Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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NA20300	hp2	a0001	c0001	t0001	g0245	AFR	USA	CPLX1_chr4_779957_831129	CPLX1	chr4	779957	831129
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NA21309	hp2	a0001	c0001	t0003	g0191	AFR	LWK	CPLX1_chr4_779957_831129	CPLX1	chr4	779957	831129
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chr4:786510	G G	C C	1	a0001c0003 a0001c0003	1	HG02809.hp1 HG02809.hp1	synonymous_variant	LOW	c.396C>G c.396C>G	p.Leu132Leu p.Leu132Leu	CPLX1	ENSG00000168993.15	transcript	ENST00000304062.11	protein_coding	4/4	559/2112	396/405	132/134			chr4	786510

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JoGo Online Haplotype Explorer CPLX1_chr4_779957_831129

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 29)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 389)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 3)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 31)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 389)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 416)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 24)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 630)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)