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chr1:63415951	T T	C C	2	a0001c0003 a0001c0004 a0001c0003 a0001c0004	15	HG01192.hp1 HG01891.hp2 HG02280.hp2 others(12): Show HG01192.hp1 HG01891.hp2 HG02280.hp2 HG02615.hp1 HG02622.hp2 HG02647.hp1 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02965.hp1 HG03195.hp2 HG03579.hp2 HG06807.hp1 NA18522.hp2 NA19043.hp2 NA20300.hp2	synonymous_variant	LOW	c.981T>C c.981T>C	p.Phe327Phe p.Phe327Phe	ALG6	ENSG00000088035.18	transcript	ENST00000263440.6	protein_coding	11/15	1249/3325	981/1524	327/507	chr1	63415951
chr1:63436948	C C	T T	1	a0001c0007 a0001c0007	1	NA18966.hp1 NA18966.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1452C>T c.1452C>T	p.Phe484Phe p.Phe484Phe	ALG6	ENSG00000088035.18	transcript	ENST00000263440.6	protein_coding	15/15	1720/3325	1452/1524	484/507	chr1	63436948

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chr1:63367684	C C	G G	1	a0001c0001t0013 a0001c0001t0013	1	NA18997.hp1 NA18997.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-211C>G c.-211C>G	ALG6	ENSG00000088035.18	transcript	ENST00000263440.6	protein_coding	1/15	3294		chr1	63367684
chr1:63370842	C C	G G	11	a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 others(8): Show a0001c0001t0003 a0001c0001t0005 a0001c0001t0007 a0001c0001t0011 a0001c0001t0013 a0001c0001t0019 a0001c0003t0009 a0002c0002t0005 a0003c0005t0003 a0004c0008t0003 a0006c0009t0020	102	HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00558.hp1 others(99): Show HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00558.hp1 HG00733.hp1 HG00741.hp2 HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01074.hp1 HG01081.hp2 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01175.hp1 HG01192.hp1 HG01243.hp1 HG01256.hp2 HG01358.hp2 HG01884.hp1 HG01934.hp2 HG01978.hp2 HG01981.hp2 HG02015.hp2 HG02071.hp2 HG02145.hp1 HG02257.hp1 HG02293.hp2 HG02300.hp2 HG02451.hp2 HG02523.hp2 HG02559.hp1 HG02559.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02698.hp1 HG02738.hp2 HG02896.hp1 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02970.hp2 HG03098.hp2 HG03139.hp2 HG03209.hp1 HG03453.hp1 HG03453.hp2 HG03486.hp2 HG03491.hp1 HG03491.hp2 HG03492.hp2 HG03516.hp1 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG03704.hp2 HG03831.hp1 HG03834.hp1 HG03942.hp1 HG03942.hp2 HG04115.hp1 HG04199.hp1 HG04228.hp2 HG06807.hp2 NA18747.hp1 NA18747.hp2 NA18939.hp2 NA18940.hp1 NA18941.hp2 NA18947.hp1 NA18951.hp1 NA18952.hp2 NA18957.hp2 NA18959.hp2 NA18963.hp2 NA18964.hp2 NA18966.hp2 NA18969.hp1 NA18971.hp2 NA18973.hp1 NA18979.hp2 NA18980.hp1 NA18980.hp2 NA18981.hp2 NA18983.hp2 NA18990.hp2 NA18991.hp1 NA18995.hp2 NA18997.hp1 NA19002.hp1 NA19007.hp1 NA19056.hp2 NA19057.hp2 NA19059.hp2 NA19063.hp1 NA19065.hp2 NA19077.hp2 NA19078.hp2 NA19079.hp2 NA19080.hp2 NA19086.hp2 NA19090.hp2 NA19091.hp2 NA20300.hp2 NA20805.hp2	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-136C>G c.-136C>G	ALG6	ENSG00000088035.18	transcript	ENST00000263440.6	protein_coding	2/15			chr1	63370842
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chr1:63437195	G G	T T	1	a0001c0001t0018 a0001c0001t0018	1	NA18956.hp1 NA18956.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.175G>T c.175G>T	ALG6	ENSG00000088035.18	transcript	ENST00000263440.6	protein_coding	15/15	175		chr1	63437195
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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer ALG6_chr1_63362627_63443553

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) ALG6_chr1_63362627_63443553

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 6)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 9)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 20)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 380)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 9)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 28)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 382)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 388)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 5)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 17)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1096)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)