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Degron Viewer Pfam Viewer DeepTMHMM Viewer

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chr11:11942530	G G	A A	1	a0004 a0004	3	NA18964.hp2 NA19070.hp2 NA19079.hp2 NA18964.hp2 NA19070.hp2 NA19079.hp2	missense_variant	MODERATE	c.2509G>A c.2509G>A	p.Glu837Lys p.Glu837Lys	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	20/28	2723/9994	2509/4068	837/1355	chr11	11942530

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chr11:11880272	A A	G G	1	a0001c0017 a0001c0017	1	HG03516.hp1 HG03516.hp1	synonymous_variant	LOW	c.135A>G c.135A>G	p.Pro45Pro p.Pro45Pro	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	2/28	349/9994	135/4068	45/1355	chr11	11880272
chr11:11902790	A A	G G	1	a0001c0010 a0001c0010	2	NA18983.hp1 NA19056.hp1 NA18983.hp1 NA19056.hp1	synonymous_variant	LOW	c.669A>G c.669A>G	p.Leu223Leu p.Leu223Leu	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	6/28	883/9994	669/4068	223/1355	chr11	11902790
chr11:11920218	T T	C C	2	a0001c0006 a0002c0011 a0001c0006 a0002c0011	7	HG00280.hp1 HG00639.hp1 HG01109.hp2 others(4): Show HG00280.hp1 HG00639.hp1 HG01109.hp2 HG01168.hp1 HG01169.hp2 HG03491.hp1 HG03942.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1032T>C c.1032T>C	p.Cys344Cys p.Cys344Cys	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	9/28	1246/9994	1032/4068	344/1355	chr11	11920218
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chr11:11841979	G G	T T	6	a0001c0004t0005 a0001c0004t0006 a0001c0004t0049 others(3): Show a0001c0004t0005 a0001c0004t0006 a0001c0004t0049 a0001c0015t0005 a0002c0003t0048 a0006c0016t0005	51	HG00099.hp2 HG00597.hp2 HG00609.hp2 others(48): Show HG00099.hp2 HG00597.hp2 HG00609.hp2 HG00642.hp2 HG00735.hp1 HG00741.hp2 HG01074.hp1 HG01081.hp1 HG01099.hp2 HG01175.hp2 HG01361.hp2 HG02027.hp2 HG02071.hp1 HG02083.hp1 HG02155.hp2 HG02622.hp1 HG03654.hp1 HG03834.hp2 HG03927.hp1 HG04199.hp1 NA18941.hp1 NA18942.hp1 NA18943.hp1 NA18947.hp1 NA18953.hp1 NA18954.hp2 NA18960.hp2 NA18961.hp2 NA18964.hp1 NA18971.hp1 NA18973.hp1 NA18979.hp2 NA18984.hp1 NA18986.hp2 NA18990.hp2 NA18994.hp1 NA18995.hp2 NA19004.hp1 NA19005.hp1 NA19012.hp2 NA19060.hp2 NA19076.hp2 NA19080.hp1 NA19081.hp2 NA19082.hp2 NA19083.hp2 NA19085.hp1 NA19087.hp2 NA19088.hp2 NA19091.hp2 NA20752.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-207G>T c.-207G>T	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	1/28	207		chr11	11841979
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chr11:11956328	C C	T T	1	a0001c0001t0047 a0001c0001t0047	1	HG01934.hp2 HG01934.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.153C>T c.153C>T	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	28/28	153		chr11	11956328
chr11:11956351	C C	T T	1	a0001c0001t0046 a0001c0001t0046	1	HG03453.hp1 HG03453.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.176C>T c.176C>T	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	28/28	176		chr11	11956351
chr11:11956959	A A	G G	1	a0002c0003t0045 a0002c0003t0045	1	HG02083.hp2 HG02083.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.784A>G c.784A>G	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	28/28	784		chr11	11956959
chr11:11956975	C C	A A	1	a0002c0003t0029 a0002c0003t0029	1	HG03927.hp2 HG03927.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.800C>A c.800C>A	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	28/28	800		chr11	11956975
chr11:11957120	C C	T T	1	a0001c0004t0049 a0001c0004t0049	1	HG02622.hp1 HG02622.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.945C>T c.945C>T	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	28/28	945		chr11	11957120
chr11:11957126	T T	C C	1	a0001c0001t0011 a0001c0001t0011	7	HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02809.hp2 others(4): Show HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02809.hp2 HG02976.hp2 HG03225.hp1 HG03579.hp1 NA18906.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.951T>C c.951T>C	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	28/28	951		chr11	11957126
chr11:11957268	T T	TGA TGA	6	a0001c0004t0005 a0001c0004t0006 a0001c0004t0026 others(3): Show a0001c0004t0005 a0001c0004t0006 a0001c0004t0026 a0001c0004t0049 a0001c0015t0005 a0006c0016t0005	52	HG00099.hp2 HG00597.hp2 HG00609.hp2 others(49): Show HG00099.hp2 HG00597.hp2 HG00609.hp2 HG00642.hp2 HG00735.hp1 HG00741.hp2 HG01074.hp1 HG01081.hp1 HG01099.hp2 HG01175.hp2 HG01361.hp2 HG02027.hp2 HG02071.hp1 HG02083.hp1 HG02155.hp2 HG02622.hp1 HG03654.hp1 HG03834.hp2 HG03927.hp1 HG04199.hp1 NA18941.hp1 NA18942.hp1 NA18943.hp1 NA18947.hp1 NA18949.hp1 NA18953.hp1 NA18954.hp2 NA18961.hp2 NA18963.hp1 NA18964.hp1 NA18971.hp1 NA18973.hp1 NA18979.hp2 NA18984.hp1 NA18986.hp2 NA18990.hp2 NA18994.hp1 NA18995.hp2 NA19004.hp1 NA19005.hp1 NA19012.hp2 NA19060.hp2 NA19076.hp2 NA19080.hp1 NA19081.hp2 NA19082.hp2 NA19083.hp2 NA19085.hp1 NA19087.hp2 NA19088.hp2 NA19091.hp2 NA20752.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1094_1095dupGA c.1094_1095dupGA	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	28/28	1096	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr11	11957268
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chr11:11957381	CAATG CAATG	C C	1	a0001c0001t0011 a0001c0001t0011	7	HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02809.hp2 others(4): Show HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02809.hp2 HG02976.hp2 HG03225.hp1 HG03579.hp1 NA18906.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1209_1212delTGAA c.1209_1212delTGAA	USP47	ENSG00000170242.19	transcript	ENST00000527733.7	protein_coding	28/28	1209	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr11	11957381
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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer USP47_chr11_11836972_11966887

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Translation Multiple Alignment View

ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 6)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 17)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 49)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 376)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 17)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 61)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 378)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 386)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 5)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 8)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 52)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1249)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)