Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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MLPH_chr2_237482251_237560322	237543905	GGGAGGAC others(770): Show GGGAGGACAGTGGTGAGTGGGGACAGTGGTGAGTGGGGGGACAGTGGTGA GTGGGGGACAGTGGTGAGTGGGGGACAGTGGTGAGTGGGCACGGTAGTGA GTGGGGGGACAGTGGTGAGTGGGAGGACAGTGGTGAGTGGGGACAGTGGT GAGTGGGGGGACAGTGGTGAGTGGGCACGGTGGTGAGTGGGGGGACAGTG GTGAGTGGGCACGGTGGTGAGTGGAGGGGACAGTGGTGAGTGGGGACAGT GGTGAGTGGGGGGACAGTGGTGAGTGGGGGGACAGTGTGTGGGGGGACAG TGGTGAGTTGGGGGGACAGTGGTGAGTGGGGACAGTGGTGAGTGGGGACA GTAATGAGTCGGGGGACAGTGGTGAGTGGGCACAGTAGTGAGTGGGGGGA CAGTGGTGAGTGGGGACAGTGGTGAGTGGGGGGACAGTGGTGAATGGGGA CAGTAGTGAGTGGGGGACCGTGGTGAGTGGGGGCACAGTGGTGAGTGGGG ACAGTGGTGAGTCGGGGGACAGTGGTGAATGGGCACGGTAGTGAGTGGGG GGACAGTAGTGAGTGGGGACAGTGGTGAGTGGGGGGGACAGTGGTGAGTG GGGGGACAGTGGTGAGTGGGGGGGGACAGTTGTTGAGTTGGGGGACACTT TAGTGTTGGGGGGGACATTGTTTATTGGGGGCATAGTGGTGTGTGGTTGT CAGTGTGTGGTGGTGGTCAGTGGTGATTGGGCACTGTAGTGAGTGGGGGG ACAGTGGTGAGTGGGAGGACAGTGGTGA	G G	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG01496.hp2 HG02922.hp2 HG03225.hp1 others(2): Show HG01496.hp2 HG02922.hp2 HG03225.hp1 HG03540.hp1 NA19240.hp2	a0009 a0009	a0009c0009 a0009c0009	a0009c0009t0002 a0009c0009t0002	a0009c0009t0002g0010 a0009c0009t0002g0105 a0009c0009t0002g0116 others(2): Show a0009c0009t0002g0010 a0009c0009t0002g0105 a0009c0009t0002g0116 a0009c0009t0002g0124 a0009c0009t0002g0125	5	264	0.0189	-777	c.153 others(19): Show c.1539+1248_1540-1923del	MLPH	ENSG00000115648.14	transcript	ENST00000264605.8	protein_coding	12/15		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr2	TogoVar
NEU4_chr2_241804193_241822413	241805447	TCCCCCCT others(770): Show TCCCCCCTCAGCCCAGGGACCTCCGCAGGCCACCCTCCCTCCCCCCTCAG CCCAGGGACCTCCGCAGGCCACCCTCCCTCCCCCCTCAGCCCAGGGACCT CCGCAGGCCACCCTCCCCCCTCAGCCCAGGAACCTCCGCAGGCCACCCTC CCTCCCCCCTCAGCCCAGGAACCTCCGCAGGCCACCCTCCCTCCCCCCTC AGCCCAGGGACCTCCGCAGGCCACCCTCCCCCCTCAGCCCAGGAACCTCC GCAGGCCACCCTCCCTCCCCCCTCAGCCCAGGAACCTCCGCAGGCCACCT TCCCTCCCCCCTCAGCCCAGGGACCTCCGCAGGCCACCCTCCCCCCTCAG CCCAGGAACCTCCGCAGGCCACCCTCCCTCCCCCCTCAGCCCAGGAACCT CCGCAGGCCACCCTCCCTCCCCCCTCAGCCCAGGAACCTCCGCAGGCCAC CCTCCCTCCCCCCTCAGCCCAGGAACCTCCGCAGACCACCTTCCCTCCCC CCTCAGCCCAGGGACCTCCTCCCTCCCCCCTCAGCCCAAGGGACCTAGGC AGGCCACCCTCCCCCCTCAGCCCAGGAACCTCCGCAGGCCACCTTCCCTC CCCCCTCAGCCCAGGGACCTCCGCAGGCCACCTTCCCTCCCCCCTCAGCC CAGGGACCTCCGCAGGCCACCCTCCCTCCCCCCTCAGCCCAGGGACCTCC GCAGGCCACCCTCCCCCCTCAGCCCAGGGACCTCCGCAGGCCACCCTCCC CCCTCAGCCCAGGAACCTCCGCAGGCCA	T T	upstream_gene_variant upstream_gene_variant	MODIFIER	HG04199.hp1 HG04199.hp1	a0001 a0001	a0001c0002 a0001c0002	a0001c0002t0001 a0001c0002t0001	a0001c0002t0001g0083 a0001c0002t0001g0083	1	270	0.0037	-777	c.-38 others(11): Show c.-3830_-3054del	NEU4	ENSG00000204099.12	transcript	ENST00000407683.6	protein_coding		3745		chr2	TogoVar
SLC12A7_chr5_1045384_1117063	1070173	GCCCCCAG others(770): Show GCCCCCAGTGAGCCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGGCATCACACTTAT GCAGCCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGGCATCACACTTATGCAGCCCC CAGTGAGCCCCCAGCACACGGCATCACACTTATGCAGCCCCAGTGAGCCC CCAGCACACGGGCATCACACTTATGCAGCCCCCAGTGAGCCCCCAGCACA CGGCATCACACTTATGCAGCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGGCATCAC ACTTATGCAGCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGGCATCACACTTATGCA GCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGGCATCACACTTATGCAGCCCCCAGT GAGCCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGCATCACACTTATGCAGCCCCCA GTGAGCCCCCAGCACACGGGCATCACACTTATGCAGCCCCCAGTGAGCCC CCAGCACACGGGCATCACACTTATGCAGCCCCAGTGAGCCCCCAGCACAC GGCATCACACTTATGCAGCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGCATCACAC TTATGCAGCCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGGCATCACACTTATGCAG CCCCCAGTGAGCCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGCATCACACTTATGC AGCCCCCAGTGAGCCCCCAGCACACGGTATCACACTTATGCAGCCCCCAG TGAGCCCCCAGCACACGGGCATCACACTTATGCAGCCCCCAGTGAGCCCC CAGCACACGGGTATCACACTTATGCAGC	G G	intron_variant intron_variant	MODIFIER	NA18984.hp2 NA18984.hp2	a0002 a0002	a0002c0011 a0002c0011	a0002c0011t0002 a0002c0011t0002	a0002c0011t0002g0034 a0002c0011t0002g0034	1	105	0.0095	-777	c.224 others(19): Show c.2241+2683_2241+3459del	SLC12A7	ENSG00000113504.21	transcript	ENST00000264930.10	protein_coding	17/23			chr5	TogoVar
DDX51_chr12_132131594_132149319	132134791	CCCGAGTG others(769): Show CCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCACTCCTCCCACCTCCCCGAGTGTGCCCA CGGTGCCCACTCCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCGCTCCTC CCACCTCCCGAGTGTGCCCCGGTGCCCGCTCCTCCCACCTCCCCGAGTGT GCCCACGGTGCCCGCTACCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCA CTCCTCCCACCTCTCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCACTCCTCCCACCTCC CCGAGTGTGCCCACGGTGCCCACTCCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCACG GTGCCCGCTCCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCGCTCCTCCC ACCTCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCGCTCCTCCCACCTCCCGAGTATGC CCCGGTGCCCGCTCCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCACTCC TCCCACCTCCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCACTCCTCCCACCTCCCGAG TGTGCCCACGGTGCCCGCTCCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCCGGTGCCC GCTCCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCGCTACCTCCCACCTC CCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCGCTACCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCA CGGTGCCCGCTACCTCCCACCTCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCACTCCT CCCACCTCCCCGAGTGTGCCCACGGTGCCCGCTCCTCCCACCTCCCGAGT GTGCCCCGGTGCCCGCTCCTCCCACCT	C C	downstream_gene_variant downstream_gene_variant	MODIFIER	HG02056.hp2 HG02056.hp2	a0005 a0005	a0005c0007 a0005c0007	a0005c0007t0011 a0005c0007t0011	a0005c0007t0011g0019 a0005c0007t0011g0019	1	330	0.0030	-776	c.37 others(11): Show c.3705_*4480del	DDX51	ENSG00000185163.10	transcript	ENST00000397333.4	protein_coding		1802		chr12	TogoVar
DIP2C_chr10_269201_694668	321922	GCGGGGCT others(769): Show GCGGGGCTCCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTG CGGGGCTCCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTGC GGGGCTCCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTGCG GGGCTCCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTGCGG GGCTCCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTGCGGG GCTCCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTGCGGGG CTCCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTGCGGGGC TCCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTGCGGGGCT CCGGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCAGTCGGGGGTGCGGGGCTC CGGCGAGAGACCAGTGTTGTTAGAACAGTCAGTCGGGGGTGCGGGGCTCC GGCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCAGTCGGGGGTGCGGGGGTCCG GCGAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCAGTCGGGGGTGCGGGGCTCCGG CGAGAGACCAGTGTTGTTAGAACAGTCAGTCGGGGGTGCGGGGCTCCGGC GAGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCCGTCGGGGGTGCGGGGCTCCGGCG AGAGACCGGCGCTGTTAGAACAGTCAGTCGGGGGTGCGGGGCTCCGGCGA GAGACCAGTGTTGTTAGAACAGTCAGT	G G	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG03225.hp1 HG03453.hp2 HG03225.hp1 HG03453.hp2	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0002 a0001c0001t0002	a0001c0001t0002g0004 a0001c0001t0002g0025 a0001c0001t0002g0004 a0001c0001t0002g0025	2	84	0.0238	-776	c.392 others(19): Show c.3924+4308_3924+5083del	DIP2C	ENSG00000151240.18	transcript	ENST00000280886.12	protein_coding	31/36			chr10	TogoVar
DLGAP2_chr8_732628_1713476	1642167	CCACCTGT others(769): Show CCACCTGTGTCACCCTCCAACCCGCCGGTCCTCACCTGTGTCACCCTCGA CCCCGCCGGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCGCCGGCCCTCACCTG TGTCACCCTCCAACCCGCCGGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCGCC GGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCGCCGGTCCTCACCTGTGTCACC CTCGACCCCGCCGGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCGCCGGTCCTC ACCTGTGTCACCCTCGACCCCCCCGGTCCTCACCTGTGTCACCCTCGACC CCCCCGGTCCTCACCTGTGTCACCCTCGAACCCGCCAGCCCTCACCTGTG TCACCCTCGACCCCGCCGGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCGCCGG TCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCCCCGGTCCTCACCTGTGTCACCCT CGACCCCGCCGGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCGCCGGTCCTCAC CTGTGTCACCCTCGACCCCGCCGGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGAACCC GCCGGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGAACCCGCCGGCCCTCACCTGTGTC ACCCCTCGAACCCGCCAGCCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCGCCGGC CCTCACCTGTGTCACCCTCGAACCCGCCGGTCCTCACCTGTGTCACCCTC GACCCCGCCGGTCCTCACCTGTGTCACCCTCGACCCCCCCGGTCCTCACC TGTGTCACCCTCGACCCCCCCGGTCCT	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	NA18906.hp1 NA18906.hp1	a0004 a0004	a0004c0008 a0004c0008	a0004c0008t0016 a0004c0008t0016	a0004c0008t0016g0028 a0004c0008t0016g0028	1	25	0.0400	-776	c.181 others(19): Show c.1810+9138_1810+9913del	DLGAP2	ENSG00000198010.13	transcript	ENST00000637795.2	protein_coding	8/14		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr8	TogoVar
LMLN_chr3_197955217_198048720	198004405	CCATCTAT others(769): Show CCATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATCATACGTAGTAAGTT TGCCATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATCATACGTAGTAAG TTTGCCATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATCATACGTAGTA AGTTTGACATCTATATATCATCTATACAGATACATATCATACGTAGTAAG TTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATCATACGTAGTA AGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATCATACGTAG TAAGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATCATACGT AGTAAGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATCATAC GTAGTAAGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATCAT ACGTAGTAAGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATATC ATACGTAGTAAGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGATACATA TCATACGTAGTAAGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGATACA TATCATACGTAGTAAGTTTGCCATCTATCTATATATCATCTATACAGATA CATATCATACGTAGTAAGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACAGA TACATATCATACGTAGTAAGTTTGACATCTATCTATATATCATCTATACA GATACATATCATACGTAGTAAGTTTGA	C C	intron_variant intron_variant	MODIFIER	NA18977.hp1 NA19084.hp1 NA18977.hp1 NA19084.hp1	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0003 a0001c0001t0003	a0001c0001t0003g0113 a0001c0001t0003g0114 a0001c0001t0003g0113 a0001c0001t0003g0114	2	239	0.0084	-776	c.131 others(19): Show c.1319+1332_1319+2107del	LMLN	ENSG00000185621.11	transcript	ENST00000420910.7	protein_coding	12/16		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr3	TogoVar
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