Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr15:78471825	A A	C C	1	a0001c0008 a0001c0008	2	NA18948.hp2 NA18957.hp1 NA18948.hp2 NA18957.hp1	synonymous_variant	LOW	c.784A>C c.784A>C	p.Arg262Arg p.Arg262Arg	IREB2	ENSG00000136381.13	transcript	ENST00000258886.13	protein_coding	7/22	906/6324	784/2892	262/963	chr15	78471825
chr15:78471845	A A	G G	1	a0001c0006 a0001c0006	4	HG02630.hp1 HG02976.hp1 HG03130.hp1 others(1): Show HG02630.hp1 HG02976.hp1 HG03130.hp1 HG03139.hp2	synonymous_variant	LOW	c.804A>G c.804A>G	p.Lys268Lys p.Lys268Lys	IREB2	ENSG00000136381.13	transcript	ENST00000258886.13	protein_coding	7/22	926/6324	804/2892	268/963	chr15	78471845
chr15:78478316	C C	T T	1	a0001c0012 a0001c0012	1	HG01099.hp2 HG01099.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1215C>T c.1215C>T	p.Leu405Leu p.Leu405Leu	IREB2	ENSG00000136381.13	transcript	ENST00000258886.13	protein_coding	10/22	1337/6324	1215/2892	405/963	chr15	78478316
chr15:78484844	G G	A A	1	a0001c0004 a0001c0004	6	NA18978.hp2 NA18982.hp1 NA18997.hp1 others(3): Show NA18978.hp2 NA18982.hp1 NA18997.hp1 NA19054.hp2 NA19082.hp1 NA19083.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1497G>A c.1497G>A	p.Leu499Leu p.Leu499Leu	IREB2	ENSG00000136381.13	transcript	ENST00000258886.13	protein_coding	12/22	1619/6324	1497/2892	499/963	chr15	78484844
chr15:78497146	C C	T T	3	a0001c0002 a0001c0008 a0001c0009 a0001c0002 a0001c0008 a0001c0009	154	HG00099.hp2 HG00280.hp1 HG00280.hp2 others(151): Show HG00099.hp2 HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp1 HG00423.hp1 HG00438.hp1 HG00544.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00597.hp2 HG00609.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00673.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp2 HG00738.hp1 HG00741.hp2 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp1 HG01106.hp1 HG01106.hp2 HG01109.hp2 HG01123.hp1 HG01123.hp2 HG01169.hp1 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01192.hp2 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01346.hp1 HG01361.hp1 HG01515.hp2 HG01516.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01952.hp2 HG01975.hp1 HG01981.hp2 HG02004.hp1 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02027.hp2 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02080.hp1 HG02129.hp1 HG02129.hp2 HG02132.hp2 HG02145.hp2 HG02165.hp2 HG02280.hp2 HG02300.hp2 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02559.hp1 HG02683.hp1 HG02698.hp2 HG02738.hp2 HG02818.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02970.hp2 HG03098.hp1 HG03225.hp2 HG03491.hp1 HG03491.hp2 HG03492.hp2 HG03540.hp1 HG03654.hp2 HG03704.hp2 HG03710.hp1 HG03710.hp2 HG03834.hp2 HG03942.hp2 HG04115.hp2 HG04184.hp1 HG04199.hp1 HG04228.hp1 NA18612.hp1 NA18612.hp2 NA18747.hp1 NA18906.hp2 NA18939.hp2 NA18941.hp1 NA18942.hp1 NA18944.hp1 NA18945.hp1 NA18948.hp2 NA18949.hp1 NA18950.hp2 NA18951.hp2 NA18954.hp2 NA18956.hp1 NA18957.hp1 NA18959.hp1 NA18962.hp1 NA18967.hp1 NA18968.hp2 NA18969.hp2 NA18970.hp2 NA18971.hp2 NA18973.hp2 NA18978.hp1 NA18980.hp1 NA18980.hp2 NA18981.hp2 NA18983.hp1 NA18989.hp2 NA18990.hp1 NA18992.hp2 NA18998.hp1 NA18999.hp1 NA18999.hp2 NA19007.hp1 NA19007.hp2 NA19009.hp1 NA19009.hp2 NA19010.hp1 NA19012.hp1 NA19030.hp1 NA19043.hp2 NA19055.hp1 NA19056.hp2 NA19058.hp2 NA19066.hp1 NA19067.hp2 NA19068.hp2 NA19072.hp2 NA19074.hp1 NA19076.hp2 NA19078.hp1 NA19079.hp1 NA19082.hp2 NA19086.hp2 NA19087.hp1 NA19091.hp1 NA20129.hp2 NA20300.hp1 NA20805.hp2 NA20905.hp2 NA21309.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2616C>T c.2616C>T	p.Ala872Ala p.Ala872Ala	IREB2	ENSG00000136381.13	transcript	ENST00000258886.13	protein_coding	21/22	2738/6324	2616/2892	872/963	chr15	78497146
chr15:78497299	A A	C C	1	a0001c0009 a0001c0009	1	HG03540.hp1 HG03540.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2769A>C c.2769A>C	p.Thr923Thr p.Thr923Thr	IREB2	ENSG00000136381.13	transcript	ENST00000258886.13	protein_coding	21/22	2891/6324	2769/2892	923/963	chr15	78497299

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chr15:78438217	A A	G G	3	a0001c0001t0047 a0001c0001t0048 a0001c0001t0049 a0001c0001t0047 a0001c0001t0048 a0001c0001t0049	3	HG02886.hp1 NA19030.hp2 NA21309.hp1 HG02886.hp1 NA19030.hp2 NA21309.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-121A>G c.-121A>G	IREB2	ENSG00000136381.13	transcript	ENST00000258886.13	protein_coding	1/22	121		chr15	78438217
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chr15:78438249	C C	T T	16	a0001c0001t0002 a0001c0001t0018 a0001c0001t0019 others(13): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0018 a0001c0001t0019 a0001c0001t0027 a0001c0001t0042 a0001c0001t0044 a0001c0002t0003 a0001c0002t0017 a0001c0002t0026 a0001c0002t0039 a0001c0002t0040 a0001c0002t0041 a0001c0002t0043 a0001c0002t0045 a0001c0008t0003 a0004c0007t0019	144	HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00544.hp1 others(141): Show HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00544.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00597.hp2 HG00609.hp1 HG00639.hp2 HG00673.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp2 HG00738.hp2 HG00741.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01074.hp2 HG01081.hp2 HG01106.hp2 HG01123.hp2 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01192.hp2 HG01255.hp2 HG01256.hp2 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01261.hp1 HG01496.hp2 HG01515.hp1 HG01515.hp2 HG01517.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01952.hp2 HG01975.hp1 HG01978.hp2 HG01981.hp2 HG02004.hp1 HG02004.hp2 HG02015.hp1 HG02056.hp1 HG02074.hp2 HG02080.hp1 HG02083.hp1 HG02109.hp1 HG02129.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp2 HG02165.hp2 HG02257.hp2 HG02258.hp1 HG02300.hp2 HG02559.hp1 HG02683.hp1 HG02698.hp1 HG02738.hp2 HG02922.hp2 HG02970.hp1 HG03041.hp2 HG03098.hp2 HG03195.hp1 HG03225.hp1 HG03490.hp1 HG03491.hp1 HG03540.hp2 HG03710.hp2 HG03831.hp2 HG03834.hp2 HG03927.hp1 HG03942.hp1 HG03942.hp2 HG04204.hp2 HG04228.hp2 HG06807.hp1 NA18612.hp2 NA18747.hp1 NA18939.hp2 NA18940.hp1 NA18941.hp1 NA18945.hp1 NA18946.hp2 NA18948.hp2 NA18950.hp2 NA18952.hp1 NA18952.hp2 NA18953.hp1 NA18954.hp2 NA18956.hp1 NA18957.hp1 NA18959.hp1 NA18959.hp2 NA18960.hp2 NA18961.hp1 NA18962.hp1 NA18962.hp2 NA18963.hp1 NA18967.hp1 NA18970.hp1 NA18970.hp2 NA18971.hp2 NA18973.hp2 NA18974.hp2 NA18977.hp1 NA18977.hp2 NA18978.hp1 NA18980.hp2 NA18981.hp1 NA18982.hp2 NA18987.hp2 NA18989.hp2 NA18991.hp2 NA18995.hp2 NA18997.hp2 NA18998.hp1 NA18999.hp2 NA19001.hp1 NA19003.hp2 NA19004.hp2 NA19005.hp1 NA19005.hp2 NA19007.hp1 NA19009.hp1 NA19010.hp1 NA19056.hp1 NA19056.hp2 NA19064.hp2 NA19065.hp1 NA19066.hp2 NA19068.hp1 NA19068.hp2 NA19072.hp1 NA19072.hp2 NA19074.hp2 NA19082.hp2 NA19083.hp2 NA19084.hp1 NA19086.hp1 NA19086.hp2 NA19087.hp1 NA19088.hp1 NA19091.hp2 NA20129.hp1 NA20805.hp1 NA21309.hp2	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-89C>T c.-89C>T	IREB2	ENSG00000136381.13	transcript	ENST00000258886.13	protein_coding	1/22			chr15	78438249
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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer IREB2_chr15_78433216_78506453

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Translation Multiple Alignment View

ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 6)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 12)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 49)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 378)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 12)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 59)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 385)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 420)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 5)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 40)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 659)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)