Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr10:35126922	G G	T T	2	a0001c0002t0004 a0001c0002t0020 a0001c0002t0004 a0001c0002t0020	12	HG00738.hp2 HG01071.hp1 HG01109.hp1 others(9): Show HG00738.hp2 HG01071.hp1 HG01109.hp1 HG02257.hp2 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02647.hp1 HG02723.hp1 HG02809.hp1 HG02965.hp1 HG03471.hp2 NA19240.hp2	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-326G>T c.-326G>T	CREM	ENSG00000095794.21	transcript	ENST00000685392.1	protein_coding	1/8	10914		chr10	35126922
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chr10:35137827	A A	G G	9	a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0007 others(6): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0007 a0001c0001t0009 a0001c0001t0018 a0001c0002t0004 a0001c0002t0020 a0001c0003t0002 a0003c0006t0003	122	HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00423.hp2 others(119): Show HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00423.hp2 HG00544.hp1 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00733.hp2 HG00735.hp2 HG00738.hp2 HG00741.hp2 HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01074.hp1 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp2 HG01109.hp1 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01175.hp1 HG01192.hp1 HG01258.hp2 HG01358.hp2 HG01515.hp1 HG01515.hp2 HG01516.hp2 HG01928.hp1 HG01975.hp1 HG01981.hp1 HG01993.hp1 HG02015.hp1 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02129.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp2 HG02257.hp2 HG02273.hp1 HG02280.hp1 HG02293.hp1 HG02486.hp1 HG02559.hp2 HG02572.hp2 HG02602.hp2 HG02615.hp2 HG02622.hp2 HG02647.hp1 HG02683.hp2 HG02723.hp1 HG02723.hp2 HG02738.hp2 HG02809.hp1 HG02886.hp1 HG02895.hp2 HG02965.hp1 HG03017.hp2 HG03041.hp1 HG03225.hp2 HG03239.hp2 HG03471.hp2 HG03486.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03540.hp1 HG03579.hp2 HG03669.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG03710.hp1 HG03710.hp2 HG03927.hp2 HG03942.hp1 HG04115.hp1 HG04115.hp2 HG04199.hp2 HG04204.hp1 HG06807.hp1 NA18612.hp2 NA18941.hp1 NA18943.hp2 NA18944.hp1 NA18946.hp2 NA18947.hp2 NA18953.hp2 NA18954.hp1 NA18955.hp1 NA18959.hp1 NA18959.hp2 NA18961.hp1 NA18965.hp2 NA18972.hp2 NA18975.hp1 NA18980.hp1 NA18984.hp2 NA18985.hp2 NA18990.hp2 NA18991.hp1 NA19000.hp1 NA19000.hp2 NA19002.hp2 NA19004.hp1 NA19005.hp2 NA19007.hp1 NA19010.hp1 NA19011.hp2 NA19012.hp2 NA19057.hp2 NA19058.hp1 NA19058.hp2 NA19065.hp2 NA19066.hp1 NA19068.hp1 NA19070.hp1 NA19074.hp1 NA19076.hp1 NA19081.hp2 NA19089.hp2 NA19240.hp2 NA20805.hp1	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-9A>G c.-9A>G	CREM	ENSG00000095794.21	transcript	ENST00000685392.1	protein_coding	2/8			chr10	35137827
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chr10:35212734	G G	A A	1	a0001c0001t0015 a0001c0001t0015	1	HG01891.hp1 HG01891.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1336G>A c.1336G>A	CREM	ENSG00000095794.21	transcript	ENST00000685392.1	protein_coding	8/8	1336		chr10	35212734

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JoGo Online Haplotype Explorer CREM_chr10_35121846_35217953

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 20)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 291)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 6)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 23)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 291)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 294)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 20)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1115)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)