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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ABLIM2_chr4_7960327_8163813	8074776	CT CT	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00323.hp1 others(141): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp1 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00558.hp2 HG00609.hp1 HG00609.hp2 HG00621.hp2 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00738.hp1 HG01069.hp1 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01081.hp2 HG01099.hp1 HG01106.hp1 HG01109.hp1 HG01123.hp1 HG01175.hp1 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01256.hp1 HG01261.hp1 HG01346.hp1 HG01346.hp2 HG01358.hp1 HG01496.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01928.hp1 HG01928.hp2 HG01943.hp1 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp2 HG02004.hp1 HG02004.hp2 HG02015.hp1 HG02015.hp2 HG02040.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02056.hp2 HG02129.hp2 HG02148.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02165.hp1 HG02165.hp2 HG02257.hp1 HG02258.hp2 HG02293.hp1 HG02293.hp2 HG02300.hp1 HG02300.hp2 HG02451.hp1 HG02486.hp1 HG02572.hp1 HG02602.hp2 HG02630.hp1 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02683.hp2 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