NA18984.hp2
NA18985.hp1
NA18985.hp2
NA18986.hp1
NA18989.hp1
NA18994.hp2
NA18997.hp1
NA18997.hp2
NA18999.hp2
NA19004.hp1
NA19005.hp2
NA19009.hp1
NA19009.hp2
NA19010.hp2
NA19012.hp2
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19043.hp1
NA19043.hp2
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NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-560G>A
c.-560G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/10 70245 chr1 147541592
chr1:147604799 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0025
a0001c0001t0025
 1 NA21309.hp2
NA21309.hp2
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c.-455C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 2/10 7038 chr1 147604799
chr1:147606805 G
G
 T
T
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a0001c0001t0017
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NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.-321G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 3/10 5032 chr1 147606805
chr1:147624993 G
G
 A
A
 7 a0001c0001t0004
a0001c0001t0008
a0001c0001t0010
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a0001c0001t0008
a0001c0001t0010
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NA20905.hp1
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c.*34G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 34 chr1 147624993
chr1:147625027 G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0008
a0001c0001t0015
a0001c0001t0026
a0001c0001t0008
a0001c0001t0015
a0001c0001t0026
 17 HG02055.hp1
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HG02055.hp2
HG02109.hp2
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NA19030.hp1
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c.*68G>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 68 chr1 147625027
chr1:147625077 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0021
a0001c0001t0021
 1 HG01884.hp2
HG01884.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*118G>A
c.*118G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 118 chr1 147625077
chr1:147625105 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0023
a0001c0001t0023
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*146C>T
c.*146C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 146 chr1 147625105
chr1:147625454 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0016
a0001c0001t0016
 2 HG03453.hp1
NA19043.hp1
HG03453.hp1
NA19043.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*495T>C
c.*495T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 495 chr1 147625454
chr1:147625465 T
T
 C
C
 14 a0001c0001t0003
a0001c0001t0005
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others(11): Show 
a0001c0001t0003
a0001c0001t0005
a0001c0001t0006
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a0001c0001t0013
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a0001c0010t0003
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HG00423.hp2
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NA18962.hp2
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NA19064.hp2
NA19065.hp2
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NA19077.hp1
NA19077.hp2
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NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA19091.hp2
NA19240.hp1
NA20300.hp1
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NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*506T>C
c.*506T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 506 chr1 147625465
chr1:147625540 G
G
 A
A
 1 a0004c0005t0018
a0004c0005t0018
 1 HG01074.hp2
HG01074.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*581G>A
c.*581G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 581 chr1 147625540
chr1:147625834 T
T
 C
C
 11 a0001c0001t0004
a0001c0001t0008
a0001c0001t0010
others(8): Show 
a0001c0001t0004
a0001c0001t0008
a0001c0001t0010
a0001c0001t0013
a0001c0001t0014
a0001c0001t0015
a0001c0001t0022
a0001c0001t0026
a0001c0001t0028
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a0001c0006t0010
 70 HG00099.hp1
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HG00099.hp1
HG00323.hp2
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HG00621.hp2
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HG02056.hp2
HG02071.hp1
HG02071.hp2
HG02083.hp2
HG02109.hp2
HG02129.hp2
HG02132.hp1
HG02145.hp1
HG02280.hp1
HG02280.hp2
HG02559.hp1
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02896.hp2
HG02922.hp2
HG02970.hp2
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HG03041.hp1
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NA18977.hp2
NA18982.hp1
NA18983.hp1
NA18986.hp1
NA18989.hp2
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NA19002.hp2
NA19004.hp2
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NA19010.hp1
NA19012.hp2
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19054.hp1
NA19056.hp2
NA19062.hp1
NA19070.hp1
NA19081.hp1
NA19081.hp2
NA19083.hp1
NA19240.hp1
NA20905.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*875T>C
c.*875T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 875 chr1 147625834
chr1:147625887 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0019
a0001c0001t0019
 1 HG01081.hp2
HG01081.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*928C>T
c.*928C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 10/10 928 chr1 147625887

chr:pos ref alt #
# of ghapid:genebody level
 ghapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid genebody_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr1:147541737 G
G
 A
A
 14 a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0034
a0001c0001t0003g0003
others(11): Show 
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a0001c0001t0002g0034
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a0001c0001t0003g0009
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a0001c0001t0003g0032
a0001c0001t0003g0033
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 17 HG00423.hp2
HG00544.hp1
HG00673.hp1
others(14): Show 
HG00423.hp2
HG00544.hp1
HG00673.hp1
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NA18951.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18985.hp2
NA18989.hp1
NA19004.hp1
NA19054.hp2
NA19060.hp1
NA19077.hp1
NA19086.hp2
NA19090.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+63G>A
c.-478+63G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147541737
chr1:147541818 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0284
a0001c0001t0006g0284
 1 HG02647.hp1
HG02647.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+144C>G
c.-478+144C>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147541818
chr1:147542050 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0010g0283
a0001c0001t0010g0283
 1 HG01952.hp2
HG01952.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+376A>G
c.-478+376A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147542050
chr1:147542066 A
A
 C
C
 99 a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0019
a0001c0001t0002g0021
others(96): Show 
a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0019
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0206
a0001c0001t0002g0221
a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0248
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a0001c0001t0002g0251
a0001c0001t0002g0252
a0001c0001t0002g0255
a0001c0001t0002g0256
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a0001c0001t0002g0258
a0001c0001t0002g0263
a0001c0001t0002g0268
a0001c0001t0002g0269
a0001c0001t0002g0276
a0001c0001t0002g0281
a0001c0001t0003g0020
a0001c0001t0003g0242
a0001c0001t0003g0254
a0001c0001t0003g0261
a0001c0001t0006g0018
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 T
T
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 A
A
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c.-478+802G>A
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C
 G
G
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a0001c0001t0024g0194
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c.-478+876C>G
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 T
T
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c.-478+1046G>T
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 A
A
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a0001c0001t0014g0195
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HG02280.hp1
HG02896.hp2
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c.-478+1134G>A
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chr1:147542811 A
A
 G
G
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a0001c0001t0009g0280
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NA20129.hp1
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c.-478+1137A>G
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 C
C
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c.-478+1299G>C
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C
 T
T
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c.-478+1735C>T
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A
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a0001c0001t0010g0199
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c.-478+1750T>A
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G
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C
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G
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C
 A
A
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c.-478+2209C>A
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T
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c.-478+2335C>T
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c.-478+2658A>G
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CCTCT
 C
C
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others(8): Show 
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G
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c.-478+2890G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147544564
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C
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T
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c.-478+2901C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147544575
chr1:147544639 C
C
 T
T
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chr1:147544645 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0149
a0001c0001t0007g0149
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HG03710.hp2
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c.-478+2971C>T
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chr1:147544678 T
T
 G
G
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HG00423.hp2
HG00438.hp2
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c.-478+3004T>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147544678
chr1:147544836 T
T
 C
C
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a0001c0001t0015g0198
a0001c0001t0009g0197
a0001c0001t0015g0198
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HG03041.hp2
HG02055.hp1
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+3162T>C
c.-478+3162T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147544836
chr1:147544838 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0278
a0001c0001t0006g0278
 1 HG02965.hp1
HG02965.hp1
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c.-478+3164C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147544838
chr1:147544859 C
C
 T
T
 28 a0001c0001t0002g0206
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others(25): Show 
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a0001c0001t0002g0221
a0001c0001t0002g0281
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others(28): Show 
HG01433.hp1
HG01884.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-478+3185C>T
c.-478+3185C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147544859
chr1:147545166 C
C
 A
A
 55 a0001c0001t0002g0030
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others(52): Show 
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a0001c0001t0009g0228
a0001c0001t0009g0231
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a0001c0001t0010g0016
a0001c0001t0012g0174
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a0001c0001t0014g0229
a0001c0001t0016g0224
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a0002c0002t0002g0166
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 60 HG00099.hp1
HG00423.hp2
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others(57): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp2
HG00438.hp2
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HG02280.hp2
HG02523.hp1
HG02976.hp2
HG03041.hp1
HG03098.hp2
HG03139.hp2
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HG03195.hp2
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NA18522.hp2
NA18942.hp1
NA18944.hp1
NA18945.hp1
NA18951.hp2
NA18953.hp1
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NA18957.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18962.hp2
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NA18985.hp2
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NA19004.hp1
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NA19091.hp2
NA20129.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+3492C>A
c.-478+3492C>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545166
chr1:147545178 A
A
 T
T
 1 a0002c0002t0002g0279
a0002c0002t0002g0279
 1 HG02602.hp2
HG02602.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+3504A>T
c.-478+3504A>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545178
chr1:147545348 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0037
a0001c0001t0001g0037
 1 NA18994.hp1
NA18994.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+3674T>C
c.-478+3674T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545348
chr1:147545370 T
T
 C
C
 40 a0001c0001t0002g0019
a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0002g0233
others(37): Show 
a0001c0001t0002g0019
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a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0248
a0001c0001t0002g0249
a0001c0001t0002g0250
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 41 HG00639.hp1
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others(38): Show 
HG00639.hp1
HG00738.hp2
HG01074.hp1
HG01192.hp2
HG01256.hp2
HG01257.hp1
HG01258.hp2
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HG01952.hp1
HG02080.hp1
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NA21309.hp2
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c.-478+3696T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0010g0016
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NA18986.hp1
NA19012.hp2
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c.-478+3998C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545672
chr1:147545678 C
C
 T
T
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a0001c0001t0011g0148
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HG03831.hp2
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c.-478+4004C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545678
chr1:147545754 A
A
 C
C
 28 a0001c0001t0002g0206
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a0001c0001t0010g0283
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a0001c0001t0021g0220
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c.-478+4080A>C
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T
 C
C
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a0005c0008t0001g0038
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HG00597.hp2
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c.-478+4155T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545829
chr1:147545872 A
A
 G
G
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a0001c0001t0006g0278
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HG02965.hp1
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c.-478+4198A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545872
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T
 A
A
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HG01884.hp2
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HG01884.hp2
HG01952.hp2
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NA19030.hp2
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c.-478+4270T>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545944
chr1:147545987 C
C
 T
T
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a0002c0002t0002g0022
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HG01109.hp2
HG01099.hp1
HG01109.hp2
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c.-478+4313C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147545987
chr1:147546154 G
G
 T
T
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a0001c0001t0006g0284
 1 HG02647.hp1
HG02647.hp1
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c.-478+4480G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147546154
chr1:147546248 G
G
 A
A
 44 a0001c0001t0002g0030
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HG00423.hp2
HG00438.hp2
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NA18962.hp2
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NA19077.hp1
NA19081.hp2
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NA19091.hp2
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c.-478+4574G>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0034
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a0001c0001t0002g0179
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 95 HG00099.hp1
HG00423.hp2
HG00438.hp2
others(92): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp2
HG00438.hp2
HG00544.hp1
HG00558.hp2
HG00621.hp2
HG00673.hp1
HG01123.hp2
HG01168.hp2
HG01175.hp2
HG01358.hp1
HG01433.hp1
HG01884.hp2
HG01952.hp2
HG02027.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02056.hp1
HG02074.hp1
HG02109.hp2
HG02129.hp1
HG02145.hp1
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02280.hp2
HG02486.hp1
HG02486.hp2
HG02523.hp1
HG02559.hp1
HG02572.hp2
HG02630.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp1
HG02818.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp2
HG02897.hp2
HG02922.hp1
HG02922.hp2
HG02965.hp2
HG02970.hp2
HG02976.hp2
HG03041.hp1
HG03041.hp2
HG03098.hp2
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03195.hp1
HG03195.hp2
HG03225.hp2
HG03453.hp1
HG03453.hp2
HG03486.hp1
HG03579.hp1
HG03834.hp1
HG04115.hp1
HG06807.hp1
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A
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T
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a0001c0001t0009g0197
a0001c0001t0015g0198
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HG02055.hp1
HG03041.hp2
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T
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A
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T
 A
A
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A
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c.-478+4917G>A
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G
 C
C
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NA19004.hp1
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NA19086.hp2
NA19090.hp2
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c.-478+5085G>C
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G
 A
A
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HG03209.hp2
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c.-478+5270G>A
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 GT
GT
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c.-478+5338dupA
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chr1:147547020 C
C
 T
T
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HG02717.hp1
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c.-478+5346C>T
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chr1:147547114 A
A
 G
G
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c.-478+5440A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0005g0041
a0001c0001t0005g0042
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HG02027.hp1
HG02074.hp2
NA19003.hp1
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c.-478+5592T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147547266
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0043
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NA19007.hp1
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c.-478+5668T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147547342
chr1:147547392 C
C
 T
T
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c.-478+5718C>T
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T
 C
C
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a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
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c.-478+6235T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147547909
chr1:147547931 T
T
 C
C
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a0002c0003t0001g0044
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NA20752.hp2
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c.-478+6257T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147547931
chr1:147547988 G
G
 A
A
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a0001c0001t0006g0284
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HG02647.hp1
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c.-478+6314G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147547988
chr1:147548029 T
T
 C
C
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HG02717.hp1
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c.-478+6355T>C
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G
 T
T
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a0001c0001t0006g0216
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HG03486.hp1
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c.-478+6498G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147548172
chr1:147548328 C
C
 T
T
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c.-478+6654C>T
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A
 G
G
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others(54): Show 
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NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.-478+7011A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0007g0191
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HG02976.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+7165C>A
c.-478+7165C>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147548839
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A
 T
T
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NA19091.hp2
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c.-478+7193A>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147548867
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C
 CT
CT
 44 a0001c0001t0002g0030
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a0001c0001t0002g0176
others(41): Show 
a0001c0001t0002g0030
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 48 HG00099.hp1
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others(45): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp2
HG00438.hp2
HG00544.hp1
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HG01168.hp2
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c.-478+7322dupT
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CTTT
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CTT
 C
C
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HG01884.hp2
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c.-478+7321_-478+7322delTT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147548979
chr1:147549037 T
T
 C
C
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a0001c0001t0012g0204
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HG03834.hp1
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c.-478+7363T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147549037
chr1:147549045 C
C
 T
T
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a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
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c.-478+7371C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147549045
chr1:147549083 T
T
 C
C
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HG00597.hp2
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c.-478+7409T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147549083
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G
 A
A
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NA18522.hp1
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NA19240.hp2
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c.-478+7503G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147549177
chr1:147549375 C
C
 T
T
 21 a0001c0001t0002g0206
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others(18): Show 
a0001c0001t0002g0206
a0001c0001t0002g0221
a0001c0001t0006g0216
a0001c0001t0006g0222
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a0001c0001t0008g0211
a0001c0001t0008g0213
a0001c0001t0008g0214
a0001c0001t0008g0215
a0001c0001t0009g0218
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a0001c0001t0010g0209
a0001c0001t0010g0283
a0001c0001t0012g0204
a0001c0001t0012g0205
a0001c0001t0015g0217
a0001c0001t0021g0220
a0001c0001t0022g0212
a0001c0001t0023g0208
 23 HG01433.hp1
HG01884.hp2
HG01952.hp2
others(20): Show 
HG01433.hp1
HG01884.hp2
HG01952.hp2
HG02055.hp2
HG02109.hp2
HG02145.hp1
HG02486.hp2
HG02559.hp1
HG02572.hp2
HG02630.hp2
HG02723.hp1
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HG02886.hp1
HG02922.hp2
HG02965.hp2
HG02970.hp2
HG03139.hp1
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HG03579.hp1
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HG06807.hp1
NA18522.hp1
NA19030.hp2
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c.-478+7701C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147549375
chr1:147549648 G
G
 C
C
 31 a0001c0001t0002g0019
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others(28): Show 
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 32 HG00639.hp1
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others(29): Show 
HG00639.hp1
HG00738.hp2
HG01074.hp1
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NA18999.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.-478+7974G>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147549648
chr1:147549679 C
C
 A
A
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others(16): Show 
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 19 HG01074.hp2
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others(16): Show 
HG01074.hp2
HG01891.hp2
HG02630.hp1
HG02647.hp1
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HG02723.hp2
HG02818.hp1
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HG02896.hp2
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NA19043.hp2
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NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+8005C>A
c.-478+8005C>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147549679
chr1:147549744 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0029g0147
a0001c0001t0029g0147
 1 HG03942.hp2
HG03942.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+8070A>G
c.-478+8070A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147549744
chr1:147550117 C
C
 CT
CT
 8 a0001c0001t0002g0002
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others(5): Show 
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 13 HG00609.hp1
HG01099.hp1
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others(10): Show 
HG00609.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.-478+8447dupT
c.-478+8447dupT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147550117
chr1:147550285 G
G
 T
T
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a0001c0001t0011g0058
a0002c0002t0001g0014
a0004c0005t0001g0059
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HG01516.hp1
others(1): Show 
HG00323.hp1
HG01175.hp1
HG01516.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.-478+8611G>T
c.-478+8611G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147550285
chr1:147550327 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0006g0237
a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0006g0237
 2 HG02630.hp1
HG02723.hp2
HG02630.hp1
HG02723.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+8653A>G
c.-478+8653A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147550327
chr1:147550425 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0006g0161
a0001c0001t0006g0161
 1 HG02970.hp1
HG02970.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+8751G>A
c.-478+8751G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147550425
chr1:147550532 C
C
 G
G
 28 a0001c0001t0002g0019
a0001c0001t0002g0248
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others(25): Show 
a0001c0001t0002g0019
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a0001c0001t0002g0251
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HG01074.hp1
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c.-478+8858C>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
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c.-478+8881G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147550555
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0060
a0005c0008t0001g0038
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HG00597.hp2
NA19007.hp2
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c.-478+9131G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147550805
chr1:147550857 G
G
 A
A
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a0001c0001t0006g0278
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HG02965.hp1
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c.-478+9183G>A
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T
 C
C
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c.-478+9249T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147550923
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G
 T
T
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a0001c0001t0004g0146
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HG00323.hp2
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c.-478+9345G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551019
chr1:147551021 A
A
 G
G
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others(2): Show 
a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0230
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others(3): Show 
HG01175.hp2
HG02280.hp2
HG03098.hp2
HG03195.hp1
HG03195.hp2
NA20129.hp1
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c.-478+9347A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551021
chr1:147551031 C
C
 CCTTATAA
others(4): Show 
CCTTATAACAAT
 1 a0001c0001t0002g0263
a0001c0001t0002g0263
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NA18997.hp2
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others(15): Show 
c.-478+9359_-478+9369dupTTATAACAATC
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147551031
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T
 C
C
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a0001c0001t0003g0009
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HG00673.hp1
HG00423.hp2
HG00673.hp1
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c.-478+9399T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551073
chr1:147551123 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0034
a0001c0001t0002g0034
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NA18989.hp1
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c.-478+9449A>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551123
chr1:147551237 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0057
a0001c0001t0004g0057
 1 NA20905.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+9563A>G
c.-478+9563A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551237
chr1:147551252 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0049
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HG01169.hp2
HG01168.hp1
HG01169.hp2
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c.-478+9578G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551252
chr1:147551494 C
C
 T
T
 13 a0001c0001t0002g0002
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others(10): Show 
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a0001c0001t0002g0021
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 18 HG00609.hp1
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others(15): Show 
HG00609.hp1
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c.-478+9820C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551494
chr1:147551661 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
 1 HG00621.hp2
HG00621.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+9987G>A
c.-478+9987G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551661
chr1:147551783 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0008g0215
a0001c0001t0008g0215
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HG02559.hp1
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c.-478+10109A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551783
chr1:147551864 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0070
a0001c0001t0005g0070
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HG02683.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+10190G>A
c.-478+10190G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551864
chr1:147551959 G
G
 A
A
 9 a0001c0001t0002g0221
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others(6): Show 
a0001c0001t0002g0221
a0001c0001t0006g0222
a0001c0001t0009g0218
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 9 HG01433.hp1
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others(6): Show 
HG01433.hp1
HG01884.hp2
HG01952.hp2
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HG06807.hp1
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c.-478+10285G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147551959
chr1:147552120 C
C
 T
T
 53 a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0034
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others(50): Show 
a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0034
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G
 A
A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0071
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HG02109.hp1
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c.-478+10627T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147552301
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0263
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NA18997.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147552381
chr1:147552382 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0263
a0001c0001t0002g0263
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NA18997.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147552382
chr1:147552384 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0263
a0001c0001t0002g0263
 1 NA18997.hp2
NA18997.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147552384
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T
 TA
TA
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HG01433.hp1
HG01884.hp2
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c.-478+10775dupA
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chr1:147552466 C
C
 T
T
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a0001c0001t0006g0216
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HG03486.hp1
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c.-478+10792C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147552466
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0221
a0001c0001t0006g0222
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HG02965.hp2
HG06807.hp1
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c.-478+11118C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147552792
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A
 G
G
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c.-478+11194A>G
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 AT
AT
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T
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a0001c0001t0001g0143
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NA18968.hp2
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G
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c.-478+11556C>G
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 A
A
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 T
T
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NA18954.hp2
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c.-478+11929C>T
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 C
C
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c.-478+11945G>C
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C
 G
G
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NA18997.hp2
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c.-478+11946C>G
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 G
G
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c.-478+12043C>G
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A
 C
C
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NA18997.hp2
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c.-478+12162A>C
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 A
A
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c.-478+12249T>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0255
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HG01516.hp2
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c.-478+12603A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147554277
chr1:147554304 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0263
a0001c0001t0002g0263
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NA18997.hp2
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c.-478+12630T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147554304
chr1:147554348 G
G
 A
A
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HG00738.hp2
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c.-478+12674G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147554348
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C
 G
G
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HG01175.hp2
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HG02055.hp2
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NA21309.hp2
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c.-478+12676C>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147554350
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G
 T
T
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a0001c0001t0003g0160
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 4 HG02145.hp1
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others(1): Show 
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02970.hp1
HG03098.hp1
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c.-478+12695G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147554369
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C
 T
T
 153 a0001c0001t0002g0002
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HG00099.hp1
HG00423.hp2
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c.-478+12738C>T
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C
 A
A
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a0001c0001t0015g0217
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HG02145.hp1
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c.-478+12857C>A
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T
 C
C
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A
 C
C
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a0001c0001t0002g0263
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NA18997.hp2
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 A
A
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HG03486.hp1
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0075
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HG01243.hp1
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c.-478+13063T>C
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 C
C
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NA18997.hp2
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c.-478+13208G>C
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A
 C
C
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HG02965.hp1
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c.-478+13261A>C
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T
 C
C
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T
 C
C
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a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
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C
 T
T
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c.-478+13774C>T
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G
 T
T
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 C
C
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NA18985.hp1
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c.-478+13906T>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0263
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NA18997.hp2
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c.-478+13919T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0005g0141
a0001c0001t0005g0140
a0001c0001t0005g0141
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NA18986.hp2
NA18955.hp2
NA18986.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0263
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others(1): Show 
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a0001c0001t0002g0263
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 4 HG02080.hp1
NA18983.hp1
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others(1): Show 
HG02080.hp1
NA18983.hp1
NA18994.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147555691
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 T
T
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A
 G
G
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147555803
chr1:147556092 A
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 G
G
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others(4): Show 
a0001c0001t0002g0002
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c.-478+14622dupT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147556284
chr1:147556284 A
A
 ATT
ATT
 9 a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0021
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others(6): Show 
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HG01099.hp1
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others(8): Show 
c.-478+14621_-478+14622dupTT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147556284
chr1:147556326 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0019g0274
a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
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c.-478+14652A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147556326
chr1:147556416 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0164
a0001c0001t0003g0164
 1 HG00558.hp2
HG00558.hp2
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c.-478+14742G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147556416
chr1:147556442 ATTATTTT
others(5): Show 
ATTATTTTTATTT
 A
A
 1 a0001c0001t0006g0216
a0001c0001t0006g0216
 1 HG03486.hp1
HG03486.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+14783_-478+14
others(18): Show 
c.-478+14783_-478+14794delATTTTTATTTTT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147556442
chr1:147556486 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0240
a0001c0001t0006g0240
 1 HG06807.hp2
HG06807.hp2
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c.-478+14812C>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147556486
chr1:147556713 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0233
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others(1): Show 
a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0014g0234
a0002c0002t0002g0238
 4 HG02818.hp1
NA19043.hp2
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others(1): Show 
HG02818.hp1
NA19043.hp2
NA19240.hp1
NA21309.hp1
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c.-478+15039G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147556713
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T
 A
A
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a0001c0001t0002g0021
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others(3): Show 
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a0001c0001t0002g0021
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 11 HG00609.hp1
HG01099.hp1
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others(8): Show 
HG00609.hp1
HG01099.hp1
HG01109.hp2
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NA19070.hp1
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c.-478+15204T>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147556878
chr1:147556953 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0010g0283
a0001c0001t0010g0283
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HG01952.hp2
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c.-478+15279C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147556953
chr1:147557143 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0006g0216
a0001c0001t0006g0216
 1 HG03486.hp1
HG03486.hp1
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c.-478+15469G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557143
chr1:147557180 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0144
a0001c0001t0004g0144
 1 HG00597.hp1
HG00597.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+15506T>C
c.-478+15506T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557180
chr1:147557185 T
T
 A
A
 3 a0001c0001t0011g0058
a0002c0002t0001g0014
a0004c0005t0001g0059
a0001c0001t0011g0058
a0002c0002t0001g0014
a0004c0005t0001g0059
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HG01175.hp1
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others(1): Show 
HG00323.hp1
HG01175.hp1
HG01516.hp1
HG01517.hp1
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c.-478+15511T>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557185
chr1:147557235 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0021g0220
a0001c0001t0021g0220
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HG01884.hp2
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c.-478+15561A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557235
chr1:147557403 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0024g0194
a0001c0001t0024g0194
 1 HG03225.hp2
HG03225.hp2
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c.-478+15729A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557403
chr1:147557509 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0050
 1 NA19060.hp2
NA19060.hp2
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c.-478+15835G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557509
chr1:147557594 C
C
 T
T
 1 a0002c0002t0001g0014
a0002c0002t0001g0014
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HG01516.hp1
HG01517.hp1
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c.-478+15920C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557594
chr1:147557613 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0016g0224
a0001c0001t0016g0224
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
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c.-478+15939G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557613
chr1:147557666 C
C
 A
A
 6 a0001c0001t0002g0002
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others(3): Show 
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a0001c0001t0002g0021
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 11 HG00609.hp1
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others(8): Show 
HG00609.hp1
HG01099.hp1
HG01109.hp2
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c.-478+15992C>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0010g0283
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HG01952.hp2
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c.-478+16009G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147557683
chr1:147557698 G
G
 A
A
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c.-478+16024G>A
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A
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G
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a0001c0001t0004g0056
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HG00609.hp2
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c.-478+16115A>G
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T
 C
C
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c.-478+16116T>C
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TG
 T
T
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HG02970.hp1
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c.-478+16287delG
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C
 T
T
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c.-478+16466C>T
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T
 C
C
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a0001c0001t0024g0194
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HG03225.hp2
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c.-478+16479T>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0083
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NA19002.hp2
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c.-478+16781G>A
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A
 T
T
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HG01175.hp2
HG01891.hp2
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C
 T
T
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G
 A
A
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c.-478+17007G>A
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C
 T
T
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C
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G
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 T
T
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c.-478+17499dupT
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A
 G
G
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G
 A
A
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NA18945.hp1
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T
 A
A
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T
 G
G
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NA18972.hp2
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 A
A
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c.-478+18277G>A
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G
 A
A
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HG02895.hp1
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c.-478+18497G>A
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C
 T
T
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HG03225.hp2
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G
 A
A
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HG03486.hp1
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C
 G
G
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A
 C
C
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c.-478+18861A>C
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 TA
TA
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NA18957.hp2
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c.-478+19041C>G
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G
 C
C
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A
 T
T
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G
 A
A
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a0001c0001t0007g0010
a0001c0001t0007g0085
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NA20129.hp2
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T
 C
C
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NA18906.hp2
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C
 A
A
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G
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HG01074.hp2
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c.-478+20120A>G
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C
 G
G
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HG01099.hp1
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c.-478+20130C>G
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 C
C
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a0001c0001t0011g0148
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HG03831.hp2
HG03927.hp2
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c.-478+20337G>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562011
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 T
T
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HG00609.hp1
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c.-478+20394C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562068
chr1:147562093 C
C
 G
G
 6 a0001c0001t0002g0002
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others(3): Show 
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others(8): Show 
HG00609.hp1
HG01099.hp1
HG01109.hp2
HG02135.hp2
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NA18985.hp1
NA19009.hp1
NA19070.hp1
NA19079.hp1
NA19086.hp1
NA19091.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+20419C>G
c.-478+20419C>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562093
chr1:147562119 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0006g0216
a0001c0001t0006g0216
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HG03486.hp1
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c.-478+20445G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562119
chr1:147562176 A
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 G
G
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a0001c0001t0024g0194
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HG03225.hp2
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c.-478+20502A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562176
chr1:147562317 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0024g0194
a0001c0001t0024g0194
 1 HG03225.hp2
HG03225.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+20643G>A
c.-478+20643G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562317
chr1:147562331 A
A
 AAAATAAA
others(1): Show 
AAAATAAAT
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others(3): Show 
a0001c0001t0003g0159
a0001c0001t0003g0160
a0001c0001t0006g0161
a0001c0001t0009g0218
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HG02145.hp1
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HG02280.hp2
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HG03098.hp1
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others(14): Show 
c.-478+20673_-478+20680dupTAAATAAA
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147562331
chr1:147562383 G
G
 A
A
 27 a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0002g0233
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others(24): Show 
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T
 C
C
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G
 A
A
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562670
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0061
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NA19062.hp2
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c.-478+21039T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562713
chr1:147562724 A
A
 G
G
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a0001c0001t0016g0224
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HG03453.hp1
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c.-478+21050A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562724
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T
 C
C
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a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
HG01934.hp1
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c.-478+21151T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147562825
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T
 C
C
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HG01099.hp1
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c.-478+21330T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563004
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T
 C
C
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HG01074.hp2
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HG02886.hp2
HG03486.hp2
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c.-478+21514T>C
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chr1:147563277 C
C
 T
T
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a0001c0001t0006g0237
a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0006g0237
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HG02630.hp1
HG02723.hp2
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c.-478+21603C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563277
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A
 G
G
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a0001c0001t0010g0016
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NA19012.hp2
NA18986.hp1
NA19012.hp2
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c.-478+21656A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563330
chr1:147563341 A
A
 C
C
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a0001c0001t0002g0021
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a0001c0001t0010g0199
a0002c0002t0002g0022
 11 HG00609.hp1
HG01099.hp1
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others(8): Show 
HG00609.hp1
HG01099.hp1
HG01109.hp2
HG02135.hp2
NA18981.hp1
NA18985.hp1
NA19009.hp1
NA19070.hp1
NA19079.hp1
NA19086.hp1
NA19091.hp1
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c.-478+21667A>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563341
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C
 A
A
 1 a0001c0001t0007g0191
a0001c0001t0007g0191
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HG02976.hp1
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c.-478+21683C>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563357
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A
 T
T
 1 a0001c0001t0014g0229
a0001c0001t0014g0229
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HG02280.hp2
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c.-478+21708A>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563382
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T
 A
A
 3 a0001c0001t0012g0243
a0001c0001t0017g0244
a0001c0001t0020g0245
a0001c0001t0012g0243
a0001c0001t0017g0244
a0001c0001t0020g0245
 3 HG02735.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
HG02735.hp1
HG02738.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+21799T>A
c.-478+21799T>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563473
chr1:147563505 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0014g0229
a0001c0001t0014g0229
 1 HG02280.hp2
HG02280.hp2
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c.-478+21831A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563505
chr1:147563716 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0240
a0001c0001t0006g0240
 1 HG06807.hp2
HG06807.hp2
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c.-478+22042C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563716
chr1:147563796 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0024g0194
a0001c0001t0024g0194
 1 HG03225.hp2
HG03225.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+22122A>G
c.-478+22122A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563796
chr1:147563798 C
C
 T
T
 72 a0001c0001t0002g0002
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others(69): Show 
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a0002c0002t0002g0022
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 81 HG00609.hp1
HG01074.hp2
HG01081.hp2
others(78): Show 
HG00609.hp1
HG01074.hp2
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01109.hp2
HG01175.hp2
HG01891.hp2
HG01934.hp1
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp2
HG02135.hp2
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02280.hp1
HG02280.hp2
HG02486.hp1
HG02559.hp1
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02615.hp1
HG02615.hp2
HG02630.hp1
HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp1
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02818.hp2
HG02886.hp1
HG02886.hp2
HG02895.hp2
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02897.hp2
HG02922.hp1
HG02922.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp1
HG02970.hp2
HG03041.hp1
HG03041.hp2
HG03098.hp1
HG03098.hp2
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03195.hp2
HG03209.hp1
HG03225.hp1
HG03225.hp2
HG03453.hp1
HG03453.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
HG03540.hp1
HG03579.hp1
HG03579.hp2
HG04115.hp2
NA18522.hp1
NA18522.hp2
NA18906.hp2
NA18981.hp1
NA18985.hp1
NA19009.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19043.hp1
NA19043.hp2
NA19070.hp1
NA19079.hp1
NA19086.hp1
NA19091.hp1
NA19240.hp1
NA19240.hp2
NA20129.hp1
NA20300.hp2
NA21309.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+22124C>T
c.-478+22124C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563798
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C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0150
a0001c0001t0004g0150
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HG01978.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+22260C>T
c.-478+22260C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147563934
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C
 T
T
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others(3): Show 
a0001c0001t0003g0159
a0001c0001t0003g0160
a0001c0001t0006g0161
a0001c0001t0009g0218
a0001c0001t0014g0229
a0001c0001t0015g0217
 6 HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02280.hp2
others(3): Show 
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02280.hp2
HG02818.hp2
HG02970.hp1
HG03098.hp1
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c.-478+22395C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564069
chr1:147564257 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0272
a0001c0001t0006g0272
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HG03540.hp1
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c.-478+22583C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564257
chr1:147564283 C
C
 A
A
 3 a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
a0001c0001t0024g0194
a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
a0001c0001t0024g0194
 3 HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG03225.hp2
HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG03225.hp2
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c.-478+22609C>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564283
chr1:147564300 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0023
 1 NA19077.hp1
NA19077.hp1
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c.-478+22626G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564300
chr1:147564355 CT
CT
 C
C
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others(3): Show 
a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0268
a0001c0001t0002g0269
a0001c0001t0010g0199
a0002c0002t0002g0022
 11 HG00609.hp1
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others(8): Show 
HG00609.hp1
HG01099.hp1
HG01109.hp2
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NA18981.hp1
NA18985.hp1
NA19009.hp1
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NA19091.hp1
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c.-478+22684delT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147564355
chr1:147564441 G
G
 T
T
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a0001c0001t0029g0147
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HG03942.hp2
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c.-478+22767G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564441
chr1:147564455 C
C
 A
A
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a0001c0001t0028g0105
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HG03710.hp1
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c.-478+22781C>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564455
chr1:147564456 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0005g0087
a0001c0001t0005g0087
 1 NA18983.hp2
NA18983.hp2
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c.-478+22782T>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564456
chr1:147564479 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0216
a0001c0001t0006g0216
 1 HG03486.hp1
HG03486.hp1
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c.-478+22805T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564479
chr1:147564673 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0005g0155
a0001c0001t0005g0155
 1 HG01981.hp2
HG01981.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+22999A>G
c.-478+22999A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564673
chr1:147564683 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0275
a0001c0001t0006g0275
 1 HG01891.hp2
HG01891.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+23009G>C
c.-478+23009G>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564683
chr1:147564918 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0024g0194
a0001c0001t0024g0194
 1 HG03225.hp2
HG03225.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+23244T>A
c.-478+23244T>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564918
chr1:147564923 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0216
a0001c0001t0006g0216
 1 HG03486.hp1
HG03486.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+23249A>G
c.-478+23249A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564923
chr1:147564980 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0216
a0001c0001t0006g0216
 1 HG03486.hp1
HG03486.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+23306T>C
c.-478+23306T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564980
chr1:147564988 T
T
 TGAGTACA
others(14): Show 
TGAGTACAATAGCTACAATATG
 1 a0001c0001t0004g0106
a0001c0001t0004g0106
 1 HG02071.hp2
HG02071.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+23315_-478+23
others(27): Show 
c.-478+23315_-478+23316insAGTACAATAGCTACAATATGG
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147564988
chr1:147564988 T
T
 TTTCGAGT
others(17): Show 
TTTCGAGTACAATAGCTACAATATG
 1 a0001c0001t0004g0136
a0001c0001t0004g0136
 1 HG02129.hp2
HG02129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+23314_-478+23
others(30): Show 
c.-478+23314_-478+23315insTTCGAGTACAATAGCTACAATATG
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564988
chr1:147564992 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0106
a0001c0001t0004g0136
a0001c0001t0004g0106
a0001c0001t0004g0136
 2 HG02071.hp2
HG02129.hp2
HG02071.hp2
HG02129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+23318A>G
c.-478+23318A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147564992
chr1:147565378 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0263
a0001c0001t0002g0263
 1 NA18997.hp2
NA18997.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+23704A>T
c.-478+23704A>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147565378
chr1:147565690 A
A
 C
C
 6 a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0268
others(3): Show 
a0001c0001t0002g0002
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0268
a0001c0001t0002g0269
a0001c0001t0010g0199
a0002c0002t0002g0022
 11 HG00609.hp1
HG01099.hp1
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others(8): Show 
HG00609.hp1
HG01099.hp1
HG01109.hp2
HG02135.hp2
NA18981.hp1
NA18985.hp1
NA19009.hp1
NA19070.hp1
NA19079.hp1
NA19086.hp1
NA19091.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+24016A>C
c.-478+24016A>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147565690
chr1:147565767 C
C
 T
T
 6 a0001c0001t0003g0159
a0001c0001t0003g0160
a0001c0001t0006g0161
others(3): Show 
a0001c0001t0003g0159
a0001c0001t0003g0160
a0001c0001t0006g0161
a0001c0001t0009g0218
a0001c0001t0014g0229
a0001c0001t0015g0217
 6 HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02280.hp2
others(3): Show 
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02280.hp2
HG02818.hp2
HG02970.hp1
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+24093C>T
c.-478+24093C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147565767
chr1:147565790 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
 2 HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG01081.hp2
HG01934.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+24116T>C
c.-478+24116T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147565790
chr1:147565816 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0003g0159
a0001c0001t0003g0160
a0001c0001t0006g0161
a0001c0001t0003g0159
a0001c0001t0003g0160
a0001c0001t0006g0161
 3 HG02145.hp2
HG02970.hp1
HG03098.hp1
HG02145.hp2
HG02970.hp1
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+24142A>G
c.-478+24142A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147565816
chr1:147565825 T
T
 C
C
 57 a0001c0001t0002g0206
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others(54): Show 
a0001c0001t0002g0206
a0001c0001t0002g0232
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0276
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 61 HG01074.hp2
HG01175.hp2
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others(58): Show 
HG01074.hp2
HG01175.hp2
HG01891.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp2
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NA19043.hp1
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NA20129.hp1
NA20300.hp2
NA21309.hp1
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-478+24151T>C
c.-478+24151T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147565825
chr1:147565866 T
T
 C
C
 5 a0001c0001t0003g0159
a0001c0001t0003g0160
a0001c0001t0006g0161
others(2): Show 
a0001c0001t0003g0159
a0001c0001t0003g0160
a0001c0001t0006g0161
a0001c0001t0009g0218
a0001c0001t0014g0229
 5 HG02145.hp2
HG02280.hp2
HG02818.hp2
others(2): Show 
HG02145.hp2
HG02280.hp2
HG02818.hp2
HG02970.hp1
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+24192T>C
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A
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G
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A
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G
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A
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T
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 T
T
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c.-478+25101dupA
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AAAAAAAG
 A
A
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0278
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HG02965.hp1
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c.-478+25226G>A
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C
 G
G
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G
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C
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c.-478+25479G>C
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C
 A
A
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a0001c0001t0003g0164
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HG00558.hp2
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c.-478+25526C>A
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C
 G
G
 1 a0001c0001t0015g0217
a0001c0001t0015g0217
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HG02145.hp1
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T
 C
C
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a0001c0001t0006g0161
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HG02970.hp1
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c.-478+25800T>C
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C
 A
A
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a0001c0001t0016g0265
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NA19043.hp1
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A
 C
C
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G
 C
C
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a0001c0001t0007g0088
a0001c0001t0007g0149
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HG02273.hp1
HG03710.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0146
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HG00323.hp2
HG02698.hp2
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C
 T
T
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a0003c0004t0001g0135
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HG01071.hp1
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C
 T
T
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G
 C
C
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 C
C
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a0001c0001t0008g0193
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A
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c.-478+26540T>A
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A
 T
T
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A
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C
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G
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C
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T
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0078
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HG02132.hp1
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T
 G
G
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HG01081.hp2
HG01934.hp1
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c.-478+27154T>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
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G
 A
A
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C
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T
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A
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c.-478+28005dupA
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T
 C
C
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HG02280.hp2
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c.-478+28107T>C
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A
 G
G
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c.-478+28509A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0012g0205
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c.-478+28692T>C
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G
 C
C
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c.-478+28716G>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0011g0058
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HG00323.hp1
HG01175.hp1
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c.-478+28877G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147570551
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G
 GC
GC
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c.-478+28916dupC
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147570584
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T
 TTTTC
TTTTC
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NA20805.hp1
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others(10): Show 
c.-478+28960_-478+28961insCTTT
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chr1:147570632 T
T
 TTTC
TTTC
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c.-478+28979T>G
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T
 TG
TG
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T
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TTG
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A
 T
T
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a0001c0001t0024g0194
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HG03225.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147570716
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C
 T
T
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a0001c0001t0005g0186
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HG01123.hp2
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c.-478+29118C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147570792
chr1:147570814 C
C
 T
T
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147570814
chr1:147570815 A
A
 C
C
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a0002c0002t0001g0066
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c.-478+29141A>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147570815
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others(1938): Show 
GGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGAT
CTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTG
TGCCCAGCCCATTGACTGATTTTCTTTTTTTCTTTTCCTTTTATTTTTTT
TGAGATGGAGTTTTGCTCTTGTTGCTATCGGGGTATTTGCATGCATCTCC
CATCCACCAGGCTGTACACCCTGGGACCCACCAGGTGCCCCTGAGAACAT
AGTAGGTCACACACGTTCCAAGGCATGTCTCATCATAGAGACAATTCGTG
GTCAGGAGGTAATAGCTCATTGTTACAGCATTTGCAGTGTGTGATCGGTT
GTGGCATTTGTTCTCAGAACTTTTCATTTTTGATTCTGACTGCTCTGAGG
TGGGTAGGATTGTTTTTATTATCCCCATTTTACCTAGAAAAAAAATGAGA
CAATCTGGTCTCAGATCTGAGTCTTCTGATTCCAAATCCTTCCTTCCTTC
TTGAGCCTTCTGGCCAACCATCACTGATACTCCCATTCTGCAGAGAAAGA
CCAACCTGACACCACCCTTGGGTGGTGTATTTTAGACATAGGCAAGAGTG
GTTTCAGGTTTTCTAATCTCCAAAAAAGTAGCTGCAGCTAGAGACCCTCC
TCTTCATCAAAGCAAAGCTCCTGGGTTGGGAGGAGCTCAATGAACTGGGA
ATTTGGGGGAGAGTTTACCACTAGCCCCTCCCCAGGTTATGTTGAAGTCC
CTTAGTTCTTCCTCAAATGGTGAAAAAGCACCCTTTTCCCTGTATCCCAC
TCCCATTTTCCTACAGAGGGACCTCAGGGTGATGGAAATCAGAGAGAGGA
AATGGCCTCACAACAAGGTGTGGTGGTAGGCAGCCCTCCAGACACACTTG
GTAAGAAAAGCTGGACCTGCTGAGGGTTGCCTCCTGCAGAGATAACACAG
GAAGAGGAGAGAATATGTGCCTTCCCAGACCTCTGCATACCTGAAGCAGC
ATCTAAGTTTCCTTGGTTTTGCCCCAAACTCCTGTACCAGAACCCAGGAC
TCTATTCATTTTCTCTATGCATTTGATCCACATACGTTTATTGAGCACCT
ACTATAAGCCAGGCCCTGTTTGGGTATAAGAGATAAAACATCATGCCTGT
AATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCATGGGATCATGAGG
TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTGTACT
AAAAATACAAAAAAAAATTAGCTGGACGTGGTGGCGGGAGCCTGTAGTCC
CAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGG
AGTTTGCAGTGAGCCAAGATTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAAGTA
GAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAACAAAACAA
AAACAAACGTAAAAGAGATAAAACACCGTAAAACACAATTCTGTCCTGGA
GTTTACATTCTTGTGGGGTATAAGACTAAAGTCCAGGCATGGAGCAGGCT
TTCTCAGAAAAGGTTCCTAAGAGACAAGTGACCAATGTGTTTCCATTTCA
GCCTCTCCTAGCATTGATAGACATCACTTCCAGGACAGGCTAGAGCTCTG
CTGGATGGGAAAGCTTTTGACCTGAGCTGACCATAGGTGACCAGCCAGTA
TGCATTCTAATCACCTTAACACCTCTTTAGAAGGAAAGGTTCATAGGTAG
AAGTTTTTGTTTGTTTGCTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGG
CTGGAGTGCAGTGGCACGATATTGGCTTATTGCCACCTCTGCCTCCTGGA
TTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTG
CGTATCACCAAGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGA
 G
G
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a0001c0001t0005g0089
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HG01261.hp1
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chr1:147570862 T
T
 C
C
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c.-478+29188T>C
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T
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a0001c0001t0024g0194
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HG03225.hp2
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A
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G
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a0001c0001t0004g0057
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NA20905.hp1
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T
 C
C
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a0001c0001t0024g0194
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HG03225.hp2
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c.-478+29489T>C
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G
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A
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a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
HG01934.hp1
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c.-478+29555G>A
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A
 C
C
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c.-478+29705A>C
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C
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T
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a0001c0001t0009g0266
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HG02647.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0012g0204
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HG03834.hp1
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c.-478+29752G>A
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C
 G
G
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c.-478+29800C>G
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G
 A
A
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c.-478+29818G>A
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A
 T
T
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c.-478+29845A>T
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A
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c.-478+30080G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0276
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HG02886.hp2
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c.-478+30232C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147571906
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G
 T
T
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c.-478+30317G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147571991
chr1:147572002 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0032
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HG02027.hp2
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c.-478+30328C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147572002
chr1:147572007 G
G
 A
A
 6 a0001c0001t0002g0002
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HG01099.hp1
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c.-478+30333G>A
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chr1:147572056 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0268
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HG00609.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+30382G>A
c.-478+30382G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147572056
chr1:147572067 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0268
a0001c0001t0002g0268
 1 HG00609.hp1
HG00609.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-478+30393G>A
c.-478+30393G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147572067
chr1:147572083 C
C
 CAA
CAA
 212 a0001c0001t0001g0007
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G
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A
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A
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 A
A
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CA
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C
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c.-478+30548delA
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AAAAAAC
 A
A
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A
 G
G
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a0001c0001t0028g0105
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HG03710.hp1
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A
 T
T
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a0001c0001t0005g0141
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NA18986.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0170
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0170
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HG02074.hp1
NA18942.hp1
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c.-478+31216G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0029g0147
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HG03942.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147572957
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G
 T
T
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A
 G
G
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C
 G
G
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HG03225.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0022g0212
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NA19030.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147573240
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ACT
 A
A
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A
 G
G
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others(2): Show 
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c.-477-31136A>G
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T
 C
C
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HG02109.hp1
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c.-477-30784T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147574039
chr1:147574084 C
C
 G
G
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others(16): Show 
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c.-477-30693C>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147574084
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C
 T
T
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NA20752.hp1
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c.-477-30474C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147574303
chr1:147575009 G
G
 T
T
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NA20905.hp2
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c.-477-29768G>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147575009
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0079
a0001c0001t0001g0079
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NA18971.hp2
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c.-477-29744G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147575033
chr1:147575502 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0007g0073
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HG02897.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
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c.-477-29275A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147575502
chr1:147575759 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0012g0241
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a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
a0001c0001t0024g0194
 3 HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG03225.hp2
HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG03225.hp2
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c.-477-29018T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147575759
chr1:147575799 A
A
 G
G
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a0001c0001t0006g0271
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others(8): Show 
HG02055.hp1
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c.-477-28978A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147575799
chr1:147575881 C
C
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CA
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C
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c.-477-28470G>C
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c.-477-28458G>T
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C
 T
T
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T
 C
C
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HG01081.hp2
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c.-477-28340T>C
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G
 A
A
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c.-477-28318G>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG03225.hp2
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c.-477-28204A>G
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 A
A
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0065
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NA19002.hp1
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T
 A
A
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a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
a0001c0001t0024g0194
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HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG03225.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0007g0074
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HG02055.hp1
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chr1:147577213 C
C
 T
T
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a0001c0001t0008g0210
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HG02109.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147577213
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T
 G
G
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a0001c0001t0005g0092
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HG01169.hp1
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147577243
chr1:147577381 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0010g0199
a0001c0001t0010g0199
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NA19070.hp1
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c.-477-27396T>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147577381
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0272
a0001c0001t0002g0281
a0001c0001t0006g0272
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HG03540.hp1
NA19240.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147577392
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A
 ATG
ATG
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a0001c0001t0001g0060
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HG00621.hp2
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others(8): Show 
c.-477-26907_-477-26906dupGT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
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A
 ATGTG
ATGTG
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others(10): Show 
c.-477-26909_-477-26906dupGTGT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
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A
 ATGTGTG
ATGTGTG
 75 a0001c0001t0002g0002
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others(12): Show 
c.-477-26911_-477-26906dupGTGTGT
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A
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others(1): Show 
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others(14): Show 
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a0001c0001t0002g0276
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HG00323.hp1
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c.-477-26913_-477-26906dupGTGTGTGT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
chr1:147577834 A
A
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ATGTGTGTGTG
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a0001c0001t0003g0003
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a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0258
a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0020
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
chr1:147577834 A
A
 ATGTGTGT
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ATGTGTGTGTGTG
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HG02523.hp1
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
chr1:147577834 A
A
 ATGTGTGT
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ATGTGTGTGTGTGTG
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a0001c0001t0002g0188
a0001c0001t0003g0024
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 19 HG00438.hp2
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HG00438.hp2
HG00558.hp2
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
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A
 ATGTGTGT
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ATGTGTGTGTGTGTGTG
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a0001c0001t0013g0168
a0001c0001t0002g0183
a0001c0001t0013g0168
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NA19005.hp2
NA18997.hp1
NA19005.hp2
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others(22): Show 
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A
 ATGTGTGT
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a0001c0001t0003g0026
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NA18961.hp2
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c.-477-26923_-477-26906dupGTGTGTGTGTGTGTGTGT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
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A
 ATGTGTGT
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ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
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NA18977.hp2
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others(26): Show 
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
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ATGTG
 A
A
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a0001c0001t0010g0283
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others(1): Show 
a0001c0001t0004g0080
a0001c0001t0010g0283
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HG01952.hp2
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HG00544.hp2
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HG02486.hp2
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c.-477-26909_-477-26906delGTGT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147577834
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C
 T
T
 56 a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0034
a0001c0001t0002g0176
others(53): Show 
a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0034
a0001c0001t0002g0176
a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0183
a0001c0001t0002g0188
a0001c0001t0002g0258
a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0009
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a0001c0006t0010g0171
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a0002c0002t0002g0166
a0002c0002t0002g0259
a0002c0002t0002g0260
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a0006c0009t0005g0031
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HG00423.hp2
HG00438.hp2
others(58): Show 
HG00099.hp1
HG00423.hp2
HG00438.hp2
HG00544.hp1
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NA19091.hp2
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c.-477-26699C>T
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A
 G
G
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others(37): Show 
a0001c0001t0001g0045
a0001c0001t0001g0102
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 43 HG00140.hp1
HG01071.hp2
HG01081.hp1
others(40): Show 
HG00140.hp1
HG01071.hp2
HG01081.hp1
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NA20752.hp1
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c.-477-26580A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147578197
chr1:147578558 C
C
 T
T
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a0001c0001t0010g0283
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HG01952.hp2
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c.-477-26219C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147578558
chr1:147578721 A
A
 G
G
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a0001c0001t0012g0241
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HG01934.hp1
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c.-477-26056A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147578721
chr1:147578758 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
a0001c0001t0012g0241
a0001c0001t0019g0274
 2 HG01081.hp2
HG01934.hp1
HG01081.hp2
HG01934.hp1
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c.-477-26019G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147578758
chr1:147578797 T
T
 C
C
 122 a0001c0001t0001g0045
a0001c0001t0001g0102
a0001c0001t0001g0113
others(119): Show 
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a0001c0001t0001g0102
a0001c0001t0001g0113
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c.-477-25519G>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0012g0205
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HG02486.hp2
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c.-477-25369A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147579408
chr1:147579502 C
C
 T
T
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a0001c0001t0007g0191
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HG02976.hp1
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c.-477-25275C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147579502
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A
 C
C
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a0001c0001t0004g0128
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HG02056.hp2
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c.-477-25204A>C
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C
 T
T
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0158
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HG01891.hp1
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c.-477-25022C>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0008g0196
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HG02896.hp2
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c.-477-24931G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147579846
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T
 G
G
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a0001c0001t0004g0043
a0001c0001t0004g0081
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HG02071.hp1
NA19007.hp1
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c.-477-24831T>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147579946
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T
 C
C
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others(1): Show 
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a0001c0001t0007g0103
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others(1): Show 
HG02109.hp1
HG03209.hp2
NA18906.hp1
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147580090
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C
 T
T
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a0001c0001t0014g0195
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HG02280.hp1
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c.-477-24685C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147580092
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T
 C
C
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a0001c0001t0019g0274
a0001c0001t0007g0097
a0001c0001t0019g0274
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HG01081.hp2
HG00140.hp1
HG01081.hp2
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c.-477-24505T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147580272
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C
 T
T
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a0001c0001t0010g0209
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HG02723.hp1
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c.-477-24375C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147580402
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C
 T
T
 1 a0001c0001t0012g0205
a0001c0001t0012g0205
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HG02486.hp2
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c.-477-24222C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147580555
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A
 C
C
 1 a0001c0001t0009g0270
a0001c0001t0009g0270
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HG03225.hp1
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c.-477-23993A>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147580784
chr1:147580855 G
G
 C
C
 24 a0001c0001t0006g0018
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others(21): Show 
a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0192
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HG01175.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
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c.-477-23922G>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147580855
chr1:147580985 TTGA
TTGA
 T
T
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a0001c0001t0004g0083
a0001c0001t0004g0078
a0001c0001t0004g0080
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HG00544.hp2
HG02132.hp1
NA19002.hp2
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others(9): Show 
c.-477-23787_-477-23785delGAT
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 INFO_REALIGN_3_PRIME chr1 147580985
chr1:147581000 G
G
 A
A
 24 a0001c0001t0006g0018
a0001c0001t0006g0192
a0001c0001t0006g0216
others(21): Show 
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a0001c0001t0006g0192
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 25 HG01175.hp2
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others(22): Show 
HG01175.hp2
HG01884.hp2
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NA18522.hp2
NA18906.hp2
NA19043.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp1
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c.-477-23777G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147581000
chr1:147581540 G
G
 A
A
 94 a0001c0001t0001g0062
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others(91): Show 
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c.-477-23137T>G
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T
 C
C
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c.-477-22903T>C
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A
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G
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HG00140.hp1
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c.-477-22902A>G
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C
 T
T
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a0001c0006t0010g0172
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HG01168.hp2
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c.-477-22571C>T
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A
 T
T
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 129 HG00423.hp2
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others(126): Show 
HG00423.hp2
HG00438.hp2
HG00544.hp1
HG00558.hp2
HG00621.hp1
HG00673.hp1
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HG01081.hp1
HG01123.hp2
HG01169.hp1
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HG01934.hp2
HG01952.hp1
HG01981.hp2
HG02027.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
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HG02109.hp2
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HG02559.hp1
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C
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C
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 A
A
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T
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A
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C
 A
A
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a0001c0001t0015g0217
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A
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HG00099.hp2
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A
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C
 A
A
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C
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T
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HG03942.hp1
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 A
A
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HG03927.hp2
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 C
C
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HG02630.hp2
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C
 T
T
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HG02145.hp1
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 A
A
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NA18906.hp2
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T
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c.-477-17920A>C
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C
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CTCTA
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A
 C
C
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c.-477-17739A>C
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C
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T
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c.-477-17682C>T
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T
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G
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a0001c0001t0004g0136
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HG02129.hp2
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c.-477-17569T>G
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GT
 G
G
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c.-477-17171A>G
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C
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CTGTGTG
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a0002c0002t0002g0259
a0002c0002t0002g0260
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NA18981.hp2
NA19003.hp2
NA19009.hp2
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CTG
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C
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a0001c0001t0007g0149
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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T
 G
G
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a0002c0002t0007g0100
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HG02602.hp1
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0251
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NA20905.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0216
a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0006g0237
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HG02630.hp1
HG02723.hp2
HG03486.hp1
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c.-477-16896G>A
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A
 G
G
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NA18971.hp1
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A
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 C
C
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T
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C
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C
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C
 T
T
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C
 T
T
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a0001c0001t0007g0097
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HG00140.hp1
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T
 G
G
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c.-477-15540T>G
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C
 T
T
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HG00140.hp1
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G
 C
C
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T
 C
C
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HG02698.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0177
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HG02523.hp1
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 C
C
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c.-477-14011C>T
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A
 C
C
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a0005c0008t0001g0038
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HG00597.hp2
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c.-477-13996A>C
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c.-477-13995T>C
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A
 G
G
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A
 G
G
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a0001c0001t0006g0284
a0001c0001t0009g0218
a0001c0001t0014g0195
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HG02280.hp1
HG02647.hp1
HG02818.hp2
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C
 G
G
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a0001c0001t0015g0217
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a0001c0001t0007g0097
a0001c0001t0015g0217
a0001c0001t0025g0239
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HG02145.hp1
NA21309.hp2
HG00140.hp1
HG02145.hp1
NA21309.hp2
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c.-477-13234C>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147591543
chr1:147591852 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0014g0229
a0001c0001t0014g0229
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HG02280.hp2
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c.-477-12925A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147591852
chr1:147592113 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0003g0025
a0001c0001t0003g0182
a0001c0001t0003g0025
a0001c0001t0003g0182
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NA18962.hp2
NA18962.hp1
NA18962.hp2
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c.-477-12664A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147592113
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G
 A
A
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 4 HG00738.hp2
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HG00738.hp2
HG01168.hp1
HG01169.hp2
HG01516.hp2
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c.-477-12392G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147592385
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A
 T
T
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a0001c0001t0007g0191
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HG02976.hp1
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c.-477-12283A>T
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0062
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HG00438.hp2
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HG00438.hp1
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HG00558.hp2
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C
 A
A
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a0001c0001t0014g0195
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HG02280.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0009g0200
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HG03453.hp2
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G
 T
T
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A
 G
G
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T
 C
C
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C
 T
T
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A
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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 G
G
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 A
A
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 A
A
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C
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 C
C
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G
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A
 T
T
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HG02976.hp1
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 C
C
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HG02717.hp1
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c.-477-9740T>C
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C
 T
T
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HG02723.hp1
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 A
A
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 A
A
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T
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A
 G
G
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G
 A
A
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T
 A
A
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 G
G
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NA21309.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0282
a0001c0001t0006g0192
a0001c0001t0006g0282
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HG03579.hp2
HG03486.hp2
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T
 A
A
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a0001c0001t0002g0258
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G
 A
A
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G
 C
C
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G
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HG02735.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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 G
G
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HG06807.hp1
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T
 C
C
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G
 C
C
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a0001c0001t0014g0195
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a0001c0001t0015g0217
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others(16): Show 
HG00140.hp1
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c.-477-6656G>C
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T
 C
C
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HG03453.hp2
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c.-477-6638T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147598139
chr1:147598161 G
G
 A
A
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a0001c0001t0004g0128
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HG02056.hp2
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c.-477-6616G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147598161
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 A
A
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a0001c0001t0004g0080
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HG00544.hp2
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c.-477-6571T>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147598206
chr1:147598543 G
G
 T
T
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a0001c0001t0004g0134
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HG03017.hp1
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C
 T
T
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T
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 T
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G
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a0001c0001t0028g0105
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HG03710.hp1
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T
 C
C
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a0001c0001t0011g0086
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HG03927.hp2
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G
 T
T
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NA19010.hp1
NA19056.hp2
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G
 GC
GC
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c.-477-5284dupC
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C
 G
G
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c.-477-5287C>G
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CG
 C
C
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c.-477-5283delG
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G
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C
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c.-477-5283G>C
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C
 CA
CA
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C
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A
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a0001c0001t0007g0097
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HG00140.hp1
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c.-477-5280C>A
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C
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G
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c.-477-5279C>G
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C
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NA18906.hp2
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A
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C
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G
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T
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A
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A
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A
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C
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T
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T
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C
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C
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A
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c.-477-3981dupG
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chr1:147600930 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0056
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HG00609.hp2
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c.-477-3847C>T
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0034
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a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0002g0034
a0005c0008t0001g0038
 3 HG00597.hp2
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HG00597.hp2
NA18989.hp1
NA19007.hp2
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c.-477-3606G>T
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chr1:147601562 A
A
 C
C
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others(9): Show 
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a0001c0001t0001g0050
a0001c0001t0001g0077
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HG00438.hp1
HG01081.hp2
HG01099.hp1
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c.-477-3215A>C
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CAT
 C
C
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others(114): Show 
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HG02074.hp1
HG02080.hp2
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HG02132.hp2
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HG02145.hp1
HG02145.hp2
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others(6): Show 
c.-477-3192_-477-3191delAT
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0130
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NA18953.hp2
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c.-477-3187G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147601590
chr1:147601613 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0118
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HG03831.hp1
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c.-477-3164G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147601613
chr1:147601618 A
A
 T
T
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a0002c0002t0001g0054
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G
 C
C
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T
 C
C
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TTTTA
 T
T
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C
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T
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A
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T
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c.-477-2595G>A
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 T
T
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C
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T
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A
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A
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A
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G
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C
 T
T
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0029
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NA19090.hp2
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c.-477-623C>T
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A
 C
C
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G
 T
T
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T
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T
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a0001c0001t0006g0236
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147604649
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CCTAA
 C
C
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others(6): Show 
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C
 T
T
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HG02523.hp1
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c.-477-99C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 1/9 chr1 147604678
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T
 C
C
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c.-343+12T>C
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A
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G
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a0001c0001t0007g0097
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HG00140.hp1
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c.-343+76A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0008g0213
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HG02055.hp2
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AG
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c.-343+222dupG
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0248
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HG03540.hp2
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c.-343+300T>C
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C
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G
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A
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A
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C
 T
T
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G
 C
C
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 A
A
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C
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 A
A
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 A
A
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A
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 A
A
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C
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CTTT
 C
C
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T
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A
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G
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C
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T
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a0002c0002t0002g0022
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A
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a0001c0001t0023g0208
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HG02630.hp2
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 G
G
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G
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A
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C
 T
T
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HG01256.hp2
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T
 C
C
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T
 G
G
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HG02630.hp2
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C
 T
T
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A
 G
G
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NA18955.hp2
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c.-259-478A>G
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G
 C
C
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a0001c0001t0003g0162
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HG02976.hp2
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 C
C
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A
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G
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HG02630.hp2
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C
 T
T
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HG01074.hp1
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0136
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HG02071.hp2
HG02129.hp2
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c.54-445C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0163
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HG02273.hp2
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chr1:147612708 A
A
 G
G
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CAG
 C
C
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c.54-158_54-157delAG
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C
 T
T
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a0001c0001t0016g0224
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HG03453.hp1
NA19043.hp1
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G
 A
A
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HG01081.hp1
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C
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G
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T
 C
C
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NA18953.hp2
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C
 G
G
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BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 5/9 chr1 147613541
chr1:147613552 C
C
 A
A
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a0001c0001t0003g0170
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0170
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NA18942.hp1
HG02074.hp1
NA18942.hp1
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c.370+353C>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0006g0275
a0001c0001t0023g0208
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HG02630.hp2
HG01891.hp2
HG02630.hp2
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chr1:147614223 G
G
 A
A
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a0001c0001t0003g0159
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HG02970.hp1
HG03098.hp1
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c.371-204G>A
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A
 T
T
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HG02056.hp2
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A
 C
C
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c.560+241dupT
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A
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T
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a0001c0001t0023g0208
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HG02630.hp2
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c.560+496A>T
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G
 A
A
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c.560+551G>A
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others(3): Show 
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 T
T
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others(10): Show 
c.561-591_561-582delTTTCTAAACA
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 6/9 chr1 147615211
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A
 G
G
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c.561-267A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0009g0200
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HG03453.hp2
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c.561-170A>G
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C
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A
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a0001c0001t0001g0063
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HG00673.hp2
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c.561-31C>A
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T
 A
A
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T
 C
C
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a0001c0001t0003g0024
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NA18944.hp1
NA18961.hp2
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c.660+142T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0159
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HG02145.hp2
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c.660+167A>G
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C
 T
T
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c.660+181C>T
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 G
G
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c.660+255T>G
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 A
A
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C
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T
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HG02698.hp1
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A
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C
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G
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 A
A
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a0002c0002t0001g0123
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HG01261.hp2
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A
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A
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T
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TA
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TCA
 T
T
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a0002c0002t0002g0247
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a0002c0002t0001g0112
a0002c0002t0002g0247
a0002c0002t0005g0096
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HG02559.hp2
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T
 C
C
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c.2902+520T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0016g0224
a0001c0001t0016g0265
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NA19043.hp1
HG03453.hp1
NA19043.hp1
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c.2903-538A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0006g0240
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HG06807.hp2
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c.2903-483C>T
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A
 G
G
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c.2903-398A>G
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chr1:147621911 C
C
 T
T
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a0001c0001t0016g0265
a0001c0001t0016g0224
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HG03453.hp1
NA19043.hp1
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c.2903-360C>T
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 8/9 chr1 147621911
chr1:147622026 C
C
 A
A
 2 a0001c0001t0016g0224
a0001c0001t0016g0265
a0001c0001t0016g0224
a0001c0001t0016g0265
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NA19043.hp1
HG03453.hp1
NA19043.hp1
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c.2903-245C>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 8/9 chr1 147622026
chr1:147622076 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0232
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HG02818.hp1
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c.2903-195A>G
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 8/9 chr1 147622076
chr1:147622086 A
A
 G
G
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C
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A
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A
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HG01934.hp1
HG02486.hp2
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G
 A
A
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HG02976.hp1
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A
 C
C
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T
 C
C
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T
 C
C
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HG02723.hp1
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c.3164-257T>C
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 9/9 chr1 147623585
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G
 A
A
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c.3164-189G>A
BCL9 ENSG00000116128.12 transcript ENST00000234739.8 protein_coding 9/9 chr1 147623653

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