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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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BAALC_chr8_103135725_103235305	103171231	CAGAA CAGAA	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp2 HG00280.hp2 HG00323.hp2 others(162): Show HG00099.hp2 HG00280.hp2 HG00323.hp2 HG00408.hp1 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00609.hp2 HG00642.hp2 HG00738.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01109.hp2 HG01167.hp2 HG01168.hp1 HG01169.hp2 HG01192.hp1 HG01192.hp2 HG01243.hp2 HG01255.hp2 HG01256.hp1 HG01256.hp2 HG01257.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp1 HG01261.hp2 HG01346.hp2 HG01358.hp2 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01975.hp1 HG01993.hp1 HG02004.hp2 HG02015.hp2 HG02027.hp1 HG02109.hp2 HG02129.hp2 HG02132.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02145.hp1 HG02148.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02165.hp1 HG02165.hp2 HG02280.hp2 HG02451.hp1 HG02486.hp2 HG02523.hp1 HG02559.hp2 HG02572.hp2 HG02615.hp1 HG02615.hp2 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02683.hp1 HG02683.hp2 HG02735.hp1 HG02735.hp2 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG02809.hp1 HG02818.hp1 HG02818.hp2 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