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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ABHD8_chr19_17287131_17308425	17305781	CT CT	C C	upstream_gene_variant upstream_gene_variant	MODIFIER	HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 others(195): Show HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp1 HG00423.hp1 HG00544.hp2 HG00639.hp2 HG00642.hp2 HG00673.hp2 HG00733.hp2 HG00738.hp1 HG00738.hp2 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01099.hp2 HG01109.hp1 HG01109.hp2 HG01123.hp1 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01167.hp2 HG01169.hp2 HG01175.hp1 HG01192.hp2 HG01243.hp1 HG01257.hp1 HG01258.hp1 HG01346.hp1 HG01361.hp1 HG01517.hp1 HG01884.hp1 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01978.hp2 HG01981.hp2 HG02027.hp2 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02074.hp1 HG02074.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02129.hp1 HG02135.hp1 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02155.hp2 HG02165.hp2 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02293.hp2 HG02300.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02523.hp1 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