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ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

  Error connecting to IGV?   SH3GL2_chr9_17574066_17802124  SH3GL2_chr9_17574066_17802124 (clean+top1000)

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Item Value
geneid 6456
ensemblid ENSG00000107295.10
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HG00438 hp2 a0001 c0001 t0002 g0241 EAS CHS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00558 hp1 a0001 c0001 t0001 g0083 EAS CHS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00558 hp2 a0001 c0001 t0001 g0139 EAS CHS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00609 hp1 a0001 c0001 t0001 g0124 EAS CHS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00609 hp2 a0001 c0001 t0001 g0038 EAS CHS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00639 hp1 a0001 c0001 t0001 g0149 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00639 hp2 a0001 c0001 t0002 g0030 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00642 hp1 a0001 c0001 t0002 g0177 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00642 hp2 a0001 c0001 t0003 g0098 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00673 hp1 a0001 c0001 t0001 g0090 EAS CHS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00673 hp2 a0001 c0001 t0001 g0043 EAS CHS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00733 hp1 a0001 c0001 t0003 g0094 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00733 hp2 a0001 c0001 t0001 g0065 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00735 hp1 a0001 c0001 t0002 g0018 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG00735 hp2 a0001 c0001 t0001 g0066 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01070 hp1 a0001 c0001 t0001 g0080 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01070 hp2 a0001 c0001 t0002 g0001 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01071 hp1 a0001 c0001 t0002 g0001 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01071 hp2 a0001 c0001 t0003 g0035 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01074 hp1 a0001 c0001 t0011 g0256 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01074 hp2 a0001 c0001 t0001 g0081 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01081 hp1 a0001 c0001 t0002 g0026 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01081 hp2 a0001 c0001 t0001 g0176 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01099 hp1 a0001 c0001 t0002 g0127 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01099 hp2 a0001 c0001 t0005 g0171 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01109 hp1 a0001 c0001 t0002 g0197 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01109 hp2 a0001 c0001 t0001 g0243 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01175 hp1 a0001 c0001 t0001 g0170 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01175 hp2 a0001 c0001 t0001 g0095 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01192 hp1 a0001 c0001 t0001 g0152 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01192 hp2 a0001 c0001 t0006 g0215 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01243 hp1 a0001 c0001 t0001 g0166 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01243 hp2 a0001 c0001 t0001 g0100 AMR PUR SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01255 hp1 a0001 c0001 t0001 g0052 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01255 hp2 a0001 c0001 t0002 g0239 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01258 hp1 a0001 c0001 t0001 g0114 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01258 hp2 a0001 c0001 t0006 g0213 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01261 hp1 a0001 c0001 t0002 g0156 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01261 hp2 a0001 c0001 t0002 g0118 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01358 hp1 a0001 c0001 t0006 g0212 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01358 hp2 a0001 c0001 t0002 g0104 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01361 hp1 a0001 c0001 t0001 g0113 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01361 hp2 a0001 c0001 t0003 g0237 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01433 hp1 a0001 c0001 t0001 g0027 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01433 hp2 a0001 c0001 t0001 g0187 AMR CLM SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01515 hp1 a0001 c0001 t0003 g0076 EUR IBS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01515 hp2 a0001 c0001 t0001 g0115 EUR IBS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01516 hp1 a0001 c0001 t0003 g0028 EUR IBS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01516 hp2 a0001 c0001 t0002 g0238 EUR IBS SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01884 hp1 a0001 c0001 t0001 g0159 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01884 hp2 a0001 c0001 t0001 g0250 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG01978 hp1 a0001 c0001 t0002 g0024 AMR PEL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG02015 hp1 a0001 c0001 t0001 g0068 EAS KHV SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG02040 hp2 a0001 c0001 t0001 g0121 EAS KHV SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02055 hp1 a0001 c0001 t0001 g0227 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02055 hp2 a0001 c0001 t0001 g0194 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02056 hp1 a0001 c0001 t0001 g0091 EAS KHV SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02056 hp2 a0001 c0001 t0001 g0034 EAS KHV SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG02074 hp2 a0001 c0001 t0001 g0120 EAS KHV SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG02148 hp2 a0001 c0001 t0002 g0025 AMR PEL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02165 hp1 a0001 c0001 t0002 g0069 EAS CDX SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02165 hp2 a0001 c0001 t0001 g0032 EAS CDX SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02257 hp1 a0001 c0001 t0001 g0186 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG02258 hp1 a0001 c0001 t0001 g0020 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02258 hp2 a0001 c0001 t0001 g0225 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02273 hp1 a0001 c0001 t0002 g0045 AMR PEL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02273 hp2 a0001 c0001 t0002 g0092 AMR PEL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG02300 hp1 a0001 c0001 t0002 g0103 AMR PEL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02300 hp2 a0001 c0001 t0001 g0128 AMR PEL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02451 hp1 a0001 c0001 t0001 g0249 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02451 hp2 a0001 c0001 t0001 g0161 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02523 hp1 a0001 c0001 t0001 g0110 EAS KHV SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02523 hp2 a0001 c0001 t0002 g0003 EAS KHV SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02572 hp1 a0001 c0001 t0004 g0230 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02572 hp2 a0001 c0001 t0001 g0252 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02622 hp1 a0001 c0001 t0003 g0200 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02622 hp2 a0001 c0001 t0006 g0221 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02630 hp1 a0001 c0001 t0001 g0246 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02630 hp2 a0001 c0002 t0013 g0162 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02647 hp1 a0001 c0001 t0002 g0202 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02647 hp2 a0001 c0001 t0001 g0222 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02683 hp1 a0001 c0001 t0005 g0169 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02683 hp2 a0001 c0001 t0001 g0061 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02717 hp1 a0001 c0001 t0004 g0148 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02717 hp2 a0001 c0001 t0002 g0199 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02723 hp1 a0001 c0001 t0001 g0203 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02723 hp2 a0001 c0001 t0001 g0224 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02735 hp1 a0001 c0001 t0001 g0048 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02735 hp2 a0001 c0001 t0001 g0173 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02809 hp1 a0001 c0001 t0006 g0214 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02809 hp2 a0001 c0001 t0004 g0206 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02886 hp1 a0001 c0001 t0004 g0174 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02886 hp2 a0001 c0001 t0001 g0201 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02895 hp1 a0001 c0001 t0001 g0188 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02895 hp2 a0001 c0001 t0004 g0255 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02965 hp1 a0001 c0001 t0001 g0210 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02965 hp2 a0001 c0001 t0001 g0235 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02976 hp1 a0001 c0001 t0008 g0196 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02976 hp2 a0001 c0001 t0001 g0185 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03017 hp1 a0001 c0001 t0007 g0172 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03017 hp2 a0001 c0001 t0001 g0117 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03041 hp1 a0001 c0001 t0002 g0021 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03041 hp2 a0001 c0001 t0008 g0253 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03098 hp1 a0001 c0002 t0005 g0226 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03098 hp2 a0001 c0001 t0018 g0216 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03130 hp1 a0001 c0001 t0010 g0218 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03130 hp2 a0001 c0001 t0001 g0244 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03139 hp1 a0001 c0001 t0001 g0157 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03139 hp2 a0001 c0001 t0011 g0257 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03195 hp1 a0001 c0001 t0001 g0190 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03195 hp2 a0001 c0001 t0002 g0247 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03225 hp1 a0001 c0001 t0001 g0183 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03225 hp2 a0001 c0001 t0001 g0254 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03453 hp1 a0001 c0001 t0001 g0164 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03453 hp2 a0001 c0001 t0006 g0217 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03486 hp1 a0001 c0001 t0001 g0192 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03486 hp2 a0001 c0001 t0004 g0205 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03491 hp1 a0001 c0001 t0001 g0140 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03491 hp2 a0001 c0001 t0002 g0144 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03516 hp1 a0001 c0001 t0008 g0158 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03516 hp2 a0001 c0001 t0001 g0207 AFR ESN SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03540 hp1 a0001 c0001 t0001 g0223 AFR GWD SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG03579 hp1 a0001 c0001 t0001 g0234 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03579 hp2 a0001 c0001 t0021 g0258 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03654 hp1 a0001 c0001 t0001 g0175 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03654 hp2 a0001 c0001 t0001 g0054 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03669 hp1 a0001 c0001 t0001 g0073 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03669 hp2 a0001 c0001 t0001 g0141 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03704 hp1 a0001 c0001 t0001 g0154 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03704 hp2 a0001 c0001 t0002 g0167 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03710 hp1 a0001 c0001 t0002 g0031 SAS PJL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG03831 hp1 a0001 c0001 t0002 g0062 SAS BEB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03831 hp2 a0001 c0001 t0003 g0002 SAS BEB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
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HG04184 hp1 a0001 c0001 t0007 g0143 SAS BEB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG04184 hp2 a0001 c0001 t0005 g0022 SAS BEB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG04199 hp1 a0001 c0001 t0005 g0178 SAS STU SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG04199 hp2 a0001 c0001 t0003 g0023 SAS STU SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG04228 hp1 a0001 c0001 t0001 g0084 SAS STU SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG04228 hp2 a0001 c0001 t0007 g0165 SAS STU SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18612 hp1 a0001 c0001 t0001 g0106 EAS CHB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18612 hp2 a0001 c0001 t0005 g0046 EAS CHB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18747 hp1 a0001 c0001 t0001 g0097 EAS CHB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18747 hp2 a0001 c0001 t0001 g0142 EAS CHB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18906 hp1 a0001 c0001 t0001 g0208 AFR YRI SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18906 hp2 a0001 c0001 t0002 g0204 AFR YRI SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18939 hp1 a0001 c0001 t0001 g0136 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18939 hp2 a0001 c0001 t0002 g0245 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18942 hp1 a0001 c0001 t0002 g0123 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18942 hp2 a0001 c0001 t0001 g0040 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18943 hp1 a0001 c0001 t0001 g0089 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18943 hp2 a0001 c0001 t0001 g0082 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18944 hp1 a0001 c0001 t0001 g0071 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18944 hp2 a0001 c0001 t0002 g0079 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18948 hp1 a0001 c0001 t0001 g0232 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18948 hp2 a0001 c0001 t0005 g0047 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18950 hp1 a0001 c0001 t0001 g0059 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18950 hp2 a0001 c0001 t0001 g0011 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18953 hp1 a0001 c0001 t0002 g0072 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18953 hp2 a0001 c0001 t0001 g0006 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18961 hp1 a0001 c0001 t0001 g0087 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18961 hp2 a0001 c0001 t0001 g0051 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18962 hp1 a0001 c0001 t0002 g0133 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18962 hp2 a0001 c0003 t0002 g0039 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18966 hp1 a0001 c0001 t0001 g0060 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18966 hp2 a0001 c0001 t0001 g0088 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18968 hp1 a0001 c0001 t0002 g0236 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18968 hp2 a0001 c0001 t0001 g0056 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18970 hp1 a0001 c0001 t0001 g0105 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18970 hp2 a0001 c0001 t0001 g0145 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18971 hp1 a0001 c0001 t0001 g0013 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18971 hp2 a0001 c0001 t0001 g0053 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18972 hp1 a0001 c0001 t0002 g0004 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18972 hp2 a0001 c0001 t0002 g0057 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18975 hp1 a0001 c0001 t0001 g0012 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18975 hp2 a0001 c0001 t0005 g0036 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18977 hp1 a0001 c0001 t0001 g0007 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18977 hp2 a0001 c0001 t0001 g0130 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18986 hp1 a0001 c0001 t0015 g0041 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18986 hp2 a0001 c0001 t0002 g0129 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18989 hp1 a0001 c0001 t0001 g0044 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18989 hp2 a0001 c0001 t0001 g0240 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18991 hp1 a0001 c0001 t0001 g0008 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18991 hp2 a0001 c0001 t0002 g0233 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18994 hp1 a0001 c0001 t0001 g0014 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18994 hp2 a0001 c0001 t0001 g0109 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18999 hp1 a0001 c0001 t0001 g0147 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA18999 hp2 a0001 c0001 t0001 g0135 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19002 hp1 a0001 c0001 t0001 g0116 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19002 hp2 a0001 c0001 t0001 g0078 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19009 hp1 a0001 c0001 t0002 g0070 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19009 hp2 a0001 c0001 t0002 g0005 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19010 hp1 a0001 c0001 t0001 g0075 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19010 hp2 a0001 c0001 t0005 g0146 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19011 hp1 a0001 c0001 t0001 g0067 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19011 hp2 a0001 c0001 t0001 g0016 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19012 hp1 a0001 c0001 t0002 g0131 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19012 hp2 a0001 c0001 t0001 g0049 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19030 hp1 a0001 c0001 t0001 g0251 AFR LWK SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19030 hp2 a0001 c0001 t0001 g0242 AFR LWK SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19064 hp1 a0001 c0001 t0001 g0229 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19064 hp2 a0001 c0001 t0016 g0122 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19074 hp1 a0001 c0001 t0001 g0055 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19074 hp2 a0001 c0001 t0001 g0126 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19077 hp1 a0001 c0001 t0001 g0085 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19077 hp2 a0001 c0001 t0002 g0017 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19079 hp1 a0001 c0001 t0001 g0108 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19079 hp2 a0001 c0001 t0001 g0228 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19086 hp1 a0001 c0001 t0002 g0132 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19086 hp2 a0001 c0001 t0001 g0033 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19087 hp1 a0003 c0005 t0014 g0137 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19087 hp2 a0001 c0003 t0002 g0010 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19088 hp1 a0001 c0001 t0001 g0042 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19088 hp2 a0001 c0001 t0002 g0134 EAS JPT SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19240 hp1 a0001 c0001 t0009 g0181 AFR YRI SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA19240 hp2 a0001 c0001 t0010 g0219 AFR YRI SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20129 hp1 a0001 c0001 t0004 g0209 AFR ASW SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20129 hp2 a0001 c0001 t0001 g0019 AFR ASW SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20752 hp1 a0001 c0001 t0001 g0099 EUR TSI SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20752 hp2 a0001 c0001 t0003 g0151 EUR TSI SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20805 hp1 a0001 c0001 t0001 g0029 EUR TSI SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20805 hp2 a0001 c0001 t0003 g0155 EUR TSI SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20905 hp1 a0001 c0001 t0001 g0015 SAS GIH SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20905 hp2 a0001 c0001 t0002 g0101 SAS GIH SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02109 hp1 a0001 c0001 t0004 g0198 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02109 hp2 a0001 c0001 t0001 g0160 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02559 hp1 a0001 c0001 t0001 g0163 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG02559 hp2 a0001 c0001 t0004 g0193 AFR ACB SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03471 hp1 a0001 c0001 t0001 g0248 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG03471 hp2 a0001 c0001 t0001 g0184 AFR MSL SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG06807 hp1 a0001 c0001 t0009 g0009 AFR USA SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
HG06807 hp2 a0001 c0001 t0002 g0179 AFR USA SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20300 hp1 a0001 c0001 t0001 g0191 AFR USA SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
NA20300 hp2 a0001 c0001 t0002 g0037 AFR USA SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
homoSapiens_chm13v2 hp1 a0002 c0004 t0003 g0111 REF REF SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124
homoSapiens_grch38 hp1 a0001 c0001 t0012 g0182 REF REF SH3GL2_chr9_17574066_17802124 SH3GL2 chr9 17574066 17802124

chr:pos ref alt #
# of ahapid:amino-acid(protein) level
 ahapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr9:17793461 G
G
 T
T
 1 a0003
a0003
 1 NA19087.hp1
NA19087.hp1
 missense_variant MODERATE c.823G>T
c.823G>T
 p.Gly275Trp
p.Gly275Trp
 SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 8/9 1000/2617 823/1059 275/352 chr9 17793461
chr9:17793465 G
G
 T
T
 1 a0002
a0002
 1 homoSapiens_chm13v2.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 missense_variant MODERATE c.827G>T
c.827G>T
 p.Gly276Val
p.Gly276Val
 SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 8/9 1004/2617 827/1059 276/352 chr9 17793465

chr:pos ref alt #
# of chapid
 chapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr9:17793385 T
T
 C
C
 1 a0001c0002
a0001c0002
 2 HG02630.hp2
HG03098.hp1
HG02630.hp2
HG03098.hp1
 synonymous_variant LOW c.747T>C
c.747T>C
 p.Ser249Ser
p.Ser249Ser
 SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 8/9 924/2617 747/1059 249/352 chr9 17793385
chr9:17793400 A
A
 G
G
 1 a0001c0006
a0001c0006
 1 HG03710.hp2
HG03710.hp2
 synonymous_variant LOW c.762A>G
c.762A>G
 p.Glu254Glu
p.Glu254Glu
 SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 8/9 939/2617 762/1059 254/352 chr9 17793400
chr9:17795545 T
T
 A
A
 1 a0001c0003
a0001c0003
 2 NA18962.hp2
NA19087.hp2
NA18962.hp2
NA19087.hp2
 splice_region_variant&synonymous_variant LOW c.861T>A
c.861T>A
 p.Gly287Gly
p.Gly287Gly
 SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 9/9 1038/2617 861/1059 287/352 chr9 17795545

chr:pos ref alt #
# of thapid:transcript level
 thapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr9:17579130 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0011
a0001c0001t0021
a0001c0001t0011
a0001c0001t0021
 3 HG01074.hp1
HG03139.hp2
HG03579.hp2
HG01074.hp1
HG03139.hp2
HG03579.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-113C>G
c.-113C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/9 113 chr9 17579130
chr9:17579165 C
C
 T
T
 5 a0001c0001t0006
a0001c0001t0010
a0001c0001t0018
others(2): Show 
a0001c0001t0006
a0001c0001t0010
a0001c0001t0018
a0001c0001t0019
a0001c0001t0020
 11 HG01192.hp2
HG01258.hp2
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others(8): Show 
HG01192.hp2
HG01258.hp2
HG01358.hp1
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HG03098.hp2
HG03130.hp1
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NA19240.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-78C>T
c.-78C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/9 78 chr9 17579165
chr9:17579170 C
C
 CCCCGCTC
others(11): Show 
CCCCGCTCGGCCCTCCAGT
 1 a0001c0001t0017
a0001c0001t0017
 1 HG01978.hp2
HG01978.hp2
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-69_-52dupGCTCGGCC
others(10): Show 
c.-69_-52dupGCTCGGCCCTCCAGTCCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/9 51 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17579170
chr9:17579192 C
C
 G
G
 24 a0001c0001t0001
a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
others(21): Show 
a0001c0001t0001
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a0003c0005t0014
 259 HG00140.hp1
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HG00280.hp1
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c.-51C>G
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T
 G
G
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c.-43T>G
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G
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A
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c.*199G>A
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 C
C
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a0003c0005t0014
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NA19087.hp1
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c.*241G>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0016
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NA19064.hp2
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c.*358A>G
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G
 C
C
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a0001c0001t0007
a0002c0004t0003
a0001c0001t0003
a0001c0001t0007
a0002c0004t0003
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others(13): Show 
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c.*636G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 9/9 636 chr9 17796379
chr9:17796409 G
G
 C
C
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a0001c0001t0019
a0001c0001t0009
a0001c0001t0019
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HG02145.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
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c.*666G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 9/9 666 chr9 17796409
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T
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others(24): Show 
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a0001c0001t0007
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others(1): Show 
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HG04228.hp2
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others(25): Show 
c.*752_*782dupAATTTCTTGCTATACAGAAACTATGTATGTA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 9/9 783 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17796492
chr9:17796532 C
C
 G
G
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C
 T
T
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a0001c0002t0013
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HG02630.hp2
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T
 G
G
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c.*927T>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0008
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c.*1121G>A
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G
 C
C
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c.*1207G>C
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chr:pos ref alt #
# of ghapid:genebody level
 ghapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid genebody_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr9:17579353 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0259
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HG00438.hp1
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c.45+66C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17579353
chr9:17579372 T
T
 C
C
 152 a0001c0001t0001g0006
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C
 T
T
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HG03139.hp2
HG03579.hp2
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C
 G
G
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C
 A
A
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0252
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HG02572.hp2
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c.45+280C>G
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G
 T
T
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a0001c0001t0003g0151
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0003g0151
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HG00280.hp1
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c.45+300G>T
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C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0003g0151
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0003g0151
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c.45+301C>T
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0152
a0001c0006t0001g0153
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G
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 G
G
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c.45+405T>G
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chr9:17579696 C
C
 G
G
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c.45+409C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17579696
chr9:17579727 T
T
 C
C
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a0001c0001t0003g0002
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HG03831.hp2
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c.45+440T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17579727
chr9:17579758 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0004g0148
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HG00639.hp1
HG02717.hp1
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c.45+471C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17579758
chr9:17579763 C
C
 T
T
 15 a0001c0001t0001g0168
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c.45+476C>T
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chr9:17579765 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0080
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others(95): Show 
HG00140.hp1
HG00280.hp2
HG00408.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.45+478C>G
c.45+478C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17579765
chr9:17579774 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0003
 1 HG02523.hp2
HG02523.hp2
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c.45+487C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17579774
chr9:17579844 A
A
 C
C
 11 a0001c0001t0006g0212
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others(8): Show 
a0001c0001t0006g0212
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 11 HG01192.hp2
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others(8): Show 
HG01192.hp2
HG01258.hp2
HG01358.hp1
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c.45+557A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17579844
chr9:17579936 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0152
a0001c0006t0001g0153
a0001c0001t0001g0152
a0001c0006t0001g0153
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HG03710.hp2
HG01192.hp1
HG03710.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+649A>G
c.45+649A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17579936
chr9:17580008 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0002g0077
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 3 HG02148.hp1
NA18944.hp2
NA19002.hp2
HG02148.hp1
NA18944.hp2
NA19002.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+721T>C
c.45+721T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17580008
chr9:17580081 A
A
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0152
a0001c0006t0001g0153
a0001c0001t0001g0152
a0001c0006t0001g0153
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HG01192.hp1
HG03710.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+794A>T
c.45+794A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17580081
chr9:17580232 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0009g0181
 1 NA19240.hp1
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+945T>G
c.45+945T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17580232
chr9:17580327 G
G
 A
A
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C
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G
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NA18999.hp1
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 T
T
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A
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C
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A
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A
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 T
T
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HG00323.hp1
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c.45+1828G>T
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 A
A
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CTA
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C
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T
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A
 G
G
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G
 A
A
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c.45+2376G>A
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0207
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a0001c0001t0004g0206
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HG02809.hp2
HG03516.hp2
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c.45+2478C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17581765
chr9:17581781 C
C
 G
G
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c.45+2494C>G
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chr9:17581907 C
C
 T
T
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NA18970.hp2
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c.45+2620C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17581907
chr9:17581918 C
C
 G
G
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a0001c0001t0002g0144
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HG03491.hp2
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c.45+2631C>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0007g0143
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HG04184.hp1
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c.45+2707A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17581994
chr9:17582168 G
G
 T
T
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c.45+2881G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17582168
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AATTG
 A
A
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 intron_variant MODIFIER c.45+2999_45+3002del
others(4): Show 
c.45+2999_45+3002delTGAT
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chr9:17582315 CT
CT
 C
C
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0248
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others(2): Show 
HG01243.hp1
HG01884.hp2
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c.45+3030delT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17582315
chr9:17582403 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0259
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HG00438.hp1
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c.45+3116G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17582403
chr9:17582629 T
T
 A
A
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a0001c0001t0001g0084
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HG04228.hp1
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c.45+3342T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17582629
chr9:17582700 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0246
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HG02630.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+3413A>G
c.45+3413A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17582700
chr9:17582764 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0001g0250
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HG01884.hp2
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c.45+3477C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17582764
chr9:17583023 C
C
 T
T
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0019g0220
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others(1): Show 
HG01192.hp1
HG02145.hp1
HG02630.hp1
HG03710.hp2
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c.45+3736C>T
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chr9:17583290 G
G
 A
A
 28 a0001c0001t0001g0080
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others(25): Show 
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0154
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a0001c0001t0001g0161
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a0001c0001t0005g0178
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 28 HG00323.hp1
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others(25): Show 
HG00323.hp1
HG00642.hp1
HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01081.hp2
HG01099.hp2
HG01175.hp1
HG01261.hp1
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
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HG02630.hp2
HG02683.hp1
HG02735.hp2
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HG03516.hp1
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c.45+4003G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17583290
chr9:17583312 A
A
 G
G
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others(88): Show 
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a0001c0001t0001g0007
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a0001c0001t0007g0096
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a0001c0001t0016g0122
a0001c0001t0017g0112
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a0002c0004t0003g0111
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HG00280.hp2
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others(89): Show 
HG00140.hp1
HG00280.hp2
HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00558.hp2
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HG00642.hp2
HG00673.hp1
HG00733.hp1
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HG01099.hp1
HG01109.hp2
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HG01261.hp2
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HG01361.hp1
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HG01515.hp2
HG01516.hp2
HG01978.hp2
HG02027.hp1
HG02027.hp2
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HG02040.hp2
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HG02074.hp2
HG02145.hp1
HG02145.hp2
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HG02273.hp2
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HG02300.hp2
HG02523.hp1
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c.45+4025A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0007g0165
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c.45+4213C>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0164
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HG03453.hp1
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c.45+4215A>G
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A
 G
G
 94 a0001c0001t0001g0006
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c.45+4561A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0142
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NA18747.hp2
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c.45+4687A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0152
a0001c0006t0001g0153
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HG01192.hp1
HG03710.hp2
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c.45+4688C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17583975
chr9:17584151 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0008
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NA18991.hp1
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c.45+4864G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584151
chr9:17584203 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0075
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NA19010.hp1
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c.45+4916C>T
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chr9:17584227 G
G
 A
A
 89 a0001c0001t0001g0006
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c.45+5172T>C
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0148
 1 HG02717.hp1
HG02717.hp1
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c.45+5173G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584460
chr9:17584512 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0074
 1 HG02074.hp1
HG02074.hp1
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c.45+5225A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584512
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
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c.45+5396G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584683
chr9:17584704 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0135
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others(8): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
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 11 HG00558.hp2
HG02027.hp1
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others(8): Show 
HG00558.hp2
HG02027.hp1
NA18939.hp1
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c.45+5417A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584704
chr9:17584733 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0084
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HG04228.hp1
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c.45+5446A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0248
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0248
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 6 HG01243.hp1
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others(3): Show 
HG01243.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
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c.45+5447T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584734
chr9:17584770 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.45+5483C>T
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chr9:17584791 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
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c.45+5504A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584791
chr9:17584989 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0183
 2 HG02559.hp1
HG03225.hp1
HG02559.hp1
HG03225.hp1
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c.45+5702A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584989
chr9:17584995 C
C
 A
A
 7 a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0248
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0248
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a0001c0001t0001g0250
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 7 HG01243.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
others(4): Show 
HG01243.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG02630.hp1
HG03195.hp2
HG03471.hp1
HG03486.hp2
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c.45+5708C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17584995
chr9:17585140 C
C
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0004g0209
 4 HG02965.hp1
HG03516.hp2
NA18906.hp1
others(1): Show 
HG02965.hp1
HG03516.hp2
NA18906.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+5853C>G
c.45+5853C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585140
chr9:17585215 G
G
 A
A
 10 a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0214
others(7): Show 
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0020g0211
 10 HG01074.hp1
HG01192.hp2
HG01258.hp2
others(7): Show 
HG01074.hp1
HG01192.hp2
HG01258.hp2
HG01358.hp1
HG02280.hp1
HG02809.hp1
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NA19240.hp2
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c.45+5928G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585215
chr9:17585276 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
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NA18906.hp1
others(1): Show 
HG02965.hp1
HG03516.hp2
NA18906.hp1
NA20129.hp1
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c.45+5989A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585276
chr9:17585330 A
A
 G
G
 26 a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
others(23): Show 
a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
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a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0203
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a0001c0001t0001g0252
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a0001c0001t0002g0197
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a0001c0001t0002g0202
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a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0004g0148
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 26 HG00639.hp1
HG01109.hp1
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others(23): Show 
HG00639.hp1
HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp1
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HG02717.hp2
HG02723.hp1
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HG02976.hp1
HG02976.hp2
HG03195.hp1
HG03486.hp1
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NA18906.hp2
NA19030.hp1
NA19240.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+6043A>G
c.45+6043A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585330
chr9:17585348 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0165
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+6061G>T
c.45+6061G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585348
chr9:17585536 A
A
 G
G
 11 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0246
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0008g0253
 11 HG01243.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
others(8): Show 
HG01243.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG02630.hp1
HG02895.hp2
HG03041.hp2
HG03195.hp2
HG03225.hp2
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+6249A>G
c.45+6249A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585536
chr9:17585553 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0001g0149
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a0001c0001t0004g0148
 3 HG00639.hp1
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HG02717.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+6266T>C
c.45+6266T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585553
chr9:17585567 C
C
 T
T
 9 a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0214
others(6): Show 
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0214
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a0001c0001t0020g0211
 9 HG01192.hp2
HG01258.hp2
HG01358.hp1
others(6): Show 
HG01192.hp2
HG01258.hp2
HG01358.hp1
HG02280.hp1
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HG03098.hp2
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NA19240.hp2
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c.45+6280C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585567
chr9:17585579 G
G
 A
A
 21 a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0154
others(18): Show 
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0168
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a0001c0001t0002g0004
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a0001c0001t0002g0156
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a0001c0001t0002g0177
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a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0004g0174
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 21 HG00323.hp1
HG00642.hp1
HG01070.hp1
others(18): Show 
HG00323.hp1
HG00642.hp1
HG01070.hp1
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HG03704.hp2
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NA18972.hp1
NA19009.hp2
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+6292G>A
c.45+6292G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585579
chr9:17585671 TCTCAGTG
others(10): Show 
TCTCAGTGCAGTTCACAG
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0130
a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0130
 2 HG00558.hp1
NA18977.hp2
HG00558.hp1
NA18977.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+6402_45+6418del
others(17): Show 
c.45+6402_45+6418delCTCAGTGCAGTTCACAG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17585671
chr9:17585722 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0129
 1 NA18986.hp2
NA18986.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+6435A>G
c.45+6435A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585722
chr9:17585825 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0073
 1 HG03669.hp1
HG03669.hp1
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c.45+6538A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585825
chr9:17585828 G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0252
 5 HG01433.hp2
HG02257.hp1
HG02572.hp2
others(2): Show 
HG01433.hp2
HG02257.hp1
HG02572.hp2
HG02895.hp1
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+6541G>A
c.45+6541G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17585828
chr9:17585898 G
G
 A
A
 181 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0080
others(178): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0083
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a0001c0001t0001g0141
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a0001c0001t0001g0163
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a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0168
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a0001c0001t0001g0186
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HG01361.hp2
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HG03704.hp2
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c.45+6688G>A
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T
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C
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c.45+6787C>G
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A
 G
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c.45+6816A>G
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G
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A
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A
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G
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c.45+7228A>G
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chr9:17586535 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0222
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HG02647.hp2
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c.45+7248G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17586535
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C
 A
A
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a0001c0001t0009g0181
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HG02809.hp2
NA19240.hp1
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c.45+7351C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17586638
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C
 A
A
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c.45+8134A>G
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G
 A
A
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HG02559.hp1
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c.45+8153G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17587440
chr9:17587614 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0071
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NA18944.hp1
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c.45+8327A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17587614
chr9:17587622 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0163
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HG02559.hp1
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c.45+8335A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0127
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HG01099.hp1
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c.45+8372C>T
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A
 C
C
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c.45+8402A>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0070
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NA19009.hp1
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c.45+8417C>T
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G
 C
C
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a0001c0001t0001g0184
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a0001c0001t0001g0186
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HG01243.hp1
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c.45+8418G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17587705
chr9:17587739 A
A
 T
T
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a0001c0001t0002g0204
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NA18906.hp2
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c.45+8452A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17587739
chr9:17587838 T
T
 A
A
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others(2): Show 
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NA18962.hp1
NA18999.hp2
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c.45+8551T>A
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chr9:17587899 C
C
 A
A
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a0001c0001t0001g0184
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HG03471.hp2
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c.45+8612C>A
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chr9:17587899 C
C
 CA
CA
 29 a0001c0001t0001g0157
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a0001c0001t0001g0185
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 29 HG01109.hp1
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others(26): Show 
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HG01433.hp2
HG02055.hp2
HG02109.hp1
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HG02280.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02622.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
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HG02976.hp2
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NA20129.hp1
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c.45+8624dupA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17587899
chr9:17587899 CA
CA
 C
C
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others(3): Show 
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HG01243.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.45+8624delA
c.45+8624delA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17587899
chr9:17588085 G
G
 C
C
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others(2): Show 
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others(2): Show 
HG01192.hp1
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c.45+8798G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17588085
chr9:17588168 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
 1 NA18948.hp1
NA18948.hp1
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c.45+8881C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17588168
chr9:17588251 TG
TG
 T
T
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a0001c0001t0001g0248
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a0001c0001t0001g0248
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HG01884.hp2
HG02451.hp1
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c.45+8966delG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17588251
chr9:17588286 G
G
 A
A
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a0001c0001t0005g0022
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HG04184.hp2
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c.45+8999G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17588286
chr9:17588339 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0204
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NA18906.hp2
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c.45+9052G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17588339
chr9:17588399 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0184
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HG03471.hp2
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c.45+9112A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17588399
chr9:17588449 T
T
 C
C
 28 a0001c0001t0001g0185
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others(25): Show 
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a0001c0001t0001g0186
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HG02647.hp2
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c.45+9162T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17588449
chr9:17588787 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0183
 2 HG02559.hp1
HG03225.hp1
HG02559.hp1
HG03225.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+9500G>A
c.45+9500G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17588787
chr9:17589004 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0184
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HG03471.hp2
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c.45+9717A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589004
chr9:17589046 A
A
 T
T
 31 a0001c0001t0001g0184
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a0001c0001t0001g0186
others(28): Show 
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
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 31 HG01109.hp1
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others(28): Show 
HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp1
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HG02451.hp1
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HG02572.hp2
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HG02647.hp2
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HG02895.hp1
HG02976.hp1
HG02976.hp2
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HG03471.hp2
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NA19240.hp1
NA20300.hp1
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c.45+9759A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589046
chr9:17589107 C
C
 A
A
 116 a0001c0001t0001g0027
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others(114): Show 
HG00140.hp1
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c.45+9820C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589107
chr9:17589118 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0248
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a0001c0001t0001g0248
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HG01884.hp2
HG02451.hp1
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c.45+9831A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589118
chr9:17589206 T
T
 C
C
 34 a0001c0001t0001g0166
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a0001c0001t0001g0184
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a0001c0001t0001g0186
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HG01109.hp1
HG01243.hp1
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c.45+9919T>C
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chr9:17589433 C
C
 G
G
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a0001c0001t0002g0069
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HG02165.hp1
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c.45+10146C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589433
chr9:17589450 T
T
 G
G
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others(20): Show 
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HG00642.hp1
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c.45+10163T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589450
chr9:17589469 A
A
 C
C
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a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
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a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0004g0189
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a0001c0001t0004g0205
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a0001c0001t0008g0196
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0011g0256
 36 HG01074.hp1
HG01109.hp1
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others(33): Show 
HG01074.hp1
HG01109.hp1
HG01243.hp1
HG01433.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp1
HG02280.hp2
HG02451.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02622.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02895.hp1
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HG02976.hp2
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HG03195.hp2
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HG03471.hp2
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HG03486.hp2
HG03540.hp2
NA18906.hp2
NA19030.hp1
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+10182A>C
c.45+10182A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589469
chr9:17589682 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0255
 1 HG02895.hp2
HG02895.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+10395A>C
c.45+10395A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589682
chr9:17589792 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0085
 1 NA19077.hp1
NA19077.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+10505T>A
c.45+10505T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589792
chr9:17589823 G
G
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0124
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0126
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0124
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0126
a0001c0001t0002g0123
 4 HG00609.hp1
HG02040.hp1
NA18942.hp1
others(1): Show 
HG00609.hp1
HG02040.hp1
NA18942.hp1
NA19074.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+10536G>T
c.45+10536G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589823
chr9:17589824 T
T
 A
A
 4 a0001c0001t0001g0124
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0126
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0124
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0126
a0001c0001t0002g0123
 4 HG00609.hp1
HG02040.hp1
NA18942.hp1
others(1): Show 
HG00609.hp1
HG02040.hp1
NA18942.hp1
NA19074.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+10537T>A
c.45+10537T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589824
chr9:17589935 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0205
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+10648C>T
c.45+10648C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17589935
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C
 CTTCT
CTTCT
 3 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0019g0220
a0001c0006t0001g0153
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0019g0220
a0001c0006t0001g0153
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HG02145.hp1
HG03710.hp2
HG01192.hp1
HG02145.hp1
HG03710.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+10881_45+10884d
others(6): Show 
c.45+10881_45+10884dupTTCT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17590163
chr9:17590296 T
T
 G
G
 6 a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0166
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 6 HG01243.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
others(3): Show 
HG01243.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG03195.hp2
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HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+11009T>G
c.45+11009T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17590296
chr9:17590301 G
G
 A
A
 127 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0027
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others(124): Show 
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a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0001g0110
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a0001c0001t0001g0173
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a0001c0001t0001g0176
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a0001c0001t0001g0234
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a0001c0001t0002g0001
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+11014G>A
c.45+11014G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17590301
chr9:17590367 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0030
 1 HG00639.hp2
HG00639.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+11080C>G
c.45+11080C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17590367
chr9:17590433 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
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 4 HG02965.hp1
HG03516.hp2
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others(1): Show 
HG02965.hp1
HG03516.hp2
NA18906.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+11146T>C
c.45+11146T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17590433
chr9:17590667 AAGCTCCT
others(7): Show 
AAGCTCCTTTTCCCT
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0222
 1 HG02647.hp2
HG02647.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+11387_45+11400d
others(16): Show 
c.45+11387_45+11400delTTTTCCCTAGCTCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17590667
chr9:17590789 T
T
 C
C
 7 a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0248
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
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a0001c0001t0011g0256
 7 HG01074.hp1
HG01243.hp1
HG01884.hp2
others(4): Show 
HG01074.hp1
HG01243.hp1
HG01884.hp2
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HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+11502T>C
c.45+11502T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17590789
chr9:17590815 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0074
 1 HG02074.hp1
HG02074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+11528G>A
c.45+11528G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17590815
chr9:17590845 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0148
 1 HG02717.hp1
HG02717.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+11558T>G
c.45+11558T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17590845
chr9:17591044 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0001g0251
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+11757C>T
c.45+11757C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17591044
chr9:17591194 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0068
 1 HG02015.hp1
HG02015.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+11907C>T
c.45+11907C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17591194
chr9:17591408 G
G
 T
T
 164 a0001c0001t0001g0006
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others(161): Show 
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T
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C
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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G
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c.45+12545A>G
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T
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c.45+12545A>T
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G
 T
T
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a0001c0006t0001g0153
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HG01192.hp1
HG03710.hp2
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c.45+12569G>T
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chr9:17591980 A
A
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G
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a0001c0001t0002g0156
 1 HG01261.hp1
HG01261.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+12693A>G
c.45+12693A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17591980
chr9:17591986 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0183
 2 HG02559.hp1
HG03225.hp1
HG02559.hp1
HG03225.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+12699T>C
c.45+12699T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17591986
chr9:17591992 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0152
a0001c0006t0001g0153
a0001c0001t0001g0152
a0001c0006t0001g0153
 2 HG01192.hp1
HG03710.hp2
HG01192.hp1
HG03710.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+12705T>C
c.45+12705T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17591992
chr9:17592020 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0152
 1 HG01192.hp1
HG01192.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+12733G>C
c.45+12733G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17592020
chr9:17592114 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0011g0257
 3 HG02630.hp1
HG03139.hp2
HG03471.hp2
HG02630.hp1
HG03139.hp2
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+12827G>T
c.45+12827G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17592114
chr9:17592189 G
G
 A
A
 8 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0248
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0247
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a0001c0001t0011g0256
 8 HG01074.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
others(5): Show 
HG01074.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG02559.hp1
HG03195.hp2
HG03225.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+12902G>A
c.45+12902G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17592189
chr9:17592252 G
G
 A
A
 8 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0248
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
 8 HG01074.hp1
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HG02451.hp1
others(5): Show 
HG01074.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG02559.hp1
HG03195.hp2
HG03225.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp2
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c.45+12965G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17592252
chr9:17592735 G
G
 GA
GA
 9 a0001c0001t0001g0163
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others(6): Show 
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a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0247
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 9 HG01074.hp1
HG01243.hp1
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others(6): Show 
HG01074.hp1
HG01243.hp1
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG02559.hp1
HG03195.hp2
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HG03471.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+13456dupA
c.45+13456dupA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17592735
chr9:17592880 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+13593C>G
c.45+13593C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17592880
chr9:17592929 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0066
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0066
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 4 HG00323.hp2
HG00733.hp2
HG00735.hp2
others(1): Show 
HG00323.hp2
HG00733.hp2
HG00735.hp2
HG03831.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+13642A>G
c.45+13642A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17592929
chr9:17592964 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0255
 1 HG02895.hp2
HG02895.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+13677A>G
c.45+13677A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17592964
chr9:17592966 G
G
 A
A
 13 a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0192
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0004g0193
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 13 HG01109.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
others(10): Show 
HG01109.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02559.hp2
HG02622.hp1
HG02647.hp1
HG02717.hp2
HG02886.hp2
HG02976.hp1
HG03195.hp1
HG03486.hp1
HG03540.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+13679G>A
c.45+13679G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17592966
chr9:17593043 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0123
 1 NA18942.hp1
NA18942.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+13756G>C
c.45+13756G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17593043
chr9:17593147 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0016g0122
a0001c0001t0016g0122
 1 NA19064.hp2
NA19064.hp2
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c.45+13860A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17593147
chr9:17593150 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0020g0211
 1 HG02280.hp1
HG02280.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+13863T>G
c.45+13863T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17593150
chr9:17593213 T
T
 G
G
 10 a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0214
others(7): Show 
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0010g0219
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a0001c0001t0020g0211
 10 HG01192.hp2
HG01258.hp2
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others(7): Show 
HG01192.hp2
HG01258.hp2
HG01358.hp1
HG02280.hp1
HG02809.hp1
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03453.hp2
HG06807.hp1
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+13926T>G
c.45+13926T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17593213
chr9:17593222 T
T
 C
C
 26 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
others(23): Show 
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
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a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0203
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 26 HG01109.hp1
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HG02055.hp2
others(23): Show 
HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp1
HG02280.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02622.hp1
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02895.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp1
HG02976.hp2
HG03195.hp1
HG03486.hp1
HG03540.hp2
NA18906.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+13935T>C
c.45+13935T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17593222
chr9:17593260 A
A
 G
G
 178 a0001c0001t0001g0006
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others(175): Show 
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a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0001g0091
a0001c0001t0001g0093
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0201
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A
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A
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G
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G
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G
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C
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c.45+15374T>A
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0222
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HG02647.hp2
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c.45+15416C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17594703
chr9:17594798 C
C
 T
T
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a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0008g0253
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HG03225.hp2
HG03041.hp2
HG03225.hp2
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c.45+15511C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17594798
chr9:17594852 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0144
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HG03491.hp2
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c.45+15565T>C
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G
 A
A
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NA19240.hp2
NA20752.hp1
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NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.45+15892G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17595179
chr9:17595280 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0222
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HG02647.hp2
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c.45+15993C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17595280
chr9:17595308 C
C
 A
A
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others(12): Show 
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HG01884.hp1
HG02109.hp2
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c.45+16021C>A
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A
 G
G
 158 a0001c0001t0001g0006
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C
 A
A
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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T
 G
G
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 C
C
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A
 AT
AT
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c.45+16414dupT
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G
 T
T
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HG03579.hp2
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G
 A
A
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C
 T
T
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T
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 G
G
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c.45+16584A>G
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A
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C
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a0001c0001t0001g0222
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HG02647.hp2
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c.45+16659A>C
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C
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G
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c.45+16708C>G
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A
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G
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HG02895.hp2
HG03041.hp2
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c.45+16728A>G
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G
 T
T
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c.45+16764G>T
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chr9:17596101 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.45+16814A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596101
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others(2): Show 
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 C
C
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HG01884.hp1
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others(11): Show 
c.45+16885_45+16893delAAAACTATT
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chr9:17596204 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0079
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HG02148.hp1
NA18944.hp2
NA19002.hp2
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c.45+16917A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596204
chr9:17596362 TA
TA
 T
T
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others(1): Show 
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others(1): Show 
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c.45+17077delA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17596362
chr9:17596404 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
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HG03516.hp2
NA18906.hp1
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c.45+17117G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596404
chr9:17596431 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0223
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HG03540.hp1
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c.45+17144T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596431
chr9:17596630 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
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NA18906.hp1
HG03516.hp2
NA18906.hp1
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c.45+17343G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596630
chr9:17596660 C
C
 T
T
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a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
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c.45+17373C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596660
chr9:17596667 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0190
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HG03195.hp1
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c.45+17380T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596667
chr9:17596693 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
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HG02074.hp2
HG02040.hp2
HG02074.hp2
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c.45+17406A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596693
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T
 G
G
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others(3): Show 
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a0001c0001t0001g0180
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HG00323.hp1
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c.45+17548T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596835
chr9:17596854 A
A
 G
G
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a0001c0001t0006g0217
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HG03453.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+17567A>G
c.45+17567A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596854
chr9:17596944 G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0071
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0072
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NA18944.hp1
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HG02165.hp2
NA18944.hp1
NA18953.hp1
NA19009.hp1
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c.45+17657G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17596944
chr9:17597163 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0034
 1 HG02056.hp2
HG02056.hp2
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c.45+17876G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597163
chr9:17597326 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
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c.45+18039A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597326
chr9:17597363 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0002g0204
 1 NA18906.hp2
NA18906.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+18076A>C
c.45+18076A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597363
chr9:17597403 G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0235
 2 HG02965.hp2
HG03579.hp1
HG02965.hp2
HG03579.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+18116G>C
c.45+18116G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597403
chr9:17597418 G
G
 A
A
 10 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0157
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0222
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a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0021g0258
a0001c0002t0005g0226
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 10 HG01192.hp1
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others(7): Show 
HG01192.hp1
HG02055.hp1
HG02258.hp2
HG02647.hp2
HG02723.hp2
HG03098.hp1
HG03139.hp1
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HG03710.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+18131G>A
c.45+18131G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597418
chr9:17597421 G
G
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0254
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0004g0255
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 4 HG02895.hp2
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others(1): Show 
HG02895.hp2
HG03041.hp2
HG03225.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.45+18134G>T
c.45+18134G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597421
chr9:17597489 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
 2 HG03516.hp2
NA18906.hp1
HG03516.hp2
NA18906.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+18202C>G
c.45+18202C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597489
chr9:17597516 C
C
 CA
CA
 24 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0086
others(21): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0087
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a0001c0001t0001g0120
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a0001c0001t0001g0136
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 24 HG00558.hp1
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others(21): Show 
HG00558.hp1
HG00639.hp2
HG01081.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02027.hp2
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NA19087.hp2
NA19088.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+18243dupA
c.45+18243dupA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17597516
chr9:17597516 CA
CA
 C
C
 10 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0223
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
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a0001c0001t0002g0118
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a0001c0002t0005g0226
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 10 HG01074.hp1
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others(7): Show 
HG01074.hp1
HG01192.hp1
HG01261.hp2
HG02055.hp1
HG02258.hp2
HG02647.hp2
HG02723.hp2
HG03098.hp1
HG03540.hp1
HG03710.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+18243delA
c.45+18243delA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17597516
chr9:17597737 C
C
 G
G
 22 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
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others(19): Show 
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0190
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a0001c0001t0001g0194
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a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0252
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a0001c0001t0004g0189
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 22 HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG02055.hp2
others(19): Show 
HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp1
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HG02723.hp1
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HG02976.hp2
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NA19240.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.45+18450C>G
c.45+18450C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597737
chr9:17597808 C
C
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
others(2): Show 
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a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0004g0205
 5 HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG03195.hp2
others(2): Show 
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG03195.hp2
HG03471.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+18521C>A
c.45+18521C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597808
chr9:17597873 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0184
 1 HG03471.hp2
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+18586C>G
c.45+18586C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597873
chr9:17597977 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0021g0258
 2 HG02647.hp2
HG03579.hp2
HG02647.hp2
HG03579.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+18690C>T
c.45+18690C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17597977
chr9:17598001 G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
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 5 HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
others(2): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
HG02630.hp2
HG03516.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+18714G>A
c.45+18714G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17598001
chr9:17598084 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0084
 1 HG04228.hp1
HG04228.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+18797G>C
c.45+18797G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17598084
chr9:17598183 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0002g0204
 1 NA18906.hp2
NA18906.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+18896C>T
c.45+18896C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17598183
chr9:17598289 C
C
 T
T
 173 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
others(170): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0084
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a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0087
a0001c0001t0001g0088
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a0001c0001t0001g0090
a0001c0001t0001g0091
a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0099
a0001c0001t0001g0100
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a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0113
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a0001c0001t0001g0116
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a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0124
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0126
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a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0141
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a0001c0001t0001g0145
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a0001c0001t0001g0154
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a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0173
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a0001c0001t0001g0183
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a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0190
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G
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C
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T
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G
 C
C
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a0001c0001t0002g0031
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HG03710.hp1
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A
 G
G
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A
 T
T
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G
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a0001c0001t0002g0245
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 A
A
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c.45+19927G>A
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C
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T
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c.45+20651A>G
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C
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CT
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c.45+20665dupT
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A
 T
T
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c.45+20740A>T
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G
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others(19): Show 
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c.45+20832A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17600119
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A
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G
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c.45+20851A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0164
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HG03453.hp1
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c.45+20856C>T
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A
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G
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c.45+20915A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0184
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HG03471.hp2
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c.45+21240C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17600527
chr9:17600661 T
T
 C
C
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C
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HG02630.hp1
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A
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G
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C
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G
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T
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C
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G
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A
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T
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 G
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c.45+22589A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.45+22700G>A
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G
 T
T
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C
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T
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HG00735.hp1
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C
 T
T
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G
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others(58): Show 
HG01109.hp1
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c.45+22805A>G
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T
 A
A
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HG03579.hp2
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c.45+22820T>A
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C
 T
T
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HG03041.hp1
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HG02258.hp1
HG03041.hp1
NA20129.hp2
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c.45+22874C>T
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T
 G
G
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NA19079.hp2
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c.45+23501delT
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A
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G
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HG01243.hp1
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A
 C
C
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HG02074.hp1
NA18968.hp2
NA18972.hp2
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c.45+23578A>C
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A
 G
G
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HG02280.hp1
HG03486.hp2
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c.45+23735A>G
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C
 A
A
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C
 T
T
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c.45+23789C>T
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C
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T
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HG02622.hp2
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A
 G
G
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HG00438.hp2
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c.45+23869A>G
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 G
G
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HG02559.hp1
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 A
A
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a0001c0001t0001g0027
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others(122): Show 
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c.45+23948C>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0127
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HG01099.hp1
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c.45+23991A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17603278
chr9:17603303 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
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HG02559.hp1
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c.45+24016A>T
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chr9:17603437 A
A
 G
G
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a0001c0001t0019g0220
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0019g0220
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HG02717.hp1
HG02145.hp1
HG02717.hp1
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c.45+24150A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17603437
chr9:17603498 G
G
 A
A
 26 a0001c0001t0001g0027
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others(23): Show 
HG00140.hp2
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c.45+24211G>A
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chr9:17603658 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0188
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HG02895.hp1
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c.45+24371C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17603658
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C
 A
A
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others(7): Show 
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a0001c0001t0001g0191
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others(7): Show 
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c.45+24399C>A
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T
 C
C
 146 a0001c0001t0001g0006
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others(143): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0040
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a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0044
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a0001c0001t0001g0056
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others(143): Show 
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HG00140.hp2
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HG03471.hp1
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NA18612.hp1
NA18747.hp1
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NA18939.hp1
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NA18942.hp2
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NA18943.hp2
NA18944.hp2
NA18953.hp2
NA18961.hp1
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NA18962.hp2
NA18968.hp2
NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18972.hp1
NA18972.hp2
NA18975.hp2
NA18977.hp2
NA18986.hp1
NA18986.hp2
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NA18999.hp2
NA19002.hp1
NA19002.hp2
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NA19011.hp1
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NA19030.hp2
NA19064.hp1
NA19064.hp2
NA19074.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp1
NA19079.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0217
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HG03453.hp2
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c.45+24515G>A
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G
 A
A
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C
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A
 G
G
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c.45+24778A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0002g0127
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HG01099.hp1
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c.45+24997C>G
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T
 C
C
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c.45+25649T>C
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c.45+25707dupT
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chr9:17604977 AT
AT
 A
A
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c.45+25707delT
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ATT
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A
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0032
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HG02165.hp2
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T
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G
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G
 A
A
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 G
G
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c.45+25928A>G
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G
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NA18977.hp2
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA18994.hp2
NA18999.hp1
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c.45+25955C>G
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T
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C
 G
G
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NA18906.hp1
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c.45+26008C>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0028
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HG01516.hp1
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c.45+26020A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17605307
chr9:17605326 C
C
 T
T
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c.45+26039C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17605326
chr9:17605451 T
T
 C
C
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c.45+26164T>C
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G
 C
C
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c.45+26330G>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0204
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NA18906.hp2
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c.45+26498G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17605785
chr9:17605937 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0019g0220
a0001c0001t0019g0220
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HG02145.hp1
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c.45+26650A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17605937
chr9:17606035 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
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HG02559.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+26748C>T
c.45+26748C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606035
chr9:17606083 A
A
 AGGTT
AGGTT
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c.45+26797_45+26800dupGGTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17606083
chr9:17606084 G
G
 GGTTT
GGTTT
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others(6): Show 
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C
 T
T
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a0002c0004t0003g0111
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.45+26866C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606153
chr9:17606154 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
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HG03471.hp2
HG03516.hp2
NA18906.hp1
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c.45+26867G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606154
chr9:17606228 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0163
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HG02559.hp1
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c.45+26941G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606228
chr9:17606251 C
C
 T
T
 257 a0001c0001t0001g0006
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NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+26964C>T
c.45+26964C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606251
chr9:17606259 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0020g0211
 1 HG02280.hp1
HG02280.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+26972A>G
c.45+26972A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606259
chr9:17606311 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0205
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+27024T>G
c.45+27024T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606311
chr9:17606313 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0023
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+27026G>C
c.45+27026G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606313
chr9:17606354 G
G
 A
A
 17 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(14): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0183
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a0001c0001t0001g0222
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others(14): Show 
HG01884.hp1
HG01884.hp2
HG02109.hp2
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c.45+27067G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606354
chr9:17606404 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0020g0211
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HG03516.hp2
NA18906.hp1
HG02280.hp1
HG03516.hp2
NA18906.hp1
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c.45+27117C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606404
chr9:17606432 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
 1 HG02559.hp1
HG02559.hp1
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c.45+27145C>G
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chr9:17606539 C
C
 T
T
 28 a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
others(25): Show 
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
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a0001c0001t0001g0192
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a0001c0001t0001g0201
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a0001c0001t0001g0227
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 28 HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG02055.hp1
others(25): Show 
HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp1
HG02280.hp1
HG02280.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02622.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02895.hp1
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HG02976.hp1
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HG03540.hp2
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NA19240.hp1
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c.45+27252C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606539
chr9:17606568 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0186
 1 HG02257.hp1
HG02257.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+27281T>G
c.45+27281T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606568
chr9:17606786 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0110
 1 HG02523.hp1
HG02523.hp1
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c.45+27499A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606786
chr9:17606891 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0145
 1 NA18970.hp2
NA18970.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+27604G>A
c.45+27604G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17606891
chr9:17607004 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0165
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+27717C>G
c.45+27717C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607004
chr9:17607039 G
G
 A
A
 40 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(37): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
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a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0247
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a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0206
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a0001c0001t0008g0196
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a0001c0001t0011g0256
a0001c0002t0005g0226
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 40 HG01074.hp1
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others(37): Show 
HG01074.hp1
HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG01884.hp1
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG02280.hp2
HG02451.hp1
HG02451.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp2
HG02622.hp1
HG02622.hp2
HG02630.hp1
HG02630.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02723.hp2
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HG02895.hp1
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HG02976.hp2
HG03098.hp1
HG03195.hp1
HG03195.hp2
HG03225.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp1
HG03486.hp2
HG03540.hp1
HG03540.hp2
NA19240.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+27752G>A
c.45+27752G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607039
chr9:17607377 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0148
 1 HG02717.hp1
HG02717.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+28090C>T
c.45+28090C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607377
chr9:17607556 G
G
 A
A
 15 a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0170
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a0001c0001t0001g0168
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 15 HG00323.hp1
HG00735.hp1
HG01099.hp2
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HG00323.hp1
HG00735.hp1
HG01099.hp2
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c.45+28269G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607556
chr9:17607575 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0163
 2 HG02559.hp1
HG03139.hp1
HG02559.hp1
HG03139.hp1
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c.45+28288C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607575
chr9:17607735 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0021
 1 HG03041.hp1
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+28448A>G
c.45+28448A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607735
chr9:17607797 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0010g0218
 1 HG03130.hp1
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+28510G>A
c.45+28510G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607797
chr9:17607803 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+28516G>C
c.45+28516G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607803
chr9:17607969 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+28682A>G
c.45+28682A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17607969
chr9:17608074 A
A
 G
G
 12 a0001c0001t0001g0183
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others(9): Show 
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 12 HG01884.hp2
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others(9): Show 
HG01884.hp2
HG02258.hp2
HG02451.hp1
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NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+28787A>G
c.45+28787A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17608074
chr9:17608147 C
C
 CT
CT
 21 a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0090
others(18): Show 
a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0090
a0001c0001t0001g0159
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a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0223
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a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0006g0221
a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0013g0162
 21 HG00673.hp1
HG01070.hp1
HG01884.hp1
others(18): Show 
HG00673.hp1
HG01070.hp1
HG01884.hp1
HG01884.hp2
HG02015.hp2
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HG02258.hp2
HG02451.hp1
HG02451.hp2
HG02622.hp2
HG02630.hp2
HG02647.hp2
HG02723.hp2
HG02976.hp2
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HG03225.hp1
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HG03540.hp1
HG03831.hp2
HG04184.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+28878dupT
c.45+28878dupT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17608147
chr9:17608147 C
C
 CTT
CTT
 98 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0038
others(95): Show 
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a0001c0001t0001g0012
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a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0042
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 98 HG00140.hp1
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others(95): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00280.hp2
HG00323.hp2
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HG00609.hp1
HG00609.hp2
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HG02300.hp2
HG02523.hp1
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HG03139.hp1
HG03139.hp2
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HG03579.hp1
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HG03831.hp1
HG03942.hp1
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NA18612.hp1
NA18747.hp1
NA18747.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
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NA18966.hp2
NA18970.hp1
NA18975.hp1
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NA18977.hp2
NA18986.hp1
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NA18989.hp2
NA19002.hp1
NA19002.hp2
NA19011.hp1
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NA19064.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+28877_45+28878d
others(4): Show 
c.45+28877_45+28878dupTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17608147
chr9:17608147 C
C
 CTTT
CTTT
 43 a0001c0001t0001g0006
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others(40): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0109
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a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0005g0178
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a0001c0001t0006g0213
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a0001c0001t0008g0253
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a0001c0001t0010g0219
a0003c0005t0014g0137
 43 HG00323.hp1
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others(40): Show 
HG00323.hp1
HG00558.hp2
HG00735.hp1
HG01099.hp2
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CT
 C
C
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C
 G
G
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a0001c0001t0004g0148
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HG02717.hp1
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c.45+28903C>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0007g0165
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HG04228.hp2
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c.45+28917G>A
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C
 T
T
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c.45+28939C>T
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 G
G
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A
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0254
 3 HG01243.hp1
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HG03453.hp1
HG01243.hp1
HG03225.hp2
HG03453.hp1
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c.45+29027A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0053
a0003c0005t0014g0137
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NA19087.hp1
NA18971.hp2
NA19087.hp1
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c.45+29050A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17608337
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0192
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HG03486.hp1
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c.45+29065T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17608352
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G
 A
A
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G
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G
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HG03139.hp1
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T
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HG01978.hp1
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c.45+29406C>T
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T
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 G
G
 1 a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0063
 1 HG00140.hp2
HG00140.hp2
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c.45+29552A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17608839
chr9:17608950 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
HG03516.hp1
HG03579.hp2
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c.45+29663A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17608950
chr9:17608989 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0005g0226
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HG03098.hp1
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c.45+29702C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17608989
chr9:17608993 C
C
 G
G
 45 a0001c0001t0001g0007
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c.45+29706C>G
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chr9:17609047 G
G
 A
A
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others(110): Show 
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HG00280.hp2
HG00323.hp1
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c.45+29760G>A
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T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.45+29798T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17609085
chr9:17609224 G
G
 T
T
 7 a0001c0001t0001g0159
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others(4): Show 
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 7 HG01243.hp1
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others(4): Show 
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HG01884.hp1
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c.45+29937G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17609224
chr9:17609304 G
G
 A
A
 183 a0001c0001t0001g0006
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G
 C
C
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.45+30727G>C
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0176
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HG00642.hp1
HG01081.hp2
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c.45+30775C>A
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G
 T
T
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T
 G
G
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a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
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T
 C
C
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C
 T
T
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A
 G
G
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HG01358.hp2
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c.45+31229A>G
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T
 C
C
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chr9:17610616 A
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C
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others(105): Show 
HG00140.hp2
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A
 T
T
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c.45+31332A>T
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G
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GT
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C
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T
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A
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G
 T
T
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G
 A
A
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 C
C
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0240
a0001c0001t0015g0041
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A
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G
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C
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A
 G
G
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a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
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HG03139.hp1
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c.45+32321A>G
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chr9:17611759 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
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HG03139.hp1
HG03579.hp2
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c.45+32472A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0032
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HG02165.hp2
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c.45+32489C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17611776
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
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HG02074.hp2
HG02040.hp2
HG02074.hp2
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c.45+32541C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17611828
chr9:17611894 T
T
 A
A
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a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0011
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NA18975.hp1
NA18950.hp2
NA18975.hp1
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c.45+32607T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17611894
chr9:17612027 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
HG03139.hp1
HG03579.hp2
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c.45+32740G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612027
chr9:17612047 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
HG03139.hp1
HG03579.hp2
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c.45+32760A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612047
chr9:17612093 T
T
 C
C
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a0001c0001t0003g0155
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NA20805.hp2
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c.45+32806T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612093
chr9:17612133 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
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c.45+32846C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612133
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0139
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HG00558.hp2
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c.45+32925G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612212
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G
 A
A
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c.45+32957G>A
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chr9:17612252 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0014
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NA18994.hp1
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c.45+32965G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612252
chr9:17612303 A
A
 G
G
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a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
HG03579.hp2
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c.45+33016A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612303
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A
 G
G
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c.45+33190A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612477
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T
 C
C
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c.45+33436T>C
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AAACC
 A
A
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a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
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HG02630.hp1
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NA20129.hp1
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others(6): Show 
c.45+33512_45+33515delAACC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612798
chr9:17612842 C
C
 A
A
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a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
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HG03139.hp1
HG03579.hp2
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c.45+33555C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612842
chr9:17612937 A
A
 C
C
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a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0002g0031
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HG03669.hp2
HG03710.hp1
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c.45+33650A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612937
chr9:17612944 C
C
 T
T
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.45+33657C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17612944
chr9:17613195 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0103
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HG02300.hp1
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c.45+33908G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17613195
chr9:17613322 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0103
 1 HG02300.hp1
HG02300.hp1
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c.45+34035G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17613322
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0163
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c.45+34076C>A
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C
 A
A
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a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0009g0009
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c.45+34147C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17613434
chr9:17613442 A
A
 G
G
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C
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T
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a0001c0001t0021g0258
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HG03139.hp1
HG03579.hp2
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A
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G
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A
 G
G
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C
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A
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T
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C
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 99 HG00140.hp2
HG00280.hp1
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HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00323.hp1
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NA18942.hp2
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NA18962.hp2
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NA19012.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.45+34549A>G
c.45+34549A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17613836
chr9:17613990 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0129
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NA18986.hp2
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c.45+34703C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17613990
chr9:17614086 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0002g0239
 1 HG01255.hp2
HG01255.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+34799A>G
c.45+34799A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614086
chr9:17614180 A
A
 G
G
 6 a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0011g0256
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0011g0256
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 6 HG01074.hp1
HG02280.hp1
HG02630.hp1
others(3): Show 
HG01074.hp1
HG02280.hp1
HG02630.hp1
HG03098.hp2
HG03139.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+34893A>G
c.45+34893A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614180
chr9:17614263 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
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HG02559.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+34976T>C
c.45+34976T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614263
chr9:17614289 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0025
a0001c0001t0002g0025
 1 HG02148.hp2
HG02148.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+35002G>A
c.45+35002G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614289
chr9:17614294 T
T
 TG
TG
 7 a0001c0001t0001g0109
a0001c0001t0001g0225
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0109
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0132
a0001c0001t0002g0138
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 7 HG02027.hp1
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others(4): Show 
HG02027.hp1
HG02258.hp2
HG03098.hp1
NA18994.hp2
NA19010.hp2
NA19012.hp1
NA19086.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+35008dupG
c.45+35008dupG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17614294
chr9:17614295 G
G
 GA
GA
 13 a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0201
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0210
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a0001c0001t0004g0206
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 13 HG01109.hp1
HG02109.hp1
HG02809.hp2
others(10): Show 
HG01109.hp1
HG02109.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp2
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HG03540.hp2
NA18948.hp2
NA18961.hp2
NA18968.hp1
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NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+35036dupA
c.45+35036dupA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17614295
chr9:17614295 G
G
 GAA
GAA
 39 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0038
others(36): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0074
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a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0186
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a0001c0001t0001g0223
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a0001c0001t0001g0249
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a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0008g0158
a0001c0003t0002g0039
 39 HG00140.hp2
HG00408.hp1
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others(36): Show 
HG00140.hp2
HG00408.hp1
HG00609.hp2
HG01258.hp2
HG01358.hp1
HG01884.hp2
HG02027.hp2
HG02055.hp2
HG02074.hp1
HG02165.hp1
HG02257.hp1
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HG02451.hp1
HG02559.hp2
HG02717.hp1
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HG03453.hp1
HG03471.hp1
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NA18612.hp2
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp2
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18966.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp1
NA18975.hp2
NA18977.hp1
NA19010.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+35035_45+35036d
others(4): Show 
c.45+35035_45+35036dupAA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17614295
chr9:17614295 G
G
 GAAA
GAAA
 12 a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0056
others(9): Show 
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0073
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 12 HG01071.hp2
HG02015.hp1
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others(9): Show 
HG01071.hp2
HG02015.hp1
HG02257.hp2
HG02572.hp1
HG02735.hp1
HG03130.hp1
HG03669.hp1
HG03831.hp2
NA18968.hp2
NA18972.hp2
NA19012.hp2
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+35034_45+35036d
others(5): Show 
c.45+35034_45+35036dupAAA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17614295
chr9:17614295 G
G
 GAAAA
GAAAA
 13 a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0115
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0115
a0001c0001t0001g0121
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a0001c0001t0001g0235
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 13 HG00642.hp2
HG00673.hp2
HG00735.hp2
others(10): Show 
HG00642.hp2
HG00673.hp2
HG00735.hp2
HG01515.hp2
HG02040.hp2
HG02145.hp2
HG02895.hp2
HG02965.hp2
HG03041.hp1
HG03486.hp2
HG03669.hp2
HG03704.hp2
NA18939.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+35033_45+35036d
others(6): Show 
c.45+35033_45+35036dupAAAA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17614295
chr9:17614295 G
G
 GAAAAA
GAAAAA
 42 a0001c0001t0001g0012
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others(39): Show 
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a0001c0001t0001g0042
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a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0087
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a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0001g0107
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a0001c0001t0002g0101
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a0001c0001t0016g0122
 42 HG00280.hp2
HG00323.hp2
HG00408.hp2
others(39): Show 
HG00280.hp2
HG00323.hp2
HG00408.hp2
HG00558.hp1
HG00639.hp1
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HG00733.hp2
HG00735.hp1
HG01081.hp1
HG01099.hp1
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HG01243.hp2
HG01258.hp1
HG01358.hp2
HG01361.hp2
HG01515.hp1
HG02040.hp1
HG02056.hp1
HG02074.hp2
HG02148.hp1
HG02148.hp2
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02723.hp2
HG03491.hp2
HG03942.hp1
HG06807.hp2
NA18747.hp1
NA18944.hp2
NA18961.hp1
NA18975.hp1
NA18977.hp2
NA19002.hp1
NA19002.hp2
NA19009.hp2
NA19030.hp2
NA19064.hp2
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G
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GAAAAAA
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G
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GAAAAAAA
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G
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HG06807.hp1
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G
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G
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NA18989.hp1
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a0001c0001t0001g0067
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NA19011.hp1
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G
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AAA
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 G
G
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c.45+35036delA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17614295
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GAA
 G
G
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GAAA
 G
G
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HG00642.hp1
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17614295
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A
 G
G
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NA18999.hp2
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NA19064.hp1
NA19077.hp1
NA19079.hp2
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NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+35009A>G
c.45+35009A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614296
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A
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G
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HG00438.hp1
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c.45+35010A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614297
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A
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G
 4 a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0090
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 4 HG00673.hp1
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HG00673.hp1
HG02258.hp1
NA18747.hp2
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c.45+35011A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614298
chr9:17614299 A
A
 G
G
 6 a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0001g0176
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HG00642.hp1
HG01070.hp2
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c.45+35012A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614299
chr9:17614377 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
HG03139.hp1
HG03579.hp2
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c.45+35090C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614377
chr9:17614461 G
G
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0012
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NA18975.hp1
NA18950.hp2
NA18975.hp1
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c.45+35174G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614461
chr9:17614554 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0002g0101
 2 HG01243.hp2
NA20905.hp2
HG01243.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+35267G>A
c.45+35267G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614554
chr9:17614571 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0205
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
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c.45+35284C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614571
chr9:17614573 A
A
 G
G
 15 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0053
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others(12): Show 
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a0001c0001t0001g0053
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 15 HG00558.hp2
HG02027.hp1
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others(12): Show 
HG00558.hp2
HG02027.hp1
HG03017.hp2
NA18953.hp2
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NA18970.hp1
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NA18999.hp1
NA18999.hp2
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NA19086.hp1
NA19087.hp1
NA19088.hp2
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c.45+35286A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614573
chr9:17614691 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
 1 NA19240.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+35404G>A
c.45+35404G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614691
chr9:17614780 A
A
 G
G
 63 a0001c0001t0001g0007
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others(60): Show 
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a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0034
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 63 HG00140.hp2
HG00323.hp1
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others(60): Show 
HG00140.hp2
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00609.hp2
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HG01074.hp2
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HG02559.hp2
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HG03669.hp2
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NA19077.hp1
NA19079.hp2
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+35493A>G
c.45+35493A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17614780
chr9:17615094 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
 2 HG03098.hp2
NA20129.hp1
HG03098.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+35807C>G
c.45+35807C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17615094
chr9:17615155 G
G
 A
A
 48 a0001c0001t0001g0006
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a0001c0001t0001g0014
others(45): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
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 48 HG00280.hp1
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others(45): Show 
HG00280.hp1
HG00438.hp1
HG00558.hp2
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NA18991.hp1
NA18994.hp1
NA18994.hp2
NA18999.hp2
NA19011.hp2
NA19012.hp1
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NA20752.hp2
NA20805.hp1
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NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+35868G>A
c.45+35868G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17615155
chr9:17615189 G
G
 C
C
 227 a0001c0001t0001g0006
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a0001c0001t0001g0008
others(224): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
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a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0054
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c.45+36068T>G
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G
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c.45+36112A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0124
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HG00609.hp1
HG00673.hp2
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c.45+36144C>T
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T
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a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
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c.45+36236C>T
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C
 T
T
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c.45+36242C>T
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C
 T
T
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c.45+36316C>T
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C
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CA
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c.45+36397dupA
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C
 CAA
CAA
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CA
 C
C
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c.45+36397delA
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CAA
 C
C
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CAAA
 C
C
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c.45+36395_45+36397delAAA
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CAAAA
 C
C
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others(33): Show 
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HG00438.hp1
HG00673.hp1
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HG03225.hp1
HG03225.hp2
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NA18986.hp1
NA18986.hp2
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NA18994.hp1
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NA20129.hp2
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NA20905.hp2
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others(6): Show 
c.45+36394_45+36397delAAAA
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CAAAAA
 C
C
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 52 HG00323.hp2
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others(49): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp1
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HG01081.hp1
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HG01192.hp1
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HG01361.hp2
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others(7): Show 
c.45+36393_45+36397delAAAAA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17615658
chr9:17615732 T
T
 TA
TA
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C
 A
A
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T
 C
C
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c.45+36627T>C
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 T
T
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G
 A
A
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c.45+36757G>A
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T
 C
C
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A
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c.45+37124A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616411
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C
 G
G
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NA18906.hp2
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c.45+37135C>G
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A
 G
G
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NA19012.hp1
NA19012.hp2
NA19030.hp2
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NA19064.hp2
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NA19074.hp2
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NA19077.hp2
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NA19079.hp2
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NA20752.hp2
NA20805.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
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c.45+37209A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616496
chr9:17616595 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0021g0258
 1 HG03579.hp2
HG03579.hp2
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c.45+37308A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616595
chr9:17616633 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0006g0221
 3 HG02622.hp2
HG03516.hp2
NA18906.hp1
HG02622.hp2
HG03516.hp2
NA18906.hp1
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c.45+37346A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616633
chr9:17616634 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0008g0158
 1 HG03516.hp1
HG03516.hp1
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c.45+37347C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616634
chr9:17616754 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0142
 1 NA18747.hp2
NA18747.hp2
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c.45+37467A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616754
chr9:17616780 G
G
 T
T
 2 a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
 2 HG03098.hp2
NA20129.hp1
HG03098.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+37493G>T
c.45+37493G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616780
chr9:17616813 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0253
 1 HG03041.hp2
HG03041.hp2
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c.45+37526C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616813
chr9:17616878 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0020g0211
 3 HG02280.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG02280.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
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c.45+37591T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616878
chr9:17616882 A
A
 G
G
 23 a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0147
others(20): Show 
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a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0147
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0248
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a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0177
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a0001c0001t0020g0211
 24 HG00438.hp2
HG00642.hp1
HG01070.hp2
others(21): Show 
HG00438.hp2
HG00642.hp1
HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG01081.hp2
HG01255.hp2
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HG03139.hp2
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HG03471.hp2
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NA18991.hp2
NA18999.hp1
NA20805.hp1
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c.45+37595A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17616882
chr9:17617164 A
A
 C
C
 11 a0001c0001t0001g0190
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others(8): Show 
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0008g0196
 11 HG01109.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
others(8): Show 
HG01109.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
HG02647.hp1
HG02717.hp2
HG02886.hp2
HG02976.hp1
HG03195.hp1
HG03486.hp1
HG03540.hp2
NA20300.hp1
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c.45+37877A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617164
chr9:17617220 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
 2 HG03098.hp2
NA20129.hp1
HG03098.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+37933C>T
c.45+37933C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617220
chr9:17617251 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0002g0167
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HG03704.hp2
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c.45+37964A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617251
chr9:17617280 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0191
 1 NA20300.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+37993A>G
c.45+37993A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617280
chr9:17617284 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0017g0112
a0001c0001t0017g0112
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HG01978.hp2
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c.45+37997G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617284
chr9:17617371 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
 2 HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01070.hp1
HG01074.hp2
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c.45+38084C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617371
chr9:17617373 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0017g0112
a0001c0001t0017g0112
 1 HG01978.hp2
HG01978.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+38086A>G
c.45+38086A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617373
chr9:17617377 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
 2 HG03098.hp2
NA20129.hp1
HG03098.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+38090C>G
c.45+38090C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617377
chr9:17617411 T
T
 C
C
 67 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0034
others(64): Show 
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a0001c0001t0001g0013
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a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0192
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a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0069
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a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0132
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a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0028
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a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0198
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a0001c0001t0006g0213
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 67 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00280.hp2
others(64): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00280.hp2
HG00323.hp1
HG00558.hp2
HG00609.hp2
HG01070.hp1
HG01071.hp2
HG01074.hp2
HG01109.hp1
HG01258.hp2
HG01261.hp1
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HG01516.hp1
HG01978.hp1
HG02015.hp1
HG02027.hp1
HG02027.hp2
HG02055.hp2
HG02056.hp2
HG02109.hp1
HG02165.hp1
HG02559.hp2
HG02647.hp1
HG02717.hp2
HG02886.hp2
HG02976.hp1
HG03098.hp1
HG03195.hp1
HG03486.hp1
HG03491.hp1
HG03516.hp1
HG03540.hp1
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HG03669.hp2
HG03710.hp1
HG03831.hp1
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HG04199.hp1
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NA18747.hp2
NA18906.hp2
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NA18942.hp2
NA18943.hp2
NA18953.hp2
NA18962.hp1
NA18962.hp2
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NA18970.hp1
NA18971.hp1
NA18975.hp2
NA18994.hp2
NA18999.hp2
NA19012.hp1
NA19064.hp1
NA19074.hp2
NA19077.hp1
NA19079.hp2
NA19086.hp1
NA19087.hp1
NA19088.hp2
NA20300.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+38124T>C
c.45+38124T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617411
chr9:17617597 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0002g0241
 1 HG00438.hp2
HG00438.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+38310A>G
c.45+38310A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617597
chr9:17617607 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0257
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0020g0211
 4 HG01074.hp1
HG02280.hp1
HG03139.hp1
others(1): Show 
HG01074.hp1
HG02280.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+38320T>C
c.45+38320T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17617607
chr9:17617839 C
C
 T
T
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G
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c.45+38983A>G
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C
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T
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A
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T
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A
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G
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HG01071.hp2
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T
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A
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TTGTGTG
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T
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T
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 T
T
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A
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G
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a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
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HG01258.hp2
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c.45+39723A>G
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T
 G
G
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a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
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c.45+39840T>G
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A
 G
G
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c.45+39878A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0003g0237
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c.45+39901C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0008g0158
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HG03516.hp1
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c.45+39973A>G
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T
 A
A
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c.45+40033T>A
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0125
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HG02040.hp1
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c.45+40151G>T
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C
 G
G
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a0001c0001t0004g0174
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HG02886.hp1
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c.45+40160C>G
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0021g0258
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HG02055.hp1
HG02723.hp2
HG03579.hp2
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c.45+40304T>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0008g0253
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a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0009g0009
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HG02559.hp1
HG03041.hp2
HG06807.hp1
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c.45+40315C>A
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G
 T
T
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others(1): Show 
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a0001c0001t0001g0180
a0001c0001t0002g0102
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others(1): Show 
HG00280.hp2
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C
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G
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a0001c0001t0001g0224
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HG02055.hp1
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HG03579.hp2
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A
 G
G
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G
 T
T
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c.45+40548G>T
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TG
 T
T
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0255
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c.45+40604G>A
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A
 AT
AT
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HG01109.hp1
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c.45+40745dupT
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chr9:17620088 CA
CA
 C
C
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a0001c0001t0001g0250
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HG01884.hp2
HG02451.hp1
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c.45+40807delA
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T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0075
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NA19010.hp1
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c.45+40940T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17620227
chr9:17620229 G
G
 C
C
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HG01109.hp1
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c.45+40942G>C
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 A
A
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others(103): Show 
HG00280.hp1
HG00323.hp2
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HG02683.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0075
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T
 G
G
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a0001c0002t0005g0226
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0224
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HG02055.hp1
HG02723.hp2
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C
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A
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a0001c0001t0001g0114
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 A
A
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T
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A
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G
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A
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A
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C
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C
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c.45+41994G>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0015
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NA20905.hp1
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c.45+42064A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621351
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T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0048
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HG02735.hp1
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c.45+42160T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621447
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C
 G
G
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c.45+42238C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621525
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A
 G
G
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HG01109.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
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HG03195.hp1
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c.45+42301A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621588
chr9:17621613 T
T
 G
G
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a0001c0001t0003g0023
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HG04199.hp2
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c.45+42326T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621613
chr9:17621617 T
T
 C
C
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a0001c0001t0011g0257
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a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0020g0211
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HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG02280.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+42330T>C
c.45+42330T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621617
chr9:17621772 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.45+42485A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621772
chr9:17621852 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0023
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+42565C>G
c.45+42565C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621852
chr9:17621918 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
 1 HG02559.hp1
HG02559.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+42631T>C
c.45+42631T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621918
chr9:17621920 C
C
 T
T
 13 a0001c0001t0001g0029
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others(10): Show 
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a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0001
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a0001c0001t0002g0233
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others(11): Show 
HG00642.hp1
HG01070.hp2
HG01071.hp1
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NA18991.hp2
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c.45+42633C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621920
chr9:17621967 A
A
 C
C
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others(49): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0038
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 52 HG00140.hp1
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others(49): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00280.hp2
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NA19088.hp2
NA20300.hp2
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c.45+42680A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17621967
chr9:17622212 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0257
 1 HG03139.hp2
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+42925C>A
c.45+42925C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622212
chr9:17622215 G
G
 A
A
 126 a0001c0001t0001g0008
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a0001c0001t0002g0001
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c.45+42928G>A
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A
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G
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a0001c0001t0001g0163
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HG02559.hp1
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c.45+43218A>G
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A
 G
G
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c.45+43484A>G
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G
 A
A
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c.45+43523G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
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HG02055.hp1
HG02723.hp2
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c.45+43580T>C
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G
 A
A
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c.45+43612G>A
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G
 C
C
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HG00438.hp1
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HG03225.hp2
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NA20905.hp2
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c.45+43653G>C
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C
 T
T
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
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c.45+43670C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622957
chr9:17622960 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
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a0001c0001t0001g0014
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a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0090
a0001c0001t0001g0099
a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0110
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a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0031
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HG00438.hp1
HG00673.hp1
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HG03225.hp2
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c.45+43673C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622960
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C
 G
G
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others(8): Show 
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a0001c0001t0001g0191
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HG01109.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
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c.45+43677C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622964
chr9:17622966 TTTTCCTT
others(3): Show 
TTTTCCTTTCG
 T
T
 1 a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0253
 1 HG03041.hp2
HG03041.hp2
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others(12): Show 
c.45+43699_45+43708delGTTTCCTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622966
chr9:17622975 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0008g0158
 1 HG03516.hp1
HG03516.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43688C>T
c.45+43688C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622975
chr9:17622976 G
G
 GTTTCCTT
others(3): Show 
GTTTCCTTCCC
 1 a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0054
 1 HG03654.hp2
HG03654.hp2
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others(12): Show 
c.45+43696_45+43697insCCCTTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 G
G
 GTTTCCTT
others(8): Show 
GTTTCCTTCCCTTTCC
 6 a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0002g0037
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0002g0037
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0156
a0001c0001t0003g0028
 6 HG00280.hp2
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others(3): Show 
HG00280.hp2
HG01261.hp1
HG01516.hp1
HG02015.hp1
NA18943.hp2
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43696_45+43697i
others(17): Show 
c.45+43696_45+43697insCCCTTTCCTTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 G
G
 GTTTCCTT
others(13): Show 
GTTTCCTTCCCTTTCCTTTCC
 1 a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0001g0229
 1 NA19064.hp1
NA19064.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43696_45+43697i
others(22): Show 
c.45+43696_45+43697insCCCTTTCCTTTCCTTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 G
G
 GTTTCCTT
others(23): Show 
GTTTCCTTCCCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCC
 3 a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
 3 HG01258.hp2
HG01358.hp1
HG01978.hp1
HG01258.hp2
HG01358.hp1
HG01978.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43696_45+43697i
others(32): Show 
c.45+43696_45+43697insCCCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCTTTCC
TT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 G
G
 GTTTCCTT
others(23): Show 
GTTTCCTTCCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
 1 a0001c0001t0001g0228
a0001c0001t0001g0228
 1 NA19079.hp2
NA19079.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43696_45+43697i
others(32): Show 
c.45+43696_45+43697insCCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
TT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 G
G
 GTTTCCTT
others(33): Show 
GTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCGTTCCGTTCCTTTCC
 1 a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0223
 1 HG03540.hp1
HG03540.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43698_45+43699i
others(42): Show 
c.45+43698_45+43699insCTTTCCTTTCCGTTCCGTTCCGTTCCTT
TCCTTTCCTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 G
G
 GTTTCCTT
others(23): Show 
GTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCC
 8 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0043
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0202
a0001c0006t0001g0153
 8 HG00673.hp2
HG00733.hp2
HG01258.hp1
others(5): Show 
HG00673.hp2
HG00733.hp2
HG01258.hp1
HG02165.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG03710.hp2
NA19088.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43698_45+43699i
others(32): Show 
c.45+43698_45+43699insCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCTTTCCTT
TC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 G
G
 GTTTCCTT
others(28): Show 
GTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCTTTCC
 5 a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0130
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0130
a0001c0001t0002g0119
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 5 HG00558.hp1
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others(2): Show 
HG00558.hp1
HG01361.hp2
HG02145.hp2
NA18943.hp1
NA18977.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43698_45+43699i
others(37): Show 
c.45+43698_45+43699insCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCTTTCCTT
TCCTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 GTTTCCTT
others(23): Show 
GTTTCCTTTCGTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0099
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0099
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a0001c0001t0002g0031
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others(2): Show 
HG00438.hp1
HG02258.hp1
HG03710.hp1
NA20129.hp2
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43699_45+43728d
others(32): Show 
c.45+43699_45+43728delGTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTT
TC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622976 GTTTCCTT
others(28): Show 
GTTTCCTTTCGTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
 G
G
 27 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
others(24): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
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a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0002g0129
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a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0015g0041
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 27 HG00673.hp1
HG01099.hp2
HG01243.hp2
others(24): Show 
HG00673.hp1
HG01099.hp2
HG01243.hp2
HG01433.hp1
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HG02523.hp1
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HG02809.hp1
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HG03225.hp1
HG03704.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp1
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18991.hp1
NA18994.hp1
NA19011.hp2
NA19030.hp2
NA19077.hp2
NA20905.hp1
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43699_45+43733d
others(37): Show 
c.45+43699_45+43733delGTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTT
TCCTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622976
chr9:17622977 T
T
 TTTCCTTC
others(18): Show 
TTTCCTTCCCTTTCCTTTCCTTTCCG
 1 a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0063
 1 HG00140.hp2
HG00140.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43696_45+43697i
others(27): Show 
c.45+43696_45+43697insCCCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622977
chr9:17622977 T
T
 TTTCCTTT
others(18): Show 
TTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCG
 23 a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0088
a0001c0001t0001g0091
others(20): Show 
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HG00323.hp2
HG00558.hp2
HG00609.hp1
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others(27): Show 
c.45+43698_45+43699insCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622977
chr9:17622977 T
T
 TTTCCTTT
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TTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCGTTCCG
 1 a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0005g0226
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HG03098.hp1
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c.45+43698_45+43699insCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCGTTCCGT
TCCTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622977
chr9:17622977 T
T
 TTTCCTTT
others(23): Show 
TTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCG
 1 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0011
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NA18950.hp2
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c.45+43698_45+43699insCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCTT
TC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622977
chr9:17622979 T
T
 TCCTTC
TCCTTC
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a0001c0001t0001g0040
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a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0142
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HG02027.hp2
HG02056.hp2
HG02559.hp2
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NA18942.hp2
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others(7): Show 
c.45+43696_45+43697insCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622979
chr9:17622981 CTTTCG
CTTTCG
 C
C
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a0001c0001t0004g0209
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a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
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NA18906.hp2
NA20129.hp1
HG03098.hp2
NA18906.hp2
NA20129.hp1
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others(7): Show 
c.45+43699_45+43703delGTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622981
chr9:17622982 T
T
 TTCCCTTT
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 10 a0001c0001t0001g0013
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
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HG00323.hp1
HG00609.hp2
HG01070.hp1
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others(22): Show 
c.45+43696_45+43697insCCCTTTCCTTTCCTTTCCGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622982
chr9:17622982 T
T
 TTTCCTTT
others(13): Show 
TTTCCTTTCCTTTCCTTTCCG
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others(21): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0066
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HG00408.hp1
HG00639.hp1
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others(22): Show 
c.45+43698_45+43699insCTTTCCTTTCCTTTCCGTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622982
chr9:17622982 T
T
 TTTCCTTT
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 1 a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0127
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HG01099.hp1
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others(32): Show 
c.45+43698_45+43699insCTTTCCTTTCCTTTCCGTTCCTTTCCGT
TC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622982
chr9:17622984 T
T
 C
C
 8 a0001c0001t0001g0085
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others(5): Show 
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0093
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HG00140.hp1
HG01074.hp1
HG02027.hp1
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c.45+43697T>C
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G
 C
C
 145 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0011
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a0001c0001t0001g0011
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a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0132
a0001c0001t0002g0133
a0001c0001t0002g0134
a0001c0001t0002g0138
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others(143): Show 
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HG00140.hp2
HG00280.hp2
HG00323.hp1
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HG00408.hp2
HG00558.hp1
HG00558.hp2
HG00609.hp1
HG00609.hp2
HG00639.hp1
HG00639.hp2
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HG01070.hp1
HG01070.hp2
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HG01071.hp2
HG01074.hp1
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HG01081.hp1
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HG01261.hp1
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HG01358.hp1
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HG01361.hp1
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HG01515.hp2
HG01516.hp1
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HG02015.hp1
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HG02027.hp1
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NA18747.hp1
NA18747.hp2
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NA18968.hp2
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NA18971.hp1
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NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18977.hp2
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NA18999.hp2
NA19002.hp1
NA19002.hp2
NA19010.hp1
NA19012.hp1
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NA19077.hp1
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NA19079.hp2
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NA19087.hp1
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NA19088.hp2
NA20300.hp1
NA20300.hp2
NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43699G>C
c.45+43699G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622986
chr9:17622986 G
G
 GTTTCC
GTTTCC
 9 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0145
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0173
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0189
 9 HG01515.hp1
HG02280.hp2
HG02735.hp2
others(6): Show 
HG01515.hp1
HG02280.hp2
HG02735.hp2
HG02886.hp1
NA18939.hp2
NA18961.hp2
NA18970.hp2
NA18977.hp1
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43752_45+43756d
others(7): Show 
c.45+43752_45+43756dupTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622986 G
G
 GTTTCCTT
others(3): Show 
GTTTCCTTTCC
 13 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0002g0003
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
a0002c0004t0003g0111
 13 HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG00735.hp1
others(10): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG00735.hp1
HG01175.hp2
HG02523.hp2
HG03486.hp2
NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA18968.hp1
NA19009.hp2
NA19010.hp2
NA19012.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43747_45+43756d
others(12): Show 
c.45+43747_45+43756dupTCCTTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622986 G
G
 GTTTCCTT
others(13): Show 
GTTTCCTTTCCGTTCCTTTCC
 1 a0001c0001t0001g0087
a0001c0001t0001g0087
 1 NA18961.hp1
NA18961.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43709_45+43710i
others(22): Show 
c.45+43709_45+43710insGTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622986 G
G
 GTTTCCTT
others(8): Show 
GTTTCCTTTCCTTTCC
 7 a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0002g0004
a0001c0001t0002g0179
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0002g0004
a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0019g0220
a0001c0003t0002g0039
 7 HG00438.hp2
HG01192.hp2
HG02145.hp1
others(4): Show 
HG00438.hp2
HG01192.hp2
HG02145.hp1
HG06807.hp2
NA18962.hp2
NA18971.hp2
NA18972.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43742_45+43756d
others(17): Show 
c.45+43742_45+43756dupTCCTTTCCTTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622986 G
G
 GTTTCCTT
others(13): Show 
GTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
 3 a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0170
 3 HG01175.hp1
HG03669.hp1
NA19074.hp1
HG01175.hp1
HG03669.hp1
NA19074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43737_45+43756d
others(22): Show 
c.45+43737_45+43756dupTCCTTTCCTTTCCTTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622986 G
G
 GTTTCCTT
others(18): Show 
GTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
 6 a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0147
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0147
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0251
 6 HG00280.hp1
HG01255.hp1
HG02630.hp1
others(3): Show 
HG00280.hp1
HG01255.hp1
HG02630.hp1
HG02735.hp1
NA18999.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43732_45+43756d
others(27): Show 
c.45+43732_45+43756dupTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622986 G
G
 GTTTCCTT
others(28): Show 
GTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
 3 a0001c0001t0003g0151
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0003g0151
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0010g0219
 3 HG06807.hp1
NA19240.hp2
NA20752.hp2
HG06807.hp1
NA19240.hp2
NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43722_45+43756d
others(37): Show 
c.45+43722_45+43756dupTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
TTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622986 GTTTCC
GTTTCC
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0002g0070
 3 NA18944.hp1
NA19009.hp1
NA19086.hp2
NA18944.hp1
NA19009.hp1
NA19086.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43752_45+43756d
others(7): Show 
c.45+43752_45+43756delTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622986 GTTTCCTT
others(3): Show 
GTTTCCTTTCC
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
 2 NA18950.hp1
NA18989.hp1
NA18950.hp1
NA18989.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43747_45+43756d
others(12): Show 
c.45+43747_45+43756delTCCTTTCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622986
chr9:17622987 T
T
 G
G
 6 a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0002g0037
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0002g0037
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0156
a0001c0001t0003g0028
 6 HG00280.hp2
HG01261.hp1
HG01516.hp1
others(3): Show 
HG00280.hp2
HG01261.hp1
HG01516.hp1
HG02015.hp1
NA18943.hp2
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43700T>G
c.45+43700T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622987
chr9:17622987 T
T
 TTTCCTTT
others(8): Show 
TTTCCTTTCCTTTCCG
 9 a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0002g0021
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0008g0196
 9 HG00639.hp2
HG01109.hp1
HG01261.hp2
others(6): Show 
HG00639.hp2
HG01109.hp1
HG01261.hp2
HG02015.hp2
HG02109.hp1
HG02717.hp2
HG02976.hp1
HG03041.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43714_45+43715i
others(17): Show 
c.45+43714_45+43715insGTTCCTTTCCTTTCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622987
chr9:17622989 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0002g0204
 1 NA18906.hp2
NA18906.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43702T>C
c.45+43702T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622989
chr9:17622992 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0054
 1 HG03654.hp2
HG03654.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43705T>G
c.45+43705T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622992
chr9:17622992 T
T
 TTTCCGTT
others(3): Show 
TTTCCGTTCCG
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43709_45+43710i
others(12): Show 
c.45+43709_45+43710insGTTCCGTTCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622992
chr9:17622992 T
T
 TTTCCTTT
others(3): Show 
TTTCCTTTCCG
 1 a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0190
 1 HG03195.hp1
HG03195.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43714_45+43715i
others(12): Show 
c.45+43714_45+43715insGTTCCTTTCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17622992
chr9:17622996 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0164
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43709C>G
c.45+43709C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622996
chr9:17622997 T
T
 G
G
 7 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0086
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0005g0036
 7 HG02027.hp2
HG02056.hp2
HG02559.hp2
others(4): Show 
HG02027.hp2
HG02056.hp2
HG02559.hp2
NA18747.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18975.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43710T>G
c.45+43710T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17622997
chr9:17623002 T
T
 G
G
 32 a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0093
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a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0109
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0163
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 33 HG00140.hp1
HG00408.hp2
HG00642.hp1
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HG00140.hp1
HG00408.hp2
HG00642.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.45+43715T>G
c.45+43715T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623002
chr9:17623004 TCCTTTCC
others(34): Show 
TCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTCC
 T
T
 7 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0254
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a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0020g0211
 7 HG01243.hp1
HG02280.hp1
HG02717.hp1
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HG01243.hp1
HG02280.hp1
HG02717.hp1
HG03130.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03225.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43722_45+43762d
others(43): Show 
c.45+43722_45+43762delTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCC
TTTCCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623004
chr9:17623007 T
T
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0002g0204
 3 HG02559.hp1
NA18906.hp2
NA19010.hp1
HG02559.hp1
NA18906.hp2
NA19010.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43720T>G
c.45+43720T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623007
chr9:17623038 T
T
 TC
TC
 4 a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0243
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
 4 HG01109.hp2
HG02965.hp2
HG03130.hp2
others(1): Show 
HG01109.hp2
HG02965.hp2
HG03130.hp2
HG03579.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43751_45+43752i
others(3): Show 
c.45+43751_45+43752insC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623038
chr9:17623039 T
T
 C
C
 5 a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0235
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
 5 HG01109.hp2
HG02300.hp2
HG02965.hp2
others(2): Show 
HG01109.hp2
HG02300.hp2
HG02965.hp2
HG03130.hp2
HG03579.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43752T>C
c.45+43752T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTCC
TCCTTCC
 8 a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0186
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0005g0022
 8 HG01099.hp1
HG01433.hp2
HG02040.hp1
others(5): Show 
HG01099.hp1
HG01433.hp2
HG02040.hp1
HG02257.hp1
HG02572.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp2
NA18939.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43799_45+43804d
others(8): Show 
c.45+43799_45+43804dupCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTCCC
others(5): Show 
TCCTTCCCCTTCC
 1 a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0191
 1 NA20300.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43793_45+43804d
others(14): Show 
c.45+43793_45+43804dupCCCCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTCCC
others(11): Show 
TCCTTCCCCTTCCCCTTCC
 7 a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0197
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0008g0196
 7 HG01109.hp1
HG02109.hp1
HG02647.hp1
others(4): Show 
HG01109.hp1
HG02109.hp1
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02886.hp2
HG02976.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43787_45+43804d
others(20): Show 
c.45+43787_45+43804dupCCCCTTCCCCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTCCC
others(17): Show 
TCCTTCCCCTTCCCCTTCCCCTTCC
 1 a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0190
 1 HG03195.hp1
HG03195.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43781_45+43804d
others(26): Show 
c.45+43781_45+43804dupCCCCTTCCCCTTCCCCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTTCC
others(4): Show 
TCCTTTCCTTCC
 4 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0004g0206
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0009g0181
 4 HG01884.hp1
HG02809.hp2
HG03704.hp2
others(1): Show 
HG01884.hp1
HG02809.hp2
HG03704.hp2
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43756_45+43757i
others(13): Show 
c.45+43756_45+43757insTCCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTTCC
others(9): Show 
TCCTTTCCTTTCCTTCC
 5 a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0207
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0006g0221
 5 HG02109.hp2
HG02451.hp2
HG02622.hp2
others(2): Show 
HG02109.hp2
HG02451.hp2
HG02622.hp2
HG03516.hp2
NA18906.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43756_45+43757i
others(18): Show 
c.45+43756_45+43757insTCCTTTCCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTTCC
others(14): Show 
TCCTTTCCTTTCCTTTCCTTCC
 5 a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0247
 5 HG00408.hp2
HG01884.hp2
HG02451.hp1
others(2): Show 
HG00408.hp2
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG03195.hp2
HG03471.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43756_45+43757i
others(23): Show 
c.45+43756_45+43757insTCCTTTCCTTTCCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTTCC
others(26): Show 
TCCTTTCCTTTCCTTTCCTTCCCCTTCCCCTTCC
 2 a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0194
 2 HG02055.hp2
HG03486.hp1
HG02055.hp2
HG03486.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43756_45+43757i
others(35): Show 
c.45+43756_45+43757insTCCTTTCCTTTCCTTCCCCTTCCCCTTC
CCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 T
T
 TCCTTTCC
others(31): Show 
TCCTTTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTCCCCTTCCCCTTCC
 1 a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0195
 1 HG03540.hp2
HG03540.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43756_45+43757i
others(40): Show 
c.45+43756_45+43757insTCCTTTCCTTTCCTTTCCTTCCCCTTCC
CCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 TCCTTCC
TCCTTCC
 T
T
 71 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
others(68): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0090
a0001c0001t0001g0099
a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0109
a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0180
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0228
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0037
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0156
a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0003g0028
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0005g0036
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0015g0041
a0001c0001t0017g0112
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a0001c0002t0013g0162
 71 HG00140.hp2
HG00280.hp2
HG00323.hp1
others(68): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp2
HG00323.hp1
HG00438.hp1
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HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01243.hp2
HG01261.hp1
HG01433.hp1
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HG01978.hp2
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HG04228.hp2
NA18612.hp1
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NA18942.hp2
NA18943.hp2
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NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18991.hp1
NA18994.hp1
NA18994.hp2
NA19002.hp2
NA19011.hp2
NA19030.hp2
NA19064.hp1
NA19077.hp1
NA19077.hp2
NA19079.hp2
NA20129.hp2
NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43799_45+43804d
others(8): Show 
c.45+43799_45+43804delCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 TCCTTCCC
others(4): Show 
TCCTTCCCCTTC
 T
T
 1 a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0021g0258
 1 HG03579.hp2
HG03579.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43755_45+43765d
others(13): Show 
c.45+43755_45+43765delTTCCCCTTCCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623039 TCCTTCCC
others(5): Show 
TCCTTCCCCTTCC
 T
T
 2 a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
 2 HG01258.hp2
HG01358.hp1
HG01258.hp2
HG01358.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43793_45+43804d
others(14): Show 
c.45+43793_45+43804delCCCCTTCCCCTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623039
chr9:17623044 C
C
 T
T
 20 a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0093
others(17): Show 
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0062
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a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0238
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a0001c0001t0004g0255
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a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0011g0256
 21 HG00140.hp1
HG00642.hp1
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others(18): Show 
HG00140.hp1
HG00642.hp1
HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG01074.hp1
HG01081.hp2
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HG03516.hp1
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HG04199.hp1
NA18948.hp1
NA18991.hp2
NA19002.hp1
NA19010.hp1
NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43757C>T
c.45+43757C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623044
chr9:17623045 C
C
 CCTTT
CCTTT
 10 a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0232
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0238
a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0011g0256
 11 HG00642.hp1
HG01070.hp2
HG01071.hp1
others(8): Show 
HG00642.hp1
HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG01074.hp1
HG01081.hp2
HG01255.hp2
HG01516.hp2
HG02572.hp1
NA18948.hp1
NA18991.hp2
NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43759_45+43760i
others(6): Show 
c.45+43759_45+43760insTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623045
chr9:17623045 C
C
 CCTTTCCT
others(7): Show 
CCTTTCCTTTCCTTT
 5 a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0004g0255
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0008g0158
 5 HG02027.hp1
HG02895.hp2
HG03516.hp1
others(2): Show 
HG02027.hp1
HG02895.hp2
HG03516.hp1
HG04199.hp1
NA19002.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43759_45+43760i
others(16): Show 
c.45+43759_45+43760insTTTCCTTTCCTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623045
chr9:17623045 C
C
 CCTTTCCT
others(12): Show 
CCTTTCCTTTCCTTTCCTTT
 2 a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0002g0062
 2 HG00140.hp1
HG03831.hp1
HG00140.hp1
HG03831.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43759_45+43760i
others(21): Show 
c.45+43759_45+43760insTTTCCTTTCCTTTCCTTTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623045
chr9:17623045 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0007g0172
a0001c0001t0007g0172
 1 HG03017.hp1
HG03017.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43758C>T
c.45+43758C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623045
chr9:17623047 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0184
 2 HG03471.hp2
NA19010.hp1
HG03471.hp2
NA19010.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+43760C>T
c.45+43760C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623047
chr9:17623057 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0184
 1 HG03471.hp2
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43770C>T
c.45+43770C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623057
chr9:17623062 C
C
 T
T
 41 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
others(38): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0090
a0001c0001t0001g0099
a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0015g0041
a0001c0001t0017g0112
a0001c0001t0020g0211
a0001c0002t0013g0162
 41 HG00438.hp1
HG00673.hp1
HG01099.hp2
others(38): Show 
HG00438.hp1
HG00673.hp1
HG01099.hp2
HG01243.hp1
HG01243.hp2
HG01433.hp1
HG01978.hp2
HG02055.hp1
HG02258.hp1
HG02258.hp2
HG02280.hp1
HG02523.hp1
HG02622.hp1
HG02630.hp2
HG02683.hp1
HG02683.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp2
HG02809.hp1
HG02976.hp2
HG03130.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03225.hp1
HG03225.hp2
HG03704.hp1
HG03710.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp1
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18991.hp1
NA18994.hp1
NA19011.hp2
NA19030.hp2
NA19077.hp2
NA20129.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43775C>T
c.45+43775C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623062
chr9:17623220 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0205
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+43933G>C
c.45+43933G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623220
chr9:17623317 T
T
 C
C
 41 a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0038
others(38): Show 
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0001g0109
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0180
a0001c0001t0001g0228
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0002g0024
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a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0156
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a0001c0001t0003g0028
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0005g0036
a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0011g0256
a0001c0003t0002g0039
 41 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00280.hp2
others(38): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00280.hp2
HG00323.hp1
HG00609.hp2
HG01070.hp1
HG01071.hp2
HG01074.hp1
HG01074.hp2
HG01258.hp2
HG01261.hp1
HG01358.hp1
HG01516.hp1
HG01978.hp1
HG02015.hp1
HG02027.hp1
HG02027.hp2
HG02056.hp2
HG02165.hp1
HG02559.hp2
HG03486.hp2
HG03491.hp1
HG03516.hp1
HG03654.hp2
HG03831.hp1
HG03942.hp2
HG04199.hp1
HG04228.hp2
NA18747.hp2
NA18906.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp2
NA18962.hp2
NA18971.hp1
NA18975.hp2
NA18994.hp2
NA19064.hp1
NA19077.hp1
NA19079.hp2
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+44030T>C
c.45+44030T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623317
chr9:17623320 C
C
 T
T
 39 a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0038
others(36): Show 
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0001g0109
a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0180
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a0001c0001t0001g0229
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c.45+44033C>T
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0058
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HG00642.hp1
HG01070.hp2
HG01071.hp1
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c.45+44040C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623327
chr9:17623403 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0075
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NA19010.hp1
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c.45+44116A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623403
chr9:17623491 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
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HG02723.hp2
HG02055.hp1
HG02723.hp2
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c.45+44204A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623491
chr9:17623556 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0237
a0001c0001t0003g0237
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HG01361.hp2
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c.45+44269C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623556
chr9:17623705 T
T
 TAC
TAC
 3 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
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NA18953.hp1
HG01258.hp2
HG01358.hp1
NA18953.hp1
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others(4): Show 
c.45+44449_45+44450dupAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623705
chr9:17623705 T
T
 TACAC
TACAC
 58 a0001c0001t0001g0006
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a0001c0001t0001g0011
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 58 HG00323.hp2
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others(55): Show 
HG00323.hp2
HG00408.hp2
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HG00558.hp2
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NA19002.hp2
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NA19088.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+44447_45+44450d
others(6): Show 
c.45+44447_45+44450dupACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623705
chr9:17623705 T
T
 TACACAC
TACACAC
 8 a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0224
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0237
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 8 HG01361.hp2
HG02055.hp1
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others(5): Show 
HG01361.hp2
HG02055.hp1
HG02647.hp2
HG02723.hp2
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HG03831.hp2
NA19087.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+44445_45+44450d
others(8): Show 
c.45+44445_45+44450dupACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623705
chr9:17623705 T
T
 TACACACA
others(1): Show 
TACACACAC
 3 a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0005g0022
 3 HG01099.hp1
HG04184.hp2
HG04199.hp2
HG01099.hp1
HG04184.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+44443_45+44450d
others(10): Show 
c.45+44443_45+44450dupACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623705
chr9:17623705 TAC
TAC
 T
T
 133 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0013
others(130): Show 
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a0001c0001t0001g0013
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a0001c0001t0001g0063
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a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0080
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others(4): Show 
c.45+44449_45+44450delAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623705
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TACAC
 T
T
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others(6): Show 
c.45+44447_45+44450delACAC
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chr9:17623705 TACACACA
others(9): Show 
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 T
T
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a0001c0001t0001g0207
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HG02451.hp1
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others(18): Show 
c.45+44435_45+44450delACACACACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17623705
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C
 T
T
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a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0018g0216
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NA20129.hp1
HG03098.hp2
NA20129.hp1
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c.45+44571C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17623858
chr9:17623961 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
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HG02723.hp2
HG02055.hp1
HG02723.hp2
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c.45+44674T>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0239
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HG01255.hp2
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c.45+44740G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17624027
chr9:17624070 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0191
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HG01109.hp1
HG02055.hp2
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c.45+44783G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17624070
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
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c.45+44841G>A
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G
 A
A
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NA18986.hp2
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NA20905.hp2
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c.45+44866G>A
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chr9:17624159 A
A
 G
G
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C
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HG03579.hp2
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A
 T
T
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HG03579.hp2
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c.45+45303G>C
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G
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T
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G
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C
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T
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c.45+46283A>G
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C
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A
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a0001c0001t0001g0223
a0001c0002t0005g0226
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A
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G
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a0001c0001t0001g0105
a0003c0005t0014g0137
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NA18953.hp2
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c.45+46404A>G
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G
 T
T
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A
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A
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 G
G
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A
 G
G
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C
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T
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G
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A
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HG00642.hp1
HG01081.hp2
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A
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NA18747.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0007g0172
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HG03017.hp1
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 G
G
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c.45+47065C>G
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C
 A
A
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HG04199.hp2
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c.45+47082C>A
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G
 A
A
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HG01884.hp2
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c.45+47121G>A
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C
 T
T
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HG02559.hp2
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
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HG02723.hp2
HG02055.hp1
HG02723.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0011
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NA19002.hp2
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NA20905.hp2
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c.45+47167C>T
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chr9:17626478 T
T
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0186
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a0001c0001t0001g0203
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a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0252
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HG02257.hp1
HG02572.hp2
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c.45+47191T>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0222
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HG02647.hp2
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c.45+47303A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17626590
chr9:17626618 C
C
 T
T
 41 a0001c0001t0001g0008
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a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0110
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HG00438.hp1
HG00673.hp1
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NA20905.hp2
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c.45+47331C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17626618
chr9:17626623 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
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HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG03195.hp2
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c.45+47336A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17626623
chr9:17626730 A
A
 G
G
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HG01109.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp1
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c.45+47443A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17626730
chr9:17626736 GTGGACAT
GTGGACAT
 G
G
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a0001c0001t0005g0047
others(1): Show 
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a0001c0001t0005g0046
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 4 NA18612.hp2
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NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA18971.hp2
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others(9): Show 
c.45+47451_45+47457delGGACATT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17626736
chr9:17626745 T
T
 A
A
 4 a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
 4 NA18612.hp2
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others(1): Show 
NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA18971.hp2
NA19010.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+47458T>A
c.45+47458T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17626745
chr9:17626764 T
T
 C
C
 44 a0001c0001t0001g0008
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a0001c0001t0001g0015
others(41): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0016
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a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0224
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a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0242
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0031
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a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0005g0169
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a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0015g0041
a0001c0001t0017g0112
a0001c0001t0020g0211
a0001c0002t0013g0162
 44 HG00438.hp1
HG00673.hp1
HG01099.hp2
others(41): Show 
HG00438.hp1
HG00673.hp1
HG01099.hp2
HG01243.hp1
HG01243.hp2
HG01433.hp1
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HG02055.hp1
HG02109.hp2
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HG02717.hp1
HG02723.hp2
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HG03139.hp1
HG03139.hp2
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HG03704.hp1
HG03710.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp1
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18991.hp1
NA18994.hp1
NA19011.hp2
NA19030.hp2
NA19077.hp2
NA20129.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+47477T>C
c.45+47477T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17626764
chr9:17626949 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0002g0024
 1 HG01978.hp1
HG01978.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+47662C>T
c.45+47662C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17626949
chr9:17626989 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0003g0023
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0005g0022
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HG03710.hp2
HG04184.hp2
others(1): Show 
HG01192.hp1
HG03710.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+47702A>G
c.45+47702A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17626989
chr9:17627144 C
C
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0006g0221
 3 HG02622.hp2
HG03516.hp2
NA18906.hp1
HG02622.hp2
HG03516.hp2
NA18906.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+47857C>G
c.45+47857C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17627144
chr9:17627176 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0223
 1 HG03540.hp1
HG03540.hp1
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c.45+47889C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17627176
chr9:17627215 C
C
 G
G
 27 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
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others(24): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0001g0090
a0001c0001t0001g0099
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a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0259
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a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0101
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a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0005g0169
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 27 HG00438.hp1
HG00673.hp1
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others(24): Show 
HG00438.hp1
HG00673.hp1
HG01099.hp2
HG01243.hp2
HG01433.hp1
HG01978.hp2
HG02258.hp1
HG02523.hp1
HG02622.hp1
HG02683.hp1
HG02683.hp2
HG02809.hp1
HG03704.hp1
HG03710.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp1
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18991.hp1
NA18994.hp1
NA19011.hp2
NA19077.hp2
NA20129.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+47928C>G
c.45+47928C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17627215
chr9:17627233 T
T
 A
A
 74 a0001c0001t0001g0006
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a0001c0001t0001g0034
others(71): Show 
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T
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G
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c.45+48003A>G
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 T
T
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
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HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01175.hp2
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c.45+48159G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.45+48163T>C
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G
 A
A
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c.45+48369G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0227
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HG02055.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
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c.45+48659G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17627946
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A
 T
T
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c.45+48666A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17627953
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A
 G
G
 205 a0001c0001t0001g0006
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T
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A
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c.45+49104G>A
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GGT
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G
 T
T
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HG00735.hp1
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c.45+49124G>T
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 G
G
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 G
G
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c.45+49159_45+49166delGTGTGTGT
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 G
G
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c.45+49157_45+49166delGTGTGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17628411
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others(5): Show 
GGTGTGTGTGTGT
 G
G
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a0001c0001t0001g0015
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others(14): Show 
c.45+49155_45+49166delGTGTGTGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17628411
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others(9): Show 
GGTGTGTGTGTGTGTGT
 G
G
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a0001c0006t0001g0153
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HG03710.hp2
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others(18): Show 
c.45+49151_45+49166delGTGTGTGTGTGTGTGT
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others(15): Show 
GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
 G
G
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a0001c0001t0001g0159
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HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
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others(24): Show 
c.45+49145_45+49166delGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
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others(17): Show 
GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
 G
G
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a0001c0001t0002g0144
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HG03491.hp2
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others(26): Show 
c.45+49143_45+49166delGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17628411
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others(21): Show 
GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
 G
G
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HG02559.hp1
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others(30): Show 
c.45+49139_45+49166delGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17628411
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T
 G
G
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a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
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HG00642.hp2
HG00733.hp1
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c.45+49126T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17628413
chr9:17628421 T
T
 G
G
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0248
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others(4): Show 
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c.45+49134T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17628421
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T
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0085
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a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0109
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NA19077.hp1
NA18994.hp2
NA19077.hp1
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c.45+49136T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17628423
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T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0163
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HG02559.hp1
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c.45+49154T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17628441
chr9:17628448 G
G
 GTGTGTA
GTGTGTA
 3 a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
 3 NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA19010.hp2
NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA19010.hp2
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others(8): Show 
c.45+49166_45+49171dupTATGTG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17628448
chr9:17628644 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+49357T>A
c.45+49357T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17628644
chr9:17628712 A
A
 G
G
 7 a0001c0001t0001g0207
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a0001c0001t0001g0248
others(4): Show 
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a0001c0001t0001g0208
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c.45+49425A>G
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C
 G
G
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c.45+49441C>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0173
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HG02735.hp2
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c.45+49441C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17628728
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C
 T
T
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HG02148.hp1
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 A
A
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others(4): Show 
HG01884.hp2
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c.45+49489G>A
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chr9:17628776 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0223
a0001c0002t0005g0226
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HG03540.hp1
HG03098.hp1
HG03540.hp1
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c.45+49489G>T
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T
 C
C
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NA19010.hp1
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c.45+49553T>C
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CT
 C
C
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 57 HG00280.hp1
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others(54): Show 
HG00280.hp1
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NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+49706delT
c.45+49706delT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17628980
chr9:17629092 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0139
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HG00558.hp2
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c.45+49805A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17629092
chr9:17629171 T
T
 C
C
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a0001c0001t0003g0076
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HG01515.hp1
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c.45+49884T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17629171
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A
 G
G
 1 a0001c0001t0007g0172
a0001c0001t0007g0172
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HG03017.hp1
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c.45+49982A>G
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T
 C
C
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HG02809.hp2
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c.45+50004T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17629291
chr9:17629298 GA
GA
 G
G
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C
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T
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T
 C
C
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c.45+50186T>C
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C
 T
T
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 C
C
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c.45+50574T>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0020g0211
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HG02280.hp1
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0005g0226
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HG02630.hp1
HG03098.hp1
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c.45+50674T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17629961
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0060
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NA18944.hp1
NA18944.hp2
NA18966.hp1
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c.45+50931A>G
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A
 G
G
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c.45+51142A>G
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G
 A
A
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c.45+51162G>A
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 G
G
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c.45+51199A>G
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C
 T
T
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c.45+51442A>G
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T
 G
G
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NA19064.hp1
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c.45+51459T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17630746
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0102
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HG00280.hp2
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c.45+51463A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17630750
chr9:17630999 A
A
 T
T
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a0001c0001t0001g0186
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HG02257.hp1
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c.45+51712A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17630999
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C
 G
G
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a0001c0001t0018g0216
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HG03098.hp2
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c.45+51849C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17631136
chr9:17631145 T
T
 C
C
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c.45+51858T>C
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C
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G
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a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0230
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HG02572.hp1
HG02257.hp2
HG02572.hp1
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c.45+51870C>G
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T
 G
G
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c.45+51872T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17631159
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A
 G
G
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T
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c.45+51919G>T
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A
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c.45+53258A>G
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G
 A
A
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c.45+53526G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.45+53575T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17632862
chr9:17632996 C
C
 A
A
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HG03654.hp2
HG04184.hp1
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c.45+53709C>A
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G
 A
A
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c.45+53738G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0009g0181
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NA19240.hp1
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c.45+53766C>T
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G
 A
A
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NA20752.hp1
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c.45+53774G>A
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A
 C
C
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HG01884.hp2
HG02055.hp2
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c.45+53830A>C
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 T
T
 95 a0001c0001t0001g0006
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C
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A
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T
 A
A
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HG02145.hp2
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c.45+54131T>A
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T
 G
G
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HG00280.hp2
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c.45+54194T>G
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G
 A
A
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T
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C
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c.45+54821T>C
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T
 C
C
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HG02886.hp2
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c.45+54822T>C
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G
 C
C
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a0001c0001t0001g0251
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NA19030.hp1
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c.45+54867G>C
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T
 TG
TG
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a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0009g0181
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HG02280.hp2
HG02809.hp2
NA19240.hp1
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c.45+54869_45+54870insG
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0062
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HG03831.hp1
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c.45+54903A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0184
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HG03471.hp2
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c.45+54995C>A
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A
 G
G
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C
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c.45+55084C>G
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 T
T
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G
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c.45+56117T>G
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chr9:17635515 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0206
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a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0009g0181
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HG02809.hp2
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HG02280.hp2
HG02809.hp2
NA19240.hp1
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c.45+56228C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17635515
chr9:17635524 G
G
 C
C
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a0001c0001t0001g0044
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c.45+56237G>C
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chr9:17635572 A
A
 G
G
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c.45+56285A>G
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A
 G
G
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c.45+56286A>G
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chr9:17635691 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0008
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c.45+56404A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17635691
chr9:17635714 A
A
 G
G
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others(119): Show 
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c.45+56427A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0237
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HG01361.hp2
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c.45+56606A>G
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G
 A
A
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c.45+56799G>A
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G
 T
T
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c.45+56915G>T
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 C
C
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HG02145.hp2
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c.45+56922G>C
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A
 G
G
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others(101): Show 
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c.45+56924A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.45+56934G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0206
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a0001c0003t0002g0010
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 24 HG00558.hp2
HG00609.hp2
HG01258.hp1
others(21): Show 
HG00558.hp2
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C
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A
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A
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A
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c.45+57389C>G
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C
 T
T
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HG01074.hp1
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c.45+57454C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17636741
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T
 C
C
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HG02976.hp2
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c.45+57460T>C
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T
 A
A
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c.45+57469T>A
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G
 T
T
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c.45+57472G>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0102
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a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
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c.45+57486G>A
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chr9:17636823 A
A
 T
T
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
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HG02630.hp1
NA20129.hp1
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c.45+57564G>A
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chr9:17636948 T
T
 A
A
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a0001c0001t0002g0102
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a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
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HG01099.hp1
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HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
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c.45+57661T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17636948
chr9:17636949 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
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a0001c0001t0002g0003
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a0001c0001t0002g0127
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HG00280.hp2
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HG02523.hp2
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c.45+57662G>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0193
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HG02559.hp2
HG02647.hp2
HG03139.hp2
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c.45+57785A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0113
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HG01361.hp1
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c.45+57845G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637132
chr9:17637179 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0222
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HG02647.hp2
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chr9:17637196 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
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HG02523.hp2
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
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c.45+57909G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637196
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 G
G
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others(73): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
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HG00408.hp1
HG00408.hp2
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HG00558.hp1
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HG00673.hp1
HG00733.hp2
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HG01071.hp2
HG01175.hp2
HG01192.hp2
HG01243.hp2
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HG02015.hp2
HG02040.hp2
HG02074.hp2
HG02145.hp1
HG02148.hp1
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NA18966.hp2
NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp1
NA18971.hp2
NA18975.hp2
NA18977.hp1
NA18977.hp2
NA18986.hp1
NA18989.hp2
NA18991.hp1
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NA19064.hp2
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NA19079.hp2
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NA19087.hp1
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NA20752.hp1
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NA20905.hp1
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c.45+57911A>G
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chr9:17637209 A
A
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0108
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0108
 2 NA19011.hp2
NA19079.hp1
NA19011.hp2
NA19079.hp1
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c.45+57922A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637209
chr9:17637238 T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
 3 HG00280.hp2
HG01099.hp1
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HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
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c.45+57951T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637238
chr9:17637413 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0214
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
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c.45+58126C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637413
chr9:17637470 C
C
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0087
a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0087
a0001c0001t0001g0110
 3 HG02074.hp1
HG02523.hp1
NA18961.hp1
HG02074.hp1
HG02523.hp1
NA18961.hp1
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c.45+58183C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637470
chr9:17637590 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
others(2): Show 
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a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
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others(2): Show 
HG02622.hp2
HG03139.hp1
HG03516.hp2
HG03579.hp2
NA18906.hp1
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c.45+58303T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637590
chr9:17637653 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.45+58366A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637653
chr9:17637674 C
C
 G
G
 1 a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0005g0226
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HG03098.hp1
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c.45+58387C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637674
chr9:17637882 C
C
 T
T
 1 a0001c0006t0001g0153
a0001c0006t0001g0153
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HG03710.hp2
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c.45+58595C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637882
chr9:17637931 C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0185
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0011g0256
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others(1): Show 
HG01074.hp1
HG02630.hp2
HG02976.hp2
NA19030.hp2
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c.45+58644C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17637931
chr9:17638099 G
G
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0157
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
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 5 HG02622.hp2
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HG03516.hp2
others(2): Show 
HG02622.hp2
HG03139.hp1
HG03516.hp2
HG03579.hp2
NA18906.hp1
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c.45+58812G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17638099
chr9:17638156 C
C
 CA
CA
 15 a0001c0001t0001g0157
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others(12): Show 
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0242
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a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0021g0258
a0001c0002t0013g0162
 15 HG00280.hp2
HG01074.hp1
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others(12): Show 
HG00280.hp2
HG01074.hp1
HG01099.hp1
HG02523.hp2
HG02622.hp2
HG02630.hp2
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HG03139.hp1
HG03225.hp2
HG03516.hp2
HG03579.hp2
NA18906.hp1
NA18972.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+58879dupA
c.45+58879dupA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17638156
chr9:17638156 C
C
 CAA
CAA
 83 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
others(80): Show 
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
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a0001c0001t0001g0115
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a0001c0001t0001g0250
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 83 HG00140.hp1
HG00140.hp2
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others(80): Show 
HG00140.hp1
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HG00323.hp1
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NA19087.hp1
NA20300.hp2
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NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+58878_45+58879d
others(4): Show 
c.45+58878_45+58879dupAA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17638156
chr9:17638156 C
C
 CAAAA
CAAAA
 5 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0246
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0234
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 5 HG02630.hp1
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others(2): Show 
HG02630.hp1
HG02647.hp2
HG02895.hp2
HG03579.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+58876_45+58879d
others(6): Show 
c.45+58876_45+58879dupAAAA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17638156
chr9:17638165 AAC
AAC
 A
A
 9 a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0135
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0131
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 9 HG03654.hp2
HG04184.hp1
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others(6): Show 
HG03654.hp2
HG04184.hp1
NA18953.hp1
NA18962.hp1
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NA19012.hp1
NA19086.hp1
NA19088.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+58880_45+58881d
others(4): Show 
c.45+58880_45+58881delCA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17638165
chr9:17638169 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0214
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+58882A>G
c.45+58882A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17638169
chr9:17638170 A
A
 C
C
 9 a0001c0001t0001g0054
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others(6): Show 
a0001c0001t0001g0054
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C
 A
A
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T
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0004g0255
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c.45+58923G>T
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 T
T
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a0001c0001t0006g0214
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HG02809.hp1
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c.45+58940G>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0013
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NA18971.hp1
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 A
A
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c.45+58998G>A
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 C
C
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HG01884.hp1
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c.45+59029G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17638316
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 A
A
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c.45+59189G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17638476
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 T
T
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a0001c0001t0020g0211
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HG02280.hp1
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c.45+59239G>T
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 C
C
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a0001c0001t0001g0115
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HG01515.hp2
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c.45+59454G>C
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C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0156
a0001c0001t0002g0156
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HG01261.hp1
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c.45+59509C>T
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 T
T
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G
 T
T
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T
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G
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a0001c0001t0001g0033
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NA19086.hp2
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c.45+59814T>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0068
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HG02015.hp1
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T
 A
A
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T
 C
C
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A
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T
 C
C
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c.45+60737T>C
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C
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c.45+60790A>C
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A
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G
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HG03579.hp1
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c.45+60882A>G
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CAGTAA
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others(7): Show 
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 G
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T
 A
A
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HG01516.hp2
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C
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c.45+61116A>C
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A
 AT
AT
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c.45+61180dupT
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chr9:17640644 C
C
 T
T
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c.45+61357C>T
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G
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A
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c.45+61411G>A
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 G
G
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c.45+61576A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.45+61753C>T
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A
 G
G
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HG02145.hp1
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HG02257.hp2
HG02273.hp1
HG02572.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp2
HG02735.hp1
HG02895.hp2
HG03017.hp1
HG03041.hp2
HG03225.hp2
HG03471.hp2
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HG03669.hp2
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c.45+61843A>G
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C
 T
T
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others(1): Show 
HG00280.hp2
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c.45+61913C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17641200
chr9:17641306 A
A
 C
C
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HG01074.hp1
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c.45+62019A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17641306
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A
 T
T
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a0001c0001t0002g0156
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HG01261.hp1
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 A
A
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c.45+62134G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17641421
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A
 G
G
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HG00438.hp2
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c.45+62189A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17641476
chr9:17641479 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0048
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HG02735.hp1
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c.45+62192T>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0206
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NA19240.hp1
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c.45+62237G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17641524
chr9:17641538 C
C
 A
A
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NA18942.hp1
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c.45+62251C>A
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C
 T
T
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others(1): Show 
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HG02630.hp1
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c.45+62260C>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0084
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HG04228.hp1
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c.45+62261G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0030
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HG00639.hp2
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C
 A
A
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HG02630.hp1
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C
 A
A
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 T
T
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G
 A
A
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c.45+62451G>A
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T
 C
C
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HG02523.hp1
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c.45+62484T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17641771
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T
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TGCATGG
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A
 T
T
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c.45+62524A>T
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chr9:17641813 G
G
 A
A
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c.45+62528C>T
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A
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G
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a0001c0001t0004g0230
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c.45+62529A>G
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G
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HG02630.hp1
HG02647.hp2
HG02895.hp2
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c.45+62606A>G
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G
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HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
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c.45+62622A>G
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A
 G
G
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 106 HG00280.hp1
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others(103): Show 
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HG00280.hp2
HG00323.hp2
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chr9:17642092 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0003g0023
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HG03704.hp2
HG04199.hp2
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c.45+62805G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642092
chr9:17642171 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642171
chr9:17642177 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
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NA20129.hp2
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c.45+62890A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642177
chr9:17642240 T
T
 G
G
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A
 G
G
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NA18953.hp1
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T
 A
A
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a0001c0001t0003g0023
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c.45+63048T>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0002g0026
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C
 G
G
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a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0019g0220
a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0019g0220
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642492
chr9:17642518 T
T
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0002g0241
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642518
chr9:17642549 C
C
 G
G
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a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0009g0181
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HG02809.hp2
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HG02280.hp2
HG02809.hp2
NA19240.hp1
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c.45+63262C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642549
chr9:17642666 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.45+63379T>C
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chr9:17642671 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
 2 HG02630.hp1
NA20129.hp1
HG02630.hp1
NA20129.hp1
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c.45+63384G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642671
chr9:17642781 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0017g0112
a0001c0001t0017g0112
 1 HG01978.hp2
HG01978.hp2
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c.45+63494C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642781
chr9:17642782 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0185
a0001c0002t0013g0162
a0001c0001t0001g0185
a0001c0002t0013g0162
 2 HG02630.hp2
HG02976.hp2
HG02630.hp2
HG02976.hp2
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c.45+63495G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642782
chr9:17642802 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0229
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a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0229
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NA18991.hp2
NA19064.hp1
NA18970.hp1
NA18991.hp2
NA19064.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+63515G>T
c.45+63515G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17642802
chr9:17642832 G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
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HG00280.hp2
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HG02523.hp2
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c.45+63545G>C
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chr9:17642856 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0014
others(107): Show 
a0001c0001t0001g0006
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A
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T
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c.45+63925A>T
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G
 T
T
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c.45+63939G>T
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A
 G
G
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c.45+63943A>G
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T
 A
A
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a0001c0001t0001g0187
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HG01433.hp2
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c.45+64032T>A
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chr9:17643321 A
A
 G
G
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.45+64034A>G
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chr9:17643337 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0246
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0246
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HG02630.hp1
HG02895.hp2
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NA20129.hp1
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c.45+64050A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643337
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others(7): Show 
CTATTTGAATACCTT
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0003g0155
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NA20805.hp2
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others(16): Show 
c.45+64077_45+64090delGAATACCTTTATTT
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chr9:17643389 C
C
 G
G
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a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
HG02559.hp2
NA19240.hp2
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c.45+64102C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643389
chr9:17643445 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0002g0233
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NA18991.hp2
NA19064.hp1
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c.45+64158G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643445
chr9:17643466 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0203
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HG02723.hp1
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c.45+64179A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643466
chr9:17643504 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0139
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HG00558.hp2
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c.45+64217G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643504
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others(20): Show 
AGTCATTGGTTCTGTTTATGTGTTTTTT
 A
A
 1 a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0009
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HG06807.hp1
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others(29): Show 
c.45+64310_45+64336delTTTTTTGTCATTGGTTCTGTTTATGTG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17643575
chr9:17643583 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0135
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0054
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HG03654.hp2
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c.45+64296G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643583
chr9:17643596 G
G
 GT
GT
 12 a0001c0001t0001g0190
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c.45+64315dupT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17643596
chr9:17643616 T
T
 A
A
 4 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.45+64329T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643616
chr9:17643674 G
G
 T
T
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NA20905.hp1
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c.45+64463C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643750
chr9:17643866 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0005g0226
 1 HG03098.hp1
HG03098.hp1
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c.45+64579T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643866
chr9:17643886 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0006g0215
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a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0019g0220
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HG02145.hp1
NA19030.hp1
HG01192.hp2
HG02145.hp1
NA19030.hp1
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c.45+64599G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643886
chr9:17643943 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0140
 1 HG03491.hp1
HG03491.hp1
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c.45+64656C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17643943
chr9:17644070 A
A
 T
T
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0248
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a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0248
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 6 HG01884.hp2
HG02055.hp2
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others(3): Show 
HG01884.hp2
HG02055.hp2
HG02451.hp1
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c.45+64783A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17644070
chr9:17644154 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
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others(47): Show 
HG00558.hp2
HG00609.hp2
HG01243.hp1
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HG01884.hp2
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NA18968.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.45+64867A>G
c.45+64867A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17644154
chr9:17644165 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0020g0211
 1 HG02280.hp1
HG02280.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+64878G>C
c.45+64878G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17644165
chr9:17644169 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0051
 1 NA18961.hp2
NA18961.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+64882C>A
c.45+64882C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17644169
chr9:17644231 T
T
 A
A
 4 a0001c0001t0001g0185
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0242
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others(1): Show 
HG01074.hp1
HG02630.hp2
HG02976.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.45+64944T>A
c.45+64944T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17644231
chr9:17644269 A
A
 T
T
 62 a0001c0001t0001g0008
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others(59): Show 
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HG02040.hp2
HG02074.hp2
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HG03041.hp1
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NA18962.hp2
NA18966.hp2
NA18968.hp1
NA18972.hp1
NA18977.hp2
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp1
NA18994.hp2
NA19002.hp2
NA19009.hp1
NA19009.hp2
NA19074.hp2
NA19077.hp2
NA19086.hp2
NA19087.hp1
NA19087.hp2
NA19240.hp1
NA20752.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+64982A>T
c.45+64982A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17644269
chr9:17644278 G
G
 A
A
 188 a0001c0001t0001g0006
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c.45+65038T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0254
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HG03225.hp2
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c.45+65157C>T
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chr9:17644490 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0051
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NA18961.hp2
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c.45+65203C>T
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chr9:17644524 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0100
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a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0001g0115
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HG01433.hp1
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HG01243.hp2
HG01433.hp1
HG01515.hp2
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c.45+65237G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17644524
chr9:17644568 A
A
 T
T
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a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0010g0219
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HG02559.hp2
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HG03139.hp2
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c.45+65281A>T
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G
 A
A
 99 a0001c0001t0001g0006
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c.45+65438G>A
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 T
T
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c.45+65520G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17644807
chr9:17644867 G
G
 C
C
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G
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NA18942.hp1
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T
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G
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HG06807.hp1
NA18906.hp2
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C
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G
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NA19088.hp1
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0209
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HG02630.hp1
HG02895.hp2
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0246
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c.45+65860G>T
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C
 CTTTTTTT
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CTTTTTTTTTTTTT
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HG02280.hp2
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C
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a0001c0001t0002g0004
a0001c0003t0002g0010
 4 NA18950.hp1
NA18972.hp1
NA19064.hp1
others(1): Show 
NA18950.hp1
NA18972.hp1
NA19064.hp1
NA19087.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65880_45+65895d
others(18): Show 
c.45+65880_45+65895dupTTTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 C
C
 CTTTTTTT
others(12): Show 
CTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 2 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0002g0138
 2 HG02027.hp1
HG03139.hp1
HG02027.hp1
HG03139.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65877_45+65895d
others(21): Show 
c.45+65877_45+65895dupTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 C
C
 CTTTTTTT
others(13): Show 
CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 6 a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0006g0221
 6 HG02622.hp2
HG03516.hp2
HG03710.hp1
others(3): Show 
HG02622.hp2
HG03516.hp2
HG03710.hp1
NA18906.hp1
NA18942.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65876_45+65895d
others(22): Show 
c.45+65876_45+65895dupTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 C
C
 CTTTTTTT
others(14): Show 
CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
 1 NA18948.hp1
NA18948.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65875_45+65895d
others(23): Show 
c.45+65875_45+65895dupTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 C
C
 CTTTTTTT
others(15): Show 
CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 3 a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0129
 3 HG00609.hp2
NA18986.hp2
NA19077.hp2
HG00609.hp2
NA18986.hp2
NA19077.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65874_45+65895d
others(24): Show 
c.45+65874_45+65895dupTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 C
C
 CTTTTTTT
others(20): Show 
CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65869_45+65895d
others(29): Show 
c.45+65869_45+65895dupTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTT
CTT
 C
C
 7 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0237
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0237
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0011g0257
 7 HG01071.hp2
HG01361.hp2
HG02559.hp2
others(4): Show 
HG01071.hp2
HG01361.hp2
HG02559.hp2
HG02647.hp2
HG03139.hp2
HG03516.hp1
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65894_45+65895d
others(4): Show 
c.45+65894_45+65895delTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTT
CTTT
 C
C
 11 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0164
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
 11 HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG00735.hp1
others(8): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG00735.hp1
HG01258.hp2
HG01358.hp1
HG01515.hp1
HG02258.hp1
HG02717.hp1
HG03453.hp1
NA20129.hp2
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65893_45+65895d
others(5): Show 
c.45+65893_45+65895delTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTT
CTTTT
 C
C
 7 a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0170
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0006g0214
 7 HG00642.hp1
HG01175.hp1
HG01258.hp1
others(4): Show 
HG00642.hp1
HG01175.hp1
HG01258.hp1
HG02027.hp2
HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65892_45+65895d
others(6): Show 
c.45+65892_45+65895delTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTT
CTTTTT
 C
C
 18 a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0051
others(15): Show 
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0002g0025
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a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0006g0217
 18 HG00438.hp2
HG01109.hp1
HG01358.hp2
others(15): Show 
HG00438.hp2
HG01109.hp1
HG01358.hp2
HG02074.hp1
HG02109.hp1
HG02148.hp2
HG02717.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
NA18961.hp2
NA18966.hp1
NA18968.hp2
NA18972.hp2
NA18991.hp2
NA18994.hp1
NA19012.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65891_45+65895d
others(7): Show 
c.45+65891_45+65895delTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTT
CTTTTTT
 C
C
 67 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0034
others(64): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0052
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a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0067
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a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0087
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0091
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0147
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a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0173
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0002g0001
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a0001c0001t0002g0103
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a0001c0001t0002g0127
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a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0238
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a0001c0001t0003g0028
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a0001c0001t0005g0046
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a0001c0001t0008g0196
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 68 HG00280.hp1
HG00280.hp2
HG00323.hp2
others(65): Show 
HG00280.hp1
HG00280.hp2
HG00323.hp2
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HG00639.hp2
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NA18612.hp2
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NA18942.hp1
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18944.hp2
NA18948.hp2
NA18953.hp2
NA18961.hp1
NA18975.hp1
NA18999.hp1
NA19010.hp2
NA19011.hp1
NA19074.hp1
NA19077.hp1
NA19088.hp1
NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65890_45+65895d
others(8): Show 
c.45+65890_45+65895delTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTTT
others(1): Show 
CTTTTTTTT
 C
C
 6 a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0248
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0247
 6 HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG02559.hp1
others(3): Show 
HG01884.hp2
HG02451.hp1
HG02559.hp1
HG03195.hp2
HG03471.hp1
NA18970.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65888_45+65895d
others(10): Show 
c.45+65888_45+65895delTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTTT
others(2): Show 
CTTTTTTTTT
 C
C
 7 a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0242
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0010g0218
a0001c0002t0013g0162
 7 HG01243.hp1
HG02630.hp2
HG02976.hp2
others(4): Show 
HG01243.hp1
HG02630.hp2
HG02976.hp2
HG03130.hp1
HG06807.hp1
NA18906.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65887_45+65895d
others(11): Show 
c.45+65887_45+65895delTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTTT
others(3): Show 
CTTTTTTTTTT
 C
C
 1 a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0020g0211
 1 HG02280.hp1
HG02280.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65886_45+65895d
others(12): Show 
c.45+65886_45+65895delTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTTT
others(4): Show 
CTTTTTTTTTTT
 C
C
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a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0210
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a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0002g0024
 4 HG01884.hp1
HG01978.hp1
HG02109.hp2
others(1): Show 
HG01884.hp1
HG01978.hp1
HG02109.hp2
HG02965.hp1
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others(13): Show 
c.45+65885_45+65895delTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTTT
others(5): Show 
CTTTTTTTTTTTT
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0161
 1 HG02451.hp2
HG02451.hp2
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others(14): Show 
c.45+65884_45+65895delTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTTT
others(7): Show 
CTTTTTTTTTTTTTT
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0002g0062
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HG03831.hp1
HG01175.hp2
HG03831.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65882_45+65895d
others(16): Show 
c.45+65882_45+65895delTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTTT
others(8): Show 
CTTTTTTTTTTTTTTT
 C
C
 81 a0001c0001t0001g0007
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a0001c0001t0001g0008
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 81 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00323.hp1
others(78): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00323.hp1
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NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65881_45+65895d
others(17): Show 
c.45+65881_45+65895delTTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645151 CTTTTTTT
others(9): Show 
CTTTTTTTTTTTTTTTT
 C
C
 3 a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0004g0255
 3 HG02630.hp1
HG02895.hp2
NA20129.hp1
HG02630.hp1
HG02895.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65880_45+65895d
others(18): Show 
c.45+65880_45+65895delTTTTTTTTTTTTTTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17645151
chr9:17645179 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0061
 1 HG02683.hp2
HG02683.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65892T>G
c.45+65892T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645179
chr9:17645182 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0002g0024
 1 HG01978.hp1
HG01978.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65895T>A
c.45+65895T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645182
chr9:17645182 T
T
 TTTTTTTT
others(7): Show 
TTTTTTTTTTTTTTA
 1 a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0023
 1 HG04199.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65895_45+65896i
others(16): Show 
c.45+65895_45+65896insTTTTTTTTTTTTTA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645182
chr9:17645182 T
T
 TTTTTTTT
others(8): Show 
TTTTTTTTTTTTTTTA
 1 a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0002g0167
 1 HG03704.hp2
HG03704.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+65895_45+65896i
others(17): Show 
c.45+65895_45+65896insTTTTTTTTTTTTTTA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645182
chr9:17645182 T
T
 TTTTTTTT
others(15): Show 
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA
 1 a0002c0004t0003g0111
a0002c0004t0003g0111
 1 homoSapiens_chm13v2.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+65895_45+65896i
others(24): Show 
c.45+65895_45+65896insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645182
chr9:17645317 C
C
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0002g0233
 3 NA18970.hp1
NA18991.hp2
NA19064.hp1
NA18970.hp1
NA18991.hp2
NA19064.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+66030C>A
c.45+66030C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645317
chr9:17645377 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0214
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+66090G>C
c.45+66090G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645377
chr9:17645414 A
A
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0020g0211
 5 HG02280.hp1
HG02622.hp2
HG03139.hp1
others(2): Show 
HG02280.hp1
HG02622.hp2
HG03139.hp1
HG03516.hp2
NA18906.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+66127A>G
c.45+66127A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645414
chr9:17645575 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0010g0219
 3 HG02559.hp2
HG02647.hp2
NA19240.hp2
HG02559.hp2
HG02647.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+66288A>G
c.45+66288A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645575
chr9:17645703 A
A
 G
G
 33 a0001c0001t0001g0038
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a0001c0001t0001g0044
others(30): Show 
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0105
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a0001c0001t0001g0229
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a0001c0001t0002g0004
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a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
a0002c0004t0003g0111
 33 HG00558.hp2
HG00609.hp2
HG01192.hp2
others(30): Show 
HG00558.hp2
HG00609.hp2
HG01192.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02145.hp1
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HG02809.hp2
HG03669.hp1
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HG04199.hp2
NA18939.hp2
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NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
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NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19009.hp2
NA19064.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA19240.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+66416A>G
c.45+66416A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645703
chr9:17645844 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0001g0254
 1 HG03225.hp2
HG03225.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+66557T>C
c.45+66557T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645844
chr9:17645920 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0011g0256
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0242
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a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
HG02976.hp2
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HG01074.hp1
HG02630.hp2
HG02976.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+66633T>C
c.45+66633T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17645920
chr9:17646156 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0138
 1 HG02027.hp1
HG02027.hp1
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c.45+66869G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646156
chr9:17646160 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0001g0254
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HG03225.hp2
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c.45+66873G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646160
chr9:17646212 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0018g0216
 1 HG03098.hp2
HG03098.hp2
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c.45+66925T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646212
chr9:17646215 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0003g0155
 1 NA20805.hp2
NA20805.hp2
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c.45+66928C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646215
chr9:17646348 T
T
 C
C
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others(3): Show 
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
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others(3): Show 
HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG02723.hp2
HG03225.hp1
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c.45+67061T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646348
chr9:17646422 A
A
 G
G
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a0001c0001t0003g0002
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a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0003g0002
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HG01433.hp1
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HG01071.hp2
HG01433.hp1
HG03831.hp2
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c.45+67135A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646422
chr9:17646668 T
T
 TC
TC
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a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
others(1): Show 
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
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 4 HG00280.hp2
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others(1): Show 
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67383dupC
c.45+67383dupC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17646668
chr9:17646687 G
G
 A
A
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others(13): Show 
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a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0107
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others(13): Show 
HG00408.hp2
HG01192.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.45+67400G>A
c.45+67400G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646687
chr9:17646709 G
G
 C
C
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a0001c0001t0002g0102
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others(1): Show 
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67422G>C
c.45+67422G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646709
chr9:17646717 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0242
a0001c0002t0013g0162
 3 HG02630.hp2
HG02976.hp2
NA19030.hp2
HG02630.hp2
HG02976.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67430A>G
c.45+67430A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646717
chr9:17646750 C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0002g0003
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others(1): Show 
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a0001c0001t0004g0205
 4 HG00280.hp2
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others(1): Show 
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67463C>T
c.45+67463C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646750
chr9:17646888 C
C
 A
A
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a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0018g0216
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HG03098.hp2
HG02145.hp2
HG03098.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67601C>A
c.45+67601C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646888
chr9:17646895 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0149
 1 HG00639.hp1
HG00639.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+67608C>T
c.45+67608C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646895
chr9:17646896 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0235
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HG02965.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67609G>A
c.45+67609G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646896
chr9:17646935 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0238
a0001c0001t0002g0238
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HG01516.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67648G>A
c.45+67648G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646935
chr9:17646945 G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
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others(1): Show 
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0004g0205
 4 HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
others(1): Show 
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67658G>A
c.45+67658G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646945
chr9:17646967 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0018g0216
 2 HG02145.hp2
HG03098.hp2
HG02145.hp2
HG03098.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67680G>A
c.45+67680G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646967
chr9:17646990 C
C
 A
A
 4 a0001c0001t0002g0003
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others(1): Show 
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a0001c0001t0002g0102
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a0001c0001t0004g0205
 4 HG00280.hp2
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HG02523.hp2
others(1): Show 
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67703C>A
c.45+67703C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17646990
chr9:17647039 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0052
 1 HG01255.hp1
HG01255.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+67752C>T
c.45+67752C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647039
chr9:17647080 G
G
 T
T
 4 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
others(1): Show 
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0004g0205
 4 HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
others(1): Show 
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67793G>T
c.45+67793G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647080
chr9:17647128 A
A
 T
T
 10 a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0235
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0249
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 10 HG01884.hp2
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HG02451.hp1
others(7): Show 
HG01884.hp2
HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02559.hp1
HG02630.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp2
HG03195.hp2
HG03471.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+67841A>T
c.45+67841A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647128
chr9:17647134 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0184
 1 HG03471.hp2
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+67847T>C
c.45+67847T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647134
chr9:17647148 C
C
 G
G
 30 a0001c0001t0001g0015
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a0001c0001t0001g0038
others(27): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0004
a0001c0001t0002g0005
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a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0101
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a0001c0001t0002g0138
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a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0005g0022
a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
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 30 HG00558.hp2
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others(27): Show 
HG00558.hp2
HG00609.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG03669.hp1
HG03704.hp2
HG03710.hp1
HG04184.hp2
HG04199.hp2
NA18939.hp2
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
NA18972.hp1
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NA18991.hp2
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NA19087.hp2
NA20805.hp1
NA20905.hp1
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T
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C
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TTCTC
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 intron_variant MODIFIER c.45+68138_45+68141d
others(6): Show 
c.45+68138_45+68141dupCTCT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17647411
chr9:17647411 T
T
 TTCTCTC
TTCTCTC
 4 a0001c0001t0002g0025
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0206
others(1): Show 
a0001c0001t0002g0025
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0009g0181
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others(1): Show 
HG02148.hp2
HG02280.hp2
HG02809.hp2
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others(8): Show 
c.45+68136_45+68141dupCTCTCT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17647411
chr9:17647411 TTCTCTCT
others(3): Show 
TTCTCTCTCTC
 T
T
 4 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
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others(1): Show 
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0004g0205
 4 HG00280.hp2
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others(1): Show 
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG02523.hp2
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others(12): Show 
c.45+68132_45+68141delCTCTCTCTCT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17647411
chr9:17647429 GTCTCTC
GTCTCTC
 G
G
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a0001c0001t0001g0075
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others(6): Show 
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0131
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HG03654.hp2
HG04184.hp1
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others(8): Show 
c.45+68148_45+68153delCTCTCT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17647429
chr9:17647498 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
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HG00323.hp1
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c.45+68211G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647498
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0210
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HG02965.hp1
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c.45+68215C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647502
chr9:17647621 A
A
 G
G
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others(8): Show 
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 11 HG00408.hp2
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others(8): Show 
HG00408.hp2
HG01192.hp2
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c.45+68334A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647621
chr9:17647662 G
G
 A
A
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others(13): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
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 16 HG00280.hp2
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others(13): Show 
HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG01884.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.45+68375G>A
c.45+68375G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647662
chr9:17647672 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+68385A>G
c.45+68385A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647672
chr9:17647704 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0001g0093
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HG00140.hp1
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c.45+68417A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647704
chr9:17647713 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
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NA20129.hp1
HG02630.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+68426A>G
c.45+68426A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647713
chr9:17647864 A
A
 G
G
 14 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
others(11): Show 
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0185
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HG02145.hp2
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c.45+68577A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0051
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a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0051
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NA18961.hp2
NA18966.hp2
NA19086.hp2
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c.45+68667A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647954
chr9:17647981 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0002g0241
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HG02015.hp1
HG00438.hp2
HG02015.hp1
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c.45+68694C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647981
chr9:17647982 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0011g0256
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HG02630.hp1
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HG01074.hp1
HG02630.hp1
NA20129.hp1
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c.45+68695A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17647982
chr9:17648049 GCTTA
GCTTA
 G
G
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a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0225
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HG02258.hp2
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HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG03225.hp1
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others(6): Show 
c.45+68766_45+68769delACTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17648049
chr9:17648106 T
T
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0225
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HG02258.hp2
HG03225.hp1
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c.45+68819T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17648106
chr9:17648148 C
C
 T
T
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a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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c.45+68861C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17648148
chr9:17648185 G
G
 A
A
 221 a0001c0001t0001g0006
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c.45+68898G>A
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chr9:17648243 A
A
 C
C
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a0001c0001t0001g0252
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HG02572.hp2
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c.45+68956A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17648243
chr9:17648371 C
C
 G
G
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c.45+69084C>G
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chr9:17648467 C
C
 G
G
 7 a0001c0001t0001g0159
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c.45+69180C>G
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chr9:17648729 A
A
 G
G
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c.45+69442A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17648729
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T
 C
C
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NA20905.hp2
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c.45+69576T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17648863
chr9:17648887 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0110
 1 HG02523.hp1
HG02523.hp1
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c.45+69600T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17648887
chr9:17648979 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0179
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HG06807.hp2
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c.45+69692G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17648979
chr9:17649029 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
 3 NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA19010.hp2
NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA19010.hp2
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c.45+69742A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17649029
chr9:17649092 C
C
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
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others(2): Show 
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a0001c0001t0001g0160
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HG01884.hp1
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others(2): Show 
HG00735.hp1
HG01884.hp1
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c.45+69805C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17649092
chr9:17649142 C
C
 A
A
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a0001c0001t0001g0056
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
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HG03654.hp2
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NA18953.hp1
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c.45+69855C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17649142
chr9:17649231 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
 2 HG02717.hp1
HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03486.hp2
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c.45+69944A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17649231
chr9:17649474 T
T
 C
C
 7 a0001c0001t0001g0183
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others(4): Show 
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others(4): Show 
HG02055.hp1
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c.45+70187T>C
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0254
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HG03225.hp2
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c.45+70259G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17649546
chr9:17649568 G
G
 T
T
 242 a0001c0001t0001g0006
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c.45+70557A>C
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A
 G
G
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HG03579.hp2
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c.45+70665A>G
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A
 G
G
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c.45+70683A>G
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G
 A
A
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NA18961.hp2
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c.45+70705G>A
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T
 C
C
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c.45+70742T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17650029
chr9:17650164 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0063
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HG00140.hp2
HG02735.hp1
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c.45+70877G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17650164
chr9:17650278 A
A
 G
G
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a0001c0001t0004g0193
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HG02559.hp2
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c.45+70991A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17650278
chr9:17650369 TTTTG
TTTTG
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0159
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HG01884.hp1
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others(6): Show 
c.45+71094_45+71097delGTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17650369
chr9:17650552 A
A
 G
G
 7 a0001c0001t0001g0159
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c.45+71265A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
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c.45+71316C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17650603
chr9:17650645 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0011g0257
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NA19240.hp2
HG02647.hp2
HG03139.hp2
NA19240.hp2
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c.45+71358C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17650645
chr9:17650659 G
G
 C
C
 243 a0001c0001t0001g0006
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C
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A
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c.45+72049C>A
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T
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c.45+72056T>C
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AT
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A
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HG02055.hp2
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c.45+72073delT
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chr9:17651408 G
G
 A
A
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a0001c0001t0003g0155
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NA20805.hp2
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c.45+72121G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17651408
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T
 C
C
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HG02630.hp2
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c.45+72176T>C
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A
 T
T
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0170
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HG01175.hp1
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c.45+72386T>C
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 G
G
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c.45+72443T>G
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chr9:17651743 G
G
 C
C
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a0001c0001t0019g0220
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
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NA19240.hp1
HG02145.hp1
NA19240.hp1
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c.45+72456G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17651743
chr9:17651747 T
T
 A
A
 2 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03486.hp2
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c.45+72460T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17651747
chr9:17651770 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0190
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c.45+72483C>G
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 A
A
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G
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c.45+73598G>T
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C
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G
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c.45+73643C>G
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T
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c.45+73695A>T
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G
 C
C
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HG00609.hp2
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G
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A
 G
G
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c.45+73878A>G
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T
 C
C
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HG03453.hp2
HG03471.hp1
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c.45+73927T>C
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A
 G
G
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others(6): Show 
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a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0248
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 9 HG01884.hp2
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others(6): Show 
HG01884.hp2
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c.45+73946A>G
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 T
T
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a0001c0001t0002g0024
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HG01978.hp1
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C
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T
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C
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c.45+74050T>C
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A
 C
C
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c.45+74184A>C
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A
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c.45+74189G>A
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A
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G
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a0001c0001t0001g0246
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c.45+74221A>G
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C
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A
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c.45+74291C>A
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A
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c.45+74423G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0118
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a0001c0001t0002g0167
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HG00639.hp2
HG01081.hp1
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c.45+74483G>A
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chr9:17653952 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0020g0211
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HG02280.hp1
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c.45+74665C>T
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chr9:17654143 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0224
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a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
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 6 HG02055.hp1
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HG02055.hp1
HG02258.hp2
HG02723.hp2
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chr9:17654208 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0069
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HG02165.hp1
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654208
chr9:17654227 C
C
 T
T
 11 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
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others(8): Show 
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0135
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a0001c0001t0002g0072
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a0001c0001t0007g0143
 11 HG02165.hp2
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others(8): Show 
HG02165.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
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c.45+74940C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654227
chr9:17654273 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.45+74986T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654273
chr9:17654328 C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
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 4 HG01884.hp1
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others(1): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
HG03098.hp1
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c.45+75041C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654328
chr9:17654365 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
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c.45+75078A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654365
chr9:17654376 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0246
 1 HG02630.hp1
HG02630.hp1
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c.45+75089G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654376
chr9:17654379 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
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c.45+75092T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654379
chr9:17654465 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0002g0119
a0001c0002t0013g0162
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0002g0119
a0001c0002t0013g0162
 3 HG01192.hp1
HG02145.hp2
HG02630.hp2
HG01192.hp1
HG02145.hp2
HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+75178G>T
c.45+75178G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654465
chr9:17654540 T
T
 C
C
 15 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
others(12): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0192
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a0001c0001t0006g0221
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 15 HG01884.hp1
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others(12): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp1
HG02257.hp2
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NA20129.hp2
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c.45+75253T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654540
chr9:17654622 T
T
 C
C
 37 a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0164
others(34): Show 
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0175
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a0001c0001t0001g0184
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a0001c0001t0001g0186
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a0001c0001t0001g0223
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a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0021g0258
 37 HG00280.hp2
HG00639.hp2
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others(34): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG01099.hp1
HG01175.hp1
HG01192.hp2
HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG02055.hp1
HG02055.hp2
HG02148.hp2
HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
HG02451.hp1
HG02523.hp2
HG02630.hp1
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HG03139.hp1
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HG03669.hp2
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HG03831.hp1
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+75335T>C
c.45+75335T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654622
chr9:17654777 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0045
 1 HG02273.hp1
HG02273.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+75490G>T
c.45+75490G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654777
chr9:17654778 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0045
 1 HG02273.hp1
HG02273.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+75491T>C
c.45+75491T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654778
chr9:17654942 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0004g0209
 2 HG03130.hp2
NA20129.hp1
HG03130.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+75655G>A
c.45+75655G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654942
chr9:17654960 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0257
 1 HG03139.hp2
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+75673A>G
c.45+75673A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654960
chr9:17654986 G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
 3 HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+75699G>C
c.45+75699G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17654986
chr9:17655075 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+75788C>T
c.45+75788C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17655075
chr9:17655286 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0259
 2 HG00438.hp1
HG01361.hp1
HG00438.hp1
HG01361.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+75999G>A
c.45+75999G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17655286
chr9:17655304 G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0004g0209
 2 HG03130.hp2
NA20129.hp1
HG03130.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+76017G>C
c.45+76017G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17655304
chr9:17655332 G
G
 A
A
 108 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
others(105): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
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a0001c0001t0001g0071
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a0001c0001t0001g0093
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G
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c.45+76069A>G
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A
 G
G
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.45+76079A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17655366
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 A
A
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c.45+76250G>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0095
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HG01175.hp2
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c.45+76446A>G
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C
 T
T
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c.45+76451C>T
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 A
A
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a0001c0001t0003g0237
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HG01361.hp2
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c.45+76452G>A
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chr9:17655746 G
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 A
A
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G
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A
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A
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c.45+77117dupT
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A
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c.45+77123A>T
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C
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c.45+77126C>T
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T
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C
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C
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 C
C
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 A
A
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A
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c.45+77461G>A
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C
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CA
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c.45+77500dupA
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C
 CAA
CAA
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A
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T
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c.45+77734T>C
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c.45+77858T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657145
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 A
A
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c.45+77859T>A
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chr9:17657146 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
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HG02451.hp1
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.45+77859T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657146
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.45+77863C>G
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GGA
 G
G
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HG02165.hp2
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c.45+78072_45+78073delGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17657348
chr9:17657365 T
T
 G
G
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NA19086.hp2
NA19087.hp1
NA19087.hp2
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NA19240.hp2
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NA20129.hp2
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
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c.45+78078T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657365
chr9:17657380 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
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c.45+78093C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657380
chr9:17657473 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0054
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HG03654.hp2
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c.45+78186T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657473
chr9:17657477 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.45+78190C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657477
chr9:17657501 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0011
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NA18950.hp2
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c.45+78214T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657501
chr9:17657522 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0132
a0001c0001t0002g0133
a0001c0001t0002g0134
a0001c0001t0007g0143
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HG02165.hp2
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c.45+78235C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657522
chr9:17657559 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.45+78272A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657559
chr9:17657709 A
A
 G
G
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+78422A>G
c.45+78422A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657709
chr9:17657733 C
C
 CAG
CAG
 132 a0001c0001t0001g0006
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others(129): Show 
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HG00280.hp2
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NA19087.hp2
NA19240.hp1
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NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20805.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+78446_45+78447i
others(4): Show 
c.45+78446_45+78447insAG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657733
chr9:17657772 A
A
 C
C
 9 a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
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 9 HG01109.hp2
HG02572.hp2
HG02647.hp2
others(6): Show 
HG01109.hp2
HG02572.hp2
HG02647.hp2
HG02723.hp1
HG02895.hp1
HG02965.hp1
HG03130.hp2
NA18906.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+78485A>C
c.45+78485A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17657772
chr9:17657936 T
T
 C
C
 10 a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0186
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0223
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 10 HG01192.hp2
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others(7): Show 
HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG02257.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.45+78649T>C
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G
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a0001c0001t0002g0132
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NA19086.hp1
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G
 GTA
GTA
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A
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A
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HG01099.hp1
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c.45+79067G>A
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A
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c.45+79234G>A
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 T
T
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a0001c0001t0005g0036
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C
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HG03516.hp1
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c.45+79415A>G
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chr9:17658755 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.45+79468C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17658755
chr9:17658858 A
A
 T
T
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c.45+79571A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17658858
chr9:17658862 G
G
 A
A
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HG01192.hp2
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c.45+79575G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17658862
chr9:17658865 C
C
 T
T
 33 a0001c0001t0001g0015
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NA20905.hp1
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c.45+79578C>T
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chr9:17658903 C
C
 T
T
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c.45+79616C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17658903
chr9:17659126 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0125
 1 HG02040.hp1
HG02040.hp1
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c.45+79839G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659126
chr9:17659228 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0255
 1 HG02895.hp2
HG02895.hp2
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c.45+79941C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659228
chr9:17659237 C
C
 G
G
 11 a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0008g0158
 11 HG01109.hp2
HG02572.hp2
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others(8): Show 
HG01109.hp2
HG02572.hp2
HG02647.hp2
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NA20129.hp1
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c.45+79950C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659237
chr9:17659257 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
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c.45+79970A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659257
chr9:17659406 A
A
 T
T
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.45+80119A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659406
chr9:17659444 GGT
GGT
 G
G
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
 4 HG02622.hp2
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others(1): Show 
HG02622.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
NA20129.hp2
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others(4): Show 
c.45+80174_45+80175delGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17659444
chr9:17659530 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0234
 1 HG03579.hp1
HG03579.hp1
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c.45+80243A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659530
chr9:17659597 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
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 15 HG02055.hp2
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others(12): Show 
HG02055.hp2
HG02165.hp2
HG02258.hp1
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c.45+80310G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659597
chr9:17659610 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0072
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NA18953.hp1
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c.45+80323G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659610
chr9:17659684 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0175
 1 HG03654.hp1
HG03654.hp1
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c.45+80397T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659684
chr9:17659872 A
A
 G
G
 15 a0001c0001t0001g0020
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others(12): Show 
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a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
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a0001c0001t0001g0194
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a0001c0001t0002g0072
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a0001c0001t0002g0132
a0001c0001t0002g0133
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 15 HG02055.hp2
HG02165.hp2
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others(12): Show 
HG02055.hp2
HG02165.hp2
HG02258.hp1
HG02451.hp1
HG02976.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
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NA18953.hp1
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NA18968.hp2
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NA19012.hp1
NA19086.hp1
NA19088.hp2
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c.45+80585A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659872
chr9:17659911 G
G
 T
T
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a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
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c.45+80624G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17659911
chr9:17660130 T
T
 G
G
 1 a0001c0002t0013g0162
a0001c0002t0013g0162
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
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c.45+80843T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17660130
chr9:17660190 A
A
 G
G
 15 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
others(12): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0135
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 15 HG02055.hp2
HG02165.hp2
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others(12): Show 
HG02055.hp2
HG02165.hp2
HG02258.hp1
HG02451.hp1
HG02976.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
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NA18962.hp1
NA18968.hp2
NA18999.hp2
NA19012.hp1
NA19086.hp1
NA19088.hp2
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c.45+80903A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17660190
chr9:17660213 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0253
 1 HG03041.hp2
HG03041.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+80926G>A
c.45+80926G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17660213
chr9:17660229 CA
CA
 C
C
 43 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
others(40): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0159
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a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0132
a0001c0001t0002g0133
a0001c0001t0002g0134
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a0001c0001t0004g0193
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a0001c0001t0004g0230
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a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
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 43 HG01074.hp1
HG01109.hp2
HG01884.hp1
others(40): Show 
HG01074.hp1
HG01109.hp2
HG01884.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp2
HG02145.hp2
HG02165.hp2
HG02257.hp2
HG02258.hp1
HG02280.hp2
HG02451.hp1
HG02451.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02630.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp1
HG02809.hp1
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HG02965.hp1
HG02976.hp2
HG03098.hp1
HG03130.hp2
HG03139.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
NA18747.hp2
NA18906.hp1
NA18953.hp1
NA18962.hp1
NA18968.hp2
NA18999.hp2
NA19012.hp1
NA19086.hp1
NA19088.hp2
NA19240.hp2
NA20129.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+80943delA
c.45+80943delA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17660229
chr9:17660278 T
T
 G
G
 23 a0001c0001t0001g0015
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others(20): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0001g0089
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a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0175
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a0001c0001t0002g0102
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a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0002g0177
 23 HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(20): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG00673.hp2
HG01081.hp1
HG01099.hp1
HG01175.hp1
HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG02040.hp1
HG02148.hp2
HG02273.hp2
HG02300.hp1
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HG03704.hp2
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NA18939.hp1
NA18943.hp1
NA19074.hp1
NA20805.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+80991T>G
c.45+80991T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17660278
chr9:17660375 C
C
 G
G
 20 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
others(17): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0184
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A
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 C
C
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 T
T
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c.45+81125G>T
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C
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T
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c.45+81148C>T
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A
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C
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c.45+81243A>C
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C
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c.45+81274A>C
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c.45+81292A>G
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G
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C
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.45+81325G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17660612
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C
 T
T
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G
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A
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NA18966.hp2
NA18968.hp1
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NA18970.hp2
NA18971.hp2
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NA19240.hp1
NA20129.hp1
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NA20905.hp2
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c.45+82149A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17661436
chr9:17661673 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
 1 NA19240.hp2
NA19240.hp2
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c.45+82386G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17661673
chr9:17661765 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0007
 1 NA18977.hp1
NA18977.hp1
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c.45+82478C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17661765
chr9:17661806 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0243
 1 HG01109.hp2
HG01109.hp2
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c.45+82519C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17661806
chr9:17661814 AAACTTT
AAACTTT
 A
A
 9 a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0223
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0018g0216
 9 HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG02257.hp1
others(6): Show 
HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG02723.hp2
HG03098.hp2
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HG03540.hp1
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others(8): Show 
c.45+82537_45+82542delTTTAAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17661814
chr9:17661931 G
G
 C
C
 15 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0159
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others(12): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
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a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
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a0001c0001t0011g0257
a0001c0002t0005g0226
 15 HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp2
others(12): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp2
HG02280.hp2
HG02451.hp2
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NA19240.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+82644G>C
c.45+82644G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17661931
chr9:17661982 T
T
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+82695T>G
c.45+82695T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17661982
chr9:17662099 A
A
 G
G
 6 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0004g0148
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
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 6 HG01074.hp1
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others(3): Show 
HG01074.hp1
HG02145.hp2
HG02630.hp2
HG02717.hp1
HG03139.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+82812A>G
c.45+82812A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662099
chr9:17662183 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0007
 1 NA18977.hp1
NA18977.hp1
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c.45+82896T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662183
chr9:17662184 G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
 3 HG01074.hp1
HG03139.hp1
HG03486.hp2
HG01074.hp1
HG03139.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+82897G>T
c.45+82897G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662184
chr9:17662413 G
G
 A
A
 79 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
others(76): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
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a0001c0001t0001g0051
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a0001c0001t0002g0017
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 79 HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
others(76): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00408.hp2
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NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp2
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18950.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp2
NA18966.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18977.hp1
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18989.hp2
NA18991.hp1
NA18991.hp2
NA18994.hp2
NA19002.hp1
NA19002.hp2
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NA19010.hp1
NA19011.hp2
NA19030.hp1
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NA19064.hp2
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NA19077.hp2
NA19079.hp1
NA19079.hp2
NA19086.hp2
NA19087.hp2
NA19240.hp1
NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+83126G>A
c.45+83126G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662413
chr9:17662418 C
C
 T
T
 34 a0001c0001t0001g0015
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others(31): Show 
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a0001c0001t0001g0029
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 34 HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(31): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG01099.hp1
HG01175.hp1
HG01192.hp2
HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG02055.hp1
HG02148.hp2
HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
HG02523.hp2
HG02630.hp1
HG02723.hp2
HG02895.hp2
HG03098.hp2
HG03225.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp2
HG03516.hp1
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HG03654.hp1
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HG03704.hp2
HG03831.hp1
NA20805.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+83131C>T
c.45+83131C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662418
chr9:17662483 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0175
 1 HG03654.hp1
HG03654.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+83196C>T
c.45+83196C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662483
chr9:17662484 G
G
 A
A
 11 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
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a0001c0001t0007g0143
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HG03654.hp2
HG04184.hp1
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c.45+83197G>A
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0130
a0001c0001t0001g0130
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NA18977.hp2
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c.45+83373G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662660
chr9:17662692 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0156
a0001c0001t0002g0156
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HG01261.hp1
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c.45+83405T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662692
chr9:17662703 C
C
 CT
CT
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a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0074
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HG00609.hp2
HG01978.hp2
HG02074.hp1
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NA19077.hp1
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c.45+83439dupT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17662703
chr9:17662703 CT
CT
 C
C
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a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0107
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HG00408.hp2
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HG00323.hp2
HG00408.hp1
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c.45+83439delT
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chr9:17662703 CTT
CTT
 C
C
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
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a0001c0001t0002g0133
a0001c0001t0002g0134
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 120 HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00438.hp1
others(117): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00438.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+83438_45+83439d
others(4): Show 
c.45+83438_45+83439delTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17662703
chr9:17662703 CTTT
CTTT
 C
C
 36 a0001c0001t0001g0015
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others(33): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
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 36 HG00280.hp2
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HG00642.hp1
others(33): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
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NA19030.hp2
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.45+83437_45+83439d
others(5): Show 
c.45+83437_45+83439delTTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17662703
chr9:17662720 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0255
 2 HG02630.hp1
HG02895.hp2
HG02630.hp1
HG02895.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+83433T>C
c.45+83433T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662720
chr9:17662895 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0006g0221
 1 HG02622.hp2
HG02622.hp2
 intron_variant MODIFIER c.45+83608G>C
c.45+83608G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17662895
chr9:17662943 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0095
 1 HG01175.hp2
HG01175.hp2
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c.45+83656T>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0007g0165
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HG04228.hp2
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G
 A
A
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T
 G
G
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HG02647.hp2
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A
 G
G
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T
 G
G
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c.46-83697T>G
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A
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c.46-83678T>A
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HG02145.hp2
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c.46-83655A>G
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chr9:17663515 A
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G
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 T
T
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a0001c0001t0001g0040
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NA18942.hp2
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A
 C
C
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a0001c0001t0001g0040
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NA18942.hp2
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c.46-83383A>C
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A
 C
C
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a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-83359A>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0164
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HG03453.hp1
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c.46-83346G>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0130
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NA18977.hp2
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c.46-83311A>G
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G
 C
C
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c.46-83262G>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0054
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HG03654.hp2
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c.46-83200T>C
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 T
T
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a0001c0001t0001g0222
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C
 T
T
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others(110): Show 
HG00140.hp1
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NA18970.hp1
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NA18977.hp1
NA18986.hp1
NA18986.hp2
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0222
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HG02647.hp2
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c.46-82814A>G
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 T
T
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c.46-82813A>T
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GAAATA
 G
G
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HG02451.hp1
HG02976.hp2
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17664328
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C
 G
G
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c.46-82638C>G
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C
 G
G
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c.46-82636C>G
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T
 C
C
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NA19086.hp1
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c.46-82574T>C
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T
 C
C
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-82481T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17664585
chr9:17664610 C
C
 T
T
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a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
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c.46-82456C>T
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G
 T
T
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G
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C
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G
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HG03041.hp2
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A
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T
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A
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G
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A
 G
G
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T
 C
C
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a0001c0001t0008g0158
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HG03516.hp1
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C
 A
A
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c.46-82142C>A
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G
 T
T
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HG02040.hp1
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C
 G
G
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NA18906.hp2
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G
 A
A
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c.46-81782A>G
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G
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C
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c.46-81686G>C
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T
 C
C
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A
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c.46-81675C>A
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A
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a0001c0001t0002g0119
a0001c0002t0013g0162
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HG02145.hp2
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c.46-81539G>A
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 T
T
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a0001c0001t0002g0021
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HG03041.hp1
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0242
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HG02647.hp2
NA19030.hp2
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17665611
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G
 A
A
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c.46-81344G>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
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HG02809.hp1
HG03139.hp1
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0031
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HG03710.hp1
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A
 G
G
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HG01192.hp2
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T
 G
G
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HG02055.hp2
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HG02976.hp2
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c.46-80854T>G
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G
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HG02165.hp2
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c.46-80853C>G
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chr9:17666260 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-80806A>G
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chr9:17666276 C
C
 A
A
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a0001c0001t0001g0186
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HG02280.hp2
HG02809.hp1
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c.46-80790C>A
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A
 C
C
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a0001c0001t0001g0029
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HG00639.hp2
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c.46-80770A>C
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G
 T
T
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HG02559.hp2
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c.46-80702G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666364
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C
 CGT
CGT
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a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0032
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a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0175
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a0001c0001t0001g0190
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a0001c0001t0002g0062
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a0001c0001t0002g0103
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others(4): Show 
c.46-80488_46-80487dupGT
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chr9:17666545 C
C
 CGTGT
CGTGT
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a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0095
others(25): Show 
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a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0095
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a0001c0001t0002g0132
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others(25): Show 
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NA18999.hp2
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NA19088.hp2
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others(6): Show 
c.46-80490_46-80487dupGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666545
chr9:17666545 C
C
 CGTGTGT
CGTGTGT
 24 a0001c0001t0001g0006
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others(21): Show 
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a0001c0001t0001g0020
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NA19074.hp1
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-80492_46-80487d
others(8): Show 
c.46-80492_46-80487dupGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666545
chr9:17666545 C
C
 CGTGTGTG
others(1): Show 
CGTGTGTGT
 4 a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0002g0018
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0002g0018
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 4 HG00735.hp1
HG02257.hp1
NA18612.hp2
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HG00735.hp1
HG02257.hp1
NA18612.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-80494_46-80487d
others(10): Show 
c.46-80494_46-80487dupGTGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666545
chr9:17666545 C
C
 CGTGTGTG
others(3): Show 
CGTGTGTGTGT
 1 a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0141
 1 HG03669.hp2
HG03669.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-80496_46-80487d
others(12): Show 
c.46-80496_46-80487dupGTGTGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666545
chr9:17666545 CGT
CGT
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0173
a0001c0001t0001g0246
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0173
a0001c0001t0001g0246
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 4 HG02630.hp1
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HG02735.hp2
others(1): Show 
HG02630.hp1
HG02630.hp2
HG02735.hp2
HG03942.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-80488_46-80487d
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c.46-80488_46-80487delGT
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chr9:17666545 CGTGT
CGTGT
 C
C
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a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
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a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
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HG02055.hp1
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HG02258.hp2
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666545
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0108
a0001c0001t0002g0037
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c.46-80490G>A
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chr9:17666578 G
G
 A
A
 6 a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0108
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a0001c0001t0001g0108
a0001c0001t0002g0037
a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0138
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HG02148.hp1
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HG02027.hp1
HG02148.hp1
HG02273.hp1
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NA20300.hp2
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c.46-80488G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666578
chr9:17666578 G
G
 GTA
GTA
 3 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
 3 HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
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others(4): Show 
c.46-80483_46-80482dupTA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666578
chr9:17666578 G
G
 GTATA
GTATA
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a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0093
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a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0001g0252
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a0001c0001t0002g0031
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others(30): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
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HG01243.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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others(6): Show 
c.46-80485_46-80482dupTATA
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chr9:17666578 G
G
 GTGTA
GTGTA
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0002g0231
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others(7): Show 
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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others(6): Show 
c.46-80487_46-80486insGTAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666578
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G
 GTGTATA
GTGTATA
 42 a0001c0001t0001g0007
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others(39): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
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 42 HG00438.hp1
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others(39): Show 
HG00438.hp1
HG00558.hp1
HG00673.hp1
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others(8): Show 
c.46-80487_46-80486insGTATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666578
chr9:17666578 G
G
 GTGTGTAT
others(1): Show 
GTGTGTATA
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a0001c0001t0001g0034
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
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others(7): Show 
HG00408.hp1
HG00408.hp2
HG01255.hp2
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NA19064.hp2
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others(10): Show 
c.46-80487_46-80486insGTGTATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17666578
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A
 G
G
 33 a0001c0001t0001g0015
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a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
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others(30): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-80486A>G
c.46-80486A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666580
chr9:17666700 G
G
 A
A
 32 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
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others(29): Show 
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a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0164
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 32 HG00280.hp2
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NA20905.hp1
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c.46-80366G>A
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chr9:17666763 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0108
a0001c0001t0001g0108
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NA19079.hp1
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c.46-80303G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666763
chr9:17666787 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0173
a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0173
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HG02735.hp2
HG00323.hp2
HG02735.hp2
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c.46-80279G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666787
chr9:17666788 C
C
 T
T
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HG02280.hp1
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
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c.46-80278C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666788
chr9:17666813 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0093
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HG00140.hp1
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c.46-80253C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666813
chr9:17666893 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
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NA18948.hp1
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c.46-80173A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666893
chr9:17666958 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0023
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HG04199.hp2
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c.46-80108T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17666958
chr9:17667077 T
T
 C
C
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HG02145.hp2
HG02257.hp1
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c.46-79989T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17667077
chr9:17667128 T
T
 A
A
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a0001c0001t0001g0007
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others(159): Show 
HG00140.hp1
HG00280.hp2
HG00323.hp1
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HG00642.hp1
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HG01074.hp1
HG01081.hp1
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HG01109.hp2
HG01175.hp1
HG01175.hp2
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HG01243.hp1
HG01243.hp2
HG01255.hp2
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HG01261.hp1
HG01261.hp2
HG01358.hp2
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HG02109.hp2
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HG02148.hp2
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HG02165.hp2
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HG02257.hp2
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HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02280.hp2
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HG02572.hp2
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HG02630.hp1
HG02630.hp2
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HG02717.hp1
HG02723.hp1
HG02723.hp2
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HG02895.hp2
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HG03041.hp1
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HG03098.hp2
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HG03130.hp2
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03225.hp1
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HG03579.hp2
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HG03654.hp2
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HG03669.hp2
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NA20905.hp2
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c.46-79938T>A
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chr9:17667131 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-79935A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0236
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NA18968.hp1
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c.46-79871A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
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a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0011g0257
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 13 HG01884.hp1
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others(10): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp2
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c.46-79840C>G
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chr9:17667466 G
G
 C
C
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0014
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HG00609.hp1
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NA18994.hp1
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c.46-79600G>C
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chr9:17667477 A
A
 G
G
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-79589A>G
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G
 C
C
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
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a0001c0001t0001g0227
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HG02055.hp1
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c.46-79502G>C
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A
 G
G
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others(6): Show 
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0002g0119
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a0001c0001t0004g0189
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a0001c0001t0006g0214
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 9 HG01074.hp1
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others(6): Show 
HG01074.hp1
HG02145.hp2
HG02257.hp1
HG02280.hp2
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HG02809.hp1
HG03139.hp1
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c.46-79222A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17667844
chr9:17668151 G
G
 T
T
 7 a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0018g0216
 7 HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG02258.hp2
others(4): Show 
HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG02258.hp2
HG02723.hp2
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HG03225.hp1
HG03540.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-78915G>T
c.46-78915G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17668151
chr9:17668572 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0022
 1 HG04184.hp2
HG04184.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-78494T>G
c.46-78494T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17668572
chr9:17668603 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0246
 1 HG02630.hp1
HG02630.hp1
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c.46-78463C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17668603
chr9:17668641 G
G
 A
A
 110 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
others(107): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0058
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a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0001g0073
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a0001c0001t0001g0078
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a0001c0001t0001g0083
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a0001c0001t0001g0090
a0001c0001t0001g0093
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a0001c0001t0001g0100
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a0001c0001t0001g0106
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a0001c0001t0001g0108
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a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0114
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a0001c0001t0001g0126
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a0001c0001t0001g0140
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a0001c0001t0001g0183
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a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
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a0001c0001t0002g0245
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a0001c0001t0015g0041
a0001c0001t0016g0122
a0001c0001t0018g0216
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a0001c0003t0002g0010
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 110 HG00140.hp1
HG00280.hp2
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others(107): Show 
HG00140.hp1
HG00280.hp2
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00408.hp2
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HG00642.hp1
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HG02015.hp2
HG02027.hp1
HG02055.hp1
HG02056.hp2
HG02145.hp1
HG02148.hp1
HG02148.hp2
HG02165.hp1
HG02258.hp2
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02300.hp1
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HG02523.hp2
HG02630.hp1
HG02683.hp2
HG02723.hp2
HG02895.hp2
HG03017.hp1
HG03017.hp2
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HG03540.hp1
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HG03654.hp1
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HG03704.hp1
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HG03710.hp1
HG03831.hp1
HG03831.hp2
HG03942.hp1
HG06807.hp1
NA18612.hp1
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp2
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18950.hp2
NA18953.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp2
NA18966.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18977.hp1
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18989.hp2
NA18991.hp1
NA18991.hp2
NA18994.hp2
NA19002.hp1
NA19002.hp2
NA19009.hp1
NA19010.hp1
NA19011.hp2
NA19030.hp1
NA19064.hp1
NA19064.hp2
NA19074.hp2
NA19077.hp2
NA19079.hp1
NA19079.hp2
NA19086.hp2
NA19087.hp2
NA19240.hp1
NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20805.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-78297A>G
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T
 C
C
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C
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A
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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C
 T
T
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-78139G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0232
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NA18948.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-78006G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0203
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c.46-78002G>A
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 C
C
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others(1): Show 
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c.46-77988G>C
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0232
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NA18948.hp1
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 T
T
 17 a0001c0001t0001g0019
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HG01884.hp1
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c.46-77896G>T
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 A
A
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.46-77855G>A
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G
 C
C
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NA18977.hp2
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c.46-77855G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17669211
chr9:17669211 G
G
 T
T
 139 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
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others(136): Show 
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a0001c0001t0001g0007
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A
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G
 C
C
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a0001c0001t0001g0136
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T
 C
C
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG01175.hp2
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G
 C
C
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
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G
 A
A
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c.46-77122G>A
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0147
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NA18999.hp1
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c.46-76985C>A
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C
 G
G
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a0001c0001t0002g0072
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 6 NA18953.hp1
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NA18953.hp1
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c.46-76951C>G
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G
 C
C
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others(5): Show 
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c.46-76899G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670167
chr9:17670168 G
G
 A
A
 13 a0001c0001t0001g0019
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c.46-76898G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670168
chr9:17670270 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0128
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HG02300.hp2
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c.46-76796A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.46-76780C>A
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chr9:17670335 T
T
 C
C
 100 a0001c0001t0001g0006
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others(97): Show 
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a0001c0001t0001g0008
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c.46-76731T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670335
chr9:17670355 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0238
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HG01516.hp2
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c.46-76711C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670355
chr9:17670398 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0240
a0001c0001t0001g0240
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NA18989.hp2
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c.46-76668T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670398
chr9:17670402 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
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NA18948.hp1
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c.46-76664T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670402
chr9:17670643 T
T
 C
C
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a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
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HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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c.46-76423T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670643
chr9:17670674 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
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NA18948.hp1
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c.46-76392T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670674
chr9:17670808 G
G
 T
T
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others(6): Show 
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
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HG01109.hp2
HG02572.hp2
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c.46-76258G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670808
chr9:17670849 A
A
 C
C
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a0001c0001t0007g0165
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HG04228.hp2
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c.46-76217A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670849
chr9:17670884 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
 1 NA18948.hp1
NA18948.hp1
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c.46-76182T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670884
chr9:17670941 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
 1 NA18948.hp1
NA18948.hp1
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c.46-76125T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670941
chr9:17670964 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0087
a0001c0001t0001g0087
 1 NA18961.hp1
NA18961.hp1
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c.46-76102A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17670964
chr9:17671020 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-76046G>A
c.46-76046G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17671020
chr9:17671142 T
T
 C
C
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a0001c0002t0013g0162
a0001c0001t0002g0119
a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
HG02145.hp2
HG02630.hp2
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c.46-75924T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17671142
chr9:17671214 ATTTAATC
ATTTAATC
 A
A
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others(5): Show 
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HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG02723.hp2
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HG03225.hp1
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others(9): Show 
c.46-75845_46-75839delCTTTAAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17671214
chr9:17671302 AT
AT
 A
A
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others(75): Show 
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a0001c0001t0001g0008
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HG00323.hp1
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T
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C
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G
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T
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c.46-75600G>T
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c.46-75517G>T
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A
 C
C
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HG02257.hp2
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 G
G
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0232
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0119
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0014
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NA18994.hp1
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T
 C
C
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C
 A
A
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NA20905.hp2
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G
 C
C
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A
 G
G
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 T
T
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A
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c.46-74787G>A
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T
 A
A
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HG03225.hp2
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c.46-74743T>A
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G
 A
A
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C
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G
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C
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G
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G
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HG01243.hp1
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c.46-74351A>G
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 G
G
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NA19030.hp1
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C
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A
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HG03130.hp1
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C
 T
T
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 C
C
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A
 C
C
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C
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G
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HG03130.hp1
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c.46-74017C>T
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G
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T
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NA18971.hp2
NA18970.hp2
NA18971.hp2
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c.46-74000G>T
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T
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C
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-73921T>C
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0234
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HG03579.hp1
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c.46-73919T>G
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G
 T
T
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a0001c0001t0008g0253
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HG02523.hp1
HG03041.hp2
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c.46-73915G>T
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A
 AT
AT
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c.46-73732dupT
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chr9:17673318 A
A
 ATT
ATT
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G
 C
C
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c.46-73728G>C
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 T
T
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0202
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HG02647.hp1
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c.46-73557A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0095
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HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-73546A>G
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 A
A
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c.46-73463G>A
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 C
C
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C
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T
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A
 C
C
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A
 G
G
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 A
A
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c.46-72955A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0002g0231
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HG02257.hp2
HG02572.hp1
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c.46-72757C>A
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chr9:17674309 C
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G
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c.46-72680C>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
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NA18612.hp2
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c.46-72620T>C
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chr9:17674458 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-72608G>T
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chr9:17674474 C
C
 T
T
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A
 G
G
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c.46-72561A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0015g0041
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NA18986.hp1
NA18944.hp1
NA18986.hp1
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c.46-72377G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0093
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HG00140.hp1
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c.46-72204G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17674862
chr9:17674874 G
G
 A
A
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c.46-72192G>A
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HG00323.hp1
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T
 A
A
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HG00673.hp1
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C
 T
T
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C
 T
T
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T
 C
C
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T
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c.46-71743C>T
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A
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C
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a0001c0001t0001g0089
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NA18943.hp1
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c.46-71649A>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0005g0036
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NA18975.hp2
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c.46-71564C>T
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G
 T
T
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NA18962.hp2
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c.46-71548G>T
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 A
A
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 C
C
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NA20752.hp1
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 A
A
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HG02280.hp1
HG03516.hp2
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c.46-71397G>A
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A
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G
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C
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A
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G
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T
 C
C
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C
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c.46-71178T>C
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 A
A
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T
 G
G
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 A
A
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c.46-71013G>A
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G
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c.46-70921A>G
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C
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T
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A
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C
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A
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 T
T
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HG03139.hp1
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C
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HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-70116A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17676950
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 T
T
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a0001c0001t0001g0254
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HG03225.hp2
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 A
A
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NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18977.hp1
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c.46-70047G>A
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 G
G
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a0001c0001t0004g0255
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HG02630.hp1
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C
 G
G
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HG03139.hp2
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G
 A
A
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 A
A
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c.46-69884delT
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T
 A
A
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-69818T>A
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G
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c.46-69735A>G
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G
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T
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c.46-69719G>T
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C
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T
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A
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-69694G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17677372
chr9:17677376 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0056
 1 NA18968.hp2
NA18968.hp2
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c.46-69690A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17677376
chr9:17677421 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
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c.46-69645G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17677421
chr9:17677479 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0123
 1 NA18942.hp1
NA18942.hp1
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c.46-69587C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17677479
chr9:17677525 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0010g0218
 1 HG03130.hp1
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-69541A>G
c.46-69541A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17677525
chr9:17677559 T
T
 C
C
 1 a0001c0002t0013g0162
a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-69507T>C
c.46-69507T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17677559
chr9:17677584 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0166
 1 HG01243.hp1
HG01243.hp1
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c.46-69482C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17677584
chr9:17677624 G
G
 GTA
GTA
 17 a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0185
others(14): Show 
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0242
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 17 HG01109.hp2
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others(14): Show 
HG01109.hp2
HG01175.hp2
HG02055.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-69424_46-69423d
others(4): Show 
c.46-69424_46-69423dupAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17677624
chr9:17677624 G
G
 GTATA
GTATA
 10 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0124
a0001c0001t0001g0192
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0124
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0011g0257
 10 HG00609.hp1
HG02257.hp2
HG02559.hp2
others(7): Show 
HG00609.hp1
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
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NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-69426_46-69423d
others(6): Show 
c.46-69426_46-69423dupATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17677624
chr9:17677624 G
G
 GTATATAT
others(1): Show 
GTATATATA
 4 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0002t0005g0226
 4 HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
others(1): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-69430_46-69423d
others(10): Show 
c.46-69430_46-69423dupATATATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17677624
chr9:17677624 GTA
GTA
 G
G
 15 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
others(12): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0132
a0001c0001t0002g0133
a0001c0001t0002g0134
a0001c0001t0004g0189
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a0001c0001t0007g0143
a0001c0002t0013g0162
 15 HG02165.hp2
HG02258.hp1
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others(12): Show 
HG02165.hp2
HG02258.hp1
HG02280.hp2
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NA19088.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-69424_46-69423d
others(4): Show 
c.46-69424_46-69423delAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17677624
chr9:17677624 GTATA
GTATA
 G
G
 36 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
others(33): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0025
a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0062
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a0001c0001t0002g0118
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 36 HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(33): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01074.hp1
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HG01099.hp1
HG01175.hp1
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HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG02055.hp1
HG02145.hp2
HG02148.hp2
HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
HG02523.hp2
HG02630.hp1
HG02723.hp2
HG02895.hp2
HG03098.hp2
HG03225.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp2
HG03486.hp2
HG03516.hp2
HG03540.hp1
HG03579.hp2
HG03654.hp1
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HG03704.hp2
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-69426_46-69423d
others(6): Show 
c.46-69426_46-69423delATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17677624
chr9:17677674 C
C
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-69392C>A
c.46-69392C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17677674
chr9:17677725 A
A
 G
G
 92 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
others(89): Show 
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0027
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a0001c0001t0001g0034
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a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0071
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c.46-69341A>G
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T
 TC
TC
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c.46-69280dupC
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C
 G
G
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a0001c0001t0006g0215
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HG01192.hp2
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c.46-69283C>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0237
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HG01361.hp2
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c.46-69210A>G
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A
 C
C
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a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
HG03486.hp2
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c.46-69088A>C
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G
 A
A
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c.46-69067G>A
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C
 G
G
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NA20905.hp1
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c.46-69044C>G
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A
 T
T
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a0001c0001t0008g0158
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HG03516.hp1
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c.46-69031A>T
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T
 G
G
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HG00280.hp2
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c.46-68905T>G
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T
 C
C
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c.46-68898T>C
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chr9:17678205 G
G
 A
A
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HG03098.hp1
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c.46-68861G>A
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 T
T
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others(49): Show 
HG00280.hp2
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c.46-68852A>T
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C
 T
T
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c.46-68803C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0006g0214
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HG02809.hp1
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c.46-68751A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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c.46-68745G>A
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 C
C
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c.46-68699G>C
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 C
C
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c.46-68684T>C
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T
 C
C
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HG02109.hp2
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c.46-68618T>C
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C
 G
G
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.46-68609C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17678457
chr9:17678551 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0183
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c.46-68515A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17678551
chr9:17678562 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0034
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HG02056.hp2
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c.46-68504G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17678562
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G
 A
A
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HG03486.hp2
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c.46-68488G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17678578
chr9:17678625 C
C
 G
G
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HG01074.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.46-68441C>G
c.46-68441C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17678625
chr9:17678626 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0095
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HG01175.hp2
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c.46-68440T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17678626
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A
 G
G
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others(8): Show 
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HG00642.hp2
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c.46-68320A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0034
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HG02056.hp2
NA19086.hp2
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c.46-68308G>A
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T
 A
A
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a0001c0001t0001g0168
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HG03942.hp2
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chr9:17678829 T
T
 C
C
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a0001c0001t0002g0127
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HG01099.hp1
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0127
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HG01099.hp1
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T
 G
G
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a0001c0002t0005g0226
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HG03098.hp1
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C
 G
G
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c.46-68222C>G
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T
 C
C
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c.46-68190T>C
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 T
T
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c.46-68180G>T
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G
 A
A
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c.46-68118G>A
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G
 A
A
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c.46-68090G>A
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 T
T
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c.46-68063G>T
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T
 A
A
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a0001c0001t0001g0232
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NA18948.hp1
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c.46-68056T>A
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 A
A
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c.46-68027G>A
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chr9:17679051 G
G
 C
C
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a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0242
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NA19030.hp2
HG02647.hp2
NA19030.hp2
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c.46-68015G>C
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T
 C
C
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HG02630.hp2
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HG02280.hp2
HG02630.hp2
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c.46-68003T>C
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C
 A
A
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a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
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HG02280.hp2
HG02809.hp1
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c.46-67982C>A
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A
 T
T
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HG03130.hp1
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c.46-67965A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679101
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0030
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HG02559.hp2
HG00639.hp2
HG02559.hp2
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c.46-67958A>G
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A
 G
G
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HG03017.hp1
HG03017.hp2
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NA18962.hp2
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NA18970.hp2
NA18971.hp2
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NA19064.hp2
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c.46-67879A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679187
chr9:17679212 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0008g0158
 1 HG03516.hp1
HG03516.hp1
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c.46-67854T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679212
chr9:17679224 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
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c.46-67842G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679224
chr9:17679270 A
A
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
a0001c0002t0013g0162
 4 HG02280.hp2
HG02630.hp2
HG02809.hp1
others(1): Show 
HG02280.hp2
HG02630.hp2
HG02809.hp1
HG03139.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-67796A>C
c.46-67796A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679270
chr9:17679354 T
T
 A
A
 3 a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
 3 NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA19010.hp2
NA18612.hp2
NA18948.hp2
NA19010.hp2
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c.46-67712T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679354
chr9:17679437 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0193
 1 HG02559.hp2
HG02559.hp2
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c.46-67629T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679437
chr9:17679441 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0193
 1 HG02559.hp2
HG02559.hp2
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c.46-67625C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679441
chr9:17679479 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0095
 1 HG01175.hp2
HG01175.hp2
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c.46-67587G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679479
chr9:17679484 C
C
 G
G
 14 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0184
others(11): Show 
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0223
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a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
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 14 HG02055.hp1
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others(11): Show 
HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02258.hp2
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c.46-67582C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679484
chr9:17679500 C
C
 G
G
 11 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
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others(8): Show 
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0142
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a0001c0001t0002g0133
a0001c0001t0002g0134
a0001c0001t0007g0143
 11 HG02165.hp2
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others(8): Show 
HG02165.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
NA18747.hp2
NA18953.hp1
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NA18999.hp2
NA19012.hp1
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NA19088.hp2
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c.46-67566C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679500
chr9:17679553 A
A
 G
G
 90 a0001c0001t0001g0007
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a0001c0001t0001g0011
others(87): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
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a0002c0004t0003g0111
 90 HG00140.hp1
HG00323.hp1
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others(87): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00408.hp2
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HG02165.hp1
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HG03516.hp1
HG03579.hp1
HG03669.hp1
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HG03942.hp1
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NA18612.hp1
NA18906.hp1
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp2
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18950.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp2
NA18966.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18977.hp1
NA18986.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18989.hp2
NA18991.hp1
NA18991.hp2
NA18994.hp2
NA19002.hp1
NA19002.hp2
NA19009.hp1
NA19010.hp1
NA19011.hp2
NA19030.hp1
NA19064.hp1
NA19064.hp2
NA19074.hp2
NA19077.hp2
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NA19079.hp2
NA19086.hp2
NA19087.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-67513A>G
c.46-67513A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679553
chr9:17679595 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
 1 NA18948.hp1
NA18948.hp1
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c.46-67471C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679595
chr9:17679689 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0029
 1 NA20805.hp1
NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-67377G>A
c.46-67377G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679689
chr9:17679695 T
T
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
 2 HG01074.hp1
HG03486.hp2
HG01074.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-67371T>G
c.46-67371T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679695
chr9:17679705 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0020g0211
 2 HG02280.hp1
HG03516.hp2
HG02280.hp1
HG03516.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-67361C>T
c.46-67361C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679705
chr9:17679706 G
G
 A
A
 7 a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0223
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0018g0216
 7 HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02258.hp2
others(4): Show 
HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02258.hp2
HG02723.hp2
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HG03225.hp1
HG03540.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-67360G>A
c.46-67360G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17679706
chr9:17679706 G
G
 C
C
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a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-67360G>C
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chr9:17679715 A
A
 G
G
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-67351A>G
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G
 T
T
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a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
HG03486.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0207
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HG03516.hp2
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c.46-67263A>G
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G
 C
C
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a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
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c.46-67227G>C
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C
 A
A
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c.46-67190C>A
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 C
C
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c.46-67125G>C
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C
 T
T
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others(10): Show 
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HG02109.hp2
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c.46-67053C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680013
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T
 C
C
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 33 HG00280.hp2
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others(30): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-66972T>C
c.46-66972T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680094
chr9:17680114 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0004g0198
 1 HG02109.hp1
HG02109.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-66952G>T
c.46-66952G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680114
chr9:17680144 A
A
 C
C
 3 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0185
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a0001c0001t0001g0249
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HG02451.hp1
HG02976.hp2
HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-66922A>C
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C
 G
G
 18 a0001c0001t0001g0015
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c.46-66883C>G
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A
 T
T
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HG02257.hp1
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c.46-66870A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680196
chr9:17680200 A
A
 C
C
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NA20905.hp1
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c.46-66866A>C
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chr9:17680378 A
A
 G
G
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.46-66688A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680378
chr9:17680395 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0104
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HG01358.hp2
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c.46-66671A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680395
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T
 C
C
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others(15): Show 
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a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
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a0001c0001t0002g0167
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HG00280.hp2
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
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c.46-66601T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680465
chr9:17680498 C
C
 T
T
 45 a0001c0001t0001g0015
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others(42): Show 
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a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0025
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a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0062
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a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
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a0001c0001t0002g0134
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a0001c0001t0002g0177
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a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0021g0258
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HG00639.hp2
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others(42): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
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HG02258.hp2
HG02273.hp2
HG02280.hp1
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HG02630.hp1
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HG03225.hp1
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NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-66568C>T
c.46-66568C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680498
chr9:17680503 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0021g0258
 1 HG03579.hp2
HG03579.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-66563A>G
c.46-66563A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680503
chr9:17680554 A
A
 G
G
 15 a0001c0001t0001g0020
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others(12): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
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a0001c0001t0001g0135
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a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0132
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HG02165.hp2
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others(12): Show 
HG02055.hp2
HG02165.hp2
HG02258.hp1
HG02451.hp1
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HG03654.hp2
HG04184.hp1
NA18747.hp2
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NA18962.hp1
NA18968.hp2
NA18999.hp2
NA19012.hp1
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NA19088.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-66512A>G
c.46-66512A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680554
chr9:17680583 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0215
 1 HG01192.hp2
HG01192.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-66483C>T
c.46-66483C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17680583
chr9:17680596 A
A
 AT
AT
 13 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0159
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others(10): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0159
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a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0192
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 13 HG01884.hp1
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HG02257.hp2
others(10): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp2
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HG02572.hp1
HG02622.hp2
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HG03139.hp2
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HG03486.hp1
NA19240.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-66464dupT
c.46-66464dupT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17680596
chr9:17680752 C
C
 T
T
 33 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
others(30): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0170
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a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0223
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a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0025
a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0092
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0018g0216
a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0021g0258
 33 HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(30): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG01099.hp1
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c.46-66314C>T
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T
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c.46-66305G>T
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C
 T
T
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c.46-66199C>T
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GTGTA
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c.46-66075C>G
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chr9:17681017 T
T
 C
C
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c.46-66049T>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
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c.46-65993G>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.46-65857A>G
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G
 A
A
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NA20905.hp1
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c.46-65787G>A
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T
 G
G
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a0001c0001t0004g0198
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HG02109.hp1
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c.46-65699T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17681367
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
HG02630.hp1
HG02895.hp2
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c.46-65692C>T
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chr9:17681380 C
C
 G
G
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a0001c0001t0009g0009
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others(1): Show 
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a0001c0001t0009g0009
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others(1): Show 
HG02145.hp1
HG06807.hp1
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c.46-65686C>G
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C
 T
T
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HG00280.hp2
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HG02723.hp2
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HG03225.hp1
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HG03516.hp2
HG03540.hp1
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HG03669.hp2
HG03704.hp2
HG03831.hp1
NA20805.hp1
NA20905.hp1
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c.46-65659C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17681407
chr9:17681528 C
C
 G
G
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.46-65538C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17681528
chr9:17681543 A
A
 G
G
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others(1): Show 
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a0001c0001t0004g0189
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others(1): Show 
HG02280.hp2
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c.46-65523A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17681543
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G
 T
T
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others(8): Show 
HG02165.hp2
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NA19088.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-65506G>T
c.46-65506G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17681560
chr9:17681578 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0242
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-65488A>G
c.46-65488A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17681578
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TCAAGA
 T
T
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others(30): Show 
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a0001c0001t0001g0029
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C
 G
G
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a0001c0001t0002g0018
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HG00735.hp1
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G
 T
T
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c.46-65391G>T
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A
 G
G
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HG02258.hp1
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c.46-65343A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.46-65295C>A
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C
 T
T
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HG02622.hp2
HG03453.hp2
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c.46-65198C>T
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A
 T
T
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NA19074.hp1
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17681888
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 G
G
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HG01192.hp2
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 T
T
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HG02145.hp2
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c.46-65111C>T
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 A
A
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A
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 G
G
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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C
 G
G
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 T
T
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A
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G
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HG01243.hp1
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C
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A
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c.46-64746C>A
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 G
G
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a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0002g0241
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HG00438.hp2
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c.46-64705A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0108
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NA19079.hp1
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c.46-64691A>G
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0068
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HG02015.hp1
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c.46-64685G>A
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G
 T
T
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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G
 C
C
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NA20905.hp1
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c.46-64490G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0251
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
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c.46-64476G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682590
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C
 T
T
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-64437C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682629
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T
 TA
TA
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a0001c0001t0001g0160
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HG02109.hp2
HG02451.hp2
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c.46-64369dupA
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chr9:17682683 TA
TA
 T
T
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a0001c0001t0001g0020
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HG00639.hp2
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NA20905.hp1
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c.46-64369delA
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chr9:17682694 A
A
 G
G
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a0001c0001t0004g0174
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HG02886.hp1
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c.46-64372A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0049
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NA19012.hp2
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c.46-64348G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682718
chr9:17682723 C
C
 A
A
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-64343C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682723
chr9:17682778 A
A
 G
G
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-64288A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682778
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0102
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HG00280.hp2
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c.46-64199C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682867
chr9:17682907 C
C
 G
G
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a0001c0001t0003g0237
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HG01361.hp2
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c.46-64159C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682907
chr9:17682992 A
A
 G
G
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-64074A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682992
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
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HG02451.hp1
HG02976.hp2
HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-64073T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17682993
chr9:17683042 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-64024A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17683042
chr9:17683057 A
A
 C
C
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a0001c0001t0001g0184
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others(2): Show 
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a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0207
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others(2): Show 
HG02280.hp1
HG03453.hp1
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c.46-64009A>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0029
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NA20805.hp1
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c.46-63940T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17683126
chr9:17683243 G
G
 T
T
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a0001c0001t0006g0214
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HG02809.hp1
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c.46-63823G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17683243
chr9:17683306 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0152
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HG01192.hp1
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c.46-63760A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17683306
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C
 T
T
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others(30): Show 
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a0001c0001t0001g0020
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others(30): Show 
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HG00639.hp2
HG00642.hp1
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HG03225.hp1
HG03453.hp1
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HG03516.hp2
HG03540.hp1
HG03579.hp2
HG03654.hp1
HG03669.hp2
HG03704.hp2
HG03831.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-63696C>T
c.46-63696C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17683370
chr9:17683386 C
C
 T
T
 14 a0001c0001t0001g0164
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others(11): Show 
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0184
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a0001c0001t0001g0224
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a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0018g0216
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 14 HG02055.hp1
HG02257.hp1
HG02258.hp2
others(11): Show 
HG02055.hp1
HG02257.hp1
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HG02280.hp1
HG02630.hp1
HG02723.hp2
HG02895.hp2
HG03098.hp2
HG03225.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp2
HG03516.hp2
HG03540.hp1
HG03579.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-63680C>T
c.46-63680C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17683386
chr9:17683423 C
C
 T
T
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a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
 2 HG01074.hp1
HG03486.hp2
HG01074.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-63643C>T
c.46-63643C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17683423
chr9:17683491 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0125
 1 HG02040.hp1
HG02040.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-63575C>T
c.46-63575C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17683491
chr9:17683497 C
C
 G
G
 163 a0001c0001t0001g0006
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c.46-63569C>G
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AG
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C
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T
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HG01175.hp2
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 C
C
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A
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HG03516.hp1
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C
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G
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HG02717.hp1
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c.46-63327C>G
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G
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C
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c.46-63311G>C
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A
 G
G
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HG03041.hp2
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c.46-63104A>G
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chr9:17684170 T
T
 C
C
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a0001c0001t0005g0050
 1 HG00408.hp1
HG00408.hp1
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c.46-62896T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684170
chr9:17684272 G
G
 C
C
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HG03654.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0087
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NA18961.hp1
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c.46-62764G>A
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chr9:17684437 G
G
 A
A
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HG00639.hp2
HG00642.hp1
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c.46-62629G>A
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chr9:17684459 G
G
 A
A
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HG01884.hp1
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c.46-62607G>A
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C
 T
T
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HG03017.hp2
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c.46-62422C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684644
chr9:17684663 C
C
 T
T
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HG03130.hp1
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c.46-62403C>T
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chr9:17684786 G
G
 C
C
 46 a0001c0001t0001g0006
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others(43): Show 
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 46 HG00140.hp1
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others(43): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
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NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-62280G>C
c.46-62280G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684786
chr9:17684795 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0038
 1 HG00609.hp2
HG00609.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-62271G>C
c.46-62271G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684795
chr9:17684820 A
A
 C
C
 26 a0001c0001t0001g0008
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others(23): Show 
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a0001c0001t0001g0040
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 26 HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
others(23): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
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HG03041.hp1
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NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19064.hp2
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-62246A>C
c.46-62246A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684820
chr9:17684824 C
C
 A
A
 11 a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0203
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a0001c0001t0001g0210
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a0001c0001t0001g0252
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 11 HG01109.hp2
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others(8): Show 
HG01109.hp2
HG02572.hp2
HG02647.hp2
HG02723.hp1
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NA18906.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-62242C>A
c.46-62242C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684824
chr9:17684841 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0020g0211
 2 HG02280.hp1
HG03516.hp2
HG02280.hp1
HG03516.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-62225A>G
c.46-62225A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684841
chr9:17684867 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0148
 1 HG02717.hp1
HG02717.hp1
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c.46-62199A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684867
chr9:17684908 A
A
 G
G
 11 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
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a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
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a0001c0001t0002g0134
a0001c0001t0007g0143
 11 HG02165.hp2
HG03654.hp2
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others(8): Show 
HG02165.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
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c.46-62158A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684908
chr9:17684943 T
T
 C
C
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a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0011g0256
 3 HG01074.hp1
HG02717.hp1
HG03486.hp2
HG01074.hp1
HG02717.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-62123T>C
c.46-62123T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17684943
chr9:17685027 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
 1 NA18948.hp1
NA18948.hp1
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c.46-62039T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685027
chr9:17685029 A
A
 G
G
 56 a0001c0001t0001g0015
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a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
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others(53): Show 
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HG00639.hp2
HG00642.hp1
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NA20129.hp2
NA20805.hp1
NA20905.hp1
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c.46-62037A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685029
chr9:17685145 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0003g0237
a0001c0001t0003g0237
 1 HG01361.hp2
HG01361.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-61921G>C
c.46-61921G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685145
chr9:17685171 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0125
 2 HG00609.hp2
HG02040.hp1
HG00609.hp2
HG02040.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-61895A>C
c.46-61895A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685171
chr9:17685178 C
C
 G
G
 13 a0001c0001t0001g0095
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others(10): Show 
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a0001c0001t0001g0188
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 13 HG01109.hp2
HG01175.hp2
HG02572.hp2
others(10): Show 
HG01109.hp2
HG01175.hp2
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HG02647.hp2
HG02723.hp1
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HG02965.hp1
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HG03130.hp2
HG03516.hp1
HG03579.hp1
NA18906.hp1
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-61888C>G
c.46-61888C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685178
chr9:17685213 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0164
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-61853C>T
c.46-61853C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685213
chr9:17685289 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0095
 1 HG01175.hp2
HG01175.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-61777C>G
c.46-61777C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685289
chr9:17685292 G
G
 C
C
 9 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0192
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others(6): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
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 9 HG01192.hp2
HG02257.hp2
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others(6): Show 
HG01192.hp2
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02622.hp2
HG03139.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-61774G>C
c.46-61774G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685292
chr9:17685302 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-61764C>G
c.46-61764C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685302
chr9:17685331 G
G
 C
C
 8 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0002g0231
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0011g0257
 8 HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
others(5): Show 
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02622.hp2
HG03139.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-61735G>C
c.46-61735G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685331
chr9:17685390 C
C
 G
G
 18 a0001c0001t0001g0163
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others(15): Show 
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
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a0001c0001t0002g0202
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a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0008g0196
 18 HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG01884.hp2
others(15): Show 
HG01109.hp1
HG01433.hp2
HG01884.hp2
HG02109.hp1
HG02559.hp1
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HG02647.hp1
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HG02717.hp2
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HG02976.hp1
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HG03195.hp2
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HG03540.hp2
NA18906.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-61676C>G
c.46-61676C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17685390
chr9:17685419 A
A
 C
C
 95 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
others(92): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0053
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C
 G
G
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NA18989.hp1
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c.46-61624C>G
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 A
A
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HG03139.hp1
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c.46-61332G>A
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A
 G
G
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HG01243.hp1
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c.46-61306A>G
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 T
T
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HG00558.hp2
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 A
A
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c.46-61297G>A
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A
 T
T
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.46-61265A>T
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G
 C
C
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NA18971.hp1
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c.46-61253G>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0004
a0001c0001t0002g0005
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NA19009.hp2
NA18972.hp1
NA19009.hp2
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A
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C
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HG01243.hp2
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T
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G
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HG02165.hp1
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c.46-61076T>G
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C
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HG00323.hp1
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c.46-61052A>C
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T
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c.46-61041A>T
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C
 T
T
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HG02257.hp2
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c.46-61025C>T
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G
 T
T
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a0001c0001t0008g0158
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HG03516.hp1
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c.46-60990G>T
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 GAAAA
GAAAA
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A
 G
G
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a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
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c.46-60963A>G
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G
 A
A
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HG01884.hp1
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HG02280.hp2
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c.46-60941G>A
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A
 G
G
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a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
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c.46-60891A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0002g0195
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HG03540.hp2
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c.46-60887C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17686179
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
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others(113): Show 
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c.46-60866A>G
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G
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HG03654.hp2
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c.46-60822A>G
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C
 T
T
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G
 C
C
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c.46-60807G>C
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 A
A
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 A
A
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a0001c0001t0001g0185
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
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c.46-60783G>A
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T
 G
G
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a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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c.46-60772T>G
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 A
A
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NA20905.hp1
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c.46-60694T>A
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G
 A
A
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HG01175.hp2
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c.46-60692G>A
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 A
A
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HG01175.hp2
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c.46-60686G>A
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 T
T
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a0001c0001t0001g0175
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HG03654.hp1
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c.46-60674G>T
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G
 T
T
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HG01175.hp2
HG02683.hp2
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c.46-60614G>T
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
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HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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c.46-60562G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17686504
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T
 C
C
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HG00280.hp2
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c.46-60559T>C
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 T
T
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a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0062
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a0001c0001t0002g0102
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a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0167
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others(15): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
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HG03831.hp1
NA20805.hp1
NA20905.hp1
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c.46-60555C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.46-60529C>T
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chr9:17686553 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0246
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HG02630.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-60513T>C
c.46-60513T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17686553
chr9:17686660 AT
AT
 A
A
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c.46-60115dupA
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A
 C
C
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.46-60090A>C
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chr9:17687153 C
C
 T
T
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HG02257.hp2
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c.46-59913C>T
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C
 G
G
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a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0239
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HG03041.hp1
HG01255.hp2
HG03041.hp1
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c.46-59870C>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0149
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HG00639.hp1
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c.46-59850A>G
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T
 A
A
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HG00280.hp2
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c.46-59848T>A
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
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others(124): Show 
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c.46-59834A>G
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A
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HG03041.hp2
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c.46-59801C>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0230
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HG02572.hp1
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c.46-59782G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
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HG02451.hp1
HG02976.hp2
HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-59776G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17687290
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-59652G>A
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G
 A
A
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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G
 C
C
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c.46-59640G>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0232
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CTGAT
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0154
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HG03704.hp1
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c.46-59565A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17687501
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A
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A
 G
G
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c.46-59534A>G
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G
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A
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c.46-59315G>A
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A
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NA18962.hp2
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c.46-59289G>A
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0164
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HG03453.hp1
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c.46-59285C>G
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A
 G
G
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HG03516.hp2
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c.46-59249A>G
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 T
T
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 T
T
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C
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A
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C
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c.46-58964T>C
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C
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A
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A
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c.46-58422G>A
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T
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C
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C
 A
A
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C
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T
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c.46-58048C>T
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C
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c.46-58017T>C
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A
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a0001c0001t0001g0175
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HG03654.hp1
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c.46-58014G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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C
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T
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NA18999.hp2
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c.46-57931C>T
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C
 T
T
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G
 A
A
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C
 A
A
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G
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c.46-57703A>G
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chr9:17689371 A
A
 C
C
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-57695A>C
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C
 A
A
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NA18986.hp2
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G
 A
A
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C
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C
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NA18972.hp2
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 G
G
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HG02056.hp1
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 A
A
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A
 G
G
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HG02630.hp1
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T
 C
C
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C
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T
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G
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c.46-56677G>A
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C
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A
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HG02647.hp2
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A
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c.46-55783C>T
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c.46-55696G>T
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chr9:17691385 T
T
 A
A
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.46-55681T>A
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chr9:17691413 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0001g0154
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HG03704.hp1
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c.46-55653A>G
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chr9:17691435 C
C
 T
T
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HG01071.hp2
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C
 T
T
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0003
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HG02523.hp2
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A
 C
C
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NA18968.hp1
NA18939.hp2
NA18968.hp1
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17691499
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A
 T
T
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A
 G
G
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c.46-55466A>G
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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C
 T
T
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HG02622.hp2
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HG03486.hp1
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c.46-55220C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17691846
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G
 A
A
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NA20752.hp1
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c.46-55218G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17691848
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G
 C
C
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a0001c0001t0008g0158
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HG03516.hp1
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A
 G
G
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HG02145.hp2
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c.46-55053A>G
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A
 G
G
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NA19088.hp1
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CT
 C
C
 162 a0001c0001t0001g0006
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a0001c0001t0001g0066
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c.46-54774delT
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c.46-54738A>G
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C
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c.46-54450G>C
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C
 CA
CA
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c.46-54412dupA
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chr9:17692643 C
C
 CAA
CAA
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others(111): Show 
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others(4): Show 
c.46-54413_46-54412dupAA
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G
 C
C
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HG02559.hp2
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c.46-54377G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17692689
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G
 C
C
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a0001c0001t0001g0007
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NA18977.hp1
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c.46-54288G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17692778
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A
 G
G
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.46-54285A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17692781
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A
 T
T
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a0001c0001t0001g0203
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a0001c0001t0001g0244
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c.46-54220A>T
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 G
G
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HG01884.hp1
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c.46-54166A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17692900
chr9:17692971 G
G
 C
C
 18 a0001c0001t0001g0015
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c.46-54095G>C
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chr9:17692995 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0001g0254
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HG03225.hp2
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c.46-54071C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17692995
chr9:17693062 C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0014
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NA18977.hp2
NA18994.hp1
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17693062
chr9:17693350 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0203
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c.46-53716G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17693350
chr9:17693365 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0078
 1 NA19002.hp2
NA19002.hp2
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c.46-53701G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17693365
chr9:17693526 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0013
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NA18971.hp1
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c.46-53540A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17693526
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0184
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a0001c0001t0001g0246
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c.46-53527G>T
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TAC
 T
T
 37 a0001c0001t0001g0015
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HG02723.hp2
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HG03486.hp2
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c.46-53485_46-53484delCA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17693571
chr9:17693595 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0003
 1 HG02523.hp2
HG02523.hp2
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c.46-53471G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17693595
chr9:17693618 A
A
 G
G
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HG02280.hp1
HG02630.hp1
HG02895.hp2
HG03453.hp1
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c.46-53448A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17693618
chr9:17693936 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0001g0254
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HG03225.hp2
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c.46-53130A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17693936
chr9:17693980 A
A
 G
G
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HG01884.hp1
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c.46-53086A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17693980
chr9:17694043 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0193
 1 HG02559.hp2
HG02559.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-53023C>T
c.46-53023C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17694043
chr9:17694141 A
A
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0145
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NA18971.hp2
NA18977.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18977.hp1
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c.46-52925A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17694141
chr9:17694149 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0193
 1 HG02559.hp2
HG02559.hp2
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c.46-52917A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17694149
chr9:17694388 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0028
a0001c0001t0003g0028
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HG01516.hp1
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c.46-52678G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17694388
chr9:17694388 G
G
 C
C
 122 a0001c0001t0001g0007
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G
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HG03130.hp1
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A
 C
C
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G
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 G
G
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A
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c.46-52363G>A
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C
 G
G
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HG01192.hp2
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G
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A
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T
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c.46-51614G>T
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C
 T
T
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c.46-51601C>T
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A
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G
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a0001c0001t0002g0057
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NA18972.hp2
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c.46-51550A>G
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G
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A
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c.46-51471G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695595
chr9:17695621 A
A
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AAAAAGCCCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGGGA
TCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCC
TCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCT
AATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATTTTAGCCGGGAT
GGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTG
CTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCC
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HG03516.hp2
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c.46-51432_46-51431insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAG
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CTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTAC
GCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATTTTA
GCCGGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTC
CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAAAAGCCC
TTTCT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17695621
chr9:17695621 A
A
 AAAAAGCC
others(328): Show 
AAAAAGCCCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGG
GATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTG
CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGG
CTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATTTTAGCCGGG
ATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAG
TGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCC
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a0001c0001t0020g0211
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c.46-51432_46-51431insTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGC
AGTGGCGGGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCA
TTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACT
ACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATTT
TAGCCGGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCC
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CCTTTCT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17695621
chr9:17695622 A
A
 T
T
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c.46-51444A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695622
chr9:17695682 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0002g0057
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0002g0057
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NA18975.hp1
NA18972.hp2
NA18975.hp1
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c.46-51384C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695682
chr9:17695752 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0013g0162
a0001c0002t0013g0162
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
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c.46-51314A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695752
chr9:17695783 T
T
 A
A
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 56 HG00280.hp2
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others(53): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
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HG02257.hp2
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NA20129.hp1
NA20129.hp2
NA20300.hp1
NA20805.hp1
NA20905.hp1
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c.46-51283T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695783
chr9:17695783 T
T
 TAAAAATG
others(313): Show 
TAAAAATGGAAACATTGTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC
AGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA
CCATCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA
TTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT
GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGA
GATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 1 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0185
 1 HG02976.hp2
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-51265_46-51264i
others(322): Show 
c.46-51265_46-51264insGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAAT
CCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCG
AGACCATCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA
AAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAG
GCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC
CGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTC
TCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGAAACATTGTG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17695783
chr9:17695783 T
T
 TAAAAATG
others(314): Show 
TAAAAATGGAAACATTGTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC
AGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA
CCATCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA
TTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT
GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGA
GATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 1 a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0249
 1 HG02451.hp1
HG02451.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-51265_46-51264i
others(323): Show 
c.46-51265_46-51264insGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAAT
CCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCG
AGACCATCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA
AAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAG
GCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC
CGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTC
TCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGAAACATTGTG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17695783
chr9:17695783 T
T
 TAAAAATG
others(315): Show 
TAAAAATGGAAACATTGTGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCC
AGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGA
CCATCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA
TTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCT
GAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGA
GATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 1 a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0194
 1 HG02055.hp2
HG02055.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-51265_46-51264i
others(324): Show 
c.46-51265_46-51264insGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAAT
CCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCG
AGACCATCCTGGCTAAAACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAA
AAATTAGCCGGGCGTAGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAG
GCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGC
CGAGATCCCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTC
TCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGGAAACATTGTG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17695783
chr9:17695814 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0214
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-51252A>T
c.46-51252A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695814
chr9:17695818 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-51248C>T
c.46-51248C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695818
chr9:17695867 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0013g0162
a0001c0002t0013g0162
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
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c.46-51199G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695867
chr9:17695943 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0002t0005g0226
 4 HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
others(1): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-51123A>G
c.46-51123A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695943
chr9:17695998 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0088
a0001c0001t0001g0088
 1 NA18966.hp2
NA18966.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-51068C>G
c.46-51068C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17695998
chr9:17696036 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0002g0241
 1 HG00438.hp2
HG00438.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-51030G>A
c.46-51030G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696036
chr9:17696182 C
C
 CT
CT
 25 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
others(22): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0021
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a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0123
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a0001c0003t0002g0039
a0002c0004t0003g0111
 25 HG01255.hp2
HG01258.hp1
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others(22): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02300.hp2
HG03041.hp1
HG03710.hp1
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19064.hp2
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-50875dupT
c.46-50875dupT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17696182
chr9:17696208 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0206
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-50858C>A
c.46-50858C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696208
chr9:17696411 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0102
 1 HG00280.hp2
HG00280.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-50655A>G
c.46-50655A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696411
chr9:17696510 A
A
 T
T
 22 a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
others(19): Show 
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
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a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0017
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 22 HG01255.hp2
HG01258.hp1
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HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
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NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-50556A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696510
chr9:17696558 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0205
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
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c.46-50508G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696558
chr9:17696653 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0245
 2 NA18939.hp2
NA18968.hp1
NA18939.hp2
NA18968.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-50413A>G
c.46-50413A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696653
chr9:17696783 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0003
 1 HG02523.hp2
HG02523.hp2
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c.46-50283A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696783
chr9:17696867 A
A
 C
C
 11 a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0166
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0166
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others(8): Show 
HG00408.hp2
HG01243.hp1
HG02145.hp1
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c.46-50199A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696867
chr9:17696873 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
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NA18948.hp1
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c.46-50193A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696873
chr9:17696888 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-50178C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696888
chr9:17696945 G
G
 T
T
 1 a0002c0004t0003g0111
a0002c0004t0003g0111
 1 homoSapiens_chm13v2.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-50121G>T
c.46-50121G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696945
chr9:17696951 A
A
 G
G
 1 a0002c0004t0003g0111
a0002c0004t0003g0111
 1 homoSapiens_chm13v2.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-50115A>G
c.46-50115A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17696951
chr9:17697030 G
G
 GATACTGT
others(1): Show 
GATACTGTC
 26 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0040
others(23): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0002g0031
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a0001c0001t0002g0233
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a0001c0003t0002g0039
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 26 HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
others(23): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02258.hp1
HG02300.hp2
HG03041.hp1
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NA18942.hp1
NA18942.hp2
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NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19064.hp2
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-50035_46-50028d
others(10): Show 
c.46-50035_46-50028dupATACTGTC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17697030
chr9:17697039 C
C
 A
A
 38 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0040
others(35): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
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a0001c0001t0001g0232
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a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0021
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a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0006g0215
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a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
a0002c0004t0003g0111
 38 HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01255.hp2
others(35): Show 
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02258.hp1
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HG02647.hp2
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NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19064.hp2
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20129.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-50027C>A
c.46-50027C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697039
chr9:17697042 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0205
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-50024G>T
c.46-50024G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697042
chr9:17697088 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0164
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-49978A>G
c.46-49978A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697088
chr9:17697097 G
G
 T
T
 50 a0001c0001t0001g0007
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others(47): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
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 50 HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
others(47): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
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NA18612.hp1
NA18943.hp2
NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18961.hp2
NA18966.hp2
NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18972.hp2
NA18977.hp1
NA18986.hp1
NA18991.hp1
NA18994.hp2
NA19002.hp2
NA19009.hp2
NA19010.hp1
NA19011.hp2
NA19064.hp2
NA19074.hp2
NA19079.hp1
NA19086.hp2
NA20300.hp2
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-49969G>T
c.46-49969G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697097
chr9:17697180 G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
others(1): Show 
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
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 4 HG01099.hp2
HG02683.hp1
HG04184.hp2
others(1): Show 
HG01099.hp2
HG02683.hp1
HG04184.hp2
HG04199.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-49886G>A
c.46-49886G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697180
chr9:17697183 G
G
 A
A
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a0001c0001t0004g0206
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
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c.46-49883G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697183
chr9:17697227 C
C
 CT
CT
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c.46-49825dupT
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chr9:17697243 A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0101
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NA20905.hp2
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c.46-49823A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697243
chr9:17697295 C
C
 A
A
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a0001c0001t0005g0022
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HG04184.hp2
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c.46-49771C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697295
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0188
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HG01109.hp2
HG01192.hp2
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c.46-49732C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697334
chr9:17697364 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
HG02258.hp1
HG03139.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-49702C>T
c.46-49702C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697364
chr9:17697415 G
G
 GC
GC
 53 a0001c0001t0001g0007
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others(50): Show 
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a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
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a0001c0001t0001g0106
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 53 HG00140.hp1
HG00323.hp1
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others(50): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00438.hp1
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NA18972.hp2
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NA18994.hp2
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NA19079.hp1
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others(3): Show 
c.46-49651_46-49650insC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697415
chr9:17697424 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0038
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NA18953.hp2
HG00609.hp2
NA18953.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-49642A>G
c.46-49642A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697424
chr9:17697464 C
C
 T
T
 20 a0001c0001t0001g0043
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others(17): Show 
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0089
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a0001c0001t0001g0116
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 20 HG00408.hp2
HG00438.hp2
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others(17): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00673.hp2
HG01243.hp1
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HG02895.hp2
HG06807.hp1
NA18939.hp1
NA18943.hp1
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NA19030.hp1
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NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-49602C>T
c.46-49602C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697464
chr9:17697492 T
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 C
C
 27 a0001c0001t0001g0008
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others(24): Show 
a0001c0001t0001g0008
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a0001c0001t0002g0245
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a0001c0003t0002g0010
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 27 HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
others(24): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
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NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18970.hp1
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NA18989.hp1
NA18991.hp1
NA18991.hp2
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NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-49574T>C
c.46-49574T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697492
chr9:17697512 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-49554G>A
c.46-49554G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697512
chr9:17697648 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0206
 1 HG02809.hp2
HG02809.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-49418C>T
c.46-49418C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17697648
chr9:17697680 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
HG03139.hp1
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T
 C
C
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C
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T
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HG01175.hp2
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 A
A
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T
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A
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c.46-49208G>A
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G
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 T
T
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HG03041.hp2
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c.46-49144G>T
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 C
C
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a0001c0001t0009g0181
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others(15): Show 
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HG02145.hp1
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HG06807.hp1
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NA18943.hp1
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NA19030.hp1
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NA19074.hp1
NA19079.hp2
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c.46-49134G>C
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chr9:17697934 G
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 A
A
 46 a0001c0001t0001g0008
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others(43): Show 
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 46 HG01109.hp2
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others(43): Show 
HG01109.hp2
HG01192.hp2
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HG01258.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-49132G>A
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G
 A
A
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c.46-49088G>A
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G
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HG02145.hp2
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c.46-48880A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
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HG02895.hp2
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c.46-48857T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.46-48849A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0242
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NA19030.hp2
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c.46-48760A>G
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C
 G
G
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others(6): Show 
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c.46-48731C>G
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chr9:17698412 G
G
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C
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a0001c0001t0002g0231
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HG02559.hp2
HG02572.hp1
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HG03453.hp2
HG03486.hp1
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c.46-48654G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17698412
chr9:17698475 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
 1 NA18948.hp1
NA18948.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-48591T>A
c.46-48591T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17698475
chr9:17698567 A
A
 G
G
 48 a0001c0001t0001g0007
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 48 HG00140.hp1
HG00323.hp1
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others(45): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
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HG03017.hp2
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NA18970.hp2
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NA18972.hp2
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c.46-48499A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17698567
chr9:17698766 G
G
 T
T
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others(4): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
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 7 HG01884.hp1
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HG02280.hp2
others(4): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02280.hp2
HG02451.hp2
HG02809.hp1
HG03098.hp1
NA19240.hp2
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c.46-48300G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17698766
chr9:17698789 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0127
 1 HG01099.hp1
HG01099.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-48277G>A
c.46-48277G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17698789
chr9:17698927 C
C
 T
T
 23 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
others(20): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0123
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a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
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 23 HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
others(20): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
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NA18942.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-48139C>T
c.46-48139C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17698927
chr9:17698970 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
 2 HG02280.hp2
HG02809.hp1
HG02280.hp2
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-48096C>T
c.46-48096C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17698970
chr9:17698980 C
C
 A
A
 19 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0192
others(16): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0008g0158
 19 HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02257.hp2
others(16): Show 
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp2
HG02723.hp1
HG02895.hp1
HG02965.hp1
HG03130.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
HG03516.hp1
HG03579.hp1
NA18906.hp1
NA20129.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-48086C>A
c.46-48086C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17698980
chr9:17699065 G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
 2 HG02717.hp1
HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-48001G>C
c.46-48001G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17699065
chr9:17699103 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0084
 1 HG04228.hp1
HG04228.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-47963C>T
c.46-47963C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17699103
chr9:17699119 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0013g0162
a0001c0002t0013g0162
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-47947C>T
c.46-47947C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17699119
chr9:17699120 G
G
 A
A
 26 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
others(23): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0170
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a0001c0001t0002g0103
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a0001c0001t0002g0118
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a0001c0001t0018g0216
 26 HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(23): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
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HG01261.hp2
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HG02055.hp1
HG02148.hp2
HG02257.hp1
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HG03654.hp1
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HG03704.hp2
HG03831.hp1
NA19030.hp2
NA20805.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-47946G>A
c.46-47946G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17699120
chr9:17699153 C
C
 CA
CA
 11 a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0091
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0091
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
 11 HG02056.hp1
HG02109.hp1
HG02717.hp1
others(8): Show 
HG02056.hp1
HG02109.hp1
HG02717.hp1
HG02809.hp2
HG03669.hp1
HG03704.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp2
NA18906.hp2
NA18948.hp2
NA19010.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-47890dupA
c.46-47890dupA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17699153
chr9:17699153 CA
CA
 C
C
 24 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0088
others(21): Show 
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0088
a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0126
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a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0037
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a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0015g0041
a0001c0001t0018g0216
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C
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C
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 C
C
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C
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G
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c.46-47835C>G
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 A
A
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c.46-47831G>A
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 C
C
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17699265
chr9:17699286 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.46-47780G>A
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G
 A
A
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HG00438.hp2
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c.46-47747G>A
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C
 T
T
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c.46-47556C>T
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C
 T
T
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a0003c0005t0014g0137
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c.46-47506C>T
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C
 G
G
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c.46-47417C>G
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G
 C
C
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a0001c0001t0001g0110
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HG02523.hp1
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c.46-47368G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17699698
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0070
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NA19009.hp1
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c.46-47239G>A
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A
 G
G
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HG00438.hp2
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T
 A
A
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 46 HG00140.hp1
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HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
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c.46-47083C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17699983
chr9:17700030 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
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c.46-47036C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17700030
chr9:17700031 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
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 21 HG01255.hp2
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others(18): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-47035G>A
c.46-47035G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17700031
chr9:17700051 C
C
 CAAGAAGA
others(92): Show 
CAAGAAGAAAATTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCAGTCCGCAGTC
CGACCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
 1 a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0055
 1 NA19074.hp1
NA19074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-47004_46-47003i
others(101): Show 
c.46-47004_46-47003insTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCA
GTCCGCAGTCCGACCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAGAAGAAAAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17700051
chr9:17700051 C
C
 CAAGAAGA
others(93): Show 
CAAGAAGAAAATTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCAGTCCGCAGTC
CGACCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
A
 17 a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0089
others(14): Show 
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
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a0001c0001t0001g0136
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a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0001g0240
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
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 17 HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00673.hp2
others(14): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00673.hp2
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NA19030.hp1
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NA19079.hp2
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-47004_46-47003i
others(102): Show 
c.46-47004_46-47003insTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCACTGCA
GTCCGCAGTCCGACCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAGAAGAAAAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17700051
chr9:17700058 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-47008A>C
c.46-47008A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17700058
chr9:17700197 C
C
 CT
CT
 4 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0002t0005g0226
 4 HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
others(1): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02451.hp2
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-46868dupT
c.46-46868dupT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17700197
chr9:17700238 C
C
 G
G
 18 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
others(15): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0025
a0001c0001t0002g0026
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a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0092
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0103
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a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0002g0177
 18 HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(15): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
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HG01358.hp2
HG02148.hp2
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HG03654.hp1
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HG03831.hp1
NA20805.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-46828C>G
c.46-46828C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17700238
chr9:17700270 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0088
a0001c0001t0001g0088
 1 NA18966.hp2
NA18966.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-46796C>G
c.46-46796C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17700270
chr9:17700295 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-46771C>T
c.46-46771C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17700295
chr9:17700310 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0215
 1 HG01192.hp2
HG01192.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-46756C>T
c.46-46756C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17700310
chr9:17700368 G
G
 A
A
 151 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
others(148): Show 
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a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0066
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a0001c0001t0001g0093
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a0001c0001t0001g0105
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a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0141
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a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
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a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0232
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a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
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a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0004
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0017
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c.46-46698G>A
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G
 T
T
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c.46-46689G>T
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C
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T
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a0001c0001t0001g0012
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NA18975.hp1
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c.46-46657C>T
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 C
C
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c.46-46504T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
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HG02258.hp1
HG03139.hp1
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c.46-46500A>G
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C
 T
T
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c.46-46477C>T
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G
 A
A
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c.46-46418G>A
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C
 G
G
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c.46-46414C>G
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A
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G
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a0001c0001t0001g0232
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NA18948.hp1
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c.46-46338A>G
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A
 G
G
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c.46-46193A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.46-46132C>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
HG02258.hp1
HG03139.hp1
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c.46-45976G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701090
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C
 G
G
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a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
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c.46-45910C>G
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A
 G
G
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others(8): Show 
HG02165.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
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c.46-45888A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0150
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HG00280.hp1
HG01070.hp1
HG01074.hp2
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c.46-45868C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701198
chr9:17701303 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0185
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-45763A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701303
chr9:17701542 A
A
 T
T
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HG01255.hp2
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c.46-45524A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701542
chr9:17701746 A
A
 C
C
 2 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
 2 HG01175.hp2
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG03130.hp1
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c.46-45320A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701746
chr9:17701748 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0005g0022
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a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0005g0178
 4 HG01099.hp2
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others(1): Show 
HG01099.hp2
HG02683.hp1
HG04184.hp2
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c.46-45318A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701748
chr9:17701787 G
G
 A
A
 42 a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0001g0040
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a0001c0001t0001g0020
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HG01192.hp2
HG01255.hp2
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HG02258.hp1
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NA18942.hp2
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NA20129.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-45279G>A
c.46-45279G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701787
chr9:17701806 C
C
 G
G
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a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
HG02809.hp2
HG02895.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-45260C>G
c.46-45260C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701806
chr9:17701844 T
T
 A
A
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others(24): Show 
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a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
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HG02723.hp2
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-45222T>A
c.46-45222T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701844
chr9:17701891 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
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 53 HG00140.hp1
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others(50): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
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HG03942.hp1
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NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18972.hp2
NA18977.hp1
NA18986.hp1
NA18991.hp1
NA18991.hp2
NA18994.hp2
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NA19074.hp2
NA19079.hp1
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NA20300.hp2
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-45175C>G
c.46-45175C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701891
chr9:17701973 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0214
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-45093A>G
c.46-45093A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17701973
chr9:17702027 A
A
 G
G
 23 a0001c0001t0001g0020
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others(20): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
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others(20): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
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HG02300.hp2
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NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
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NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-45039A>G
c.46-45039A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17702027
chr9:17702066 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0199
 1 HG02717.hp2
HG02717.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-45000G>A
c.46-45000G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17702066
chr9:17702076 A
A
 G
G
 175 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
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others(172): Show 
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
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a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0056
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a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0075
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G
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CA
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G
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A
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HG03139.hp1
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c.46-44603G>A
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C
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T
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HG02145.hp2
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G
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c.46-44376A>G
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T
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c.46-44204C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0031
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HG03710.hp1
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c.46-44046C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17703020
chr9:17703078 A
A
 T
T
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0010g0218
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HG01175.hp2
HG03130.hp1
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A
 G
G
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0136
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NA18939.hp1
HG00673.hp2
NA18939.hp1
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0199
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HG02717.hp2
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c.46-43711A>G
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chr9:17703388 A
A
 G
G
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c.46-43678A>G
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G
 C
C
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c.46-43649G>C
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G
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c.46-43508A>G
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C
 T
T
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others(8): Show 
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others(8): Show 
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c.46-43432C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17703634
chr9:17703733 G
G
 A
A
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HG01175.hp2
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c.46-43333G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17703733
chr9:17703739 A
A
 G
G
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a0001c0001t0006g0214
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HG02809.hp1
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c.46-43327A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17703739
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C
 A
A
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HG01255.hp2
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c.46-43296C>A
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G
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G
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A
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c.46-43105G>A
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C
 T
T
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C
 G
G
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NA20905.hp2
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c.46-43017C>G
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C
 T
T
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T
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C
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A
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AAATCAGTGGCATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGTTTCCTTGT
ATTTTGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTAT
ACTCTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACATTGTGCAGGTTAGTTACATATG
TATACATGTGCCATGCTGGTGCACTGCACCCACTAATGTGTCATCTAGCA
TTAGGTATATCTCCCAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCGACCCCACCAC
AGTCCCCAGAGTGTGATATTCCCCTTCCTGGGTCCATGTGATCTCATTGT
TCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTTCTT
GCGATAGTTTACTGAGAATGATGGTTTCCAATTTCATCCATGTCCCTACA
AAGGATATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTA
TATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTT
GGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAATAAACATACGTGTG
CATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATACTCATTTGGGTATATACCCAG
TAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCTGAGGA
ATCGCCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCCACCAA
CAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCGCATCCTCTCCAGCACCTGTTGTT
TCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATATCTCA
TAGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGCATTTC
TTCATGTGTTTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTCTGTT
CATGTCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTTGTAAA
TTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAGATGAG
TAGGTTGCAAAAATTTTCTCCCATGTTGTAGGTTGCCTGTTCACTCTGAT
GGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATCCCATT
TGTCAATTTTGTCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTGGACATGAAG
TCCTTGCCCACGCCTATGTCCTGAATGGTAATGCCTAGGTTTTCTTCTAG
GGTTTTTATGGTTTTAGGTTTAACGTTTAAATCTTTAATCCATCTTGAAT
TGATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACAT
ATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCC
CCATTGCTTGTTTTTCTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATAT
GCGGCATTATTTCTGAGGGCTCTGTTCTGTTCCATTGATCTATATCTCTG
TTTTGGTACCAGAAACCGAATCCAGCAGCACATCAAAAAGCTTATCCACC
ATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATATACGC
AAATCAATAAATGTAATCCAGCATATAAACAGAGCCAAAGACAAAAACCA
CATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCAACAAC
CCTTCATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGTATTTC
AAAATAATAAGAGCTATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATACTGAA
TGGGCAAAAACTGGAAGCATTCCCTTTGAAAACCGGCACAAGACAGGGAT
GCCCTCTCTCACCGCTCCTATTCAACATAGTGTTGGAAGTTCTGGCCAGG
GCAATCAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAAAGAGGA
AGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTTTATCTAGAAAACC
CCATCGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCAGCAAA
GTCTCAGGATACAAAATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTATACAC
CAACAACAGACAAACAGAGAGCCAAATCATGGGTGAACTCCCATTCACAA
TTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGATGTG
AAGGACCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAAGGAAATAAAAGA
GGAGACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAGAATCA
ATATCGTGAAAATGGCCATACTGCCCAAGGTAATTTACAGATTCAATGCC
ATCCCCATCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAATTGGAAAAAACTAC
TTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCGCATTGCCAAGTCAATCC
TAAGCCAAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACACTACCTGACTTCAAACTA
TACTACAAGGCTACAGT
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CTTGTATTTTGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
ATTATACTCTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACATTGTGCAGGTTAGTTAC
ATATGTATACATGTGCCATGCTGGTGCACTGCACCCACTAATGTGTCATC
TAGCATTAGGTATATCTCCCAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCGACCCC
ACCACAGTCCCCAGAGTGTGATATTCCCCTTCCTGGGTCCATGTGATCTC
ATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGGTTTTTTG
TTCTTGCGATAGTTTACTGAGAATGATGGTTTCCAATTTCATCCATGTCC
CTACAAAGGATATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATG
GTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTT
GGGTTGGTTCCAAGTCTTTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAATAAACATAC
GTGTGCATGTGTCTTTATAGCAGCATGATTTATACTCATTTGGGTATATA
CCCAGTAATGGGATGGCTGGGTCAAATGGTATTTCTAGTTCTAGATCCCT
GAGGAATCGCCACACTGACTTCCACAATGGTTGAACTAGTTTACAGTCCC
ACCAACAGTGTAAAAGTGTTCCTATTTCTCCGCATCCTCTCCAGCACCTG
TTGTTTCCTGACTTTTTAATGATTGCCATTCTAACTGGTGTGAGATGATA
TCTCATAGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCTGATGGCCAGTGATGATGAGC
ATTTCTTCATGTGTTTTTTGGCTGCATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGT
CTGTTCATGTCCTTCGCCCACTTTTTGATGGGGTTGTTTGTTTTTTTCTT
GTAAATTTGTTTGAGTTCATTGTAGATTCTGGATATTAGCCCTTTGTCAG
ATGAGTAGGTTGCAAAAATTTTCTCCCATGTTGTAGGTTGCCTGTTCACT
CTGATGGTAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAATTAGATC
CCATTTGTCAATTTTGTCTTTTGTTGCCATTGCTTTTGGTGTTTTGGACA
TGAAGTCCTTGCCCACGCCTATGTCCTGAATGGTAATGCCTAGGTTTTCT
TCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTTTAACGTTTAAATCTTTAATCCATCT
TGAATTGATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTC
TACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCC
TTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTA
GATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTCTGTTCTGTTCCATTGATCTATAT
CTCTGTTTTGGTACCAGAAACCGAATCCAGCAGCACATCAAAAAGCTTAT
CCACCATGATCAAGTGGGCTTCATCCCTGGGATGCAAGGCTGGTTCAATA
TACGCAAATCAATAAATGTAATCCAGCATATAAACAGAGCCAAAGACAAA
AACCACATGATTATCTCAATAGATGCAGAAAAAGCCTTTGACAAAATTCA
ACAACCCTTCATGCTAAAAACTCTCAATAAATTAGGTATTGATGGGACGT
ATTTCAAAATAATAAGAGCTATCTATGACAAACCCACAGCCAATATCATA
CTGAATGGGCAAAAACTGGAAGCATTCCCTTTGAAAACCGGCACAAGACA
GGGATGCCCTCTCTCACCGCTCCTATTCAACATAGTGTTGGAAGTTCTGG
CCAGGGCAATCAGGCAGGAGAAGGAAATAAAGGGTATTCAATTAGGAAAA
GAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCAGACGACATGATTGTTTATCTAGA
AAACCCCATCGTCTCAGCCCAAAATCTCCTTAAGCTGATAAGCAACTTCA
GCAAAGTCTCAGGATACAAAATCAATGTACAAAAATCACAAGCATTCTTA
TACACCAACAACAGACAAACAGAGAGCCAAATCATGGGTGAACTCCCATT
CACAATTGCTTCAAAGAGAATAAAATACCTAGGAATCCAACTTACAAGGG
ATGTGAAGGACCTCTTCAAGGAGAACTACAAACCACTGCTCAAGGAAATA
AAAGAGGAGACAAACAAATGGAAGAACATTCCATGCTCATGGGTAGGAAG
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C
 T
T
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c.46-42925C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0185
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HG02976.hp2
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c.46-42920A>G
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G
 A
A
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c.46-42894G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17704172
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0207
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c.46-42885C>T
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A
 C
C
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c.46-42852A>C
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G
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NA18977.hp2
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c.46-42738A>G
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G
 A
A
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HG02572.hp1
HG02257.hp2
HG02572.hp1
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c.46-42734G>A
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-42686G>T
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 G
G
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HG00280.hp2
HG00639.hp2
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
NA20905.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-42626delA
c.46-42626delA
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chr9:17704437 A
A
 G
G
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others(19): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
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HG02300.hp2
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HG03710.hp1
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NA18989.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-42629A>G
c.46-42629A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17704437
chr9:17704446 G
G
 A
A
 59 a0001c0001t0001g0015
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 59 HG00280.hp2
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others(56): Show 
HG00280.hp2
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c.46-42620G>A
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G
 A
A
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c.46-42553G>A
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0130
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NA18977.hp2
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c.46-42547C>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0005g0146
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NA19010.hp2
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c.46-42342T>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
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a0001c0001t0006g0221
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HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02895.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
HG03130.hp2
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NA20129.hp1
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c.46-42276G>A
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chr9:17704800 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-42266C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17704800
chr9:17704899 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0193
 1 HG02559.hp2
HG02559.hp2
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c.46-42167C>G
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G
 A
A
 18 a0001c0001t0001g0015
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others(15): Show 
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a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0002g0103
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a0001c0001t0002g0167
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 18 HG00280.hp2
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others(15): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
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NA20905.hp1
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c.46-42088G>A
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chr9:17705014 A
A
 G
G
 22 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0040
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a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
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a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0239
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 22 HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
others(19): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02258.hp1
HG02300.hp2
HG03041.hp1
HG03710.hp1
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-42052A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17705014
chr9:17705050 C
C
 CA
CA
 7 a0001c0001t0001g0020
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others(4): Show 
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 7 HG01175.hp2
HG02258.hp1
HG03130.hp1
others(4): Show 
HG01175.hp2
HG02258.hp1
HG03130.hp1
HG03669.hp1
HG03710.hp1
HG04184.hp1
HG04184.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-42007dupA
c.46-42007dupA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17705050
chr9:17705050 CA
CA
 C
C
 39 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0029
others(36): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0170
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a0001c0001t0001g0252
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a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0002g0167
a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
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a0001c0001t0004g0209
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a0001c0001t0004g0255
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 39 HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(36): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG01081.hp1
HG01099.hp1
HG01109.hp2
HG01175.hp1
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HG02148.hp2
HG02257.hp2
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HG02300.hp1
HG02523.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02895.hp1
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NA18906.hp1
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NA20805.hp1
NA20905.hp1
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c.46-42007delA
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C
 A
A
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A
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G
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c.46-41812A>G
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T
 C
C
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c.46-41716T>C
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chr9:17705390 G
G
 A
A
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c.46-41676G>A
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CAT
 C
C
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others(4): Show 
c.46-41586_46-41585delTA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17705478
chr9:17705553 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0254
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HG03225.hp2
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c.46-41513G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17705553
chr9:17705615 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0029
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NA20805.hp1
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c.46-41451C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17705615
chr9:17705632 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0131
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NA19012.hp1
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c.46-41434A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17705632
chr9:17705882 C
C
 A
A
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others(7): Show 
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others(7): Show 
HG03654.hp2
HG04184.hp1
NA18747.hp2
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c.46-41184C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17705882
chr9:17706031 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0040
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NA18942.hp2
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c.46-41035C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17706031
chr9:17706127 A
A
 T
T
 45 a0001c0001t0001g0015
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c.46-40112T>C
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 A
A
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c.46-40081G>A
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C
 G
G
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HG01261.hp2
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c.46-40036C>G
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A
 G
G
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c.46-39973A>G
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A
 T
T
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HG01978.hp1
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c.46-39960A>T
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 A
A
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a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0203
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c.46-39954G>A
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G
 C
C
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others(18): Show 
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0166
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others(18): Show 
HG00408.hp2
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HG02630.hp1
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NA18906.hp2
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c.46-39932G>C
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C
 T
T
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others(41): Show 
HG00280.hp2
HG00639.hp2
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HG01081.hp1
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HG03831.hp1
NA18906.hp1
NA20129.hp1
NA20129.hp2
NA20805.hp1
NA20905.hp1
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c.46-39864C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707202
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C
 G
G
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a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
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c.46-39771C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707295
chr9:17707345 A
A
 T
T
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a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
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HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03486.hp2
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c.46-39721A>T
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A
 T
T
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.46-39629A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707437
chr9:17707485 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-39581T>C
c.46-39581T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707485
chr9:17707553 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0257
 1 HG03139.hp2
HG03139.hp2
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c.46-39513A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707553
chr9:17707567 A
A
 G
G
 11 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0159
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a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0185
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HG02055.hp2
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others(8): Show 
HG01884.hp1
HG02055.hp2
HG02109.hp2
HG02145.hp2
HG02280.hp2
HG02451.hp1
HG02451.hp2
HG02976.hp2
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HG03139.hp1
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c.46-39499A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707567
chr9:17707636 C
C
 G
G
 1 a0003c0005t0014g0137
a0003c0005t0014g0137
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NA19087.hp1
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c.46-39430C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707636
chr9:17707679 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0059
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a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
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 21 HG01255.hp2
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others(18): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
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NA18942.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-39387T>C
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chr9:17707690 G
G
 T
T
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others(23): Show 
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a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0192
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a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
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a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0008g0196
 26 HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
others(23): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02886.hp2
HG02895.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp1
HG03130.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
HG03516.hp1
HG03540.hp2
HG03579.hp1
NA18906.hp1
NA20129.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-39376G>T
c.46-39376G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707690
chr9:17707707 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
 1 NA19240.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-39359A>G
c.46-39359A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707707
chr9:17707715 T
T
 C
C
 10 a0001c0001t0001g0054
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0142
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a0001c0001t0002g0131
a0001c0001t0002g0132
a0001c0001t0002g0133
a0001c0001t0002g0134
a0001c0001t0007g0143
 10 HG03654.hp2
HG04184.hp1
NA18747.hp2
others(7): Show 
HG03654.hp2
HG04184.hp1
NA18747.hp2
NA18953.hp1
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NA18968.hp2
NA18999.hp2
NA19012.hp1
NA19086.hp1
NA19088.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-39351T>C
c.46-39351T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707715
chr9:17707766 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0065
 1 HG00733.hp2
HG00733.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-39300C>T
c.46-39300C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707766
chr9:17707782 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
 3 HG02055.hp2
HG02451.hp1
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-39284G>A
c.46-39284G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707782
chr9:17707787 C
C
 T
T
 26 a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0001g0192
others(23): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0203
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a0001c0001t0001g0243
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a0001c0001t0004g0193
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a0001c0001t0008g0196
 26 HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
others(23): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02886.hp2
HG02895.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp1
HG03130.hp2
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HG03486.hp1
HG03516.hp1
HG03540.hp2
HG03579.hp1
NA18906.hp1
NA20129.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-39279C>T
c.46-39279C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707787
chr9:17707804 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0205
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-39262C>T
c.46-39262C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17707804
chr9:17708021 C
C
 T
T
 32 a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0001g0160
others(29): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0008g0196
a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
 32 HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
others(29): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01884.hp1
HG02109.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp2
HG02280.hp2
HG02451.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02886.hp2
HG02895.hp1
HG02965.hp1
HG02976.hp1
HG03098.hp1
HG03130.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
HG03516.hp1
HG03540.hp2
HG03579.hp1
NA18906.hp1
NA19240.hp2
NA20129.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-39045C>T
c.46-39045C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17708021
chr9:17708042 C
C
 T
T
 19 a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
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others(16): Show 
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0089
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a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0228
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a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
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 19 HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00673.hp2
others(16): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00673.hp2
HG01243.hp1
HG02015.hp1
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HG02145.hp1
HG02630.hp1
HG06807.hp1
NA18939.hp1
NA18943.hp1
NA18989.hp2
NA19002.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19064.hp1
NA19074.hp1
NA19079.hp2
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-39024C>T
c.46-39024C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17708042
chr9:17708227 C
C
 T
T
 26 a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
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others(23): Show 
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
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a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0136
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HG00438.hp2
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c.46-38839C>T
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
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c.46-38772G>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0084
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HG04228.hp1
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c.46-38753G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17708313
chr9:17708318 T
T
 A
A
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HG01109.hp2
HG01192.hp2
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NA20129.hp2
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c.46-38748T>A
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chr9:17708318 T
T
 C
C
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others(48): Show 
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a0001c0001t0001g0040
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a0001c0001t0001g0166
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a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0228
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0240
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0002g0031
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a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
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a0001c0001t0019g0220
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others(48): Show 
HG00408.hp2
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HG01243.hp1
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HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02015.hp1
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NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18989.hp2
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NA19009.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19064.hp1
NA19074.hp1
NA19077.hp2
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NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-38748T>C
c.46-38748T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17708318
chr9:17708331 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
 2 HG02809.hp2
HG02895.hp2
HG02809.hp2
HG02895.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-38735A>G
c.46-38735A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17708331
chr9:17708336 G
G
 A
A
 46 a0001c0001t0001g0019
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others(43): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
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a0001c0001t0001g0166
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a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0231
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a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
a0001c0001t0020g0211
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 46 HG00408.hp2
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others(43): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00673.hp2
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01243.hp1
HG02015.hp1
HG02040.hp1
HG02145.hp1
HG02257.hp2
HG02258.hp1
HG02280.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02630.hp1
HG02647.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02895.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
HG03130.hp2
HG03453.hp1
HG03453.hp2
HG03471.hp2
HG03486.hp1
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HG03516.hp2
HG03579.hp1
HG03579.hp2
HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA18939.hp1
NA18943.hp1
NA18989.hp2
NA19002.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19064.hp1
NA19074.hp1
NA19079.hp2
NA19240.hp1
NA20129.hp1
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-38730G>A
c.46-38730G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17708336
chr9:17708339 T
T
 G
G
 2 a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0237
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0237
 2 HG01361.hp2
HG04199.hp2
HG01361.hp2
HG04199.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-38727T>G
c.46-38727T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17708339
chr9:17708361 T
T
 C
C
 26 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0192
others(23): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0203
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a0001c0001t0001g0222
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a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
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 26 HG01109.hp1
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others(23): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
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A
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G
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A
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A
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 T
T
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T
 TAC
TAC
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a0001c0001t0001g0067
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chr9:17709680 T
T
 TACAC
TACAC
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a0001c0001t0001g0185
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a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0243
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HG02647.hp2
HG02723.hp1
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c.46-37355_46-37352dupACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17709680
chr9:17709680 T
T
 TACACAC
TACACAC
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HG02451.hp1
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others(8): Show 
c.46-37357_46-37352dupACACAC
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chr9:17709680 T
T
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others(1): Show 
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 11 a0001c0001t0001g0191
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others(8): Show 
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
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HG01109.hp1
HG02109.hp1
HG02559.hp2
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others(10): Show 
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17709680
chr9:17709680 T
T
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a0001c0001t0004g0230
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a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0008g0196
 3 HG02572.hp1
HG02976.hp1
HG03130.hp2
HG02572.hp1
HG02976.hp1
HG03130.hp2
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others(12): Show 
c.46-37361_46-37352dupACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17709680
chr9:17709680 T
T
 TACACACA
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a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0006g0215
 2 HG01192.hp2
HG02965.hp1
HG01192.hp2
HG02965.hp1
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others(14): Show 
c.46-37363_46-37352dupACACACACACAC
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chr9:17709680 T
T
 TACACACA
others(7): Show 
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 2 a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0008g0158
 2 HG02257.hp2
HG03516.hp1
HG02257.hp2
HG03516.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-37365_46-37352d
others(16): Show 
c.46-37365_46-37352dupACACACACACACAC
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chr9:17709680 T
T
 TACACACA
others(9): Show 
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 4 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0006g0217
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
 4 HG02622.hp2
HG03453.hp2
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others(1): Show 
HG02622.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp1
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others(18): Show 
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chr9:17709680 TAC
TAC
 T
T
 96 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0015
others(93): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0015
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others(94): Show 
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 intron_variant MODIFIER c.46-37353_46-37352d
others(4): Show 
c.46-37353_46-37352delAC
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chr9:17709680 TACAC
TACAC
 T
T
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17709680
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TACACACACAC
 T
T
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chr9:17709680 TACACACA
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 T
T
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a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
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HG02809.hp2
HG02895.hp2
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others(14): Show 
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17709680
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T
 C
C
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c.46-37325T>C
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G
 C
C
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c.46-37283G>C
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C
 G
G
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HG00280.hp2
HG00639.hp2
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NA20905.hp1
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c.46-37235C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17709831
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T
 C
C
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HG00408.hp2
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c.46-37217T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.46-37154A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17709912
chr9:17709930 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0136
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0228
a0001c0001t0001g0229
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a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0002g0241
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HG00438.hp2
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others(17): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
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HG02040.hp1
HG02145.hp1
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NA18939.hp1
NA18943.hp1
NA18989.hp2
NA19002.hp1
NA19030.hp1
NA19030.hp2
NA19064.hp1
NA19074.hp1
NA19079.hp2
NA19240.hp1
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c.46-37136A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17709930
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0174
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HG02886.hp1
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c.46-37041G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17710025
chr9:17710109 G
G
 A
A
 11 a0001c0001t0001g0188
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others(8): Show 
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a0001c0001t0001g0203
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a0001c0001t0008g0158
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others(8): Show 
HG01109.hp2
HG02572.hp2
HG02647.hp2
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C
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C
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A
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c.46-36638G>A
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C
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T
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G
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a0001c0001t0007g0143
 1 HG04184.hp1
HG04184.hp1
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c.46-36315C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17710751
chr9:17710807 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0214
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
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c.46-36259T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17710807
chr9:17710851 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0017g0112
a0001c0001t0017g0112
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HG01978.hp2
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c.46-36215A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17710851
chr9:17710860 A
A
 T
T
 2 a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
HG02809.hp2
HG02895.hp2
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c.46-36206A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17710860
chr9:17710878 G
G
 A
A
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c.46-36188G>A
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chr9:17711083 A
A
 C
C
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HG01109.hp1
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NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-35983A>C
c.46-35983A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711083
chr9:17711136 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0002g0119
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HG03139.hp1
HG02145.hp2
HG03139.hp1
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c.46-35930G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711136
chr9:17711157 A
A
 C
C
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others(28): Show 
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a0001c0001t0008g0196
 31 HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
others(28): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp1
HG02809.hp2
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HG02895.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
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NA18906.hp1
NA20129.hp1
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NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-35909A>C
c.46-35909A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711157
chr9:17711207 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0186
 1 HG02257.hp1
HG02257.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-35859A>G
c.46-35859A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711207
chr9:17711421 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-35645A>G
c.46-35645A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711421
chr9:17711449 A
A
 C
C
 1 a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0005g0226
 1 HG03098.hp1
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-35617A>C
c.46-35617A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711449
chr9:17711492 C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0005g0022
 2 HG01243.hp1
HG04184.hp2
HG01243.hp1
HG04184.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-35574C>T
c.46-35574C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711492
chr9:17711554 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0152
 1 HG01192.hp1
HG01192.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-35512T>A
c.46-35512T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711554
chr9:17711825 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
 2 HG02717.hp1
HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-35241A>G
c.46-35241A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711825
chr9:17711826 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0203
 1 HG02723.hp1
HG02723.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-35240A>G
c.46-35240A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711826
chr9:17711961 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-35105C>A
c.46-35105C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17711961
chr9:17712076 G
G
 A
A
 6 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0207
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0020g0211
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 7 HG01070.hp2
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others(4): Show 
HG01070.hp2
HG01071.hp1
HG02280.hp1
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HG03516.hp2
HG03579.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-34990G>A
c.46-34990G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712076
chr9:17712106 A
A
 G
G
 28 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
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others(25): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0203
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a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0231
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a0001c0001t0004g0198
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a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0008g0158
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 28 HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
others(25): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
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NA20129.hp2
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c.46-34960A>G
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chr9:17712201 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0237
a0001c0001t0003g0237
 1 HG01361.hp2
HG01361.hp2
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c.46-34865C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712201
chr9:17712258 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0205
 1 HG03486.hp2
HG03486.hp2
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c.46-34808G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712258
chr9:17712267 A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
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c.46-34799A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712267
chr9:17712297 A
A
 G
G
 9 a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0083
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0001g0088
a0001c0001t0001g0108
a0001c0001t0002g0037
a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0077
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 9 HG00558.hp1
HG02148.hp1
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others(6): Show 
HG00558.hp1
HG02148.hp1
HG02273.hp1
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c.46-34769A>G
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chr9:17712448 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
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others(17): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
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NA18942.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-34618T>C
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chr9:17712548 T
T
 C
C
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a0001c0001t0006g0215
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HG01192.hp2
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c.46-34518T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712548
chr9:17712665 A
A
 G
G
 11 a0001c0001t0001g0032
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others(8): Show 
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a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
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a0001c0001t0002g0132
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others(8): Show 
HG02165.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
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c.46-34401A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712665
chr9:17712690 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0107
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HG00408.hp2
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c.46-34376T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712690
chr9:17712701 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0240
a0001c0001t0001g0240
 1 NA18989.hp2
NA18989.hp2
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c.46-34365A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712701
chr9:17712756 A
A
 G
G
 55 a0001c0001t0001g0007
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others(52): Show 
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a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
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others(52): Show 
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HG00323.hp1
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NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18972.hp2
NA18977.hp1
NA18986.hp1
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NA18994.hp2
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NA19079.hp1
NA19086.hp2
NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-34310A>G
c.46-34310A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712756
chr9:17712842 C
C
 G
G
 24 a0001c0001t0001g0038
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others(21): Show 
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a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
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 24 HG00408.hp2
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others(21): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00609.hp2
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NA19030.hp2
NA19064.hp1
NA19074.hp1
NA19079.hp2
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-34224C>G
c.46-34224C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712842
chr9:17712886 TA
TA
 T
T
 27 a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0001g0191
others(24): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0192
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 27 HG01109.hp1
HG01109.hp2
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others(24): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
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HG03130.hp2
HG03195.hp2
HG03486.hp1
HG03516.hp1
HG03540.hp2
HG03579.hp1
NA18906.hp1
NA20129.hp1
NA20129.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-34178delA
c.46-34178delA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17712886
chr9:17712961 A
A
 G
G
 1 a0001c0002t0013g0162
a0001c0002t0013g0162
 1 HG02630.hp2
HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-34105A>G
c.46-34105A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17712961
chr9:17713009 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0164
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-34057T>C
c.46-34057T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17713009
chr9:17713027 C
C
 G
G
 20 a0001c0001t0001g0188
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a0001c0001t0001g0201
others(17): Show 
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0201
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c.46-33982T>A
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 T
T
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c.46-33981A>T
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 A
A
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c.46-33934G>A
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c.46-33829A>G
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C
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G
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HG01884.hp1
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T
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G
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C
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T
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a0001c0001t0005g0047
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NA18948.hp2
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G
 A
A
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c.46-33589G>A
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chr9:17713504 A
A
 C
C
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c.46-33409T>C
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T
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G
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c.46-33405T>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0250
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HG01884.hp2
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c.46-33367C>G
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A
 C
C
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a0001c0001t0002g0156
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HG01261.hp1
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c.46-33150A>C
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A
 G
G
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c.46-33133A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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c.46-33130A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17713936
chr9:17713944 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0128
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HG02300.hp2
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c.46-33122T>C
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chr9:17713982 C
C
 A
A
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others(2): Show 
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others(2): Show 
HG02280.hp1
HG03453.hp1
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c.46-33084C>A
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A
 G
G
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others(3): Show 
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others(3): Show 
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c.46-32962A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0240
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NA18989.hp2
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c.46-32903T>C
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G
 C
C
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others(26): Show 
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a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
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HG01109.hp1
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HG02895.hp1
HG02895.hp2
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c.46-32776G>C
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0145
 3 NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18977.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18977.hp1
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c.46-32671C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17714395
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G
 C
C
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others(25): Show 
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a0001c0001t0001g0043
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others(25): Show 
HG00408.hp2
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NA19030.hp1
NA19030.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-32650G>C
c.46-32650G>C
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C
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-32550C>T
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A
 G
G
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others(2): Show 
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
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c.46-32500A>G
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chr9:17714579 T
T
 G
G
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a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03486.hp2
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c.46-32487T>G
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C
 G
G
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A
 T
T
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c.46-32444A>T
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chr9:17714672 G
G
 C
C
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.46-32394G>C
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chr9:17714687 T
T
 C
C
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a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
HG02809.hp2
HG02895.hp2
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c.46-32379T>C
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0186
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c.46-32305C>G
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G
 A
A
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others(75): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-32296G>A
c.46-32296G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17714770
chr9:17714778 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
 1 HG02258.hp1
HG02258.hp1
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c.46-32288C>T
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chr9:17714817 A
A
 G
G
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others(26): Show 
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HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
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HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02895.hp1
HG02895.hp2
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NA18906.hp1
NA20129.hp1
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NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-32249A>G
c.46-32249A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17714817
chr9:17714866 T
T
 C
C
 29 a0001c0001t0001g0019
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others(26): Show 
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a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0198
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a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0008g0158
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 29 HG01109.hp1
HG01109.hp2
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others(26): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
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HG02895.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-32200T>C
c.46-32200T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17714866
chr9:17714879 G
G
 A
A
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others(8): Show 
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T
 C
C
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a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0011g0257
a0001c0002t0005g0226
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HG03098.hp1
HG03139.hp2
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c.46-32168T>C
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A
 G
G
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c.46-32024A>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.46-32017C>A
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G
 A
A
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c.46-31952G>A
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T
 C
C
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c.46-31880T>C
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C
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CT
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HG02280.hp1
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c.46-31858dupT
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chr9:17715194 CT
CT
 C
C
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c.46-31858delT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17715194
chr9:17715199 T
T
 C
C
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a0001c0001t0005g0022
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HG04184.hp2
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c.46-31867T>C
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G
 T
T
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a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
HG02809.hp2
HG02895.hp2
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c.46-31852G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17715214
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A
 T
T
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C
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G
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A
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c.46-31310G>A
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A
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C
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G
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G
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 C
C
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A
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G
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HG02258.hp1
HG03139.hp1
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
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HG02258.hp1
HG03139.hp1
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A
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 T
T
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a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
HG02258.hp1
HG03139.hp1
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c.46-30499C>G
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chr9:17716667 A
A
 T
T
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a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
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HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02257.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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c.46-30399A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17716667
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A
 G
G
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c.46-30369A>G
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A
 T
T
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a0001c0001t0002g0069
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HG02165.hp1
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c.46-30312A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17716754
chr9:17716788 C
C
 G
G
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HG00438.hp2
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c.46-30278C>G
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chr9:17716886 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0117
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HG03017.hp2
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c.46-30180C>G
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G
 A
A
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HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
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HG02572.hp2
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HG02647.hp2
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NA20129.hp2
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c.46-30172G>A
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chr9:17716896 C
C
 T
T
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others(87): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
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HG02109.hp2
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HG02258.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-30170C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17716896
chr9:17716940 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-30126A>G
c.46-30126A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17716940
chr9:17717000 A
A
 C
C
 25 a0001c0001t0001g0019
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others(22): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0188
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a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0006g0215
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 25 HG01109.hp1
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HG01192.hp2
others(22): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG02109.hp1
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c.46-30066A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717000
chr9:17717059 C
C
 G
G
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a0001c0001t0004g0206
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HG02809.hp2
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c.46-30007C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717059
chr9:17717230 A
A
 G
G
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c.46-29836A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717230
chr9:17717247 G
G
 A
A
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.46-29819G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717247
chr9:17717269 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0008g0158
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HG03516.hp1
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c.46-29797C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717269
chr9:17717424 T
T
 TA
TA
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NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-29641dupA
c.46-29641dupA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17717424
chr9:17717475 AC
AC
 A
A
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HG00408.hp2
HG00438.hp2
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c.46-29589delC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17717475
chr9:17717553 G
G
 C
C
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a0001c0001t0001g0128
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HG02300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-29513G>C
c.46-29513G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717553
chr9:17717587 G
G
 C
C
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others(1): Show 
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a0001c0001t0005g0169
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others(1): Show 
HG00323.hp1
HG01099.hp2
HG02683.hp1
HG04199.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-29479G>C
c.46-29479G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717587
chr9:17717591 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0038
 1 HG00609.hp2
HG00609.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-29475C>G
c.46-29475C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717591
chr9:17717646 G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0184
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0207
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others(2): Show 
HG02280.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-29420G>A
c.46-29420G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717646
chr9:17717671 G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0207
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0020g0211
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HG02280.hp1
HG03453.hp1
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HG03516.hp2
HG03579.hp2
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c.46-29395G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717671
chr9:17717673 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0040
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NA18942.hp2
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c.46-29393G>A
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chr9:17717692 C
C
 T
T
 113 a0001c0001t0001g0015
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A
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c.46-29253delT
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chr9:17717871 C
C
 G
G
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a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
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c.46-29195C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17717871
chr9:17717945 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0194
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
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c.46-29121G>A
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chr9:17717956 C
C
 T
T
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a0001c0001t0008g0158
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HG03516.hp1
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c.46-29110C>T
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A
 T
T
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G
 A
A
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c.46-28993G>A
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T
 G
G
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HG02257.hp1
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G
 A
A
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others(22): Show 
HG01109.hp1
HG01109.hp2
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c.46-28754G>A
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chr9:17718317 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0082
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NA18943.hp2
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c.46-28749G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718317
chr9:17718318 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0082
 1 NA18943.hp2
NA18943.hp2
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c.46-28748A>G
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C
 G
G
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others(9): Show 
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a0001c0001t0001g0032
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others(9): Show 
HG02165.hp2
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c.46-28646C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718420
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G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0012
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NA18975.hp1
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c.46-28619G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718447
chr9:17718485 C
C
 A
A
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a0001c0001t0001g0006
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NA18953.hp2
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c.46-28581C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718485
chr9:17718495 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0095
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HG01175.hp2
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c.46-28571G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718495
chr9:17718496 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
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c.46-28570G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718496
chr9:17718613 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-28453A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718613
chr9:17718621 A
A
 C
C
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a0001c0001t0020g0211
a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0020g0211
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HG02280.hp1
HG03516.hp2
HG03579.hp2
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c.46-28445A>C
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chr9:17718737 A
A
 G
G
 16 a0001c0001t0001g0019
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others(13): Show 
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HG03139.hp2
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c.46-28329A>G
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chr9:17718832 C
C
 G
G
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a0001c0001t0002g0127
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HG01099.hp1
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c.46-28234C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718832
chr9:17718892 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0072
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NA18953.hp1
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c.46-28174G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718892
chr9:17718894 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03486.hp2
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c.46-28172A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718894
chr9:17718920 G
G
 A
A
 28 a0001c0001t0001g0015
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c.46-28146G>A
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A
 G
G
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others(9): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
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c.46-28118A>G
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A
 G
G
 14 a0001c0001t0001g0032
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others(11): Show 
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a0001c0001t0001g0054
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a0001c0001t0001g0142
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0002g0131
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 14 HG01884.hp1
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HG02165.hp2
others(11): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02165.hp2
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NA19088.hp2
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c.46-28115A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17718951
chr9:17719038 C
C
 G
G
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others(19): Show 
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a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
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HG00438.hp2
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others(19): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
HG00609.hp2
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NA19079.hp2
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c.46-28028C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719038
chr9:17719222 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0224
 1 HG02723.hp2
HG02723.hp2
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c.46-27844G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719222
chr9:17719350 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0255
 1 HG02895.hp2
HG02895.hp2
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c.46-27716A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719350
chr9:17719424 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0002g0119
 2 HG02145.hp2
HG03139.hp1
HG02145.hp2
HG03139.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-27642A>G
c.46-27642A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719424
chr9:17719639 A
A
 G
G
 11 a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
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others(8): Show 
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0054
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 11 HG02165.hp2
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others(8): Show 
HG02165.hp2
HG03654.hp2
HG04184.hp1
NA18747.hp2
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NA18962.hp1
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NA18999.hp2
NA19012.hp1
NA19086.hp1
NA19088.hp2
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c.46-27427A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719639
chr9:17719642 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0001g0095
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0006g0217
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 4 HG01175.hp2
HG02257.hp1
HG03130.hp1
others(1): Show 
HG01175.hp2
HG02257.hp1
HG03130.hp1
HG03453.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-27424A>G
c.46-27424A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719642
chr9:17719662 A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
 2 HG02717.hp1
HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-27404A>G
c.46-27404A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719662
chr9:17719697 G
G
 T
T
 21 a0001c0001t0001g0040
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a0001c0001t0001g0051
others(18): Show 
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0051
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a0001c0001t0001g0232
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a0001c0001t0002g0031
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a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0123
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a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0002g0245
a0001c0003t0002g0010
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 21 HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
others(18): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG03041.hp1
HG03710.hp1
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18948.hp1
NA18950.hp1
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NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-27369G>T
c.46-27369G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719697
chr9:17719709 C
C
 T
T
 36 a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
others(33): Show 
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0089
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a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0186
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a0001c0001t0001g0228
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0001g0240
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0002g0195
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c.46-27357C>T
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C
 G
G
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c.46-27276C>G
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G
 GA
GA
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c.46-27257dupA
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chr9:17719820 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0012
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NA18975.hp1
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c.46-27246C>G
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0044
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HG01258.hp1
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NA18939.hp2
NA18942.hp1
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NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
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c.46-27229T>G
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G
 A
A
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HG01192.hp2
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c.46-27222G>A
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AC
 A
A
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others(47): Show 
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HG00438.hp2
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HG02647.hp1
HG02647.hp2
HG02717.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp2
HG02895.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
HG02976.hp1
HG02976.hp2
HG03130.hp1
HG03130.hp2
HG03453.hp2
HG03516.hp1
HG03540.hp2
HG03579.hp1
HG06807.hp1
NA18906.hp1
NA18906.hp2
NA18939.hp1
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NA19030.hp1
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NA19064.hp1
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NA20129.hp1
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c.46-27086delC
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C
 A
A
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others(20): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01978.hp1
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NA18939.hp2
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NA18942.hp2
NA18948.hp1
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NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-27087C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17719979
chr9:17720057 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-27009G>C
c.46-27009G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17720057
chr9:17720094 A
A
 G
G
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others(2): Show 
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a0001c0001t0001g0049
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 5 NA18966.hp1
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others(2): Show 
NA18966.hp1
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T
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C
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a0001c0001t0001g0157
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C
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T
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C
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c.46-26875A>C
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C
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HG02723.hp1
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c.46-26808G>C
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T
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HG02622.hp1
NA18906.hp2
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c.46-26783C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17720283
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G
 A
A
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HG00735.hp1
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c.46-26751G>A
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C
 A
A
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a0001c0001t0008g0158
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HG03516.hp1
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c.46-26692C>A
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A
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T
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HG02735.hp1
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 T
T
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A
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A
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others(11): Show 
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 14 HG01109.hp2
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C
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T
 C
C
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HG01255.hp1
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G
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 G
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c.46-25700T>G
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T
 A
A
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c.46-25574T>A
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A
 G
G
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C
 T
T
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c.46-25521C>T
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A
 T
T
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c.46-25484A>T
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C
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 A
A
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c.46-25269T>A
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chr9:17721874 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0253
 1 HG03041.hp2
HG03041.hp2
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c.46-25192A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17721874
chr9:17722068 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0010g0218
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HG02257.hp1
HG03130.hp1
HG01175.hp2
HG02257.hp1
HG03130.hp1
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c.46-24998A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17722068
chr9:17722071 A
A
 G
G
 22 a0001c0001t0001g0040
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others(19): Show 
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a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0051
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c.46-24995A>G
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chr9:17722077 A
A
 G
G
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a0001c0001t0003g0237
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HG01361.hp2
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c.46-24989A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17722077
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G
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.46-24960G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17722106
chr9:17722165 C
C
 T
T
 38 a0001c0001t0001g0038
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others(35): Show 
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a0001c0001t0001g0043
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HG00408.hp2
HG00438.hp2
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c.46-24901C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17722165
chr9:17722431 T
T
 A
A
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others(35): Show 
HG00408.hp2
HG00438.hp2
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HG02630.hp1
HG02647.hp1
HG02717.hp2
HG02886.hp2
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HG03453.hp2
HG03471.hp2
HG03516.hp2
HG03540.hp2
HG03579.hp2
HG06807.hp1
NA18906.hp2
NA18939.hp1
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NA18989.hp2
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NA19240.hp1
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c.46-24635T>A
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T
 C
C
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CT
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c.46-24518dupT
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C
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T
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G
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A
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G
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G
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A
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T
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c.46-23834G>T
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A
 T
T
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.46-23780A>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0215
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HG01192.hp2
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c.46-23766G>A
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C
 A
A
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 T
T
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a0001c0001t0005g0047
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NA18612.hp2
NA18948.hp2
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G
 C
C
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c.46-23334G>C
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GTGTT
 G
G
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G
 GT
GT
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c.46-23308dupT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17723750
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T
 A
A
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c.46-23261T>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.46-23125C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17723941
chr9:17724098 T
T
 G
G
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 22 HG01255.hp2
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others(19): Show 
HG01255.hp2
HG01258.hp1
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c.46-22968T>G
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G
 A
A
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c.46-22956G>A
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A
 G
G
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c.46-22952A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0074
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HG02074.hp1
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c.46-22947T>C
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T
 C
C
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c.46-22836T>C
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A
 G
G
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c.46-22808A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
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HG02809.hp2
HG02895.hp2
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c.46-22782T>C
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A
 G
G
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HG01255.hp2
HG01258.hp1
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NA18948.hp1
NA18950.hp1
NA18961.hp2
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-22767A>G
c.46-22767A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17724299
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0068
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HG02015.hp1
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c.46-22614C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0021
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HG03041.hp1
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c.46-22613C>T
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A
 G
G
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C
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c.46-22443A>C
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A
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C
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G
 T
T
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HG02717.hp1
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T
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C
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G
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A
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T
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C
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 G
G
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G
 A
A
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 G
G
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C
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A
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A
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C
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HG03486.hp2
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A
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A
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T
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C
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G
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 A
A
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A
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c.46-20483G>A
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A
 C
C
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HG01192.hp2
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A
 G
G
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A
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G
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a0001c0001t0001g0054
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HG03654.hp2
HG04184.hp1
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c.46-20339A>G
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T
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A
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-20310T>A
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G
 T
T
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HG02717.hp1
HG03486.hp2
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c.46-20285G>T
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G
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T
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c.46-20220G>T
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G
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A
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a0001c0001t0001g0141
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HG03669.hp2
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c.46-20187G>A
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C
 T
T
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G
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A
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 A
A
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c.46-19912G>A
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G
 T
T
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HG03516.hp1
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c.46-19849G>T
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 G
G
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A
 C
C
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a0001c0001t0004g0206
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HG02809.hp2
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c.46-18910A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17728156
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.46-18903C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17728163
chr9:17728170 C
C
 T
T
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c.46-18896C>T
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T
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G
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HG03654.hp1
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chr9:17728192 A
A
 G
G
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c.46-18874A>G
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T
 C
C
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T
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A
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G
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G
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
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HG02717.hp1
HG03486.hp2
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c.46-17697T>C
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C
 A
A
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.46-17679C>A
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G
 A
A
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chr9:17729407 G
G
 C
C
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a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0002g0247
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T
 C
C
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0020g0211
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c.46-17465G>A
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T
 G
G
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HG01192.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0021g0258
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c.46-17424G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17729642
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T
 C
C
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G
 A
A
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c.46-17334G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17729732
chr9:17729815 C
C
 G
G
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T
 A
A
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a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0001g0109
a0001c0001t0015g0041
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NA18944.hp1
NA18986.hp1
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0109
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a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0001g0109
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NA18944.hp1
NA18986.hp1
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 G
G
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NA18944.hp1
NA18986.hp1
NA18994.hp2
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C
 G
G
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GT
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c.46-17083dupT
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C
 A
A
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c.46-17076C>A
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A
 T
T
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HG03139.hp1
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c.46-16956A>T
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A
 T
T
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c.46-16810A>T
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C
 T
T
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a0001c0002t0013g0162
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c.46-16671C>T
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A
 C
C
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G
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HG02809.hp2
HG02895.hp2
HG03139.hp2
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c.46-16402A>G
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G
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HG03486.hp1
NA20129.hp2
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c.46-16321A>G
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 TG
TG
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A
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c.46-15690A>T
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T
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c.46-15689A>T
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G
 C
C
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HG02717.hp1
HG03486.hp2
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c.46-15648G>C
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A
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C
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CAG
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C
 CAG
CAG
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chr9:17731457 C
C
 G
G
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c.46-15609C>G
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A
 G
G
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HG03130.hp2
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c.46-15545A>G
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c.46-15532A>G
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T
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c.46-14823delT
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A
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C
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c.46-14777A>C
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A
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.46-14729G>A
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T
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a0001c0001t0003g0035
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HG01071.hp2
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c.46-14692G>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-14576A>G
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chr9:17732557 C
C
 T
T
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HG00323.hp1
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c.46-14509C>T
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A
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0157
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c.46-14237A>G
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chr9:17732883 A
A
 G
G
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T
 A
A
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c.46-14178T>A
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 C
C
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NA19011.hp2
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c.46-14153G>C
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G
 T
T
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c.46-14135G>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-14098G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17732968
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0148
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HG02717.hp1
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c.46-14069C>T
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C
 T
T
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HG03453.hp1
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c.46-14044C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17733022
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C
 A
A
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HG00408.hp1
HG00438.hp1
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c.46-13986C>A
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 T
T
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a0001c0001t0001g0008
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NA18986.hp1
NA18991.hp1
NA18994.hp2
NA19002.hp2
NA19010.hp1
NA19011.hp2
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NA20300.hp2
NA20752.hp1
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c.46-13942G>T
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C
 A
A
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HG03486.hp2
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c.46-13907C>A
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A
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T
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A
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c.46-13758G>A
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C
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NA18989.hp2
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c.46-13732G>C
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T
 C
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C
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 T
T
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HG02145.hp2
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c.46-13696C>T
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A
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A
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c.46-13503A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.46-13481A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17733585
chr9:17733603 A
A
 G
G
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c.46-13463A>G
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T
 A
A
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c.46-13449T>A
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chr9:17733651 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0008
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others(98): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
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NA19086.hp2
NA19087.hp2
NA19240.hp1
NA20300.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-13415T>C
c.46-13415T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17733651
chr9:17733715 C
C
 T
T
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others(22): Show 
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HG01255.hp2
HG01258.hp1
others(22): Show 
HG00438.hp2
HG01255.hp2
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NA18961.hp2
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18971.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-13351C>T
c.46-13351C>T
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chr9:17733736 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-13330A>G
c.46-13330A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17733736
chr9:17733757 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp1
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-13309C>T
c.46-13309C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17733757
chr9:17733758 G
G
 A
A
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HG02886.hp2
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c.46-13308G>A
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T
 C
C
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c.46-13277T>C
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G
 A
A
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NA18950.hp2
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CA
 C
C
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c.46-13188delA
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chr9:17733887 T
T
 C
C
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c.46-13179T>C
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C
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c.46-13165G>C
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T
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c.46-13144G>T
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C
 G
G
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.46-13013G>A
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C
 A
A
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c.46-13002C>A
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c.46-12934C>T
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A
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G
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HG00140.hp1
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c.46-12780A>G
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C
 G
G
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C
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G
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c.46-12646A>G
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T
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c.46-12618C>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
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c.46-12618C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17734448
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A
 G
G
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c.46-12573A>G
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G
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A
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c.46-12567G>A
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A
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c.46-12560G>A
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C
 T
T
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c.46-12424C>T
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A
 G
G
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HG02809.hp2
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c.46-12387A>G
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C
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0206
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HG02809.hp2
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c.46-12361C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17734705
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A
 G
G
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HG01081.hp1
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c.46-12355A>G
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 T
T
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NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp2
NA18972.hp2
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NA20752.hp1
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c.46-12293A>T
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G
 C
C
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others(1): Show 
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c.46-12278G>C
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T
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G
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c.46-11981A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0007g0143
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HG04184.hp1
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c.46-11962A>G
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chr9:17735139 G
G
 C
C
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a0001c0001t0001g0125
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a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0136
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HG02040.hp1
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HG00673.hp2
HG02040.hp1
NA18939.hp1
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c.46-11927G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17735139
chr9:17735220 G
G
 A
A
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c.46-11846G>A
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C
 T
T
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HG03139.hp1
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 G
G
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HG00642.hp2
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c.46-11666A>G
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G
 C
C
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NA18942.hp2
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c.46-11644G>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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c.46-11605C>T
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chr9:17735485 C
C
 T
T
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 73 HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
others(70): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00408.hp1
HG00438.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp2
HG00673.hp1
HG00733.hp2
HG00735.hp2
HG01175.hp1
HG01243.hp2
HG01255.hp2
HG01258.hp1
HG01361.hp1
HG01433.hp1
HG01515.hp2
HG01978.hp1
HG02015.hp2
HG02027.hp1
HG02056.hp2
HG02148.hp1
HG02165.hp1
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NA18612.hp1
NA18939.hp2
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NA18942.hp2
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NA18944.hp1
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NA18950.hp2
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NA18968.hp1
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c.46-11581C>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0006g0215
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HG01192.hp2
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c.46-11569G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17735497
chr9:17735514 AT
AT
 A
A
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c.46-11542delT
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chr9:17735603 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
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c.46-11463T>C
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G
 A
A
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c.46-11357G>A
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T
 C
C
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c.46-11341T>C
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A
 G
G
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HG00609.hp2
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c.46-11289A>G
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chr9:17735861 A
A
 G
G
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a0001c0001t0004g0205
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HG03486.hp2
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c.46-11205A>G
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C
 A
A
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HG03139.hp1
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c.46-11194C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17735872
chr9:17735872 C
C
 G
G
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T
 C
C
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A
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c.46-10722T>G
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C
 A
A
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a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0020g0211
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HG02280.hp1
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c.46-10683C>A
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C
 T
T
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 T
T
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HG02258.hp1
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c.46-10610A>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0010g0218
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HG02257.hp1
HG03130.hp1
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c.46-10535C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0252
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HG02572.hp2
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c.46-10474A>G
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A
 T
T
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a0001c0001t0007g0143
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HG04184.hp1
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c.46-10409A>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
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c.46-10369A>G
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A
 G
G
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c.46-10289A>G
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A
 G
G
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HG02895.hp2
HG02809.hp2
HG02895.hp2
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c.46-10215A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0007g0143
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HG04184.hp1
HG03654.hp2
HG04184.hp1
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c.46-10026A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0206
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HG02809.hp2
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c.46-10009A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737057
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A
 C
C
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HG01243.hp1
HG02895.hp2
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c.46-9955A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737111
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G
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others(21): Show 
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c.46-9915A>G
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C
 T
T
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c.46-9884C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737182
chr9:17737331 T
T
 A
A
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a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0207
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HG03453.hp1
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c.46-9735T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737331
chr9:17737351 T
T
 A
A
 22 a0001c0001t0001g0040
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HG00438.hp2
HG01255.hp2
HG01978.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-9715T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737351
chr9:17737421 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0180
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HG00323.hp1
HG01175.hp1
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c.46-9645T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737421
chr9:17737427 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0174
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HG02886.hp1
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c.46-9639C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737427
chr9:17737433 T
T
 C
C
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HG01433.hp2
HG01884.hp2
HG02559.hp1
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HG03471.hp1
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c.46-9633T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737433
chr9:17737441 C
C
 G
G
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.46-9625C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737441
chr9:17737706 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0206
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HG02809.hp2
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c.46-9360G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737706
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C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0234
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HG03579.hp1
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c.46-9264C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737802
chr9:17737806 T
T
 G
G
 8 a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0230
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HG02559.hp2
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NA20129.hp2
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c.46-9260T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17737806
chr9:17737895 C
C
 G
G
 181 a0001c0001t0001g0007
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a0001c0001t0001g0008
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HG00280.hp2
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c.46-9171C>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0117
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HG03017.hp2
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c.46-9165C>T
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G
 A
A
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c.46-8732G>A
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G
 T
T
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a0001c0001t0002g0026
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HG01081.hp1
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c.46-8694G>T
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C
 G
G
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c.46-8599C>G
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 A
A
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c.46-8586G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738480
chr9:17738511 C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.46-8555C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738511
chr9:17738513 TATGTGTG
others(65): Show 
TATGTGTGTGTATATACATACATATATACATAAGTGTGTGTGTATATACA
TACATATATATATAGAGAGAGAG
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
 1 HG02145.hp2
HG02145.hp2
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others(72): Show 
c.46-8551_46-8480delTGTGTGTGTATATACATACATATATACATA
AGTGTGTGTGTATATACATACATATATATATAGAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738513
chr9:17738514 A
A
 ATG
ATG
 9 a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0003g0002
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a0001c0001t0003g0002
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c.46-8544_46-8543dupGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738514
chr9:17738518 G
G
 T
T
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HG00408.hp2
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c.46-8548G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738518
chr9:17738525 TATAC
TATAC
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
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others(1): Show 
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a0001c0001t0001g0194
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others(1): Show 
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 intron_variant MODIFIER c.46-8533_46-8530del
others(4): Show 
c.46-8533_46-8530delCATA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738525
chr9:17738529 C
C
 CATACATA
others(107): Show 
CATACATATATACATATGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTG
TATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATACATACATATATACA
TATGTGTGTGTGTAT
 1 a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0004g0255
 1 HG02895.hp2
HG02895.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8522_46-8521ins
others(114): Show 
c.46-8522_46-8521insTGTGTGTATATACATACATATATACATATG
TGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATACATACATATA
TACATATGTGTGTGTGTATATACATATATACATA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738529
chr9:17738529 C
C
 CATACATA
others(107): Show 
CATACATATATACATGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTG
TATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATACATACATATATACA
TATGTGTGTGTGTAT
 1 a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0022
 1 HG04184.hp2
HG04184.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8523_46-8522ins
others(114): Show 
c.46-8523_46-8522insGTGTGTGTATATACATACATATATACATAT
GTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATACATACATAT
ATACATATGTGTGTGTGTATATACATATATACAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738529
chr9:17738537 TATACATA
others(21): Show 
TATACATAAGTGTGTGTGTATATACATAC
 T
T
 9 a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
others(6): Show 
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0028
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a0001c0001t0003g0098
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others(6): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
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HG01516.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.46-8525_46-8498del
others(28): Show 
c.46-8525_46-8498delCATAAGTGTGTGTGTATATACATACATA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738537
chr9:17738544 AAG
AAG
 A
A
 69 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0012
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a0001c0001t0001g0012
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chr9:17738565 C
C
 CATAT
CATAT
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a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0187
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a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0187
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chr9:17738569 T
T
 TATACATA
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TATACATATGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATA
CATACATATATACATATGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTG
TGTGTGTATATACATAC
 1 a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0191
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NA20300.hp1
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TATGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATACATA
CATATATACATATGTGTGTGTGTATATACATACATA
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chr9:17738569 T
T
 TATACATA
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TATACATATGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATA
CATACATATATACATATGTGTGTGTGTATATACATATATACATATGTGTG
TGTGTATATACATAC
 53 a0001c0001t0001g0006
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a0001c0001t0001g0012
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c.46-8494_46-8493insCATATGTGTGTATATACATACATATATACA
TATGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTGTATATACA
TATATACATATGTGTGTGTGTATATACATACATA
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chr9:17738569 T
T
 TATACATA
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TATACATATGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATA
CATACATATATACATGTGTGTGTGTATATACATATATACATATGTGTGTG
TGTATATACATAC
 5 a0001c0001t0001g0052
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a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0173
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HG00323.hp2
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c.46-8494_46-8493insCATATGTGTGTATATACATACATATATACA
TATGTGTGTGTATATACATACATATATACATGTGTGTGTGTATATACATA
TATACATATGTGTGTGTGTATATACATACATA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738569
chr9:17738569 T
T
 TATACATA
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TATACATATGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTGTA
TATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATACATAC
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c.46-8494_46-8493insCATATGTGTGTGTATATACATACATATATA
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738569
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T
 TATACATA
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TATACATATGTGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTG
TATATACATAC
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a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0207
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HG03139.hp1
HG03516.hp2
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c.46-8494_46-8493insCATATGTGTGTGTGTATATACATACATATA
TACATATGTGTGTGTGTATATACATACATA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738569
chr9:17738571 T
T
 TACATATG
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TACATATGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATACA
TACATATATACATATGTGTGTGTGTATATACATATATACATATGTGTGTG
TGTATATACATAC
 1 a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0002g0247
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HG03195.hp2
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c.46-8494_46-8493insCATATGTGTGTATATACATACATATATACA
TATGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTGTATATACA
TATATACATATGTGTGTGTGTATATACATACA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738571
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T
 TACATATG
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TACATATGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTATATACA
TATATACATATGTGTGTGTGTATATACATATATACATATGTGTGTGTGTA
TATACATAC
 2 a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0006g0214
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c.46-8494_46-8493insCATATGTGTGTATATACATACATATATACA
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TACATATGTGTGTGTGTATATACATACA
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T
 TACATATG
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TACATATGTGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTGTA
TATACATACATATATACATATGTGTGTGTGTATATACATAC
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a0001c0001t0011g0257
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HG03139.hp2
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c.46-8494_46-8493insCATATGTGTGTGTGTATATACATACATATA
TACATATGTGTGTGTGTATATACATACATATATACATATGTGTGTGTGTA
TATACATACA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738571
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T
 TAGAG
TAGAG
 3 a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0072
a0001c0001t0001g0083
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0072
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NA18953.hp1
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HG00558.hp1
NA18953.hp1
NA19009.hp1
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c.46-8492_46-8491insGAGA
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T
 G
G
 8 a0001c0001t0001g0083
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a0001c0001t0001g0106
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a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0070
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c.46-8491T>G
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T
 TAG
TAG
 4 a0001c0001t0001g0242
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a0001c0001t0002g0204
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HG02717.hp1
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others(2): Show 
c.46-8473_46-8472dupGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738575
chr9:17738575 T
T
 TAGAG
TAGAG
 30 a0001c0001t0001g0032
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others(27): Show 
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0040
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 30 HG00438.hp2
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others(27): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
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NA18962.hp2
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c.46-8447T>C
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TTA
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T
 TTATA
TTATA
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T
 TTATATA
TTATATA
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c.46-8429_46-8424dupTATATA
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T
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T
 TTATATAT
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T
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HG00438.hp1
HG00642.hp1
HG01109.hp2
HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG02148.hp2
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HG02300.hp1
NA18939.hp1
NA18943.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8435_46-8424dup
others(12): Show 
c.46-8435_46-8424dupTATATATATATA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738626 T
T
 TTATATAT
others(7): Show 
TTATATATATATATA
 1 a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0021g0258
 1 HG03579.hp2
HG03579.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8437_46-8424dup
others(14): Show 
c.46-8437_46-8424dupTATATATATATATA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738626 T
T
 TTATATAT
others(11): Show 
TTATATATATATATATATA
 1 a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0002g0239
 1 HG01255.hp2
HG01255.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(18): Show 
c.46-8424_46-8423insTATATATATATATATATA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738626 T
T
 TTTTA
TTTTA
 6 a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0003g0155
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
 6 HG02809.hp1
HG03139.hp1
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HG02809.hp1
HG03139.hp1
HG03516.hp2
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NA20805.hp2
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c.46-8439_46-8438insTTAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738626 T
T
 TTTTATA
TTTTATA
 26 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0080
others(23): Show 
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0002g0004
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0178
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a0001c0001t0019g0220
a0003c0005t0014g0137
 26 HG01070.hp1
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others(23): Show 
HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01081.hp2
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NA18972.hp1
NA18975.hp1
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NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8439_46-8438ins
others(6): Show 
c.46-8439_46-8438insTTATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738626 T
T
 TTTTATAT
others(1): Show 
TTTTATATA
 18 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0049
others(15): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0017g0112
a0001c0006t0001g0153
 18 HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00639.hp1
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HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00639.hp1
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NA19077.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8439_46-8438ins
others(8): Show 
c.46-8439_46-8438insTTATATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738626 T
T
 TTTTATAT
others(3): Show 
TTTTATATATA
 8 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0052
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0002g0079
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 8 HG00558.hp2
HG01255.hp1
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HG00558.hp2
HG01255.hp1
HG02074.hp1
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NA18944.hp2
NA19088.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8439_46-8438ins
others(10): Show 
c.46-8439_46-8438insTTATATATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738626 T
T
 TTTTATAT
others(5): Show 
TTTTATATATATA
 5 a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0173
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0173
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0002g0156
 5 HG00323.hp2
HG01192.hp1
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others(2): Show 
HG00323.hp2
HG01192.hp1
HG01261.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.46-8439_46-8438ins
others(12): Show 
c.46-8439_46-8438insTTATATATATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738626 T
T
 TTTTATAT
others(7): Show 
TTTTATATATATATA
 1 a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0061
 1 HG02683.hp2
HG02683.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8439_46-8438ins
others(14): Show 
c.46-8439_46-8438insTTATATATATATAT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738626
chr9:17738628 A
A
 T
T
 2 a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0206
 2 HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8438A>T
c.46-8438A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738628
chr9:17738641 T
T
 TATAGAGA
others(7): Show 
TATAGAGAGAGAGAG
 1 a0001c0001t0001g0180
a0001c0001t0001g0180
 1 HG00323.hp1
HG00323.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(14): Show 
c.46-8424_46-8423insTAGAGAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATAGA
others(3): Show 
TATATAGAGAG
 1 a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0101
 1 NA20905.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(10): Show 
c.46-8424_46-8423insTATAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATAGA
others(7): Show 
TATATAGAGAGAGAG
 3 a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0001g0145
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0011g0257
 3 HG02165.hp1
HG03139.hp2
NA18970.hp2
HG02165.hp1
HG03139.hp2
NA18970.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(14): Show 
c.46-8424_46-8423insTATAGAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATATA
others(3): Show 
TATATATAGAG
 4 a0001c0001t0001g0088
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0002g0123
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0088
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0179
 4 HG03704.hp1
HG06807.hp2
NA18942.hp1
others(1): Show 
HG03704.hp1
HG06807.hp2
NA18942.hp1
NA18966.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(10): Show 
c.46-8424_46-8423insTATATAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATATA
others(5): Show 
TATATATAGAGAG
 2 a0001c0001t0001g0130
a0001c0001t0006g0217
a0001c0001t0001g0130
a0001c0001t0006g0217
 2 HG03453.hp2
NA18977.hp2
HG03453.hp2
NA18977.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(12): Show 
c.46-8424_46-8423insTATATAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATATA
others(7): Show 
TATATATAGAGAGAG
 12 a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0066
others(9): Show 
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0082
a0001c0001t0001g0106
a0001c0001t0001g0115
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0002g0037
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a0001c0001t0006g0212
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 12 HG00609.hp2
HG00735.hp2
HG01175.hp1
others(9): Show 
HG00609.hp2
HG00735.hp2
HG01175.hp1
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NA18612.hp1
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NA19011.hp2
NA19088.hp2
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(14): Show 
c.46-8424_46-8423insTATATAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATATA
others(9): Show 
TATATATAGAGAGAGAG
 5 a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0194
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
a0001c0001t0002g0045
 5 HG02015.hp2
HG02055.hp2
HG02273.hp1
others(2): Show 
HG02015.hp2
HG02055.hp2
HG02273.hp1
HG02451.hp1
HG03669.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(16): Show 
c.46-8424_46-8423insTATATAGAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATATA
others(21): Show 
TATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
 2 a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0206
 2 HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(28): Show 
c.46-8424_46-8423insTATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATATA
others(3): Show 
TATATATATAG
 13 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0043
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0087
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0151
a0001c0001t0005g0050
a0001c0003t0002g0039
 13 HG00408.hp1
HG00642.hp2
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others(10): Show 
HG00408.hp1
HG00642.hp2
HG00673.hp2
HG00733.hp1
HG00733.hp2
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NA18991.hp1
NA19077.hp2
NA20752.hp2
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c.46-8424_46-8423insTATATATAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
chr9:17738641 T
T
 TATATATA
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a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0125
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HG01516.hp1
HG02040.hp1
HG02630.hp1
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chr9:17738641 T
T
 TATATATA
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a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0053
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HG00558.hp1
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c.46-8424_46-8423insTATATATAGAGAGA
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T
 TATATATA
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a0001c0001t0001g0147
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0030
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HG00639.hp2
HG02280.hp2
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c.46-8424_46-8423insTATATATATAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
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T
 TATATATA
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a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0078
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 18 HG00408.hp2
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HG00408.hp2
HG00673.hp1
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NA19002.hp2
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c.46-8424_46-8423insTATATATATAGAGA
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T
 TATATATA
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HG02976.hp2
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T
 TATATATA
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a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0100
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HG01192.hp2
HG01243.hp2
NA18950.hp2
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T
 TATATATA
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a0001c0001t0003g0076
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a0001c0001t0001g0117
a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0007g0096
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HG01515.hp1
HG03017.hp2
HG03942.hp1
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c.46-8424_46-8423insTATATATATATAGAGA
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T
 TATATATA
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TATATATATATATAGAGAG
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a0001c0001t0001g0251
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NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8424_46-8423ins
others(18): Show 
c.46-8424_46-8423insTATATATATATAGAGAGA
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T
 TATATATA
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TATATATATATATATAG
 2 a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0007g0165
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HG04228.hp2
HG03654.hp2
HG04228.hp2
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others(16): Show 
c.46-8424_46-8423insTATATATATATATAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
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T
 TATATATA
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TATATATATATATATATATAGAGAGAGAGAGAG
 1 a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0119
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HG02145.hp2
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c.46-8424_46-8423insTATATATATATATATATAGAGAGAGAGAGA
GA
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TAG
 T
T
 9 a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0001g0029
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HG02056.hp1
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738641
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G
 T
T
 48 a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
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 48 HG00438.hp2
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others(45): Show 
HG00438.hp2
HG01071.hp2
HG01074.hp1
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NA20129.hp2
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c.46-8423G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738643
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0029
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others(27): Show 
HG00280.hp2
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HG01109.hp1
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c.46-8421G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738645
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G
 T
T
 12 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0091
a0001c0001t0001g0141
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a0001c0001t0001g0091
a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0102
a0001c0001t0002g0103
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 12 HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG01433.hp2
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HG00280.hp2
HG01099.hp1
HG01433.hp2
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c.46-8419G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738647
chr9:17738649 G
G
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0019
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a0001c0001t0002g0127
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0002g0127
a0001c0001t0006g0221
 4 HG01099.hp1
HG01433.hp2
HG02622.hp2
others(1): Show 
HG01099.hp1
HG01433.hp2
HG02622.hp2
NA20129.hp2
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c.46-8417G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738649
chr9:17738661 G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0011g0257
 3 HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG03139.hp2
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8405G>C
c.46-8405G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738661
chr9:17738661 G
G
 GAC
GAC
 3 a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0175
 3 HG01192.hp1
HG02683.hp2
HG03654.hp1
HG01192.hp1
HG02683.hp2
HG03654.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8404_46-8403ins
others(2): Show 
c.46-8404_46-8403insCA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738661
chr9:17738661 G
G
 GAGAC
GAGAC
 10 a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0064
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0173
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0144
a0001c0001t0002g0156
a0001c0001t0017g0112
 10 HG00323.hp2
HG01255.hp1
HG01261.hp1
others(7): Show 
HG00323.hp2
HG01255.hp1
HG01261.hp1
HG01978.hp2
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HG02735.hp2
HG03491.hp2
HG03942.hp2
NA18944.hp2
NA19088.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8402_46-8401ins
others(4): Show 
c.46-8402_46-8401insCAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738661
chr9:17738661 G
G
 GAGAGAC
GAGAGAC
 14 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
others(11): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0005g0171
a0001c0006t0001g0153
 14 HG00140.hp2
HG00558.hp2
HG01099.hp2
others(11): Show 
HG00140.hp2
HG00558.hp2
HG01099.hp2
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HG02735.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.46-8400_46-8399ins
others(6): Show 
c.46-8400_46-8399insCAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738661
chr9:17738661 G
G
 GAGAGAGA
others(1): Show 
GAGAGAGAC
 25 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0084
others(22): Show 
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0002g0004
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0178
a0003c0005t0014g0137
 25 HG00280.hp1
HG00639.hp1
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others(22): Show 
HG00280.hp1
HG00639.hp1
HG01081.hp2
HG01258.hp1
HG02040.hp2
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HG02300.hp2
HG02683.hp1
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HG04184.hp2
HG04199.hp1
HG04228.hp1
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NA18972.hp1
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NA19087.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8398_46-8397ins
others(8): Show 
c.46-8398_46-8397insCAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738661
chr9:17738661 G
G
 GAGAGAGA
others(3): Show 
GAGAGAGAGAC
 7 a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0159
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0007g0143
 7 HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01884.hp1
others(4): Show 
HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01884.hp1
HG02109.hp2
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HG04184.hp1
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8396_46-8395ins
others(10): Show 
c.46-8396_46-8395insCAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738661
chr9:17738661 G
G
 GAGAGAGA
others(5): Show 
GAGAGAGAGAGAC
 3 a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0019g0220
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0019g0220
 3 HG02145.hp1
HG02895.hp2
HG03130.hp1
HG02145.hp1
HG02895.hp2
HG03130.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8394_46-8393ins
others(12): Show 
c.46-8394_46-8393insCAGAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738661
chr9:17738661 G
G
 GAGAGAGA
others(7): Show 
GAGAGAGAGAGAGAC
 3 a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
 3 HG02809.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
HG02809.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8392_46-8391ins
others(14): Show 
c.46-8392_46-8391insCAGAGAGAGAGAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17738661
chr9:17738673 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0002t0005g0226
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0205
a0001c0002t0005g0226
 3 HG02717.hp1
HG03098.hp1
HG03486.hp2
HG02717.hp1
HG03098.hp1
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8393G>A
c.46-8393G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738673
chr9:17738783 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0003g0200
 1 HG02622.hp1
HG02622.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8283C>G
c.46-8283C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738783
chr9:17738852 T
T
 C
C
 10 a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0002g0195
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0008g0196
 10 HG01109.hp1
HG02109.hp1
HG02622.hp1
others(7): Show 
HG01109.hp1
HG02109.hp1
HG02622.hp1
HG02647.hp1
HG02717.hp2
HG02886.hp2
HG02976.hp1
HG03540.hp2
NA18906.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-8214T>C
c.46-8214T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17738852
chr9:17738859 C
C
 T
T
 68 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
others(65): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0135
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0173
a0001c0001t0001g0175
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0004
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0144
a0001c0001t0002g0156
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0017g0112
a0001c0001t0019g0220
a0001c0006t0001g0153
a0003c0005t0014g0137
 68 HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00323.hp2
others(65): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00323.hp2
HG00558.hp2
HG00639.hp1
HG01070.hp1
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HG01081.hp2
HG01099.hp2
HG01175.hp2
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A
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A
 G
G
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c.46-8122A>G
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T
 A
A
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c.46-8084T>A
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T
 C
C
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NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-8058T>C
c.46-8058T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17739008
chr9:17739136 A
A
 G
G
 6 a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0170
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a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0180
a0001c0001t0001g0184
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others(3): Show 
HG00323.hp1
HG01175.hp1
HG02280.hp1
HG03453.hp1
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HG03579.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-7930A>G
c.46-7930A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17739136
chr9:17739212 T
T
 A
A
 28 a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
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others(25): Show 
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0044
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 28 HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(25): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-7854T>A
c.46-7854T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17739212
chr9:17739220 T
T
 TGTCAACA
others(8): Show 
TGTCAACAGAGTCATC
 1 a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0118
 1 HG01261.hp2
HG01261.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-7845_46-7831dup
others(15): Show 
c.46-7845_46-7831dupGTCAACAGAGTCATC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17739220
chr9:17739569 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0037
a0001c0001t0002g0037
 1 NA20300.hp2
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-7497A>T
c.46-7497A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17739569
chr9:17739582 C
C
 G
G
 6 a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0009g0009
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0019g0220
 6 HG02145.hp1
HG02257.hp1
HG02809.hp1
others(3): Show 
HG02145.hp1
HG02257.hp1
HG02809.hp1
HG03130.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-7484C>G
c.46-7484C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17739582
chr9:17739624 A
A
 AT
AT
 240 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
others(237): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
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a0001c0001t0001g0166
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a0001c0001t0001g0170
a0001c0001t0001g0173
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C
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c.46-7402G>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0018g0216
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HG03098.hp2
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T
 G
G
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c.46-7294T>G
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C
 T
T
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c.46-7257C>T
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C
 T
T
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c.46-7229C>T
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G
 A
A
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c.46-7228G>A
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A
 T
T
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a0001c0001t0001g0227
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HG02055.hp1
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c.46-7134A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17739932
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A
 G
G
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c.46-6956A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17740110
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 A
A
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c.46-6912T>A
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 T
T
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a0001c0001t0001g0061
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HG02683.hp2
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c.46-6880A>T
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 C
C
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c.46-6837T>C
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G
 C
C
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HG01884.hp1
HG02109.hp2
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c.46-6613G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17740453
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A
 AGTATT
AGTATT
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others(3): Show 
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0187
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others(3): Show 
HG01433.hp2
HG01884.hp2
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others(5): Show 
c.46-6575_46-6571dupGTATT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17740465
chr9:17740465 A
A
 AGTATTGT
others(3): Show 
AGTATTGTATT
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a0001c0001t0003g0200
a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
HG02622.hp1
HG02630.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-6580_46-6571dup
others(10): Show 
c.46-6580_46-6571dupGTATTGTATT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17740465
chr9:17740465 A
A
 AGTATTGT
others(8): Show 
AGTATTGTATTGTATT
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a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0098
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HG03225.hp2
HG00642.hp2
HG03225.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-6585_46-6571dup
others(15): Show 
c.46-6585_46-6571dupGTATTGTATTGTATT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17740465
chr9:17740465 A
A
 AGTATTGT
others(13): Show 
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a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0035
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HG03831.hp2
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HG01071.hp2
HG03831.hp2
HG04199.hp2
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others(20): Show 
c.46-6590_46-6571dupGTATTGTATTGTATTGTATT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17740465
chr9:17740465 A
A
 AGTATTGT
others(18): Show 
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others(1): Show 
a0001c0001t0003g0028
a0001c0001t0003g0094
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HG00733.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.46-6595_46-6571dup
others(25): Show 
c.46-6595_46-6571dupGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17740465
chr9:17740465 AGTATT
AGTATT
 A
A
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a0001c0001t0001g0020
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others(54): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
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c.46-6575_46-6571delGTATT
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 A
A
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a0001c0001t0004g0198
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HG02109.hp1
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others(10): Show 
c.46-6580_46-6571delGTATTGTATT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17740465
chr9:17740572 C
C
 T
T
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a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0196
a0001c0001t0008g0253
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HG03041.hp2
HG02976.hp1
HG03041.hp2
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c.46-6494C>T
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0190
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HG00642.hp2
HG00733.hp1
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c.46-6447C>T
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TTTAAA
 T
T
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0044
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HG02572.hp2
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HG03139.hp2
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chr9:17740952 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0194
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a0001c0001t0001g0194
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HG02055.hp2
HG02451.hp1
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c.46-6114T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0070
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a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0020g0211
a0001c0003t0002g0010
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others(30): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
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HG01261.hp2
HG01358.hp2
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HG02145.hp2
HG02148.hp1
HG02148.hp2
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
HG03041.hp1
HG03710.hp1
HG06807.hp2
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18944.hp2
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
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c.46-6045C>T
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C
 G
G
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NA18948.hp2
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NA20905.hp1
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c.46-5939C>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0093
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HG01258.hp2
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HG00140.hp1
HG01243.hp2
HG01258.hp2
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NA20752.hp1
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c.46-5838A>G
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A
 G
G
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G
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A
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c.46-5744G>A
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T
 C
C
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A
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G
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HG03491.hp1
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c.46-5687A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0146
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c.46-5595T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0054
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HG03654.hp2
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c.46-5572C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0019g0220
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HG02145.hp1
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c.46-5435A>G
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G
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c.46-5392T>G
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A
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A
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G
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 A
A
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c.46-5267G>A
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T
 G
G
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a0001c0001t0002g0018
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HG00735.hp1
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c.46-5249T>G
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C
 T
T
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 C
C
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c.46-5196T>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0084
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HG04228.hp1
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c.46-5082C>T
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A
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G
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c.46-4800A>G
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G
 C
C
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c.46-4722G>C
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G
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A
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c.46-4522G>A
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chr9:17742669 C
C
 T
T
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c.46-4397C>T
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G
 A
A
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HG02257.hp1
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c.46-4390G>A
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chr9:17742759 A
A
 G
G
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a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
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c.46-4307A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0231
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HG01109.hp1
HG02257.hp2
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c.46-4304C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17742762
chr9:17742907 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.46-4159G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17742907
chr9:17742998 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.46-4068A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17742998
chr9:17743081 C
C
 T
T
 33 a0001c0001t0001g0044
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a0001c0001t0002g0017
others(30): Show 
a0001c0001t0001g0044
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a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0045
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a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0020g0211
a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
a0002c0004t0003g0111
 33 HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(30): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG00735.hp1
HG01255.hp2
HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02145.hp2
HG02148.hp1
HG02148.hp2
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
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NA18989.hp1
NA18991.hp2
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743081
chr9:17743097 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0215
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HG01192.hp2
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c.46-3969A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743097
chr9:17743218 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0034
 1 HG02056.hp2
HG02056.hp2
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c.46-3848A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743218
chr9:17743235 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0215
 1 HG01192.hp2
HG01192.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3831C>T
c.46-3831C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743235
chr9:17743237 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
 1 NA19240.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3829G>T
c.46-3829G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743237
chr9:17743303 T
T
 C
C
 9 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
others(6): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0019g0220
 9 HG02145.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
others(6): Show 
HG02145.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
HG02895.hp2
HG03139.hp2
HG03486.hp2
HG06807.hp1
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3763T>C
c.46-3763T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743303
chr9:17743411 CTAA
CTAA
 C
C
 56 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0044
others(53): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
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a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0002g0070
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HG00639.hp2
HG00642.hp1
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NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3651_46-3649del
others(3): Show 
c.46-3651_46-3649delTAA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743411
chr9:17743429 A
A
 G
G
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a0001c0001t0020g0211
 1 HG02280.hp1
HG02280.hp1
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c.46-3637A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743429
chr9:17743532 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0188
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0234
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 4 HG01109.hp2
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others(1): Show 
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HG02647.hp2
HG02895.hp1
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c.46-3534T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743532
chr9:17743569 A
A
 AAC
AAC
 13 a0001c0001t0001g0019
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others(10): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0140
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 13 HG02258.hp1
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HG02258.hp1
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HG02622.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-3466_46-3465dup
others(2): Show 
c.46-3466_46-3465dupAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACAC
AACAC
 9 a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0195
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others(6): Show 
a0001c0001t0002g0003
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0002g0231
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 9 HG01109.hp1
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others(6): Show 
HG01109.hp1
HG02109.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.46-3468_46-3465dup
others(4): Show 
c.46-3468_46-3465dupACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACAC
AACACAC
 5 a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0223
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0223
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 5 HG01243.hp1
HG02723.hp2
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others(2): Show 
HG01243.hp1
HG02723.hp2
HG03130.hp2
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NA19011.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3470_46-3465dup
others(6): Show 
c.46-3470_46-3465dupACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACACA
others(1): Show 
AACACACAC
 8 a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0003g0155
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a0001c0001t0007g0172
 8 HG02055.hp1
HG02258.hp2
HG02280.hp2
others(5): Show 
HG02055.hp1
HG02258.hp2
HG02280.hp2
HG02965.hp2
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NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3472_46-3465dup
others(8): Show 
c.46-3472_46-3465dupACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACACA
others(3): Show 
AACACACACAC
 18 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0043
others(15): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0058
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a0001c0001t0001g0190
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a0001c0001t0007g0165
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 18 HG00673.hp2
HG01109.hp2
HG01884.hp2
others(15): Show 
HG00673.hp2
HG01109.hp2
HG01884.hp2
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HG02895.hp2
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NA18991.hp1
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NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3474_46-3465dup
others(10): Show 
c.46-3474_46-3465dupACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACACA
others(5): Show 
AACACACACACAC
 29 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0032
others(26): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0049
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a0001c0001t0001g0105
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0117
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a0001c0001t0001g0126
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a0001c0001t0001g0161
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a0001c0001t0001g0176
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 29 HG00408.hp2
HG01081.hp2
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others(26): Show 
HG00408.hp2
HG01081.hp2
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NA19074.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.46-3476_46-3465dup
others(12): Show 
c.46-3476_46-3465dupACACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACACA
others(7): Show 
AACACACACACACAC
 44 a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0027
others(41): Show 
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0001g0051
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a0001c0001t0001g0056
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a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0071
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a0001c0001t0001g0106
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a0001c0001t0001g0186
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 44 HG00558.hp1
HG00673.hp1
HG00733.hp2
others(41): Show 
HG00558.hp1
HG00673.hp1
HG00733.hp2
HG01074.hp1
HG01175.hp1
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HG03486.hp2
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HG03704.hp1
NA18612.hp1
NA18747.hp2
NA18939.hp1
NA18944.hp1
NA18961.hp2
NA18966.hp1
NA18966.hp2
NA18968.hp2
NA18971.hp1
NA18971.hp2
NA18972.hp1
NA18972.hp2
NA18975.hp1
NA18986.hp1
NA18994.hp2
NA18999.hp1
NA19002.hp2
NA19009.hp2
NA19010.hp1
NA19086.hp2
NA20300.hp1
NA20752.hp1
NA20805.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3478_46-3465dup
others(14): Show 
c.46-3478_46-3465dupACACACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACACA
others(9): Show 
AACACACACACACACAC
 21 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0052
others(18): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0040
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a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0068
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a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0130
a0001c0001t0001g0135
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a0001c0001t0001g0194
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a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
 21 HG00323.hp1
HG00323.hp2
HG00639.hp1
others(18): Show 
HG00323.hp1
HG00323.hp2
HG00639.hp1
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HG01258.hp2
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NA18977.hp2
NA18999.hp2
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NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3480_46-3465dup
others(16): Show 
c.46-3480_46-3465dupACACACACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACACA
others(11): Show 
AACACACACACACACACAC
 10 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0038
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0085
a0001c0001t0001g0093
a0001c0001t0001g0115
a0001c0001t0001g0168
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a0001c0001t0004g0193
 10 HG00140.hp1
HG00438.hp1
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others(7): Show 
HG00140.hp1
HG00438.hp1
HG00609.hp2
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NA19011.hp2
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NA19077.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3482_46-3465dup
others(18): Show 
c.46-3482_46-3465dupACACACACACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACACA
others(13): Show 
AACACACACACACACACACAC
 4 a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0124
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0074
a0001c0001t0001g0124
a0001c0001t0011g0257
 4 HG00609.hp1
HG02074.hp1
HG03139.hp2
others(1): Show 
HG00609.hp1
HG02074.hp1
HG03139.hp2
HG03669.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3484_46-3465dup
others(20): Show 
c.46-3484_46-3465dupACACACACACACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 A
A
 AACACACA
others(15): Show 
AACACACACACACACACACACAC
 1 a0001c0001t0019g0220
a0001c0001t0019g0220
 1 HG02145.hp1
HG02145.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3486_46-3465dup
others(22): Show 
c.46-3486_46-3465dupACACACACACACACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 AAC
AAC
 A
A
 49 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
others(46): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0001g0254
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a0001c0001t0002g0021
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a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0031
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a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0129
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a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0233
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a0001c0001t0002g0239
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a0001c0001t0005g0022
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a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0146
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a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0018g0216
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a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
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 49 HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00438.hp2
others(46): Show 
HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG00735.hp1
HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01255.hp2
HG01258.hp1
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HG01978.hp1
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HG02148.hp1
HG02148.hp2
HG02273.hp1
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HG02280.hp1
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HG02683.hp1
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HG03225.hp2
HG03710.hp1
HG03710.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp1
HG06807.hp2
NA18612.hp2
NA18939.hp2
NA18944.hp2
NA18948.hp2
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19010.hp2
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3466_46-3465del
others(2): Show 
c.46-3466_46-3465delAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743569 AACACACA
others(3): Show 
AACACACACAC
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0123
 1 NA18942.hp1
NA18942.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3474_46-3465del
others(10): Show 
c.46-3474_46-3465delACACACACAC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743569
chr9:17743600 A
A
 ACACACAC
others(9): Show 
ACACACACACACACACC
 1 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0185
 1 HG02976.hp2
HG02976.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3465_46-3464ins
others(16): Show 
c.46-3465_46-3464insACACACACACACACCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743600
chr9:17743600 A
A
 ACACACAC
others(7): Show 
ACACACACACACACC
 3 a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0246
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0246
 3 HG02630.hp1
NA18906.hp1
NA19030.hp2
HG02630.hp1
NA18906.hp1
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3465_46-3464ins
others(14): Show 
c.46-3465_46-3464insACACACACACACCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743600
chr9:17743600 A
A
 ACACACAC
others(9): Show 
ACACACACACACACCCC
 1 a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0005g0226
 1 HG03098.hp1
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3465_46-3464ins
others(16): Show 
c.46-3465_46-3464insACACACACACACCCCC
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17743600
chr9:17743601 C
C
 CACACACA
others(4): Show 
CACACACACACA
 1 a0001c0001t0001g0095
a0001c0001t0001g0095
 1 HG01175.hp2
HG01175.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3465_46-3464ins
others(11): Show 
c.46-3465_46-3464insACACACACACA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743601
chr9:17743601 C
C
 CACACACA
others(8): Show 
CACACACACACACACA
 1 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0152
 1 HG01192.hp1
HG01192.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3465_46-3464ins
others(15): Show 
c.46-3465_46-3464insACACACACACACACA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743601
chr9:17743620 A
A
 G
G
 8 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(5): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0006g0214
 8 HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp1
others(5): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp1
HG02451.hp2
HG02809.hp1
HG02965.hp2
HG03471.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3446A>G
c.46-3446A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743620
chr9:17743632 T
T
 C
C
 54 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0044
others(51): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0002g0025
a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0092
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0172
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0020g0211
a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
a0001c0006t0001g0153
a0002c0004t0003g0111
 54 HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(51): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG00735.hp1
HG01192.hp2
HG01255.hp2
HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02145.hp2
HG02148.hp1
HG02148.hp2
HG02258.hp1
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
HG03017.hp1
HG03041.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
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HG03710.hp1
HG03710.hp2
HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
HG06807.hp2
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18944.hp2
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20129.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3434T>C
c.46-3434T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743632
chr9:17743639 C
C
 T
T
 7 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
others(4): Show 
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HG01192.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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HG03486.hp2
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c.46-3427C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743639
chr9:17743641 G
G
 A
A
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 54 HG00438.hp2
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others(51): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.46-3425G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743641
chr9:17743690 A
A
 T
T
 5 a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0199
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others(2): Show 
a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0204
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 5 HG02109.hp1
HG02647.hp1
HG02717.hp2
others(2): Show 
HG02109.hp1
HG02647.hp1
HG02717.hp2
HG03540.hp2
NA18906.hp2
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c.46-3376A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743690
chr9:17743695 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0235
 2 HG02965.hp2
HG03471.hp2
HG02965.hp2
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3371C>G
c.46-3371C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743695
chr9:17743857 A
A
 C
C
 4 a0001c0001t0007g0096
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others(1): Show 
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0172
 4 HG03017.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
others(1): Show 
HG03017.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3209A>C
c.46-3209A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743857
chr9:17743942 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0117
a0001c0001t0001g0117
 1 HG03017.hp2
HG03017.hp2
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c.46-3124A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743942
chr9:17743991 A
A
 G
G
 22 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
others(19): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
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a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
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 22 HG01109.hp1
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HG02257.hp2
others(19): Show 
HG01109.hp1
HG01192.hp2
HG02257.hp2
HG02258.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp1
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HG03139.hp1
HG03139.hp2
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HG03516.hp2
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NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-3075A>G
c.46-3075A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17743991
chr9:17744021 T
T
 A
A
 33 a0001c0001t0001g0015
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a0001c0001t0001g0055
others(30): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0120
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a0001c0001t0001g0139
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a0001c0001t0002g0195
a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0199
a0001c0001t0002g0202
a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0002g0231
a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
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a0001c0001t0005g0146
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a0001c0001t0005g0171
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 33 HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
others(30): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00558.hp2
HG01070.hp1
HG01074.hp2
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HG02109.hp1
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HG02683.hp2
HG02717.hp2
HG02735.hp1
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HG04184.hp2
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HG04228.hp1
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NA18948.hp2
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NA19087.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3045T>A
c.46-3045T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744021
chr9:17744037 T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0001g0232
 1 NA18948.hp1
NA18948.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-3029T>A
c.46-3029T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744037
chr9:17744081 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0031
 1 HG03710.hp1
HG03710.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2985G>A
c.46-2985G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744081
chr9:17744103 AT
AT
 A
A
 3 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0013g0162
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0013g0162
 3 HG02280.hp2
HG02630.hp2
NA20129.hp1
HG02280.hp2
HG02630.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2957delT
c.46-2957delT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17744103
chr9:17744180 TAAGAC
TAAGAC
 T
T
 5 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
others(2): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0011g0257
 5 HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
others(2): Show 
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2881_46-2877del
others(5): Show 
c.46-2881_46-2877delCAAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17744180
chr9:17744220 C
C
 G
G
 9 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0006g0221
 9 HG02258.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
others(6): Show 
HG02258.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02723.hp1
HG02965.hp1
HG03139.hp1
HG03486.hp1
HG03516.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2846C>G
c.46-2846C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744220
chr9:17744369 A
A
 AT
AT
 22 a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0125
others(19): Show 
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0125
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0183
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0227
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a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0240
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0007g0143
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 22 HG00408.hp2
HG01109.hp2
HG01243.hp1
others(19): Show 
HG00408.hp2
HG01109.hp2
HG01243.hp1
HG02040.hp1
HG02055.hp1
HG02258.hp2
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HG02723.hp2
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NA18989.hp2
NA19002.hp1
NA19064.hp1
NA19079.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2682dupT
c.46-2682dupT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17744369
chr9:17744369 AT
AT
 A
A
 6 a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0089
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0021g0258
 6 HG02040.hp2
HG02074.hp2
HG03579.hp2
others(3): Show 
HG02040.hp2
HG02074.hp2
HG03579.hp2
HG04228.hp1
NA18943.hp1
NA19074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2682delT
c.46-2682delT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17744369
chr9:17744428 C
C
 T
T
 6 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0006g0214
 6 HG01884.hp1
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others(3): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp1
HG02451.hp2
HG02809.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2638C>T
c.46-2638C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744428
chr9:17744429 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
 1 NA19240.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2637G>A
c.46-2637G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744429
chr9:17744478 A
A
 G
G
 36 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
others(33): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0139
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a0001c0001t0002g0199
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a0001c0001t0002g0204
a0001c0001t0002g0231
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a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0146
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a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0010g0218
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 36 HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
others(33): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00558.hp2
HG01070.hp1
HG01074.hp2
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HG02257.hp2
HG02647.hp1
HG02683.hp1
HG02683.hp2
HG02717.hp2
HG02735.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03195.hp2
HG03540.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp2
NA18747.hp1
NA18906.hp2
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NA18948.hp2
NA19010.hp2
NA19074.hp1
NA19087.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2588A>G
c.46-2588A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744478
chr9:17744519 C
C
 T
T
 13 a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0002g0017
others(10): Show 
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0233
a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
 13 HG02145.hp2
HG02148.hp1
HG02273.hp1
others(10): Show 
HG02145.hp2
HG02148.hp1
HG02273.hp1
NA18942.hp1
NA18944.hp2
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2547C>T
c.46-2547C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744519
chr9:17744558 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
 1 HG02280.hp2
HG02280.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2508A>T
c.46-2508A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744558
chr9:17744567 A
A
 G
G
 9 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0006g0221
 9 HG02258.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
others(6): Show 
HG02258.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02723.hp1
HG02965.hp1
HG03139.hp1
HG03486.hp1
HG03516.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2499A>G
c.46-2499A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744567
chr9:17744568 C
C
 T
T
 54 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0044
others(51): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0002g0017
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a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0070
a0001c0001t0002g0077
a0001c0001t0002g0079
a0001c0001t0002g0092
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0119
a0001c0001t0002g0123
a0001c0001t0002g0129
a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
a0001c0001t0002g0239
a0001c0001t0002g0241
a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0172
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0020g0211
a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
a0001c0006t0001g0153
a0002c0004t0003g0111
 54 HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(51): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG00735.hp1
HG01192.hp2
HG01255.hp2
HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG01978.hp1
HG02027.hp1
HG02145.hp2
HG02148.hp1
HG02148.hp2
HG02258.hp1
HG02273.hp1
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
HG03017.hp1
HG03041.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
HG03516.hp2
HG03710.hp1
HG03710.hp2
HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
HG06807.hp2
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18944.hp2
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20129.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2498C>T
c.46-2498C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744568
chr9:17744693 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0141
a0001c0001t0001g0141
 1 HG03669.hp2
HG03669.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2373C>T
c.46-2373C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744693
chr9:17744694 C
C
 T
T
 1 a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0005g0226
 1 HG03098.hp1
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2372C>T
c.46-2372C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744694
chr9:17744803 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0013g0162
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0013g0162
 3 HG02280.hp2
HG02630.hp2
NA20129.hp1
HG02280.hp2
HG02630.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2263G>A
c.46-2263G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744803
chr9:17744832 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0156
a0001c0001t0002g0156
 1 HG01261.hp1
HG01261.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2234T>G
c.46-2234T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744832
chr9:17744850 G
G
 T
T
 20 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
others(17): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0172
a0001c0001t0011g0257
 20 HG01192.hp2
HG02258.hp1
HG02559.hp2
others(17): Show 
HG01192.hp2
HG02258.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
HG03017.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
HG03516.hp2
HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.46-2216G>T
c.46-2216G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744850
chr9:17744964 G
G
 A
A
 1 a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0005g0226
 1 HG03098.hp1
HG03098.hp1
 intron_variant MODIFIER c.46-2102G>A
c.46-2102G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17744964
chr9:17745054 A
A
 C
C
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a0001c0001t0007g0172
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HG03017.hp1
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A
 C
C
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T
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C
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HG02145.hp1
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c.46-1993T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17745073
chr9:17745093 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0013g0162
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NA20129.hp1
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G
 A
A
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c.46-1729G>A
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G
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HG02027.hp2
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c.46-1654A>G
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C
 T
T
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c.46-1604A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0152
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c.46-1557C>T
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chr9:17745633 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0087
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NA18961.hp1
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c.46-1433G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17745633
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AG
 A
A
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c.46-1396delG
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chr9:17745671 T
T
 A
A
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c.46-1395T>A
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chr9:17745798 G
G
 C
C
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a0001c0001t0006g0215
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HG01192.hp2
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c.46-1268G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 1/8 chr9 17745798
chr9:17745818 T
T
 C
C
 235 a0001c0001t0001g0006
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c.46-1099G>A
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HG01074.hp1
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c.46-912A>G
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G
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A
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a0001c0001t0011g0256
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c.46-905G>A
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T
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G
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C
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T
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0043
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G
 A
A
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c.46-617G>A
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T
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a0001c0001t0001g0052
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HG01255.hp1
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c.46-571G>T
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G
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A
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NA18966.hp1
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c.46-548G>A
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A
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A
 G
G
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HG02523.hp1
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C
 T
T
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c.46-413C>T
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C
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c.46-229G>C
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T
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A
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c.114+41C>A
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HG02572.hp1
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c.114+87T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747221
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A
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others(162): Show 
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 intron_variant MODIFIER c.114+147G>A
c.114+147G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747281
chr9:17747363 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0006g0215
 1 HG01192.hp2
HG01192.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+229C>T
c.114+229C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747363
chr9:17747438 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+304G>A
c.114+304G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747438
chr9:17747448 G
G
 C
C
 34 a0001c0001t0001g0013
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HG00438.hp2
HG00639.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+314G>C
c.114+314G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747448
chr9:17747448 G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0011g0256
a0001c0001t0011g0256
 1 HG01074.hp1
HG01074.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+314G>T
c.114+314G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747448
chr9:17747496 T
T
 G
G
 27 a0001c0001t0001g0019
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others(24): Show 
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a0001c0001t0001g0020
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 27 HG01109.hp2
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HG02258.hp1
others(24): Show 
HG01109.hp2
HG02145.hp1
HG02258.hp1
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c.114+362T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747496
chr9:17747594 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0168
a0001c0001t0001g0168
 1 HG03942.hp2
HG03942.hp2
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c.114+460T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747594
chr9:17747604 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0003g0155
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NA20805.hp2
HG01081.hp2
NA20805.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+470C>G
c.114+470C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747604
chr9:17747966 A
A
 G
G
 146 a0001c0001t0001g0006
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others(143): Show 
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a0001c0001t0001g0007
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 146 HG00140.hp1
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others(143): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00323.hp2
HG00408.hp2
HG00438.hp1
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HG00639.hp1
HG00642.hp2
HG00673.hp1
HG00673.hp2
HG00733.hp1
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HG01074.hp1
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HG01081.hp2
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HG02630.hp1
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NA18966.hp2
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NA18971.hp2
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NA18977.hp2
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NA20905.hp1
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c.114+832A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17747966
chr9:17748014 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
 1 HG02280.hp2
HG02280.hp2
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c.114+880C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748014
chr9:17748185 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0007
 1 NA18977.hp1
NA18977.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+1051C>T
c.114+1051C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748185
chr9:17748346 A
A
 G
G
 19 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
others(16): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
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others(16): Show 
HG02258.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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NA20129.hp2
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c.114+1212A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748346
chr9:17748361 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
 1 HG02280.hp2
HG02280.hp2
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c.114+1227A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748361
chr9:17748458 A
A
 G
G
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0021g0258
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 5 HG02630.hp2
HG02965.hp2
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others(2): Show 
HG02630.hp2
HG02965.hp2
HG03471.hp2
HG03579.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+1324A>G
c.114+1324A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748458
chr9:17748505 A
A
 G
G
 4 a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
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others(1): Show 
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0172
 4 HG03017.hp1
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HG04184.hp1
others(1): Show 
HG03017.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+1371A>G
c.114+1371A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748505
chr9:17748522 C
C
 G
G
 19 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
others(16): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0172
a0001c0001t0011g0257
 19 HG02258.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
others(16): Show 
HG02258.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02717.hp1
HG02723.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
HG03017.hp1
HG03139.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp1
HG03486.hp2
HG03516.hp2
HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+1388C>G
c.114+1388C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748522
chr9:17748588 T
T
 A
A
 34 a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0002g0017
others(31): Show 
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0002g0017
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0024
a0001c0001t0002g0025
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a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0045
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a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0119
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a0001c0001t0002g0177
a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0236
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a0001c0001t0002g0241
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a0001c0003t0002g0010
a0001c0003t0002g0039
a0001c0006t0001g0153
a0002c0004t0003g0111
 34 HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(31): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG00735.hp1
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HG02148.hp1
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HG02280.hp1
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HG03710.hp1
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HG06807.hp2
NA18939.hp2
NA18942.hp1
NA18944.hp2
NA18950.hp1
NA18962.hp2
NA18968.hp1
NA18986.hp2
NA18989.hp1
NA18991.hp2
NA19009.hp1
NA19077.hp2
NA19087.hp2
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+1454T>A
c.114+1454T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748588
chr9:17748588 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0244
a0001c0001t0001g0244
 1 HG03130.hp2
HG03130.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+1454T>G
c.114+1454T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748588
chr9:17748699 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0001g0252
 1 HG02572.hp2
HG02572.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+1565G>A
c.114+1565G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748699
chr9:17748813 A
A
 G
G
 10 a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0028
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0151
a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0003g0237
 10 HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
others(7): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
HG01361.hp2
HG01516.hp1
HG02622.hp1
HG03225.hp2
HG03831.hp2
HG04199.hp2
NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+1679A>G
c.114+1679A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748813
chr9:17748857 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
 1 HG02280.hp2
HG02280.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+1723T>C
c.114+1723T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748857
chr9:17748860 G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
 3 HG02145.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
HG02145.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+1726G>C
c.114+1726G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748860
chr9:17748863 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0140
a0001c0001t0001g0140
 1 HG03491.hp1
HG03491.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+1729A>G
c.114+1729A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748863
chr9:17748880 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0011
 1 NA18950.hp2
NA18950.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+1746G>A
c.114+1746G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748880
chr9:17748890 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
 2 NA18950.hp1
NA18989.hp1
NA18950.hp1
NA18989.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+1756C>G
c.114+1756C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17748890
chr9:17748962 C
C
 T
T
 172 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
others(169): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
a0001c0001t0001g0032
a0001c0001t0001g0033
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0042
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a0001c0001t0001g0049
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C
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C
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chr9:17750137 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0233
a0001c0001t0002g0233
 1 NA18991.hp2
NA18991.hp2
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c.114+3003A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750137
chr9:17750169 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0008g0158
 1 HG03516.hp1
HG03516.hp1
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c.114+3035C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750169
chr9:17750309 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0138
a0001c0001t0002g0138
 1 HG02027.hp1
HG02027.hp1
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c.114+3175C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750309
chr9:17750328 CAAAATGA
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CAAAATGAAATAAATTAG
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0128
a0001c0001t0001g0128
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HG02300.hp2
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others(19): Show 
c.114+3196_114+3212delAAATGAAATAAATTAGA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17750328
chr9:17750398 T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
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NA19240.hp2
HG03098.hp1
NA19240.hp2
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c.114+3264T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750398
chr9:17750407 A
A
 C
C
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a0001c0001t0007g0165
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0165
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HG04228.hp2
HG03942.hp1
HG04228.hp2
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c.114+3273A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750407
chr9:17750425 C
C
 G
G
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others(3): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
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HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
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c.114+3291C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750425
chr9:17750513 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0244
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HG03130.hp2
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c.114+3379G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750513
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0020
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HG02258.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
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c.114+3518G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750652
chr9:17750888 C
C
 T
T
 98 a0001c0001t0001g0006
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c.114+3754C>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0003g0155
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NA20805.hp2
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c.114+3763G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750897
chr9:17750921 G
G
 T
T
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HG01243.hp2
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c.114+3787G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17750921
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A
 C
C
 181 a0001c0001t0001g0006
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A
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C
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HG03139.hp2
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G
 A
A
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G
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T
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HG02572.hp1
HG03486.hp2
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C
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CGT
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 intron_variant MODIFIER c.114+4374_114+4375d
others(4): Show 
c.114+4374_114+4375dupGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17751479
chr9:17751479 C
C
 CGTGT
CGTGT
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a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0208
others(32): Show 
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0002g0018
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a0001c0001t0002g0024
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a0001c0001t0002g0031
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 35 HG00438.hp2
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HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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others(6): Show 
c.114+4372_114+4375dupGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17751479
chr9:17751479 C
C
 CGTGTGTG
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CGTGTGTGTGT
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
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HG02965.hp1
HG03098.hp1
HG04184.hp1
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chr9:17751479 C
C
 CGTGTGTG
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CGTGTGTGTGTGT
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a0001c0001t0001g0157
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HG03139.hp1
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17751479
chr9:17751479 C
C
 CGTGTGTG
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CGTGTGTGTGTGTGT
 3 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0006g0221
 3 HG02258.hp1
HG02622.hp2
NA20129.hp2
HG02258.hp1
HG02622.hp2
NA20129.hp2
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others(16): Show 
c.114+4362_114+4375dupGTGTGTGTGTGTGT
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C
 CGTGTGTG
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CGTGTGTGTGTGTGTGT
 2 a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0004g0209
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NA20129.hp1
HG02572.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+4360_114+4375d
others(18): Show 
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C
 CGTGTGTG
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CGTGTGTGTGTGTGTGTGT
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a0001c0001t0001g0203
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HG02723.hp1
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others(20): Show 
c.114+4358_114+4375dupGTGTGTGTGTGTGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17751479
chr9:17751479 C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0193
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others(1): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0255
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others(1): Show 
HG02559.hp2
HG02717.hp1
HG02895.hp2
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+4345C>T
c.114+4345C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17751479
chr9:17751479 CGT
CGT
 C
C
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a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0001g0115
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0100
a0001c0001t0001g0115
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
 5 HG01243.hp2
HG01258.hp2
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HG01243.hp2
HG01258.hp2
HG01358.hp1
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others(4): Show 
c.114+4374_114+4375delGT
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chr9:17751479 CGTGT
CGTGT
 C
C
 16 a0001c0001t0001g0159
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others(13): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
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a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
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 16 HG01192.hp2
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others(13): Show 
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HG01884.hp1
HG01884.hp2
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NA19240.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+4372_114+4375d
others(6): Show 
c.114+4372_114+4375delGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17751479
chr9:17751479 CGTGTGT
CGTGTGT
 C
C
 11 a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0002g0144
a0001c0001t0003g0002
others(8): Show 
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0002g0144
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0028
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0151
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 11 HG00642.hp2
HG00733.hp1
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others(8): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.114+4370_114+4375d
others(8): Show 
c.114+4370_114+4375delGTGTGT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17751479
chr9:17751483 T
T
 C
C
 4 a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0185
a0001c0001t0001g0194
a0001c0001t0001g0249
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 4 HG02055.hp2
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others(1): Show 
HG02055.hp2
HG02451.hp1
HG02976.hp2
HG03453.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+4349T>C
c.114+4349T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17751483
chr9:17751509 T
T
 TGTGTGTG
others(8): Show 
TGTGTGTGTGTGTGTG
 2 a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0207
 2 HG03486.hp1
HG03516.hp2
HG03486.hp1
HG03516.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+4375_114+4376i
others(17): Show 
c.114+4375_114+4376insGTGTGTGTGTGTGTG
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17751509
chr9:17751510 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0251
a0001c0001t0001g0251
 1 NA19030.hp1
NA19030.hp1
 intron_variant MODIFIER c.114+4376T>G
c.114+4376T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17751510
chr9:17751557 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
 1 HG02280.hp2
HG02280.hp2
 intron_variant MODIFIER c.114+4423C>A
c.114+4423C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17751557
chr9:17751561 T
T
 C
C
 201 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
others(198): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0012
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a0001c0001t0001g0016
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a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0042
a0001c0001t0001g0043
a0001c0001t0001g0044
a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0071
a0001c0001t0001g0073
a0001c0001t0001g0074
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a0001c0001t0001g0087
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a0001c0001t0001g0113
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a0001c0001t0001g0136
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a0001c0001t0001g0142
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A
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C
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T
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HG03453.hp1
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T
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A
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G
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T
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
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c.114+4697G>A
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AC
 A
A
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c.114+4726delC
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T
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C
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A
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A
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G
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C
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CA
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C
 T
T
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a0001c0001t0008g0196
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HG02976.hp1
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T
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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C
 T
T
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.114+5159C>T
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T
 C
C
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a0001c0001t0020g0211
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HG02280.hp1
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c.114+5213T>C
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A
 T
T
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A
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NA19074.hp2
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C
 G
G
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c.114+5522C>G
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C
 G
G
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HG03225.hp2
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c.114+5566C>G
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T
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c.114+5568T>C
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C
 G
G
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T
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a0001c0001t0001g0113
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c.114+5791C>T
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chr9:17753030 G
G
 T
T
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.114+5896G>T
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C
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A
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HG06807.hp1
NA19240.hp1
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c.114+5920C>A
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C
 T
T
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C
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A
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A
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G
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HG01081.hp1
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T
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G
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c.114+6503C>T
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0051
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NA18961.hp2
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c.114+6673G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17753807
chr9:17753872 G
G
 T
T
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a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
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c.114+6738G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17753872
chr9:17753894 A
A
 G
G
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HG03942.hp1
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c.114+6760A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0002g0031
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HG03710.hp1
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c.114+7026A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17754160
chr9:17754162 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0086
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HG02027.hp2
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c.114+7028G>T
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A
 G
G
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c.114+7100A>G
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C
 T
T
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c.115-7118C>T
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chr9:17754395 C
C
 T
T
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HG02258.hp1
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HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp2
HG02965.hp1
HG03017.hp1
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HG04184.hp1
HG04228.hp2
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chr9:17754423 C
C
 T
T
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c.115-7014C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17754423
chr9:17754500 T
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 C
C
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c.115-6937T>C
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0056
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NA18968.hp2
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c.115-6922T>C
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chr9:17754517 C
C
 G
G
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a0001c0001t0002g0144
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HG03491.hp2
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c.115-6920C>G
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T
 C
C
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c.115-6908T>C
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.115-6875A>G
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chr9:17754585 A
A
 G
G
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a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
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HG03098.hp1
NA19240.hp2
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c.115-6852A>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0087
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NA18961.hp1
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c.115-6721T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17754716
chr9:17754749 A
A
 T
T
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c.115-6688A>T
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 C
C
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c.115-6685G>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0196
a0001c0001t0008g0253
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HG02976.hp1
HG03041.hp2
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c.115-6646G>A
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T
 C
C
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
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c.115-6443T>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0206
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HG02809.hp2
HG02886.hp1
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c.115-6391G>A
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C
 T
T
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c.115-6374C>T
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G
 A
A
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HG03098.hp1
NA19240.hp2
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c.115-6373G>A
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 A
A
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HG02280.hp2
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c.115-6236G>A
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chr9:17755229 A
A
 G
G
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a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
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HG02145.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
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c.115-6208A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17755229
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T
 G
G
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HG01074.hp1
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c.115-6149T>G
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A
 G
G
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HG03471.hp2
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c.115-6112A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17755325
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A
 G
G
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others(6): Show 
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a0001c0001t0004g0206
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HG02559.hp2
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c.115-6099A>G
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C
 G
G
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c.115-6079C>G
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A
 T
T
 2 a0001c0001t0008g0196
a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0196
a0001c0001t0008g0253
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HG02976.hp1
HG03041.hp2
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c.115-6033A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17755404
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T
 C
C
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a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
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NA19240.hp2
HG03098.hp1
NA19240.hp2
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c.115-5949T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17755488
chr9:17755550 T
T
 A
A
 147 a0001c0001t0001g0006
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A
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0054
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HG03654.hp2
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G
 T
T
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C
 T
T
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HG02572.hp1
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A
 G
G
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HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG03130.hp1
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chr9:17756728 A
A
 T
T
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HG02572.hp1
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C
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T
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c.115-4663C>T
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 G
G
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HG02572.hp1
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c.115-4655A>G
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G
 A
A
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a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0008g0196
a0001c0001t0008g0253
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HG02976.hp1
HG03041.hp2
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c.115-4649G>A
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 A
A
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a0001c0002t0013g0162
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HG02630.hp2
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c.115-4567T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17756870
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0160
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HG02109.hp2
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c.115-4542T>C
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A
 G
G
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others(6): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0174
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HG02717.hp1
others(6): Show 
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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HG03486.hp2
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c.115-4425A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757012
chr9:17757053 C
C
 A
A
 9 a0001c0001t0004g0148
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others(6): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0174
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others(6): Show 
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
HG02809.hp2
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HG03130.hp1
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HG03486.hp2
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c.115-4384C>A
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G
 T
T
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a0001c0001t0001g0154
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HG03704.hp1
 intron_variant MODIFIER c.115-4297G>T
c.115-4297G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757140
chr9:17757154 C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0200
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HG02622.hp1
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c.115-4283C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757154
chr9:17757191 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0038
a0001c0001t0001g0038
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HG00609.hp2
 intron_variant MODIFIER c.115-4246A>G
c.115-4246A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757191
chr9:17757200 C
C
 G
G
 9 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0174
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others(6): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0174
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 9 HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
others(6): Show 
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp2
HG03130.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.115-4237C>G
c.115-4237C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757200
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C
 G
G
 4 a0001c0001t0007g0096
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others(1): Show 
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
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 4 HG03017.hp1
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others(1): Show 
HG03017.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.115-4059C>G
c.115-4059C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757378
chr9:17757400 A
A
 G
G
 9 a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0174
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others(6): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0193
a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0011g0257
 9 HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
others(6): Show 
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02717.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp2
HG03130.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.115-4037A>G
c.115-4037A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757400
chr9:17757419 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0189
 1 HG02280.hp2
HG02280.hp2
 intron_variant MODIFIER c.115-4018G>A
c.115-4018G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757419
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GA
 G
G
 10 a0001c0001t0001g0254
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0028
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HG00733.hp1
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c.115-3967delA
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chr9:17757527 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0099
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HG01243.hp2
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c.115-3910C>G
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chr9:17757551 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
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a0001c0001t0001g0203
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HG02258.hp1
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HG02622.hp2
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c.115-3886A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757551
chr9:17757562 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0190
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HG01192.hp2
HG01433.hp2
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c.115-3875G>A
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C
 T
T
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HG00280.hp1
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HG02683.hp2
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c.115-3862C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757575
chr9:17757577 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0128
 1 HG02300.hp2
HG02300.hp2
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c.115-3860G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757577
chr9:17757676 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0144
a0001c0001t0002g0144
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HG03491.hp2
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c.115-3761A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757676
chr9:17757876 C
C
 G
G
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others(31): Show 
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0117
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0150
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a0001c0001t0010g0218
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0018g0216
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others(31): Show 
HG00140.hp2
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HG04228.hp1
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NA18747.hp1
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NA19074.hp1
NA19087.hp1
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c.115-3561C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17757876
chr9:17758005 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0152
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HG01192.hp1
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c.115-3432T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17758005
chr9:17758122 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0067
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NA19011.hp1
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c.115-3315C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17758122
chr9:17758141 C
C
 T
T
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others(3): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
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others(3): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp1
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c.115-3296C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17758141
chr9:17758213 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0155
a0001c0001t0003g0155
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NA20805.hp2
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c.115-3224C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17758213
chr9:17758297 A
A
 T
T
 10 a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0028
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
a0001c0001t0003g0151
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others(7): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
HG01361.hp2
HG01516.hp1
HG02622.hp1
HG03225.hp2
HG03831.hp2
HG04199.hp2
NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.115-3140A>T
c.115-3140A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17758297
chr9:17758307 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0005g0178
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HG04199.hp1
 intron_variant MODIFIER c.115-3130T>C
c.115-3130T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17758307
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C
 T
T
 9 a0001c0001t0004g0148
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a0001c0001t0004g0193
others(6): Show 
a0001c0001t0004g0148
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0193
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a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
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 9 HG02559.hp2
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others(6): Show 
HG02559.hp2
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HG02717.hp1
HG02809.hp2
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HG03130.hp1
HG03139.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.115-3048C>T
c.115-3048C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17758389
chr9:17758477 G
G
 T
T
 142 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
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a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
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a0001c0001t0001g0051
a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0054
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a0001c0001t0001g0091
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c.115-2960G>T
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NA18986.hp1
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NA18977.hp2
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NA18953.hp2
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a0001c0001t0001g0184
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CA
 C
C
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 15 HG00280.hp2
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HG00280.hp2
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NA19087.hp1
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c.115-2842delA
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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 C
C
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C
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A
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A
 G
G
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0242
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NA19030.hp2
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chr9:17759055 C
C
 A
A
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a0001c0001t0001g0176
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HG01081.hp2
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G
 C
C
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a0003c0005t0014g0137
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NA19087.hp1
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c.115-2371G>C
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C
 T
T
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a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0164
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HG03453.hp1
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A
 G
G
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T
 C
C
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A
 T
T
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NA19074.hp2
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0042
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NA19088.hp1
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T
 A
A
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a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
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HG06807.hp1
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HG02145.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
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c.115-1824T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17759613
chr9:17759654 T
T
 G
G
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others(3): Show 
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T
 C
C
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others(3): Show 
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0187
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others(3): Show 
HG01192.hp2
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chr9:17759982 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0144
a0001c0001t0002g0144
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HG03491.hp2
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c.115-1455C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17759982
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G
 A
A
 10 a0001c0001t0001g0254
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
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others(7): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
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c.115-1338G>A
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chr9:17760208 T
T
 A
A
 2 a0001c0001t0003g0094
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a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0098
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HG00733.hp1
HG00642.hp2
HG00733.hp1
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c.115-1229T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760208
chr9:17760254 T
T
 C
C
 1 a0001c0006t0001g0153
a0001c0006t0001g0153
 1 HG03710.hp2
HG03710.hp2
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c.115-1183T>C
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C
 T
T
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others(32): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
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a0001c0001t0001g0063
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 35 HG00140.hp2
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others(32): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
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NA18747.hp1
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NA19074.hp1
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NA20905.hp1
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c.115-1175C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760262
chr9:17760292 C
C
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0147
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0147
 2 NA18994.hp1
NA18999.hp1
NA18994.hp1
NA18999.hp1
 intron_variant MODIFIER c.115-1145C>G
c.115-1145C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760292
chr9:17760333 T
T
 C
C
 13 a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
others(10): Show 
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a0001c0001t0003g0002
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a0001c0001t0003g0237
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0010g0219
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 13 HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
others(10): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
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HG03225.hp2
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HG04199.hp2
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c.115-1104T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760333
chr9:17760344 A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0021g0258
a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0021g0258
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HG03471.hp2
HG03579.hp2
HG02965.hp2
HG03471.hp2
HG03579.hp2
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c.115-1093A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760344
chr9:17760363 T
T
 C
C
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others(32): Show 
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a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
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a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0089
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 35 HG00140.hp2
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others(32): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
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HG02683.hp2
HG02717.hp1
HG02735.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp2
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp2
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NA18612.hp2
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c.115-1074T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760363
chr9:17760440 C
C
 T
T
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a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
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NA19240.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
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c.115-997C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760440
chr9:17760477 A
A
 G
G
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a0001c0001t0007g0143
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others(1): Show 
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
a0001c0001t0007g0165
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 4 HG03017.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
others(1): Show 
HG03017.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
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c.115-960A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760477
chr9:17760543 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0234
a0001c0001t0001g0234
 1 HG03579.hp1
HG03579.hp1
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c.115-894C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760543
chr9:17760584 C
C
 G
G
 26 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
others(23): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
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a0001c0001t0001g0063
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a0001c0001t0001g0081
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a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
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a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0018g0216
a0003c0005t0014g0137
 26 HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
others(23): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00558.hp2
HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01258.hp1
HG02040.hp2
HG02074.hp2
HG02683.hp1
HG02683.hp2
HG02735.hp1
HG03098.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp2
NA18747.hp1
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18975.hp2
NA19010.hp2
NA19074.hp1
NA19087.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.115-853C>G
c.115-853C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760584
chr9:17760840 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0179
a0001c0001t0002g0179
 1 HG06807.hp2
HG06807.hp2
 intron_variant MODIFIER c.115-597C>T
c.115-597C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760840
chr9:17760914 G
G
 C
C
 1 a0001c0006t0001g0153
a0001c0006t0001g0153
 1 HG03710.hp2
HG03710.hp2
 intron_variant MODIFIER c.115-523G>C
c.115-523G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760914
chr9:17760921 G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0191
 3 HG01884.hp1
HG02451.hp2
NA20300.hp1
HG01884.hp1
HG02451.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.115-516G>A
c.115-516G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760921
chr9:17760928 G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0089
 1 NA18943.hp1
NA18943.hp1
 intron_variant MODIFIER c.115-509G>C
c.115-509G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17760928
chr9:17761091 C
C
 A
A
 2 a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
 2 HG03098.hp1
NA19240.hp2
HG03098.hp1
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.115-346C>A
c.115-346C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17761091
chr9:17761141 A
A
 G
G
 20 a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0025
others(17): Show 
a0001c0001t0002g0018
a0001c0001t0002g0021
a0001c0001t0002g0025
a0001c0001t0002g0030
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0092
a0001c0001t0002g0101
a0001c0001t0002g0103
a0001c0001t0002g0104
a0001c0001t0002g0118
a0001c0001t0002g0138
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a0001c0001t0002g0239
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a0001c0001t0002g0245
a0001c0001t0020g0211
a0001c0006t0001g0153
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 20 HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
others(17): Show 
HG00438.hp2
HG00639.hp2
HG00642.hp1
HG00735.hp1
HG01255.hp2
HG01261.hp2
HG01358.hp2
HG02027.hp1
HG02148.hp2
HG02273.hp2
HG02280.hp1
HG02300.hp1
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HG03710.hp1
HG03710.hp2
HG06807.hp2
NA18939.hp2
NA18968.hp1
NA20905.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.115-296A>G
c.115-296A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17761141
chr9:17761158 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0060
 1 NA18966.hp1
NA18966.hp1
 intron_variant MODIFIER c.115-279C>T
c.115-279C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 2/8 chr9 17761158
chr9:17761185 A
A
 T
T
 32 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
others(29): Show 
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
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a0001c0001t0004g0148
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a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0036
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0011g0257
a0001c0001t0018g0216
a0003c0005t0014g0137
 32 HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
others(29): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00558.hp2
HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01258.hp1
HG02040.hp2
HG02074.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02683.hp1
HG02683.hp2
HG02717.hp1
HG02735.hp1
HG02895.hp2
HG03098.hp2
HG03139.hp2
HG03486.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp2
NA18747.hp1
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18975.hp2
NA19010.hp2
NA19074.hp1
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T
 G
G
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a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
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HG03098.hp1
NA19240.hp2
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c.115-215T>G
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0209
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NA20129.hp1
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0049
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NA19012.hp2
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0259
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HG00438.hp1
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A
 G
G
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NA20300.hp2
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C
 T
T
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c.115-56C>T
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C
 G
G
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HG03041.hp2
HG03516.hp1
HG02976.hp1
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HG03516.hp1
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c.187+35C>G
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T
 C
C
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HG02886.hp1
HG03130.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG03130.hp1
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c.187+47T>C
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chr9:17761569 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0149
a0001c0001t0001g0149
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HG00639.hp1
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c.187+60A>G
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G
 A
A
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c.187+108G>A
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C
 T
T
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NA20805.hp1
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0105
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NA18970.hp1
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A
 C
C
 166 a0001c0001t0001g0006
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others(163): Show 
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A
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c.187+890delC
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TCA
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T
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C
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A
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c.187+890C>A
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CA
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c.187+906dupA
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C
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c.187+906delA
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A
 T
T
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c.187+891A>T
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 G
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HG03710.hp1
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c.187+947A>G
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C
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T
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a0001c0001t0003g0002
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HG03831.hp2
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c.187+1386C>T
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chr9:17762986 C
C
 T
T
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a0001c0002t0005g0226
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HG03098.hp1
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c.187+1477C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17762986
chr9:17763007 G
G
 C
C
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c.187+1498G>C
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G
 A
A
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c.187+1567G>A
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T
 C
C
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HG00280.hp1
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c.187+2001C>T
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
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HG01074.hp1
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c.187+2067A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17763576
chr9:17763603 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0110
a0001c0001t0001g0110
 1 HG02523.hp1
HG02523.hp1
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c.187+2094C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17763603
chr9:17763892 A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0087
a0001c0001t0001g0087
 1 NA18961.hp1
NA18961.hp1
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c.187+2383A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17763892
chr9:17763940 AGAAAG
AGAAAG
 A
A
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others(6): Show 
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a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
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HG02258.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
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others(7): Show 
c.187+2436_187+2440delGGAAA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17763940
chr9:17764012 G
G
 A
A
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a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
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a0001c0001t0003g0200
a0001c0001t0003g0237
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HG00733.hp1
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others(7): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
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c.187+2503G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17764012
chr9:17764065 G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
 2 HG03098.hp1
NA19240.hp2
HG03098.hp1
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.187+2556G>A
c.187+2556G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17764065
chr9:17764149 C
C
 T
T
 17 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(14): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0009g0009
a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
a0001c0002t0013g0162
 17 HG01192.hp2
HG01433.hp2
HG01884.hp1
others(14): Show 
HG01192.hp2
HG01433.hp2
HG01884.hp1
HG01884.hp2
HG02109.hp2
HG02145.hp1
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HG02559.hp1
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HG02809.hp1
HG03195.hp1
HG03471.hp1
HG06807.hp1
NA19240.hp1
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NA20300.hp1
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c.187+2640C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17764149
chr9:17764472 C
C
 T
T
 10 a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
others(7): Show 
a0001c0001t0001g0019
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0157
a0001c0001t0001g0192
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0001g0252
a0001c0001t0006g0221
a0001c0001t0018g0216
 10 HG02258.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
others(7): Show 
HG02258.hp1
HG02572.hp2
HG02622.hp2
HG02723.hp1
HG02965.hp1
HG03098.hp2
HG03139.hp1
HG03486.hp1
HG03516.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.187+2963C>T
c.187+2963C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17764472
chr9:17764552 C
C
 T
T
 6 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0186
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0006g0214
 6 HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp1
others(3): Show 
HG01884.hp1
HG02109.hp2
HG02257.hp1
HG02451.hp2
HG02809.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.187+3043C>T
c.187+3043C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17764552
chr9:17764640 T
T
 TTGGGAGT
others(215): Show 
TTGGGAGTACATCTGTATTAGATTACTGCTCCCGGGTGCTTGCTGGCTTT
CACATCTTGGGTACATGGACAGGCCAGGGGAATCAGTAGGATTTGATGCT
TCGAGGGTACTTTGGGAGTACATCTGTATTAGATTACTGCTCCCGGGTGC
TTGCTGGCTTTCACATCTTGGGTACATGGACAGGCCAGGGCAATCAGTAG
GATTTGATGCTTCGAGGGTACTC
 24 a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0063
others(21): Show 
a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0080
a0001c0001t0001g0081
a0001c0001t0001g0084
a0001c0001t0001g0089
a0001c0001t0001g0097
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0036
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0146
a0001c0001t0005g0169
a0001c0001t0005g0171
a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0018g0216
a0003c0005t0014g0137
 24 HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
others(21): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00558.hp2
HG01070.hp1
HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01258.hp1
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HG02074.hp2
HG02683.hp1
HG02735.hp1
HG03098.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp2
NA18747.hp1
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18975.hp2
NA19010.hp2
NA19074.hp1
NA19087.hp1
 intron_variant MODIFIER c.187+3329_187+3330i
others(224): Show 
c.187+3329_187+3330insGGATTTGATGCTTCGAGGGTACTCTGGG
AGTACATCTGTATTAGATTACTGCTCCCGGGTGCTTGCTGGCTTTCACAT
CTTGGGTACATGGACAGGCCAGGGGAATCAGTAGGATTTGATGCTTCGAG
GGTACTTTGGGAGTACATCTGTATTAGATTACTGCTCCCGGGTGCTTGCT
GGCTTTCACATCTTGGGTACATGGACAGGCCAGGGCAATCAGTA
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17764640
chr9:17764693 ATCTTGGG
others(215): Show 
ATCTTGGGTACATGGACAGGCCAGGGGAATCAGTAGGATTTGATGCTTCG
AGGGTACTTTGGGAGTACATCTGTATTAGATTACTGCTCCCGGGTGCTTG
CTGGCTTTCACATCTTGGGTACATGGACAGGCCAGGGCAATCAGTAAGAT
TTGATGCTTCAAGGGTACTTTGGGAGTACATCTGTATTAGATTACTGCTC
CCGGGTGCTTGCTGGCTTTCACG
 A
A
 2 a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0013g0162
a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0013g0162
 2 HG02630.hp2
NA20129.hp1
HG02630.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.187+3330_187+3551d
others(2): Show 
c.187+3330_187+3551del
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17764693
chr9:17764719 G
G
 C
C
 153 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
others(150): Show 
a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0011
a0001c0001t0001g0012
a0001c0001t0001g0013
a0001c0001t0001g0014
a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0016
a0001c0001t0001g0027
a0001c0001t0001g0029
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a0001c0001t0001g0042
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a0001c0001t0001g0052
a0001c0001t0001g0053
a0001c0001t0001g0054
a0001c0001t0001g0056
a0001c0001t0001g0058
a0001c0001t0001g0059
a0001c0001t0001g0060
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0064
a0001c0001t0001g0065
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0068
a0001c0001t0001g0071
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a0001c0001t0001g0086
a0001c0001t0001g0087
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a0001c0001t0001g0091
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a0001c0001t0001g0105
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A
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A
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T
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C
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c.187+3353T>C
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A
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c.187+3406G>A
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G
 C
C
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c.187+3432G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17764941
chr9:17764941 GAATCAGT
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TAGATTACTGCTCCCGGGTGCTTGCTGGCTTTCACATCTTGGGTACATGG
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 G
G
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a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
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NA19240.hp2
HG03098.hp1
NA19240.hp2
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c.187+3637_187+3747del
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17764941
chr9:17764973 T
T
 C
C
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c.187+3464T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17764973
chr9:17765008 G
G
 A
A
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a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
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c.187+3499G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765008
chr9:17765037 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0176
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HG01081.hp2
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c.187+3528A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765037
chr9:17765042 C
C
 A
A
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c.187+3533C>A
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T
 C
C
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G
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C
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A
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c.187+3686T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765195
chr9:17765227 CGGGTGCT
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CGGGTGCTTGCTGGCTTTCACATCTTGGGTTCATGGACAGGCCAGGGGAA
TCAGTAGGATTTGATGCTTCGAGGGTACTTTGGGAGTACATCTGTATTAG
ATTACTGCTCCT
 C
C
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a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
 intron_variant MODIFIER c.187+3739_187+3849d
others(2): Show 
c.187+3739_187+3849del
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17765227
chr9:17765229 G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0017
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NA19077.hp2
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c.187+3720G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765229
chr9:17765262 G
G
 A
A
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c.187+3829T>C
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A
 T
T
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a0001c0001t0001g0071
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NA18944.hp1
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c.187+4015A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765524
chr9:17765536 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0084
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HG04228.hp1
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c.187+4027T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765536
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0058
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HG02015.hp2
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c.187+4047G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765556
chr9:17765604 G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0061
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HG02683.hp2
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c.187+4095G>T
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chr9:17765635 C
C
 T
T
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c.187+4126C>T
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A
 T
T
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others(3): Show 
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c.187+4179A>T
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G
 C
C
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a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0021g0258
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HG02965.hp2
HG03471.hp2
HG03579.hp2
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c.187+4252G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765761
chr9:17765799 C
C
 T
T
 202 a0001c0001t0001g0006
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c.187+4294A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765803
chr9:17765825 C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0144
a0001c0001t0002g0144
 1 HG03491.hp2
HG03491.hp2
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c.187+4316C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765825
chr9:17765952 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
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HG00408.hp2
HG01074.hp1
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c.187+4443T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765952
chr9:17765986 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0190
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HG01192.hp2
HG01433.hp2
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c.187+4477C>G
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chr9:17765986 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0040
a0001c0001t0001g0040
 1 NA18942.hp2
NA18942.hp2
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c.187+4477C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17765986
chr9:17766188 C
C
 G
G
 43 a0001c0001t0001g0048
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 43 HG00140.hp2
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HG00280.hp1
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HG02895.hp2
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HG03139.hp2
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c.187+4679C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17766188
chr9:17766203 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0076
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HG01515.hp1
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c.187+4694G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17766203
chr9:17766317 G
G
 A
A
 213 a0001c0001t0001g0006
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a0001c0001t0001g0073
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G
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C
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T
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T
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C
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A
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C
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HG01433.hp2
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c.187+5580T>C
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C
 G
G
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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T
 C
C
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c.187+5633T>C
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T
 G
G
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a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0021g0258
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HG03471.hp2
HG03579.hp2
HG02965.hp2
HG03471.hp2
HG03579.hp2
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c.187+5734T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17767243
chr9:17767273 T
T
 G
G
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a0001c0001t0001g0166
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c.187+5764T>G
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chr9:17767653 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0063
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a0001c0001t0001g0048
a0001c0001t0001g0055
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c.187+6144T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17767653
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A
 G
G
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others(1): Show 
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0010g0219
a0001c0002t0005g0226
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others(1): Show 
HG02630.hp2
HG03098.hp1
NA19240.hp2
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c.187+6153A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17767662
chr9:17767813 A
A
 G
G
 34 a0001c0001t0001g0048
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others(31): Show 
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a0001c0001t0001g0055
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a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0001g0120
a0001c0001t0001g0121
a0001c0001t0001g0139
a0001c0001t0001g0150
a0001c0001t0004g0148
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a0001c0001t0004g0193
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a0001c0001t0004g0206
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0005g0022
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a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0050
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a0001c0001t0005g0169
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a0003c0005t0014g0137
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others(31): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
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HG01099.hp2
HG01258.hp1
HG02040.hp2
HG02074.hp2
HG02109.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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HG02717.hp1
HG02735.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp2
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp2
NA18747.hp1
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18975.hp2
NA19010.hp2
NA19074.hp1
NA19087.hp1
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c.187+6304A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17767813
chr9:17768206 C
C
 T
T
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a0001c0001t0019g0220
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HG02145.hp1
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c.187+6697C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17768206
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G
 C
C
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a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
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a0001c0001t0001g0053
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c.187+6882dupA
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C
 CAA
CAA
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CA
 C
C
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c.187+6882delA
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CAA
 C
C
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c.187+6881_187+6882delAA
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G
 C
C
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HG00673.hp2
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c.187+7107G>C
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A
 G
G
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c.187+7116A>G
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G
 A
A
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HG02630.hp2
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NA19240.hp2
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c.187+7153G>A
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 A
A
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c.187+7205G>A
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 C
C
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HG00642.hp2
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c.187+7273G>C
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C
 T
T
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others(7): Show 
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a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0028
a0001c0001t0003g0035
a0001c0001t0003g0094
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HG00642.hp2
HG00733.hp1
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c.187+7276C>T
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A
 G
G
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HG02280.hp2
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c.187+7314A>G
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A
 G
G
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HG03704.hp1
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c.187+7332A>G
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G
 A
A
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others(7): Show 
a0001c0001t0001g0254
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
a0001c0001t0003g0028
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a0001c0001t0003g0094
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a0001c0001t0003g0200
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HG01071.hp2
others(7): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
HG01361.hp2
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c.187+7457G>A
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C
 G
G
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a0001c0001t0010g0219
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HG02630.hp2
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c.187+7473C>G
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C
 G
G
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HG01074.hp1
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c.187+7480C>G
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T
 C
C
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AT
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c.187+7546dupT
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C
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T
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c.187+7690C>T
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A
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C
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C
 T
T
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NA18972.hp2
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c.187+7819C>T
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C
 T
T
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NA18944.hp1
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C
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G
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T
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G
 A
A
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A
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HG02056.hp2
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C
 G
G
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T
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G
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NA19010.hp2
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A
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c.187+10340G>A
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A
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C
 T
T
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A
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C
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a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
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c.187+10376A>C
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TGTAA
 T
T
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C
 A
A
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C
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T
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A
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 G
G
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a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
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NA18948.hp2
NA18612.hp2
NA18948.hp2
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c.187+10748A>G
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G
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a0001c0001t0005g0036
a0001c0001t0005g0046
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a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0146
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others(44): Show 
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G
 A
A
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others(27): Show 
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 30 HG00140.hp2
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others(27): Show 
HG00140.hp2
HG00280.hp1
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G
 A
A
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0089
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NA18943.hp1
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chr9:17773743 C
C
 G
G
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a0001c0001t0001g0128
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HG02300.hp2
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A
 G
G
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C
 T
T
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NA19240.hp2
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0016
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NA19011.hp2
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c.187+12346G>A
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A
 G
G
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A
 C
C
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HG01978.hp1
NA19030.hp1
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T
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c.188-12022C>T
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A
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HG00140.hp2
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C
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T
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A
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A
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c.188-11497G>A
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T
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A
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T
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T
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C
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T
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T
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C
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T
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G
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A
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C
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A
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A
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T
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C
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G
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A
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T
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HG03195.hp2
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CTAA
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T
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c.188-6543A>G
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G
 T
T
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.188-6520G>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17779861
chr9:17779891 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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c.188-6490A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17779891
chr9:17779912 G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0038
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HG00609.hp2
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c.188-6469G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17779912
chr9:17779995 T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0247
a0001c0001t0002g0247
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HG03195.hp2
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c.188-6386T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17779995
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A
 C
C
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a0001c0001t0011g0256
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HG01074.hp1
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c.188-6336A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780045
chr9:17780119 A
A
 G
G
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a0001c0001t0004g0255
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HG02895.hp2
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c.188-6262A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780119
chr9:17780369 G
G
 A
A
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others(37): Show 
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a0001c0001t0001g0055
a0001c0001t0001g0063
a0001c0001t0001g0080
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a0001c0001t0001g0120
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HG00280.hp1
HG00408.hp1
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c.188-6012G>A
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chr9:17780374 A
A
 C
C
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others(1): Show 
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a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0228
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others(1): Show 
HG00408.hp2
NA19002.hp1
NA19064.hp1
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c.188-6007A>C
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G
 A
A
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a0001c0001t0002g0037
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NA20300.hp2
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c.188-5917G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780464
chr9:17780465 C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0037
a0001c0001t0002g0037
 1 NA20300.hp2
NA20300.hp2
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c.188-5916C>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780465
chr9:17780465 C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0076
a0001c0001t0003g0076
 1 HG01515.hp1
HG01515.hp1
 intron_variant MODIFIER c.188-5916C>T
c.188-5916C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780465
chr9:17780469 G
G
 GT
GT
 28 a0001c0001t0001g0107
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a0001c0001t0001g0159
others(25): Show 
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
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 28 HG00408.hp2
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others(25): Show 
HG00408.hp2
HG01074.hp1
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c.188-5901dupT
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chr9:17780469 G
G
 GTT
GTT
 32 a0001c0001t0001g0055
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others(29): Show 
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a0001c0001t0001g0080
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a0001c0001t0005g0178
a0001c0001t0010g0218
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 32 HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00558.hp2
others(29): Show 
HG00280.hp1
HG00408.hp1
HG00558.hp2
HG01070.hp1
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HG02074.hp2
HG02109.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02683.hp1
HG02717.hp1
HG02809.hp2
HG02886.hp1
HG02895.hp2
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03139.hp2
HG03486.hp2
HG04184.hp2
HG04199.hp1
HG04228.hp1
NA18612.hp2
NA18747.hp1
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18975.hp2
NA19010.hp2
NA19074.hp1
NA19087.hp1
 intron_variant MODIFIER c.188-5902_188-5901d
others(4): Show 
c.188-5902_188-5901dupTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17780469
chr9:17780479 T
T
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0099
a0001c0001t0001g0152
a0001c0001t0001g0099
a0001c0001t0001g0152
 2 HG01192.hp1
NA20752.hp1
HG01192.hp1
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.188-5902T>A
c.188-5902T>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780479
chr9:17780480 T
T
 A
A
 104 a0001c0001t0001g0006
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
others(101): Show 
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a0001c0001t0001g0007
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T
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A
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AATT
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A
 ATT
ATT
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A
 T
T
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c.188-5899A>T
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A
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c.188-5889delT
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T
 A
A
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HG02965.hp2
HG02976.hp1
HG03041.hp2
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c.188-5898T>A
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0184
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HG03471.hp2
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c.188-5812C>T
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chr9:17780614 A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0008g0158
a0001c0001t0008g0196
a0001c0001t0008g0253
a0001c0001t0021g0258
a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0013g0162
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HG02280.hp2
HG02630.hp2
HG02965.hp2
HG02976.hp1
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c.188-5767A>G
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C
 T
T
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HG00642.hp2
HG00733.hp1
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c.188-5758C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780623
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0235
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HG02965.hp2
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c.188-5677C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780704
chr9:17780731 T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0175
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HG03654.hp1
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c.188-5650T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780731
chr9:17780769 TG
TG
 T
T
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others(3): Show 
a0001c0001t0001g0166
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
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others(3): Show 
HG01243.hp1
HG02055.hp1
HG02258.hp2
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c.188-5610delG
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chr9:17780812 A
A
 T
T
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a0001c0001t0004g0209
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others(1): Show 
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a0001c0001t0004g0209
a0001c0002t0005g0226
a0001c0002t0013g0162
 4 HG02280.hp2
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others(1): Show 
HG02280.hp2
HG02630.hp2
HG03098.hp1
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c.188-5569A>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780812
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A
 G
G
 17 a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
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others(14): Show 
a0001c0001t0001g0107
a0001c0001t0001g0116
a0001c0001t0001g0164
a0001c0001t0001g0166
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a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0223
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a0001c0001t0001g0229
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a0001c0001t0001g0244
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 17 HG00408.hp2
HG01109.hp2
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others(14): Show 
HG00408.hp2
HG01109.hp2
HG01243.hp1
HG02055.hp1
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c.188-5505A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780876
chr9:17780917 T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
 1 NA19240.hp2
NA19240.hp2
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c.188-5464T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780917
chr9:17780929 C
C
 T
T
 5 a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0007g0096
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others(2): Show 
a0001c0001t0001g0154
a0001c0001t0007g0096
a0001c0001t0007g0143
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 5 HG03017.hp1
HG03704.hp1
HG03942.hp1
others(2): Show 
HG03017.hp1
HG03704.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
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c.188-5452C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780929
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T
 G
G
 11 a0001c0001t0001g0201
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others(8): Show 
a0001c0001t0001g0201
a0001c0001t0001g0254
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a0001c0001t0003g0023
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 11 HG00642.hp2
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others(8): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
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HG01516.hp1
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HG03225.hp2
HG03831.hp2
HG04199.hp2
NA20752.hp2
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c.188-5408T>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 chr9 17780973
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C
 T
T
 108 a0001c0001t0001g0006
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a0001c0001t0001g0008
others(105): Show 
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a0001c0001t0001g0007
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a0001c0001t0001g0176
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a0001c0001t0006g0212
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a0001c0001t0006g0215
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a0001c0006t0001g0153
 108 HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00323.hp2
others(105): Show 
HG00140.hp1
HG00323.hp1
HG00323.hp2
HG00438.hp1
HG00558.hp1
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HG00673.hp2
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HG01175.hp2
HG01192.hp1
HG01192.hp2
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HG01255.hp1
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HG01358.hp1
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HG02056.hp2
HG02074.hp1
HG02145.hp1
HG02165.hp2
HG02300.hp2
HG02451.hp1
HG02523.hp1
HG02559.hp1
HG02630.hp1
HG02683.hp2
HG02735.hp2
HG02976.hp2
HG03017.hp2
HG03195.hp1
HG03225.hp1
HG03453.hp2
HG03471.hp1
HG03654.hp1
HG03654.hp2
HG03669.hp1
HG03669.hp2
HG03704.hp1
HG03710.hp2
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NA18612.hp1
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NA18942.hp2
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NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18950.hp2
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NA18961.hp1
NA18961.hp2
NA18966.hp1
NA18966.hp2
NA18968.hp2
NA18970.hp1
NA18970.hp2
NA18971.hp1
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C
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NA19240.hp2
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T
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T
 A
A
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a0001c0001t0001g0140
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HG03491.hp1
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c.188-4918T>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0140
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c.188-4916T>C
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C
 G
G
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HG02280.hp1
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c.188-4753C>G
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C
 T
T
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HG01515.hp1
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C
 A
A
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c.188-4705C>A
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C
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G
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c.188-4561C>G
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HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
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TTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTG
GCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGGTTCACGCCATTC
TCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCG
CCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAG
CCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCGCCCGCCTCGGCCTCC
CAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGATCAGGTGGAATTTGTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17781859
chr9:17781859 T
T
 TTCAGGTG
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TTCAGGTGGAATTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA
GACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGTGGCGC
AATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGGTTCACGCCATTCTCCT
GCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGCGCCCG
GCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTAGCCAG
GATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAA
GTGCTGGGATTACAGGCGTGA
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a0001c0001t0007g0172
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HG03017.hp1
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TTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGGACTGCAGT
GGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGGTTCACGCCATT
CTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACCGC
GCCCGGCTAATTTTTTGTACTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCTTGTTA
GCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCGCCCGCCTCGGCCTC
CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGATCAGGTGGAATTTGTT
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 3/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17781859
chr9:17781937 G
G
 C
C
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T
 C
C
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a0001c0001t0004g0198
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HG02109.hp1
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A
 C
C
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G
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A
 G
G
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T
 G
G
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A
 G
G
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 G
G
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c.188-3608A>G
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T
 G
G
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c.188-3586T>G
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A
 G
G
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NA18961.hp2
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c.188-3568A>G
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C
 A
A
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c.188-3487C>A
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C
 T
T
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HG01081.hp2
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c.188-3484C>T
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 T
T
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a0001c0001t0002g0197
a0001c0001t0002g0231
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HG01109.hp1
HG02257.hp2
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T
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C
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A
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G
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a0001c0001t0004g0189
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HG02280.hp2
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c.188-2897A>G
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C
 T
T
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HG02109.hp1
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c.188-2652C>T
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G
 T
T
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HG02630.hp1
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c.188-2612G>T
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G
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A
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c.188-2532G>A
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T
 A
A
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a0001c0001t0001g0049
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NA19012.hp2
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c.188-2451T>A
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 G
G
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a0001c0001t0001g0184
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HG02965.hp2
HG03471.hp2
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c.188-2379T>G
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A
 C
C
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HG02015.hp2
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c.188-2327A>C
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G
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A
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G
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G
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A
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A
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G
 C
C
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c.188-1398G>C
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A
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G
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c.188-1358A>G
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C
 G
G
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c.188-1226C>G
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T
 C
C
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c.188-1175T>C
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C
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G
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A
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NA18966.hp1
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A
 T
T
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NA18972.hp1
NA18975.hp1
NA19009.hp2
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c.188-985A>T
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C
 T
T
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CAAAG
 C
C
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T
 A
A
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T
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C
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G
 A
A
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c.188-501G>A
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C
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T
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T
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c.188-416C>T
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G
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A
 T
T
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G
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C
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c.188-181G>C
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G
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HG03540.hp2
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A
 G
G
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HG01074.hp1
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c.188-55A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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G
 A
A
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G
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c.331+194C>G
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C
 T
T
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HG02165.hp2
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c.331+204C>T
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A
 G
G
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c.331+212A>G
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G
 C
C
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c.331+371G>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 4/8 chr9 17786895
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A
 G
G
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HG04228.hp2
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c.332-384A>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0038
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HG00609.hp2
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c.332-268A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0170
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HG01175.hp1
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c.332-201C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 4/8 chr9 17787179
chr9:17787213 G
G
 A
A
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HG01884.hp1
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c.332-167G>A
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C
 G
G
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HG00642.hp2
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c.332-158C>G
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chr9:17787280 C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0203
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HG02723.hp1
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c.332-100C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 4/8 chr9 17787280
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T
 C
C
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HG01192.hp2
HG01433.hp2
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c.465+68T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 5/8 chr9 17787581
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C
 A
A
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a0001c0001t0010g0219
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NA19240.hp2
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c.465+92C>A
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chr9:17787629 G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0010g0219
a0001c0001t0010g0219
 1 NA19240.hp2
NA19240.hp2
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c.465+116G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 5/8 chr9 17787629
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A
 G
G
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a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0008
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c.465+223A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0029
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NA20805.hp1
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T
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c.466-489dupA
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C
 G
G
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a0001c0001t0002g0118
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c.466-481C>G
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A
 T
T
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C
 G
G
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c.466-157C>G
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T
 C
C
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G
 A
A
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c.624+40G>A
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G
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NA19240.hp2
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c.624+89A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 chr9 17789639
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C
 T
T
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c.624+300C>T
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 T
T
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SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 INFO_REALIGN_3_PRIME chr9 17789855
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A
 C
C
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NA19240.hp2
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c.624+330A>C
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chr9:17789884 G
G
 A
A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0053
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0164
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T
 C
C
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c.624+423T>C
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G
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c.624+426A>G
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A
 G
G
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c.624+472A>G
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A
 C
C
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a0001c0001t0001g0259
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HG00438.hp1
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c.624+525A>C
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A
 G
G
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G
 T
T
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A
 T
T
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a0001c0001t0009g0181
a0001c0001t0019g0220
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C
 G
G
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a0001c0001t0001g0184
a0001c0001t0001g0235
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HG02965.hp2
HG03471.hp2
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chr9:17790217 G
G
 T
T
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c.624+667G>T
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A
 G
G
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NA18972.hp2
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T
 G
G
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HG00408.hp1
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c.625-703T>G
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C
 A
A
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others(36): Show 
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a0001c0001t0018g0216
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a0001c0002t0005g0226
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others(36): Show 
HG00408.hp1
HG01099.hp2
HG01192.hp2
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c.625-673C>A
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chr9:17790593 A
A
 G
G
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HG02965.hp2
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c.625-638A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 chr9 17790593
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G
 A
A
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a0001c0001t0001g0016
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NA19011.hp2
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c.625-392G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 chr9 17790839
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C
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0061
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a0001c0001t0001g0015
a0001c0001t0001g0061
a0001c0001t0001g0180
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HG02683.hp2
NA20905.hp1
HG00323.hp1
HG02683.hp2
NA20905.hp1
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c.625-232C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 chr9 17790999
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C
 G
G
 12 a0001c0001t0003g0002
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others(9): Show 
a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
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 12 HG00642.hp2
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others(9): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
HG01071.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.625-214C>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 chr9 17791017
chr9:17791053 C
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 T
T
 1 a0001c0001t0004g0198
a0001c0001t0004g0198
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HG02109.hp1
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c.625-178C>T
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 chr9 17791053
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T
 C
C
 4 a0001c0001t0007g0096
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others(1): Show 
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a0001c0001t0007g0143
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 4 HG03017.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
others(1): Show 
HG03017.hp1
HG03942.hp1
HG04184.hp1
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.625-51T>C
c.625-51T>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 chr9 17791180
chr9:17791193 G
G
 A
A
 17 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(14): Show 
a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0186
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a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0235
a0001c0001t0001g0248
a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0004g0189
a0001c0001t0006g0214
a0001c0001t0006g0215
a0001c0001t0021g0258
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 17 HG01192.hp2
HG01433.hp2
HG01884.hp1
others(14): Show 
HG01192.hp2
HG01433.hp2
HG01884.hp1
HG01884.hp2
HG02109.hp2
HG02257.hp1
HG02280.hp2
HG02451.hp2
HG02559.hp1
HG02630.hp2
HG02809.hp1
HG02965.hp2
HG03098.hp1
HG03195.hp1
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HG03579.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.625-38G>A
c.625-38G>A
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 6/8 chr9 17791193
chr9:17791427 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0176
a0001c0001t0001g0176
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HG01081.hp2
 intron_variant MODIFIER c.728+93A>G
c.728+93A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 7/8 chr9 17791427
chr9:17791444 C
C
 T
T
 39 a0001c0001t0001g0159
a0001c0001t0001g0160
a0001c0001t0001g0161
others(36): Show 
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c.728+110C>T
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 T
T
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HG02965.hp1
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c.728+175G>T
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G
 A
A
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c.728+434G>A
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 T
T
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c.728+446C>T
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A
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G
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a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0004g0148
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HG00408.hp1
HG01099.hp2
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c.728+588A>G
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C
 G
G
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a0001c0001t0004g0209
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NA20129.hp1
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c.728+654C>G
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A
 G
G
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a0001c0001t0003g0002
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HG03831.hp2
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c.728+656A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 7/8 chr9 17791990
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A
 G
G
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a0001c0001t0004g0205
a0001c0001t0004g0230
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HG03486.hp2
HG02572.hp1
HG03486.hp2
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c.728+673A>G
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A
 G
G
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c.728+689A>G
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C
 T
T
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a0001c0001t0001g0161
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a0001c0001t0001g0163
a0001c0001t0001g0184
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a0001c0001t0001g0187
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0001g0235
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a0001c0001t0004g0209
a0001c0001t0004g0230
a0001c0001t0004g0255
a0001c0001t0005g0022
a0001c0001t0005g0036
a0001c0001t0005g0046
a0001c0001t0005g0047
a0001c0001t0005g0050
a0001c0001t0005g0146
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C
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c.729-813T>C
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A
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G
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C
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T
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A
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c.729-430T>A
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G
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T
 C
C
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A
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A
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C
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T
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HG02523.hp1
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HG03471.hp2
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c.859+312T>A
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A
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c.859+323G>A
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C
 T
T
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c.859+507T>C
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T
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c.859+695C>T
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A
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C
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a0001c0001t0001g0184
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HG03471.hp2
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c.859+820A>C
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G
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A
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a0001c0001t0021g0258
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HG03579.hp2
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c.859+836G>A
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T
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C
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HG06807.hp2
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c.859+896A>G
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G
 C
C
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c.859+897G>C
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A
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T
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G
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G
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c.860-373A>G
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A
 C
C
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a0001c0001t0003g0023
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a0001c0001t0003g0002
a0001c0001t0003g0023
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others(10): Show 
HG00642.hp2
HG00733.hp1
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.860-313A>C
c.860-313A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 8/8 chr9 17795231
chr9:17795289 A
A
 C
C
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a0001c0001t0001g0184
 1 HG03471.hp2
HG03471.hp2
 intron_variant MODIFIER c.860-255A>C
c.860-255A>C
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 8/8 chr9 17795289
chr9:17795326 A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0049
a0001c0001t0001g0049
 1 NA19012.hp2
NA19012.hp2
 intron_variant MODIFIER c.860-218A>G
c.860-218A>G
SH3GL2 ENSG00000107295.10 transcript ENST00000380607.5 protein_coding 8/8 chr9 17795326

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