Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr19:52414654	A A	G G	105	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0002 a0001c0001t0001g0003 others(102): Show a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0002 a0001c0001t0001g0003 a0001c0001t0001g0009 a0001c0001t0001g0015 a0001c0001t0001g0025 a0001c0001t0001g0026 a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0028 a0001c0001t0001g0034 a0001c0001t0001g0036 a0001c0001t0001g0038 a0001c0001t0001g0039 a0001c0001t0001g0040 a0001c0001t0001g0041 a0001c0001t0001g0042 a0001c0001t0001g0043 a0001c0001t0001g0044 a0001c0001t0001g0064 a0001c0001t0001g0065 a0001c0001t0001g0066 a0001c0001t0001g0068 a0001c0001t0001g0085 a0001c0001t0001g0086 a0001c0001t0001g0095 a0001c0001t0001g0096 a0001c0001t0001g0098 a0001c0001t0001g0099 a0001c0001t0001g0100 a0001c0001t0001g0101 a0001c0001t0001g0102 a0001c0001t0001g0103 a0001c0001t0001g0104 a0001c0001t0001g0105 a0001c0001t0001g0107 a0001c0001t0001g0108 a0001c0001t0001g0110 a0001c0001t0001g0113 a0001c0001t0001g0114 a0001c0001t0001g0115 a0001c0001t0001g0116 a0001c0001t0001g0117 a0001c0001t0001g0119 a0001c0001t0001g0120 a0001c0001t0001g0121 a0001c0001t0001g0122 a0001c0001t0001g0123 a0001c0001t0001g0124 a0001c0001t0001g0125 a0001c0001t0001g0126 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0130 a0001c0001t0001g0131 a0001c0001t0001g0134 a0001c0001t0001g0135 a0001c0001t0001g0136 a0001c0001t0001g0137 a0001c0001t0001g0138 a0001c0001t0001g0139 a0001c0001t0001g0140 a0001c0001t0001g0141 a0001c0001t0001g0143 a0001c0001t0001g0144 a0001c0001t0001g0145 a0001c0001t0001g0148 a0001c0001t0001g0149 a0001c0001t0001g0165 a0001c0001t0001g0180 a0001c0001t0001g0199 a0001c0001t0001g0205 a0001c0001t0001g0207 a0001c0001t0001g0208 a0001c0001t0001g0229 a0001c0001t0001g0243 a0001c0001t0001g0244 a0001c0001t0003g0053 a0001c0001t0003g0067 a0001c0001t0003g0160 a0001c0001t0003g0189 a0001c0001t0003g0238 a0001c0001t0003g0240 a0001c0001t0009g0035 a0001c0001t0009g0056 a0001c0001t0011g0202 a0001c0001t0011g0203 a0001c0001t0012g0060 a0001c0001t0012g0151 a0001c0001t0013g0002 a0001c0001t0013g0003 a0001c0001t0014g0166 a0001c0001t0014g0187 a0001c0001t0018g0167 a0001c0001t0019g0028 a0001c0001t0020g0097 a0001c0001t0023g0055 a0001c0010t0001g0003 a0002c0002t0005g0016 a0002c0002t0005g0179 a0002c0002t0005g0198 a0003c0004t0001g0003 a0003c0004t0001g0106 a0004c0003t0016g0033 a0004c0003t0024g0033 a0009c0008t0001g0002 a0012c0012t0001g0118	205	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 others(202): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00280.hp1 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp2 HG00558.hp2 HG00609.hp1 HG00621.hp1 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00673.hp1 HG00733.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG00738.hp2 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp1 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01106.hp2 HG01123.hp1 HG01167.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01175.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp2 HG01256.hp1 HG01256.hp2 HG01257.hp1 HG01258.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp1 HG01261.hp2 HG01346.hp1 HG01358.hp1 HG01358.hp2 HG01361.hp1 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01496.hp1 HG01515.hp2 HG01517.hp1 HG01517.hp2 HG01891.hp1 HG01934.hp1 HG01943.hp1 HG01975.hp1 HG01981.hp1 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG02015.hp1 HG02027.hp2 HG02056.hp2 HG02080.hp2 HG02083.hp1 HG02129.hp1 HG02145.hp2 HG02148.hp2 HG02165.hp1 HG02257.hp2 HG02273.hp1 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02293.hp1 HG02293.hp2 HG02300.hp1 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02559.hp2 HG02602.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02683.hp1 HG02698.hp1 HG02717.hp1 HG02735.hp1 HG02735.hp2 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG02886.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02922.hp1 HG02922.hp2 HG02970.hp1 HG02970.hp2 HG02976.hp2 HG03017.hp1 HG03017.hp2 HG03041.hp1 HG03139.hp1 HG03139.hp2 HG03195.hp2 HG03209.hp1 HG03471.hp1 HG03486.hp1 HG03490.hp1 HG03491.hp1 HG03491.hp2 HG03492.hp2 HG03540.hp1 HG03654.hp1 HG03654.hp2 HG03669.hp2 HG03688.hp1 HG03704.hp1 HG03831.hp1 HG03831.hp2 HG03834.hp1 HG03927.hp2 HG03942.hp1 HG04115.hp1 HG04184.hp2 HG04199.hp2 HG04228.hp1 HG06807.hp1 NA18906.hp1 NA18939.hp2 NA18944.hp1 NA18945.hp2 NA18947.hp1 NA18947.hp2 NA18950.hp1 NA18951.hp2 NA18952.hp1 NA18952.hp2 NA18955.hp2 NA18956.hp1 NA18961.hp1 NA18961.hp2 NA18963.hp1 NA18966.hp2 NA18969.hp2 NA18971.hp1 NA18971.hp2 NA18973.hp2 NA18974.hp1 NA18975.hp1 NA18979.hp1 NA18982.hp1 NA18983.hp1 NA18983.hp2 NA18984.hp2 NA18985.hp1 NA18986.hp1 NA18988.hp1 NA18990.hp2 NA18992.hp1 NA19000.hp1 NA19001.hp2 NA19007.hp1 NA19009.hp2 NA19010.hp1 NA19010.hp2 NA19012.hp2 NA19030.hp2 NA19043.hp1 NA19054.hp2 NA19058.hp1 NA19059.hp1 NA19060.hp2 NA19062.hp1 NA19064.hp1 NA19065.hp1 NA19066.hp2 NA19067.hp1 NA19072.hp1 NA19074.hp2 NA19075.hp1 NA19076.hp2 NA19078.hp1 NA19080.hp2 NA19081.hp1 NA19083.hp2 NA19084.hp1 NA19085.hp1 NA19085.hp2 NA19086.hp1 NA19088.hp1 NA19089.hp1 NA19090.hp2 NA19091.hp2 NA19240.hp2 NA20300.hp1 NA20300.hp2 NA20752.hp1 NA20752.hp2 NA20805.hp1 NA20905.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.272-470A>G c.272-470A>G	ZNF528	ENSG00000167555.14	transcript	ENST00000360465.8	protein_coding	6/6		chr19	52414654
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chr19:52415091	G G	A A	1	a0001c0001t0003g0162 a0001c0001t0003g0162	1	HG02818.hp1 HG02818.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.272-33G>A c.272-33G>A	ZNF528	ENSG00000167555.14	transcript	ENST00000360465.8	protein_coding	6/6		chr19	52415091

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JoGo Online Haplotype Explorer ZNF528_chr19_52392849_52423401

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 12)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 15)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 24)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 245)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 15)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 35)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 260)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 476)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 11)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 27)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 239)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)