Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr9:6256292	G G	A A	12	a0001c0002t0002 a0001c0002t0004 a0001c0002t0006 others(9): Show a0001c0002t0002 a0001c0002t0004 a0001c0002t0006 a0001c0002t0010 a0001c0002t0011 a0001c0002t0012 a0001c0002t0013 a0001c0002t0014 a0001c0002t0015 a0001c0006t0002 a0002c0003t0006 a0004c0005t0002	155	HG00280.hp1 HG00323.hp2 HG00423.hp1 others(152): Show HG00280.hp1 HG00323.hp2 HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00621.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp1 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01099.hp1 HG01123.hp2 HG01168.hp2 HG01169.hp2 HG01243.hp1 HG01255.hp1 HG01256.hp2 HG01261.hp1 HG01496.hp2 HG01884.hp1 HG01928.hp2 HG01934.hp1 HG01934.hp2 HG01943.hp1 HG01952.hp1 HG01975.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG01993.hp2 HG02015.hp1 HG02027.hp2 HG02055.hp2 HG02080.hp1 HG02080.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp2 HG02132.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02148.hp2 HG02165.hp2 HG02257.hp2 HG02258.hp1 HG02273.hp1 HG02273.hp2 HG02293.hp1 HG02300.hp1 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02523.hp1 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02602.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp2 HG02698.hp1 HG02723.hp2 HG02735.hp2 HG02818.hp2 HG02886.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp1 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02976.hp1 HG03195.hp1 HG03195.hp2 HG03225.hp1 HG03239.hp2 HG03453.hp1 HG03490.hp1 HG03490.hp2 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03492.hp2 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG03654.hp2 HG03704.hp2 HG03710.hp2 HG03831.hp1 HG03834.hp2 NA18747.hp2 NA18906.hp1 NA18942.hp1 NA18944.hp2 NA18950.hp2 NA18951.hp1 NA18951.hp2 NA18954.hp1 NA18955.hp1 NA18957.hp1 NA18957.hp2 NA18961.hp1 NA18961.hp2 NA18969.hp1 NA18970.hp2 NA18972.hp1 NA18976.hp1 NA18977.hp1 NA18979.hp1 NA18982.hp2 NA18984.hp2 NA18988.hp1 NA18990.hp1 NA18990.hp2 NA18991.hp1 NA18991.hp2 NA18992.hp1 NA18992.hp2 NA18993.hp1 NA18994.hp2 NA18995.hp2 NA18997.hp2 NA18998.hp1 NA18998.hp2 NA19000.hp1 NA19004.hp2 NA19007.hp1 NA19009.hp2 NA19011.hp2 NA19012.hp1 NA19030.hp1 NA19056.hp2 NA19060.hp1 NA19062.hp1 NA19063.hp1 NA19063.hp2 NA19064.hp2 NA19065.hp1 NA19068.hp1 NA19070.hp2 NA19072.hp2 NA19077.hp2 NA19081.hp2 NA19085.hp1 NA19090.hp1 NA19090.hp2 NA19091.hp2 NA19240.hp1 NA20129.hp2 NA20300.hp2 NA20752.hp1 NA20805.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.124G>A c.124G>A	IL33	ENSG00000137033.12	transcript	ENST00000682010.1	protein_coding	8/8	124		chr9	6256292
chr9:6256300	T T	C C	1	a0001c0001t0009 a0001c0001t0009	3	HG00741.hp2 HG03130.hp1 HG03516.hp2 HG00741.hp2 HG03130.hp1 HG03516.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.132T>C c.132T>C	IL33	ENSG00000137033.12	transcript	ENST00000682010.1	protein_coding	8/8	132		chr9	6256300
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JoGo Online Haplotype Explorer IL33_chr9_6210807_6262983

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 4)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 7)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 16)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 334)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 7)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 22)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 335)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 362)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 18)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 558)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)