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chr11:46312665	A A	G G	1	a0001c0006 a0001c0006	3	HG01109.hp2 HG02965.hp2 HG03486.hp2 HG01109.hp2 HG02965.hp2 HG03486.hp2	synonymous_variant	LOW	c.957A>G c.957A>G	p.Glu319Glu p.Glu319Glu	CREB3L1	ENSG00000157613.11	transcript	ENST00000621158.5	protein_coding	7/12	1407/2673	957/1560	319/519	chr11	46312665
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chr11:46317426	C C	T T	2	a0001c0012 a0003c0003 a0001c0012 a0003c0003	13	HG02451.hp2 HG02647.hp2 HG02809.hp2 others(10): Show HG02451.hp2 HG02647.hp2 HG02809.hp2 HG02895.hp2 HG02897.hp1 HG02965.hp1 HG02976.hp1 HG03139.hp2 HG03209.hp1 HG03225.hp2 HG03453.hp2 HG03540.hp2 NA19240.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1197C>T c.1197C>T	p.Ser399Ser p.Ser399Ser	CREB3L1	ENSG00000157613.11	transcript	ENST00000621158.5	protein_coding	10/12	1647/2673	1197/1560	399/519	chr11	46317426

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chr11:46277758	C C	G G	6	a0001c0001t0004 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 others(3): Show a0001c0001t0004 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0019 a0001c0012t0004 a0003c0003t0007	20	HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02486.hp2 others(17): Show HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02486.hp2 HG02630.hp1 HG02818.hp2 HG02896.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02965.hp1 HG02976.hp1 HG02976.hp2 HG03041.hp2 HG03098.hp2 HG03139.hp2 HG03225.hp1 HG03540.hp2 HG03579.hp2 NA18522.hp2 NA19240.hp1 NA20129.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-354C>G c.-354C>G	CREB3L1	ENSG00000157613.11	transcript	ENST00000621158.5	protein_coding	1/12	354		chr11	46277758
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chr:pos	ref	alt	# # of ghapid:genebody level	ghapids	# # of haplotypeids	haplotypeids	annotation	impact	hgvs_c	genename	geneid	featuretype	featureid	genebody_biotype	rank	status	chr	pos
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JoGo Online Haplotype Explorer CREB3L1_chr11_46272662_46326409

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 8)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 13)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 20)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 257)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 13)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 32)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 265)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 304)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 7)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 18)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 430)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)