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chr15:66490570	C C	T T	1	a0001c0003 a0001c0003	1	HG02622.hp1 HG02622.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1137C>T c.1137C>T	p.Ile379Ile p.Ile379Ile	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	11/11	1573/2547	1137/1182	379/393	chr15	66490570

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chr15:66386940	G G	T T	1	a0001c0001t0014 a0001c0001t0014	1	HG02572.hp2 HG02572.hp2	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-408G>T c.-408G>T	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/11			chr15	66386940
chr15:66387148	G G	A A	1	a0001c0001t0008 a0001c0001t0008	1	HG02886.hp1 HG02886.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-200G>A c.-200G>A	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/11	200		chr15	66387148
chr15:66387179	A A	G G	1	a0001c0001t0013 a0001c0001t0013	1	HG02280.hp2 HG02280.hp2	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-169A>G c.-169A>G	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/11			chr15	66387179
chr15:66387217	C C	T T	1	a0001c0001t0012 a0001c0001t0012	1	HG02145.hp2 HG02145.hp2	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-131C>T c.-131C>T	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/11	131		chr15	66387217
chr15:66387263	G G	C C	3	a0001c0001t0003 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0003 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010	53	HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00323.hp1 others(50): Show HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00558.hp1 HG00597.hp1 HG00621.hp2 HG00642.hp1 HG00673.hp1 HG00738.hp1 HG00741.hp2 HG01071.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01106.hp2 HG01168.hp2 HG01175.hp1 HG01261.hp1 HG01361.hp1 HG01433.hp2 HG01515.hp2 HG01516.hp1 HG02004.hp1 HG02040.hp1 HG02155.hp1 HG02486.hp1 HG02572.hp1 HG02602.hp2 HG02735.hp1 HG03017.hp2 HG03490.hp2 HG03491.hp2 HG03704.hp2 HG03927.hp1 HG03942.hp1 HG04115.hp1 HG04204.hp2 HG04228.hp2 NA18747.hp1 NA18906.hp1 NA18940.hp1 NA18942.hp2 NA18943.hp2 NA18962.hp1 NA18963.hp1 NA18978.hp1 NA18981.hp1 NA18982.hp1 NA18992.hp1 NA19085.hp1 NA19091.hp1 NA20805.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-85G>C c.-85G>C	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/11	85		chr15	66387263
chr15:66387311	T T	TC TC	5	a0001c0001t0002 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 others(2): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0005t0002	63	HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00544.hp2 others(60): Show HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00544.hp2 HG00558.hp2 HG00597.hp2 HG00621.hp1 HG00642.hp2 HG00673.hp2 HG01243.hp1 HG01255.hp2 HG01884.hp1 HG02056.hp2 HG02071.hp1 HG02109.hp1 HG02148.hp2 HG02165.hp1 HG02273.hp2 HG02300.hp2 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02683.hp2 HG02886.hp1 HG02965.hp1 HG03239.hp1 HG03834.hp1 HG03942.hp2 NA18943.hp1 NA18946.hp2 NA18949.hp1 NA18953.hp1 NA18954.hp2 NA18959.hp1 NA18962.hp2 NA18968.hp2 NA18972.hp1 NA18973.hp2 NA18977.hp1 NA18979.hp2 NA18983.hp1 NA18986.hp1 NA18993.hp2 NA18994.hp1 NA18995.hp1 NA18998.hp1 NA19002.hp2 NA19009.hp1 NA19010.hp2 NA19011.hp1 NA19012.hp1 NA19030.hp1 NA19043.hp2 NA19056.hp2 NA19057.hp2 NA19065.hp2 NA19077.hp2 NA19079.hp2 NA19080.hp1 NA19083.hp1 NA19086.hp2 NA19090.hp1 NA19091.hp1 NA19091.hp2 NA20805.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-31dupC c.-31dupC	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/11	30	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr15	66387311
chr15:66387346	A A	G G	1	a0001c0001t0004 a0001c0001t0004	19	HG00423.hp1 HG03927.hp2 NA18941.hp1 others(16): Show HG00423.hp1 HG03927.hp2 NA18941.hp1 NA18944.hp1 NA18959.hp2 NA18969.hp1 NA18977.hp2 NA18979.hp1 NA18983.hp2 NA18994.hp2 NA18995.hp2 NA18998.hp2 NA19006.hp1 NA19009.hp2 NA19012.hp2 NA19054.hp2 NA19067.hp2 NA19086.hp1 NA20129.hp2	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-2A>G c.-2A>G	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/11	2		chr15	66387346
chr15:66490923	C C	A A	3	a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0009 a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0009	62	HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00280.hp1 others(59): Show HG00099.hp1 HG00140.hp1 HG00280.hp1 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00438.hp2 HG00558.hp1 HG00597.hp1 HG00621.hp2 HG00642.hp1 HG00673.hp1 HG00738.hp1 HG00741.hp2 HG01071.hp1 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01099.hp1 HG01106.hp2 HG01168.hp2 HG01175.hp1 HG01261.hp1 HG01361.hp1 HG01433.hp2 HG01515.hp2 HG01516.hp1 HG02004.hp1 HG02040.hp1 HG02155.hp1 HG02486.hp1 HG02572.hp1 HG02602.hp2 HG02735.hp1 HG02735.hp2 HG03017.hp2 HG03490.hp2 HG03491.hp2 HG03669.hp1 HG03927.hp1 HG03942.hp1 HG04115.hp1 HG04204.hp2 HG04228.hp2 NA18747.hp1 NA18906.hp1 NA18940.hp1 NA18942.hp2 NA18943.hp2 NA18962.hp1 NA18963.hp1 NA18963.hp2 NA18978.hp1 NA18981.hp1 NA18981.hp2 NA18982.hp1 NA18992.hp1 NA19007.hp2 NA19057.hp1 NA19085.hp1 NA19091.hp1 NA20805.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.308C>A c.308C>A	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	11/11	308		chr15	66490923
chr15:66491272	G G	A A	2	a0001c0001t0006 a0001c0001t0012 a0001c0001t0006 a0001c0001t0012	8	HG00280.hp2 HG00639.hp1 HG01515.hp1 others(5): Show HG00280.hp2 HG00639.hp1 HG01515.hp1 HG01517.hp2 HG01978.hp1 HG02145.hp2 HG02602.hp1 HG03688.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.657G>A c.657G>A	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	11/11	657		chr15	66491272
chr15:66491375	G G	A A	1	a0001c0001t0011 a0001c0001t0011	1	HG02040.hp2 HG02040.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.760G>A c.760G>A	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	11/11	760		chr15	66491375
chr15:66491431	A A	C C	1	a0001c0001t0007 a0001c0001t0007	2	HG01255.hp2 HG02630.hp1 HG01255.hp2 HG02630.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.816A>C c.816A>C	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	11/11	816		chr15	66491431

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chr15:66387455	G G	C C	1	a0001c0001t0001g0001 a0001c0001t0001g0001	1	NA20300.hp1 NA20300.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.80+28G>C c.80+28G>C	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/10		chr15	66387455
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chr15:66387481	G G	C C	8	a0001c0001t0006g0002 a0001c0001t0006g0003 a0001c0001t0006g0004 others(5): Show a0001c0001t0006g0002 a0001c0001t0006g0003 a0001c0001t0006g0004 a0001c0001t0006g0006 a0001c0001t0006g0007 a0001c0001t0006g0008 a0001c0001t0006g0009 a0001c0001t0012g0005	8	HG00280.hp2 HG00639.hp1 HG01515.hp1 others(5): Show HG00280.hp2 HG00639.hp1 HG01515.hp1 HG01517.hp2 HG01978.hp1 HG02145.hp2 HG02602.hp1 HG03688.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.80+54G>C c.80+54G>C	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/10		chr15	66387481
chr15:66387512	TG TG	T T	8	a0001c0001t0006g0002 a0001c0001t0006g0003 a0001c0001t0006g0004 others(5): Show a0001c0001t0006g0002 a0001c0001t0006g0003 a0001c0001t0006g0004 a0001c0001t0006g0006 a0001c0001t0006g0007 a0001c0001t0006g0008 a0001c0001t0006g0009 a0001c0001t0012g0005	8	HG00280.hp2 HG00639.hp1 HG01515.hp1 others(5): Show HG00280.hp2 HG00639.hp1 HG01515.hp1 HG01517.hp2 HG01978.hp1 HG02145.hp2 HG02602.hp1 HG03688.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.80+87delG c.80+87delG	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/10	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr15	66387512
chr15:66387619	TC TC	T T	29	a0001c0001t0001g0342 a0001c0001t0001g0343 a0001c0001t0001g0344 others(26): Show a0001c0001t0001g0342 a0001c0001t0001g0343 a0001c0001t0001g0344 a0001c0001t0001g0345 a0001c0001t0001g0346 a0001c0001t0001g0347 a0001c0001t0001g0348 a0001c0001t0001g0349 a0001c0001t0001g0350 a0001c0001t0001g0352 a0001c0001t0001g0353 a0001c0001t0001g0354 a0001c0001t0001g0355 a0001c0001t0001g0356 a0001c0001t0001g0357 a0001c0001t0001g0358 a0001c0001t0001g0359 a0001c0001t0001g0360 a0001c0001t0001g0361 a0001c0001t0001g0362 a0001c0001t0001g0363 a0001c0001t0001g0364 a0001c0001t0001g0365 a0001c0001t0001g0366 a0001c0001t0001g0367 a0001c0001t0001g0369 a0001c0001t0001g0370 a0001c0001t0013g0351 a0001c0006t0001g0368	29	HG00733.hp2 HG01069.hp1 HG01109.hp1 others(26): Show HG00733.hp2 HG01069.hp1 HG01109.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp2 HG02258.hp2 HG02280.hp2 HG02559.hp2 HG02615.hp2 HG02818.hp1 HG02895.hp1 HG02896.hp1 HG02896.hp2 HG02965.hp2 HG03098.hp2 HG03130.hp2 HG03139.hp1 HG03209.hp2 HG03225.hp2 HG03471.hp1 HG03516.hp2 HG06807.hp1 NA18906.hp2 NA19030.hp2 NA19043.hp1 NA20129.hp1 NA20300.hp2 NA21309.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.80+195delC c.80+195delC	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/10	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr15	66387619
chr15:66387814	G G	C C	1	a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0010	1	HG03225.hp1 HG03225.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.80+387G>C c.80+387G>C	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/10		chr15	66387814
chr15:66387937	G G	A A	1	a0001c0001t0002g0011 a0001c0001t0002g0011	1	NA19010.hp2 NA19010.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.80+510G>A c.80+510G>A	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/10		chr15	66387937
chr15:66387967	C C	T T	1	a0001c0001t0002g0341 a0001c0001t0002g0341	1	HG02622.hp2 HG02622.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.80+540C>T c.80+540C>T	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	1/10		chr15	66387967
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chr15:66490103	C C	T T	3	a0001c0001t0001g0245 a0001c0001t0001g0246 a0001c0001t0002g0060 a0001c0001t0001g0245 a0001c0001t0001g0246 a0001c0001t0002g0060	3	NA18946.hp1 NA18949.hp1 NA18967.hp2 NA18946.hp1 NA18949.hp1 NA18967.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1068+340C>T c.1068+340C>T	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	10/10		chr15	66490103
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chr15:66490183	G G	A A	1	a0001c0003t0001g0155 a0001c0003t0001g0155	1	HG02622.hp1 HG02622.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1069-319G>A c.1069-319G>A	MAP2K1	ENSG00000169032.11	transcript	ENST00000307102.10	protein_coding	10/10		chr15	66490183
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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer MAP2K1_chr15_66381912_66496544

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ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 1)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 14)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 372)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 6)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 19)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 372)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 372)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 0)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 11)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1600)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)