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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ABCC4_chr13_95014835_95306451	95280416	CA CA	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp2 others(134): Show HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00558.hp1 HG00558.hp2 HG00609.hp2 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00642.hp2 HG00673.hp2 HG00738.hp1 HG00738.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01099.hp1 HG01099.hp2 HG01109.hp1 HG01109.hp2 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01192.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp2 HG01256.hp1 HG01256.hp2 HG01261.hp1 HG01346.hp1 HG01361.hp1 HG01361.hp2 HG01433.hp2 HG01496.hp1 HG01496.hp2 HG01884.hp1 HG01891.hp2 HG01981.hp2 HG02055.hp1 HG02080.hp1 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp2 HG02129.hp1 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02148.hp2 HG02155.hp1 HG02257.hp1 HG02451.hp2 HG02523.hp1 HG02523.hp2 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02602.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02717.hp1 HG02735.hp1 HG02735.hp2 HG02738.hp2 HG02886.hp2 HG02896.hp1 HG02965.hp1 HG02976.hp1 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