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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ACACA_chr17_37079992_37411836	37184848	CA CA	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00323.hp1 others(182): Show HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00609.hp1 HG00609.hp2 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG00639.hp2 HG00642.hp2 HG00673.hp1 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp1 HG01099.hp1 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01167.hp2 HG01168.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01192.hp1 HG01192.hp2 HG01255.hp2 HG01261.hp2 HG01346.hp2 HG01358.hp1 HG01361.hp2 HG01433.hp1 HG01496.hp2 HG01515.hp2 HG01516.hp2 HG01517.hp1 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG01952.hp1 HG01952.hp2 HG01981.hp1 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG02004.hp1 HG02015.hp2 HG02040.hp2 HG02055.hp2 HG02071.hp2 HG02080.hp2 HG02083.hp2 HG02109.hp2 HG02145.hp1 HG02155.hp2 HG02165.hp1 HG02257.hp1 HG02258.hp1 HG02258.hp2 HG02293.hp1 HG02293.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02559.hp1 HG02572.hp1 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