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ALDH2_chr12_111761933_111822532 / BRCA1_chr17_43039295_43130364 etc.

  Error connecting to IGV?   CYSLTR2_chr13_48648929_48716226  CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 (clean+top1000)

Multiple Alignments (by translate haplotype frequency)Multiple Alignments (by aa haplotype frequency) Multiple Alignments (by translate haplotype similarity)Multiple Alignments (by aa haplotype similarity)

Item Value
geneid 57105
ensemblid ENSG00000152207.8
hgncid 18274
symbol CYSLTR2
name cysteinyl leukotriene receptor 2
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HG00408 hp1 a0001 c0001 t0008 g0004 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00408 hp2 a0001 c0001 t0001 g0229 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00438 hp1 a0001 c0001 t0001 g0261 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00438 hp2 a0001 c0001 t0008 g0004 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00558 hp1 a0001 c0001 t0006 g0124 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00558 hp2 a0001 c0001 t0001 g0276 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00609 hp1 a0001 c0001 t0002 g0150 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00609 hp2 a0001 c0001 t0008 g0002 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00621 hp1 a0001 c0001 t0002 g0154 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00621 hp2 a0001 c0001 t0001 g0255 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00642 hp1 a0001 c0001 t0002 g0128 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00642 hp2 a0001 c0001 t0001 g0253 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00673 hp1 a0001 c0001 t0003 g0003 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00673 hp2 a0001 c0001 t0002 g0061 EAS CHS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00733 hp1 a0001 c0001 t0001 g0181 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00733 hp2 a0001 c0004 t0005 g0197 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00735 hp1 a0001 c0001 t0001 g0207 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00735 hp2 a0001 c0001 t0002 g0076 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00738 hp1 a0001 c0001 t0003 g0133 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00738 hp2 a0001 c0001 t0001 g0218 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00741 hp1 a0001 c0001 t0002 g0053 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG00741 hp2 a0001 c0001 t0004 g0176 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01069 hp1 a0001 c0001 t0001 g0023 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01069 hp2 a0001 c0001 t0010 g0161 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01071 hp1 a0001 c0001 t0001 g0208 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01071 hp2 a0001 c0001 t0010 g0162 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01074 hp1 a0001 c0001 t0004 g0085 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01074 hp2 a0001 c0001 t0003 g0132 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01081 hp1 a0001 c0001 t0020 g0086 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01081 hp2 a0001 c0001 t0004 g0006 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01099 hp1 a0001 c0001 t0004 g0235 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01099 hp2 a0001 c0001 t0006 g0212 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01109 hp1 a0001 c0001 t0011 g0156 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01109 hp2 a0002 c0002 t0016 g0079 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01168 hp1 a0001 c0001 t0002 g0012 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01168 hp2 a0001 c0001 t0003 g0135 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01169 hp1 a0001 c0001 t0002 g0012 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01169 hp2 a0008 c0011 t0001 g0189 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01192 hp1 a0001 c0001 t0001 g0182 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01192 hp2 a0002 c0002 t0005 g0195 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01243 hp1 a0001 c0004 t0005 g0233 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01243 hp2 a0001 c0001 t0003 g0070 AMR PUR CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01256 hp1 a0001 c0001 t0001 g0008 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01256 hp2 a0001 c0001 t0002 g0040 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01257 hp1 a0001 c0001 t0002 g0045 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01257 hp2 a0001 c0001 t0001 g0216 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01261 hp1 a0001 c0001 t0002 g0041 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01261 hp2 a0001 c0001 t0002 g0227 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01361 hp1 a0009 c0013 t0003 g0080 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01361 hp2 a0001 c0001 t0018 g0202 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01496 hp1 a0001 c0004 t0005 g0186 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01496 hp2 a0001 c0001 t0001 g0243 AMR CLM CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01515 hp1 a0001 c0001 t0002 g0022 EUR IBS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01515 hp2 a0001 c0001 t0006 g0200 EUR IBS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01517 hp1 a0001 c0001 t0002 g0022 EUR IBS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01517 hp2 a0006 c0009 t0001 g0221 EUR IBS CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01884 hp1 a0001 c0001 t0003 g0130 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01884 hp2 a0002 c0002 t0005 g0087 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01928 hp1 a0001 c0001 t0001 g0007 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01928 hp2 a0001 c0001 t0004 g0006 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01934 hp1 a0001 c0001 t0001 g0198 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01934 hp2 a0001 c0001 t0001 g0007 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01943 hp1 a0001 c0001 t0006 g0211 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01943 hp2 a0001 c0001 t0001 g0230 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01952 hp1 a0001 c0001 t0004 g0174 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01952 hp2 a0001 c0001 t0002 g0001 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01975 hp1 a0001 c0001 t0004 g0057 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01975 hp2 a0001 c0004 t0005 g0184 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01978 hp1 a0001 c0001 t0001 g0238 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01978 hp2 a0001 c0001 t0004 g0006 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01993 hp1 a0001 c0001 t0001 g0265 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG01993 hp2 a0001 c0001 t0002 g0044 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02015 hp1 a0001 c0001 t0001 g0271 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02015 hp2 a0001 c0001 t0002 g0275 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02055 hp1 a0002 c0002 t0005 g0194 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02055 hp2 a0001 c0001 t0006 g0213 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02056 hp1 a0001 c0001 t0001 g0219 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02056 hp2 a0001 c0001 t0015 g0011 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02071 hp1 a0001 c0001 t0001 g0203 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02071 hp2 a0001 c0001 t0008 g0002 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02074 hp1 a0001 c0001 t0001 g0247 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02074 hp2 a0001 c0001 t0025 g0001 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02080 hp1 a0001 c0001 t0008 g0002 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02080 hp2 a0001 c0001 t0002 g0074 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02129 hp1 a0001 c0001 t0008 g0002 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02129 hp2 a0001 c0001 t0001 g0256 EAS KHV CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02145 hp1 a0010 c0014 t0004 g0123 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02145 hp2 a0001 c0001 t0006 g0112 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02165 hp1 a0001 c0001 t0001 g0155 EAS CDX CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02165 hp2 a0001 c0001 t0001 g0254 EAS CDX CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02257 hp1 a0001 c0001 t0003 g0094 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02257 hp2 a0001 c0001 t0012 g0081 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02293 hp1 a0001 c0001 t0004 g0175 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02293 hp2 a0001 c0001 t0001 g0199 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
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HG02300 hp2 a0001 c0001 t0002 g0001 AMR PEL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02451 hp1 a0001 c0001 t0003 g0093 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02451 hp2 a0001 c0001 t0011 g0165 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02572 hp1 a0001 c0001 t0003 g0071 AFR GWD CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
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HG03540 hp1 a0001 c0001 t0009 g0257 AFR GWD CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
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HG04199 hp1 a0001 c0001 t0002 g0032 SAS STU CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
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NA19075 hp2 a0001 c0001 t0002 g0054 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA19082 hp1 a0001 c0001 t0008 g0166 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA19082 hp2 a0001 c0001 t0002 g0141 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA19086 hp1 a0001 c0001 t0001 g0279 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA19086 hp2 a0001 c0001 t0002 g0064 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA19090 hp1 a0001 c0001 t0017 g0252 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA19090 hp2 a0001 c0001 t0002 g0062 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA19240 hp1 a0001 c0004 t0005 g0129 AFR YRI CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA19240 hp2 a0001 c0001 t0001 g0114 AFR YRI CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA20129 hp1 a0004 c0005 t0007 g0097 AFR ASW CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA20129 hp2 a0001 c0001 t0001 g0210 AFR ASW CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA20752 hp1 a0001 c0001 t0006 g0236 EUR TSI CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA20752 hp2 a0001 c0001 t0019 g0193 EUR TSI CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA20905 hp1 a0001 c0001 t0003 g0134 SAS GIH CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA20905 hp2 a0001 c0001 t0023 g0052 SAS GIH CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02486 hp1 a0001 c0001 t0001 g0232 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02486 hp2 a0001 c0001 t0010 g0163 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02559 hp1 a0001 c0001 t0001 g0273 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG02559 hp2 a0001 c0001 t0003 g0017 AFR ACB CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG03471 hp1 a0003 c0003 t0007 g0115 AFR MSL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG03471 hp2 a0001 c0001 t0003 g0101 AFR MSL CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG06807 hp1 a0001 c0001 t0001 g0222 AFR USA CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
HG06807 hp2 a0001 c0001 t0001 g0024 AFR USA CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA18955 hp1 a0001 c0001 t0026 g0030 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA18955 hp2 a0001 c0001 t0001 g0272 EAS JPT CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA20300 hp1 a0002 c0002 t0005 g0021 AFR USA CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA20300 hp2 a0001 c0001 t0009 g0111 AFR USA CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA21309 hp1 a0011 c0012 t0010 g0119 AFR LWK CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
NA21309 hp2 a0001 c0001 t0002 g0011 AFR LWK CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
homoSapiens_chm13v2 hp1 a0001 c0001 t0004 g0019 REF REF CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226
homoSapiens_grch38 hp1 a0001 c0001 t0001 g0240 REF REF CYSLTR2_chr13_48648929_48716226 CYSLTR2 chr13 48648929 48716226

chr:pos ref alt #
# of ahapid:amino-acid(protein) level
 ahapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr13:48706925
C
C
 A
A
 1 a0007
a0007
 2 NA18947.hp2
NA19004.hp1
NA18947.hp2
NA19004.hp1
 missense_variant MODERATE c.108C>A
c.108C>A
 p.Phe36Leu
p.Phe36Leu
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 462/4763 108/1041 36/346 chr13 48706925
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G
G
 C
C
 1 a0003
a0003
 7 HG02896.hp1
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HG02970.hp1
others(4): Show 
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02970.hp1
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp1
 missense_variant MODERATE c.115G>C
c.115G>C
 p.Glu39Gln
p.Glu39Gln
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 469/4763 115/1041 39/346 chr13 48706932
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T
T
 G
G
 1 a0012
a0012
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 missense_variant MODERATE c.148T>G
c.148T>G
 p.Phe50Val
p.Phe50Val
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A
A
 G
G
 1 a0012
a0012
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 missense_variant MODERATE c.308A>G
c.308A>G
 p.Asn103Ser
p.Asn103Ser
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 662/4763 308/1041 103/346 chr13 48707125
chr13:48707278
G
G
 A
A
 1 a0008
a0008
 1 HG01169.hp2
HG01169.hp2
 missense_variant MODERATE c.461G>A
c.461G>A
 p.Ser154Asn
p.Ser154Asn
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 815/4763 461/1041 154/346 chr13 48707278
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A
A
 G
G
 1 a0006
a0006
 2 HG01517.hp2
HG04199.hp2
HG01517.hp2
HG04199.hp2
 missense_variant MODERATE c.601A>G
c.601A>G
 p.Met201Val
p.Met201Val
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 955/4763 601/1041 201/346 chr13 48707418
chr13:48707476
G
G
 A
A
 1 a0011
a0011
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
 missense_variant MODERATE c.659G>A
c.659G>A
 p.Cys220Tyr
p.Cys220Tyr
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1013/4763 659/1041 220/346 chr13 48707476
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C
C
 T
T
 1 a0002
a0002
 10 HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01884.hp2
others(7): Show 
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
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NA20300.hp1
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c.707C>T
 p.Ser236Leu
p.Ser236Leu
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1061/4763 707/1041 236/346 chr13 48707524
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C
C
 G
G
 2 a0004
a0005
a0004
a0005
 5 HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG03516.hp1
others(2): Show 
HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG03516.hp1
NA19043.hp2
NA20129.hp1
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c.726C>G
 p.His242Gln
p.His242Gln
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1080/4763 726/1041 242/346 chr13 48707543
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A
A
 G
G
 1 a0005
a0005
 2 HG02572.hp2
NA19043.hp2
HG02572.hp2
NA19043.hp2
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c.788A>G
 p.Tyr263Cys
p.Tyr263Cys
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1142/4763 788/1041 263/346 chr13 48707605
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T
T
 A
A
 1 a0012
a0012
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 missense_variant MODERATE c.832T>A
c.832T>A
 p.Leu278Ile
p.Leu278Ile
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1186/4763 832/1041 278/346 chr13 48707649
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C
C
 G
G
 1 a0010
a0010
 1 HG02145.hp1
HG02145.hp1
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c.875C>G
 p.Ala292Gly
p.Ala292Gly
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1229/4763 875/1041 292/346 chr13 48707692
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G
 A
A
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HG01361.hp1
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c.944G>A
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p.Arg315Lys
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1298/4763 944/1041 315/346 chr13 48707761

chr:pos ref alt #
# of chapid
 chapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr13:48707627
C
C
 T
T
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a0001c0007
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HG02735.hp1
HG04204.hp2
 synonymous_variant LOW c.810C>T
c.810C>T
 p.His270His
p.His270His
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1164/4763 810/1041 270/346 chr13 48707627
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C
C
 T
T
 1 a0001c0004
a0001c0004
 6 HG00733.hp2
HG01243.hp1
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others(3): Show 
HG00733.hp2
HG01243.hp1
HG01496.hp1
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NA19240.hp1
 synonymous_variant LOW c.900C>T
c.900C>T
 p.Phe300Phe
p.Phe300Phe
 CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1254/4763 900/1041 300/346 chr13 48707717

chr:pos ref alt #
# of thapid:transcript level
 thapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid transcript_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr13:48691253
G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0009
a0003c0003t0007
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others(1): Show 
a0001c0001t0009
a0003c0003t0007
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a0005c0008t0007
 18 HG02572.hp2
HG02723.hp2
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others(15): Show 
HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG02818.hp1
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c.-224G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/5 15565 chr13 48691253
chr13:48696567
A
A
 G
G
 17 a0001c0001t0002
a0001c0001t0004
a0001c0001t0006
others(14): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0004
a0001c0001t0006
a0001c0001t0008
a0001c0001t0009
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a0001c0001t0023
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a0001c0001t0027
a0003c0003t0007
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a0005c0008t0007
a0010c0014t0004
a0012c0010t0022
 143 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00408.hp1
others(140): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00408.hp1
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HG01099.hp2
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HG03831.hp1
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HG04115.hp1
HG04115.hp2
HG04199.hp1
HG04204.hp1
HG04228.hp2
NA18939.hp1
NA18939.hp2
NA18940.hp2
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18948.hp2
NA18950.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp2
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18964.hp1
NA18967.hp1
NA18968.hp1
NA18970.hp2
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18980.hp2
NA18985.hp1
NA18988.hp1
NA18989.hp1
NA18989.hp2
NA18991.hp2
NA18993.hp2
NA18995.hp1
NA18995.hp2
NA18999.hp2
NA19001.hp1
NA19004.hp2
NA19005.hp2
NA19006.hp2
NA19007.hp2
NA19009.hp1
NA19010.hp1
NA19010.hp2
NA19012.hp2
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA19043.hp2
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19065.hp1
NA19070.hp2
NA19075.hp1
NA19075.hp2
NA19082.hp1
NA19082.hp2
NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA20129.hp1
NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp2
NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 5_prime_UTR_variant MODIFIER c.-61A>G
c.-61A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/5 10251 chr13 48696567
chr13:48696600
C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0004
a0001c0001t0006
a0001c0001t0008
others(1): Show 
a0001c0001t0004
a0001c0001t0006
a0001c0001t0008
a0010c0014t0004
 45 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
others(42): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp2
HG00741.hp2
HG01074.hp1
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HG01099.hp2
HG01515.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
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HG02055.hp2
HG02071.hp2
HG02080.hp1
HG02129.hp1
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02602.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp2
HG03017.hp2
HG03209.hp2
HG03927.hp1
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NA18939.hp2
NA18950.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp1
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NA18989.hp2
NA18991.hp2
NA18993.hp2
NA18995.hp1
NA19009.hp1
NA19070.hp2
NA19075.hp1
NA19082.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant LOW c.-28C>T
c.-28C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/5 chr13 48696600
chr13:48707907
T
T
 G
G
 1 a0012c0010t0022
a0012c0010t0022
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*49T>G
c.*49T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 49 chr13 48707907
chr13:48708060
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022
a0012c0010t0022
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*202G>A
c.*202G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 202 chr13 48708060
chr13:48708150
T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0008
a0001c0001t0008
 12 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp2
others(9): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp2
HG02071.hp2
HG02080.hp1
HG02129.hp1
NA18950.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp1
NA18993.hp2
NA19009.hp1
NA19082.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*292T>G
c.*292T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 292 chr13 48708150
chr13:48708346
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0021
a0001c0001t0021
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*488A>G
c.*488A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 488 chr13 48708346
chr13:48708457
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0014
a0001c0001t0014
 2 HG02735.hp2
HG03831.hp2
HG02735.hp2
HG03831.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*599T>C
c.*599T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 599 chr13 48708457
chr13:48708480
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0012
a0001c0001t0012
 4 HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
others(1): Show 
HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
HG03486.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*622T>C
c.*622T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 622 chr13 48708480
chr13:48708504
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0023
a0001c0001t0023
 1 NA20905.hp2
NA20905.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*646T>C
c.*646T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 646 chr13 48708504
chr13:48708566
C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0011
a0001c0001t0011
 5 HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG02886.hp1
others(2): Show 
HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG02886.hp1
HG03195.hp1
HG03516.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*708C>G
c.*708C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 708 chr13 48708566
chr13:48708587
T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0009
a0002c0002t0016
a0001c0001t0009
a0002c0002t0016
 7 HG01109.hp2
HG02818.hp1
HG03453.hp1
others(4): Show 
HG01109.hp2
HG02818.hp1
HG03453.hp1
HG03540.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20300.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*729T>C
c.*729T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 729 chr13 48708587
chr13:48708895
C
C
 T
T
 6 a0001c0001t0002
a0001c0001t0015
a0001c0001t0023
others(3): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0015
a0001c0001t0023
a0001c0001t0025
a0001c0001t0026
a0001c0001t0027
 73 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00609.hp1
others(70): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00609.hp1
HG00621.hp1
HG00642.hp1
HG00673.hp2
HG00735.hp2
HG00741.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG01256.hp2
HG01257.hp1
HG01261.hp1
HG01261.hp2
HG01515.hp1
HG01517.hp1
HG01952.hp2
HG01993.hp2
HG02015.hp2
HG02056.hp2
HG02074.hp2
HG02080.hp2
HG02300.hp2
HG02602.hp2
HG02683.hp2
HG02738.hp1
HG03017.hp1
HG03491.hp2
HG03492.hp1
HG03669.hp1
HG04115.hp2
HG04199.hp1
HG04204.hp1
NA18939.hp1
NA18940.hp2
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18948.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp2
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18964.hp1
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18980.hp2
NA18985.hp1
NA18988.hp1
NA18989.hp1
NA18995.hp2
NA18999.hp2
NA19001.hp1
NA19004.hp2
NA19005.hp2
NA19006.hp2
NA19007.hp2
NA19010.hp1
NA19010.hp2
NA19012.hp2
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19065.hp1
NA19075.hp2
NA19082.hp2
NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA20905.hp2
NA21309.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1037C>T
c.*1037C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1037 chr13 48708895
chr13:48709166
C
C
 T
T
 1 a0012c0010t0022
a0012c0010t0022
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1308C>T
c.*1308C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1308 chr13 48709166
chr13:48709261
A
A
 G
G
 1 a0012c0010t0022
a0012c0010t0022
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1403A>G
c.*1403A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1403 chr13 48709261
chr13:48709346
C
C
 T
T
 1 a0002c0002t0013
a0002c0002t0013
 3 HG02965.hp2
HG02976.hp1
HG03041.hp1
HG02965.hp2
HG02976.hp1
HG03041.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1488C>T
c.*1488C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1488 chr13 48709346
chr13:48709351
A
A
 G
G
 13 a0001c0001t0002
a0001c0001t0004
a0001c0001t0006
others(10): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0004
a0001c0001t0006
a0001c0001t0008
a0001c0001t0011
a0001c0001t0015
a0001c0001t0023
a0001c0001t0024
a0001c0001t0025
a0001c0001t0026
a0001c0001t0027
a0010c0014t0004
a0012c0010t0022
 125 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00408.hp1
others(122): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00642.hp1
HG00673.hp2
HG00735.hp2
HG00741.hp1
HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01099.hp2
HG01109.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG01256.hp2
HG01257.hp1
HG01261.hp1
HG01261.hp2
HG01515.hp1
HG01515.hp2
HG01517.hp1
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG01952.hp2
HG01975.hp1
HG01978.hp2
HG01993.hp2
HG02015.hp2
HG02055.hp2
HG02056.hp2
HG02071.hp2
HG02074.hp2
HG02080.hp1
HG02080.hp2
HG02129.hp1
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02300.hp2
HG02451.hp2
HG02602.hp1
HG02602.hp2
HG02630.hp1
HG02647.hp2
HG02683.hp2
HG02738.hp1
HG02886.hp1
HG03017.hp1
HG03017.hp2
HG03195.hp1
HG03209.hp2
HG03491.hp2
HG03492.hp1
HG03516.hp2
HG03669.hp1
HG03831.hp1
HG03927.hp1
HG04115.hp1
HG04115.hp2
HG04199.hp1
HG04204.hp1
HG04228.hp2
NA18939.hp1
NA18939.hp2
NA18940.hp2
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18948.hp2
NA18950.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp2
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18964.hp1
NA18967.hp1
NA18968.hp1
NA18970.hp2
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18980.hp2
NA18985.hp1
NA18988.hp1
NA18989.hp1
NA18989.hp2
NA18991.hp2
NA18993.hp2
NA18995.hp1
NA18995.hp2
NA18999.hp2
NA19001.hp1
NA19004.hp2
NA19005.hp2
NA19006.hp2
NA19007.hp2
NA19009.hp1
NA19010.hp1
NA19010.hp2
NA19012.hp2
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19065.hp1
NA19070.hp2
NA19075.hp1
NA19075.hp2
NA19082.hp1
NA19082.hp2
NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp2
NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1493A>G
c.*1493A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1493 chr13 48709351
chr13:48709515
A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0004
a0010c0014t0004
a0001c0001t0004
a0010c0014t0004
 20 HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
others(17): Show 
HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01928.hp2
HG01952.hp1
HG01975.hp1
HG01978.hp2
HG02145.hp1
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02602.hp1
HG03017.hp2
NA18939.hp2
NA18970.hp2
NA18989.hp2
NA18991.hp2
NA19070.hp2
NA19075.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*1657A>G
c.*1657A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1657 chr13 48709515
chr13:48709632
A
A
 C
C
 27 a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
a0001c0001t0004
others(24): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
a0001c0001t0004
a0001c0001t0005
a0001c0001t0006
a0001c0001t0008
a0001c0001t0009
a0001c0001t0010
a0001c0001t0011
a0001c0001t0012
a0001c0001t0015
a0001c0001t0020
a0001c0001t0023
a0001c0001t0025
a0001c0001t0026
a0001c0001t0027
a0001c0004t0005
a0002c0002t0005
a0002c0002t0013
a0002c0002t0016
a0003c0003t0007
a0004c0005t0007
a0005c0008t0007
a0009c0013t0003
a0010c0014t0004
a0011c0012t0010
a0012c0010t0022
 213 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00408.hp1
others(210): Show 
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c.*1774A>C
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chr13:48709659
A
A
 G
G
 5 a0001c0001t0004
a0001c0001t0006
a0001c0001t0008
others(2): Show 
a0001c0001t0004
a0001c0001t0006
a0001c0001t0008
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a0010c0014t0004
 46 HG00408.hp1
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others(43): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
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c.*1801A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1801 chr13 48709659
chr13:48709668
C
C
 A
A
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a0009c0013t0003
a0001c0001t0003
a0009c0013t0003
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HG00738.hp1
HG01074.hp2
others(37): Show 
HG00673.hp1
HG00738.hp1
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NA18988.hp2
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NA19070.hp1
NA20905.hp1
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c.*1810C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 1810 chr13 48709668
chr13:48709744
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others(40): Show 
AAGAGATTAAACCAAGATAGAGGAAAACACAGTAGCTGGGAAACAAGG
 A
A
 1 a0001c0001t0017
a0001c0001t0017
 1 NA19090.hp1
NA19090.hp1
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others(43): Show 
c.*1888_*1934delGAGATTAAACCAAGATAGAGGAAAACACAGTAGC
TGGGAAACAAGGA
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chr13:48709890
C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0010
a0011c0012t0010
a0001c0001t0010
a0011c0012t0010
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others(3): Show 
HG01069.hp2
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HG02486.hp2
HG02895.hp2
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NA21309.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2032C>T
c.*2032C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 2032 chr13 48709890
chr13:48709989
G
G
 A
A
 27 a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
a0001c0001t0004
others(24): Show 
a0001c0001t0002
a0001c0001t0003
a0001c0001t0004
a0001c0001t0005
a0001c0001t0006
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HG02572.hp2
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NA19063.hp2
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NA20300.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp1
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NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2131G>A
c.*2131G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 2131 chr13 48709989
chr13:48710473
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0015
a0001c0001t0015
 2 HG02056.hp2
NA18988.hp1
HG02056.hp2
NA18988.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2615A>G
c.*2615A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 2615 chr13 48710473
chr13:48710537
A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0019
a0001c0001t0019
 1 NA20752.hp2
NA20752.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2679A>C
c.*2679A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 2679 chr13 48710537
chr13:48710566
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0025
a0001c0001t0025
 1 HG02074.hp2
HG02074.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2708G>A
c.*2708G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 2708 chr13 48710566
chr13:48710659
T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0010
a0001c0001t0020
a0011c0012t0010
a0001c0001t0010
a0001c0001t0020
a0011c0012t0010
 7 HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG01081.hp1
others(4): Show 
HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG01081.hp1
HG02486.hp2
HG02895.hp2
HG02897.hp2
NA21309.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2801T>C
c.*2801T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 2801 chr13 48710659
chr13:48710742
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0018
a0001c0001t0018
 1 HG01361.hp2
HG01361.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*2884G>A
c.*2884G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 2884 chr13 48710742
chr13:48710958
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022
a0012c0010t0022
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3100G>A
c.*3100G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 3100 chr13 48710958
chr13:48711101
T
T
 A
A
 1 a0012c0010t0022
a0012c0010t0022
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3243T>A
c.*3243T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 3243 chr13 48711101
chr13:48711120
G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0026
a0001c0001t0026
 1 NA18955.hp1
NA18955.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3262G>C
c.*3262G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 3262 chr13 48711120
chr13:48711207
A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0027
a0001c0001t0027
 1 HG03669.hp1
HG03669.hp1
 3_prime_UTR_variant MODIFIER c.*3349A>C
c.*3349A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 5/5 3349 chr13 48711207

chr:pos ref alt #
# of ghapid:genebody level
 ghapids #
# of haplotypeids
 haplotypeids annotation impact hgvs_c hgvs_p genename geneid featuretype featureid genebody_biotype rank cdna
cdna pos length
 cds
cds pos length
 aa
aa pos length
 distance status chr pos
chr13:48654249
CTTTGTGT
others(15): Show 
CTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
 C
C
 1 a0001c0001t0021g0025
a0001c0001t0021g0025
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+234_-266+255d
others(24): Show 
c.-266+234_-266+255delTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654249
chr13:48654250
TTTGTGTG
others(4): Show 
TTTGTGTGTGTG
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0028
a0001c0001t0001g0028
 1 HG02615.hp1
HG02615.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+235_-266+245d
others(13): Show 
c.-266+235_-266+245delTGTGTGTGTGT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654250
chr13:48654250
TTTGTGTG
others(6): Show 
TTTGTGTGTGTGTG
 T
T
 2 a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0006g0027
 2 HG03927.hp1
NA18942.hp2
HG03927.hp1
NA18942.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+235_-266+247d
others(15): Show 
c.-266+235_-266+247delTGTGTGTGTGTGT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654250
chr13:48654251
T
T
 TTG
TTG
 15 a0001c0001t0001g0023
a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0001g0260
others(12): Show 
a0001c0001t0001g0023
a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0001g0260
a0001c0001t0001g0261
a0001c0001t0001g0262
a0001c0001t0001g0263
a0001c0001t0001g0264
a0001c0001t0001g0265
a0001c0001t0001g0266
a0001c0001t0001g0268
a0001c0001t0001g0269
a0001c0001t0001g0271
a0001c0001t0001g0272
a0001c0007t0001g0270
a0007c0006t0001g0267
 16 HG00438.hp1
HG01069.hp1
HG01993.hp1
others(13): Show 
HG00438.hp1
HG01069.hp1
HG01993.hp1
HG02015.hp1
HG03491.hp1
HG04204.hp2
HG04228.hp1
NA18940.hp1
NA18947.hp1
NA18947.hp2
NA18955.hp2
NA18982.hp1
NA18991.hp1
NA18992.hp2
NA19005.hp1
NA19006.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+287_-266+288d
others(4): Show 
c.-266+287_-266+288dupTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTG
TTG
 T
T
 19 a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0216
a0001c0001t0001g0218
others(16): Show 
a0001c0001t0001g0008
a0001c0001t0001g0216
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0001g0219
a0001c0001t0001g0220
a0001c0001t0001g0222
a0001c0001t0001g0223
a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0226
a0001c0001t0001g0228
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0001g0230
a0001c0001t0001g0231
a0001c0001t0002g0022
a0001c0001t0002g0227
a0001c0007t0001g0217
a0006c0009t0001g0221
a0007c0006t0001g0008
 21 HG00408.hp2
HG00738.hp2
HG01256.hp1
others(18): Show 
HG00408.hp2
HG00738.hp2
HG01256.hp1
HG01257.hp2
HG01261.hp2
HG01515.hp1
HG01517.hp1
HG01517.hp2
HG01943.hp2
HG02056.hp1
HG02698.hp2
HG02735.hp1
HG03704.hp1
HG06807.hp1
NA18961.hp1
NA18974.hp1
NA18979.hp1
NA18984.hp2
NA18987.hp2
NA18999.hp1
NA19004.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+287_-266+288d
others(4): Show 
c.-266+287_-266+288delTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTGTG
TTGTG
 T
T
 17 a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0198
a0001c0001t0001g0199
others(14): Show 
a0001c0001t0001g0007
a0001c0001t0001g0198
a0001c0001t0001g0199
a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0204
a0001c0001t0001g0205
a0001c0001t0001g0206
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0208
a0001c0001t0001g0209
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0006g0200
a0001c0001t0006g0211
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0014g0201
a0001c0001t0018g0202
 19 HG00735.hp1
HG01071.hp1
HG01099.hp2
others(16): Show 
HG00735.hp1
HG01071.hp1
HG01099.hp2
HG01361.hp2
HG01515.hp2
HG01928.hp1
HG01934.hp1
HG01934.hp2
HG01943.hp1
HG02055.hp2
HG02071.hp1
HG02293.hp2
HG02683.hp1
HG02735.hp2
NA18943.hp2
NA18953.hp1
NA19009.hp2
NA19058.hp2
NA20129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+285_-266+288d
others(6): Show 
c.-266+285_-266+288delTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTGTGTG
TTGTGTG
 T
T
 6 a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0188
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0191
a0001c0001t0019g0193
a0006c0009t0001g0192
a0008c0011t0001g0189
 6 HG01169.hp2
HG03490.hp2
HG03927.hp2
others(3): Show 
HG01169.hp2
HG03490.hp2
HG03927.hp2
HG04199.hp2
NA18944.hp2
NA20752.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+283_-266+288d
others(8): Show 
c.-266+283_-266+288delTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTGTGTGT
others(1): Show 
TTGTGTGTG
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0182
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0183
 5 HG00733.hp1
HG01192.hp1
NA18962.hp2
others(2): Show 
HG00733.hp1
HG01192.hp1
NA18962.hp2
NA19007.hp1
NA19012.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+281_-266+288d
others(10): Show 
c.-266+281_-266+288delTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTGTGTGT
others(3): Show 
TTGTGTGTGTG
 T
T
 12 a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0172
a0001c0001t0004g0006
others(9): Show 
a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0172
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0170
a0001c0001t0004g0173
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0175
a0001c0001t0004g0176
a0001c0001t0004g0177
a0001c0001t0006g0178
a0001c0001t0006g0179
 15 HG00741.hp2
HG01081.hp2
HG01928.hp2
others(12): Show 
HG00741.hp2
HG01081.hp2
HG01928.hp2
HG01952.hp1
HG01978.hp2
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02630.hp1
HG03017.hp2
HG03209.hp2
NA18939.hp2
NA18962.hp1
NA18991.hp2
NA19001.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+279_-266+288d
others(12): Show 
c.-266+279_-266+288delTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTGTGTGT
others(5): Show 
TTGTGTGTGTGTG
 T
T
 2 a0001c0001t0004g0159
a0001c0001t0004g0160
a0001c0001t0004g0159
a0001c0001t0004g0160
 2 NA18989.hp2
NA19075.hp1
NA18989.hp2
NA19075.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+277_-266+288d
others(14): Show 
c.-266+277_-266+288delTGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTGTGTGT
others(7): Show 
TTGTGTGTGTGTGTG
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0006g0112
a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0006g0112
 3 HG02145.hp2
HG02630.hp2
NA19240.hp2
HG02145.hp2
HG02630.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+275_-266+288d
others(16): Show 
c.-266+275_-266+288delTGTGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTGTGTGT
others(9): Show 
TTGTGTGTGTGTGTGTG
 T
T
 4 a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0004g0085
a0001c0001t0020g0086
others(1): Show 
a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0004g0085
a0001c0001t0020g0086
a0002c0002t0005g0087
 4 HG01074.hp1
HG01081.hp1
HG01884.hp2
others(1): Show 
HG01074.hp1
HG01081.hp1
HG01884.hp2
NA18959.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+273_-266+288d
others(18): Show 
c.-266+273_-266+288delTGTGTGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654251
TTGTGTGT
others(11): Show 
TTGTGTGTGTGTGTGTGTG
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0036
a0001c0001t0002g0036
 1 HG02738.hp1
HG02738.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+271_-266+288d
others(20): Show 
c.-266+271_-266+288delTGTGTGTGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654251
chr13:48654280
T
T
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+263T>A
c.-266+263T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654280
chr13:48654282
T
T
 A
A
 2 a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0026g0030
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0026g0030
 3 NA18952.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp1
NA18952.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+265T>A
c.-266+265T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654282
chr13:48654282
TGTGTGTG
others(17): Show 
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGA
 T
T
 1 a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0214
 1 HG02818.hp1
HG02818.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+286_-266+309d
others(26): Show 
c.-266+286_-266+309delGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654282
chr13:48654284
TGTGTGTG
others(15): Show 
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGA
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0026g0030
a0012c0010t0022g0029
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0026g0030
a0012c0010t0022g0029
 4 HG04228.hp2
NA18952.hp2
NA18955.hp1
others(1): Show 
HG04228.hp2
NA18952.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+288_-266+309d
others(24): Show 
c.-266+288_-266+309delGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654284
chr13:48654286
T
T
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0002g0031
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0032
a0001c0001t0011g0033
 5 HG02723.hp1
HG03017.hp1
HG03130.hp2
others(2): Show 
HG02723.hp1
HG03017.hp1
HG03130.hp2
HG03195.hp1
HG04199.hp1
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c.-266+269T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654286
chr13:48654286
TGTGTGTG
others(13): Show 
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGA
 T
T
 1 a0001c0001t0009g0257
a0001c0001t0009g0257
 1 HG03540.hp1
HG03540.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+308d
others(22): Show 
c.-266+289_-266+308delAGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654286
chr13:48654288
T
T
 A
A
 53 a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0075
others(50): Show 
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0011
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a0001c0001t0002g0061
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a0001c0001t0002g0073
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a0001c0001t0002g0076
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a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0071
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a0001c0001t0004g0065
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a0001c0001t0012g0081
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 59 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
others(56): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
HG00735.hp2
HG00741.hp1
HG01109.hp2
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HG04204.hp1
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18951.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18970.hp2
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18980.hp2
NA18985.hp1
NA18988.hp1
NA18989.hp1
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NA19010.hp1
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19065.hp1
NA19070.hp2
NA19075.hp2
NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA20905.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+271T>A
c.-266+271T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654288
chr13:48654288
TGTGTGTG
others(11): Show 
TGTGTGTGTGTGTGTGTGA
 T
T
 3 a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0032
a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0032
 4 HG03017.hp1
HG03225.hp1
HG04199.hp1
others(1): Show 
HG03017.hp1
HG03225.hp1
HG04199.hp1
HG06807.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+306d
others(20): Show 
c.-266+289_-266+306delAGTGTGTGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654288
chr13:48654290
T
T
 A
A
 23 a0001c0001t0002g0107
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0015
others(20): Show 
a0001c0001t0002g0107
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0015
a0001c0001t0003g0093
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0101
a0001c0001t0003g0102
a0001c0001t0003g0103
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a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
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a0002c0002t0013g0090
a0002c0002t0013g0091
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 25 HG02257.hp1
HG02451.hp1
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others(22): Show 
HG02257.hp1
HG02451.hp1
HG02572.hp2
HG02615.hp2
HG02622.hp2
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NA18948.hp1
NA18953.hp2
NA19043.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+273T>A
c.-266+273T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654290
chr13:48654290
TGTGTGTG
others(9): Show 
TGTGTGTGTGTGTGTGA
 T
T
 50 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0066
others(47): Show 
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0011
a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0013
a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0002g0039
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a0001c0001t0002g0054
a0001c0001t0002g0055
a0001c0001t0002g0056
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a0001c0001t0002g0060
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a0001c0001t0002g0062
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a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0073
a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0003g0037
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0004g0057
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a0001c0001t0011g0033
a0001c0001t0015g0011
a0001c0001t0015g0077
a0001c0001t0023g0052
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 56 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
others(53): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
HG00735.hp2
HG00741.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG01243.hp2
HG01256.hp2
HG01257.hp1
HG01261.hp1
HG01952.hp2
HG01975.hp1
HG01993.hp2
HG02056.hp2
HG02074.hp2
HG02080.hp2
HG02300.hp2
HG02572.hp1
HG02602.hp2
HG02683.hp2
HG02723.hp1
HG02976.hp2
HG03130.hp2
HG03195.hp1
HG03209.hp1
HG03669.hp1
HG04115.hp2
HG04184.hp2
HG04204.hp1
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18951.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18970.hp2
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18980.hp2
NA18985.hp1
NA18988.hp1
NA18989.hp1
NA19001.hp2
NA19004.hp2
NA19005.hp2
NA19006.hp2
NA19010.hp1
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19065.hp1
NA19070.hp2
NA19075.hp2
NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA20905.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+304d
others(18): Show 
c.-266+289_-266+304delAGTGTGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654290
chr13:48654292
T
T
 A
A
 52 a0001c0001t0001g0122
a0001c0001t0001g0155
a0001c0001t0002g0005
others(49): Show 
a0001c0001t0001g0122
a0001c0001t0001g0155
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0128
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a0001c0001t0003g0131
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a0001c0001t0003g0133
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a0001c0001t0003g0135
a0001c0001t0003g0137
a0001c0001t0003g0138
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a0001c0001t0003g0143
a0001c0001t0003g0144
a0001c0001t0003g0145
a0001c0001t0003g0152
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a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0011g0156
a0001c0001t0011g0157
a0001c0001t0012g0136
a0001c0004t0005g0129
a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
a0003c0003t0007g0117
a0003c0003t0007g0118
a0003c0003t0007g0125
a0004c0005t0007g0121
a0010c0014t0004g0123
a0011c0012t0010g0119
 65 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
others(62): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00642.hp1
HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
HG01109.hp1
HG01168.hp2
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HG02896.hp1
HG02896.hp2
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HG02970.hp1
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NA18951.hp2
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NA18967.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp2
NA18975.hp2
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NA18987.hp1
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NA18995.hp1
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NA20905.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+275T>A
c.-266+275T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654292
chr13:48654292
TGTGTGTG
others(7): Show 
TGTGTGTGTGTGTGA
 T
T
 24 a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0273
a0001c0001t0001g0274
others(21): Show 
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0273
a0001c0001t0001g0274
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a0002c0002t0013g0091
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a0004c0005t0007g0099
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a0005c0008t0007g0100
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HG01361.hp1
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others(22): Show 
HG01109.hp2
HG01361.hp1
HG02015.hp2
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HG02257.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+302d
others(16): Show 
c.-266+289_-266+302delAGTGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654292
chr13:48654294
T
T
 A
A
 13 a0001c0001t0002g0168
a0001c0001t0002g0169
a0001c0001t0003g0164
others(10): Show 
a0001c0001t0002g0168
a0001c0001t0002g0169
a0001c0001t0003g0164
a0001c0001t0008g0166
a0001c0001t0008g0167
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 14 HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG02451.hp2
others(11): Show 
HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG02451.hp2
HG02486.hp2
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HG02897.hp2
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NA19030.hp1
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NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+277T>A
c.-266+277T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654294
chr13:48654294
TGTGTGTG
others(5): Show 
TGTGTGTGTGTGA
 T
T
 25 a0001c0001t0001g0122
a0001c0001t0002g0107
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others(22): Show 
a0001c0001t0001g0122
a0001c0001t0002g0107
a0001c0001t0002g0128
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a0001c0001t0003g0108
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a0001c0001t0006g0126
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a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
a0003c0003t0007g0117
a0003c0003t0007g0118
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 27 HG00558.hp1
HG00642.hp1
HG02145.hp1
others(24): Show 
HG00558.hp1
HG00642.hp1
HG02145.hp1
HG02622.hp2
HG02647.hp2
HG02698.hp1
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HG02897.hp1
HG02970.hp1
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HG03225.hp2
HG03453.hp2
HG03471.hp1
HG03471.hp2
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HG04115.hp1
NA18942.hp1
NA18948.hp1
NA18953.hp2
NA18995.hp1
NA19240.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+300d
others(14): Show 
c.-266+289_-266+300delAGTGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654294
chr13:48654296
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0180
a0001c0001t0003g0180
 1 HG02818.hp2
HG02818.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+279T>A
c.-266+279T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654296
chr13:48654296
TGTGTGTG
others(3): Show 
TGTGTGTGTGA
 T
T
 37 a0001c0001t0001g0155
a0001c0001t0001g0276
a0001c0001t0002g0005
others(34): Show 
a0001c0001t0001g0155
a0001c0001t0001g0276
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0141
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a0001c0001t0002g0148
a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0002g0151
a0001c0001t0002g0153
a0001c0001t0002g0154
a0001c0001t0003g0003
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a0001c0001t0003g0132
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a0001c0001t0003g0134
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a0001c0001t0010g0018
a0001c0001t0010g0161
a0001c0001t0010g0162
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a0001c0001t0012g0136
 50 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp2
others(47): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp2
HG00609.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00673.hp1
HG00738.hp1
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HG01074.hp2
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HG02080.hp1
HG02129.hp1
HG02165.hp1
HG02486.hp2
HG02559.hp2
HG02886.hp2
HG02895.hp2
HG02896.hp2
HG02897.hp2
HG03041.hp2
HG03490.hp1
HG03492.hp2
HG03540.hp2
NA18940.hp2
NA18944.hp1
NA18950.hp2
NA18951.hp2
NA18960.hp1
NA18964.hp1
NA18967.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp2
NA18975.hp2
NA18979.hp2
NA18982.hp2
NA18987.hp1
NA18988.hp2
NA18992.hp1
NA18993.hp2
NA18995.hp2
NA18999.hp2
NA19007.hp2
NA19010.hp2
NA19070.hp1
NA19082.hp2
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+298d
others(12): Show 
c.-266+289_-266+298delAGTGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654296
chr13:48654298
T
T
 A
A
 3 a0001c0004t0005g0184
a0001c0004t0005g0185
a0001c0004t0005g0186
a0001c0004t0005g0184
a0001c0004t0005g0185
a0001c0004t0005g0186
 3 HG01496.hp1
HG01975.hp2
HG03139.hp2
HG01496.hp1
HG01975.hp2
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+281T>A
c.-266+281T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654298
chr13:48654298
TGTGTGTG
others(1): Show 
TGTGTGTGA
 T
T
 10 a0001c0001t0002g0168
a0001c0001t0002g0169
a0001c0001t0008g0166
others(7): Show 
a0001c0001t0002g0168
a0001c0001t0002g0169
a0001c0001t0008g0166
a0001c0001t0008g0167
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0011g0156
a0001c0001t0011g0157
a0001c0001t0011g0165
 10 HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG03516.hp2
others(7): Show 
HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG03516.hp2
NA18939.hp1
NA19009.hp1
NA19012.hp2
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA19082.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+296d
others(10): Show 
c.-266+289_-266+296delAGTGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654298
chr13:48654300
T
T
 A
A
 6 a0001c0001t0009g0187
a0001c0004t0005g0197
a0002c0002t0005g0021
others(3): Show 
a0001c0001t0009g0187
a0001c0004t0005g0197
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
a0002c0002t0005g0196
 7 HG00733.hp2
HG01192.hp2
HG02055.hp1
others(4): Show 
HG00733.hp2
HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG03098.hp1
HG03453.hp1
HG03579.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+283T>A
c.-266+283T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654300
chr13:48654300
TGTGTGA
TGTGTGA
 T
T
 6 a0001c0001t0001g0277
a0001c0001t0003g0180
a0001c0001t0008g0278
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0277
a0001c0001t0003g0180
a0001c0001t0008g0278
a0001c0004t0005g0184
a0001c0004t0005g0185
a0001c0004t0005g0186
 6 HG01496.hp1
HG01975.hp2
HG02818.hp2
others(3): Show 
HG01496.hp1
HG01975.hp2
HG02818.hp2
HG03139.hp2
NA18968.hp1
NA19058.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+294d
others(8): Show 
c.-266+289_-266+294delAGTGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654300
chr13:48654302
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0187
 1 HG03453.hp1
HG03453.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+285T>A
c.-266+285T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654302
chr13:48654302
TGTGA
TGTGA
 T
T
 6 a0001c0001t0001g0215
a0001c0004t0005g0197
a0002c0002t0005g0021
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0215
a0001c0004t0005g0197
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
a0002c0002t0005g0196
 7 HG00733.hp2
HG01192.hp2
HG02055.hp1
others(4): Show 
HG00733.hp2
HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG03098.hp1
HG03579.hp2
NA18985.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+289_-266+292d
others(6): Show 
c.-266+289_-266+292delAGTG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48654302
chr13:48654304
T
T
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0006g0027
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0232
a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0021g0025
a0001c0004t0005g0233
 5 HG01243.hp1
HG02486.hp1
HG02809.hp1
others(2): Show 
HG01243.hp1
HG02486.hp1
HG02809.hp1
HG03927.hp1
NA18942.hp2
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c.-266+287T>A
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A
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T
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T
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A
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C
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T
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c.-266+520C>T
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A
 G
G
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c.-266+592A>G
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T
T
 C
C
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CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654621
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A
A
 G
G
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a0001c0001t0001g0272
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NA18955.hp2
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c.-266+754A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48654771
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A
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G
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C
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G
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T
T
 G
G
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a0001c0001t0011g0088
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HG02886.hp1
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c.-266+1015T>G
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A
 G
G
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-266+1078A>G
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C
C
 G
G
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G
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A
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C
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T
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T
T
 TA
TA
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NA18988.hp2
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NA19082.hp2
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+2066dupA
c.-266+2066dupA
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48656076
chr13:48656076
T
T
 TAA
TAA
 22 a0001c0001t0003g0015
a0001c0001t0003g0017
a0001c0001t0003g0101
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a0001c0001t0003g0017
a0001c0001t0003g0101
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a0001c0001t0003g0131
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 24 HG00738.hp1
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others(21): Show 
HG00738.hp1
HG01074.hp2
HG01168.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-266+2065_-266+206
others(6): Show 
c.-266+2065_-266+2066dupAA
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48656076
chr13:48656119
G
G
 A
A
 19 a0001c0001t0002g0084
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a0001c0001t0002g0171
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others(19): Show 
HG00741.hp2
HG01074.hp1
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NA19075.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.-266+2102G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48656119
chr13:48656147
A
A
 G
G
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a0001c0004t0005g0129
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NA19240.hp1
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c.-266+2130A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48656147
chr13:48656336
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0005g0096
a0001c0001t0005g0096
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HG02970.hp2
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c.-266+2319A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48656336
chr13:48656503
T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0012g0081
a0001c0001t0012g0081
 1 HG02257.hp2
HG02257.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+2486T>G
c.-266+2486T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48656503
chr13:48656763
A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0002g0074
 2 HG02080.hp2
NA19001.hp2
HG02080.hp2
NA19001.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+2746A>G
c.-266+2746A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48656763
chr13:48656785
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0021g0025
a0001c0001t0021g0025
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
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c.-266+2768C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48656785
chr13:48657061
A
A
 C
C
 60 a0001c0001t0001g0155
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others(57): Show 
a0001c0001t0001g0155
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0107
a0001c0001t0002g0141
a0001c0001t0002g0146
a0001c0001t0002g0147
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a0001c0001t0002g0150
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others(70): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp1
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HG00673.hp1
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NA18964.hp1
NA18967.hp1
NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18968.hp2
NA18975.hp2
NA18979.hp2
NA18982.hp2
NA18987.hp1
NA18988.hp2
NA18992.hp1
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NA18995.hp2
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NA19007.hp2
NA19009.hp1
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NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+3044A>C
c.-266+3044A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48657061
chr13:48657158
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0141
a0001c0001t0002g0141
 1 NA19082.hp2
NA19082.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+3141T>C
c.-266+3141T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48657158
chr13:48657301
C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0010g0018
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others(1): Show 
a0001c0001t0010g0018
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others(2): Show 
HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG02486.hp2
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HG02897.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+3284C>T
c.-266+3284C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48657301
chr13:48657320
G
G
 C
C
 27 a0001c0001t0003g0015
a0001c0001t0003g0017
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others(24): Show 
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a0001c0001t0003g0017
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 29 HG00738.hp1
HG01074.hp2
HG01109.hp1
others(26): Show 
HG00738.hp1
HG01074.hp2
HG01109.hp1
HG01168.hp2
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HG02559.hp2
HG02622.hp1
HG02622.hp2
HG02698.hp1
HG02818.hp2
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HG03453.hp1
HG03453.hp2
HG03471.hp2
HG03486.hp2
HG03516.hp2
HG03540.hp2
HG03669.hp2
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20300.hp2
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+3303G>C
c.-266+3303G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48657320
chr13:48657381
G
G
 C
C
 3 a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0114
a0001c0001t0005g0158
 3 HG02630.hp2
NA19030.hp2
NA19240.hp2
HG02630.hp2
NA19030.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+3364G>C
c.-266+3364G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48657381
chr13:48657389
G
G
 A
A
 3 a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0006g0200
a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0006g0200
a0001c0001t0006g0236
 3 HG00738.hp2
HG01515.hp2
NA20752.hp1
HG00738.hp2
HG01515.hp2
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+3372G>A
c.-266+3372G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48657389
chr13:48657625
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0256
a0001c0001t0001g0256
 1 HG02129.hp2
HG02129.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+3608A>G
c.-266+3608A>G
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T
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C
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A
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G
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c.-266+4238A>G
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C
C
 G
G
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-266+4262C>G
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T
T
 G
G
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c.-266+4445T>G
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G
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A
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c.-266+4474G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48658491
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C
C
 A
A
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HG02451.hp2
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c.-266+4510C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48658527
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0181
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HG00733.hp1
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c.-266+4678G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48658695
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A
A
 C
C
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a0001c0001t0003g0140
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NA18987.hp1
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CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48659004
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C
 T
T
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G
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A
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c.-266+5114G>A
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C
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T
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c.-266+5226C>T
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C
 T
T
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c.-266+5407C>T
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0004g0170
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HG02300.hp1
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c.-266+5604G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48659621
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T
T
 C
C
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a0003c0003t0007g0115
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HG03471.hp1
HG03130.hp1
HG03471.hp1
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c.-266+5617T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48659634
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C
C
 T
T
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a0001c0001t0027g0072
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HG03669.hp1
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c.-266+6012C>T
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C
C
 T
T
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a0001c0001t0004g0235
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HG01099.hp1
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c.-266+6191C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660208
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0237
a0001c0001t0001g0219
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c.-266+6204G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660221
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A
A
 G
G
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c.-266+6292A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660309
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A
A
 C
C
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c.-266+6313A>C
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G
G
 A
A
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-266+6445G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660462
chr13:48660502
G
G
 A
A
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c.-266+6485G>A
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T
 C
C
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a0001c0001t0001g0238
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HG01978.hp1
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c.-266+6668T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660685
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C
C
 A
A
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HG00673.hp2
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NA19090.hp2
NA20905.hp2
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c.-266+6710C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660727
chr13:48660769
G
G
 A
A
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a0003c0003t0007g0115
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HG03471.hp1
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c.-266+6752G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660769
chr13:48660853
G
G
 A
A
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a0003c0003t0007g0016
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HG02897.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
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c.-266+6836G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660853
chr13:48660947
C
C
 G
G
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a0001c0001t0019g0193
a0001c0001t0001g0218
a0001c0001t0019g0193
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HG00738.hp2
NA20752.hp2
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c.-266+6930C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48660947
chr13:48661141
A
A
 G
G
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others(51): Show 
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 61 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
others(58): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
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HG01993.hp2
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HG03017.hp1
HG03209.hp1
HG03669.hp1
HG03704.hp1
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T
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NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+7241C>T
c.-266+7241C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661258
chr13:48661297
A
A
 T
T
 1 a0009c0013t0003g0080
a0009c0013t0003g0080
 1 HG01361.hp1
HG01361.hp1
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c.-266+7280A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661297
chr13:48661492
A
A
 G
G
 9 a0001c0001t0002g0128
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0120
others(6): Show 
a0001c0001t0002g0128
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0120
a0001c0001t0006g0124
a0001c0001t0006g0126
a0001c0001t0006g0127
a0001c0001t0021g0025
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a0010c0014t0004g0123
 9 HG00558.hp1
HG00642.hp1
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others(6): Show 
HG00558.hp1
HG00642.hp1
HG02145.hp1
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NA18995.hp1
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c.-266+7475A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661492
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T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0122
a0001c0001t0001g0122
 1 NA18942.hp1
NA18942.hp1
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c.-266+7542T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661559
chr13:48661582
T
T
 C
C
 17 a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
others(14): Show 
a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0085
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others(17): Show 
HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
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NA18991.hp2
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+7565T>C
c.-266+7565T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661582
chr13:48661648
A
A
 G
G
 54 a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
others(51): Show 
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a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
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 61 HG00140.hp1
HG00140.hp2
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others(58): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
HG00735.hp2
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HG04199.hp1
HG04204.hp1
NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18951.hp1
NA18952.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18970.hp2
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18980.hp2
NA18985.hp1
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NA18989.hp1
NA19001.hp1
NA19001.hp2
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NA19063.hp2
NA19065.hp1
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NA19075.hp2
NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA20905.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+7631A>G
c.-266+7631A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661648
chr13:48661675
T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0172
a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0172
 2 NA18962.hp1
NA19001.hp1
NA18962.hp1
NA19001.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+7658T>C
c.-266+7658T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661675
chr13:48661818
T
T
 C
C
 2 a0001c0004t0005g0129
a0011c0012t0010g0119
a0001c0004t0005g0129
a0011c0012t0010g0119
 2 NA19240.hp1
NA21309.hp1
NA19240.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+7801T>C
c.-266+7801T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661818
chr13:48661837
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0215
a0001c0001t0001g0215
 1 NA18985.hp2
NA18985.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+7820A>G
c.-266+7820A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48661837
chr13:48662069
T
T
 C
C
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+8052T>C
c.-266+8052T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48662069
chr13:48662145
A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0009g0257
a0001c0001t0009g0257
 1 HG03540.hp1
HG03540.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+8128A>C
c.-266+8128A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48662145
chr13:48662289
G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0069
 1 NA19063.hp1
NA19063.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+8272G>T
c.-266+8272G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48662289
chr13:48662323
T
T
 A
A
 6 a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
others(3): Show 
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
 6 HG02818.hp1
HG03453.hp1
HG03540.hp1
others(3): Show 
HG02818.hp1
HG03453.hp1
HG03540.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+8306T>A
c.-266+8306T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48662323
chr13:48662461
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0182
 1 HG01192.hp1
HG01192.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+8444T>C
c.-266+8444T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48662461
chr13:48662684
A
A
 G
G
 194 a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
others(191): Show 
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0034
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T
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C
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G
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A
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G
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c.-266+9604T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663621
chr13:48663651
T
T
 G
G
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+9634T>G
c.-266+9634T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663651
chr13:48663697
G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0071
 1 HG02572.hp1
HG02572.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+9680G>T
c.-266+9680G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663697
chr13:48663758
G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+9741G>T
c.-266+9741G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663758
chr13:48663790
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0234
a0001c0001t0004g0234
 1 HG02602.hp1
HG02602.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+9773T>C
c.-266+9773T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663790
chr13:48663806
G
G
 T
T
 1 a0003c0003t0007g0125
a0003c0003t0007g0125
 1 HG02970.hp1
HG02970.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+9789G>T
c.-266+9789G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663806
chr13:48663864
A
A
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0078
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0114
 5 HG02630.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
others(2): Show 
HG02630.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG03130.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+9847A>G
c.-266+9847A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663864
chr13:48663908
T
T
 C
C
 8 a0001c0001t0002g0128
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0120
others(5): Show 
a0001c0001t0002g0128
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0120
a0001c0001t0006g0124
a0001c0001t0006g0126
a0001c0001t0006g0127
a0003c0003t0007g0125
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 8 HG00558.hp1
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others(5): Show 
HG00558.hp1
HG00642.hp1
HG02145.hp1
HG02647.hp2
HG02970.hp1
HG03927.hp1
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NA18995.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+9891T>C
c.-266+9891T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663908
chr13:48663954
G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0001g0259
 1 HG03491.hp1
HG03491.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+9937G>T
c.-266+9937G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48663954
chr13:48664288
G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0230
a0001c0001t0001g0230
 1 HG01943.hp2
HG01943.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+10271G>T
c.-266+10271G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48664288
chr13:48664616
G
G
 A
A
 5 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0078
others(2): Show 
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0114
 5 HG02630.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
others(2): Show 
HG02630.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG03130.hp2
NA19240.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+10599G>A
c.-266+10599G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48664616
chr13:48664760
A
A
 G
G
 6 a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0075
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0002g0074
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 6 HG02080.hp2
HG04184.hp2
NA18951.hp1
others(3): Show 
HG02080.hp2
HG04184.hp2
NA18951.hp1
NA18970.hp2
NA19001.hp2
NA19070.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+10743A>G
c.-266+10743A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48664760
chr13:48664776
A
A
 G
G
 55 a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
others(52): Show 
a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0066
a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0075
a0001c0001t0001g0122
a0001c0001t0001g0231
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a0001c0001t0002g0013
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a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0032
a0001c0001t0002g0036
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a0001c0001t0002g0041
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a0001c0001t0002g0044
a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0047
a0001c0001t0002g0048
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a0001c0001t0002g0050
a0001c0001t0002g0051
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a0001c0001t0002g0055
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a0001c0001t0002g0059
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a0001c0001t0002g0073
a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0076
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a0001c0001t0004g0057
a0001c0001t0004g0065
a0001c0001t0004g0068
a0001c0001t0015g0011
a0001c0001t0015g0077
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a0001c0001t0023g0052
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 62 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
others(59): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
HG00735.hp2
HG00741.hp1
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HG02080.hp2
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HG02602.hp2
HG02683.hp2
HG02738.hp1
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HG04184.hp2
HG04199.hp1
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NA18942.hp1
NA18942.hp2
NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18951.hp1
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NA18955.hp1
NA18959.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18970.hp2
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18980.hp2
NA18985.hp1
NA18988.hp1
NA18989.hp1
NA19001.hp1
NA19001.hp2
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NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19065.hp1
NA19070.hp2
NA19075.hp2
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NA20905.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+10759A>G
c.-266+10759A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48664776
chr13:48665003
T
T
 C
C
 8 a0001c0001t0002g0128
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0120
others(5): Show 
a0001c0001t0002g0128
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0120
a0001c0001t0006g0124
a0001c0001t0006g0126
a0001c0001t0006g0127
a0003c0003t0007g0125
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 8 HG00558.hp1
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HG02145.hp1
others(5): Show 
HG00558.hp1
HG00642.hp1
HG02145.hp1
HG02647.hp2
HG02970.hp1
HG03927.hp1
HG04115.hp1
NA18995.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+10986T>C
c.-266+10986T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48665003
chr13:48665119
T
T
 C
C
 70 a0001c0001t0001g0210
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others(67): Show 
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0002g0005
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a0001c0001t0003g0071
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a0001c0001t0003g0108
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a0001c0001t0009g0110
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a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
a0001c0001t0011g0033
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a0001c0001t0012g0136
a0009c0013t0003g0080
 83 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp1
others(80): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00673.hp1
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HG01074.hp2
HG01099.hp2
HG01109.hp1
HG01168.hp2
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HG01361.hp1
HG01515.hp2
HG01884.hp1
HG01943.hp1
HG02015.hp2
HG02055.hp2
HG02071.hp2
HG02080.hp1
HG02129.hp1
HG02257.hp2
HG02451.hp2
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02622.hp1
HG02622.hp2
HG02698.hp1
HG02818.hp1
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HG03195.hp2
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HG03540.hp2
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NA18939.hp1
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NA18950.hp2
NA18951.hp2
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NA18960.hp1
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NA18967.hp2
NA18968.hp1
NA18968.hp2
NA18975.hp2
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NA18982.hp2
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NA19082.hp2
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c.-266+11102T>C
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C
C
 T
T
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HG01074.hp1
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c.-266+11110C>T
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A
A
 G
G
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HG01071.hp2
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c.-266+11151A>G
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A
A
 T
T
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a0012c0010t0022g0029
a0001c0001t0002g0154
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HG00621.hp1
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c.-266+11186A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48665203
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G
G
 C
C
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-266+11233G>C
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C
C
 T
T
 54 a0001c0001t0001g0010
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c.-266+11245C>T
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A
A
 G
G
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others(2): Show 
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others(2): Show 
HG00621.hp2
HG02015.hp1
HG02129.hp2
HG02165.hp2
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c.-266+11369A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48665386
chr13:48665497
G
G
 T
T
 52 a0001c0001t0001g0034
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others(55): Show 
HG00733.hp2
HG00741.hp2
HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
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HG02723.hp2
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NA18991.hp2
NA19043.hp2
NA19075.hp1
NA19240.hp1
NA19240.hp2
NA20129.hp1
NA20300.hp1
NA21309.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+11480G>T
c.-266+11480G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48665497
chr13:48665590
C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0155
a0001c0001t0001g0272
a0001c0001t0001g0155
a0001c0001t0001g0272
 2 HG02165.hp1
NA18955.hp2
HG02165.hp1
NA18955.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+11573C>T
c.-266+11573C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48665590
chr13:48665670
G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0003g0071
 2 HG02572.hp1
HG04204.hp1
HG02572.hp1
HG04204.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+11653G>A
c.-266+11653G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48665670
chr13:48665722
T
T
 G
G
 1 a0006c0009t0001g0221
a0006c0009t0001g0221
 1 HG01517.hp2
HG01517.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+11705T>G
c.-266+11705T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48665722
chr13:48665890
T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0242
 1 HG03704.hp2
HG03704.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+11873T>C
c.-266+11873T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48665890
chr13:48666149
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0230
a0001c0001t0001g0230
 1 HG01943.hp2
HG01943.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+12132C>T
c.-266+12132C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48666149
chr13:48666150
G
G
 A
A
 13 a0001c0001t0001g0210
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others(10): Show 
a0001c0001t0001g0210
a0001c0001t0006g0200
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c.-266+12133G>A
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T
T
 G
G
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A
A
 G
G
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HG04204.hp2
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c.-266+12262A>G
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T
T
 A
A
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HG04228.hp2
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c.-266+12267T>A
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T
T
 C
C
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G
 C
C
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C
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A
 G
G
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a0001c0001t0005g0096
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C
C
 T
T
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a0001c0001t0012g0083
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C
C
 A
A
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C
C
 T
T
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c.-266+13501C>T
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T
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C
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HG02809.hp1
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c.-266+13518T>C
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G
 C
C
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HG01515.hp2
HG01943.hp1
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c.-266+13536G>C
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chr13:48667646
A
A
 T
T
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HG00733.hp2
HG00741.hp2
HG01074.hp1
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c.-266+13629A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48667646
chr13:48667808
A
A
 G
G
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a0001c0004t0005g0184
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HG01975.hp2
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c.-266+13791A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48667808
chr13:48667816
A
A
 G
G
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others(6): Show 
HG00558.hp1
HG00642.hp1
HG02145.hp1
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NA18995.hp1
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c.-266+13799A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48667816
chr13:48667891
A
A
 G
G
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a0002c0002t0005g0196
 1 HG03579.hp2
HG03579.hp2
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c.-266+13874A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48667891
chr13:48667897
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+13880G>A
c.-266+13880G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48667897
chr13:48668113
C
C
 T
T
 70 a0001c0001t0001g0210
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 83 HG00408.hp1
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others(80): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
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c.-266+14096C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668113
chr13:48668145
A
A
 T
T
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a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+14128A>T
c.-266+14128A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668145
chr13:48668418
A
A
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0181
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0181
a0001c0001t0001g0182
a0001c0001t0001g0188
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others(1): Show 
HG00733.hp1
HG01192.hp1
HG02293.hp2
HG03490.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+14401A>T
c.-266+14401A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668418
chr13:48668470
C
C
 G
G
 17 a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0004g0006
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others(14): Show 
a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0004g0006
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 20 HG00741.hp2
HG01074.hp1
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others(17): Show 
HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01928.hp2
HG01952.hp1
HG01978.hp2
HG02145.hp2
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02602.hp1
HG02630.hp1
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NA18939.hp2
NA18959.hp2
NA18989.hp2
NA18991.hp2
NA19075.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+14453C>G
c.-266+14453C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668470
chr13:48668486
A
A
 G
G
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+14469A>G
c.-266+14469A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668486
chr13:48668575
G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0014g0201
a0001c0001t0014g0239
a0001c0001t0014g0201
a0001c0001t0014g0239
 2 HG02735.hp2
HG03831.hp2
HG02735.hp2
HG03831.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+14558G>A
c.-266+14558G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668575
chr13:48668679
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0027
 1 HG03927.hp1
HG03927.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+14662A>G
c.-266+14662A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668679
chr13:48668694
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+14677G>A
c.-266+14677G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668694
chr13:48668958
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0015g0077
a0001c0001t0015g0077
 1 NA18988.hp1
NA18988.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+14941C>T
c.-266+14941C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48668958
chr13:48669187
T
T
 C
C
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c.-266+15170T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669187
chr13:48669214
T
T
 A
A
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-266+15197T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669214
chr13:48669238
C
C
 A
A
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HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG03195.hp1
HG03516.hp2
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c.-266+15221C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669238
chr13:48669295
T
T
 A
A
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HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.-266+15278T>A
c.-266+15278T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669295
chr13:48669533
A
A
 G
G
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
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c.-266+15516A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669533
chr13:48669544
C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0209
a0001c0001t0001g0269
a0001c0001t0001g0209
a0001c0001t0001g0269
 2 NA18991.hp1
NA19058.hp2
NA18991.hp1
NA19058.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-266+15527C>T
c.-266+15527C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669544
chr13:48669687
T
T
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
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c.-266+15670T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669687
chr13:48669765
T
T
 A
A
 1 a0004c0005t0007g0121
a0004c0005t0007g0121
 1 HG03516.hp1
HG03516.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+15748T>A
c.-266+15748T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669765
chr13:48669881
T
T
 A
A
 7 a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0093
a0001c0001t0003g0094
others(4): Show 
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0093
a0001c0001t0003g0094
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 8 HG02257.hp1
HG02451.hp1
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others(5): Show 
HG02257.hp1
HG02451.hp1
HG02615.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-266+15864T>A
c.-266+15864T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48669881
chr13:48670052
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0034
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HG02723.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-266+16035G>A
c.-266+16035G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48670052
chr13:48670062
C
C
 T
T
 193 a0001c0001t0001g0010
a0001c0001t0001g0034
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others(190): Show 
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a0001c0001t0001g0034
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a0001c0001t0002g0146
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a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0002g0151
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a0001c0001t0002g0275
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A
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HG02809.hp1
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T
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C
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C
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G
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A
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A
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G
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T
 C
C
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C
C
 A
A
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HG01993.hp2
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c.-266+17609C>A
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G
G
 A
A
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G
G
 T
T
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c.-266+17831T>A
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C
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T
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-266+17910C>T
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C
C
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G
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a0001c0001t0001g0229
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c.-266+18010C>G
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G
G
 A
A
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T
T
 G
G
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NA19240.hp1
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c.-266+18233T>G
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G
G
 T
T
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HG03540.hp2
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c.-266+18240G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48672257
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C
C
 A
A
 1 a0003c0003t0007g0125
a0003c0003t0007g0125
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HG02970.hp1
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C
C
 T
T
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G
 GT
GT
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CTT
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CTTT
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C
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c.-265-18579_-265-18577delTTT
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T
 C
C
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c.-265-18589T>C
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A
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T
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HG01192.hp2
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c.-265-18495A>T
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C
C
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T
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c.-265-18434C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48672778
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G
G
 A
A
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T
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A
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A
 G
G
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G
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A
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T
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A
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C
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CT
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homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.-265-17754delT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48673433
chr13:48673458
T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0003g0137
a0001c0001t0003g0137
 1 NA19070.hp1
NA19070.hp1
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c.-265-17754T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48673458
chr13:48673532
G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0024g0251
a0001c0001t0024g0251
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HG03831.hp1
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c.-265-17680G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48673532
chr13:48673611
A
A
 G
G
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a0002c0002t0005g0087
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others(5): Show 
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a0002c0002t0005g0087
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 9 HG01192.hp2
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others(6): Show 
HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
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c.-265-17601A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48673611
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C
C
 T
T
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-265-17491C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48673721
chr13:48673722
G
G
 A
A
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a0001c0001t0003g0093
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others(4): Show 
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a0001c0001t0003g0093
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HG02257.hp1
HG02451.hp1
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c.-265-17490G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48673722
chr13:48673898
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0001g0250
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NA18984.hp1
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c.-265-17314C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48673898
chr13:48673899
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-265-17313G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48673899
chr13:48673909
G
G
 A
A
 6 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0078
others(3): Show 
a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
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a0001c0001t0001g0113
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HG01884.hp2
HG02630.hp2
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NA19240.hp2
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c.-265-17303G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48673909
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G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0214
 1 HG02818.hp1
HG02818.hp1
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c.-265-16970G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48674242
chr13:48674267
T
T
 G
G
 5 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0078
others(2): Show 
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a0001c0001t0001g0035
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a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0114
 5 HG02630.hp2
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others(2): Show 
HG02630.hp2
HG02723.hp1
HG02809.hp2
HG03130.hp2
NA19240.hp2
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c.-265-16945T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48674267
chr13:48674423
C
C
 G
G
 4 a0001c0001t0003g0015
a0001c0001t0003g0103
a0001c0001t0003g0105
others(1): Show 
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a0001c0001t0003g0103
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a0001c0001t0003g0106
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others(2): Show 
HG02622.hp2
HG02895.hp1
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c.-265-16789C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48674423
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0006g0027
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HG03927.hp1
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c.-265-16764G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48674448
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T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.-265-16645T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48674567
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C
C
 A
A
 67 a0001c0001t0001g0010
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others(64): Show 
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a0001c0001t0001g0067
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 75 HG00140.hp1
HG00140.hp2
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others(72): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00673.hp2
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NA18942.hp1
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NA19240.hp1
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NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-16338C>A
c.-265-16338C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48674874
chr13:48674960
G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.-265-16252G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48674960
chr13:48675108
C
C
 T
T
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a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-16104C>T
c.-265-16104C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48675108
chr13:48675226
T
T
 C
C
 1 a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0016
 2 HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-15986T>C
c.-265-15986T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48675226
chr13:48675305
A
A
 T
T
 191 a0001c0001t0001g0010
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others(188): Show 
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a0001c0001t0001g0034
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c.-265-15907A>T
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C
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C
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T
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TG
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c.-265-15624delG
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chr13:48675632
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0214
 1 HG02818.hp1
HG02818.hp1
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c.-265-15580C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48675632
chr13:48675668
G
G
 A
A
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a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
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c.-265-15544G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48675668
chr13:48675726
C
C
 A
A
 1 a0002c0002t0013g0089
a0002c0002t0013g0089
 1 HG02976.hp1
HG02976.hp1
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c.-265-15486C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48675726
chr13:48675803
C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0259
a0001c0001t0001g0259
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HG03491.hp1
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c.-265-15409C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48675803
chr13:48675868
A
A
 G
G
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a0001c0001t0002g0249
a0001c0001t0002g0248
a0001c0001t0002g0249
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HG03492.hp1
HG03491.hp2
HG03492.hp1
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c.-265-15344A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48675868
chr13:48675945
A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0004g0057
a0001c0001t0004g0057
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HG01975.hp1
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c.-265-15267A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48675945
chr13:48675985
C
C
 G
G
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others(4): Show 
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a0001c0001t0003g0093
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0164
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 8 HG02257.hp1
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others(5): Show 
HG02257.hp1
HG02451.hp1
HG02615.hp2
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c.-265-15227C>G
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chr13:48676095
C
C
 T
T
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others(6): Show 
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a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0120
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a0001c0001t0006g0127
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 9 HG00558.hp1
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others(6): Show 
HG00558.hp1
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HG02145.hp1
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chr13:48676194
C
C
 A
A
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a0001c0004t0005g0129
a0011c0012t0010g0119
 2 NA19240.hp1
NA21309.hp1
NA19240.hp1
NA21309.hp1
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c.-265-15018C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48676194
chr13:48676482
T
T
 C
C
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48676482
chr13:48676488
G
G
 A
A
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a0001c0004t0005g0184
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HG01975.hp2
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c.-265-14724G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48676488
chr13:48676492
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
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c.-265-14720G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48676492
chr13:48676527
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0011g0088
a0001c0001t0011g0088
 1 HG02886.hp1
HG02886.hp1
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c.-265-14685G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48676527
chr13:48676633
A
A
 T
T
 1 a0004c0005t0007g0121
a0004c0005t0007g0121
 1 HG03516.hp1
HG03516.hp1
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c.-265-14579A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48676633
chr13:48676861
G
G
 A
A
 37 a0001c0001t0002g0084
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others(34): Show 
a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
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a0001c0001t0004g0159
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others(39): Show 
HG00733.hp2
HG00741.hp2
HG01074.hp1
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NA19043.hp2
NA19075.hp1
NA20129.hp1
NA20300.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.-265-14351G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48676861
chr13:48676905
C
C
 T
T
 77 a0001c0001t0001g0210
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others(74): Show 
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a0001c0001t0002g0005
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 91 HG00408.hp1
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others(88): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp1
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HG00621.hp1
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NA18939.hp1
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NA18987.hp1
NA18988.hp2
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NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-14307C>T
c.-265-14307C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48676905
chr13:48676962
A
A
 G
G
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
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c.-265-14250A>G
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G
G
 A
A
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a0001c0004t0005g0186
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HG01496.hp1
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c.-265-14112G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48677100
chr13:48677209
A
A
 G
G
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a0003c0003t0007g0016
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HG02896.hp1
HG02897.hp1
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c.-265-14003A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48677209
chr13:48677233
A
A
 G
G
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a0002c0002t0013g0089
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HG02976.hp1
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c.-265-13979A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48677233
chr13:48677489
G
G
 A
A
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a0001c0001t0024g0251
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HG03831.hp1
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c.-265-13723G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48677489
chr13:48677596
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0265
a0001c0001t0001g0265
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HG01993.hp1
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c.-265-13616C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48677596
chr13:48677868
A
A
 AT
AT
 25 a0001c0001t0001g0024
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c.-265-13326dupT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48677868
chr13:48677868
AT
AT
 A
A
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c.-265-13326delT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48677868
chr13:48677888
G
G
 A
A
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C
 T
T
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a0001c0001t0005g0092
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A
A
 G
G
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C
C
 T
T
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C
C
 G
G
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C
 T
T
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a0001c0001t0006g0127
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HG04115.hp1
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T
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C
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C
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T
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a0001c0001t0001g0181
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A
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G
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G
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A
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A
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G
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c.-265-11377A>G
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A
 C
C
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a0001c0001t0001g0226
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NA18987.hp2
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c.-265-11258A>C
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TC
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T
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HG02723.hp2
NA19043.hp2
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c.-265-11217delC
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C
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G
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HG02486.hp2
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c.-265-11221C>G
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C
 A
A
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HG00733.hp2
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c.-265-11077C>A
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A
A
 C
C
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a0001c0004t0005g0184
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a0001c0004t0005g0184
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HG01243.hp1
HG01496.hp1
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c.-265-11076A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680136
chr13:48680190
C
C
 A
A
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NA18943.hp1
NA18948.hp2
NA18960.hp2
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c.-265-11022C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680190
chr13:48680562
G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0255
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HG00621.hp2
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c.-265-10650G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680562
chr13:48680643
C
C
 T
T
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a0001c0001t0002g0074
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HG02080.hp2
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c.-265-10569C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680643
chr13:48680756
T
T
 G
G
 41 a0001c0001t0003g0003
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others(44): Show 
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HG00738.hp1
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NA18953.hp2
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NA18988.hp2
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c.-265-10456T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680756
chr13:48680781
CTTTCT
CTTTCT
 C
C
 46 a0001c0001t0003g0014
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others(43): Show 
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a0001c0001t0003g0070
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a0001c0001t0003g0131
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NA20752.hp1
NA20905.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10412_-265-10
others(11): Show 
c.-265-10412_-265-10408delCTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48680781
chr13:48680795
CTTTTCT
CTTTTCT
 C
C
 30 a0001c0001t0003g0003
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others(27): Show 
a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0015
a0001c0001t0003g0037
a0001c0001t0003g0071
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 34 HG00673.hp1
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others(31): Show 
HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
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HG02895.hp1
HG02896.hp2
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HG03225.hp2
HG03453.hp2
HG03486.hp2
HG03490.hp1
HG03492.hp2
HG03516.hp2
HG03669.hp2
NA18951.hp2
NA18953.hp2
NA18967.hp2
NA18968.hp2
NA18979.hp2
NA18982.hp2
NA18987.hp1
NA18988.hp2
NA18992.hp1
NA19070.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10412_-265-10
others(12): Show 
c.-265-10412_-265-10407delCTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48680795
chr13:48680795
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others(4): Show 
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 C
C
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others(61): Show 
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 72 HG00140.hp1
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others(69): Show 
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NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18948.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp2
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18964.hp1
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18980.hp2
NA18985.hp1
NA18988.hp1
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NA19010.hp2
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NA19063.hp2
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NA19086.hp2
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NA20905.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-10412_-265-10
others(17): Show 
c.-265-10412_-265-10402delCTTTTTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48680795
chr13:48680795
CTTTTCTT
others(5): Show 
CTTTTCTTTTTTT
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0051
a0001c0001t0002g0051
 1 NA18989.hp1
NA18989.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10412_-265-10
others(18): Show 
c.-265-10412_-265-10401delCTTTTTTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48680795
chr13:48680796
TTTTC
TTTTC
 T
T
 14 a0001c0001t0004g0160
a0001c0001t0004g0177
a0001c0001t0006g0027
others(11): Show 
a0001c0001t0004g0160
a0001c0001t0004g0177
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0126
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
a0001c0001t0010g0162
a0001c0001t0010g0163
a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0116
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 15 HG01071.hp2
HG02486.hp2
HG02818.hp1
others(12): Show 
HG01071.hp2
HG02486.hp2
HG02818.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02970.hp1
HG03130.hp1
HG03453.hp1
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NA18991.hp2
NA18995.hp1
NA19043.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-10412_-265-10
others(10): Show 
c.-265-10412_-265-10409delCTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48680796
chr13:48680797
TTTC
TTTC
 T
T
 12 a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0010g0018
a0001c0001t0020g0086
others(9): Show 
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0010g0018
a0001c0001t0020g0086
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a0001c0004t0005g0186
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a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0117
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 13 HG00733.hp2
HG01081.hp1
HG01243.hp1
others(10): Show 
HG00733.hp2
HG01081.hp1
HG01243.hp1
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HG01975.hp2
HG02809.hp1
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NA19030.hp1
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10412_-265-10
others(9): Show 
c.-265-10412_-265-10410delCTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48680797
chr13:48680799
TC
TC
 T
T
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a0001c0001t0005g0095
a0002c0002t0005g0196
others(3): Show 
a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0002c0002t0005g0196
a0002c0002t0013g0089
a0002c0002t0013g0090
a0002c0002t0016g0079
 6 HG01109.hp2
HG02615.hp2
HG02965.hp1
others(3): Show 
HG01109.hp2
HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02965.hp2
HG02976.hp1
HG03579.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-10412delC
c.-265-10412delC
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680799
chr13:48680800
C
C
 CT
CT
 9 a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0229
others(6): Show 
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0229
a0001c0001t0001g0231
a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0247
a0001c0001t0002g0128
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 9 HG00408.hp2
HG00642.hp1
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others(6): Show 
HG00408.hp2
HG00642.hp1
HG00735.hp1
HG01361.hp2
HG02074.hp1
HG02735.hp1
HG03704.hp1
HG03704.hp2
NA18961.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10392dupT
c.-265-10392dupT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48680800
chr13:48680800
C
C
 T
T
 5 a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
others(2): Show 
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
a0002c0002t0013g0091
 6 HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
others(3): Show 
HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG03041.hp1
HG03098.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10412C>T
c.-265-10412C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680800
chr13:48680804
T
T
 C
C
 2 a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
 2 HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02615.hp2
HG02965.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10408T>C
c.-265-10408T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680804
chr13:48680805
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0005g0096
a0001c0001t0005g0096
 1 HG02970.hp2
HG02970.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-10407T>C
c.-265-10407T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680805
chr13:48680867
T
T
 C
C
 17 a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
others(14): Show 
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a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
a0003c0003t0007g0117
a0003c0003t0007g0118
a0003c0003t0007g0125
a0004c0005t0007g0097
a0004c0005t0007g0099
a0004c0005t0007g0121
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a0005c0008t0007g0100
 18 HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG02818.hp1
others(15): Show 
HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02970.hp1
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp1
HG03516.hp1
HG03540.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA19043.hp2
NA20129.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-10345T>C
c.-265-10345T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680867
chr13:48680965
T
T
 C
C
 9 a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
others(6): Show 
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
a0002c0002t0005g0196
a0002c0002t0013g0089
a0002c0002t0013g0090
a0002c0002t0013g0091
a0002c0002t0016g0079
 10 HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01884.hp2
others(7): Show 
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02965.hp2
HG02976.hp1
HG03041.hp1
HG03098.hp1
HG03579.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10247T>C
c.-265-10247T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48680965
chr13:48681028
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0006g0127
a0001c0001t0006g0127
 1 HG04115.hp1
HG04115.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10184G>A
c.-265-10184G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48681028
chr13:48681153
G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0009g0257
a0001c0001t0009g0257
 1 HG03540.hp1
HG03540.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-10059G>C
c.-265-10059G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48681153
chr13:48681580
C
C
 T
T
 36 a0001c0001t0004g0006
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a0001c0001t0004g0057
others(33): Show 
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0057
a0001c0001t0004g0065
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a0001c0001t0004g0159
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a0001c0001t0004g0170
a0001c0001t0004g0173
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a0001c0001t0004g0177
a0001c0001t0004g0234
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a0001c0001t0006g0027
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a0001c0001t0006g0126
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a0001c0001t0006g0211
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 45 HG00408.hp1
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others(42): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp2
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HG01074.hp1
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HG02145.hp2
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HG02630.hp1
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NA18939.hp2
NA18950.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp1
NA18970.hp2
NA18989.hp2
NA18991.hp2
NA18993.hp2
NA18995.hp1
NA19009.hp1
NA19070.hp2
NA19075.hp1
NA19082.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-9632C>T
c.-265-9632C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48681580
chr13:48681766
C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0001g0028
a0001c0001t0001g0273
others(1): Show 
a0001c0001t0001g0024
a0001c0001t0001g0028
a0001c0001t0001g0273
a0001c0001t0001g0274
 5 HG02559.hp1
HG02615.hp1
HG03139.hp1
others(2): Show 
HG02559.hp1
HG02615.hp1
HG03139.hp1
HG03225.hp1
HG06807.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-9446C>T
c.-265-9446C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48681766
chr13:48681820
C
C
 T
T
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-9392C>T
c.-265-9392C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48681820
chr13:48681836
C
C
 T
T
 34 a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0015
others(31): Show 
a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0015
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C
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A
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C
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A
 T
T
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G
 A
A
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c.-265-8447G>A
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A
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G
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c.-265-8398A>G
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G
G
 C
C
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c.-265-8393G>C
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G
 C
C
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c.-265-8276G>C
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C
 T
T
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c.-265-8177C>T
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0219
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HG02056.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-8121G>A
c.-265-8121G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48683091
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C
C
 T
T
 65 a0001c0001t0001g0231
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G
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A
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A
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T
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A
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G
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G
 A
A
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c.-265-7245G>A
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T
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C
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G
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A
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c.-265-6879G>A
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C
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T
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-265-6805C>T
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A
A
 C
C
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A
A
 T
T
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a0001c0001t0002g0084
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NA18959.hp2
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chr13:48685065
G
G
 A
A
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c.-265-6147G>A
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G
G
 A
A
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NA19070.hp1
NA20905.hp1
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c.-265-6145G>A
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chr13:48685260
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others(7): Show 
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 A
A
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others(115): Show 
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-5930_-265-591
others(18): Show 
c.-265-5930_-265-5917delGAGAACTCACTCAC
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48685260
chr13:48685321
C
C
 T
T
 1 a0002c0002t0016g0079
a0002c0002t0016g0079
 1 HG01109.hp2
HG01109.hp2
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c.-265-5891C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48685321
chr13:48685703
A
A
 G
G
 3 a0001c0001t0002g0013
a0001c0001t0002g0084
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a0001c0001t0002g0013
a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0026g0030
 4 NA18955.hp1
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others(1): Show 
NA18955.hp1
NA18959.hp2
NA19010.hp1
NA19063.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-5509A>G
c.-265-5509A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48685703
chr13:48685709
C
C
 T
T
 101 a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0011
others(98): Show 
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0011
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c.-265-5503C>T
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c.-265-5467T>C
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c.-265-5281A>G
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HG04228.hp2
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c.-265-5252G>A
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G
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A
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T
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C
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T
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G
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c.-265-4491G>A
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A
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c.-265-4374A>G
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T
T
 C
C
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a0001c0007t0001g0270
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HG04204.hp2
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c.-265-4373T>C
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0256
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HG02129.hp2
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c.-265-4332G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48686880
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G
G
 A
A
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c.-265-4282G>A
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C
 G
G
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c.-265-4226C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48686986
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G
G
 A
A
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others(42): Show 
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HG02145.hp2
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NA18995.hp1
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NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
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c.-265-4137G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48687075
chr13:48687084
TCTC
TCTC
 T
T
 6 a0001c0001t0010g0018
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a0001c0001t0010g0162
others(3): Show 
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a0001c0001t0010g0161
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 7 HG01069.hp2
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others(4): Show 
HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG01081.hp1
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others(7): Show 
c.-265-4125_-265-4123delCCT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48687084
chr13:48687211
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.-265-4001C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48687211
chr13:48687262
C
C
 A
A
 3 a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
 3 HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
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c.-265-3950C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48687262
chr13:48687332
C
C
 CATCTATC
others(5): Show 
CATCTATCTATCT
 3 a0001c0001t0011g0033
a0001c0001t0011g0156
a0001c0001t0011g0157
a0001c0001t0011g0033
a0001c0001t0011g0156
a0001c0001t0011g0157
 3 HG01109.hp1
HG03195.hp1
HG03516.hp2
HG01109.hp1
HG03195.hp1
HG03516.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-3869_-265-385
others(16): Show 
c.-265-3869_-265-3858dupCTATCTATCTAT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48687332
chr13:48687332
C
C
 CATCTATC
others(9): Show 
CATCTATCTATCTATCT
 1 a0001c0001t0011g0165
a0001c0001t0011g0165
 1 HG02451.hp2
HG02451.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-3873_-265-385
others(20): Show 
c.-265-3873_-265-3858dupCTATCTATCTATCTAT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48687332
chr13:48687389
AGAT
AGAT
 A
A
 17 a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
others(14): Show 
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
a0003c0003t0007g0117
a0003c0003t0007g0118
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a0004c0005t0007g0097
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a0005c0008t0007g0100
 18 HG02572.hp2
HG02723.hp2
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others(15): Show 
HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
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NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA19043.hp2
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NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-3819_-265-381
others(7): Show 
c.-265-3819_-265-3817delGAT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48687389
chr13:48687439
C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0269
a0001c0001t0001g0269
 1 NA18991.hp1
NA18991.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-3773C>A
c.-265-3773C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48687439
chr13:48687530
A
A
 C
C
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-265-3682A>C
c.-265-3682A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48687530
chr13:48687593
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0067
a0001c0001t0001g0067
 1 HG04184.hp2
HG04184.hp2
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c.-265-3619C>T
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T
T
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A
A
 T
T
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c.-265-3317A>T
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T
T
 C
C
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c.-265-3092T>C
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T
T
 C
C
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c.-265-2916T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48688296
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0074
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HG02080.hp2
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c.-265-2812G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48688400
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T
T
 C
C
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-265-2759T>C
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C
C
 T
T
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NA18951.hp1
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c.-265-2753C>T
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T
T
 G
G
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NA19090.hp1
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c.-265-2749T>G
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G
G
 A
A
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c.-265-2631G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48688581
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G
G
 T
T
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others(42): Show 
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chr13:48688706
T
T
 C
C
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-265-2506T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48688706
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0093
a0001c0001t0003g0094
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HG02257.hp1
HG02451.hp1
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c.-265-2384G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48688828
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0003g0130
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HG01884.hp1
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c.-265-2381G>A
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C
C
 T
T
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c.-265-2307C>T
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G
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A
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c.-265-1876G>A
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G
G
 GT
GT
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c.-265-1836dupT
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chr13:48689472
G
G
 T
T
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a0001c0001t0001g0035
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HG03130.hp2
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c.-265-1740G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48689472
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A
A
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ATATCTG
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NA18995.hp1
NA19009.hp1
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NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-1598_-265-159
others(10): Show 
c.-265-1598_-265-1593dupATCTGT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48689612
chr13:48689627
C
C
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0273
a0001c0001t0001g0273
 1 HG02559.hp1
HG02559.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-1585C>A
c.-265-1585C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48689627
chr13:48689758
A
A
 T
T
 5 a0004c0005t0007g0097
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a0004c0005t0007g0121
others(2): Show 
a0004c0005t0007g0097
a0004c0005t0007g0099
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 5 HG02572.hp2
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others(2): Show 
HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG03516.hp1
NA19043.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-1454A>T
c.-265-1454A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48689758
chr13:48689815
C
C
 T
T
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 1 NA18952.hp1
NA18952.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-1397C>T
c.-265-1397C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48689815
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C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0002g0012
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 4 HG00140.hp2
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others(1): Show 
HG00140.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-265-1102C>T
c.-265-1102C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690110
chr13:48690145
T
T
 A
A
 5 a0001c0001t0010g0018
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HG01071.hp2
HG02486.hp2
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NA21309.hp1
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c.-265-1067T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690145
chr13:48690194
G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0036
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HG02738.hp1
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c.-265-1018G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690194
chr13:48690240
T
T
 C
C
 1 a0004c0005t0007g0121
a0004c0005t0007g0121
 1 HG03516.hp1
HG03516.hp1
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c.-265-972T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690240
chr13:48690444
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0021g0025
a0001c0001t0021g0025
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
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c.-265-768T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690444
chr13:48690478
T
T
 C
C
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others(3): Show 
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a0001c0004t0005g0184
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HG00733.hp2
HG01243.hp1
HG01496.hp1
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HG03139.hp2
NA19240.hp1
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c.-265-734T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690478
chr13:48690527
A
A
 T
T
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a0001c0001t0002g0107
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NA18948.hp1
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c.-265-685A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690527
chr13:48690590
G
G
 A
A
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a0001c0001t0001g0261
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HG00438.hp1
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c.-265-622G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690590
chr13:48690732
C
C
 T
T
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a0001c0001t0003g0101
a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0101
 2 HG01243.hp2
HG03471.hp2
HG01243.hp2
HG03471.hp2
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c.-265-480C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690732
chr13:48690735
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0225
 1 NA18961.hp1
NA18961.hp1
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c.-265-477T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690735
chr13:48690763
C
C
 A
A
 1 a0011c0012t0010g0119
a0011c0012t0010g0119
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
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c.-265-449C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690763
chr13:48690895
TG
TG
 T
T
 36 a0001c0001t0004g0006
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others(33): Show 
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 45 HG00408.hp1
HG00438.hp2
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others(42): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp2
HG00741.hp2
HG01074.hp1
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NA18939.hp2
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NA19009.hp1
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NA19082.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-315delG
c.-265-315delG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48690895
chr13:48690936
G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0020g0086
a0001c0001t0020g0086
 1 HG01081.hp1
HG01081.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-276G>C
c.-265-276G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48690936
chr13:48691070
C
C
 T
T
 1 a0010c0014t0004g0123
a0010c0014t0004g0123
 1 HG02145.hp1
HG02145.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-142C>T
c.-265-142C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48691070
chr13:48691194
G
G
 A
A
 9 a0002c0002t0005g0021
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a0002c0002t0005g0194
others(6): Show 
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
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 10 HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01884.hp2
others(7): Show 
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02965.hp2
HG02976.hp1
HG03041.hp1
HG03098.hp1
HG03579.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-18G>A
c.-265-18G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48691194
chr13:48691198
G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0024g0251
a0001c0001t0024g0251
 1 HG03831.hp1
HG03831.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-265-14G>C
c.-265-14G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 1/4 chr13 48691198
chr13:48691392
G
G
 A
A
 2 a0001c0001t0006g0178
a0001c0001t0006g0179
a0001c0001t0006g0178
a0001c0001t0006g0179
 2 HG02630.hp1
HG03209.hp2
HG02630.hp1
HG03209.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-176+91G>A
c.-176+91G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48691392
chr13:48691443
A
A
 G
G
 1 a0011c0012t0010g0119
a0011c0012t0010g0119
 1 NA21309.hp1
NA21309.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-176+142A>G
c.-176+142A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48691443
chr13:48691586
A
A
 G
G
 4 a0001c0004t0005g0185
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others(1): Show 
a0001c0004t0005g0185
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a0001c0004t0005g0197
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 4 HG00733.hp2
HG01243.hp1
HG01496.hp1
others(1): Show 
HG00733.hp2
HG01243.hp1
HG01496.hp1
HG03139.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-176+285A>G
c.-176+285A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48691586
chr13:48691645
T
T
 C
C
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-176+344T>C
c.-176+344T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48691645
chr13:48691783
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0269
a0001c0001t0001g0269
 1 NA18991.hp1
NA18991.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-176+482T>A
c.-176+482T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48691783
chr13:48691842
A
A
 G
G
 17 a0001c0001t0009g0109
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a0001c0001t0009g0111
others(14): Show 
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
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a0003c0003t0007g0016
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a0004c0005t0007g0097
a0004c0005t0007g0099
a0004c0005t0007g0121
a0005c0008t0007g0098
a0005c0008t0007g0100
 18 HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG02818.hp1
others(15): Show 
HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02970.hp1
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp1
HG03516.hp1
HG03540.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA19043.hp2
NA20129.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-176+541A>G
c.-176+541A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48691842
chr13:48691883
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0011g0088
a0001c0001t0011g0088
 1 HG02886.hp1
HG02886.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-176+582T>C
c.-176+582T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48691883
chr13:48691991
A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0245
a0001c0001t0001g0245
 1 NA18950.hp1
NA18950.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-176+690A>T
c.-176+690A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48691991
chr13:48692564
T
T
 G
G
 1 a0001c0001t0015g0077
a0001c0001t0015g0077
 1 NA18988.hp1
NA18988.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-175-874T>G
c.-175-874T>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48692564
chr13:48692679
A
A
 G
G
 1 a0001c0004t0005g0184
a0001c0004t0005g0184
 1 HG01975.hp2
HG01975.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-175-759A>G
c.-175-759A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48692679
chr13:48692697
T
T
 C
C
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-175-741T>C
c.-175-741T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48692697
chr13:48692856
G
G
 T
T
 6 a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
others(3): Show 
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
 6 HG02818.hp1
HG03453.hp1
HG03540.hp1
others(3): Show 
HG02818.hp1
HG03453.hp1
HG03540.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-175-582G>T
c.-175-582G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48692856
chr13:48692890
T
T
 C
C
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-175-548T>C
c.-175-548T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48692890
chr13:48692946
G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0011g0033
a0001c0001t0011g0156
a0001c0001t0011g0157
others(1): Show 
a0001c0001t0011g0033
a0001c0001t0011g0156
a0001c0001t0011g0157
a0001c0001t0011g0165
 4 HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG03195.hp1
others(1): Show 
HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG03195.hp1
HG03516.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-175-492G>A
c.-175-492G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48692946
chr13:48693073
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0061
a0001c0001t0002g0061
 1 HG00673.hp2
HG00673.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-175-365C>T
c.-175-365C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48693073
chr13:48693146
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
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c.-175-292G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48693146
chr13:48693172
A
A
 T
T
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-175-266A>T
c.-175-266A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48693172
chr13:48693201
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0092
 1 HG02615.hp2
HG02615.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-175-237T>C
c.-175-237T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 2/4 chr13 48693201
chr13:48693532
CA
CA
 C
C
 4 a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
others(1): Show 
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
a0002c0002t0005g0196
 5 HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG03098.hp1
others(2): Show 
HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG03098.hp1
HG03579.hp2
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-103+23delA
c.-103+23delA
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48693532
chr13:48693621
CA
CA
 C
C
 36 a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0057
others(33): Show 
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0057
a0001c0001t0004g0065
a0001c0001t0004g0068
a0001c0001t0004g0085
a0001c0001t0004g0159
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a0001c0001t0004g0170
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a0001c0001t0004g0234
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a0001c0001t0006g0027
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a0001c0001t0006g0126
a0001c0001t0006g0127
a0001c0001t0006g0178
a0001c0001t0006g0179
a0001c0001t0006g0200
a0001c0001t0006g0211
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0008g0002
a0001c0001t0008g0004
a0001c0001t0008g0142
a0001c0001t0008g0166
a0001c0001t0008g0167
a0001c0001t0008g0278
a0010c0014t0004g0123
 45 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
others(42): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp2
HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01099.hp2
HG01515.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG01975.hp1
HG01978.hp2
HG02055.hp2
HG02071.hp2
HG02080.hp1
HG02129.hp1
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02602.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp2
HG03017.hp2
HG03209.hp2
HG03927.hp1
HG04115.hp1
NA18939.hp2
NA18950.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp1
NA18970.hp2
NA18989.hp2
NA18991.hp2
NA18993.hp2
NA18995.hp1
NA19009.hp1
NA19070.hp2
NA19075.hp1
NA19082.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-103+122delA
c.-103+122delA
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48693621
chr13:48693738
C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0010g0018
a0001c0001t0010g0161
a0001c0001t0010g0162
others(1): Show 
a0001c0001t0010g0018
a0001c0001t0010g0161
a0001c0001t0010g0162
a0001c0001t0010g0163
 5 HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG02486.hp2
others(2): Show 
HG01069.hp2
HG01071.hp2
HG02486.hp2
HG02895.hp2
HG02897.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-103+228C>T
c.-103+228C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48693738
chr13:48693771
C
C
 T
T
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-103+261C>T
c.-103+261C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48693771
chr13:48693954
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0139
a0001c0001t0003g0139
 1 NA18979.hp2
NA18979.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-103+444G>A
c.-103+444G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48693954
chr13:48693958
C
C
 G
G
 101 a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0011
others(98): Show 
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0011
a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0013
a0001c0001t0002g0022
a0001c0001t0002g0026
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a0001c0001t0002g0045
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a0001c0001t0002g0062
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a0001c0001t0002g0084
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a0001c0001t0004g0234
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a0001c0001t0006g0178
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a0001c0001t0006g0200
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a0001c0001t0006g0212
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a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0008g0002
a0001c0001t0008g0004
a0001c0001t0008g0142
a0001c0001t0008g0166
a0001c0001t0008g0167
a0001c0001t0008g0278
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a0001c0001t0015g0077
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a0001c0001t0024g0251
a0001c0001t0025g0001
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a0010c0014t0004g0123
 119 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00408.hp1
others(116): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp1
HG00609.hp2
HG00621.hp1
HG00642.hp1
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HG00741.hp1
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HG01099.hp2
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HG01169.hp1
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NA18939.hp1
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NA18955.hp1
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NA18960.hp1
NA18960.hp2
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NA18962.hp1
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NA18975.hp2
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NA18989.hp2
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NA19001.hp1
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NA19009.hp1
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NA19070.hp2
NA19075.hp1
NA19075.hp2
NA19082.hp1
NA19082.hp2
NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA20752.hp1
NA20905.hp2
NA21309.hp2
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-103+448C>G
c.-103+448C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48693958
chr13:48694111
A
A
 G
G
 65 a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0011
others(62): Show 
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0011
a0001c0001t0002g0012
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c.-103+601A>G
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chr13:48694177
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G
 GA
GA
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c.-103+674dupA
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48694177
chr13:48694180
A
A
 G
G
 1 a0010c0014t0004g0123
a0010c0014t0004g0123
 1 HG02145.hp1
HG02145.hp1
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c.-103+670A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694180
chr13:48694476
G
G
 T
T
 3 a0001c0001t0006g0112
a0001c0001t0006g0178
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a0001c0001t0006g0112
a0001c0001t0006g0178
a0001c0001t0006g0179
 3 HG02145.hp2
HG02630.hp1
HG03209.hp2
HG02145.hp2
HG02630.hp1
HG03209.hp2
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c.-103+966G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694476
chr13:48694490
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
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NA19030.hp2
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c.-103+980C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694490
chr13:48694622
A
A
 G
G
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HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
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c.-103+1112A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694622
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AC
AC
 A
A
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others(42): Show 
HG00408.hp1
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HG00558.hp1
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HG02145.hp2
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NA18995.hp1
NA19009.hp1
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NA19075.hp1
NA19082.hp1
NA20752.hp1
homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-103+1171delC
c.-103+1171delC
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48694679
chr13:48694831
G
G
 C
C
 4 a0001c0001t0012g0081
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others(1): Show 
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others(1): Show 
HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-103+1321G>C
c.-103+1321G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694831
chr13:48694836
C
C
 T
T
 2 a0002c0002t0013g0090
a0002c0002t0013g0091
a0002c0002t0013g0090
a0002c0002t0013g0091
 2 HG02965.hp2
HG03041.hp1
HG02965.hp2
HG03041.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-103+1326C>T
c.-103+1326C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694836
chr13:48694845
A
A
 C
C
 34 a0001c0001t0003g0003
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others(31): Show 
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 40 HG00673.hp1
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others(37): Show 
HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
HG01168.hp2
HG01243.hp2
HG01361.hp1
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HG03041.hp2
HG03195.hp2
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HG03225.hp2
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HG03540.hp2
HG03579.hp1
HG03669.hp2
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NA18953.hp2
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NA18968.hp2
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NA18987.hp1
NA18988.hp2
NA18992.hp1
NA19070.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-103+1335A>C
c.-103+1335A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694845
chr13:48694895
G
G
 C
C
 6 a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
others(3): Show 
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
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a0001c0001t0009g0257
 6 HG02818.hp1
HG03453.hp1
HG03540.hp1
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HG02818.hp1
HG03453.hp1
HG03540.hp1
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NA20300.hp2
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c.-103+1385G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694895
chr13:48694988
A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0014g0201
a0001c0001t0014g0239
a0001c0001t0014g0201
a0001c0001t0014g0239
 2 HG02735.hp2
HG03831.hp2
HG02735.hp2
HG03831.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-103+1478A>G
c.-103+1478A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694988
chr13:48694988
A
A
 T
T
 3 a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
 3 HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-103+1478A>T
c.-103+1478A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48694988
chr13:48695024
G
G
 A
A
 9 a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
others(6): Show 
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
a0002c0002t0005g0196
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 10 HG01109.hp2
HG01192.hp2
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others(7): Show 
HG01109.hp2
HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02965.hp2
HG02976.hp1
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NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1502G>A
c.-102-1502G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695024
chr13:48695046
C
C
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1480C>A
c.-102-1480C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695046
chr13:48695047
C
C
 CATGGT
CATGGT
 4 a0001c0001t0012g0081
a0001c0001t0012g0082
a0001c0001t0012g0083
others(1): Show 
a0001c0001t0012g0081
a0001c0001t0012g0082
a0001c0001t0012g0083
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 4 HG02257.hp2
HG02622.hp1
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others(1): Show 
HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1476_-102-147
others(9): Show 
c.-102-1476_-102-1472dupGGTAT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695047
chr13:48695068
A
A
 AT
AT
 17 a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0209
others(14): Show 
a0001c0001t0001g0190
a0001c0001t0001g0207
a0001c0001t0001g0209
a0001c0001t0001g0226
a0001c0001t0001g0229
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a0001c0001t0001g0277
a0001c0001t0010g0162
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a0001c0004t0005g0129
a0001c0007t0001g0270
 17 HG00408.hp2
HG00621.hp2
HG00735.hp1
others(14): Show 
HG00408.hp2
HG00621.hp2
HG00735.hp1
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HG02486.hp1
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HG03139.hp1
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NA18940.hp1
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NA19006.hp1
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NA19058.hp2
NA19090.hp1
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1432dupT
c.-102-1432dupT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATT
ATT
 9 a0001c0001t0011g0088
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0194
others(6): Show 
a0001c0001t0011g0088
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
a0003c0003t0007g0117
a0003c0003t0007g0125
 11 HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG02886.hp1
others(8): Show 
HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG02886.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02970.hp1
HG03098.hp1
HG03130.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp1
NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1433_-102-143
others(6): Show 
c.-102-1433_-102-1432dupTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATTTTT
ATTTTT
 11 a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0040
a0001c0001t0002g0042
others(8): Show 
a0001c0001t0002g0039
a0001c0001t0002g0040
a0001c0001t0002g0042
a0001c0001t0002g0048
a0001c0001t0002g0053
a0001c0001t0002g0058
a0001c0001t0002g0061
a0001c0001t0002g0151
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a0001c0001t0015g0077
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 11 HG00673.hp2
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HG01256.hp2
others(8): Show 
HG00673.hp2
HG00741.hp1
HG01256.hp2
HG02602.hp2
HG02683.hp2
HG03491.hp2
HG04204.hp1
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18988.hp1
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1436_-102-143
others(9): Show 
c.-102-1436_-102-1432dupTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATTTTTT
ATTTTTT
 26 a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0022
a0001c0001t0002g0026
others(23): Show 
a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0022
a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0002g0032
a0001c0001t0002g0036
a0001c0001t0002g0038
a0001c0001t0002g0041
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a0001c0001t0002g0054
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a0001c0001t0002g0056
a0001c0001t0002g0059
a0001c0001t0002g0064
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0073
a0001c0001t0002g0128
a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0172
a0001c0001t0002g0227
a0001c0001t0002g0249
a0001c0001t0024g0251
a0001c0001t0025g0001
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 31 HG00140.hp1
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others(28): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00642.hp1
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HG02074.hp2
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HG04199.hp1
NA18942.hp2
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NA18961.hp2
NA18962.hp1
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NA18980.hp2
NA18985.hp1
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NA19063.hp1
NA19065.hp1
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NA19086.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1437_-102-143
others(10): Show 
c.-102-1437_-102-1432dupTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
ATTTTTTT
 12 a0001c0001t0002g0011
a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0013
others(9): Show 
a0001c0001t0002g0011
a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0013
a0001c0001t0002g0031
a0001c0001t0002g0050
a0001c0001t0002g0051
a0001c0001t0002g0060
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0012g0083
a0001c0001t0012g0136
a0001c0001t0015g0011
 14 HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG02056.hp2
others(11): Show 
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG02056.hp2
HG02896.hp2
HG03017.hp1
HG03486.hp2
NA18943.hp1
NA18959.hp2
NA18989.hp1
NA19006.hp2
NA19010.hp1
NA19063.hp2
NA19090.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1438_-102-143
others(11): Show 
c.-102-1438_-102-1432dupTTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
others(1): Show 
ATTTTTTTT
 13 a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0112
others(10): Show 
a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0112
a0001c0001t0006g0124
a0001c0001t0006g0127
a0001c0001t0006g0178
a0001c0001t0006g0211
a0001c0001t0008g0002
a0001c0001t0008g0166
a0001c0001t0008g0278
a0001c0001t0012g0081
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 17 HG00558.hp1
HG00609.hp2
HG00735.hp2
others(14): Show 
HG00558.hp1
HG00609.hp2
HG00735.hp2
HG01943.hp1
HG02071.hp2
HG02080.hp1
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HG02145.hp2
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NA18968.hp1
NA18993.hp2
NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1439_-102-143
others(12): Show 
c.-102-1439_-102-1432dupTTTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
others(2): Show 
ATTTTTTTTT
 8 a0001c0001t0006g0126
a0001c0001t0006g0179
a0001c0001t0006g0200
others(5): Show 
a0001c0001t0006g0126
a0001c0001t0006g0179
a0001c0001t0006g0200
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0008g0004
a0001c0001t0008g0142
a0001c0001t0008g0167
 10 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG01099.hp2
others(7): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG01099.hp2
HG01515.hp2
HG02630.hp1
NA18950.hp2
NA18967.hp1
NA18995.hp1
NA19009.hp1
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1440_-102-143
others(13): Show 
c.-102-1440_-102-1432dupTTTTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
others(3): Show 
ATTTTTTTTTT
 7 a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0057
a0001c0001t0004g0065
others(4): Show 
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0057
a0001c0001t0004g0065
a0001c0001t0004g0170
a0001c0001t0004g0173
a0001c0001t0006g0120
a0001c0001t0006g0213
 9 HG01081.hp2
HG01928.hp2
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others(6): Show 
HG01081.hp2
HG01928.hp2
HG01975.hp1
HG01978.hp2
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HG02300.hp1
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NA18939.hp2
NA19070.hp2
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others(14): Show 
c.-102-1441_-102-1432dupTTTTTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTT
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a0001c0001t0004g0085
a0001c0001t0004g0160
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a0001c0001t0004g0068
a0001c0001t0004g0085
a0001c0001t0004g0160
a0001c0001t0004g0174
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a0001c0001t0004g0177
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HG01074.hp1
HG01952.hp1
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chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTT
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a0001c0001t0004g0159
a0001c0001t0004g0234
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HG01099.hp1
HG02602.hp1
HG03017.hp2
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chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTTT
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a0001c0001t0011g0156
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HG01109.hp1
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c.-102-1444_-102-1432dupTTTTTTTTTTTTT
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chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTTTT
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a0001c0001t0011g0157
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HG03516.hp2
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chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTTTTT
 1 a0001c0001t0011g0033
a0001c0001t0011g0033
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HG03195.hp1
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c.-102-1446_-102-1432dupTTTTTTTTTTTTTTT
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A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTTTTTT
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a0001c0001t0004g0176
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HG00741.hp2
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A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTTTTTTTT
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HG02451.hp2
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chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 2 a0004c0005t0007g0097
a0005c0008t0007g0098
a0004c0005t0007g0097
a0005c0008t0007g0098
 2 NA19043.hp2
NA20129.hp1
NA19043.hp2
NA20129.hp1
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CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 1 a0004c0005t0007g0099
a0004c0005t0007g0099
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HG02723.hp2
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c.-102-1451_-102-1432dupTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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 1 a0005c0008t0007g0100
a0005c0008t0007g0100
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HG02572.hp2
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c.-102-1452_-102-1432dupTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
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chr13:48695068
A
A
 ATTTTTTT
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ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
 5 a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
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a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
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 5 HG03453.hp1
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NA19030.hp1
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HG03453.hp1
HG03516.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1454_-102-143
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c.-102-1454_-102-1432dupTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
AT
AT
 A
A
 17 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0078
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a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0035
a0001c0001t0001g0078
a0001c0001t0001g0113
a0001c0001t0001g0204
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 17 HG01243.hp1
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others(14): Show 
HG01243.hp1
HG01257.hp2
HG01496.hp1
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NA18984.hp1
NA18992.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1432delT
c.-102-1432delT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
ATTTT
ATTTT
 A
A
 6 a0001c0001t0002g0063
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a0001c0001t0003g0102
others(3): Show 
a0001c0001t0002g0063
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0102
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HG02257.hp1
HG02698.hp1
HG04115.hp2
NA18953.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-102-1435_-102-143
others(8): Show 
c.-102-1435_-102-1432delTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
ATTTTT
ATTTTT
 A
A
 30 a0001c0001t0002g0047
a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0003g0003
others(27): Show 
a0001c0001t0002g0047
a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0015
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a0001c0001t0003g0071
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a0001c0001t0003g0101
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 36 HG00609.hp1
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others(33): Show 
HG00609.hp1
HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
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NA18992.hp1
NA19070.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1436_-102-143
others(9): Show 
c.-102-1436_-102-1432delTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695068
ATTTTTT
ATTTTTT
 A
A
 15 a0001c0001t0002g0005
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a0001c0001t0002g0074
others(12): Show 
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0046
a0001c0001t0002g0074
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 17 HG00621.hp1
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others(14): Show 
HG00621.hp1
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HG02080.hp2
NA18939.hp1
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NA19082.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1437_-102-143
others(10): Show 
c.-102-1437_-102-1432delTTTTTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695068
chr13:48695223
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0036
a0001c0001t0002g0036
 1 HG02738.hp1
HG02738.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1303C>T
c.-102-1303C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695223
chr13:48695255
C
C
 T
T
 6 a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
others(3): Show 
a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
a0003c0003t0007g0117
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a0003c0003t0007g0125
 7 HG02896.hp1
HG02897.hp1
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others(4): Show 
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02970.hp1
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1271C>T
c.-102-1271C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695255
chr13:48695257
TTTTTTTT
others(7): Show 
TTTTTTTTCCTTTTC
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0238
a0001c0001t0001g0264
a0001c0001t0001g0238
a0001c0001t0001g0264
 2 HG01978.hp1
NA19006.hp1
HG01978.hp1
NA19006.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-1257_-102-124
others(18): Show 
c.-102-1257_-102-1244delTTCTTTTTTTCCTT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695257
chr13:48695389
C
C
 T
T
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1137C>T
c.-102-1137C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695389
chr13:48695391
T
T
 C
C
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-1135T>C
c.-102-1135T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695391
chr13:48695391
T
T
 TTCTC
TTCTC
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T
T
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c.-102-1132_-102-1131insTTCTCTCT
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chr13:48695391
T
T
 TTCTTTCT
others(5): Show 
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HG00735.hp2
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others(16): Show 
c.-102-1132_-102-1131insTTCTTTCTCTCT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48695391
chr13:48695433
G
G
 A
A
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-102-1093G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695433
chr13:48695543
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CT
 C
C
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c.-102-982delT
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A
 C
C
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HG04228.hp2
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c.-102-934A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695592
chr13:48695636
T
T
 C
C
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a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.-102-890T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695636
chr13:48695639
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.-102-887T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695639
chr13:48695641
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.-102-885T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695641
chr13:48695643
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.-102-883G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695643
chr13:48695644
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
NA19030.hp2
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c.-102-882T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695644
chr13:48695667
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0003g0130
a0001c0001t0003g0130
 1 HG01884.hp1
HG01884.hp1
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c.-102-859G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695667
chr13:48695807
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0018g0202
a0001c0001t0018g0202
 1 HG01361.hp2
HG01361.hp2
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c.-102-719A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695807
chr13:48695827
T
T
 C
C
 1 a0002c0002t0016g0079
a0002c0002t0016g0079
 1 HG01109.hp2
HG01109.hp2
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c.-102-699T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48695827
chr13:48696002
C
C
 T
T
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c.-102-524C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48696002
chr13:48696020
C
C
 T
T
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 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
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c.-102-506C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48696020
chr13:48696142
A
A
 G
G
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-102-384A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48696142
chr13:48696159
AT
AT
 A
A
 4 a0001c0001t0001g0254
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others(1): Show 
a0001c0001t0001g0254
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others(1): Show 
HG00621.hp2
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 intron_variant MODIFIER c.-102-361delT
c.-102-361delT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48696159
chr13:48696242
C
C
 T
T
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a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-102-284C>T
c.-102-284C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48696242
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A
A
 G
G
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a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
 3 HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
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c.-102-228A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48696298
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T
T
 C
C
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others(2): Show 
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others(2): Show 
HG01109.hp1
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 intron_variant MODIFIER c.-102-96T>C
c.-102-96T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48696430
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A
A
 G
G
 34 a0001c0001t0003g0003
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 40 HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
others(37): Show 
HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
HG01168.hp2
HG01243.hp2
HG01361.hp1
HG01884.hp1
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HG02451.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
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NA18951.hp2
NA18953.hp2
NA18967.hp2
NA18968.hp2
NA18979.hp2
NA18982.hp2
NA18987.hp1
NA18988.hp2
NA18992.hp1
NA19070.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-102-37A>G
c.-102-37A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 3/4 chr13 48696489
chr13:48696667
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0011g0088
a0001c0001t0011g0088
 1 HG02886.hp1
HG02886.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+41G>A
c.-2+41G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696667
chr13:48696686
G
G
 A
A
 5 a0004c0005t0007g0097
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others(2): Show 
a0004c0005t0007g0097
a0004c0005t0007g0099
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 5 HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG03516.hp1
others(2): Show 
HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG03516.hp1
NA19043.hp2
NA20129.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+60G>A
c.-2+60G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696686
chr13:48696694
G
G
 A
A
 9 a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
others(6): Show 
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0087
a0002c0002t0005g0194
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 10 HG01192.hp2
HG01884.hp2
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others(7): Show 
HG01192.hp2
HG01884.hp2
HG02055.hp1
HG02965.hp2
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NA20300.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+68G>A
c.-2+68G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696694
chr13:48696823
G
G
 A
A
 1 a0001c0007t0001g0217
a0001c0007t0001g0217
 1 HG02735.hp1
HG02735.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+197G>A
c.-2+197G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696823
chr13:48696845
C
C
 T
T
 7 a0001c0001t0001g0243
a0001c0004t0005g0129
a0001c0004t0005g0184
others(4): Show 
a0001c0001t0001g0243
a0001c0004t0005g0129
a0001c0004t0005g0184
a0001c0004t0005g0185
a0001c0004t0005g0186
a0001c0004t0005g0197
a0001c0004t0005g0233
 7 HG00733.hp2
HG01243.hp1
HG01496.hp1
others(4): Show 
HG00733.hp2
HG01243.hp1
HG01496.hp1
HG01496.hp2
HG01975.hp2
HG03139.hp2
NA19240.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+219C>T
c.-2+219C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696845
chr13:48696848
A
A
 G
G
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+222A>G
c.-2+222A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696848
chr13:48696851
TGGCTCGG
others(14): Show 
TGGCTCGGAGGGTCCCACGCCC
 T
T
 3 a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
 3 HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+247_-2+267delGG
others(19): Show 
c.-2+247_-2+267delGGCTCGGAGGGTCCCACGCCC
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48696851
chr13:48696857
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0155
a0001c0001t0001g0155
 1 HG02165.hp1
HG02165.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+231G>A
c.-2+231G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696857
chr13:48696890
G
G
 T
T
 63 a0001c0001t0002g0001
a0001c0001t0002g0005
a0001c0001t0002g0011
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 72 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00609.hp1
others(69): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00609.hp1
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HG01261.hp2
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HG02683.hp2
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NA18975.hp2
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NA20905.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+264G>T
c.-2+264G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696890
chr13:48696927
G
G
 C
C
 6 a0001c0001t0009g0109
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others(3): Show 
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
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 6 HG02818.hp1
HG03453.hp1
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others(3): Show 
HG02818.hp1
HG03453.hp1
HG03540.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+301G>C
c.-2+301G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696927
chr13:48696974
C
C
 T
T
 3 a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
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a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0096
 3 HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+348C>T
c.-2+348C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48696974
chr13:48697048
A
A
 G
G
 2 a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
 2 HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02615.hp2
HG02965.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+422A>G
c.-2+422A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697048
chr13:48697050
G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0006g0124
a0001c0001t0006g0124
 1 HG00558.hp1
HG00558.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+424G>C
c.-2+424G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697050
chr13:48697176
C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0003g0093
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0093
a0001c0001t0003g0094
 2 HG02257.hp1
HG02451.hp1
HG02257.hp1
HG02451.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+550C>T
c.-2+550C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697176
chr13:48697177
G
G
 A
A
 4 a0001c0001t0012g0081
a0001c0001t0012g0082
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others(1): Show 
a0001c0001t0012g0081
a0001c0001t0012g0082
a0001c0001t0012g0083
a0001c0001t0012g0136
 4 HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
others(1): Show 
HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+551G>A
c.-2+551G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697177
chr13:48697236
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0005g0095
a0001c0001t0005g0095
 1 HG02965.hp1
HG02965.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+610T>A
c.-2+610T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697236
chr13:48697295
A
A
 C
C
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+669A>C
c.-2+669A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697295
chr13:48697342
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0242
a0001c0001t0001g0242
 1 HG03704.hp2
HG03704.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+716G>A
c.-2+716G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697342
chr13:48697345
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0004g0176
a0001c0001t0004g0176
 1 HG00741.hp2
HG00741.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+719G>A
c.-2+719G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697345
chr13:48697399
G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0002g0013
a0001c0001t0002g0084
a0001c0001t0002g0013
a0001c0001t0002g0084
 3 NA18959.hp2
NA19010.hp1
NA19063.hp2
NA18959.hp2
NA19010.hp1
NA19063.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+773G>C
c.-2+773G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697399
chr13:48697470
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0023g0052
a0001c0001t0023g0052
 1 NA20905.hp2
NA20905.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+844A>G
c.-2+844A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697470
chr13:48697511
G
G
 A
A
 42 a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0057
others(39): Show 
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0057
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a0001c0001t0004g0159
a0001c0001t0004g0160
a0001c0001t0004g0170
a0001c0001t0004g0173
a0001c0001t0004g0174
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a0001c0001t0004g0234
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a0001c0001t0006g0120
a0001c0001t0006g0124
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a0001c0001t0006g0211
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0008g0002
a0001c0001t0008g0004
a0001c0001t0008g0142
a0001c0001t0008g0166
a0001c0001t0008g0167
a0001c0001t0008g0278
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
a0010c0014t0004g0123
 51 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
others(48): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00558.hp1
HG00609.hp2
HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01099.hp2
HG01515.hp2
HG01928.hp2
HG01943.hp1
HG01952.hp1
HG01975.hp1
HG01978.hp2
HG02055.hp2
HG02071.hp2
HG02080.hp1
HG02129.hp1
HG02145.hp1
HG02145.hp2
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02602.hp1
HG02630.hp1
HG02647.hp2
HG02818.hp1
HG03017.hp2
HG03209.hp2
HG03453.hp1
HG03540.hp1
HG03927.hp1
HG04115.hp1
NA18939.hp2
NA18950.hp2
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c.-2+885G>A
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A
A
 G
G
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HG03453.hp1
HG03540.hp1
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chr13:48697582
A
A
 T
T
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HG02723.hp2
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c.-2+956A>T
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C
C
 T
T
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a0001c0001t0001g0265
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HG01993.hp1
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c.-2+973C>T
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C
C
 T
T
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a0012c0010t0022g0029
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G
G
 C
C
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NA18988.hp2
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c.-2+1015G>C
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chr13:48697655
C
C
 T
T
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c.-2+1029C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697655
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G
G
 A
A
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-2+1030G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697656
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A
A
 G
G
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HG02572.hp2
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HG03516.hp1
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CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697710
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A
A
 C
C
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NA18948.hp2
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c.-2+1148A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697774
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G
G
 A
A
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a0001c0001t0002g0031
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HG03017.hp1
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c.-2+1368G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48697994
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T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0111
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NA20300.hp2
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c.-2+1425T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698051
chr13:48698053
C
C
 G
G
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others(1): Show 
a0002c0002t0005g0021
a0002c0002t0005g0194
a0002c0002t0005g0195
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HG01192.hp2
HG02055.hp1
HG03098.hp1
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NA20300.hp1
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c.-2+1427C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698053
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T
T
 C
C
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HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG03195.hp1
HG03516.hp2
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c.-2+1470T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698096
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G
G
 A
A
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HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG03516.hp1
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c.-2+1507G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698133
chr13:48698146
A
A
 C
C
 1 a0005c0008t0007g0098
a0005c0008t0007g0098
 1 NA19043.hp2
NA19043.hp2
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c.-2+1520A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698146
chr13:48698201
C
C
 T
T
 2 a0001c0001t0001g0260
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a0001c0001t0001g0260
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NA18947.hp1
NA18940.hp1
NA18947.hp1
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c.-2+1575C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698201
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T
T
 A
A
 3 a0001c0001t0005g0092
a0001c0001t0005g0095
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a0001c0001t0005g0092
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HG02965.hp1
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HG02615.hp2
HG02965.hp1
HG02970.hp2
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c.-2+1591T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698217
chr13:48698229
C
C
 T
T
 5 a0001c0001t0011g0033
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others(2): Show 
a0001c0001t0011g0033
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others(2): Show 
HG01109.hp1
HG02451.hp2
HG02886.hp1
HG03195.hp1
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c.-2+1603C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698229
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A
A
 T
T
 6 a0003c0003t0007g0016
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 7 HG02896.hp1
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HG02896.hp1
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HG03486.hp1
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c.-2+1662A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698288
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C
C
 T
T
 5 a0001c0001t0011g0033
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a0001c0001t0011g0033
a0001c0001t0011g0088
a0001c0001t0011g0156
a0001c0001t0011g0157
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others(2): Show 
HG01109.hp1
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HG02886.hp1
HG03195.hp1
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CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698304
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T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0017g0252
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 1 NA19090.hp1
NA19090.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+1683T>C
c.-2+1683T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698309
chr13:48698311
A
A
 C
C
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HG03540.hp1
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T
 C
C
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A
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G
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T
 C
C
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G
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C
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T
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A
 G
G
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c.-2+1992A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698618
chr13:48698620
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+1994G>A
c.-2+1994G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698620
chr13:48698635
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0203
a0001c0001t0001g0203
 1 HG02071.hp1
HG02071.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+2009A>G
c.-2+2009A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698635
chr13:48698847
A
A
 G
G
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+2221A>G
c.-2+2221A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48698847
chr13:48699040
C
C
 A
A
 4 a0001c0001t0012g0081
a0001c0001t0012g0082
a0001c0001t0012g0083
others(1): Show 
a0001c0001t0012g0081
a0001c0001t0012g0082
a0001c0001t0012g0083
a0001c0001t0012g0136
 4 HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
others(1): Show 
HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+2414C>A
c.-2+2414C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48699040
chr13:48699144
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+2518G>A
c.-2+2518G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48699144
chr13:48699160
C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0002g0141
a0001c0001t0002g0148
a0001c0001t0002g0149
others(1): Show 
a0001c0001t0002g0141
a0001c0001t0002g0148
a0001c0001t0002g0149
a0001c0001t0002g0168
 4 NA18964.hp1
NA19007.hp2
NA19012.hp2
others(1): Show 
NA18964.hp1
NA19007.hp2
NA19012.hp2
NA19082.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+2534C>T
c.-2+2534C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48699160
chr13:48699378
C
C
 T
T
 11 a0001c0001t0006g0200
a0001c0001t0006g0211
a0001c0001t0006g0212
others(8): Show 
a0001c0001t0006g0200
a0001c0001t0006g0211
a0001c0001t0006g0212
a0001c0001t0006g0213
a0001c0001t0006g0236
a0001c0001t0008g0002
a0001c0001t0008g0004
a0001c0001t0008g0142
a0001c0001t0008g0166
a0001c0001t0008g0167
a0001c0001t0008g0278
 17 HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp2
others(14): Show 
HG00408.hp1
HG00438.hp2
HG00609.hp2
HG01099.hp2
HG01515.hp2
HG01943.hp1
HG02055.hp2
HG02071.hp2
HG02080.hp1
HG02129.hp1
NA18950.hp2
NA18967.hp1
NA18968.hp1
NA18993.hp2
NA19009.hp1
NA19082.hp1
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+2752C>T
c.-2+2752C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48699378
chr13:48699631
A
A
 C
C
 1 a0001c0004t0005g0184
a0001c0004t0005g0184
 1 HG01975.hp2
HG01975.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+3005A>C
c.-2+3005A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48699631
chr13:48699706
T
T
 TA
TA
 34 a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0015
others(31): Show 
a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0015
a0001c0001t0003g0017
a0001c0001t0003g0037
a0001c0001t0003g0043
a0001c0001t0003g0070
a0001c0001t0003g0071
a0001c0001t0003g0093
a0001c0001t0003g0094
a0001c0001t0003g0101
a0001c0001t0003g0102
a0001c0001t0003g0103
a0001c0001t0003g0104
a0001c0001t0003g0105
a0001c0001t0003g0106
a0001c0001t0003g0108
a0001c0001t0003g0130
a0001c0001t0003g0131
a0001c0001t0003g0132
a0001c0001t0003g0133
a0001c0001t0003g0134
a0001c0001t0003g0135
a0001c0001t0003g0137
a0001c0001t0003g0138
a0001c0001t0003g0139
a0001c0001t0003g0140
a0001c0001t0003g0143
a0001c0001t0003g0144
a0001c0001t0003g0145
a0001c0001t0003g0152
a0001c0001t0003g0164
a0001c0001t0003g0180
a0009c0013t0003g0080
 40 HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
others(37): Show 
HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
HG01168.hp2
HG01243.hp2
HG01361.hp1
HG01884.hp1
HG02257.hp1
HG02451.hp1
HG02559.hp2
HG02572.hp1
HG02622.hp2
HG02647.hp1
HG02698.hp1
HG02818.hp2
HG02886.hp2
HG02895.hp1
HG02976.hp2
HG03041.hp2
HG03195.hp2
HG03209.hp1
HG03225.hp2
HG03453.hp2
HG03471.hp2
HG03490.hp1
HG03492.hp2
HG03540.hp2
HG03579.hp1
HG03669.hp2
NA18951.hp2
NA18953.hp2
NA18967.hp2
NA18968.hp2
NA18979.hp2
NA18982.hp2
NA18987.hp1
NA18988.hp2
NA18992.hp1
NA19070.hp1
NA20905.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+3088dupA
c.-2+3088dupA
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48699706
chr13:48699733
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+3107G>A
c.-2+3107G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48699733
chr13:48700014
G
G
 C
C
 2 a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0002g0045
a0001c0001t0002g0026
a0001c0001t0002g0045
 2 HG01257.hp1
NA18942.hp2
HG01257.hp1
NA18942.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+3388G>C
c.-2+3388G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700014
chr13:48700026
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0034
a0001c0001t0001g0034
 1 HG02723.hp1
HG02723.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+3400A>G
c.-2+3400A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700026
chr13:48700061
T
T
 C
C
 3 a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0044
a0001c0001t0002g0056
a0001c0001t0002g0012
a0001c0001t0002g0044
a0001c0001t0002g0056
 4 HG00140.hp2
HG01168.hp1
HG01169.hp1
others(1): Show 
HG00140.hp2
HG01168.hp1
HG01169.hp1
HG01993.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+3435T>C
c.-2+3435T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700061
chr13:48700208
C
C
 CAAA
CAAA
 17 a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
others(14): Show 
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
a0003c0003t0007g0016
a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
a0003c0003t0007g0117
a0003c0003t0007g0118
a0003c0003t0007g0125
a0004c0005t0007g0097
a0004c0005t0007g0099
a0004c0005t0007g0121
a0005c0008t0007g0098
a0005c0008t0007g0100
 18 HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG02818.hp1
others(15): Show 
HG02572.hp2
HG02723.hp2
HG02818.hp1
HG02896.hp1
HG02897.hp1
HG02970.hp1
HG03098.hp2
HG03130.hp1
HG03453.hp1
HG03471.hp1
HG03486.hp1
HG03516.hp1
HG03540.hp1
NA19030.hp1
NA19043.hp1
NA19043.hp2
NA20129.hp1
NA20300.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+3583_-2+3584ins
others(3): Show 
c.-2+3583_-2+3584insAAA
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48700208
chr13:48700218
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0002g0056
a0001c0001t0002g0056
 1 HG00140.hp2
HG00140.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+3592A>G
c.-2+3592A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700218
chr13:48700322
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0103
a0001c0001t0003g0103
 1 HG02895.hp1
HG02895.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+3696C>T
c.-2+3696C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700322
chr13:48700375
C
C
 A
A
 2 a0001c0001t0003g0105
a0001c0001t0003g0106
a0001c0001t0003g0105
a0001c0001t0003g0106
 2 HG02622.hp2
HG03225.hp2
HG02622.hp2
HG03225.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+3749C>A
c.-2+3749C>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700375
chr13:48700470
C
C
 T
T
 1 a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0069
 1 NA19063.hp1
NA19063.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+3844C>T
c.-2+3844C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700470
chr13:48700563
C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0250
a0001c0001t0001g0250
 1 NA18984.hp1
NA18984.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+3937C>G
c.-2+3937C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700563
chr13:48700665
A
A
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0147
a0001c0001t0002g0147
 1 NA19010.hp2
NA19010.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+4039A>C
c.-2+4039A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700665
chr13:48700718
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0015g0077
a0001c0001t0015g0077
 1 NA18988.hp1
NA18988.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+4092A>G
c.-2+4092A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700718
chr13:48700843
G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0002g0032
a0001c0001t0002g0032
 1 HG04199.hp1
HG04199.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+4217G>C
c.-2+4217G>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700843
chr13:48700900
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0008g0166
a0001c0001t0008g0166
 1 NA19082.hp1
NA19082.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-2+4274T>C
c.-2+4274T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700900
chr13:48700961
G
G
 A
A
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-2+4335G>A
c.-2+4335G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48700961
chr13:48701189
G
G
 A
A
 17 a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0057
others(14): Show 
a0001c0001t0004g0006
a0001c0001t0004g0019
a0001c0001t0004g0057
a0001c0001t0004g0065
a0001c0001t0004g0068
a0001c0001t0004g0085
a0001c0001t0004g0159
a0001c0001t0004g0160
a0001c0001t0004g0170
a0001c0001t0004g0173
a0001c0001t0004g0174
a0001c0001t0004g0175
a0001c0001t0004g0176
a0001c0001t0004g0177
a0001c0001t0004g0234
a0001c0001t0004g0235
a0012c0010t0022g0029
 20 HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
others(17): Show 
HG00741.hp2
HG01074.hp1
HG01081.hp2
HG01099.hp1
HG01928.hp2
HG01952.hp1
HG01975.hp1
HG01978.hp2
HG02293.hp1
HG02300.hp1
HG02602.hp1
HG03017.hp2
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NA19075.hp1
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c.-2+4563G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701189
chr13:48701234
A
A
 G
G
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a0001c0001t0009g0110
a0001c0001t0009g0111
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HG01884.hp2
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c.-2+4608A>G
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CT
CT
 C
C
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HG01069.hp2
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c.-2+4643delT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701268
chr13:48701382
A
A
 G
G
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a0012c0010t0022g0029
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HG04228.hp2
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c.-2+4756A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701382
chr13:48701404
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0021g0025
a0001c0001t0021g0025
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
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c.-2+4778T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701404
chr13:48701600
G
G
 T
T
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 4 NA18943.hp1
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NA18943.hp1
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c.-2+4974G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701600
chr13:48701619
T
T
 C
C
 1 a0002c0002t0016g0079
a0002c0002t0016g0079
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HG01109.hp2
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c.-2+4993T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701619
chr13:48701686
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0002g0048
a0001c0001t0002g0048
 1 NA18960.hp2
NA18960.hp2
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c.-2+5060G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701686
chr13:48701707
T
T
 C
C
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others(2): Show 
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HG02886.hp1
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c.-2+5081T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701707
chr13:48701742
A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0003g0134
a0001c0001t0003g0134
 1 NA20905.hp1
NA20905.hp1
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c.-1-5075A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701742
chr13:48701767
A
A
 G
G
 65 a0001c0001t0002g0001
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others(62): Show 
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 74 HG00140.hp1
HG00140.hp2
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others(71): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00609.hp1
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NA18960.hp1
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NA18985.hp1
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NA18995.hp2
NA18999.hp2
NA19001.hp1
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NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-1-5050A>G
c.-1-5050A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701767
chr13:48701804
C
C
 G
G
 1 a0001c0001t0001g0263
a0001c0001t0001g0263
 1 NA18982.hp1
NA18982.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-5013C>G
c.-1-5013C>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701804
chr13:48701828
T
T
 A
A
 1 a0001c0001t0021g0025
a0001c0001t0021g0025
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-4989T>A
c.-1-4989T>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701828
chr13:48701915
A
A
 G
G
 1 a0001c0001t0021g0025
a0001c0001t0021g0025
 1 HG02809.hp1
HG02809.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-4902A>G
c.-1-4902A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701915
chr13:48701961
C
C
 T
T
 4 a0001c0001t0012g0081
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others(1): Show 
a0001c0001t0012g0081
a0001c0001t0012g0082
a0001c0001t0012g0083
a0001c0001t0012g0136
 4 HG02257.hp2
HG02622.hp1
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others(1): Show 
HG02257.hp2
HG02622.hp1
HG02896.hp2
HG03486.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-1-4856C>T
c.-1-4856C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48701961
chr13:48702064
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0011g0088
a0001c0001t0011g0088
 1 HG02886.hp1
HG02886.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-4753T>C
c.-1-4753T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48702064
chr13:48702192
T
T
 C
C
 1 a0002c0002t0016g0079
a0002c0002t0016g0079
 1 HG01109.hp2
HG01109.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-1-4625T>C
c.-1-4625T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48702192
chr13:48702252
G
G
 A
A
 1 a0001c0001t0001g0266
a0001c0001t0001g0266
 1 HG04228.hp1
HG04228.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-4565G>A
c.-1-4565G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48702252
chr13:48702254
C
C
 T
T
 1 a0001c0004t0005g0186
a0001c0004t0005g0186
 1 HG01496.hp1
HG01496.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-4563C>T
c.-1-4563C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48702254
chr13:48702265
T
T
 TG
TG
 20 a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0269
others(17): Show 
a0001c0001t0001g0225
a0001c0001t0001g0243
a0001c0001t0001g0269
a0001c0001t0001g0274
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a0001c0001t0004g0159
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a0001c0001t0006g0236
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 20 HG00140.hp1
HG00642.hp1
HG01496.hp2
others(17): Show 
HG00140.hp1
HG00642.hp1
HG01496.hp2
HG02293.hp1
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NA18959.hp2
NA18961.hp1
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NA18967.hp1
NA18979.hp2
NA18985.hp1
NA18991.hp1
NA19005.hp2
NA19063.hp1
NA19075.hp1
NA20752.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-4546dupG
c.-1-4546dupG
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48702265
chr13:48702273
G
G
 C
C
 1 a0001c0001t0005g0158
a0001c0001t0005g0158
 1 NA19030.hp2
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C
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A
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G
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A
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A
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C
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T
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C
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CTTA
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A
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T
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HG04115.hp2
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A
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HG02683.hp2
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G
G
 A
A
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NA18960.hp1
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G
 GTTAATTC
others(308): Show 
GTTAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCCGGACTGCGG
ACTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCTTCCCGGGTTCA
CGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTG
CCACCGCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCAC
CTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGATCCACCCGCCT
CGGCCTCCCAAAGTGC
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CAGGCGCCTGCCACCGCGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGAC
GGGGTTTCACCTTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCATGAT
CCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTTAATTCTT
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 G
G
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A
A
 C
C
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T
T
 C
C
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a0001c0001t0009g0214
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A
A
 G
G
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c.-1-2502A>G
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C
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A
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HG01993.hp1
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C
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T
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CT
 C
C
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a0001c0001t0002g0054
a0001c0001t0004g0173
a0001c0004t0005g0129
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c.-1-2290delT
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chr13:48704747
G
G
 A
A
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HG01071.hp2
HG01081.hp1
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HG02897.hp2
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c.-1-2070G>A
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G
G
 GT
GT
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a0001c0004t0005g0186
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HG00733.hp2
HG01243.hp1
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c.-1-1946dupT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48704868
chr13:48705110
C
C
 T
T
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a0003c0003t0007g0115
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HG02572.hp2
HG02723.hp2
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c.-1-1707C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705110
chr13:48705335
A
A
 G
G
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a0001c0004t0005g0184
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HG01975.hp2
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c.-1-1482A>G
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705335
chr13:48705385
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0020
a0001c0001t0001g0020
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NA19012.hp1
NA19007.hp1
NA19012.hp1
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c.-1-1432T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705385
chr13:48705400
T
T
 C
C
 1 a0001c0001t0001g0224
a0001c0001t0001g0224
 1 NA18984.hp2
NA18984.hp2
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c.-1-1417T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705400
chr13:48705494
G
G
 T
T
 1 a0001c0001t0001g0216
a0001c0001t0001g0216
 1 HG01257.hp2
HG01257.hp2
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c.-1-1323G>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705494
chr13:48705598
A
A
 C
C
 55 a0001c0001t0001g0206
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others(52): Show 
a0001c0001t0001g0206
a0001c0001t0003g0003
a0001c0001t0003g0014
a0001c0001t0003g0015
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a0001c0001t0003g0103
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a0001c0001t0003g0130
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a0001c0001t0003g0133
a0001c0001t0003g0134
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a0001c0001t0003g0137
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a0001c0001t0003g0143
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a0001c0001t0006g0178
a0001c0001t0006g0179
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a0001c0001t0009g0110
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a0001c0001t0009g0187
a0001c0001t0009g0214
a0001c0001t0009g0257
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a0003c0003t0007g0115
a0003c0003t0007g0116
a0003c0003t0007g0117
a0003c0003t0007g0118
a0003c0003t0007g0125
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a0004c0005t0007g0099
a0004c0005t0007g0121
a0005c0008t0007g0098
a0005c0008t0007g0100
a0009c0013t0003g0080
 61 HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
others(58): Show 
HG00673.hp1
HG00738.hp1
HG01074.hp2
HG01168.hp2
HG01243.hp2
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HG01884.hp1
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HG02896.hp1
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NA18987.hp1
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NA18992.hp1
NA19030.hp1
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NA19043.hp2
NA19070.hp1
NA20129.hp1
NA20300.hp2
NA20905.hp1
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c.-1-1219A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705598
chr13:48705695
A
A
 T
T
 1 a0001c0001t0006g0027
a0001c0001t0006g0027
 1 HG03927.hp1
HG03927.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-1122A>T
c.-1-1122A>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705695
chr13:48705806
G
G
 A
A
 1 a0003c0003t0007g0117
a0003c0003t0007g0117
 1 HG03486.hp1
HG03486.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-1011G>A
c.-1-1011G>A
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705806
chr13:48705867
C
C
 T
T
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-1-950C>T
c.-1-950C>T
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48705867
chr13:48705996
G
G
 GT
GT
 66 a0001c0001t0002g0001
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a0001c0001t0002g0011
others(63): Show 
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a0001c0001t0002g0005
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a0001c0001t0002g0054
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a0001c0001t0002g0060
a0001c0001t0002g0061
a0001c0001t0002g0062
a0001c0001t0002g0063
a0001c0001t0002g0064
a0001c0001t0002g0069
a0001c0001t0002g0073
a0001c0001t0002g0074
a0001c0001t0002g0076
a0001c0001t0002g0084
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a0001c0001t0002g0146
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a0001c0001t0002g0148
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a0001c0001t0002g0150
a0001c0001t0002g0151
a0001c0001t0002g0153
a0001c0001t0002g0154
a0001c0001t0002g0168
a0001c0001t0002g0169
a0001c0001t0002g0171
a0001c0001t0002g0172
a0001c0001t0002g0227
a0001c0001t0002g0248
a0001c0001t0002g0249
a0001c0001t0002g0275
a0001c0001t0003g0131
a0001c0001t0003g0144
a0001c0001t0015g0011
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a0001c0001t0027g0072
 75 HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00609.hp1
others(72): Show 
HG00140.hp1
HG00140.hp2
HG00609.hp1
HG00621.hp1
HG00642.hp1
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HG00741.hp1
HG01081.hp1
HG01168.hp1
HG01169.hp1
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HG01257.hp1
HG01261.hp1
HG01261.hp2
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HG01952.hp2
HG01993.hp2
HG02015.hp2
HG02056.hp2
HG02074.hp2
HG02080.hp2
HG02300.hp2
HG02602.hp2
HG02683.hp2
HG02738.hp1
HG03491.hp2
HG03492.hp1
HG03540.hp2
HG03669.hp1
HG04115.hp2
HG04199.hp1
HG04204.hp1
NA18939.hp1
NA18940.hp2
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NA18943.hp1
NA18944.hp1
NA18948.hp1
NA18948.hp2
NA18955.hp1
NA18959.hp2
NA18960.hp1
NA18960.hp2
NA18961.hp2
NA18962.hp1
NA18964.hp1
NA18974.hp2
NA18975.hp1
NA18975.hp2
NA18980.hp2
NA18985.hp1
NA18988.hp1
NA18989.hp1
NA18992.hp1
NA18995.hp2
NA18999.hp2
NA19001.hp1
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NA19005.hp2
NA19006.hp2
NA19007.hp2
NA19010.hp1
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NA19012.hp2
NA19063.hp1
NA19063.hp2
NA19065.hp1
NA19075.hp2
NA19082.hp2
NA19086.hp2
NA19090.hp2
NA20905.hp2
NA21309.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-1-819dupT
c.-1-819dupT
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 INFO_REALIGN_3_PRIME chr13 48705996
chr13:48705998
TG
TG
 T
T
 20 a0001c0001t0003g0132
a0001c0001t0003g0180
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others(17): Show 
a0001c0001t0003g0132
a0001c0001t0003g0180
a0001c0001t0009g0109
a0001c0001t0009g0110
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G
G
 A
A
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c.-1-671G>A
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T
T
 C
C
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T
T
 C
C
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homoSapiens_chm13v2.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-579T>C
c.-1-579T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48706238
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A
 C
C
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a0012c0010t0022g0029
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c.-1-530A>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48706287
chr13:48706322
T
T
 C
C
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a0001c0001t0001g0266
 1 HG04228.hp1
HG04228.hp1
 intron_variant MODIFIER c.-1-495T>C
c.-1-495T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48706322
chr13:48706411
T
T
 C
C
 1 a0012c0010t0022g0029
a0012c0010t0022g0029
 1 HG04228.hp2
HG04228.hp2
 intron_variant MODIFIER c.-1-406T>C
c.-1-406T>C
CYSLTR2 ENSG00000152207.8 transcript ENST00000682523.1 protein_coding 4/4 chr13 48706411

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