Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr11:6271155	G G	A A	1	a0006 a0006	1	NA19000.hp2 NA19000.hp2	missense_variant	MODERATE	c.956G>A c.956G>A	p.Arg319Gln p.Arg319Gln	CCKBR	ENSG00000110148.10	transcript	ENST00000334619.7	protein_coding	5/5	1047/2019	956/1344	319/447	chr11	6271155

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chr11:6270305	T T	C C	1	a0001c0003 a0001c0003	6	NA18960.hp1 NA18999.hp1 NA19055.hp2 others(3): Show NA18960.hp1 NA18999.hp1 NA19055.hp2 NA19060.hp1 NA19064.hp2 NA19079.hp2	synonymous_variant	LOW	c.621T>C c.621T>C	p.His207His p.His207His	CCKBR	ENSG00000110148.10	transcript	ENST00000334619.7	protein_coding	3/5	712/2019	621/1344	207/447	chr11	6270305
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chr11:6270983	T T	A A	1	a0001c0001t0006g0285 a0001c0001t0006g0285	1	NA19030.hp2 NA19030.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.812-28T>A c.812-28T>A	CCKBR	ENSG00000110148.10	transcript	ENST00000334619.7	protein_coding	4/4		chr11	6270983

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JoGo Online Haplotype Explorer CCKBR_chr11_6254838_6277127

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 8)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 12)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 36)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 308)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 12)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 56)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 354)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 426)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 7)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 13)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 269)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)