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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ACYP2_chr2_53966113_54310300	54096819	CG CG	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp1 others(126): Show HG00099.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00408.hp1 HG00408.hp2 HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00558.hp1 HG00558.hp2 HG00597.hp2 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01255.hp1 HG01255.hp2 HG01256.hp1 HG01257.hp2 HG01261.hp2 HG01346.hp2 HG01358.hp2 HG01515.hp1 HG01515.hp2 HG01516.hp2 HG01517.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp1 HG01952.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG02027.hp2 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02056.hp1 HG02056.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02129.hp1 HG02129.hp2 HG02132.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02165.hp1 HG02165.hp2 HG02293.hp2 HG02486.hp2 HG02622.hp2 HG02683.hp1 HG02698.hp2 HG02735.hp1 HG02818.hp1 HG02895.hp2 HG02897.hp2 HG02965.hp2 HG02970.hp1 HG02976.hp2 HG03017.hp2 HG03130.hp1 HG03209.hp2 HG03225.hp1 HG03239.hp2 HG03486.hp2 HG03490.hp1 HG03669.hp1 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