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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ACSL5_chr10_112369116_112433376	112386181	CT CT	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp2 HG00323.hp2 HG00733.hp2 others(135): Show HG00099.hp2 HG00323.hp2 HG00733.hp2 HG00738.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp1 HG01071.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01109.hp1 HG01192.hp1 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01258.hp2 HG01358.hp1 HG01358.hp2 HG01433.hp2 HG01496.hp1 HG01515.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01975.hp2 HG01981.hp1 HG02027.hp2 HG02055.hp2 HG02080.hp1 HG02080.hp2 HG02109.hp1 HG02135.hp2 HG02155.hp2 HG02258.hp1 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02293.hp2 HG02486.hp2 HG02523.hp2 HG02559.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp2 HG02647.hp2 HG02717.hp2 HG02735.hp1 HG02809.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp1 HG02922.hp1 HG02965.hp2 HG03017.hp1 HG03017.hp2 HG03130.hp1 HG03209.hp2 HG03239.hp2 HG03453.hp2 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03579.hp1 HG03654.hp1 HG03688.hp1 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03710.hp1 HG03831.hp2 HG03942.hp2 HG04184.hp2 HG04199.hp1 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