Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr7:8152562	A A	ACCATCTC others(341): Show ACCATCTCCTTCACCACCACTACCCCCAGCACTACCACCATCACCTCTTC CACCACTACCACCATCTCCTCCACCACCACTACCACCACCACCACCATTA TCTCCTTCATCACCACTACCCCCACCACTACCACCATCACCTCCTCCACC ATCACCACCACCACCACCACCACCATCTCCTTCATCACCACTACCCCCAC CACTATCACCATCACCATCACCTCCACCACCACCACCATCTCCTTCAACA CCACTACCCCCACCACTACCACCATCACCATCACCTCCACCACCACCACC ATCTCCTTCATCACCACTACCCCCACCACTATCACCATCACCATCACCT	1	a0001c0001t0003g0130 a0001c0001t0003g0130	1	HG02922.hp2 HG02922.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.804+4553_804+4554i others(350): Show c.804+4553_804+4554insAGGTGATGGTGATGGTGATAGTGGTGGG GGTAGTGGTGATGAAGGAGATGGTGGTGGTGGTGGAGGTGATGGTGATGG TGGTAGTGGTGGGGGTAGTGGTGTTGAAGGAGATGGTGGTGGTGGTGGAG GTGATGGTGATGGTGATAGTGGTGGGGGTAGTGGTGATGAAGGAGATGGT GGTGGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGGAGGAGGTGATGGTGGTAGTGGTGG GGGTAGTGGTGATGAAGGAGATAATGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTG GAGGAGATGGTGGTAGTGGTGGAAGAGGTGATGGTGGTAGTGCTGGGGGT AGTGGTGGTGAAGGAGATGG	ICA1	ENSG00000003147.19	transcript	ENST00000402384.8	protein_coding	8/13	chr7	8152562
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AAGGAGATGGTAGTGGTGGTGGGGGTAGTGGTGGTGAAGGAGATGGTGGT GGTGGTGGTAGTGGTGGTGGAGGAGATGGTGGTAGTGGTGGGGGTAGTGG TGATGAAGGAGATAATTGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGAGGAGATG GTGGTAGTGGTGGAAGAGGTGATGGTGGTAGTGGTGGGGGTAGTGGTGGT GAAGGAGATGGTGGTGGTGGTGGGGGTAGTGGTGATGAAGGAGATAATTG TGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGAGGAGATGGTGGTAGTGGTGGAAGAG GTGATGGTGGTAGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGAGGAGATGGTGGTAGT GGTGGGGGTAGTGGTGATGAAGGAGATAATTGTGGTGGTGGTGGTAGTGG TGGTGGAGGAGATGGTGGTAGTGGTGGAAGAGGTGATGGTGGTAGTGGTG GGGGTAGTGGTGGTGAAGGAGATGGTGGTGGTGGTGGGGGTAGTGGTGAT GAAGGAGATAATTGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGAGGAGATGGTGG TAGTGGTGGAAGAGGTGATGGTGGTAGTGGTGGGGGTAGTGGTGATGAAG GAGATGGTAGTGGTGGTGGGGGTAGTGGTGGTGAAGGAGATGGTGGTGGT GGTGGTAGTGGTGGTGGAGGAGATGGTGGTAGTGGTGGGGGTAGTGGTGA TGAAGGAGATAATTGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGAGGAGATGGTG GTAGTGGTGGAAGAGGTGATGGTGGTAGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGA GGAGATGGTGGTAGTGGTGGAAGAGGTGATGGTGGTAGTGGTGGGGGTAG TGGTGATGAAGGAGATAATGGTGGTGGTTGTGGAGGTGATGGTGATGGTG GCGGAGGAGGTGATGGTGGTAGTGGTGGGGGTAGTGGTGATGAAGGAGAT 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JoGo Online Haplotype Explorer ICA1_chr7_8108184_8267167

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) ICA1_chr7_8108184_8267167

Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary (with MANE)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 8)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 16)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 274)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 8)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 30)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 274)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 274)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 11)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 2284)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)