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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ABLIM1_chr10_114426112_114663275	114431984	TA TA	T T	3_prime_UTR_variant 3_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG00099.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp1 others(148): Show HG00099.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp2 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00673.hp2 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp1 HG01099.hp2 HG01123.hp1 HG01175.hp2 HG01192.hp2 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp2 HG01256.hp1 HG01256.hp2 HG01358.hp2 HG01433.hp1 HG01517.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01952.hp1 HG01975.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01981.hp2 HG01993.hp2 HG02015.hp1 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02074.hp1 HG02080.hp1 HG02083.hp1 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02135.hp1 HG02135.hp2 HG02148.hp2 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02300.hp1 HG02300.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02523.hp2 HG02615.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02630.hp2 HG02698.hp1 HG02698.hp2 HG02717.hp1 HG02717.hp2 HG02809.hp1 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