Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr10:6232710	G G	C C	1	a0001c0001t0016g0385 a0001c0001t0016g0385	1	HG02647.hp1 HG02647.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1516-185G>C c.1516-185G>C	PFKFB3	ENSG00000170525.21	transcript	ENST00000379775.9	protein_coding	14/14		chr10	6232710
chr10:6232887	G G	A A	1	a0001c0001t0003g0212 a0001c0001t0003g0212	1	HG00438.hp1 HG00438.hp1	splice_region_variant&intron_variant	LOW	c.1516-8G>A c.1516-8G>A	PFKFB3	ENSG00000170525.21	transcript	ENST00000379775.9	protein_coding	14/14		chr10	6232887

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer PFKFB3_chr10_6197932_6240532

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) PFKFB3_chr10_6197932_6240532

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 12)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 90)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 416)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 12)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 124)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 417)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 432)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 47)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 763)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)