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chr14:91802271	T T	G G	3	a0001 a0003 a0004 a0001 a0003 a0004	335	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 others(332): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00558.hp2 HG00597.hp1 HG00597.hp2 HG00609.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00642.hp2 HG00673.hp1 HG00673.hp2 HG00733.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG00738.hp1 HG00738.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01106.hp1 HG01106.hp2 HG01109.hp1 HG01109.hp2 HG01167.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01192.hp2 HG01257.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp1 HG01261.hp2 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01496.hp1 HG01496.hp2 HG01515.hp1 HG01515.hp2 HG01516.hp1 HG01516.hp2 HG01517.hp1 HG01517.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01928.hp2 HG01952.hp1 HG01952.hp2 HG01975.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG01981.hp1 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG01993.hp2 HG02004.hp1 HG02004.hp2 HG02015.hp1 HG02015.hp2 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02071.hp1 HG02071.hp2 HG02074.hp1 HG02074.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02132.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02135.hp2 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02148.hp1 HG02148.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02165.hp1 HG02165.hp2 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02293.hp1 HG02293.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02523.hp1 HG02523.hp2 HG02559.hp1 HG02559.hp2 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02602.hp1 HG02602.hp2 HG02615.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02683.hp1 HG02683.hp2 HG02698.hp1 HG02698.hp2 HG02717.hp1 HG02723.hp1 HG02723.hp2 HG02735.hp1 HG02735.hp2 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02818.hp1 HG02818.hp2 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG02897.hp2 HG02922.hp1 HG02922.hp2 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp2 HG02976.hp1 HG03041.hp1 HG03041.hp2 HG03098.hp1 HG03098.hp2 HG03130.hp1 HG03130.hp2 HG03139.hp1 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03195.hp2 HG03209.hp1 HG03209.hp2 HG03225.hp1 HG03225.hp2 HG03239.hp1 HG03239.hp2 HG03453.hp1 HG03453.hp2 HG03471.hp1 HG03471.hp2 HG03486.hp2 HG03490.hp1 HG03490.hp2 HG03491.hp1 HG03491.hp2 HG03492.hp1 HG03492.hp2 HG03516.hp1 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG03688.hp1 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG03710.hp1 HG03710.hp2 HG03831.hp1 HG03831.hp2 HG03834.hp1 HG03834.hp2 HG03942.hp1 HG03942.hp2 HG04115.hp1 HG04115.hp2 HG04199.hp1 HG04199.hp2 HG04204.hp1 HG04204.hp2 HG06807.hp1 HG06807.hp2 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18612.hp1 NA18612.hp2 NA18747.hp1 NA18747.hp2 NA18906.hp1 NA18906.hp2 NA18942.hp1 NA18942.hp2 NA18945.hp1 NA18945.hp2 NA18947.hp1 NA18947.hp2 NA18957.hp1 NA18957.hp2 NA18960.hp1 NA18960.hp2 NA18962.hp1 NA18962.hp2 NA18964.hp1 NA18964.hp2 NA18966.hp1 NA18966.hp2 NA18968.hp1 NA18968.hp2 NA18969.hp1 NA18969.hp2 NA18970.hp1 NA18970.hp2 NA18973.hp1 NA18973.hp2 NA18975.hp1 NA18975.hp2 NA18978.hp1 NA18978.hp2 NA18983.hp1 NA18983.hp2 NA18986.hp1 NA18986.hp2 NA18988.hp1 NA18988.hp2 NA18989.hp1 NA18989.hp2 NA18993.hp1 NA18993.hp2 NA18995.hp1 NA18995.hp2 NA18998.hp1 NA18998.hp2 NA18999.hp1 NA18999.hp2 NA19000.hp1 NA19000.hp2 NA19001.hp1 NA19001.hp2 NA19002.hp1 NA19002.hp2 NA19004.hp1 NA19004.hp2 NA19005.hp1 NA19005.hp2 NA19007.hp1 NA19007.hp2 NA19009.hp1 NA19009.hp2 NA19010.hp1 NA19010.hp2 NA19011.hp1 NA19011.hp2 NA19030.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp2 NA19054.hp1 NA19054.hp2 NA19056.hp1 NA19056.hp2 NA19057.hp1 NA19057.hp2 NA19058.hp1 NA19058.hp2 NA19060.hp1 NA19060.hp2 NA19063.hp1 NA19063.hp2 NA19065.hp1 NA19065.hp2 NA19066.hp1 NA19066.hp2 NA19068.hp1 NA19068.hp2 NA19077.hp1 NA19077.hp2 NA19079.hp1 NA19079.hp2 NA19080.hp1 NA19080.hp2 NA19081.hp1 NA19081.hp2 NA19083.hp1 NA19083.hp2 NA19084.hp1 NA19084.hp2 NA19087.hp1 NA19087.hp2 NA19088.hp1 NA19088.hp2 NA19091.hp1 NA19091.hp2 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1 NA20129.hp2 NA20300.hp1 NA20300.hp2 NA20752.hp1 NA20752.hp2 NA20805.hp1 NA20805.hp2 NA21309.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	missense_variant	MODERATE	c.452A>C c.452A>C	p.Lys151Thr p.Lys151Thr	TC2N	ENSG00000165929.13	transcript	ENST00000435962.7	protein_coding	4/12	783/5158	452/1473	151/490	chr14	91802271
chr14:91812485	A A	G G	1	a0004 a0004	1	HG03139.hp1 HG03139.hp1	missense_variant	MODERATE	c.128T>C c.128T>C	p.Val43Ala p.Val43Ala	TC2N	ENSG00000165929.13	transcript	ENST00000435962.7	protein_coding	3/12	459/5158	128/1473	43/490	chr14	91812485

chr:pos	ref	alt	# # of chapid	chapids	# # of haplotypeids	haplotypeids	annotation	impact	hgvs_c	hgvs_p	genename	geneid	featuretype	featureid	transcript_biotype	rank	cdna cdna pos length	cds cds pos length	aa aa pos length	distance	status	chr	pos
chr14:91783169	G G	A A	1	a0001c0006 a0001c0006	1	NA18612.hp1 NA18612.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1404C>T c.1404C>T	p.Asn468Asn p.Asn468Asn	TC2N	ENSG00000165929.13	transcript	ENST00000435962.7	protein_coding	12/12	1735/5158	1404/1473	468/490			chr14	91783169
chr14:91785243	A A	G G	1	a0001c0002 a0001c0002	56	HG00544.hp1 HG00558.hp2 HG00642.hp1 others(53): Show HG00544.hp1 HG00558.hp2 HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG01069.hp1 HG01074.hp1 HG01106.hp1 HG01169.hp1 HG01261.hp1 HG01496.hp1 HG01884.hp1 HG01928.hp2 HG01981.hp1 HG02165.hp1 HG02572.hp2 HG02895.hp2 HG02897.hp2 HG03225.hp1 HG03486.hp2 HG03490.hp2 HG03491.hp2 HG03492.hp2 HG03710.hp2 HG03942.hp2 HG04199.hp1 HG04204.hp2 NA18747.hp2 NA18942.hp1 NA18966.hp2 NA18969.hp1 NA18970.hp1 NA18983.hp1 NA18986.hp1 NA18989.hp1 NA18993.hp2 NA19009.hp1 NA19010.hp1 NA19011.hp1 NA19030.hp2 NA19054.hp1 NA19056.hp2 NA19058.hp1 NA19060.hp1 NA19063.hp2 NA19065.hp2 NA19066.hp2 NA19079.hp1 NA19080.hp2 NA19083.hp1 NA19084.hp1 NA19088.hp1 NA20752.hp1 NA20805.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1281T>C c.1281T>C	p.Leu427Leu p.Leu427Leu	TC2N	ENSG00000165929.13	transcript	ENST00000435962.7	protein_coding	11/12	1612/5158	1281/1473	427/490			chr14	91785243

chr:pos	ref	alt	# # of thapid:transcript level	thapids	# # of haplotypeids	haplotypeids	annotation	impact	hgvs_c	genename	geneid	featuretype	featureid	transcript_biotype	rank	distance	chr	pos
chr14:91779793	C C	T T	1	a0001c0001t0023 a0001c0001t0023	1	NA18962.hp1 NA18962.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3307G>A c.3307G>A	TC2N	ENSG00000165929.13	transcript	ENST00000435962.7	protein_coding	12/12	3307	chr14	91779793
chr14:91779821	C C	A A	42	a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 others(39): Show a0001c0001t0001 a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0004 a0001c0001t0005 a0001c0001t0006 a0001c0001t0008 a0001c0001t0009 a0001c0001t0010 a0001c0001t0012 a0001c0001t0013 a0001c0001t0014 a0001c0001t0016 a0001c0001t0017 a0001c0001t0018 a0001c0001t0019 a0001c0001t0020 a0001c0001t0021 a0001c0001t0022 a0001c0001t0023 a0001c0001t0024 a0001c0001t0025 a0001c0001t0026 a0001c0001t0027 a0001c0001t0029 a0001c0001t0030 a0001c0001t0031 a0001c0001t0033 a0001c0001t0034 a0001c0001t0035 a0001c0001t0036 a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0001c0001t0039 a0001c0002t0001 a0001c0002t0011 a0001c0006t0002 a0002c0003t0015 a0003c0004t0001 a0003c0004t0002 a0004c0005t0001 a0005c0007t0028	336	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 others(333): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00558.hp2 HG00597.hp1 HG00597.hp2 HG00609.hp1 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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer TC2N_chr14_91774746_91872536

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) TC2N_chr14_91774746_91872536

Translation Multiple Alignment View

ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 7)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 39)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 327)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 7)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 44)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 327)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 344)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 4)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 39)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 911)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)