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chr1:151578789	A A	G G	2	a0003 a0008 a0003 a0008	7	HG02145.hp1 HG02572.hp2 HG02615.hp1 others(4): Show HG02145.hp1 HG02572.hp2 HG02615.hp1 HG02965.hp1 HG03130.hp1 HG03453.hp2 HG03471.hp2	missense_variant	MODERATE	c.887A>G c.887A>G	p.Lys296Arg p.Lys296Arg	TUFT1	ENSG00000143367.17	transcript	ENST00000368849.8	protein_coding	10/13	945/3107	887/1173	296/390	chr1	151578789
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chr1:151564582	C C	T T	1	a0001c0007 a0001c0007	1	HG03130.hp2 HG03130.hp2	synonymous_variant	LOW	c.382C>T c.382C>T	p.Leu128Leu p.Leu128Leu	TUFT1	ENSG00000143367.17	transcript	ENST00000368849.8	protein_coding	5/13	440/3107	382/1173	128/390			chr1	151564582

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chr1:151540326	G G	T T	5	a0001c0001t0005 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 others(2): Show a0001c0001t0005 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0016 a0003c0003t0026	24	HG00438.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp2 others(21): Show HG00438.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp2 HG01106.hp2 HG01175.hp2 HG01261.hp1 HG01517.hp2 HG02155.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG03453.hp2 HG03490.hp2 HG03710.hp1 HG03710.hp2 HG03834.hp1 HG03927.hp2 NA18939.hp1 NA18941.hp1 NA18948.hp1 NA18985.hp1 NA18992.hp1 NA19057.hp2 NA19070.hp2 NA20752.hp1	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-41G>T c.-41G>T	TUFT1	ENSG00000143367.17	transcript	ENST00000368849.8	protein_coding	1/13			chr1	151540326
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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer TUFT1_chr1_151535309_151588583

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) TUFT1_chr1_151535309_151588583

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 8)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 10)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 26)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 347)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 10)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 39)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 348)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 366)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 7)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 23)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 447)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)