Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr10:63620679	T T	C C	1	a0001c0001t0053g0066 a0001c0001t0053g0066	1	HG03239.hp2 HG03239.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.712-134T>C c.712-134T>C	REEP3	ENSG00000165476.14	transcript	ENST00000373758.5	protein_coding	7/7		chr10	63620679

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer REEP3_chr10_63516401_63630128

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 77)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 279)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 4)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 80)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 281)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 284)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 1)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 78)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 817)

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Annotation (SNP Array)