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chr1:1085966	A A	G G	4	a0001c0002 a0001c0005 a0002c0003 others(1): Show a0001c0002 a0001c0005 a0002c0003 a0005c0007	58	HG00140.hp2 HG00323.hp1 HG00609.hp2 others(55): Show HG00140.hp2 HG00323.hp1 HG00609.hp2 HG00741.hp1 HG01070.hp1 HG01099.hp1 HG01123.hp2 HG01433.hp2 HG01515.hp1 HG01516.hp2 HG01952.hp2 HG01978.hp1 HG02027.hp2 HG02055.hp1 HG02083.hp1 HG02145.hp2 HG02155.hp1 HG02280.hp2 HG02523.hp1 HG02602.hp2 HG02615.hp1 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG02818.hp2 HG02896.hp1 HG02897.hp2 HG02965.hp1 HG02976.hp2 HG03041.hp1 HG03098.hp2 HG03139.hp1 HG03209.hp1 HG03486.hp1 HG03490.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03579.hp1 HG03669.hp1 HG03688.hp2 HG03831.hp2 NA18944.hp2 NA18947.hp2 NA18951.hp1 NA18954.hp1 NA18975.hp2 NA18978.hp1 NA18980.hp1 NA18986.hp2 NA18994.hp1 NA18999.hp1 NA19005.hp2 NA19068.hp2 NA19077.hp2 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20752.hp1 NA20752.hp2 NA20905.hp2	synonymous_variant	LOW	c.357T>C c.357T>C	p.Ile119Ile p.Ile119Ile	C1orf159	ENSG00000131591.18	transcript	ENST00000421241.7	protein_coding	7/10	522/1832	357/597	119/198	chr1	1085966
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chr1:1115811	C C	A A	1	a0001c0002t0002g0311 a0001c0002t0002g0311	1	NA20905.hp2 NA20905.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.-136+249G>T c.-136+249G>T	C1orf159	ENSG00000131591.18	transcript	ENST00000421241.7	protein_coding	1/9	chr1	1115811
chr1:1115869	A A	C C	2	a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0012 a0001c0001t0003g0011 a0001c0001t0003g0012	2	HG02257.hp2 HG02451.hp1 HG02257.hp2 HG02451.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-136+191T>G c.-136+191T>G	C1orf159	ENSG00000131591.18	transcript	ENST00000421241.7	protein_coding	1/9	chr1	1115869
chr1:1115955	C C	T T	1	a0001c0001t0001g0010 a0001c0001t0001g0010	1	HG02922.hp2 HG02922.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.-136+105G>A c.-136+105G>A	C1orf159	ENSG00000131591.18	transcript	ENST00000421241.7	protein_coding	1/9	chr1	1115955
chr1:1115961	T T	C C	1	a0001c0001t0002g0312 a0001c0001t0002g0312	1	HG03209.hp2 HG03209.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.-136+99A>G c.-136+99A>G	C1orf159	ENSG00000131591.18	transcript	ENST00000421241.7	protein_coding	1/9	chr1	1115961
chr1:1115980	C C	T T	1	a0001c0002t0004g0009 a0001c0002t0004g0009	1	HG03041.hp1 HG03041.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-136+80G>A c.-136+80G>A	C1orf159	ENSG00000131591.18	transcript	ENST00000421241.7	protein_coding	1/9	chr1	1115980

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JoGo Online Haplotype Explorer C1orf159_chr1_1076823_1121089

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 6)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 9)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 21)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 313)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 9)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 31)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 313)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 326)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 5)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 16)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 736)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)