Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr13:78658631	G G	C C	1	a0001c0001t0002g0251 a0001c0001t0002g0251	1	HG02486.hp1 HG02486.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.72+418C>G c.72+418C>G	OBI1	ENSG00000152193.8	transcript	ENST00000282003.7	protein_coding	1/5	chr13	78658631
chr13:78658640	G G	T T	1	a0001c0001t0001g0027 a0001c0001t0001g0027	1	HG03239.hp1 HG03239.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.72+409C>A c.72+409C>A	OBI1	ENSG00000152193.8	transcript	ENST00000282003.7	protein_coding	1/5	chr13	78658640
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JoGo Online Haplotype Explorer OBI1_chr13_78609289_78664155

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 8)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 8)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 7)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 252)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 8)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 14)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 252)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 296)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 7)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 0)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 7)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 476)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)