Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr19:3926132	C C	A A	1	a0001c0002t0009 a0001c0002t0009	3	HG02622.hp1 HG02809.hp2 HG03225.hp1 HG02622.hp1 HG02809.hp2 HG03225.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1540C>A c.1540C>A	ATCAY	ENSG00000167654.18	transcript	ENST00000450849.7	protein_coding	13/13	1540		chr19	3926132
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🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 8)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 47)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 384)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 8)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 53)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 384)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 384)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 53)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 967)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)