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chr3:88467224	A A	T T	1	a0003 a0003	46	HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00597.hp2 others(43): Show HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00597.hp2 HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG02056.hp1 HG02074.hp2 HG02132.hp1 HG02135.hp1 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02451.hp2 HG02572.hp2 HG02895.hp2 HG02922.hp1 HG03225.hp1 HG03225.hp2 HG03486.hp2 HG03579.hp2 HG03710.hp1 HG03927.hp1 HG03942.hp2 HG04199.hp1 NA18612.hp1 NA18939.hp2 NA18942.hp1 NA18957.hp1 NA18960.hp2 NA18961.hp1 NA18966.hp1 NA18977.hp2 NA18981.hp2 NA18986.hp1 NA18990.hp1 NA18998.hp1 NA19000.hp2 NA19003.hp1 NA19009.hp1 NA19011.hp2 NA19056.hp1 NA19074.hp1 NA19081.hp1 NA19084.hp1 NA19088.hp1 NA19090.hp1 NA20905.hp2	missense_variant	MODERATE	c.1867A>T c.1867A>T	p.Thr623Ser p.Thr623Ser	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	2325/2695	1867/2205	623/734		chr3	88467224
chr3:88467279	C C	A A	1	a0018 a0018	1	NA18987.hp1 NA18987.hp1	missense_variant	MODERATE	c.1922C>A c.1922C>A	p.Ser641Tyr p.Ser641Tyr	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	2380/2695	1922/2205	641/734		chr3	88467279
chr3:88467350	C C	T T	2	a0007 a0014 a0007 a0014	4	HG04184.hp2 NA18993.hp1 NA19078.hp2 others(1): Show HG04184.hp2 NA18993.hp1 NA19078.hp2 NA19079.hp2	missense_variant	MODERATE	c.1993C>T c.1993C>T	p.Arg665Cys p.Arg665Cys	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	2451/2695	1993/2205	665/734		chr3	88467350
chr3:88467364	TA TA	T T	1	a0005 a0005	7	HG00280.hp1 HG00639.hp1 HG01167.hp2 others(4): Show HG00280.hp1 HG00639.hp1 HG01167.hp2 HG01175.hp2 HG01256.hp1 HG01261.hp2 HG01433.hp2	frameshift_variant	HIGH	c.2009delA c.2009delA	p.Lys670fs p.Lys670fs	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	2467/2695	2009/2205	670/734	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr3	88467364
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chr3:88467393	C C	T T	1	a0016 a0016	1	NA19043.hp1 NA19043.hp1	missense_variant	MODERATE	c.2036C>T c.2036C>T	p.Ala679Val p.Ala679Val	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	2494/2695	2036/2205	679/734		chr3	88467393
chr3:88467516	G G	A A	11	a0001 a0005 a0007 others(8): Show a0001 a0005 a0007 a0008 a0010 a0011 a0017 a0018 a0019 a0020 a0021	243	HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00408.hp1 others(240): Show HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00408.hp1 HG00423.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00558.hp2 HG00609.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp1 HG00642.hp2 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01069.hp1 HG01070.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp2 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01099.hp2 HG01106.hp2 HG01123.hp1 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01167.hp2 HG01168.hp1 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01192.hp2 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01255.hp2 HG01256.hp1 HG01256.hp2 HG01257.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp2 HG01346.hp2 HG01358.hp1 HG01361.hp2 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01515.hp1 HG01515.hp2 HG01516.hp1 HG01516.hp2 HG01884.hp1 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01943.hp1 HG01952.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG01981.hp1 HG01993.hp1 HG01993.hp2 HG02015.hp1 HG02015.hp2 HG02027.hp1 HG02027.hp2 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02056.hp2 HG02071.hp1 HG02071.hp2 HG02074.hp1 HG02080.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02129.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp2 HG02145.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02165.hp1 HG02165.hp2 HG02258.hp1 HG02300.hp1 HG02300.hp2 HG02451.hp1 HG02602.hp1 HG02630.hp2 HG02683.hp1 HG02717.hp2 HG02735.hp1 HG02735.hp2 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG02818.hp2 HG02895.hp1 HG02897.hp2 HG03017.hp1 HG03098.hp2 HG03209.hp2 HG03490.hp1 HG03490.hp2 HG03492.hp1 HG03492.hp2 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG03654.hp2 HG03669.hp1 HG03669.hp2 HG03688.hp1 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG03710.hp2 HG03831.hp1 HG03831.hp2 HG03927.hp2 HG03942.hp1 HG04184.hp1 HG04199.hp2 HG04228.hp1 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18612.hp2 NA18747.hp1 NA18747.hp2 NA18939.hp1 NA18943.hp1 NA18943.hp2 NA18944.hp1 NA18944.hp2 NA18949.hp1 NA18949.hp2 NA18950.hp1 NA18950.hp2 NA18951.hp1 NA18951.hp2 NA18952.hp1 NA18952.hp2 NA18953.hp1 NA18953.hp2 NA18954.hp1 NA18955.hp1 NA18955.hp2 NA18957.hp2 NA18959.hp1 NA18959.hp2 NA18960.hp1 NA18961.hp2 NA18962.hp1 NA18962.hp2 NA18964.hp1 NA18964.hp2 NA18965.hp1 NA18965.hp2 NA18966.hp2 NA18968.hp1 NA18969.hp1 NA18969.hp2 NA18970.hp1 NA18970.hp2 NA18971.hp1 NA18971.hp2 NA18973.hp1 NA18973.hp2 NA18974.hp1 NA18974.hp2 NA18975.hp1 NA18975.hp2 NA18977.hp1 NA18979.hp1 NA18979.hp2 NA18980.hp1 NA18980.hp2 NA18981.hp1 NA18982.hp1 NA18982.hp2 NA18983.hp1 NA18983.hp2 NA18984.hp1 NA18984.hp2 NA18986.hp2 NA18987.hp1 NA18987.hp2 NA18988.hp1 NA18988.hp2 NA18990.hp2 NA18991.hp1 NA18991.hp2 NA18993.hp1 NA18993.hp2 NA18998.hp2 NA19000.hp1 NA19001.hp1 NA19001.hp2 NA19003.hp2 NA19004.hp1 NA19004.hp2 NA19005.hp1 NA19005.hp2 NA19007.hp1 NA19007.hp2 NA19009.hp2 NA19011.hp1 NA19012.hp1 NA19012.hp2 NA19054.hp1 NA19054.hp2 NA19056.hp2 NA19058.hp1 NA19058.hp2 NA19060.hp1 NA19060.hp2 NA19063.hp1 NA19063.hp2 NA19064.hp1 NA19068.hp1 NA19068.hp2 NA19070.hp2 NA19074.hp2 NA19075.hp1 NA19075.hp2 NA19077.hp1 NA19077.hp2 NA19078.hp2 NA19079.hp1 NA19079.hp2 NA19080.hp1 NA19080.hp2 NA19081.hp2 NA19082.hp1 NA19082.hp2 NA19084.hp2 NA19085.hp1 NA19085.hp2 NA19088.hp2 NA19090.hp2 NA19091.hp1 NA19091.hp2 NA20752.hp1 NA20752.hp2 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	stop_gained	HIGH	c.2159G>A c.2159G>A	p.Trp720* p.Trp720*	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	2617/2695	2159/2205	720/734		chr3	88467516

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chr3:88465747	G G	A A	1	a0016c0016 a0016c0016	1	NA19043.hp1 NA19043.hp1	synonymous_variant	LOW	c.390G>A c.390G>A	p.Thr130Thr p.Thr130Thr	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	848/2695	390/2205	130/734	chr3	88465747
chr3:88465810	A A	G G	2	a0001c0004 a0018c0022 a0001c0004 a0018c0022	43	HG01069.hp1 HG01070.hp2 HG01074.hp2 others(40): Show HG01069.hp1 HG01070.hp2 HG01074.hp2 HG01099.hp2 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01192.hp2 HG01255.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01346.hp2 HG01358.hp1 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01952.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG01981.hp1 HG01993.hp2 HG02040.hp2 HG02074.hp1 HG02300.hp2 HG02735.hp1 HG03490.hp2 HG03704.hp2 HG04199.hp2 NA18955.hp1 NA18965.hp1 NA18971.hp2 NA18974.hp2 NA18975.hp2 NA18982.hp2 NA18987.hp1 NA19001.hp2 NA19004.hp1 NA19005.hp2 NA19054.hp2 NA19068.hp2 NA19082.hp2 NA19085.hp2 NA19091.hp1 NA20752.hp1	synonymous_variant	LOW	c.453A>G c.453A>G	p.Gln151Gln p.Gln151Gln	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	911/2695	453/2205	151/734	chr3	88465810
chr3:88465874	T T	C C	1	a0016c0016 a0016c0016	1	NA19043.hp1 NA19043.hp1	synonymous_variant	LOW	c.517T>C c.517T>C	p.Leu173Leu p.Leu173Leu	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	2/2	975/2695	517/2205	173/734	chr3	88465874
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chr3:88465054	C C	T T	1	a0016c0016t0001g0029 a0016c0016t0001g0029	1	NA19043.hp1 NA19043.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-270-34C>T c.-270-34C>T	CSNKA2IP	ENSG00000283434.2	transcript	ENST00000637986.2	protein_coding	1/1		chr3	88465054

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer CSNKA2IP_chr3_88333456_88472594

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ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 21)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 27)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 3)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 383)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 27)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 36)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 383)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 386)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 30)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 10)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 2)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 2023)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)